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Align A1C3L3 to PF04286 (DUF445)

A1C3L3 has 2587 amino acids

Query:       DUF445  [M=368]
Accession:   PF04286.16
Description: Protein of unknown function (DUF445)
Scores for complete sequences (score includes all domains):
   --- full sequence ---   --- best 1 domain ---    -#dom-
    E-value  score  bias    E-value  score  bias    exp  N  Sequence Description
    ------- ------ -----    ------- ------ -----   ---- --  -------- -----------
    5.7e-63  200.0 189.9    4.1e-13   36.0  14.0    9.6  8  A1C3L3    


Domain annotation for each sequence (and alignments):
>> A1C3L3  
   #    score  bias  c-Evalue  i-Evalue hmmfrom  hmm to    alifrom  ali to    envfrom  env to     acc
 ---   ------ ----- --------- --------- ------- -------    ------- -------    ------- -------    ----
   1 !    2.1   3.1    0.0079    0.0079     226     323 ..     126     178 ..      81     269 .. 0.45
   2 !   31.0  19.2   1.3e-11   1.3e-11      78     337 ..     563     820 ..     529     824 .. 0.45
   3 !   31.2  18.4   1.1e-11   1.1e-11      77     328 ..     819    1063 ..     799    1079 .. 0.25
   4 !   13.8  41.3   2.3e-06   2.3e-06      95     175 ..    1284    1342 ..    1059    1578 .. 0.45
   5 !   23.0  30.9   3.5e-09   3.5e-09      88     255 ..    1597    1753 ..    1471    1880 .. 0.33
   6 !   31.1  18.7   1.2e-11   1.2e-11      71     333 ..    1785    2040 ..    1767    2047 .. 0.34
   7 !   30.8  20.0   1.5e-11   1.5e-11      79     329 ..    2044    2296 ..    2015    2314 .. 0.28
   8 !   36.0  14.0   4.1e-13   4.1e-13      81     324 ..    2290    2543 ..    2274    2578 .. 0.27

  Alignments for each domain:
  == domain 1  score: 2.1 bits;  conditional E-value: 0.0079
  DUF445 226 pelaeev.eelkqkllaeeavqkylke.lweslkellkkdlssedsalrkrisellaelgerlaedpelreklnehlekavekllekyrleitelieetv 323
             +++ e+v e + +++ ++   ++ ++e ++es++e + +++s+                                               +i+e i+e v
  A1C3L3 126 ESASESVsESISESVSESVSTSESVSEsVSESVSESISESVSE-----------------------------------------------SISESISESV 178
             1111111011111111111111111111222222222222222...............................................1111111111 PP

  == domain 2  score: 31.0 bits;  conditional E-value: 1.3e-11
  DUF445  78 epenaealakevakllaealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefleeelgklvl 180
             +++ +e++++ v++ ++e +++  +esv++ +++++++ ++e + +++ +++ ++ ++e+  +++++++ + +++ ++++ ++  i+e ++e ++e +   v 
  A1C3L3 563 SESVSESITESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESV-SESISESVSESVSESISESISESVSESVSE-SISESVSESVSESISESV- 662
             2334444444444444444444444455555555555555555544444444.444444445555555555555544444433.555555555555555544. PP

  DUF445 181 lekiaekilrelssll.eevqadpehelrqefdkevreliddllndpelaeeveelkqkllaeeavqkylkelweslkellkkdlssedsalrkrisellael 282
             +e+++e+i +++s+ + e++++   +++++++++ v+e +++  + +++ e+v e   + ++e   ++  ++++es++e + +++s++  + ++  +++ +++
  A1C3L3 663 SESVSESISESVSESVsESISESVSESVSESISESVSESVSESIS-ESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSES--VSESISESVSESV 762
             445555554444433213344444444444444444444444444.344444444444444444444444444444444444444442..3333333333334 PP

  DUF445 283 gerlaed..pelreklnehlekav.ekllekyrleitelieetvekwdaeeleelIel 337
              e+++e+  +++ e+++e +++ v e++ e+ +++++e ++e v +  +e ++e I +
  A1C3L3 763 SESISESvsESVSESVSESVSESVsESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESISE 820
             4444444444444444444433331334444445555555555555555555555554 PP

  == domain 3  score: 31.2 bits;  conditional E-value: 1.1e-11
  DUF445   77 eepenaealakevakllaealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefleeelgk 177 
              + ++ +e++++ +++ ++e +++ ++esv++ +++++++ ++e   +++ +++ ++ ++e+  +++++++ + +++ ++++ ++  i+e ++e ++e +  
  A1C3L3  819 S-ESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESV-SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSE-SISESVSESVSESISE 916 
              1.122222222222222222222222222222222222222222222222222.222222222222222222222222222222.3333333333333333 PP

  DUF445  178 lvllekiaekilrelssll.eevqadpehelrqefdkevreliddllndpelaeeveelkqkllaeeavqkylkelweslkellkkdlss.ed.salrkri 275 
               v +e+++e+i +++s+ + e+v++   ++++++ ++ v+e i++  +     e+v e   + ++e   ++  ++++es++e + +++s+  + s  ++  
  A1C3L3  917 SV-SESVSESISESVSESVsESVSESVSESVSESVSESVSESISESVS-----ESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSEsVSeSISESVS 1011
              22.333333333332222202222222223333333333333332222.....222222222222222222222222222222222222211101111111 PP

  DUF445  276 sellaelgerlaed..pelreklnehlekavekllekyrleitelieetvekwda 328 
              +++ +++ e+++e+  +++ e+++e +++ v+   e+ +++++e i+e v +  +
  A1C3L3 1012 ESVSESVSESVSESvsESVSESVSESISESVS---ESVSESVSESISESVSESVS 1063
              11112222222222222222222222222222...22222333333333333333 PP

  == domain 4  score: 13.8 bits;  conditional E-value: 2.3e-06
  DUF445   95 ealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefleeel 175 
              e +++ ++esv++ +++++++ ++e   +++ +++ ++ ++e+  +                      i+e ++e ++e +
  A1C3L3 1284 ESVSESISESVSESVSESVSESISESVSESVSESI-SESVSESVSE---------------------SISESVSESVSESI 1342
              11111111111111111111000000000000000.0000000000.....................00000000000000 PP

  == domain 5  score: 23.0 bits;  conditional E-value: 3.5e-09
  DUF445   88 evakllaealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefleeelgklvllekiaeki 188 
               +++ ++e +++ ++esv++ +++++++ ++e   +++ +++ ++ ++e+  +++++++ + +++ ++++ ++  i+e ++e ++e +   v +e+++e+i
  A1C3L3 1597 SISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESV-SESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSE-SISESVSESVSESISESV-SESVSESI 1694
              111111111111111111111111111111111111111111.111111111111111111111111111111.111111111111111111.11111111 PP

  DUF445  189 lrelsslleevqadpehelrqefdkevreliddllndpelaeeveelkqkllaeeavqkylkelwes 255 
               ++       v++   ++++++ ++ v+e i++  + +++ e++ e   + ++e   ++  ++++es
  A1C3L3 1695 SES-------VSESVSESISESVSESVSESISESVS-ESVSESISESVSESVSESISESVSESVSES 1753
              111.......11111111111111111111111111.011111111111111111111111111111 PP

  == domain 6  score: 31.1 bits;  conditional E-value: 1.2e-11
  DUF445   71 rlgewleepenaealakevakllaealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefl 171 
              ++ e ++ ++ +e++++ v++ ++e +++  +esv++ +++++++ ++e + +++ +++ ++ ++e+  +++++++ + +++ ++++ ++  i+e ++e +
  A1C3L3 1785 SISESVS-ESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESV-SESISESVSESVSESISESVSESVSESVSE-SISESVSESV 1882
              1222222.233333344444444444444444444444444444444444444444444.333444444444444444444444333333.4444444444 PP

  DUF445  172 eeelgklvllekiaekilrelsslleevqadpehelrqefdkevreliddllndpelaeeveelkqkllaeeavqkylkelweslkellkkdlssedsalr 272 
              +e +   v +e+++e+i +++s+   +v++   ++++++ ++ ++e +++  + +++ e+v e   + ++e   ++  ++++es++e + +++s++  + +
  A1C3L3 1883 SESISESV-SESVSESISESVSE---SVSESISESVSESVSESISESVSESVS-ESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESISESVSES--VSE 1976
              44433333.33333333333322...222222222333333333332332222.222344444444444444444444444444444444444442..222 PP

  DUF445  273 krisellaelgerlaed..pelreklnehlekav.ekllekyrleitelieetvekwdaeelee 333 
              +  +++ +++ e+++e+  +++ e+++e +++ v e++ e+ +++++e i+e v +  +e ++e
  A1C3L3 1977 SISESVSESVSESISESvsESVSESISESVSESVsESISESVSESVSESISESVSESVSESISE 2040
              2222222333333333333333333333333322022223333344444444444444444444 PP

  == domain 7  score: 30.8 bits;  conditional E-value: 1.5e-11
  DUF445   79 penaealakevakllaealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefleeelgklv 179 
              ++ +e++++ v++ ++e +++ ++esv++ +++++++ ++e   +++ +++ ++ ++e+  +++++++ + +++ ++++ ++  i+e ++e ++e +   v
  A1C3L3 2044 ESVSESISESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESV-SESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSE-SISESVSESVSESISESV 2142
              222222222222222222222222222222222222222222222222222.222222222222222222222222222222.333333333333333322 PP

  DUF445  180 llekiaekilrelssll.eevqadpehelrqefdkevreliddllndpelaeeveelkqkllaeeavqkylkelweslkellkkdlss.edsalrkrise. 277 
               +e+++e+i +++s+ + e++++   +++++++++ v+e +++  + +++ e+v e   + ++e   ++  ++++es++e + +++s+  +  + ++ise 
  A1C3L3 2143 -SESVSESISESVSESVsESISESVSESVSESISESVSESVSESIS-ESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSEsVSESVSESISEs 2241
              .222222222222221102222222233333333333333333332.222233333333333333333333333333333333333332111122222220 PP

  DUF445  278 llaelgerlaed..pelreklnehlekave.kllekyrleitelieetvekwdae 329 
              + +++ e+++e+  +++ e+++e +++ v+ ++ e+ +++++e i+e v +  +e
  A1C3L3 2242 VSESVSESISESvsESVSESVSESVSESVSeSVSESVSESVSESISESVSESVSE 2296
              2222223333333333333333333222210222222223333333333333333 PP

  == domain 8  score: 36.0 bits;  conditional E-value: 4.1e-13
  DUF445   81 naealakevakllaealeslddesvqrllkkalrkkleeidlapllgklLellleegrhqklldalldrlrdllkseeakeriaelidefleeelgklv.. 179 
               +e++++ v++ ++e +++ ++esv++ +++++++ ++e   +++ +++ ++ ++e+  +++++++ + +++ ++++ ++  i+e ++e ++e +   v  
  A1C3L3 2290 VSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESV-SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSE-SISESVSESVSESISESVse 2388
              2222223333333333333333333333333333222222222222222.222233333333333333333332222222.33333333333333332211 PP

  DUF445  180 .........llekiaekilrelssll.eevqadpehelrqefdkevreliddllndpelaeeveelkqkllaeeavqkylkelweslkellkkdlssedsa 270 
                       ++e+++e++ +++s+ + e+v++   ++++++ ++ ++e +++  + +++ e+v e   + ++e   ++  ++++es++e + +++s++  +
  A1C3L3 2389 svsesisesVSESVSESVSESISESVsESVSESISESVSESVSESISESVSESVS-ESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSES--V 2486
              1011101111222222222222211101122222222222222222222222222.122222222222222222222222222222222222222221..1 PP

  DUF445  271 lrkrisellaelgerlaed..pelreklnehlekav.ekllekyrleitelieetve 324 
               ++  +++ +++ e+++e+  +++ e+++e +++ + e++ e+ +++i+e ++e v 
  A1C3L3 2487 SESISESVSESVSESVSESvsESVSESISESVSESIsESVSESVSESISESVSESVS 2543
              111111111112222222222222222222222111011222222233333333333 PP



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