SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 14209 FitnessBrowser__Keio:14209 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3qdkA Structural insight on mechanism and diverse substrate selection strategy of ribulokinase (see paper)
33% identity, 95% coverage: 5:539/566 of query aligns to 4:524/546 of 3qdkA

query
sites
3qdkA
I
 
I
G
 
G
L
 
V
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
S
 
T
D
 
E
S
 
S
V
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
L
V
 
I
D
 
D
C
 
L
A
 
S
T
 
N
G
 
G
E
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
H
V
 
V
E
 
T
W
 
P
Y
 
Y
P
 
R
R
 
H
W
 
G
Q
 
V
K
 
I
G
 
D
Q
 
Q
F
 
Y
C
 
L
D
 
P
A
 
N
P
 
T
N
 
N
N
 
I
Q
 
K
F
 
L
R
 
G
H
 
H
-
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
S
 
V
M
 
L
E
 
T
A
 
T
A
 
S
L
 
V
K
 
P
T
 
A
V
 
V
L
 
M
A
 
K
E
 
E
L
 
D
S
 
A
V
 
D
E
 
D
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
F
T
|
T
G
x
A
S
 
C
T
 
T
P
 
M
A
 
L
P
 
P
I
 
V
D
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
P
L
 
L
A
 
C
L
 
L
R
 
L
P
 
A
E
 
Q
F
 
Y
A
 
K
E
 
D
N
 
N
P
 
P
N
 
H
A
 
S
M
 
W
F
 
V
V
 
K
L
 
L
W
|
W
K
 
K
D
 
H
H
 
H
T
 
A
A
 
A
V
 
Q
E
 
D
E
 
K
A
 
A
E
 
N
E
 
A
I
 
I
T
 
N
R
 
E
L
 
M
C
 
A
H
 
E
A
 
K
P
 
R
G
 
G
N
 
E
V
 
A
D
 
F
Y
 
L
S
 
P
R
 
R
Y
 
Y
I
 
-
G
 
G
G
 
G
I
 
K
Y
 
I
S
 
S
S
 
S
E
 
E
W
 
W
F
 
M
W
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
W
H
 
Q
V
 
I
T
 
L
R
 
D
Q
 
E
D
 
A
S
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
Y
Q
 
N
S
 
R
A
 
T
A
 
D
S
 
Q
W
 
F
I
 
L
E
 
E
L
 
A
C
 
T
D
 
D
W
 
W
V
 
I
P
 
V
A
 
S
L
 
Q
L
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
K
T
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
I
R
 
V
R
 
K
G
 
N
R
 
S
C
 
C
S
 
T
A
 
A
G
 
G
H
 
Y
K
 
K
S
 
A
L
 
I
W
 
W
H
 
H
E
 
K
S
 
R
W
 
-
G
 
E
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
P
 
S
A
 
N
S
 
E
F
 
F
F
 
F
D
 
K
E
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
R
L
 
L
N
 
E
R
 
H
H
 
L
L
 
T
P
 
T
S
 
T
P
 
K
L
 
L
F
 
R
T
 
G
D
 
D
T
 
I
W
 
V
T
 
P
A
 
L
D
 
G
I
 
E
P
 
R
V
 
A
G
 
G
T
 
G
L
 
L
C
 
L
P
 
P
E
 
E
W
 
M
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
N
E
 
P
S
 
G
V
 
I
V
 
A
I
 
V
S
 
A
G
 
V
G
 
G
A
 
N
F
 
V
D
|
D
C
 
A
H
 
H
M
 
A
G
 
A
A
 
V
V
 
P
G
 
A
A
 
V
G
 
G
-
 
V
A
 
T
Q
 
T
P
 
P
N
 
G
A
 
K
L
 
L
V
 
V
K
 
M
V
 
A
I
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
I
C
 
C
D
 
H
I
 
M
L
 
L
I
 
L
A
 
G
D
 
E
K
 
K
Q
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
Q
A
 
E
V
 
V
K
 
E
G
 
G
I
 
M
C
 
C
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
D
 
E
G
 
D
S
 
G
V
 
I
V
 
I
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
Y
 
F
A
 
A
W
 
W
F
 
F
G
 
V
R
 
K
-
 
H
-
 
G
V
 
V
L
 
S
G
 
A
W
 
A
P
 
T
L
 
F
E
 
D
Q
 
E
L
 
A
A
 
Q
A
 
E
Q
 
K
H
 
G
P
 
V
E
 
N
L
 
V
K
 
H
T
 
A
Q
 
L
I
 
L
N
 
E
A
 
E
S
 
K
Q
 
A
K
 
S
Q
 
Q
L
 
L
L
 
R
P
 
P
A
 
G
L
 
E
T
 
S
E
 
G
A
 
L
W
 
L
A
 
A
K
 
-
N
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
D
W
 
W
F
 
W
N
 
N
G
 
G
R
 
N
R
 
R
T
 
S
P
 
I
N
 
L
A
 
V
N
 
D
Q
 
T
R
 
E
L
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
L
T
 
L
D
 
G
L
 
Y
N
 
T
L
 
L
A
 
Q
T
 
T
D
 
K
A
 
P
P
 
E
L
 
E
L
 
I
F
 
Y
G
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
I
M
 
V
E
 
D
C
 
A
F
 
F
T
 
H
D
 
G
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
E
V
 
V
N
 
H
N
 
E
V
 
L
M
 
Y
A
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
P
R
 
Q
K
 
K
N
 
N
Q
 
H
V
 
L
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
I
C
 
F
C
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
T
N
 
N
R
 
R
P
 
E
L
 
I
Q
 
K
I
 
V
V
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
K
Q
 
Q
C
 
T
C
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
M
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
G
V
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
G
H
 
Y
A
 
D
D
 
S
I
 
I
P
 
E
S
 
E
A
 
A
Q
 
A
Q
 
K
K
 
K
M
 
M
A
 
G
S
 
R
A
 
V
V
 
K
E
 
D
K
 
E
T
 
T
L
 
F
Q
 
K
P
 
P
C
 
I
S
 
P
E
 
E
Q
 
H
A
 
V
Q
 
A
R
 
I
F
 
Y
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
E
Y
 
Y

3l0qA The crystal structure of xlylulose kinase from yersinia pseudotuberculosis
26% identity, 82% coverage: 80:541/566 of query aligns to 72:528/541 of 3l0qA

query
sites
3l0qA
V
 
V
V
 
K
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
F
D
 
D
S
 
A
T
|
T
G
x
C
S
 
S
T
 
L
P
 
V
A
 
V
P
 
-
I
 
L
D
 
D
A
 
K
D
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
P
L
 
L
A
 
T
L
 
V
R
 
S
P
 
P
E
 
S
F
 
G
A
 
R
E
 
N
N
 
E
P
 
Q
N
 
N
A
 
V
M
 
-
F
 
-
V
 
I
L
 
V
W
|
W
K
 
M
D
 
D
H
 
H
T
 
R
A
 
A
V
 
I
E
 
T
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
E
 
R
I
 
I
T
 
N
R
 
A
L
 
T
C
 
K
H
 
H
A
 
P
P
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
V
S
 
L
R
 
E
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
Y
 
I
S
 
S
S
 
P
E
 
E
W
 
M
F
 
Q
W
 
T
A
 
P
K
 
K
I
 
L
L
 
L
H
 
W
V
 
L
T
 
K
R
 
Q
Q
 
H
D
 
M
S
 
P
A
 
N
V
 
T
A
 
W
Q
 
S
S
 
N
A
 
V
A
 
G
S
 
H
W
 
L
I
 
F
E
 
D
L
 
L
C
 
P
D
 
D
W
 
F
V
 
L
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
T
T
 
W
R
 
R
-
 
A
P
 
T
Q
 
K
D
 
D
I
 
E
R
 
T
R
 
R
G
 
S
R
 
L
C
 
C
S
 
S
A
 
T
-
 
V
-
 
C
-
x
K
-
 
W
-
 
T
-
 
Y
-
 
L
G
 
G
H
 
H
K
 
E
S
 
D
L
 
R
W
 
W
H
 
D
E
 
P
S
 
S
W
 
Y
G
 
F
G
 
K
L
 
L
P
 
-
P
 
-
A
 
V
S
 
G
F
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
H
 
N
L
 
N
P
 
A
S
 
A
P
 
K
L
 
I
F
 
G
T
 
A
D
 
T
T
 
V
W
 
K
T
 
P
A
 
M
D
 
G
I
 
A
P
 
P
V
 
L
G
 
G
T
 
H
-
 
G
L
 
L
C
 
S
P
 
Q
E
 
R
W
 
A
A
 
A
Q
 
S
R
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
I
E
 
P
S
 
G
V
 
T
V
 
A
I
 
V
S
 
S
G
 
V
G
 
S
A
 
I
F
 
I
D
|
D
C
x
A
H
 
H
M
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
I
G
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
E
Q
 
N
P
 
A
N
 
N
-
 
F
-
 
D
-
 
R
A
 
R
L
 
I
V
 
A
K
 
L
V
 
I
I
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
T
 
T
C
 
A
D
 
H
I
 
M
L
 
A
I
 
M
A
 
-
D
 
-
K
 
-
Q
 
-
S
 
S
V
 
R
G
 
S
E
 
A
R
 
H
A
 
F
V
 
I
K
 
S
G
 
G
I
 
I
C
 
W
G
 
G
Q
 
P
V
 
Y
D
 
Y
G
 
S
S
 
A
V
 
I
V
 
L
P
 
P
G
 
E
F
 
Y
I
 
W
G
 
L
L
 
N
E
|
E
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
T
G
 
G
D
 
A
I
 
L
Y
 
-
A
 
-
W
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
I
E
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
I
A
 
Q
Q
 
S
H
 
H
P
 
P
-
 
C
-
 
Y
-
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
L
T
 
E
Q
 
Q
I
 
A
N
 
K
A
 
N
S
 
K
Q
 
G
K
 
E
Q
 
T
L
 
I
L
 
Y
P
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
N
-
 
Y
-
 
I
-
 
L
E
 
R
A
 
Q
W
 
M
A
 
A
K
 
G
N
 
E
P
 
P
S
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
F
L
 
L
D
 
T
H
 
N
L
 
D
P
 
I
V
 
H
V
 
M
L
 
L
D
 
P
W
 
Y
F
 
F
N
 
H
G
 
G
R
 
N
R
 
R
T
 
S
P
 
P
N
 
R
A
 
A
N
 
N
Q
 
P
R
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
G
L
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
S
T
 
T
-
 
T
-
 
P
-
 
E
D
 
D
A
 
M
P
 
A
L
 
L
L
 
R
F
 
Y
G
 
L
G
 
A
L
 
T
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
T
 
L
A
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
H
I
 
I
M
 
I
E
 
E
C
 
T
F
 
M
T
 
N
D
 
Q
Q
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
N
V
 
I
N
 
D
N
 
T
V
 
M
M
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
-
A
 
G
R
 
T
K
 
K
N
 
N
Q
 
P
V
 
I
I
 
F
M
 
V
Q
 
Q
A
 
E
C
 
H
C
 
A
D
 
N
V
 
A
L
 
T
N
 
G
R
 
C
P
 
A
L
 
M
Q
 
L
I
 
L
V
 
P
A
 
E
S
 
E
D
 
S
Q
 
E
C
 
A
C
 
M
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
A
 
A
I
 
M
F
 
M
A
 
G
A
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
G
V
 
V
H
 
F
A
 
E
D
 
S
I
 
L
P
 
P
S
 
E
A
 
A
Q
 
M
Q
 
A
K
 
A
M
 
M
A
 
-
S
 
S
A
 
R
V
 
I
E
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
Q
 
T
P
 
P
C
 
Q
S
 
T
E
 
N
Q
 
K
A
 
I
Q
 
K
-
 
A
R
 
Y
F
 
Y
E
 
D
Q
 
R
L
 
K
Y
 
Y
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
Q
 
H
Q
 
Q

Q5HGD2 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Staphylococcus aureus (strain COL)
28% identity, 27% coverage: 398:550/566 of query aligns to 347:495/498 of Q5HGD2

query
sites
Q5HGD2
F
 
F
N
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
T
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
S
R
 
E
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
T
D
 
E
A
 
K
P
 
E
L
 
H
L
 
F
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
L
A
 
C
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
M
E
 
E
C
 
A
F
 
M
T
 
S
-
 
K
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
Q
N
 
S
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
K
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
I
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
V
N
 
N
R
 
T
P
 
S
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
I
D
 
Q
Q
 
E
C
 
T
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
F
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
W
K
 
E
V
 
S
H
 
K
A
 
D
D
 
D
I
 
I
P
 
A
S
 
K
A
 
N
Q
 
W
Q
 
K
K
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
L
E
 
E
K
 
E
T
 
K
L
 
F
Q
 
D
P
 
P
C
 
K
S
 
M
E
 
D
Q
 
E
A
 
G
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
R
 
G
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
K
W
 
-
A
 
A
M
 
V
S
 
E
A
 
A
E
 
T
Q
 
Q
H
 
V
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

3ge1A 2.7 angstrom crystal structure of glycerol kinase (glpk) from staphylococcus aureus in complex with adp and glycerol
28% identity, 27% coverage: 398:550/566 of query aligns to 348:496/499 of 3ge1A

query
sites
3ge1A
F
 
F
N
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
T
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
S
R
 
E
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
T
D
 
E
A
 
K
P
 
E
L
 
H
L
 
F
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
L
A
 
C
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
M
E
 
E
C
 
A
F
 
M
T
 
S
-
 
K
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
Q
N
 
S
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
|
A
R
 
V
K
 
K
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
I
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
V
N
 
N
R
 
T
P
 
S
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
I
D
 
Q
Q
 
E
C
 
T
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
F
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
W
K
 
E
V
 
S
H
 
K
A
 
D
D
 
D
I
 
I
P
 
A
S
 
K
A
 
N
Q
 
W
Q
 
K
K
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
L
E
 
E
K
 
E
T
 
K
L
 
F
Q
 
D
P
 
P
C
 
K
S
 
M
E
 
D
Q
 
E
A
 
G
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
R
 
G
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
K
W
 
-
A
 
A
M
 
V
S
 
E
A
 
A
E
 
T
Q
 
Q
H
 
V
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

P18157 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
25% identity, 29% coverage: 377:541/566 of query aligns to 326:487/496 of P18157

query
sites
P18157
A
 
S
L
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
S
W
 
Y
A
 
A
K
 
E
N
 
K
P
 
V
S
 
D
L
 
S
D
 
T
H
 
D
L
 
G
P
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
P
W
 
A
F
 
F
N
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
T
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
S
R
 
D
L
 
V
K
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
V
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
T
D
 
T
A
 
K
P
 
E
L
 
H
L
 
F
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
L
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
K
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
D
C
 
A
F
 
M
-
 
E
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
N
I
 
I
A
 
S
V
 
L
N
 
K
N
 
T
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
K
N
 
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
G
D
 
D
V
 
L
L
 
L
N
 
N
R
 
V
P
 
P
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
I
D
 
N
Q
 
E
C
 
T
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
K
D
 
D
I
 
R
P
 
S
S
 
E
A
 
I
Q
 
A
Q
 
N
K
 
Q
M
 
W
A
 
-
S
 
-
A
 
N
V
 
L
E
 
D
K
 
K
T
 
R
L
 
F
Q
 
E
P
 
P
C
 
E
S
 
L
E
 
E
Q
 
E
A
 
E
Q
 
K
R
 
R
F
 
N
E
 
E
Q
 
-
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
R
 
G
Y
 
W
Q
 
Q
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

O34154 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) (see 2 papers)
27% identity, 31% coverage: 377:550/566 of query aligns to 327:496/501 of O34154

query
sites
O34154
A
 
A
L
 
E
T
 
S
E
 
E
A
 
A
W
 
V
A
 
A
K
 
K
N
 
A
P
 
S
S
 
T
L
 
G
D
 
H
H
 
N
L
 
E
P
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
P
W
 
A
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
S
R
 
Q
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
V
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
T
D
 
T
A
 
R
P
 
E
L
 
D
L
 
F
F
 
V
G
 
K
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
V
R
 
R
A
 
D
I
 
I
M
 
I
E
 
D
C
 
T
F
 
M
T
 
K
-
 
E
D
 
D
Q
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
D
V
 
I
N
 
P
N
 
-
V
 
V
M
 
L
A
 
K
L
 
V
G
 
D
G
 
G
I
 
G
A
 
A
R
 
A
K
 
N
N
 
N
Q
 
D
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
N
R
 
T
P
 
A
L
 
V
Q
 
Q
I
 
R
V
 
A
A
 
H
S
 
N
D
 
L
Q
 
E
C
 
T
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
F
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
K
D
 
D
I
 
L
P
 
E
S
 
E
A
 
I
Q
 
-
Q
 
-
K
 
K
M
 
A
A
 
F
S
 
Q
A
 
E
V
 
E
E
 
G
K
 
Q
T
 
Q
L
 
F
Q
 
E
P
 
P
C
 
I
S
 
M
E
 
A
Q
 
E
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
R
 
G
Y
 
W
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
-
A
 
A
M
 
V
S
 
A
A
 
A
E
 
T
Q
 
Q
H
 
Q
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

1gllO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 343:494/494 of 1gllO

query
sites
1gllO
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
A
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1gljO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 343:494/494 of 1gljO

query
sites
1gljO
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
|
A
R
 
V
K
 
A
N
 
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1bwfO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 343:494/494 of 1bwfO

query
sites
1bwfO
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
A
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

P0A6F3 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Escherichia coli (strain K12) (see 10 papers)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 349:500/502 of P0A6F3

query
sites
P0A6F3
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
A
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
x
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
x
E
R
|
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1bu6Y Crystal structures of escherichia coli glycerol kinase and the mutant a65t in an inactive tetramer: conformational changes and implications for allosteric regulation (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 347:498/499 of 1bu6Y

query
sites
1bu6Y
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
A
N
 
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1gldG Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 338:489/489 of 1gldG

query
sites
1gldG
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
|
A
R
 
V
K
 
A
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1glcG Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 338:489/489 of 1glcG

query
sites
1glcG
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
|
A
R
 
V
K
 
A
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1glbG Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 338:489/489 of 1glbG

query
sites
1glbG
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
|
A
R
 
V
K
 
A
N
|
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1glfO Crystal structures of escherichia coli glycerol kinase and the mutant a65t in an inactive tetramer: conformational changes and implications for allosteric regulation (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 347:498/498 of 1glfO

query
sites
1glfO
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
|
G
I
 
-
A
|
A
R
 
V
K
 
A
N
 
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1bo5O Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate. (see paper)
26% identity, 27% coverage: 398:549/566 of query aligns to 347:498/498 of 1bo5O

query
sites
1bo5O
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
P
R
 
Y
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
P
 
N
L
 
H
L
 
I
F
 
I
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
T
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
V
M
 
L
E
 
E
C
 
A
F
 
M
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
N
 
H
N
 
A
V
 
L
M
 
R
A
 
V
L
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
-
A
 
A
R
 
V
K
 
A
N
 
N
Q
 
N
V
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
G
R
 
T
P
 
R
L
 
V
Q
 
E
I
 
R
V
 
P
A
 
E
S
 
V
D
 
R
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
Q
D
 
N
I
 
L
P
 
D
S
 
E
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
K
 
K
M
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
K
 
R
T
 
E
L
 
F
Q
 
R
P
 
P
C
 
G
S
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
Y
 
N
R
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
R
A
 
A
M
 
M
S
 
A
A
 
W
E
 
E
Q
 
E
H
 
H

Sites not aligning to the query:

2w41B Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with adp (see paper)
24% identity, 20% coverage: 398:511/566 of query aligns to 356:470/507 of 2w41B

query
sites
2w41B
F
 
F
N
 
S
G
 
G
R
 
L
R
 
Y
T
 
A
P
 
P
N
 
R
A
 
W
N
 
R
Q
 
S
R
 
D
L
 
A
K
 
R
G
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
Y
D
 
G
L
 
M
N
 
T
L
 
F
A
 
N
T
 
T
D
 
E
A
 
R
P
 
S
L
 
H
L
 
I
F
 
V
G
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
E
A
 
G
T
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
Q
A
 
L
R
 
N
A
 
E
I
 
I
M
 
V
E
 
D
C
 
S
F
 
L
T
 
T
-
 
S
D
 
D
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
M
N
 
L
N
 
H
V
 
V
M
 
L
A
 
R
L
 
C
G
 
D
G
 
G
I
x
G
A
x
M
R
 
T
K
 
K
N
|
N
Q
 
K
V
 
P
I
 
F
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
N
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
N
R
 
T
P
 
K
L
 
I
Q
 
E
I
 
V
V
 
S
A
 
K
S
 
Y
D
 
K
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
E
A
 
V
K
 
K
V
 
I
H
 
W
A
 
D
D
 
S
I
 
L
P
 
D
S
 
S
A
 
V
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

2w40A Crystal structure of plasmodium falciparum glycerol kinase with bound glycerol (see paper)
24% identity, 20% coverage: 398:511/566 of query aligns to 350:464/501 of 2w40A

query
sites
2w40A
F
 
F
N
 
S
G
 
G
R
 
L
R
 
Y
T
 
A
P
 
P
N
 
R
A
 
W
N
 
R
Q
 
S
R
 
D
L
 
A
K
 
R
G
 
A
V
 
S
I
 
I
T
 
Y
D
 
G
L
 
M
N
 
T
L
 
F
A
 
N
T
 
T
D
 
E
A
 
R
P
 
S
L
 
H
L
 
I
F
 
V
G
 
R
G
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
E
A
 
G
T
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
Q
A
 
L
R
 
N
A
 
E
I
 
I
M
 
V
E
 
D
C
 
S
F
 
L
T
 
T
-
 
S
D
 
D
Q
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
M
N
 
L
N
 
H
V
 
V
M
 
L
A
 
R
L
 
C
G
 
D
G
 
G
I
 
G
A
 
M
R
 
T
K
 
K
N
 
N
Q
 
K
V
 
P
I
 
F
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
N
C
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
I
N
 
N
R
 
T
P
 
K
L
 
I
Q
 
E
I
 
V
V
 
S
A
 
K
S
 
Y
D
 
K
Q
 
E
C
 
V
C
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
E
A
 
V
K
 
K
V
 
I
H
 
W
A
 
D
D
 
S
I
 
L
P
 
D
S
 
S
A
 
V
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

O34153 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Enterococcus casseliflavus (Enterococcus flavescens) (see 3 papers)
25% identity, 30% coverage: 379:550/566 of query aligns to 330:497/506 of O34153

query
sites
O34153
T
 
S
E
 
E
A
 
E
W
 
L
A
 
A
K
 
A
N
 
K
P
 
A
S
 
K
L
 
G
D
 
D
H
 
N
L
 
E
P
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
P
W
 
A
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
S
R
 
E
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
V
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
T
D
 
T
A
 
K
P
 
E
L
 
D
L
 
F
F
 
V
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
S
R
 
K
A
 
D
I
 
V
M
 
I
E
 
D
C
 
T
F
 
M
T
 
K
-
 
K
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
D
V
 
I
N
 
P
N
 
-
V
 
L
M
 
L
A
 
K
L
 
V
G
 
D
G
 
G
I
 
G
A
 
A
R
 
A
K
 
K
N
 
N
Q
 
D
V
 
L
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
D
R
 
I
P
 
D
L
 
V
Q
 
Q
I
 
R
V
 
A
A
 
A
S
 
N
D
 
L
Q
 
E
C
 
T
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
K
D
 
D
I
 
L
P
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
D
K
 
E
M
 
L
A
 
K
S
 
S
A
 
M
V
 
A
E
 
E
K
 
E
T
 
G
L
 
Q
Q
 
M
P
 
F
C
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
M
-
 
P
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
F
 
R
E
 
D
Q
 
N
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
R
 
G
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
Q
W
 
-
A
 
A
M
 
V
S
 
A
A
 
A
E
 
T
Q
 
Q
H
 
T
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

3h3nX Glycerol kinase h232r with glycerol (see paper)
25% identity, 30% coverage: 379:550/566 of query aligns to 329:496/501 of 3h3nX

query
sites
3h3nX
T
 
S
E
 
E
A
 
E
W
 
L
A
 
A
K
 
A
N
 
K
P
 
A
S
 
K
L
 
G
D
 
D
H
 
N
L
 
E
P
 
V
V
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
P
W
 
A
F
 
F
N
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
N
 
Y
A
 
W
N
 
D
Q
 
S
R
 
E
L
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
I
 
V
T
 
F
D
 
G
L
 
L
N
 
T
L
 
R
A
 
G
T
 
T
D
 
T
A
 
K
P
 
E
L
 
D
L
 
F
F
 
V
G
 
R
G
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
A
F
 
Y
G
 
Q
A
 
S
R
 
K
A
 
D
I
 
V
M
 
I
E
 
D
C
 
T
F
 
M
T
 
K
-
 
K
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
D
V
 
I
N
 
P
N
 
-
V
 
L
M
 
L
A
 
K
L
 
V
G
 
D
G
 
G
I
 
G
A
 
A
R
 
A
K
 
K
N
 
N
Q
 
D
V
 
L
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
C
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
D
R
 
I
P
 
D
L
 
V
Q
 
Q
I
 
R
V
 
A
A
 
A
S
 
N
D
 
L
Q
 
E
C
 
T
C
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
G
V
 
F
H
 
W
A
 
K
D
 
D
I
 
L
P
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
D
K
 
E
M
 
L
A
 
K
S
 
S
A
 
M
V
 
A
E
 
E
K
 
E
T
 
G
L
 
Q
Q
 
M
P
 
F
C
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
M
-
 
P
A
 
A
Q
 
E
R
 
E
F
 
R
E
 
D
Q
 
N
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
R
 
G
Y
 
W
Q
 
K
Q
 
Q
W
 
-
A
 
A
M
 
V
S
 
A
A
 
A
E
 
T
Q
 
Q
H
 
T
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>14209 FitnessBrowser__Keio:14209
MAIAIGLDFGSDSVRALAVDCATGEEIATSVEWYPRWQKGQFCDAPNNQFRHHPRDYIES
MEAALKTVLAELSVEQRAAVVGIGVDSTGSTPAPIDADGNVLALRPEFAENPNAMFVLWK
DHTAVEEAEEITRLCHAPGNVDYSRYIGGIYSSEWFWAKILHVTRQDSAVAQSAASWIEL
CDWVPALLSGTTRPQDIRRGRCSAGHKSLWHESWGGLPPASFFDELDPILNRHLPSPLFT
DTWTADIPVGTLCPEWAQRLGLPESVVISGGAFDCHMGAVGAGAQPNALVKVIGTSTCDI
LIADKQSVGERAVKGICGQVDGSVVPGFIGLEAGQSAFGDIYAWFGRVLGWPLEQLAAQH
PELKTQINASQKQLLPALTEAWAKNPSLDHLPVVLDWFNGRRTPNANQRLKGVITDLNLA
TDAPLLFGGLIAATAFGARAIMECFTDQGIAVNNVMALGGIARKNQVIMQACCDVLNRPL
QIVASDQCCALGAAIFAAVAAKVHADIPSAQQKMASAVEKTLQPCSEQAQRFEQLYRRYQ
QWAMSAEQHYLPTSAPAQAAQAVATL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory