SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 14712 b0576 phenylalanine transporter (NCBI) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P24207 Phenylalanine-specific permease; Phenylalanine:H(+) symporter PheP from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
100% identity, 100% coverage: 1:458/458 of query aligns to 1:458/458 of P24207

query
sites
P24207
M
 
M
K
 
K
N
 
N
A
 
A
S
 
S
T
 
T
V
 
V
S
 
S
E
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
S
N
 
N
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
L
 
L
H
 
H
R
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
H
N
 
N
R
|
R
H
 
H
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
M
 
M
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
A
 
A
H
 
H
F
|
F
A
 
A
Y
|
Y
K
 
K
Y
|
Y
W
|
W
G
 
G
P
 
P
F
|
F
A
 
A
G
 
G
F
|
F
L
 
L
S
 
S
G
 
G
W
|
W
N
 
N
Y
|
Y
W
|
W
V
 
V
M
 
M
F
|
F
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
T
W
 
W
I
 
I
W
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
F
I
 
I
I
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
F
 
F
W
 
W
F
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
|
K
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
S
 
S
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
W
 
W
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
F
 
F
F
 
F
A
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
M
 
M
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
K
S
 
S
I
 
I
P
 
P
K
 
K
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
W
 
W
V
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
K
S
 
S
N
 
N
S
 
S
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
M
 
M
I
 
I
F
 
F
H
 
H
N
 
N
L
 
L
D
 
D
S
 
S
N
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
N
F
 
F
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
N
 
N
S
 
S
R
 
R
M
 
M
L
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
K
F
 
F
L
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
|
P
I
 
I
N
 
N
S
 
S
L
 
L
M
 
M
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
W
I
 
I
M
 
M
I
 
I
C
 
C
L
 
L
A
 
A
H
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
C
 
C
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
M
 
M
C
 
C
T
 
T
M
 
M
D
 
D
D
 
D
M
 
M
R
 
R
L
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
L
 
L
P
|
P
V
 
V
W
 
W
I
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
F
 
F
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
K

P15993 Aromatic amino acid transport protein AroP; Aromatic amino acid:H(+) symporter AroP; General aromatic amino acid permease; General aromatic transport system from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
65% identity, 94% coverage: 19:448/458 of query aligns to 11:440/457 of P15993

query
sites
P15993
L
 
L
H
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
K
N
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
I
 
S
G
 
A
P
 
S
A
 
V
I
 
I
Q
 
Q
M
 
S
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
I
L
 
I
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
F
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
I
 
I
M
 
M
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
V
S
 
A
G
 
G
S
 
S
F
 
F
A
 
S
H
 
H
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
G
 
G
P
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
A
S
 
S
G
 
G
W
 
W
N
 
N
Y
 
Y
W
 
W
V
 
V
M
 
L
F
x
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
K
Y
 
Y
M
 
I
Q
 
Q
Y
 
F
W
 
W
F
 
Y
P
 
P
D
 
E
V
 
I
P
 
P
T
 
T
W
 
W
I
 
V
W
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
V
F
 
F
F
 
F
I
 
V
I
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
T
N
 
N
V
 
V
R
 
K
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
M
E
 
E
F
 
F
W
 
W
F
 
F
A
 
A
L
 
I
I
 
I
K
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
A
M
 
M
I
 
I
G
 
I
F
 
F
G
 
G
L
 
G
W
 
W
L
 
L
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
G
H
 
N
G
 
G
G
 
G
E
 
P
K
 
Q
A
 
A
S
 
T
I
 
V
D
 
S
N
 
N
L
 
L
W
 
W
R
 
D
Y
 
Q
G
 
G
G
 
G
F
 
F
F
 
L
A
 
P
T
 
H
G
 
G
W
 
F
N
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
V
L
 
M
S
 
M
L
 
M
A
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
D
D
 
N
P
 
P
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
I
 
I
P
 
P
K
 
K
A
 
A
V
 
T
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
W
 
W
V
 
T
E
 
R
V
 
V
K
 
T
S
 
A
N
 
D
S
 
T
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
M
 
L
I
 
I
F
 
F
H
 
H
N
 
E
L
 
L
D
 
G
S
 
D
N
 
T
V
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
F
 
I
V
 
V
I
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
S
 
S
G
 
C
V
 
V
Y
 
Y
S
 
C
N
 
N
S
 
S
R
 
R
M
 
M
L
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
A
V
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
K
F
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
S
V
 
V
S
 
D
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
V
N
 
N
S
 
T
L
 
I
M
 
L
L
 
V
S
 
S
G
 
A
A
 
L
I
 
V
T
 
T
S
 
A
L
 
L
V
 
C
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
P
 
P
Q
 
E
K
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
S
T
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
I
N
 
N
W
 
W
I
 
A
M
 
M
I
 
I
C
 
S
L
 
L
A
 
A
H
 
H
L
 
M
R
 
K
F
 
F
R
 
R
A
 
R
A
 
A
M
 
K
R
 
Q
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
V
E
 
V
T
 
T
Q
 
R
F
 
F
K
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
L
G
 
G
N
 
N
Y
 
W
L
 
I
C
 
C
I
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
M
G
 
A
M
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
I
M
 
M
C
 
L
T
 
M
M
 
T
D
 
P
D
 
G
M
 
M
R
 
A
L
 
I
S
 
S
A
 
V
I
 
Y
L
 
L
L
 
I
P
 
P
V
 
V
W
 
W
I
 
L
V
 
I
F
 
V
L
 
L

P46349 Gamma-aminobutyric acid permease; GABA permease; 4-aminobutyrate permease; Gamma-aminobutyrate permease; Proline transporter GabP from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 14:458/458 of query aligns to 2:449/469 of P46349

query
sites
P46349
N
 
N
Q
 
Q
E
 
S
P
 
Q
T
 
S
-
 
G
L
 
L
H
 
K
R
 
K
G
 
E
L
 
L
H
 
K
N
 
T
R
 
R
H
 
H
I
 
M
Q
 
T
L
 
M
I
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
V
G
|
G
I
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
V
I
 
I
Q
 
H
M
 
S
A
 
T
G
|
G
P
 
P
A
 
G
V
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
S
Y
 
Y
G
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
A
 
V
F
 
I
L
 
F
I
 
I
M
 
M
R
 
R
Q
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
S
V
 
A
E
 
V
E
 
N
P
 
P
V
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
A
 
S
H
 
Q
F
 
Y
A
 
A
Y
 
H
K
 
D
Y
 
A
W
 
I
G
 
G
P
 
P
F
 
W
A
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
T
S
 
I
G
 
G
W
 
W
N
 
L
Y
 
Y
W
 
W
V
 
F
M
 
F
F
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
I
M
 
A
A
 
I
E
 
E
L
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
G
 
A
I
 
G
Y
 
I
M
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
P
 
H
D
 
D
V
 
I
P
 
P
T
 
L
W
 
W
I
 
L
W
 
T
A
 
S
A
 
L
A
 
I
F
 
L
F
 
T
I
 
I
I
 
V
I
 
L
N
 
T
A
 
L
V
 
T
N
 
N
L
 
V
V
 
Y
N
 
S
V
 
V
R
 
K
L
 
S
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
F
 
F
A
 
S
L
 
L
I
 
I
K
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
T
I
 
I
I
 
I
G
 
A
M
 
F
I
 
L
G
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
F
W
 
A
L
 
F
L
 
I
F
 
F
S
 
G
-
 
F
G
 
A
H
 
P
G
 
G
G
 
S
E
 
E
K
 
P
A
 
V
S
 
G
I
 
F
D
 
S
N
 
N
L
 
L
W
 
T
R
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
F
 
F
F
 
F
A
 
P
T
 
E
G
 
G
W
 
I
N
 
S
G
 
S
L
 
V
I
 
L
L
 
L
S
 
G
L
 
I
A
 
V
V
 
V
I
 
V
M
 
I
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
 
M
G
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
I
I
 
V
G
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
E
A
 
T
R
 
S
D
 
N
P
 
P
E
 
I
K
 
E
S
 
S
I
 
V
P
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
T
N
 
R
Q
 
S
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
I
L
 
V
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
S
 
S
L
 
I
V
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
W
 
W
V
 
N
E
 
S
V
 
A
K
 
N
S
 
I
N
 
L
S
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
M
 
A
I
 
V
F
 
L
H
 
E
N
 
H
L
 
I
D
 
G
S
 
V
N
 
P
V
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
Q
A
 
I
L
 
M
N
 
N
F
 
F
V
 
I
I
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
C
Y
 
L
N
 
N
S
 
S
G
|
G
V
 
L
Y
 
Y
S
 
T
N
 
T
S
 
S
R
 
R
M
 
M
L
 
L
F
 
Y
G
 
S
L
 
L
S
 
A
V
 
E
Q
 
R
G
 
N
N
 
E
A
 
A
P
 
P
K
 
R
F
 
R
L
 
F
T
 
M
R
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
V
N
 
Q
S
 
A
L
 
I
M
 
V
L
 
A
S
x
G
G
 
T
A
 
F
I
x
F
T
 
S
S
 
Y
L
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
M
N
 
N
Y
 
Y
L
 
F
L
 
S
P
 
P
Q
 
D
K
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
L
L
 
F
L
 
L
M
 
V
A
 
N
L
 
S
V
 
S
V
 
G
A
 
A
T
 
I
L
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
V
W
 
Y
I
 
L
M
 
V
I
 
I
C
 
A
L
 
V
A
 
S
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
F
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
K
M
 
L
R
 
E
R
 
K
Q
 
T
G
 
N
R
 
P
E
 
E
T
 
A
-
 
L
Q
 
K
F
 
I
K
 
K
A
 
M
L
 
W
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
F
 
F
G
 
L
N
 
T
Y
 
Y
L
 
L
C
 
T
I
 
I
A
 
I
F
 
A
L
 
I
G
 
C
M
x
G
I
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
S
M
 
M
C
 
A
T
 
F
M
 
I
D
 
D
D
 
S
M
 
M
R
 
R
L
 
D
S
 
E
A
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
T
P
 
G
V
 
V
W
 
I
I
 
T
V
 
G
F
 
I
L
 
V
F
 
L
M
 
I
A
 
S
F
 
Y
K
 
L
T
 
V
L
 
F
R
 
R
R
 
K
K
 
R

P25737 Lysine-specific permease LysP; Lysine transporter LysP; Trigger transporter LysP from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
38% identity, 88% coverage: 9:413/458 of query aligns to 3:420/489 of P25737

query
sites
P25737
E
 
S
D
 
E
T
 
T
A
 
K
S
 
T
N
 
T
Q
 
E
E
 
A
P
 
P
T
 
G
L
 
L
H
 
R
R
 
R
G
 
E
L
 
L
H
 
K
N
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
L
Q
 
T
L
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
V
G
 
A
I
 
S
G
 
G
P
 
A
A
 
T
I
 
I
Q
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
-
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
G
 
M
V
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
L
I
 
M
A
 
V
F
 
Y
L
 
F
I
 
L
M
 
M
R
 
T
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
V
 
A
V
 
A
E
 
Y
E
 
M
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
A
 
A
H
 
T
F
 
Y
A
 
G
Y
 
Q
K
 
N
Y
 
Y
W
 
V
G
 
E
P
 
E
F
 
G
A
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
A
S
 
L
G
 
G
W
 
W
N
 
N
Y
|
Y
W
 
W
V
 
Y
M
 
N
F
x
W
V
 
A
L
 
V
V
 
T
G
 
I
M
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
Q
I
 
L
Y
 
V
M
 
M
Q
 
S
Y
 
W
W
 
W
F
 
F
P
 
P
D
 
D
V
 
T
P
 
P
T
 
G
W
 
W
I
 
I
W
 
W
A
 
S
A
 
A
A
 
L
F
 
F
F
 
L
I
 
G
I
 
V
I
 
I
N
 
F
A
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
Y
V
 
I
N
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
G
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
A
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
F
 
F
A
 
S
L
 
L
I
 
I
K
|
K
V
 
V
L
 
T
A
 
T
I
 
V
I
 
I
G
 
V
M
 
F
I
 
I
G
 
I
F
 
V
G
 
G
L
 
V
W
 
L
L
 
M
L
 
I
F
 
I
S
 
G
G
 
I
H
 
F
G
 
K
G
 
G
E
 
A
K
 
Q
A
 
P
S
 
A
I
 
G
D
 
W
N
 
S
L
 
N
W
 
W
R
 
T
Y
 
I
G
 
G
-
 
E
G
 
A
F
 
P
F
 
F
A
 
A
T
 
G
G
 
G
W
 
F
N
 
A
G
 
A
L
 
M
I
 
I
L
 
G
S
 
V
L
 
A
A
 
M
V
 
I
I
 
V
M
 
G
F
|
F
S
 
S
F
 
F
G
 
Q
G
 
G
L
 
T
E
|
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
G
E
|
E
A
 
S
R
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
A
K
 
K
S
 
N
I
 
I
P
 
P
K
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
R
Q
 
Q
V
 
V
V
 
F
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
G
 
F
S
 
A
L
 
I
V
 
L
V
 
I
L
 
I
L
 
S
A
 
L
L
 
I
Y
 
I
P
 
P
W
 
Y
V
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
N
E
x
D
V
 
V
K
 
K
S
x
D
N
 
I
S
 
S
-
 
V
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
T
M
 
L
I
 
V
F
 
F
H
 
Q
N
 
H
L
 
A
D
 
G
S
 
L
N
 
L
V
 
S
V
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
V
L
 
M
N
 
N
F
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
A
Y
 
G
N
 
N
S
 
S
G
 
G
V
 
M
Y
 
Y
S
 
A
N
 
S
S
 
T
R
 
R
M
 
M
L
 
L
F
 
Y
G
 
T
L
 
L
S
 
A
V
 
C
Q
 
D
G
 
G
N
 
K
A
 
A
P
 
P
K
 
R
F
 
I
L
 
F
T
 
A
R
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
R
N
 
N
S
 
A
L
 
L
M
 
Y
L
 
A
S
 
T
G
 
T
A
 
V
I
 
I
T
 
A
S
 
G
L
 
L
V
 
C
V
 
F
L
 
L
I
 
T
N
 
S
Y
 
M
L
 
F
L
 
G
P
 
N
Q
 
Q
K
 
T
A
 
V
F
 
Y
G
 
L
L
 
W
L
 
L
M
 
L
A
 
N
L
 
T
V
 
S
V
 
G
A
 
M
T
 
T
L
 
G
L
 
F
L
 
I
N
 
A
W
 
W
I
 
L
M
 
G
I
 
I
C
 
A
L
 
I
A
 
S
H
 
H
L
 
Y
R
 
R
F
 
F
R
 
R
A
 
R
A
 
G
M
 
Y
R
 
V
R
 
L
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
E
 
D
T
 
I
Q
 
N
-
 
D
-
 
L
-
 
P
F
 
Y
K
 
R
A
 
S
L
 
G
L
 
F
Y
 
F
P
 
P
F
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P04817 Arginine permease CAN1; Canavanine resistance protein 1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
36% identity, 92% coverage: 8:428/458 of query aligns to 73:513/590 of P04817

query
sites
P04817
S
 
D
E
 
E
D
 
D
T
 
E
A
 
G
S
 
E
N
 
V
Q
 
Q
E
 
N
P
 
A
T
 
E
L
 
V
H
 
K
R
 
R
G
 
E
L
 
L
H
 
K
N
 
Q
R
 
R
H
 
H
I
 
I
Q
 
G
L
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
L
G
 
S
P
 
T
A
x
P
I
 
L
Q
 
T
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
-
 
V
A
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
G
 
L
V
 
F
A
 
M
G
 
G
I
 
S
I
 
L
A
 
A
F
 
Y
L
 
S
I
 
V
M
 
T
R
 
Q
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
A
V
 
T
E
 
F
E
 
I
P
|
P
V
|
V
S
 
T
G
 
S
S
|
S
F
 
F
A
 
T
H
 
V
F
 
F
A
 
S
Y
 
Q
K
 
R
Y
 
F
W
 
L
G
 
S
P
 
P
F
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
A
L
 
A
S
 
N
G
 
G
W
 
Y
N
 
M
Y
|
Y
W
 
W
V
 
F
M
 
S
F
 
W
V
 
A
L
 
I
V
 
T
G
 
F
M
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
S
A
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
Q
Y
 
V
M
 
I
Q
 
Q
Y
 
F
W
 
W
F
 
T
P
 
Y
D
 
K
V
 
V
P
 
P
T
 
L
W
 
A
I
 
A
W
 
W
A
 
I
A
 
S
A
 
I
F
 
F
F
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
I
N
 
T
A
 
I
V
 
M
N
 
N
L
 
L
V
 
F
N
 
P
V
 
V
R
 
K
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
E
F
 
F
W
 
W
F
 
V
A
 
A
L
 
S
I
 
I
K
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
M
 
F
I
 
L
G
 
I
F
 
Y
G
 
-
L
 
C
W
 
F
L
 
C
L
 
M
F
 
V
S
 
C
G
 
G
H
 
A
G
 
G
G
 
V
E
 
T
K
 
G
A
 
P
S
 
V
I
 
G
D
 
F
N
 
R
L
 
Y
W
 
W
R
 
R
Y
 
N
G
 
P
G
 
G
F
 
A
F
 
W
A
 
G
T
 
P
G
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
R
W
 
F
N
 
L
G
 
G
L
 
W
I
 
V
L
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
I
V
 
N
I
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
T
F
 
F
G
 
Q
G
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
A
A
x
G
E
 
E
A
 
A
R
 
A
D
 
N
P
|
P
E
 
R
K
 
K
S
 
S
I
 
V
P
 
P
K
 
R
A
 
A
V
 
I
N
 
K
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
F
L
 
I
L
 
G
A
 
L
L
 
L
Y
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
N
E
 
D
V
 
P
K
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
-
 
S
-
x
T
-
x
S
-
x
Y
S
 
V
N
 
S
S
 
T
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
I
M
 
I
I
 
A
F
 
I
H
 
E
N
 
N
L
 
S
D
 
G
S
 
T
N
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
P
S
 
H
A
 
I
L
 
F
N
 
N
F
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
T
A
 
T
S
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
A
Y
 
A
N
 
N
S
 
S
G
 
N
V
 
I
Y
 
Y
S
 
V
N
 
G
S
 
S
R
 
R
M
 
I
L
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
K
Q
 
N
G
 
K
N
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
K
F
 
F
L
 
L
T
 
S
R
 
R
V
 
T
S
 
T
R
 
K
R
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
Y
N
 
I
S
 
A
L
 
V
M
 
F
L
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
F
T
 
G
S
 
A
L
 
L
V
 
A
V
 
Y
L
 
M
I
 
E
N
 
T
Y
 
S
L
 
T
L
 
G
P
 
G
Q
 
D
K
 
K
A
 
V
F
 
F
G
 
E
L
x
W
L
 
L
M
 
L
A
 
N
L
 
I
V
 
T
V
 
G
A
 
V
T
 
A
L
 
G
L
x
F
L
 
F
N
 
A
W
 
W
I
 
L
M
 
F
I
 
I
C
 
S
L
 
I
A
 
S
H
 
H
L
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
M
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
R
 
K
R
 
Y
Q
 
R
G
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
R
R
 
D
E
 
E
T
 
L
Q
 
P
F
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
K
L
 
L
Y
 
M
P
 
P
F
 
G
G
 
L
N
 
A
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
A
I
 
A
A
 
T
F
 
F
L
 
M
G
 
T
M
 
I
I
 
I
L
 
I
L
 
I
L
 
I
M
 
Q

Q9URZ4 Cationic amino acid transporter 1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
33% identity, 93% coverage: 2:428/458 of query aligns to 68:502/587 of Q9URZ4

query
sites
Q9URZ4
K
 
K
N
 
P
A
 
A
S
 
K
T
 
A
V
 
T
S
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
G
A
 
T
S
 
A
N
 
-
Q
 
-
E
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
L
H
 
K
R
 
R
G
 
S
L
 
L
H
 
K
N
 
S
R
 
R
H
 
H
I
 
M
Q
 
Q
L
 
M
I
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
L
 
V
G
 
G
I
 
S
G
 
G
P
 
S
A
 
S
I
 
L
Q
 
A
M
 
D
A
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
A
-
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
N
Y
 
Y
G
 
S
V
 
L
A
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
M
A
 
M
F
 
F
L
 
F
I
 
I
M
 
V
R
 
Y
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
V
 
A
V
 
V
E
 
A
E
 
Y
P
 
P
V
 
V
S
 
A
G
 
G
S
 
G
F
 
F
A
 
N
H
 
T
F
 
Y
A
 
A
Y
 
T
K
 
R
Y
 
F
W
 
I
G
 
D
P
 
P
F
 
A
A
 
W
G
 
G
F
 
F
L
 
A
S
 
V
G
 
S
W
 
W
N
 
N
Y
 
Y
W
 
F
V
 
I
M
 
N
F
 
Y
V
 
F
L
 
V
V
 
T
G
 
F
M
 
P
A
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
T
A
 
C
G
 
A
I
 
I
Y
 
T
M
 
F
Q
 
R
Y
 
Y
W
 
W
F
 
-
P
 
T
D
 
D
V
 
I
P
 
N
T
 
S
W
 
A
I
 
A
W
 
W
A
 
I
A
 
S
A
 
I
F
 
F
F
 
L
I
 
V
I
 
V
I
 
I
N
 
I
A
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
V
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
V
E
 
E
F
 
F
W
 
I
F
 
L
A
 
S
L
 
T
I
 
V
K
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
T
I
 
F
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
I
F
 
L
G
 
A
L
 
I
W
 
I
L
 
I
L
 
N
F
 
C
S
 
G
G
 
G
H
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
V
S
 
P
I
 
T
D
 
D
N
 
H
L
 
R
W
 
G
R
 
Y
Y
 
I
G
 
G
G
 
G
F
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
H
-
 
K
-
 
P
F
 
F
A
 
R
T
 
H
G
 
G
W
 
F
N
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
C
L
 
S
S
 
V
L
 
F
A
 
T
V
 
T
I
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
V
R
 
D
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
S
 
A
I
 
L
P
 
P
K
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
K
Q
 
Q
V
 
V
V
 
F
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
L
 
I
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
G
 
V
S
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
L
L
 
I
L
 
G
A
 
L
L
 
L
Y
 
I
P
 
S
W
 
P
V
 
D
E
 
D
V
 
P
K
 
N
-
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
S
S
 
T
N
 
S
S
 
V
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
M
 
L
I
 
A
F
 
I
H
 
K
N
 
E
L
 
A
D
 
N
S
 
I
N
 
K
V
 
G
V
 
L
A
 
P
S
 
S
A
 
V
L
 
F
N
 
N
F
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
I
A
 
S
S
 
V
L
 
V
S
 
S
V
 
V
Y
 
T
N
 
N
S
 
S
G
 
S
V
 
T
Y
 
Y
S
 
T
N
 
A
S
 
G
R
 
R
M
 
T
L
 
L
F
 
H
G
 
G
L
 
M
S
 
A
V
 
N
Q
 
L
G
 
K
N
 
Q
A
 
A
P
 
P
K
 
S
F
 
F
L
 
F
T
 
K
R
 
Y
V
 
T
S
 
D
R
 
R
R
 
L
G
 
G
V
 
R
P
 
P
I
 
L
N
 
L
S
 
A
L
 
M
M
 
I
L
 
V
S
 
V
G
 
-
A
 
L
I
 
L
T
 
F
S
 
G
L
 
F
V
 
F
V
 
A
L
 
Y
I
 
I
N
 
N
Y
 
E
L
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
N
-
 
D
L
 
V
P
 
S
Q
 
D
K
 
T
A
 
V
F
 
F
G
 
N
L
 
W
L
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
S
V
 
G
A
 
L
T
 
S
L
 
N
L
 
F
L
 
F
N
 
T
W
 
W
I
 
G
M
 
S
I
 
I
C
 
C
L
 
L
A
 
C
H
 
H
L
 
I
R
 
I
F
 
F
R
 
R
A
 
L
A
 
A
M
 
F
R
 
K
R
 
K
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
E
 
S
T
 
L
Q
 
K
F
 
E
K
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
V
Y
 
S
P
 
P
F
 
M
G
 
G
N
 
I
Y
 
W
-
 
G
L
 
S
C
 
C
I
 
I
A
 
G
F
 
L
L
 
F
G
 
F
M
 
N
I
 
I
L
 
L
L
 
C
L
 
L
M
 
M

Sites not aligning to the query:

P19145 General amino-acid permease GAP1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 3 papers)
36% identity, 88% coverage: 15:415/458 of query aligns to 83:500/602 of P19145

query
sites
P19145
Q
 
Q
E
 
T
P
 
P
T
 
L
L
 
K
H
 
H
R
 
H
G
 
-
L
 
L
H
 
K
N
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
Q
 
Q
L
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
L
 
V
G
 
G
I
 
S
G
 
G
P
 
T
A
 
A
I
 
L
Q
 
R
M
 
T
A
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
L
L
 
L
-
 
I
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
V
 
S
A
 
T
G
 
G
I
 
T
I
 
M
A
 
I
F
 
Y
L
 
A
I
 
M
M
 
V
R
 
M
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
V
 
A
V
 
V
E
 
I
E
 
F
P
 
P
V
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
G
F
 
F
A
 
T
H
 
T
F
 
Y
A
 
A
Y
 
T
K
 
R
Y
 
F
W
 
I
G
 
D
P
 
E
F
 
S
A
 
F
G
 
G
F
 
Y
L
 
A
S
 
N
G
 
N
W
 
F
N
 
N
Y
 
Y
W
 
M
V
 
L
M
 
Q
F
 
W
V
 
L
L
 
V
V
 
V
G
 
L
M
 
P
A
 
L
E
 
E
L
 
I
T
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
S
I
 
I
Y
 
T
M
 
V
Q
 
N
Y
 
F
W
 
W
F
 
G
P
 
T
D
 
D
V
 
-
P
 
P
T
 
K
W
 
Y
I
 
R
-
 
D
-
 
G
W
 
F
A
 
V
A
 
A
A
 
L
F
 
F
F
 
W
I
 
L
I
 
A
I
 
I
N
 
V
A
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
M
V
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
G
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
A
E
 
E
F
 
F
W
 
V
F
 
F
A
 
S
L
 
F
I
 
I
K
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
T
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
I
 
I
G
 
I
F
 
L
G
 
G
L
 
I
W
 
I
L
 
L
L
 
N
F
 
C
S
 
G
G
 
G
H
 
G
G
 
P
G
 
T
E
 
G
K
 
G
A
 
Y
S
 
I
I
 
G
D
 
G
N
 
K
L
 
Y
W
 
W
R
 
H
Y
 
D
G
 
P
G
 
G
F
 
A
F
 
F
A
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
T
-
 
P
-
 
G
T
 
A
G
 
K
W
 
F
N
 
K
G
 
G
L
 
V
I
 
C
L
 
S
S
 
V
L
 
F
A
 
V
V
 
T
I
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
x
A
G
 
G
L
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
A
A
 
A
A
 
S
E
 
E
A
 
S
R
 
V
D
 
E
P
 
P
E
 
R
K
 
K
S
 
S
I
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
A
V
 
A
N
 
K
Q
 
Q
V
 
V
V
 
F
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
T
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
G
 
L
S
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
M
L
 
I
L
 
G
A
 
L
L
 
L
Y
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
N
E
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
S
V
 
V
K
 
D
S
 
A
N
 
A
S
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
M
 
I
I
 
A
F
 
I
H
 
K
N
 
T
L
 
H
D
 
G
S
 
I
N
 
K
V
 
G
V
 
L
A
 
P
S
 
S
A
 
V
L
 
V
N
 
N
F
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
Y
 
G
N
 
N
S
 
S
G
 
A
V
 
I
Y
 
Y
S
 
A
N
 
C
S
 
S
R
 
R
M
 
T
L
 
M
F
 
V
G
 
A
L
 
L
S
 
A
V
 
E
Q
 
Q
G
 
R
N
 
F
A
 
L
P
 
P
K
 
E
F
 
I
L
 
F
T
 
S
R
 
Y
V
 
V
S
 
D
R
 
R
R
 
K
G
 
G
V
 
R
P
 
P
I
 
L
N
 
V
S
 
G
L
 
I
M
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
A
I
 
V
T
 
T
S
 
S
L
 
A
V
 
F
V
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
A
Y
 
F
L
 
V
L
 
A
P
 
A
Q
 
S
K
 
K
A
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
F
 
F
G
 
N
L
 
W
L
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
S
V
 
G
A
 
L
T
 
S
L
 
S
L
 
L
L
 
F
N
 
T
W
 
W
I
 
G
M
 
G
I
 
I
C
 
C
L
 
I
A
 
C
H
 
H
L
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
A
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
D
E
 
E
T
 
L
Q
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
P
L
 
T
Y
 
G
P
 
V
F
 
W
G
 
G
N
 
S
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

P48813 High-affinity glutamine permease from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
29% identity, 92% coverage: 8:428/458 of query aligns to 134:570/663 of P48813

query
sites
P48813
S
 
S
E
 
P
D
 
Q
T
 
E
A
 
Q
S
 
E
N
 
Q
Q
 
K
E
 
Q
P
 
E
T
 
N
L
 
L
H
 
K
R
 
K
G
 
S
L
 
I
H
 
K
N
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
T
Q
 
V
L
 
M
I
 
M
A
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
T
A
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
L
 
V
G
 
G
I
 
N
G
 
S
P
 
K
A
 
V
I
 
L
Q
 
N
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
-
 
G
V
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
V
 
I
A
 
M
G
 
G
I
 
S
I
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
C
I
 
I
M
 
I
R
 
Q
Q
 
A
L
 
C
G
 
G
E
 
E
M
 
L
-
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
Y
E
 
S
P
 
D
V
 
L
S
 
I
G
 
G
S
 
G
F
 
F
A
 
N
H
 
T
F
 
Y
A
 
P
Y
 
L
K
 
F
Y
 
L
W
 
V
G
 
D
P
 
P
F
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
S
S
 
V
G
 
A
W
 
W
N
 
L
Y
 
F
W
 
C
V
 
L
M
 
Q
F
 
W
V
 
L
L
 
C
V
 
V
G
 
C
M
 
P
A
 
L
E
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
T
A
 
A
G
 
S
I
 
M
Y
 
T
M
 
I
Q
 
K
Y
 
Y
W
 
W
F
 
T
P
 
T
D
 
S
V
 
V
P
 
N
T
 
P
W
 
D
I
 
V
W
 
F
A
 
V
A
 
V
A
 
I
F
 
F
F
 
Y
I
 
V
I
 
L
I
 
I
N
 
V
A
 
V
V
 
I
N
 
N
L
 
V
V
 
F
N
 
G
V
 
A
R
 
K
L
 
G
Y
 
Y
G
 
A
E
 
E
T
 
A
E
 
D
F
 
F
W
 
F
F
 
F
A
 
N
L
 
C
I
 
C
K
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
M
I
 
I
I
 
V
G
 
G
M
 
F
I
 
F
G
 
I
F
 
L
G
 
A
L
 
I
W
 
I
L
 
I
L
 
D
F
 
C
S
 
G
G
 
G
H
 
A
G
 
G
G
 
T
E
 
D
K
 
G
A
 
Y
S
 
I
I
 
G
D
 
S
N
 
K
L
 
Y
W
 
W
R
 
R
Y
 
D
G
 
P
G
 
G
F
 
A
F
 
F
A
 
R
T
 
G
G
 
D
-
 
T
-
 
P
-
 
I
-
 
Q
-
 
R
W
 
F
N
 
K
G
 
G
L
 
V
I
 
V
L
 
A
S
 
T
L
 
F
A
 
V
V
 
T
I
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
M
L
 
S
E
 
E
L
 
Q
I
 
L
G
 
A
I
 
M
T
 
T
A
 
A
A
 
S
E
 
E
A
 
Q
R
 
S
D
 
N
P
 
P
E
 
R
K
 
K
S
 
A
I
 
I
P
 
P
K
 
S
A
 
A
V
 
A
N
 
K
Q
 
K
V
 
M
V
 
I
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
F
F
 
V
Y
 
F
I
 
L
G
 
A
S
 
S
L
 
L
V
 
T
V
 
L
L
 
V
L
 
G
A
 
F
L
 
L
Y
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
T
E
 
S
V
 
D
K
 
Q
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
A
S
 
T
N
 
K
S
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
M
 
I
I
 
A
F
 
V
H
 
S
N
 
S
L
 
H
D
 
G
S
 
V
N
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
P
S
 
H
A
 
F
L
 
I
N
 
N
F
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
S
S
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
Y
 
A
N
 
N
S
 
G
G
 
A
V
 
F
Y
 
Y
S
 
T
N
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
I
L
 
L
F
 
M
G
 
S
L
 
L
S
 
A
V
 
K
Q
 
Q
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
K
F
 
C
L
 
F
T
 
D
R
 
Y
V
 
I
S
 
D
R
 
R
R
 
E
G
 
G
V
 
R
P
 
P
I
 
A
N
 
A
S
 
A
L
 
M
M
 
L
L
 
V
S
 
S
G
 
A
A
 
L
I
 
F
T
 
G
S
 
V
L
 
I
V
 
A
V
 
F
L
 
C
I
 
A
N
 
S
Y
 
S
L
 
K
L
 
K
P
 
E
Q
 
E
K
 
D
A
 
V
F
 
F
G
 
T
L
 
W
L
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
I
V
 
S
V
 
G
A
 
L
T
 
S
L
 
Q
L
 
L
L
 
F
N
 
T
W
 
W
I
 
I
M
 
T
I
 
I
C
 
C
L
 
L
A
 
S
H
 
H
L
 
I
R
 
R
F
 
F
R
 
R
A
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
K
R
 
V
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
G
E
 
E
T
 
V
Q
 
G
F
 
Y
K
 
K
A
 
S
L
 
Q
L
 
V
Y
 
G
P
 
V
F
 
W
G
 
G
N
 
S
Y
 
-
L
 
-
C
 
A
I
 
Y
A
 
A
F
 
V
L
 
L
G
 
M
M
 
M
I
 
V
L
 
L
L
 
A
L
 
L
M
 
I

Sites not aligning to the query:

Q03770 SPS-sensor component SSY1; Amino-acid permease homolog SSY1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
28% identity, 87% coverage: 19:418/458 of query aligns to 277:757/852 of Q03770

query
sites
Q03770
L
 
I
H
 
Q
R
 
R
G
 
K
L
 
L
H
 
K
N
 
V
R
 
R
H
 
H
I
 
I
Q
 
Q
L
 
M
I
 
L
A
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
C
I
 
F
G
 
S
T
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
T
I
 
S
G
 
G
P
 
K
A
 
A
I
 
F
Q
 
S
M
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
-
 
F
A
 
G
V
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
A
 
T
G
 
G
I
 
S
I
 
I
A
 
I
F
 
L
L
 
A
I
 
T
M
 
M
R
 
L
Q
 
S
L
 
F
G
 
T
E
 
E
M
 
L
V
 
S
V
 
T
E
 
L
E
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
S
S
 
G
F
 
F
A
 
S
H
 
G
F
 
L
A
 
A
Y
 
S
K
 
R
Y
 
F
W
 
V
G
 
E
P
 
D
F
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
F
L
 
A
S
 
L
G
 
G
W
 
W
N
 
T
Y
 
Y
W
 
W
V
 
I
M
 
S
F
 
C
V
 
M
L
 
L
V
 
A
G
 
L
M
 
P
A
 
A
E
 
Q
L
 
V
T
 
S
A
 
S
A
 
S
G
x
T
I
 
F
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
W
 
Y
F
 
N
P
 
N
D
 
V
V
 
N
P
 
I
T
 
S
W
 
K
I
 
G
W
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
I
I
 
T
I
 
L
I
 
F
N
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
S
-
 
I
-
 
V
V
 
V
N
 
N
L
 
L
V
 
L
N
 
D
V
 
V
R
 
S
L
 
I
Y
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
I
E
 
V
F
 
Y
W
 
V
F
 
A
A
 
G
L
 
I
I
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
I
I
 
A
I
 
I
G
 
L
M
 
M
I
 
V
G
 
-
F
 
F
G
 
T
L
 
M
W
 
I
L
 
I
L
 
L
F
 
N
S
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
N
E
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
Y
-
 
W
-
 
D
-
 
S
K
 
S
A
 
K
S
 
S
I
 
V
D
 
R
N
 
N
L
 
L
W
 
-
R
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
L
F
 
Y
F
 
R
A
 
P
T
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
S
G
 
G
W
 
P
N
 
K
G
 
G
L
 
R
I
 
F
L
 
L
S
 
A
L
 
T
A
 
A
V
 
S
I
 
V
M
 
M
-
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
T
F
 
F
S
 
A
F
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
M
I
 
T
G
 
F
I
 
L
T
 
A
A
 
S
A
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
I
D
 
N
P
 
P
E
 
R
K
 
K
S
 
T
I
 
I
P
 
P
K
 
S
A
 
A
V
 
T
N
 
K
Q
 
R
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
I
-
 
V
-
 
L
V
 
I
V
 
S
Y
 
Y
R
 
V
I
 
F
L
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
S
I
 
V
G
 
G
S
 
I
L
 
N
V
 
I
V
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
Y
Y
 
F
P
 
P
W
 
G
V
 
I
E
 
S
V
 
E
K
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
M
-
 
D
-
 
W
-
 
R
-
 
L
-
 
R
S
 
T
N
 
N
-
 
C
-
 
R
-
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
S
 
S
S
 
S
P
 
P
F
 
W
V
 
V
M
 
V
I
 
A
F
 
L
H
 
Q
N
 
N
L
 
F
D
 
G
S
 
L
N
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
F
N
 
N
F
 
A
V
 
I
I
 
L
L
 
I
V
 
F
A
 
F
S
 
T
L
 
A
S
 
T
V
 
A
Y
 
G
N
 
I
S
 
S
G
 
S
V
 
L
Y
 
F
S
 
S
N
 
C
S
 
S
R
 
R
M
 
T
L
 
L
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
K
A
 
A
P
 
P
K
 
P
F
 
V
L
 
F
T
 
E
R
 
I
V
 
C
S
 
S
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
Y
N
 
V
S
 
S
L
 
V
M
 
I
L
 
F
S
 
S
G
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
L
V
 
F
V
 
S
L
 
V
I
 
I
N
 
A
Y
 
Y
L
 
I
-
 
A
L
 
V
P
 
D
Q
 
Q
K
 
T
A
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
N
F
 
F
G
 
D
L
 
V
L
 
L
M
 
A
A
 
N
L
 
V
V
 
S
V
 
S
A
 
A
T
 
S
L
 
T
L
 
S
L
 
I
N
 
I
W
 
W
I
 
M
M
 
G
I
 
L
C
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
F
L
 
L
R
 
R
F
 
F
R
 
Y
A
 
Y
A
 
A
M
 
L
R
 
K
R
 
Q
Q
 
R
-
 
K
-
 
D
-
 
I
-
 
I
G
 
S
R
 
R
E
 
N
T
 
D
Q
 
S
F
 
S
K
 
Y
A
 
P
L
 
Y
L
 
K
Y
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
Q
N
 
P
Y
 
Y
L
 
L
C
 
A
I
 
I

P76037 Putrescine importer PuuP from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 38% coverage: 75:246/458 of query aligns to 74:242/461 of P76037

query
sites
P76037
G
 
G
E
 
K
M
 
L
V
 
V
V
 
R
E
 
Q
E
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
A
G
 
G
S
 
S
F
 
A
A
 
Y
H
 
T
F
 
Y
A
 
A
Y
 
Q
K
 
K
Y
 
S
W
 
I
G
 
N
P
 
P
F
 
H
A
 
V
G
 
G
F
 
F
L
 
M
S
 
V
G
 
G
W
 
W
N
 
S
Y
 
S
W
 
L
V
 
L
M
 
D
F
x
Y
V
 
L
L
 
F
V
 
L
G
 
P
M
 
M
A
 
I
E
 
N
L
 
V
T
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
S
Y
 
A
W
 
L
F
 
F
P
 
P
D
 
E
V
 
V
P
 
P
T
 
P
W
 
W
I
 
V
W
 
W
A
 
V
A
 
V
A
 
T
F
 
F
F
 
V
I
 
A
I
 
I
I
 
L
N
 
T
A
 
A
V
 
A
N
 
N
L
 
L
V
 
K
N
 
S
V
 
V
R
 
N
L
 
L
Y
 
V
G
 
A
E
 
N
T
 
F
E
 
N
F
 
T
W
 
L
F
 
F
A
 
V
L
 
L
I
 
V
K
 
Q
V
 
I
L
 
S
A
 
I
I
 
M
I
 
V
G
 
V
M
 
F
I
 
I
G
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
F
L
 
L
L
 
V
F
 
V
S
 
Q
G
 
G
-
 
L
H
 
H
G
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
-
A
 
-
S
 
G
I
 
V
D
 
G
N
 
T
L
 
V
W
 
W
R
 
S
Y
 
L
G
 
Q
G
 
P
F
 
F
F
 
I
A
 
S
T
 
E
G
 
N
W
 
A
N
 
H
-
 
L
-
 
I
G
 
P
L
 
I
I
 
I
L
 
T
S
 
G
L
 
A
A
 
T
V
 
I
I
 
V
M
 
C
F
 
F
S
 
S
F
 
F
G
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
L
 
A
I
 
V
G
 
T
I
 
T
T
 
L
A
 
S
A
 
E
E
 
E
A
 
T
R
 
P
D
 
D
P
 
A
E
 
A
K
 
R
S
 
V
I
 
I
P
 
P
K
 
K
A
 
A
V
 
I

P30825 High affinity cationic amino acid transporter 1; CAT-1; CAT1; Ecotropic retroviral leukemia receptor homolog; Ecotropic retrovirus receptor homolog; Solute carrier family 7 member 1; System Y+ basic amino acid transporter from Homo sapiens (Human) (see paper)
23% identity, 83% coverage: 12:393/458 of query aligns to 21:433/629 of P30825

query
sites
P30825
A
 
C
S
 
S
N
 
R
Q
 
E
E
 
E
P
 
T
T
 
R
L
 
L
H
 
S
R
 
R
G
 
C
L
 
L
H
 
N
N
 
T
R
 
F
H
 
D
I
 
L
Q
 
V
L
 
A
I
 
L
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
S
A
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
L
 
V
G
 
L
I
 
A
G
 
G
P
 
A
-
 
V
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
I
G
 
S
Y
 
F
G
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
S
F
 
V
L
 
L
I
 
A
M
 
G
R
 
L
Q
 
C
L
 
Y
G
 
G
E
 
E
M
 
F
V
 
G
V
 
A
E
 
R
E
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
A
A
 
Y
H
 
L
F
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
K
 
V
Y
 
T
W
 
V
G
 
G
P
 
E
F
 
L
A
 
W
G
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
T
G
 
G
W
 
W
N
 
N
Y
 
L
W
 
I
V
 
L
M
 
S
F
 
Y
V
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
P
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
M
E
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
A
A
 
P
G
 
G
I
 
V
Y
 
L
M
 
A
Q
 
E
Y
 
N
W
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
D
V
 
-
P
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
I
W
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
I
F
 
I
F
 
I
I
 
L
I
 
I
I
 
L
N
 
T
A
 
G
V
 
L
N
 
L
L
 
T
V
 
L
N
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
E
Y
 
S
G
 
A
E
 
M
T
 
V
E
 
N
F
 
K
W
 
I
F
 
F
A
 
T
L
 
C
I
 
I
K
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
-
I
 
V
I
 
L
G
 
G
M
 
F
I
 
I
-
 
M
-
 
V
-
 
S
G
 
G
F
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
V
G
 
K
L
 
N
W
 
W
L
 
Q
L
 
L
F
 
T
S
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
F
G
 
G
H
x
N
G
 
T
G
 
S
E
 
G
K
 
R
A
 
L
S
 
C
I
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
D
W
 
T
R
 
K
Y
 
E
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
G
G
 
G
F
 
F
F
 
M
A
 
P
T
 
F
G
 
G
W
 
F
N
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
L
L
 
S
S
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
C
M
 
F
F
 
Y
S
 
A
F
 
F
G
 
V
G
 
G
L
 
F
E
 
D
L
 
C
I
 
I
G
 
A
I
 
T
T
 
T
A
 
G
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
S
 
A
I
 
I
P
 
P
K
 
V
A
 
G
V
 
I
N
 
V
Q
 
A
V
 
S
V
 
L
Y
 
L
R
 
I
I
 
C
L
 
F
L
 
I
F
 
A
Y
 
Y
I
 
F
G
 
G
S
 
V
L
 
S
V
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
L
L
 
M
Y
 
M
P
 
P
W
 
Y
V
 
F
E
 
C
V
 
L
K
 
-
S
 
D
N
 
N
S
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
L
V
 
P
M
 
D
I
 
A
F
 
F
H
 
K
N
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
H
V
 
V
V
 
G
A
 
W
S
 
E
A
 
G
L
 
A
N
 
K
F
 
Y
V
 
A
I
 
V
L
 
A
V
 
V
A
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
C
V
 
A
Y
 
L
N
 
S
S
 
A
G
 
S
V
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
M
Y
 
F
S
 
P
N
 
M
S
 
P
R
 
R
M
 
V
L
 
I
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
S
 
A
V
 
E
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
L
P
 
F
K
 
K
F
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
N
V
 
V
S
 
N
R
 
D
R
 
R
-
 
T
G
 
K
V
 
T
P
 
P
I
 
I
N
 
I
S
 
A
L
 
T
M
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
V
T
 
A
S
 
A
L
 
V
V
 
M
V
 
A
L
 
-
I
 
-
N
 
-
Y
 
F
L
 
L
L
 
F
P
 
D
Q
 
L
K
 
K
A
 
D
F
 
L
G
 
V
L
 
D
L
 
L
M
 
M
A
 
S
L
 
-
V
 
-
V
 
I
A
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
L
-
 
A
L
 
Y
N
 
S
W
 
L
I
 
V
M
 
A
I
 
A
C
 
C
L
 
V
A
 
L
H
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
Y
R
 
Q

P60061 Arginine/agmatine antiporter from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
21% identity, 79% coverage: 28:390/458 of query aligns to 15:373/445 of P60061

query
sites
P60061
I
 
V
Q
 
T
L
 
L
I
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
G
 
N
A
x
I
I
 
M
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
-
I
 
L
G
 
P
P
 
A
A
 
N
I
 
L
Q
 
A
M
 
S
A
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
I
V
 
A
L
 
I
L
 
Y
G
 
G
Y
 
W
G
 
L
V
 
V
A
 
T
G
 
I
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
G
I
 
L
M
 
S
R
 
M
Q
 
V
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
S
V
 
F
E
 
L
E
 
D
P
 
P
V
 
S
S
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
A
 
Y
H
 
A
F
 
Y
A
 
A
Y
 
R
K
 
R
Y
 
C
W
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
S
 
T
G
 
N
W
 
V
N
 
L
Y
|
Y
W
 
W
V
 
L
M
x
A
F
x
C
V
 
W
L
 
I
V
 
G
G
x
N
M
 
I
A
 
A
E
x
M
L
 
V
T
 
V
A
 
I
A
 
G
G
 
V
I
 
G
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
D
 
I
V
 
L
P
 
K
T
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
L
W
 
T
I
 
I
W
 
T
A
 
C
A
 
V
A
 
V
F
 
V
F
 
L
I
 
W
I
 
I
I
 
F
N
 
V
A
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
N
 
G
V
 
P
R
 
K
L
 
M
Y
 
I
G
 
T
E
 
R
T
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
F
 
A
A
 
T
L
 
V
I
 
L
K
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
V
G
 
G
M
 
I
I
 
A
G
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
-
W
 
W
L
 
F
L
 
W
F
 
F
S
 
R
G
 
G
H
 
E
G
 
T
G
 
Y
E
 
M
K
 
A
A
 
A
-
 
W
S
 
N
I
 
V
D
 
S
N
 
G
L
 
L
W
 
G
R
 
T
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
F
 
I
F
 
Q
A
 
S
T
 
T
G
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
T
M
 
L
F
x
W
S
|
S
F
 
F
G
x
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
S
I
 
A
G
 
S
I
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
K
K
 
R
S
 
N
I
 
V
P
 
P
K
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
I
Q
 
G
V
 
G
V
 
V
Y
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
I
 
V
G
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
T
V
 
A
L
 
I
L
 
M
A
 
G
L
 
M
Y
 
I
P
 
P
W
 
N
V
 
A
E
 
A
V
 
L
K
 
R
S
 
V
N
 
S
S
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
M
 
D
I
 
A
F
 
A
H
 
R
N
 
M
L
 
A
D
 
L
S
 
G
N
 
D
V
 
T
V
 
A
A
 
G
S
 
A
A
 
I
L
 
V
N
 
S
F
 
F
V
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
G
S
 
C
L
 
L
S
 
G
V
 
S
Y
 
L
N
 
G
S
 
G
G
x
W
V
 
T
Y
 
L
S
 
L
N
 
A
S
 
G
R
 
Q
M
 
T
L
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
S
 
A
V
 
D
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
F
 
I
L
 
F
T
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
N
R
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P
I
 
V
N
 
A
S
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
I
I
 
L
T
 
M
S
 
T
L
 
I
V
 
F
V
 
Q
L
 
L
I
 
-
N
 
S
Y
 
S
L
 
I
L
 
S
P
 
P
Q
 
N
-
 
A
-
 
T
K
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
S
A
 
S
L
 
V
V
x
S
V
 
V
A
 
I
T
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
P
W
 
Y
I
 
L
M
 
Y
I
 
T
C
 
C
L
 
A
A
 
A
H
 
L
L
 
L

P60063 Arginine/agmatine antiporter from Escherichia coli O157:H7 (see 3 papers)
21% identity, 79% coverage: 28:390/458 of query aligns to 15:373/445 of P60063

query
sites
P60063
I
 
V
Q
 
T
L
 
L
I
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
G
x
N
A
x
I
I
 
M
G
|
G
T
x
S
G
|
G
L
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
-
I
 
L
G
 
P
P
 
A
A
 
N
I
 
L
Q
 
A
M
 
S
A
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
I
V
 
A
L
 
I
L
 
Y
G
 
G
Y
 
W
G
 
L
V
 
V
A
 
T
G
 
I
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
G
I
 
L
M
 
S
R
 
M
Q
 
V
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
S
V
 
F
E
 
L
E
 
D
P
 
P
V
 
S
S
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
A
x
Y
H
 
A
F
 
Y
A
 
A
Y
 
R
K
 
R
Y
 
C
W
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
L
G
 
G
F
x
Y
L
 
Q
S
 
T
G
 
N
W
 
V
N
 
L
Y
|
Y
W
 
W
V
 
L
M
x
A
F
x
C
V
 
W
L
 
I
V
 
G
G
x
N
M
 
I
A
 
A
E
 
M
L
 
V
T
 
V
A
 
I
A
 
G
G
 
V
I
 
G
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
D
 
I
V
 
L
P
 
K
T
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
L
W
 
T
I
 
I
W
 
T
A
 
C
A
 
V
A
 
V
F
 
V
F
 
L
I
 
W
I
 
I
I
 
F
N
 
V
A
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
N
 
G
V
 
P
R
 
K
L
 
M
Y
 
I
G
 
T
E
 
R
T
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
F
 
A
A
 
T
L
 
V
I
 
L
K
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
V
G
 
G
M
 
I
I
 
A
G
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
-
W
 
W
L
 
F
L
 
W
F
 
F
S
 
R
G
 
G
H
 
E
G
 
T
G
 
Y
E
 
M
K
 
A
A
 
A
-
 
W
S
 
N
I
 
V
D
 
S
N
 
G
L
 
L
W
 
G
R
 
T
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
F
 
I
F
 
Q
A
 
S
T
 
T
G
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
T
M
 
L
F
x
W
S
 
S
F
 
F
G
x
I
G
|
G
L
x
V
E
|
E
L
x
S
I
x
A
G
 
S
I
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
K
K
 
R
S
 
N
I
 
V
P
 
P
K
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
I
Q
 
G
V
 
G
V
 
V
Y
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
I
 
V
G
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
T
V
 
A
L
 
I
L
 
M
A
 
G
L
 
M
Y
 
I
P
 
P
W
 
N
V
 
A
E
 
A
V
 
L
K
 
R
S
 
V
N
 
S
S
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
M
 
D
I
 
A
F
 
A
H
 
R
N
 
M
L
 
A
D
 
L
S
 
G
N
 
D
V
 
T
V
 
A
A
 
G
S
 
A
A
 
I
L
 
V
N
 
S
F
 
F
V
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
G
S
 
C
L
 
L
S
 
G
V
 
S
Y
 
L
N
 
G
S
 
G
G
x
W
V
 
T
Y
 
L
S
 
L
N
 
A
S
 
G
R
 
Q
M
 
T
L
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
S
 
A
V
 
D
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
F
 
I
L
 
F
T
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
N
R
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P
I
 
V
N
 
A
S
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
I
I
 
L
T
 
M
S
 
T
L
 
I
V
x
F
V
 
Q
L
 
L
I
 
-
N
 
S
Y
 
S
L
 
I
L
 
S
P
 
P
Q
 
N
-
 
A
-
 
T
K
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
S
A
 
S
L
 
V
V
x
S
V
 
V
A
 
I
T
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
P
W
x
Y
I
 
L
M
 
Y
I
 
T
C
 
C
L
 
A
A
 
A
H
 
L
L
 
L

5j4nA Crystal structure of the l-arginine/agmatine antiporter adic in complex with agmatine at 2.6 angstroem resolution (see paper)
21% identity, 79% coverage: 28:390/458 of query aligns to 11:369/437 of 5j4nA

query
sites
5j4nA
I
 
V
Q
 
T
L
 
L
I
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
G
 
N
A
x
I
I
 
M
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
-
I
 
L
G
 
P
P
 
A
A
 
N
I
 
L
Q
 
A
M
 
S
A
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
I
V
 
A
L
 
I
L
 
Y
G
 
G
Y
 
W
G
 
L
V
 
V
A
 
T
G
 
I
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
G
I
 
L
M
 
S
R
 
M
Q
 
V
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
S
V
 
F
E
 
L
E
 
D
P
 
P
V
 
S
S
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
A
 
Y
H
 
A
F
 
Y
A
 
A
Y
 
R
K
 
R
Y
 
C
W
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
S
 
T
G
 
N
W
 
V
N
 
L
Y
 
Y
W
 
W
V
 
L
M
x
A
F
x
C
V
 
W
L
 
I
V
x
G
G
x
N
M
 
I
A
 
A
E
x
M
L
 
V
T
 
V
A
 
I
A
 
G
G
 
V
I
 
G
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
D
 
I
V
 
L
P
 
K
T
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
L
W
 
T
I
 
I
W
 
T
A
 
C
A
 
V
A
 
V
F
 
V
F
 
L
I
 
W
I
 
I
I
 
F
N
 
V
A
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
N
 
G
V
 
P
R
 
K
L
 
M
Y
 
I
G
 
T
E
 
R
T
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
F
 
A
A
 
T
L
 
V
I
 
L
K
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
V
G
 
G
M
 
I
I
 
A
G
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
-
W
 
W
L
 
F
L
 
W
F
 
F
S
 
R
G
 
G
H
 
E
G
 
T
G
 
Y
E
 
M
K
 
A
A
 
A
-
 
W
S
 
N
I
 
V
D
 
S
N
 
G
L
 
L
W
 
G
R
 
T
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
F
 
I
F
 
Q
A
 
S
T
 
T
G
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
T
M
 
L
F
 
W
S
 
S
F
 
F
G
 
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
S
I
 
A
G
 
S
I
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
K
K
 
R
S
 
N
I
 
V
P
 
P
K
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
I
Q
 
G
V
 
G
V
 
V
Y
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
I
 
V
G
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
T
V
 
A
L
 
I
L
 
M
A
 
G
L
 
M
Y
 
I
P
 
P
W
 
N
V
 
A
E
 
A
V
 
L
K
 
R
S
 
V
N
 
S
S
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
M
 
D
I
 
A
F
 
A
H
 
R
N
 
M
L
 
A
D
 
L
S
 
G
N
 
D
V
 
T
V
 
A
A
 
G
S
 
A
A
 
I
L
 
V
N
 
S
F
 
F
V
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
G
S
 
C
L
 
L
S
 
G
V
 
S
Y
 
L
N
 
G
S
 
G
G
x
W
V
 
T
Y
 
L
S
 
L
N
 
A
S
 
G
R
 
Q
M
 
T
L
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
S
 
A
V
 
D
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
F
 
I
L
 
F
T
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
N
R
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P
I
 
V
N
 
A
S
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
I
I
 
L
T
 
M
S
 
T
L
 
I
V
 
F
V
 
Q
L
 
L
I
 
-
N
 
S
Y
 
S
L
 
I
L
 
S
P
 
P
Q
 
N
-
 
A
-
 
T
K
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
S
A
 
S
L
 
V
V
 
S
V
 
V
A
 
I
T
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
P
W
 
Y
I
 
L
M
 
Y
I
 
T
C
 
C
L
 
A
A
 
A
H
 
L
L
 
L

6f34A Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue bound to arginine. (see paper)
21% identity, 84% coverage: 48:431/458 of query aligns to 53:431/458 of 6f34A

query
sites
6f34A
A
 
A
I
 
A
Q
 
E
M
 
H
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
S
Y
 
F
G
 
I
V
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
L
I
 
A
A
 
C
F
 
V
L
 
F
I
 
A
M
 
A
R
 
L
Q
 
C
L
 
Y
G
 
A
E
 
E
M
 
F
V
 
A
V
 
S
E
 
T
E
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
A
A
 
Y
H
 
T
F
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
K
 
A
Y
 
T
W
 
F
G
 
G
P
 
E
F
 
L
A
 
I
G
 
A
F
 
W
L
 
I
S
 
L
G
 
G
W
 
W
N
 
D
Y
 
L
W
 
I
V
 
L
M
x
E
F
x
Y
V
 
G
L
 
V
V
x
A
G
 
S
M
 
S
A
 
A
E
 
V
L
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
W
G
 
S
I
 
G
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
S
Y
 
A
W
 
Y
F
 
D
P
 
P
D
 
A
V
 
K
P
 
G
T
 
T
W
 
F
I
 
I
W
 
D
A
 
L
A
 
P
A
 
A
F
 
I
F
 
I
I
 
I
I
 
V
I
 
L
N
 
F
A
 
I
V
 
T
N
 
F
L
 
L
V
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
G
L
 
A
Y
 
K
G
 
K
E
 
S
T
x
A
E
x
R
F
 
F
W
 
N
F
 
A
A
 
V
L
 
I
I
 
V
K
x
A
V
x
I
L
 
K
A
 
V
I
x
A
I
 
V
G
 
V
M
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
L
L
|
L
F
 
F
S
 
L
G
 
A
H
 
V
G
 
G
G
 
V
E
x
W
K
x
Y
A
 
V
S
 
K
I
 
P
D
 
E
N
 
N
L
 
-
W
 
-
R
 
-
Y
 
W
G
 
T
G
 
P
F
 
F
F
 
M
A
 
P
T
 
Y
G
 
G
W
 
F
N
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
A
L
 
T
S
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
V
M
 
F
F
|
F
S
x
A
F
 
Y
G
x
I
G
 
G
L
 
F
E
 
D
L
 
A
I
 
V
G
 
S
I
 
T
T
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
R
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
K
 
R
S
 
D
I
 
M
P
 
P
K
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
I
Q
 
V
V
 
S
V
 
L
Y
 
L
R
 
V
I
 
C
L
 
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
S
 
V
L
 
S
V
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
T
A
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
E
E
 
Q
V
 
L
K
 
N
S
 
V
N
 
K
S
 
-
S
 
N
P
 
P
F
 
V
V
 
A
M
 
F
I
 
A
F
 
L
H
 
N
N
 
Y
L
 
I
D
 
H
S
x
Q
N
 
D
V
 
W
V
|
V
A
 
A
S
 
G
A
 
F
L
 
I
N
 
S
F
 
L
V
 
G
I
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
G
S
 
I
L
 
T
S
 
T
V
|
V
Y
 
L
N
 
L
S
 
V
G
 
S
V
 
M
Y
 
Y
S
 
G
N
 
Q
S
 
T
R
 
R
M
 
L
L
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
S
 
S
V
 
R
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
L
P
 
P
K
 
K
F
 
V
L
 
F
T
 
A
R
 
R
V
 
I
S
 
S
-
 
P
R
 
T
R
 
R
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
I
 
Y
N
 
V
S
 
N
L
 
T
M
 
W
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
A
T
 
V
S
 
A
L
 
V
-
 
F
-
 
A
-
 
G
V
 
I
V
 
I
L
 
P
I
 
L
N
 
N
Y
 
K
L
 
L
L
 
A
P
 
E
Q
 
L
K
 
T
A
 
N
F
 
I
G
 
G
L
 
T
L
 
L
M
 
F
A
 
A
L
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
W
 
F
I
 
I
M
 
T
I
 
V
C
 
S
L
 
I
A
 
G
H
 
V
L
 
L
R
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
T
M
 
Q
R
 
P
R
 
D
Q
 
L
G
 
K
R
 
R
E
 
-
T
 
-
Q
 
A
F
 
F
K
 
R
A
 
V
L
 
P
L
 
F
Y
 
V
P
 
P
F
 
V
G
 
V
N
 
P
Y
 
I
L
 
L
C
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
C
G
 
G
M
 
Y
I
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
Q
M
 
L
C
 
P
T
 
A
M
 
M

Sites not aligning to the query:

5oqtA Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue (see paper)
21% identity, 84% coverage: 48:431/458 of query aligns to 51:429/456 of 5oqtA

query
sites
5oqtA
A
 
A
I
 
A
Q
 
E
M
 
H
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
L
L
 
V
L
 
L
G
 
S
Y
 
F
G
 
I
V
 
L
A
 
S
G
 
G
I
 
L
I
 
A
A
 
C
F
 
V
L
 
F
I
 
A
M
 
A
R
 
L
Q
 
C
L
 
Y
G
 
A
E
 
E
M
 
F
V
 
A
V
 
S
E
 
T
E
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
A
A
 
Y
H
 
T
F
 
Y
A
 
S
Y
 
Y
K
 
A
Y
 
T
W
 
F
G
 
G
P
 
E
F
 
L
A
 
I
G
 
A
F
 
W
L
 
I
S
 
L
G
 
G
W
 
W
N
 
D
Y
 
L
W
 
I
V
 
L
M
 
E
F
 
Y
V
 
G
L
 
V
V
 
A
G
 
S
M
 
S
A
 
A
E
 
V
L
 
A
T
 
V
A
 
G
A
 
W
G
 
S
I
 
G
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
S
Y
 
A
W
 
Y
F
 
D
P
 
P
D
 
A
V
 
K
P
 
G
T
 
T
W
 
F
I
 
I
W
 
D
A
 
L
A
 
P
A
 
A
F
 
I
F
 
I
I
 
I
I
 
V
I
 
L
N
 
F
A
 
I
V
 
T
N
 
F
L
 
L
V
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
G
L
 
A
Y
 
K
G
 
K
E
 
S
T
x
A
E
x
R
F
 
F
W
 
N
F
 
A
A
 
V
L
 
I
I
 
V
K
x
A
V
 
I
L
 
K
A
 
V
I
x
A
I
 
V
G
 
V
M
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
L
L
|
L
F
 
F
S
 
L
G
 
A
H
 
V
G
 
G
G
 
V
E
 
W
K
 
Y
A
 
V
S
 
K
I
 
P
D
 
E
N
 
N
L
 
-
W
 
-
R
 
-
Y
 
W
G
 
T
G
 
P
F
 
F
F
 
M
A
 
P
T
 
Y
G
 
G
W
 
F
N
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
A
L
 
T
S
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
T
I
 
V
M
 
F
F
|
F
S
x
A
F
 
Y
G
x
I
G
 
G
L
 
F
E
 
D
L
 
A
I
 
V
G
 
S
I
 
T
T
 
A
A
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
R
D
 
N
P
 
P
E
 
Q
K
 
R
S
 
D
I
 
M
P
 
P
K
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
I
Q
 
V
V
 
S
V
 
L
Y
 
L
R
 
V
I
 
C
L
 
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
S
 
V
L
 
S
V
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
T
A
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
P
W
 
Y
V
 
E
E
 
Q
V
 
L
K
 
N
S
 
V
N
 
K
S
 
-
S
 
N
P
 
P
F
 
V
V
 
A
M
 
F
I
 
A
F
 
L
H
 
N
N
 
Y
L
 
I
D
 
H
S
x
Q
N
 
D
V
 
W
V
|
V
A
 
A
S
 
G
A
 
F
L
 
I
N
 
S
F
 
L
V
 
G
I
 
A
L
 
I
V
 
A
A
 
G
S
 
I
L
 
T
S
 
T
V
 
V
Y
 
L
N
 
L
S
 
V
G
 
M
V
 
M
Y
 
Y
S
 
G
N
 
Q
S
 
T
R
 
R
M
 
L
L
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
S
 
S
V
 
R
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
L
P
 
P
K
 
K
F
 
V
L
 
F
T
 
A
R
 
R
V
 
I
S
 
S
-
 
P
R
 
T
R
 
R
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
I
 
Y
N
 
V
S
 
N
L
 
T
M
 
W
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
A
T
 
V
S
 
A
L
 
V
-
 
F
-
 
A
-
 
G
V
 
I
V
 
I
L
 
P
I
 
L
N
 
N
Y
 
K
L
 
L
L
 
A
P
 
E
Q
 
L
K
 
T
A
 
N
F
 
I
G
 
G
L
 
T
L
 
L
M
 
F
A
 
A
L
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
W
 
F
I
 
I
M
 
T
I
 
V
C
 
S
L
 
I
A
 
G
H
 
V
L
 
L
R
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
T
M
 
Q
R
 
P
R
 
D
Q
 
L
G
 
K
R
 
R
E
 
-
T
 
-
Q
 
A
F
 
F
K
 
R
A
 
V
L
 
P
L
 
F
Y
 
V
P
 
P
F
 
V
G
 
V
N
 
P
Y
 
I
L
 
L
C
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
C
G
 
G
M
 
Y
I
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
Q
M
 
L
C
 
P
T
 
A
M
 
M

Sites not aligning to the query:

3l1lA Structure of arg-bound escherichia coli adic (see paper)
21% identity, 79% coverage: 28:390/458 of query aligns to 9:356/423 of 3l1lA

query
sites
3l1lA
I
 
V
Q
 
T
L
 
L
I
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
G
 
A
A
x
I
I
 
M
G
 
G
T
x
S
G
|
G
L
 
V
F
 
F
L
 
L
G
 
-
I
 
L
G
 
P
P
 
A
A
 
N
I
 
L
Q
 
A
M
 
S
A
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
I
V
 
A
L
 
I
L
 
Y
G
 
G
Y
 
W
G
 
L
V
 
V
A
 
T
G
 
I
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
G
I
 
L
M
 
S
R
 
M
Q
 
V
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
S
V
 
F
E
 
L
E
 
D
P
 
P
V
 
S
S
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
A
 
Y
H
 
A
F
 
Y
A
 
A
Y
 
R
K
 
R
Y
 
C
W
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
F
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
L
 
Q
S
 
T
G
 
N
W
 
V
N
 
L
Y
 
Y
W
 
W
V
 
L
M
 
A
F
 
C
V
 
W
L
 
I
V
x
G
G
x
N
M
 
I
A
 
A
E
 
M
L
 
V
T
 
V
A
 
I
A
 
G
G
 
V
I
 
G
Y
 
Y
M
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
D
 
I
V
 
L
P
 
K
T
 
D
-
 
P
W
 
W
I
 
V
W
 
L
A
 
T
A
 
I
A
 
T
F
 
C
F
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
L
-
 
W
-
 
I
-
 
F
N
 
V
A
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
I
V
 
V
N
 
G
V
 
P
R
 
K
L
 
M
Y
 
I
G
 
T
E
 
R
T
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
F
 
A
A
 
T
L
 
V
I
 
L
K
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
V
G
 
G
M
 
I
I
 
A
G
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
-
W
 
W
L
 
F
L
 
W
F
 
F
S
 
R
G
 
G
H
 
E
G
 
T
G
 
-
E
 
Y
K
 
M
A
 
A
S
 
A
I
 
I
D
 
Q
N
 
S
L
 
-
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
T
L
 
L
A
 
N
V
 
V
I
 
T
M
 
L
F
x
W
S
|
S
F
 
F
G
x
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
L
 
S
I
 
A
G
 
S
I
 
V
T
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
V
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
K
K
 
R
S
 
N
I
 
V
P
 
P
K
 
I
A
 
A
V
 
T
N
 
I
Q
 
G
V
 
G
V
 
V
Y
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
I
 
V
G
 
L
S
 
S
L
 
T
V
 
T
V
 
A
L
 
I
L
 
M
A
 
G
L
 
M
Y
 
I
P
 
P
W
 
N
V
 
A
E
 
A
V
 
L
K
 
R
S
 
V
N
 
S
S
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
M
 
D
I
 
A
F
 
A
H
 
R
N
 
M
L
 
A
D
 
L
S
 
G
N
 
D
V
 
T
V
 
A
A
 
G
S
 
A
A
 
I
L
 
V
N
 
S
F
 
F
V
 
C
I
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
G
S
 
C
L
 
L
S
 
G
V
 
S
Y
 
L
N
 
G
S
 
G
G
x
W
V
 
T
Y
 
L
S
 
L
N
 
A
S
 
G
R
 
Q
M
 
T
L
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
S
 
A
V
 
D
Q
 
D
G
 
G
N
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
F
 
I
L
 
F
T
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
N
R
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P
I
 
V
N
 
A
S
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
I
I
 
L
T
 
M
S
 
T
L
 
I
V
 
F
V
 
Q
L
 
L
I
 
-
N
 
S
Y
 
S
L
 
I
L
 
S
P
 
P
Q
 
N
-
 
A
-
 
T
K
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
S
A
 
S
L
 
V
V
 
S
V
 
V
A
 
I
T
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
P
W
 
Y
I
 
L
M
 
Y
I
 
T
C
 
C
L
 
A
A
 
A
H
 
L
L
 
L

O34739 Serine/threonine exchanger SteT from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
22% identity, 90% coverage: 8:419/458 of query aligns to 3:398/438 of O34739

query
sites
O34739
S
 
T
E
 
E
D
 
D
T
 
N
A
 
G
S
 
L
N
 
K
Q
 
K
E
 
E
P
 
I
T
 
G
L
 
L
H
 
L
R
 
F
G
 
A
L
 
L
H
 
T
N
 
-
R
 
-
H
 
-
I
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
L
A
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
T
A
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
M
G
 
K
I
 
P
G
 
G
P
 
A
A
 
V
I
 
L
Q
 
A
M
 
Y
A
 
S
G
 
G
P
 
D
A
 
S
-
 
K
-
 
M
V
 
A
L
 
L
L
 
F
G
 
A
Y
 
W
G
 
L
V
 
L
A
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
T
F
 
L
L
 
A
I
 
G
M
 
G
R
 
L
Q
 
T
L
 
I
G
 
A
E
 
E
M
 
I
V
 
G
V
 
T
E
 
Q
E
 
I
P
 
P
V
 
K
S
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
L
A
 
Y
H
 
T
F
 
Y
A
 
L
Y
 
E
K
 
E
Y
 
V
W
 
Y
G
 
G
P
 
E
F
 
F
A
 
W
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
x
C
G
 
G
W
 
W
N
 
-
Y
 
-
W
 
-
V
 
V
M
 
Q
F
 
I
V
 
I
L
 
I
V
 
Y
G
 
G
M
 
P
A
 
A
E
 
I
L
 
I
T
 
G
A
 
A
A
 
L
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
M
 
F
Q
 
G
Y
 
S
W
 
L
F
 
M
P
 
A
D
 
N
V
 
L
P
 
F
T
 
G
W
 
W
-
 
G
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
G
I
 
I
W
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
L
F
 
F
F
 
L
I
x
C
I
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
-
V
 
-
N
 
-
L
 
I
V
 
I
N
 
G
V
 
T
R
 
K
L
 
Y
Y
 
G
G
 
G
E
 
F
T
 
V
E
 
Q
F
 
T
W
 
L
F
 
T
A
 
T
L
 
I
I
 
G
K
 
K
V
 
L
L
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
A
G
x
C
M
 
I
I
 
I
G
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
L
W
 
W
L
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
K
G
 
G
G
 
D
E
 
Q
-
 
H
-
 
I
-
 
F
-
 
T
-
 
A
-
 
V
K
 
N
A
 
E
S
 
S
I
 
I
D
 
S
N
 
D
L
 
M
W
 
N
R
 
F
Y
 
G
G
 
A
G
 
A
F
 
I
F
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
-
W
 
-
N
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
M
 
L
F
 
F
S
 
A
F
 
Y
G
 
D
G
 
G
L
 
W
E
 
I
L
 
L
I
 
L
G
 
A
I
 
A
T
 
L
A
 
G
A
 
G
E
 
E
A
 
M
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
E
K
 
K
S
 
L
I
 
L
P
 
P
K
 
R
A
 
A
V
 
M
N
 
T
Q
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
L
V
 
I
V
 
V
Y
 
T
R
 
A
I
 
I
L
 
Y
L
 
I
F
 
F
Y
 
I
I
 
N
G
 
F
S
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
A
Y
 
N
P
 
E
W
 
I
V
 
V
E
 
T
V
 
L
K
 
G
S
 
E
N
 
N
-
 
A
-
 
T
S
 
S
S
 
T
P
 
A
F
 
A
V
 
T
M
 
M
I
 
L
F
 
F
H
 
G
N
 
S
L
 
I
D
 
G
S
 
G
N
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
S
S
 
V
A
 
G
L
 
-
N
 
-
F
 
-
V
 
-
I
 
I
L
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
I
L
 
F
S
 
G
V
x
C
Y
 
L
N
 
N
S
 
G
G
 
K
V
 
V
Y
 
L
S
 
S
N
 
F
S
 
P
R
 
R
M
 
V
L
 
S
F
 
F
G
 
A
L
 
M
S
 
A
V
 
E
Q
 
R
G
 
K
N
 
Q
A
 
L
P
 
P
K
 
-
F
 
F
L
 
A
T
 
E
R
 
K
V
 
L
S
 
S
R
 
H
R
 
V
G
 
H
V
 
P
P
 
S
I
 
F
N
 
R
S
 
T
L
 
P
M
 
W
L
 
I
S
 
A
G
 
I
A
 
S
I
 
F
T
 
Q
S
 
I
L
 
A
V
 
L
V
 
A
L
 
L
I
 
I
N
 
M
Y
 
M
L
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
N
P
 
P
Q
 
D
K
 
K
A
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
M
 
S
A
 
E
L
 
I
V
 
S
V
 
I
A
 
F
T
 
M
L
 
I
L
 
Y
L
 
I
N
 
F
W
 
Y
I
 
V
M
 
M
I
 
A
C
 
F
L
 
F
A
 
A
H
 
V
L
 
F
R
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
-
M
 
-
R
 
R
R
 
A
Q
 
K
G
 
G
R
 
E
E
 
K
T
 
R
Q
 
A
F
 
Y
K
 
S
A
 
V
L
 
P
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
M
N
 
P
Y
 
I
L
 
L
C
 
A
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P0AAE8 Cadaverine/lysine antiporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
21% identity, 57% coverage: 198:458/458 of query aligns to 168:431/444 of P0AAE8

query
sites
P0AAE8
W
 
W
R
 
F
Y
 
D
G
 
A
G
 
A
F
 
T
F
x
Y
A
 
A
T
 
A
G
 
N
W
 
W
N
 
N
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
x
D
-
 
G
-
 
H
G
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
K
S
 
S
L
 
I
A
 
L
V
 
L
I
x
C
M
 
L
F
 
W
S
 
A
F
 
F
G
 
V
G
 
G
L
 
V
E
|
E
L
 
S
I
 
A
G
 
A
I
 
V
T
 
S
A
 
T
A
 
G
E
 
M
A
 
V
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
K
K
 
R
S
 
T
I
 
V
P
 
P
K
 
L
A
 
A
V
 
T
N
 
M
Q
 
L
V
 
G
V
 
T
Y
 
G
R
 
L
I
 
A
L
 
G
L
 
I
F
 
V
Y
|
Y
I
 
I
G
 
A
S
 
A
L
 
T
V
 
Q
V
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
G
L
 
M
Y
|
Y
P
 
P
W
 
S
V
 
S
E
 
V
V
 
M
K
 
A
S
 
A
N
 
S
S
 
G
S
 
A
P
 
P
F
 
F
V
 
A
M
 
I
I
 
S
F
 
A
H
 
S
N
 
T
L
 
I
D
 
L
S
 
G
N
 
N
V
 
W
V
 
A
A
 
A
S
 
P
A
 
L
L
 
V
N
 
S
F
 
A
V
 
F
I
 
T
L
 
A
V
 
F
A
 
A
S
x
C
L
 
L
S
 
T
V
 
S
Y
 
L
N
 
G
S
 
S
G
 
W
V
 
M
Y
 
M
S
 
L
N
 
V
S
 
G
R
 
Q
M
 
A
L
 
G
F
 
V
G
x
R
L
 
A
S
 
A
V
 
N
Q
x
D
G
 
G
N
 
N
A
 
F
P
 
P
K
 
K
F
 
V
L
x
Y
T
 
G
R
 
E
V
 
V
S
 
D
R
 
S
R
 
N
G
 
G
V
 
I
P
 
P
I
 
K
N
 
K
S
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
S
 
A
G
 
A
-
 
V
A
 
K
I
 
M
T
 
T
S
 
A
L
 
L
V
 
M
V
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
T
Y
 
L
L
 
M
-
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
K
P
 
A
Q
 
S
K
 
D
A
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
E
L
 
L
M
 
T
A
 
G
L
 
I
V
 
A
V
 
V
A
 
L
T
 
L
L
 
T
L
 
M
L
 
L
N
 
P
W
x
Y
I
 
F
M
x
Y
I
 
S
C
|
C
L
 
V
A
 
D
H
 
L
L
 
I
R
 
R
F
 
F
R
x
E
A
 
G
A
 
V
M
 
N
R
 
I
R
 
R
Q
 
N
G
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
Q
 
-
F
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
F
G
 
V
N
 
S
Y
 
L
L
 
I
C
|
C
I
 
-
A
 
S
F
 
V
L
 
L
G
 
G
M
x
C
I
 
V
L
 
F
L
x
C
L
 
F
M
 
I
C
 
A
T
 
L
M
 
M
-
 
G
-
 
A
D
 
S
D
 
S
M
 
F
R
x
E
L
 
L
S
 
A
A
 
G
I
 
T
L
 
F
L
 
I
P
 
V
V
 
S
W
 
L
I
 
I
V
 
I
F
 
L
L
 
M
F
 
F
M
x
Y
A
 
A
F
 
R
K
 
K
T
 
M
L
 
H
R
 
E
R
 
R
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

P39277 L-methionine/branched-chain amino acid exporter YjeH from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 30% coverage: 209:345/458 of query aligns to 184:319/418 of P39277

query
sites
P39277
N
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
F
L
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
V
I
 
M
M
 
F
F
x
W
S
 
C
F
 
F
G
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
A
I
 
F
G
 
A
I
 
H
T
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
E
A
 
F
R
 
K
D
 
N
P
 
P
E
 
E
K
 
R
S
 
D
I
 
F
P
 
P
K
 
R
A
 
A
V
 
L
N
 
M
Q
 
I
V
 
G
V
 
L
Y
 
L
R
 
L
I
 
A
L
 
G
L
 
L
F
 
V
Y
 
Y
I
 
W
G
 
G
S
 
C
L
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
H
L
 
F
Y
 
D
P
 
A
W
 
Y
V
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
M
V
 
A
K
 
A
S
 
A
N
 
A
S
 
S
S
 
L
P
 
P
F
 
K
V
 
I
M
 
V
I
 
V
-
 
Q
F
 
L
H
 
F
N
 
G
L
 
V
D
 
G
S
 
A
N
 
L
V
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
C
A
 
V
L
 
I
N
 
G
F
 
Y
V
 
L
I
 
A
L
 
C
V
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
Y
 
Y
N
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
I
Y
 
Q
S
 
S
N
 
F
S
 
A
R
 
R
M
 
L
L
 
V
F
 
W
G
 
S
L
 
-
S
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
H
N
 
N
A
 
P
P
 
D
K
 
H
F
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
S
R
 
R
G
 
H
V
 
I
P
 
P
I
 
N
N
 
N
S
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>14712 b0576 phenylalanine transporter (NCBI)
MKNASTVSEDTASNQEPTLHRGLHNRHIQLIALGGAIGTGLFLGIGPAIQMAGPAVLLGY
GVAGIIAFLIMRQLGEMVVEEPVSGSFAHFAYKYWGPFAGFLSGWNYWVMFVLVGMAELT
AAGIYMQYWFPDVPTWIWAAAFFIIINAVNLVNVRLYGETEFWFALIKVLAIIGMIGFGL
WLLFSGHGGEKASIDNLWRYGGFFATGWNGLILSLAVIMFSFGGLELIGITAAEARDPEK
SIPKAVNQVVYRILLFYIGSLVVLLALYPWVEVKSNSSPFVMIFHNLDSNVVASALNFVI
LVASLSVYNSGVYSNSRMLFGLSVQGNAPKFLTRVSRRGVPINSLMLSGAITSLVVLINY
LLPQKAFGLLMALVVATLLLNWIMICLAHLRFRAAMRRQGRETQFKALLYPFGNYLCIAF
LGMILLLMCTMDDMRLSAILLPVWIVFLFMAFKTLRRK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory