SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 15569 FitnessBrowser__Keio:15569 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3dr8A Structure of ynca, a putative acetyltransferase from salmonella typhimurium with its cofactor acetyl-coa
87% identity, 99% coverage: 1:170/172 of query aligns to 3:172/173 of 3dr8A

query
sites
3dr8A
M
 
M
S
 
T
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
D
C
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
|
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
D
 
D
Q
 
R
T
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
A
W
 
W
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
F
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
S
 
S
F
 
F
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
 
R
H
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
|
H
S
|
S
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
H
P
 
P
D
 
A
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
K
 
K
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
R
C
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
Q
x
A
A
|
A
S
 
S
L
 
I
H
x
R
L
 
L
H
|
H
Q
 
H
S
|
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
H
T
 
A
E
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A

Q8ZPD3 L-methionine sulfoximine/L-methionine sulfone acetyltransferase; L-amino acid N-acyltransferase; Methionine derivative detoxifier A; MDDA; EC 2.3.1.-; EC 2.3.1.- from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
87% identity, 99% coverage: 1:170/172 of query aligns to 1:170/171 of Q8ZPD3

query
sites
Q8ZPD3
M
 
M
S
 
T
I
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
D
C
 
C
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
D
 
D
Q
 
R
T
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
R
I
 
L
A
 
A
W
 
W
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
E
E
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
F
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
S
 
S
F
 
F
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
 
R
H
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
|
E
H
 
H
S
 
S
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
H
P
 
P
D
 
A
H
 
H
Q
 
Q
G
|
G
K
|
K
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
R
C
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
S
 
S
Q
 
Q
N
|
N
Q
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
R
L
 
L
H
 
H
Q
 
H
S
|
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
H
T
 
A
E
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
A

2j8rA Structure of p. Aeruginosa acetyltransferase pa4866 solved in complex with l-methionine sulfoximine (see paper)
63% identity, 97% coverage: 2:168/172 of query aligns to 2:170/170 of 2j8rA

query
sites
2j8rA
S
 
S
I
 
I
R
 
R
F
 
D
A
 
A
R
 
G
K
 
V
A
 
A
D
 
D
C
 
L
A
 
P
A
 
G
I
 
I
A
 
L
E
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
G
Y
 
N
T
 
T
A
 
T
A
|
A
I
|
I
W
|
W
N
 
N
D
 
E
Q
 
T
T
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
L
D
 
A
N
 
N
R
 
R
I
 
Q
A
 
A
W
|
W
F
 
F
E
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
R
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
-
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
|
R
S
 
P
F
|
F
D
 
E
G
 
G
F
|
F
R
 
R
H
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
H
 
H
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
R
P
 
D
D
 
D
H
 
Q
Q
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
R
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
Q
 
G
N
 
N
Q
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
G
L
 
L
H
 
H
Q
 
R
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
E
V
 
I
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
-
 
T
R
 
R
T
 
S
E
 
A
P
 
P

A6VCX3 L-methionine sulfoximine/L-methionine sulfone acetyltransferase; Methionine derivative detoxifier A; MDDA; EC 2.3.1.- from Pseudomonas aeruginosa (strain PA7) (see paper)
63% identity, 97% coverage: 2:168/172 of query aligns to 4:172/172 of A6VCX3

query
sites
A6VCX3
S
 
S
I
 
I
R
 
R
F
 
D
A
 
A
R
 
G
K
 
V
A
 
A
D
 
D
C
 
L
A
 
P
A
 
G
I
 
I
A
 
L
E
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
G
Y
 
N
T
 
T
A
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
D
 
E
Q
 
T
T
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
L
D
 
A
N
 
N
R
 
R
I
 
Q
A
 
A
W
 
W
F
 
F
E
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
R
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
-
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
|
R
S
x
P
F
|
F
D
 
E
G
 
G
F
 
F
R
 
R
H
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
H
|
H
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
R
P
 
D
D
 
D
H
 
Q
Q
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
R
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
Q
 
G
N
 
N
Q
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
G
L
 
L
H
 
H
Q
 
R
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
E
V
 
I
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
-
 
T
R
 
R
T
 
S
E
 
A
P
 
P

2j8mA Structure of p. Aeruginosa acetyltransferase pa4866 (see paper)
63% identity, 97% coverage: 2:168/172 of query aligns to 3:171/171 of 2j8mA

query
sites
2j8mA
S
 
S
I
 
I
R
 
R
F
 
D
A
 
A
R
 
G
K
 
V
A
 
A
D
 
D
C
 
L
A
 
P
A
 
G
I
 
I
A
 
L
E
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
G
Y
 
N
T
 
T
A
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
D
 
E
Q
 
T
T
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
L
D
 
A
N
 
N
R
 
R
I
 
Q
A
 
A
W
 
W
F
 
F
E
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
R
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
-
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
D
W
|
W
R
|
R
S
 
P
F
 
F
D
 
E
G
 
G
F
 
F
R
 
R
H
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
R
P
 
D
D
 
D
H
 
Q
Q
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
V
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
R
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
Q
 
G
N
 
N
Q
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
G
L
 
L
H
 
H
Q
 
R
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
E
V
 
I
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
-
 
T
R
 
R
T
 
S
E
 
A
P
 
P

4jwpA Crystal structure of ribosomal-protein-alanine n-acetyltransferase from brucella melitensis in complex with acetyl coa
54% identity, 92% coverage: 1:159/172 of query aligns to 4:162/165 of 4jwpA

query
sites
4jwpA
M
 
L
S
 
L
I
 
I
R
 
R
F
 
H
A
 
A
R
 
T
K
 
E
A
 
A
D
 
D
C
 
L
A
 
P
A
 
A
I
 
L
A
 
L
E
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
E
Y
 
N
T
 
T
A
 
L
A
|
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
D
 
E
Q
 
T
T
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
L
D
 
E
N
 
N
R
 
R
I
 
H
A
 
Q
W
 
W
F
 
L
E
 
E
A
 
N
R
 
R
T
 
N
L
 
R
A
 
D
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
A
E
 
E
E
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
P
W
 
F
R
 
R
S
 
P
F
 
F
D
 
E
G
 
G
F
 
F
R
 
R
H
 
H
T
 
S
V
 
S
E
 
E
H
 
L
S
 
S
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
A
P
 
S
D
 
N
H
 
A
Q
x
R
G
|
G
K
 
G
G
|
G
L
 
I
G
|
G
R
|
R
K
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
|
E
A
 
A
R
 
R
D
x
E
C
 
R
G
 
K
K
 
V
H
 
H
V
 
V
M
 
L
V
 
I
A
 
A
G
|
G
I
 
I
E
 
E
S
 
A
Q
 
G
N
 
N
Q
 
A
A
|
A
S
|
S
L
 
I
H
x
A
L
 
L
H
 
H
Q
 
R
S
 
S
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
V
 
E
V
 
E
T
 
C
A
 
G
Q
 
T
M
 
L
P
 
K
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
L
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q

4mbuA Crystal structure of n-acetyltransferase from staphylococcus aureus mu50 (see paper)
44% identity, 93% coverage: 3:162/172 of query aligns to 5:164/165 of 4mbuA

query
sites
4mbuA
I
 
I
R
 
R
F
 
C
A
 
A
R
 
K
K
 
K
A
 
E
D
 
D
C
 
L
A
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
L
E
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
H
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
I
Y
 
N
T
 
T
A
 
T
A
 
A
I
 
V
W
 
Y
N
 
T
D
 
Y
Q
 
K
T
 
P
V
 
Q
D
 
T
A
 
I
D
 
D
N
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
W
 
W
F
 
F
E
 
E
A
 
T
R
 
K
T
 
Q
L
 
R
A
 
N
G
 
H
Y
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
S
V
 
V
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
S
 
T
F
 
F
G
 
G
D
 
S
W
 
F
R
 
R
S
 
P
F
 
W
D
 
P
G
 
A
F
 
Y
R
 
Q
H
 
Y
T
 
T
V
 
I
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
 
D
P
 
A
D
 
S
H
 
A
Q
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
S
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
V
E
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
A
C
 
K
G
 
G
K
 
Y
H
 
R
V
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
Q
 
S
N
 
N
Q
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Q
|
Q
S
 
K
L
 
F
G
 
N
F
 
F
V
x
K
V
x
H
T
 
A
A
 
G
Q
 
T
M
 
L
P
 
T
Q
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
Y
K
 
K
F
 
F
G
 
D
R
 
Y
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
A
F
 
F
M
 
Y
Q
 
E
L
 
L
Q
 
D
L
 
L

2jlmF Structure of a putative acetyltransferase (aciad1637) from acinetobacter baylyi adp1 (see paper)
40% identity, 90% coverage: 14:168/172 of query aligns to 22:177/180 of 2jlmF

query
sites
2jlmF
I
 
I
A
 
L
E
 
E
I
 
I
Y
 
L
N
 
N
H
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
I
Y
 
N
T
 
S
A
x
T
A
|
A
I
 
L
W
 
Y
N
 
D
D
 
Y
Q
 
K
T
 
P
V
 
R
D
 
S
A
 
K
D
 
E
N
 
S
R
 
M
I
 
A
A
 
A
W
 
W
F
 
F
E
 
A
A
 
T
R
 
K
T
 
R
L
 
Q
A
 
N
G
 
N
Y
 
F
P
 
P
V
 
I
L
 
I
-
 
G
V
 
A
S
 
V
E
 
N
E
 
E
N
 
V
G
 
G
V
 
Q
V
 
L
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
S
 
S
F
 
W
G
 
G
D
 
S
W
 
F
R
 
R
S
 
A
F
 
F
D
 
P
G
 
A
F
 
Y
R
 
K
H
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Y
|
Y
V
x
I
H
 
H
P
 
K
D
 
D
H
 
Y
Q
 
R
G
 
G
K
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
R
 
K
K
 
H
L
 
L
L
 
M
S
 
N
R
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
K
E
 
R
A
 
A
R
 
V
D
 
E
C
 
S
G
 
E
K
 
V
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
C
I
 
I
E
x
D
S
 
A
Q
 
T
N
|
N
Q
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
Q
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
S
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
H
T
 
S
A
 
G
Q
 
T
M
 
I
P
 
Q
Q
 
Q
V
 
A
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
A
T
 
A
F
 
F
M
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
T
R
 
P
T
 
L
E
 
H
P
 
P

4jxrB Crystal structure of a gnat superfamily phosphinothricin acetyltransferase (pat) from sinorhizobium meliloti in complex with accoa
37% identity, 96% coverage: 2:166/172 of query aligns to 4:169/185 of 4jxrB

query
sites
4jxrB
S
 
T
I
 
L
R
 
R
F
 
D
A
 
A
R
 
V
K
 
A
A
 
A
D
 
D
C
 
L
A
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
T
E
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
H
 
E
A
 
S
V
 
V
L
 
L
Y
 
N
T
 
G
A
 
V
A
|
A
I
 
T
W
 
Y
N
 
E
D
 
E
Q
 
T
T
 
P
V
 
P
D
 
S
A
 
E
D
 
A
N
 
E
R
 
M
I
 
A
A
 
L
W
 
R
F
 
F
E
 
S
A
 
T
R
 
I
T
 
T
L
 
G
A
 
N
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
V
V
 
V
S
 
A
-
 
L
E
 
D
E
 
E
N
 
R
G
 
G
V
 
A
V
 
V
T
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
A
W
 
F
R
 
R
S
 
N
F
 
R
D
 
T
G
 
A
F
 
Y
R
 
R
H
 
F
T
 
L
V
 
V
E
 
E
H
x
D
S
|
S
V
x
I
Y
|
Y
V
x
L
H
 
S
P
|
P
D
 
E
H
 
A
Q
x
R
G
|
G
K
 
K
G
 
G
L
 
I
G
|
G
R
 
K
K
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
G
E
 
R
A
 
C
R
 
T
D
 
A
C
 
L
G
 
G
K
 
F
H
 
R
V
 
Q
M
 
M
V
 
I
A
 
A
G
 
V
I
 
I
E
 
G
S
 
G
Q
 
A
N
x
H
Q
 
P
A
x
S
S
|
S
L
 
I
H
 
A
L
 
L
H
|
H
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
E
V
 
L
T
 
Q
A
 
G
Q
 
L
M
 
M
P
 
K
Q
 
A
V
 
T
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
T
T
 
A
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
L
 
R
Q
 
P
L
 
L
D
 
G
E
 
E
R
 
G
T
 
T

5dwnA Crystal structure of phosphinothricin n-acetyltransferase from brucella ovis in complex with acetylcoa
36% identity, 97% coverage: 3:168/172 of query aligns to 6:175/181 of 5dwnA

query
sites
5dwnA
I
 
I
R
 
R
F
 
D
A
 
F
R
 
Q
K
 
P
A
 
A
D
 
D
C
 
I
A
 
E
A
 
T
I
 
I
A
 
T
E
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
T
 
G
A
 
T
A
 
G
I
 
S
W
 
Y
N
 
E
D
 
I
Q
 
E
T
 
P
V
 
P
D
 
T
A
 
M
D
 
D
N
 
E
R
 
M
I
 
A
A
 
K
W
 
R
F
 
F
E
 
A
A
 
A
R
 
F
T
 
A
L
 
D
A
 
Q
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
A
E
 
E
E
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
R
V
 
V
T
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
Y
W
 
F
R
 
R
S
 
V
F
 
R
D
 
P
G
 
A
F
 
Y
R
 
R
H
 
W
T
 
L
V
 
A
E
 
E
H
 
D
S
|
S
V
x
I
Y
|
Y
V
x
I
H
 
A
P
 
P
D
 
D
H
 
A
Q
x
K
G
|
G
K
 
Q
G
|
G
L
 
I
G
|
G
R
x
K
K
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
R
R
 
E
L
 
L
I
 
I
D
 
A
E
 
R
A
 
I
R
 
S
D
 
A
C
 
L
G
 
G
K
 
F
H
 
R
V
 
Q
M
 
L
V
 
L
A
 
A
-
 
V
-
 
I
G
 
G
I
 
D
E
 
G
S
 
E
Q
 
H
N
 
N
Q
 
I
A
x
G
S
|
S
L
 
V
H
x
K
L
|
L
H
|
H
Q
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
T
V
 
H
T
 
C
A
 
G
Q
 
R
M
 
I
P
 
E
Q
 
G
V
 
S
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
T
T
 
V
F
 
L
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
P
L
 
L
D
 
N
-
 
G
-
 
G
E
 
R
R
 
S
T
 
T
E
 
E
P
 
P

5t7eD Crystal structure of streptomyces hygroscopicus bialaphos resistance (bar) protein in complex with coenzyme a and l-phosphinothricin (see paper)
32% identity, 93% coverage: 3:162/172 of query aligns to 4:162/175 of 5t7eD

query
sites
5t7eD
I
 
I
R
 
R
F
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
E
A
 
A
D
 
D
C
 
M
A
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
C
E
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
N
H
 
H
A
x
Y
V
 
I
L
 
E
Y
 
T
T
 
S
A
 
T
A
x
V
I
 
N
W
x
F
N
 
R
D
 
T
Q
 
E
T
 
P
V
 
Q
D
 
E
A
 
P
D
 
Q
N
 
E
R
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
W
F
 
T
E
 
D
-
 
D
-
 
L
A
 
V
R
 
R
T
 
L
L
 
R
A
 
E
G
 
R
Y
 
Y
P
 
P
V
 
W
L
 
L
V
 
V
S
 
A
E
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
S
 
Y
F
 
A
G
 
G
D
 
P
W
 
W
R
x
K
S
 
A
F
x
R
D
 
N
G
 
A
F
x
Y
R
 
D
H
 
W
T
 
T
V
 
A
E
 
E
H
 
S
S
x
T
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
S
P
 
P
D
 
R
H
 
H
Q
|
Q
G
x
R
K
x
T
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
x
S
K
 
T
L
 
L
L
 
Y
S
 
T
R
 
H
L
 
L
I
 
L
D
 
K
E
 
S
A
 
L
R
 
E
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
K
 
F
H
 
K
V
 
S
M
 
V
V
 
V
A
 
A
G
x
V
I
 
I
E
x
G
S
 
L
Q
 
P
N
 
N
Q
 
D
A
x
P
S
|
S
L
 
V
H
 
R
L
x
M
H
 
H
Q
 
E
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
V
 
P
T
 
R
A
 
G
Q
 
M
M
 
L
P
 
R
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
N
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
T
 
G
F
 
F
M
 
W
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
D
L
 
F

5t7dA Crystal structure of streptomyces hygroscopicus bialaphos resistance (bar) protein in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
32% identity, 93% coverage: 3:162/172 of query aligns to 3:161/173 of 5t7dA

query
sites
5t7dA
I
 
I
R
 
R
F
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
E
A
 
A
D
 
D
C
 
M
A
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
C
E
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
N
H
 
H
A
x
Y
V
 
I
L
 
E
Y
 
T
T
 
S
A
 
T
A
x
V
I
 
N
W
 
F
N
 
R
D
 
T
Q
 
E
T
 
P
V
 
Q
D
 
E
A
 
P
D
 
Q
N
 
E
R
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
W
F
 
T
E
 
D
-
 
D
-
 
L
A
 
V
R
 
R
T
 
L
L
 
R
A
 
E
G
 
R
Y
 
Y
P
 
P
V
 
W
L
 
L
V
 
V
S
 
A
E
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
S
 
Y
F
 
A
G
 
G
D
 
P
W
 
W
R
 
K
S
 
A
F
 
R
D
 
N
G
 
A
F
 
Y
R
 
D
H
 
W
T
 
T
V
 
A
E
 
E
H
 
S
S
x
T
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
S
P
 
P
D
 
R
H
 
H
Q
|
Q
G
x
R
K
 
T
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
x
S
K
 
T
L
 
L
L
 
Y
S
 
T
R
 
H
L
 
L
I
 
L
D
 
K
E
 
S
A
 
L
R
 
E
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
K
 
F
H
 
K
V
 
S
M
 
V
V
 
V
A
 
A
G
x
V
I
 
I
E
 
G
S
 
L
Q
 
P
N
 
N
Q
 
D
A
x
P
S
|
S
L
 
V
H
x
R
L
x
M
H
 
H
Q
 
E
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
V
 
P
T
 
R
A
 
G
Q
 
M
M
 
L
P
 
R
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
N
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
T
 
G
F
 
F
M
 
W
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
D
L
 
F

6m7gA Crystal structure of arsn, n-acetyltransferase with substrate phosphinothricin from pseudomonas putida kt2440 (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:170/172 of query aligns to 2:171/176 of 6m7gA

query
sites
6m7gA
M
 
I
S
 
D
I
 
I
R
 
R
F
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
P
A
 
E
D
 
D
C
 
A
A
 
E
A
 
E
I
 
I
A
 
Q
E
 
I
I
 
I
Y
 
Y
N
 
A
H
 
P
A
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
-
I
 
I
W
 
S
N
 
F
D
 
E
Q
 
E
T
 
A
V
 
V
D
 
P
A
 
S
D
 
V
N
 
E
R
 
Q
I
 
M
A
 
R
W
 
E
F
 
R
E
 
I
A
 
S
R
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
T
Y
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
V
 
V
S
 
A
E
 
V
E
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
Q
W
 
H
R
 
R
S
 
A
F
x
R
D
 
A
G
 
A
F
x
Y
R
 
R
H
 
W
T
 
A
V
 
V
E
 
D
H
 
V
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
P
 
E
D
 
G
H
 
Q
Q
 
R
G
 
R
K
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
Y
S
 
D
R
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
P
E
 
V
A
 
L
R
 
K
D
 
R
C
 
L
G
 
G
K
 
Y
H
 
R
V
 
S
M
 
A
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
A
S
 
L
Q
 
P
N
 
N
Q
 
E
A
 
G
S
 
S
L
 
V
H
 
G
L
 
L
H
 
H
Q
 
E
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
V
 
H
T
 
I
A
 
G
Q
 
T
M
 
F
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
L
G
 
D
R
 
A
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
T
 
G
F
 
Y
M
 
W
Q
 
R
L
 
F
Q
 
D
L
 
F
-
 
G
D
 
D
E
 
E
R
 
G
T
 
L
E
 
H
P
 
P
D
 
E
A
 
A

5wphA Crystal structure of arsn, n-acetyltransferase with substrate ast from pseudomonas putida kt2440 (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:170/172 of query aligns to 2:171/179 of 5wphA

query
sites
5wphA
M
 
I
S
 
D
I
 
I
R
 
R
F
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
P
A
 
E
D
 
D
C
 
A
A
 
E
A
 
E
I
 
I
A
 
Q
E
 
I
I
 
I
Y
 
Y
N
 
A
H
 
P
A
 
I
V
 
V
L
 
L
Y
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
-
I
 
I
W
x
S
N
x
F
D
 
E
Q
 
E
T
 
A
V
 
V
D
 
P
A
 
S
D
 
V
N
 
E
R
 
Q
I
 
M
A
 
R
W
 
E
F
 
R
E
 
I
A
 
S
R
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
Q
G
 
T
Y
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
V
 
V
S
 
A
E
 
V
E
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
S
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
Q
W
 
H
R
|
R
S
 
A
F
x
R
D
 
A
G
 
A
F
x
Y
R
 
R
H
 
W
T
 
A
V
 
V
E
 
D
H
 
V
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
P
 
E
D
 
G
H
 
Q
Q
 
R
G
 
R
K
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
Y
S
 
D
R
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
P
E
 
V
A
 
L
R
 
K
D
 
R
C
 
L
G
 
G
K
 
Y
H
 
R
V
 
S
M
 
A
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
A
S
 
L
Q
 
P
N
 
N
Q
 
E
A
 
G
S
 
S
L
 
V
H
 
G
L
 
L
H
 
H
Q
 
E
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
V
 
H
T
 
I
A
 
G
Q
 
T
M
 
F
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
F
K
 
K
F
 
L
G
 
D
R
 
A
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
T
 
G
F
 
Y
M
 
W
Q
 
R
L
 
F
Q
 
D
L
 
F
-
 
G
D
 
D
E
 
E
R
 
G
T
 
L
E
 
H
P
 
P
D
 
E
A
 
A

6wqbA Crystal structure of vipf from legionella hackeliae in complex with acetyl-coa
32% identity, 51% coverage: 49:136/172 of query aligns to 187:269/290 of 6wqbA

query
sites
6wqbA
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
P
 
T
V
 
L
L
 
F
V
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
Y
N
 
N
G
 
H
V
 
I
V
 
I
T
 
V
G
 
G
Y
 
K
A
 
A
S
 
H
F
 
I
G
 
-
D
 
H
W
 
W
R
 
Q
S
 
S
F
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
K
H
 
E
T
 
A
V
 
I
E
 
F
H
 
S
S
 
D
V
x
I
Y
x
A
V
x
I
H
 
F
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
Q
|
Q
G
|
G
K
 
Q
G
|
G
L
 
W
G
|
G
R
x
G
K
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
Y
L
 
C
I
 
I
D
 
N
E
 
Q
A
 
A
R
 
L
D
 
T
C
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
N
V
 
K
M
 
L
V
 
M
A
 
L
G
x
D
I
 
V
E
 
E
S
 
T
Q
 
S
N
 
N
Q
 
Q
A
x
N
S
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
L
H
x
Y
Q
 
T
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6wqcA Crystal structure of vipf from legionella hackeliae in complex with coa
32% identity, 51% coverage: 49:136/172 of query aligns to 189:271/293 of 6wqcA

query
sites
6wqcA
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
P
 
T
V
 
L
L
 
F
V
 
L
S
 
A
E
 
S
E
 
Y
N
 
N
G
 
H
V
 
I
V
 
I
T
 
V
G
 
G
Y
 
K
A
 
A
S
 
H
F
 
I
G
 
-
D
 
H
W
 
W
R
 
Q
S
 
S
F
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
K
H
 
E
T
 
A
V
 
I
E
 
F
H
 
S
S
 
D
V
x
I
Y
x
A
V
x
I
H
 
F
P
|
P
D
 
Q
H
 
Y
Q
|
Q
G
 
G
K
 
Q
G
|
G
L
 
W
G
|
G
R
x
G
K
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
Y
L
 
C
I
 
I
D
 
N
E
 
Q
A
 
A
R
 
L
D
 
T
C
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
N
V
 
K
M
 
L
V
 
M
A
 
L
G
 
D
I
 
V
E
 
E
S
 
T
Q
 
S
N
 
N
Q
 
Q
A
 
N
S
x
A
L
 
L
H
|
H
L
|
L
H
 
Y
Q
 
T
S
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P0A944 [Ribosomal protein bS18]-alanine N-acetyltransferase; KAT; Peptidyl-lysine N-acetyltransferase; EC 2.3.1.266; EC 2.3.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 31% coverage: 84:136/172 of query aligns to 68:120/148 of P0A944

query
sites
P0A944
S
 
N
V
 
I
Y
 
A
V
 
V
H
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
Y
Q
 
Q
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
K
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
L
R
 
E
D
 
K
C
 
R
G
 
G
K
 
V
H
 
A
V
 
T
M
 
L
V
 
W
A
 
L
G
 
E
I
 
V
E
 
R
S
 
A
Q
 
S
N
 
N
Q
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
I
H
 
A
L
 
L
H
x
Y
Q
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F

Q8ZJW4 [Ribosomal protein bS18]-alanine N-acetyltransferase; EC 2.3.1.266 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
42% identity, 31% coverage: 84:136/172 of query aligns to 68:120/148 of Q8ZJW4

query
sites
Q8ZJW4
S
 
N
V
x
I
Y
x
A
V
|
V
H
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
F
Q
 
Q
G
x
R
K
x
R
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
K
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
L
R
 
E
D
 
T
C
 
R
G
 
G
K
 
V
H
 
V
V
 
T
M
 
L
V
 
W
A
 
L
G
 
E
I
 
V
E
 
R
S
 
A
Q
 
S
N
|
N
Q
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
I
H
 
A
L
 
L
H
 
Y
Q
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F

2cnsA Rimi - ribosomal s18 n-alpha-protein acetyltransferase in complex with acetylcoa. (see paper)
42% identity, 31% coverage: 84:136/172 of query aligns to 68:120/151 of 2cnsA

query
sites
2cnsA
S
x
N
V
x
I
Y
x
A
V
|
V
H
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
F
Q
|
Q
G
x
R
K
 
R
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
K
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
L
R
 
E
D
 
T
C
 
R
G
 
G
K
 
V
H
 
V
V
 
T
M
 
L
V
 
W
A
 
L
G
x
E
I
 
V
E
 
R
S
 
A
Q
 
S
N
|
N
Q
 
A
A
|
A
S
 
A
L
 
I
H
 
A
L
|
L
H
x
Y
Q
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2cnmA Rimi - ribosomal s18 n-alpha-protein acetyltransferase in complex with a bisubstrate inhibitor (cterm-arg-arg-phe-tyr-arg-ala-n-alpha- acetyl-s-coa). (see paper)
42% identity, 31% coverage: 84:136/172 of query aligns to 68:120/151 of 2cnmA

query
sites
2cnmA
S
x
N
V
x
I
Y
x
A
V
|
V
H
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
F
Q
|
Q
G
x
R
K
 
R
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
K
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
E
R
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
L
R
 
E
D
 
T
C
 
R
G
 
G
K
 
V
H
 
V
V
 
T
M
 
L
V
 
W
A
 
L
G
x
E
I
x
V
E
 
R
S
 
A
Q
 
S
N
 
N
Q
 
A
A
|
A
S
 
A
L
 
I
H
 
A
L
|
L
H
x
Y
Q
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>15569 FitnessBrowser__Keio:15569
MSIRFARKADCAAIAEIYNHAVLYTAAIWNDQTVDADNRIAWFEARTLAGYPVLVSEENG
VVTGYASFGDWRSFDGFRHTVEHSVYVHPDHQGKGLGRKLLSRLIDEARDCGKHVMVAGI
ESQNQASLHLHQSLGFVVTAQMPQVGTKFGRWLDLTFMQLQLDERTEPDAIG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory