SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 15864 FitnessBrowser__Keio:15864 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5u0mA Fatty aldehyde dehydrogenase from marinobacter aquaeolei vt8 and cofactor complex (see paper)
60% identity, 99% coverage: 2:486/492 of query aligns to 5:488/488 of 5u0mA

query
sites
5u0mA
T
 
N
L
 
V
W
 
Y
I
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
L
W
 
W
I
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
P
R
 
F
V
 
E
K
 
S
R
 
V
N
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
L
 
V
W
 
W
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
L
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
P
 
L
R
 
A
W
 
W
A
 
R
R
 
R
L
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
E
R
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
N
 
N
K
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
A
A
 
H
I
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
A
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
M
N
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
P
I
 
I
S
 
S
I
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
H
 
N
V
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
H
Q
 
T
R
 
E
S
 
S
E
 
D
M
 
V
P
 
A
D
 
G
G
 
G
A
 
H
A
 
A
S
 
V
L
 
L
R
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
P
N
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
W
 
G
S
 
V
G
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
T
M
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
Q
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
S
E
 
D
T
 
T
G
|
G
Q
 
K
A
 
C
L
 
L
S
 
A
A
 
R
L
 
H
E
 
S
D
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
F
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
S
N
 
T
T
x
V
G
 
G
Y
 
H
Q
 
L
L
 
L
H
 
H
R
 
E
Q
 
Q
L
 
F
S
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
M
|
M
G
|
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
Q
E
 
N
V
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
H
L
 
H
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
P
S
 
K
G
 
G
A
 
K
Q
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
E
V
 
V
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
I
T
 
T
P
 
V
G
 
A
N
 
E
W
 
F
D
 
D
D
 
A
E
 
D
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
I
 
M
G
 
G
G
 
S
L
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
T
 
K
A
 
A
W
 
Q
Q
 
A
Q
 
A
L
 
M
E
 
L
A
 
E
M
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
T
P
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
P
 
M
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
D
T
 
T
S
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
M
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
E
G
 
-
V
 
L
P
 
E
D
 
D
E
 
Q
E
|
E
V
 
F
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
T
V
 
V
W
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
D
 
K
T
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
E
M
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
C
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
D
E
 
D
R
 
R
E
 
K
K
 
L
F
 
Y
D
 
N
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
K
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
 
S
A
 
A
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
W
 
W
P
 
P
M
 
M
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
D
 
G
S
 
K
L
 
S
T
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
D
T
 
S
L
 
L
N
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
N
F
 
F

5u0lA X-ray crystal structure of fatty aldehyde dehydrogenase enzymes from marinobacter aquaeolei vt8 complexed with a substrate (see paper)
60% identity, 99% coverage: 2:486/492 of query aligns to 5:488/488 of 5u0lA

query
sites
5u0lA
T
 
N
L
 
V
W
 
Y
I
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
L
W
 
W
I
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
S
 
P
R
 
F
V
 
E
K
 
S
R
 
V
N
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
L
 
V
W
 
W
Q
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
A
A
 
A
D
 
S
A
 
L
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
P
 
L
R
 
A
W
 
W
A
 
R
R
 
R
L
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
E
 
E
R
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
N
 
N
K
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
A
A
 
H
I
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
A
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
M
N
 
G
K
|
K
I
 
I
A
 
P
I
 
I
S
 
S
I
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
H
 
N
V
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
H
Q
 
T
R
 
E
S
 
S
E
 
D
M
 
V
P
 
A
D
 
G
G
 
G
A
 
H
A
 
A
S
 
V
L
 
L
R
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
H
|
H
L
|
L
P
 
P
N
 
N
G
|
G
H
|
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
W
 
G
S
 
V
G
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
T
M
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
Q
 
E
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
S
E
 
D
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
C
L
 
L
S
 
A
A
 
R
L
 
H
E
 
S
D
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
S
N
 
T
T
 
V
G
 
G
Y
 
H
Q
 
L
L
 
L
H
 
H
R
 
E
Q
 
Q
L
 
F
S
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
Q
E
 
N
V
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
H
L
 
H
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
P
S
 
K
G
 
G
A
 
K
Q
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
E
V
 
V
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
L
 
I
T
 
T
P
 
V
G
 
A
N
 
E
W
 
F
D
 
D
D
 
A
E
 
D
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
I
 
M
G
 
G
G
 
S
L
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
T
 
K
A
 
A
W
 
Q
Q
 
A
Q
 
A
L
 
M
E
 
L
A
 
E
M
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
T
P
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
P
 
M
R
 
K
L
 
Q
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
D
T
 
T
S
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
M
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
E
G
 
-
V
 
L
P
 
E
D
 
D
E
 
Q
E
|
E
V
 
F
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
T
V
 
V
W
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
D
 
K
T
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
E
M
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
C
 
A
G
 
G
L
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
D
E
 
D
R
 
R
E
 
K
K
 
L
F
 
Y
D
 
N
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
K
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
|
S
A
|
A
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
W
 
W
P
 
P
M
 
M
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
D
 
G
S
 
K
L
 
S
T
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
D
T
 
S
L
 
L
N
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
N
F
 
F

3ju8A Crystal structure of succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa.
63% identity, 98% coverage: 2:484/492 of query aligns to 4:486/486 of 3ju8A

query
sites
3ju8A
T
 
T
L
 
H
W
 
Y
I
 
I
N
 
A
G
 
G
D
 
Q
W
 
W
I
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
A
 
E
S
 
T
R
 
L
V
 
E
K
 
S
R
 
L
N
 
D
P
 
P
V
 
V
S
 
G
G
 
Q
E
 
G
V
 
V
L
 
V
W
 
W
Q
 
S
G
 
G
N
 
R
D
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
C
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
F
P
 
P
R
 
A
W
 
W
A
 
A
R
 
R
L
 
R
S
 
P
F
 
L
A
 
E
E
 
Q
R
 
R
H
 
I
A
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
T
L
 
L
E
 
K
S
 
S
N
 
R
K
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
A
A
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
G
R
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
S
M
 
M
I
 
V
N
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
F
H
 
R
V
 
E
R
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
S
S
 
G
E
 
P
M
 
L
P
 
A
D
 
D
G
 
A
A
 
T
A
 
A
S
 
V
L
 
L
R
 
R
H
 
H
R
 
K
P
 
P
H
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
|
G
P
 
P
Y
|
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
G
H
 
H
L
|
L
P
 
P
N
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
C
I
 
V
I
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
W
 
K
S
 
V
G
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
T
M
 
L
R
 
K
L
 
A
W
 
W
Q
 
I
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
H
E
 
R
D
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
F
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
S
N
 
R
T
|
T
G
 
G
Y
 
N
Q
 
L
L
 
L
H
 
H
R
 
S
Q
 
Q
L
 
F
S
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
M
|
M
G
|
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
H
 
Y
L
 
T
T
 
I
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
I
T
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
P
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
W
G
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Q
 
A
R
 
T
L
 
L
T
 
R
P
 
V
G
 
G
N
 
R
W
 
F
D
 
D
D
 
E
E
 
Q
P
 
P
Q
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
M
G
 
G
G
 
A
L
 
V
I
 
I
S
 
S
E
 
L
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
Q
 
H
V
 
L
V
 
L
T
 
K
A
 
A
W
 
Q
Q
 
E
Q
 
H
L
 
L
E
 
I
A
 
G
M
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
M
R
 
T
L
 
Q
L
 
P
Q
 
I
A
 
D
G
 
G
T
 
A
S
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
L
E
 
D
M
 
V
T
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
E
V
 
R
P
 
P
D
 
D
E
 
E
E
|
E
V
 
F
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
W
 
I
R
 
R
Y
 
Y
D
 
S
T
 
D
F
 
F
D
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
M
 
E
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
R
 
Q
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
C
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
S
 
S
P
 
D
E
 
S
R
 
R
E
 
E
K
 
R
F
 
F
D
 
E
Q
 
Q
L
 
F
L
 
L
L
 
V
E
 
E
A
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
K
 
K
P
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
S
A
 
A
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
 
S
A
 
A
W
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
W
 
Y
P
 
P
M
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
S
D
 
P
S
 
S
L
 
V
T
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I

6fkuA Structure and function of aldehyde dehydrogenase from thermus thermophilus: an enzyme with an evolutionarily-distinct c-terminal arm (recombinant protein with shortened c-terminal, in complex with NADP) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 19:464/492 of query aligns to 31:495/511 of 6fkuA

query
sites
6fkuA
K
 
R
R
 
R
N
 
N
P
 
P
V
 
S
S
 
D
G
 
R
E
 
E
-
 
D
V
 
V
L
 
V
W
 
A
Q
 
R
G
 
F
N
 
P
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
K
A
 
D
Q
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
K
A
 
A
C
 
A
R
 
L
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
F
P
 
A
R
 
E
W
 
W
A
 
S
R
 
R
L
 
T
S
 
P
F
 
A
A
 
P
E
 
I
R
 
R
H
 
G
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
E
 
F
R
 
N
F
 
L
A
 
V
A
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
R
N
 
E
K
 
K
A
 
P
E
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
R
I
 
L
I
 
M
A
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
T
R
 
P
W
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
G
E
 
D
V
 
V
T
 
Q
A
 
E
M
 
A
I
 
I
N
 
D
K
 
T
-
 
A
I
 
L
A
 
F
I
 
F
S
 
A
I
 
S
K
 
E
A
 
G
Y
 
R
H
 
R
V
 
L
R
 
Y
T
 
G
G
 
Q
E
 
T
Q
 
V
R
 
P
S
 
S
E
 
E
M
 
M
P
 
R
D
 
D
G
 
K
A
 
E
A
 
L
S
 
F
L
 
T
R
 
F
H
 
R
R
 
R
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
I
F
x
I
G
x
T
P
 
A
Y
 
G
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
I
H
 
A
L
 
V
P
 
P
N
 
S
G
 
W
H
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
W
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
L
 
D
T
 
A
P
 
P
W
 
T
S
 
L
G
 
S
E
 
F
A
 
V
V
 
F
M
 
A
R
 
K
L
 
L
W
 
F
Q
 
E
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
L
 
V
V
 
V
Q
 
F
G
 
G
G
|
G
R
x
G
E
x
K
-
 
G
-
 
S
T
 
T
G
|
G
Q
|
Q
A
 
W
L
 
M
S
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
M
D
 
D
L
 
-
D
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
F
-
 
A
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
Q
T
x
V
G
 
G
Y
 
R
Q
 
W
L
 
I
H
 
G
R
 
-
Q
 
E
L
 
V
S
 
A
G
 
G
Q
 
R
P
 
N
E
 
L
K
 
I
I
 
R
L
 
P
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
M
E
 
R
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
E
L
 
G
T
 
A
I
 
W
Q
 
W
S
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
A
T
 
T
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
C
 
S
A
 
A
R
 
G
R
 
N
L
 
I
L
 
L
L
 
V
K
 
D
S
 
A
G
 
P
A
 
I
Q
 
Y
G
 
-
D
 
E
A
 
E
F
 
F
L
 
K
A
 
R
R
 
R
L
 
F
V
 
L
A
 
E
V
 
R
S
 
V
Q
 
E
R
 
A
L
 
T
T
 
L
P
 
V
G
 
G
N
 
N
W
 
P
D
 
L
D
 
L
E
 
H
P
 
P
Q
 
E
P
 
V
F
 
T
I
 
Y
G
 
G
G
 
P
L
 
F
I
 
I
S
 
N
E
 
E
Q
x
R
A
x
F
A
 
F
Q
 
A
Q
 
R
V
 
W
V
 
Q
T
 
E
A
 
H
W
 
Y
Q
 
R
Q
 
V
L
 
G
E
 
E
A
 
A
M
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
Y
P
 
P
R
 
R
L
 
F
L
 
L
Q
 
G
A
 
D
G
 
P
T
 
E
S
 
A
L
 
G
L
 
L
T
 
Y
-
 
G
-
 
W
P
 
P
G
 
T
I
 
V
I
 
W
E
 
E
M
 
V
T
 
R
G
 
P
V
 
G
A
 
T
G
 
R
V
 
L
P
 
F
D
 
T
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
T
L
 
I
R
 
N
V
 
L
W
 
V
R
 
K
Y
 
V
D
 
D
T
 
G
F
 
I
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
A
M
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
C
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
Y
S
 
T
P
 
N
E
 
H
R
 
R
E
 
H
K
 
W
F
 
A
D
 
Y
Q
 
L
L
 
F
L
 
K
L
 
V
E
 
G
A
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
M
V
 
T
N
 
S
W
 
I
N
 
N
K
 
N
P
 
A
L
 
T
T
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
E
S
 
A
T
 
H
A
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
K
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
-
 
G
-
 
G
H
 
R
R
x
E
P
 
S
S
 
G
A
 
I
W
 
W
Y
 
V
A
 
L
A
 
E
D
 
E
Y
 
Y
C
 
T
A
 
Y
W
 
W

5izdA Wild-type glyceraldehyde dehydrogenase from thermoplasma acidophilum in complex with NADP
31% identity, 83% coverage: 3:411/492 of query aligns to 5:417/494 of 5izdA

query
sites
5izdA
L
 
L
W
 
Y
I
 
I
N
 
D
G
 
G
D
 
Q
W
 
W
I
 
V
T
 
N
G
 
S
Q
 
S
G
 
S
A
 
G
S
 
K
R
 
T
V
 
V
-
 
D
K
 
K
R
 
Y
N
 
S
P
 
P
V
 
V
S
 
T
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
G
Q
 
R
G
 
F
N
 
E
D
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
R
A
 
D
Q
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
R
A
 
A
C
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
D
A
 
A
F
 
F
P
 
W
R
 
A
W
 
W
A
 
N
R
 
D
L
 
L
S
 
G
F
 
S
A
 
V
E
 
E
R
 
R
H
 
S
A
 
K
V
 
I
V
 
I
E
 
Y
R
 
R
F
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
S
 
K
N
 
N
K
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
E
A
 
N
I
 
I
I
 
I
A
 
M
R
 
E
E
 
E
T
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
V
W
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
K
T
 
E
E
 
E
V
 
V
T
 
D
A
 
G
M
 
V
I
 
I
N
 
D
K
 
Q
I
 
I
A
 
-
I
 
-
S
 
-
I
 
-
K
 
Q
A
 
Y
Y
 
Y
H
 
A
V
 
E
R
 
W
T
 
A
G
 
R
E
 
K
Q
 
L
R
 
N
S
 
G
E
 
E
M
 
V
P
 
V
D
 
E
G
 
G
A
 
T
A
 
S
S
 
S
L
 
H
R
 
R
H
 
K
-
 
I
-
 
F
-
 
Q
-
 
Y
-
 
K
R
 
V
P
 
P
H
 
Y
G
 
G
V
 
I
L
 
V
A
 
V
V
 
A
F
x
L
G
x
T
P
 
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
A
H
 
G
L
 
M
P
 
V
N
 
A
G
 
R
H
 
K
I
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
x
S
L
 
D
T
 
T
P
 
P
W
 
G
S
 
S
G
 
A
E
 
E
A
 
W
V
 
I
M
 
V
R
 
R
L
 
K
W
 
F
Q
 
V
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
P
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
L
 
F
V
 
I
Q
 
T
G
 
G
-
x
R
G
|
G
R
 
S
E
 
E
T
 
I
G
|
G
Q
x
D
A
 
Y
L
 
I
S
 
V
A
 
E
L
 
H
E
 
K
D
 
K
L
 
V
D
 
N
G
 
L
L
 
I
L
 
T
F
 
M
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Q
Q
 
R
L
 
I
H
 
M
R
 
Q
Q
 
K
L
 
A
S
 
S
G
 
A
Q
 
N
P
 
M
E
 
A
K
 
K
I
 
L
L
 
I
A
 
-
L
 
L
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
A
P
 
P
L
 
F
I
 
M
I
 
V
D
 
W
E
 
K
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
M
D
 
D
A
 
N
A
 
A
V
 
L
H
 
K
L
 
T
T
 
L
I
 
L
Q
 
W
S
 
A
A
 
K
F
 
Y
V
 
W
T
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
S
C
|
C
T
 
I
C
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
Y
L
 
V
K
 
H
S
 
E
G
 
D
A
 
I
Q
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
T
F
 
F
L
 
M
A
 
S
R
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
E
V
 
L
S
 
S
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
A
P
 
L
G
 
G
N
 
-
W
 
-
D
 
-
D
 
D
E
 
P
P
 
K
Q
 
N
P
 
A
F
 
D
I
 
M
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
N
E
 
K
Q
 
G
A
 
A
A
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
T
V
 
S
T
 
E
A
 
I
W
 
V
Q
 
E
Q
 
E
L
 
A
E
 
K
A
 
E
M
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
K
P
 
I
L
 
L
L
 
F
A
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
P
 
P
R
 
S
L
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
P
L
 
Y
Q
 
R
A
 
N
G
 
G
T
 
Y
S
 
F
L
 
F
L
 
L
T
 
P
P
 
T
G
 
I
I
 
I
I
 
G
E
 
N
M
 
A
T
 
D
G
 
Q
V
 
K
A
 
S
G
 
K
V
 
I
P
 
F
D
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
I
R
 
G
V
 
A
W
 
R
R
 
K
Y
 
I
D
 
S
T
 
S
F
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
M
I
 
Y
R
 
D
M
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
S
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
C
 
S
G
 
Y
L
 
L
V
 
F
S
 
T
P
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

4pz2B Structure of zm aldh2-6 (rf2f) in complex with NAD (see paper)
32% identity, 93% coverage: 3:460/492 of query aligns to 13:476/494 of 4pz2B

query
sites
4pz2B
L
 
L
W
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
S
W
 
F
I
 
V
T
 
D
G
 
A
-
 
V
Q
 
S
G
 
G
A
 
R
S
 
T
R
 
F
V
 
D
K
 
T
R
 
R
N
 
D
P
 
P
V
 
R
S
 
T
G
 
G
E
 
G
V
 
V
L
 
I
W
 
A
Q
 
S
G
 
V
N
 
A
D
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
K
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
L
A
 
A
C
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
F
 
F
P
 
D
R
 
H
-
 
G
-
 
E
W
 
W
A
 
P
R
 
R
L
 
M
S
 
S
F
 
G
A
 
S
E
 
E
R
 
R
H
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
M
E
 
A
R
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
V
E
 
E
S
 
E
N
 
H
K
 
A
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
H
P
 
P
R
 
A
W
 
V
E
 
T
A
 
R
A
 
A
T
 
V
E
 
D
V
 
V
T
 
G
A
 
N
M
 
A
I
 
A
N
 
G
K
 
S
I
 
L
A
 
R
I
 
Y
S
 
F
I
 
A
K
 
G
A
 
A
Y
 
A
H
 
D
V
 
K
R
 
I
T
 
H
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
R
 
L
S
 
-
E
 
K
M
 
M
P
 
P
D
 
G
G
 
Q
-
 
F
-
 
Q
A
 
G
A
 
H
S
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
E
R
 
-
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
A
A
 
G
V
 
V
F
x
I
G
x
I
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
S
H
 
T
L
x
M
P
 
F
N
 
A
G
 
V
H
 
K
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
A
I
 
L
I
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
L
S
 
S
G
 
A
E
 
L
A
 
Y
V
 
L
M
 
A
R
 
Q
L
 
L
W
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
V
V
 
V
Q
 
P
G
 
G
-
 
F
G
|
G
R
 
P
E
 
T
T
 
A
G
|
G
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
S
L
 
H
E
 
M
D
 
D
L
 
V
D
 
D
G
 
M
L
 
V
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
x
V
G
 
G
Y
 
R
Q
 
L
L
 
I
H
 
M
R
 
K
Q
 
A
L
 
S
S
 
A
G
 
E
Q
 
S
P
 
N
E
 
L
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
Y
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
V
D
 
F
E
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
M
A
 
A
V
 
V
H
 
E
L
 
L
T
 
A
I
 
V
Q
 
G
S
 
A
A
 
S
F
 
F
V
 
F
T
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
A
C
|
C
T
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
S
R
 
R
L
 
V
L
 
Y
L
 
V
K
 
Q
S
 
E
G
 
R
A
 
V
Q
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
E
A
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
A
A
 
E
V
 
R
S
 
M
Q
 
R
R
 
S
L
 
W
T
 
V
P
 
V
G
 
G
N
 
D
W
 
P
D
 
F
D
 
S
E
 
D
P
 
P
Q
 
R
P
 
A
F
 
D
I
 
Q
G
 
G
G
 
P
L
 
Q
I
 
V
S
 
D
E
 
K
Q
 
A
A
 
Q
A
 
Y
Q
 
E
Q
 
R
V
 
V
V
 
L
T
 
S
A
 
Y
W
 
I
Q
 
D
Q
 
H
L
 
G
E
 
K
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
L
A
 
L
M
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
-
L
 
C
A
 
A
P
 
P
R
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
E
A
 
G
G
 
K
T
 
G
S
 
Y
L
 
Y
L
 
I
T
 
E
P
 
P
G
 
T
I
 
V
I
 
-
E
 
-
M
 
F
T
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
K
G
 
E
-
 
D
-
 
M
-
 
I
V
 
I
P
 
A
D
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
R
 
C
V
 
L
W
 
M
R
 
K
Y
 
F
D
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
A
M
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
C
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
S
 
T
P
 
R
E
 
D
R
 
L
E
 
D
K
 
V
F
 
A
D
 
N
Q
 
R
L
 
V
L
 
V
L
 
R
E
 
S
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
K
 
N
P
 
C
L
 
Y
T
 
F
G
 
A
A
 
M
A
 
G
S
 
S
T
 
D
A
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
R
G
 
K
A
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
F
H
 
G
R
 
K
P
x
D
S
 
E
A
 
G
W
 
M
Y
 
H
A
 
A
A
 
L
D
 
D

Q9H2A2 2-aminomuconic semialdehyde dehydrogenase; Aldehyde dehydrogenase 12; Aldehyde dehydrogenase family 8 member A1; EC 1.2.1.32 from Homo sapiens (Human) (see paper)
31% identity, 90% coverage: 21:461/492 of query aligns to 29:476/487 of Q9H2A2

query
sites
Q9H2A2
N
 
D
P
 
P
V
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
Y
W
 
C
Q
 
R
G
 
V
N
 
P
D
 
N
A
 
S
D
 
G
A
 
K
A
 
D
Q
 
E
V
 
I
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
F
P
 
P
R
 
S
W
 
W
A
 
S
R
 
S
L
 
R
S
 
S
F
 
P
A
 
Q
E
 
E
R
 
R
H
 
S
A
 
R
V
 
V
V
 
L
E
 
N
R
 
Q
F
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
Q
N
 
S
K
 
L
A
 
E
E
 
E
L
 
F
T
 
A
A
 
Q
I
 
A
I
 
E
A
 
S
R
 
K
E
 
D
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
T
R
 
L
W
 
A
E
 
L
A
 
A
A
 
R
T
 
T
-
 
M
E
 
D
V
 
I
T
 
P
A
x
R
M
 
S
I
 
V
N
 
Q
K
 
N
I
 
F
A
 
R
I
 
F
-
 
F
-
 
A
S
 
S
I
 
S
K
 
S
A
 
L
Y
 
H
H
 
H
V
 
T
R
 
S
T
 
E
G
 
C
E
 
T
Q
 
Q
R
 
M
S
 
D
E
 
H
M
 
L
P
 
G
D
 
C
G
 
M
A
 
H
A
 
Y
S
 
T
L
 
V
R
 
R
H
 
-
R
 
A
P
 
P
H
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
A
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
S
P
 
P
Y
 
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
G
 
L
H
 
Y
L
 
L
P
 
L
N
 
T
G
 
W
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
M
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
T
I
 
V
I
 
I
F
 
A
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
S
W
 
V
S
 
T
G
 
A
E
 
W
A
 
M
V
 
L
M
 
C
R
 
K
L
 
L
W
 
L
Q
 
D
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
V
Q
 
F
G
 
G
-
 
T
G
 
G
R
 
P
E
 
R
T
 
V
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
V
A
 
S
L
 
H
E
 
P
D
 
E
L
 
V
D
 
P
G
 
L
L
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
Q
N
 
P
T
 
T
G
 
A
Y
 
E
Q
 
R
L
 
I
H
 
-
R
 
T
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
A
Q
 
P
P
 
H
E
 
C
K
 
K
I
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
N
P
 
P
L
 
A
I
 
I
I
 
I
D
 
F
E
 
E
V
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
C
V
 
I
H
 
P
L
 
A
T
 
T
I
 
V
Q
 
R
S
 
S
A
 
S
F
 
F
V
 
A
T
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
C
 
C
T
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
S
R
 
R
L
 
I
L
 
F
L
 
V
K
 
Q
S
 
K
G
 
S
A
 
I
Q
 
Y
G
 
S
D
 
E
A
 
-
F
 
F
L
 
L
A
 
K
R
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
E
V
 
A
S
 
T
Q
 
R
R
 
K
L
 
W
T
 
K
P
 
V
G
 
G
N
 
I
W
 
P
D
 
S
D
 
D
E
 
-
P
 
P
Q
 
L
P
 
V
F
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
S
E
 
K
Q
 
A
A
 
H
A
 
L
Q
 
E
Q
 
K
V
 
V
V
 
R
T
 
S
A
 
Y
W
 
V
Q
 
K
Q
 
R
L
 
A
E
 
L
A
 
A
M
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
C
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
D
P
 
K
L
 
L
L
 
S
A
 
L
P
 
P
R
 
A
L
 
R
L
 
N
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
Y
S
 
F
L
 
M
L
 
L
T
 
P
P
 
T
G
 
V
I
 
I
I
 
T
E
 
D
M
 
I
T
 
K
G
 
D
V
 
E
A
 
S
G
 
C
V
 
C
P
 
M
D
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
T
R
 
C
V
 
V
W
 
V
R
 
P
Y
 
F
D
 
D
T
 
S
F
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
I
R
 
E
M
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
V
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
C
 
A
G
 
T
L
 
V
V
 
W
S
 
S
P
 
S
E
 
N
R
 
V
E
 
G
K
 
R
F
 
V
D
 
H
Q
 
R
L
 
V
L
 
A
L
 
K
E
 
K
A
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
T
K
 
N
P
 
C
L
 
W
T
 
L
G
 
I
A
x
R
A
 
E
S
 
L
T
 
N
A
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
M
G
 
K
A
 
S
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
G
A
 
A
W
 
K
Y
 
D
A
 
S
A
 
Y
D
 
D
Y
 
F

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
32% identity, 93% coverage: 5:461/492 of query aligns to 14:471/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
E
W
 
W
I
 
L
T
 
D
G
 
A
Q
 
N
G
 
N
A
 
G
S
 
E
R
 
A
V
 
I
K
 
D
-
 
V
R
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
D
V
 
K
L
 
L
W
 
G
Q
 
S
G
 
V
N
 
P
D
 
K
A
 
M
D
 
G
A
 
A
A
 
D
Q
 
E
V
 
T
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
C
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
N
A
 
R
A
 
A
F
 
L
P
 
P
R
 
A
W
 
W
A
 
R
R
 
A
L
 
L
S
 
T
F
 
A
A
 
K
E
 
E
R
 
R
H
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
L
E
 
R
R
 
N
F
 
W
A
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
M
E
 
M
S
 
E
N
 
H
K
 
Q
A
 
D
E
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
R
I
 
L
I
 
M
A
 
T
R
 
L
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
K
T
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
S
A
 
-
M
 
-
I
 
-
N
 
-
K
 
-
I
 
Y
A
 
A
I
 
A
S
 
S
I
 
F
K
 
I
A
 
E
Y
 
W
H
 
F
V
 
A
R
 
E
T
 
E
G
 
G
E
 
K
Q
 
R
-
 
I
-
 
Y
R
 
G
S
 
D
E
 
T
M
 
I
P
 
P
D
 
G
G
 
H
A
 
Q
A
 
A
S
 
D
L
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
I
-
 
V
-
 
I
H
 
K
R
 
Q
P
 
P
H
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
I
G
 
T
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
A
H
 
A
L
 
M
P
 
I
N
 
T
G
 
R
H
 
K
I
 
A
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
I
 
M
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
x
S
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
F
S
 
S
G
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
A
R
 
E
L
 
L
W
 
A
Q
 
I
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
N
 
N
L
 
V
V
 
V
Q
 
T
G
 
G
G
 
S
R
x
A
-
 
G
E
 
A
T
 
V
G
|
G
Q
 
N
A
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
S
L
 
N
E
 
P
D
 
L
L
 
V
D
 
R
G
 
K
L
 
L
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
x
I
G
 
G
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
L
H
 
M
R
 
E
Q
 
Q
L
 
C
S
 
A
G
 
K
Q
 
D
P
 
I
E
 
K
K
 
K
I
 
V
L
 
-
A
 
S
L
 
L
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
A
P
 
P
L
 
F
I
 
I
I
 
V
D
 
F
E
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
E
L
 
G
T
 
A
I
 
L
Q
 
A
S
 
S
A
 
K
F
 
F
V
 
R
T
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
C
|
C
T
 
V
C
 
C
A
 
A
R
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
Y
L
 
V
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
A
 
V
Q
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
Q
A
 
Q
V
 
A
S
 
M
Q
 
S
R
 
K
L
 
L
T
 
H
P
 
I
G
 
G
N
 
D
W
 
G
D
 
L
D
 
D
E
 
N
P
 
G
Q
 
V
P
 
T
F
 
-
I
 
I
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
Q
x
K
V
 
V
V
 
E
T
 
E
A
 
H
W
 
I
Q
 
A
Q
 
D
L
 
A
E
 
L
A
 
E
M
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
V
L
 
V
L
 
C
A
 
G
P
 
G
R
 
K
L
 
A
L
 
H
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
T
 
G
S
 
N
L
 
F
L
 
F
T
 
Q
P
 
P
G
 
T
I
 
I
-
 
L
I
 
V
E
 
D
M
 
V
T
 
P
G
 
A
V
 
N
A
 
A
G
 
K
V
 
V
P
 
S
D
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
R
 
P
V
 
L
W
 
F
R
 
R
Y
 
F
D
 
K
T
 
D
F
 
E
D
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
A
M
 
Q
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
A
C
 
A
G
 
Y
L
 
F
V
 
Y
S
 
A
P
 
R
E
 
D
R
 
L
E
 
S
K
 
R
F
 
V
D
 
F
Q
 
R
L
 
V
L
 
G
L
 
E
E
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
G
W
 
I
N
 
N
K
 
T
P
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
-
A
 
S
A
 
N
S
 
E
T
 
V
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
K
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
L
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
G
A
 
S
W
 
K
Y
 
Y
A
 
G
-
 
I
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 93% coverage: 5:461/492 of query aligns to 15:472/482 of P25526

query
sites
P25526
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
E
W
 
W
I
 
L
T
 
D
G
 
A
Q
 
N
G
 
N
A
 
G
S
 
E
R
 
A
V
 
I
K
 
D
-
 
V
R
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
D
V
 
K
L
 
L
W
 
G
Q
 
S
G
 
V
N
 
P
D
 
K
A
 
M
D
 
G
A
 
A
A
 
D
Q
 
E
V
 
T
E
 
R
Q
 
A
A
 
A
C
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
N
A
 
R
A
 
A
F
 
L
P
 
P
R
 
A
W
 
W
A
 
R
R
 
A
L
 
L
S
 
T
F
 
A
A
 
K
E
 
E
R
 
R
H
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
L
E
 
R
R
 
N
F
 
W
A
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
M
E
 
M
S
 
E
N
 
H
K
 
Q
A
 
D
E
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
R
I
 
L
I
 
M
A
 
T
R
 
L
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
K
T
 
G
E
 
E
V
 
I
T
 
S
A
 
-
M
 
-
I
 
-
N
 
-
K
 
-
I
 
Y
A
 
A
I
 
A
S
 
S
I
 
F
K
 
I
A
 
E
Y
 
W
H
 
F
V
 
A
R
 
E
T
 
E
G
 
G
E
 
K
Q
 
R
-
 
I
-
 
Y
R
 
G
S
 
D
E
 
T
M
 
I
P
 
P
D
 
G
G
 
H
A
 
Q
A
 
A
S
 
D
L
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
I
-
 
V
-
 
I
H
 
K
R
 
Q
P
 
P
H
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
I
G
 
T
P
 
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
G
 
A
H
 
A
L
 
M
P
 
I
N
 
T
G
 
R
H
 
K
I
 
A
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
T
 
T
I
 
M
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
|
P
S
x
A
E
x
S
L
 
Q
T
 
T
P
 
P
W
 
F
S
 
S
G
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
A
R
 
E
L
 
L
W
 
A
Q
 
I
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
N
 
N
L
 
V
V
 
V
Q
 
T
G
 
G
G
 
S
R
 
A
-
 
G
E
 
A
T
 
V
G
 
G
Q
 
N
A
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
S
L
 
N
E
 
P
D
 
L
L
 
V
D
 
R
G
 
K
L
 
L
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
N
 
E
T
 
I
G
 
G
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
L
H
 
M
R
 
E
Q
 
Q
L
 
C
S
 
A
G
 
K
Q
 
D
P
 
I
E
 
K
K
 
K
I
 
V
L
 
-
A
 
S
L
 
L
E
 
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
A
P
 
P
L
 
F
I
 
I
I
 
V
D
 
F
E
 
D
V
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
E
L
 
G
T
 
A
I
 
L
Q
 
A
S
 
S
A
 
K
F
 
F
V
 
R
T
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
C
 
C
T
 
V
C
 
C
A
 
A
R
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
Y
L
 
V
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
A
 
V
Q
 
Y
G
 
-
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
Q
A
 
Q
V
 
A
S
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
L
T
 
H
P
 
I
G
 
G
N
 
D
W
 
G
D
 
L
D
 
D
E
 
N
P
 
G
Q
 
V
P
 
T
F
 
-
I
 
I
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
E
T
 
E
A
 
H
W
 
I
Q
 
A
Q
 
D
L
 
A
E
 
L
A
 
E
M
 
K
G
 
G
G
 
A
R
 
R
P
 
V
L
 
V
L
 
C
A
 
G
P
 
G
R
 
K
L
 
A
L
 
H
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
T
 
G
S
 
N
L
 
F
L
 
F
T
 
Q
P
 
P
G
 
T
I
 
I
-
 
L
I
 
V
E
 
D
M
 
V
T
 
P
G
 
A
V
 
N
A
 
A
G
 
K
V
 
V
P
 
S
D
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
R
 
P
V
 
L
W
 
F
R
 
R
Y
 
F
D
 
K
T
 
D
F
 
E
D
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
A
M
 
Q
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
R
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
A
C
 
A
G
 
Y
L
 
F
V
 
Y
S
 
A
P
 
R
E
 
D
R
 
L
E
 
S
K
 
R
F
 
V
D
 
F
Q
 
R
L
 
V
L
 
G
L
 
E
E
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
V
 
V
N
 
G
W
 
I
N
 
N
K
 
T
P
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
-
A
 
S
A
 
N
S
 
E
T
 
V
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
K
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
L
H
 
G
R
 
R
P
 
E
S
 
G
A
 
S
W
 
K
Y
 
Y
A
 
G
-
 
I
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
30% identity, 91% coverage: 3:452/492 of query aligns to 9:463/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
L
 
L
W
 
Y
I
 
I
N
 
G
G
 
G
D
 
R
W
 
Y
I
 
V
-
 
E
T
 
A
G
 
S
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
F
V
 
E
K
 
T
R
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
W
 
A
Q
 
K
G
 
V
N
 
Q
D
 
R
A
 
A
D
 
S
A
 
R
A
 
E
Q
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
C
 
V
R
 
Q
A
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
R
 
V
W
 
W
A
 
A
R
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
A
 
M
E
 
Q
R
 
R
H
 
S
A
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
R
R
 
R
F
 
A
A
 
V
A
 
D
L
 
I
L
 
L
E
 
R
S
 
E
N
 
R
K
 
N
A
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
A
E
 
E
A
 
T
-
 
R
A
 
S
T
 
V
E
 
D
V
 
I
T
 
V
A
 
T
M
 
G
I
 
A
N
 
D
K
 
V
I
 
L
A
 
E
I
 
Y
S
 
Y
I
 
A
K
 
G
A
 
L
Y
 
V
H
 
P
V
 
A
R
 
I
T
 
E
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
I
S
 
P
E
 
L
M
 
R
P
 
E
D
 
T
G
 
S
A
 
F
A
 
V
S
 
Y
L
 
T
R
 
R
H
 
R
R
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
G
F
 
I
G
|
G
P
x
A
Y
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
G
 
V
H
 
Q
L
 
I
P
 
A
N
 
L
G
 
W
H
x
K
I
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
I
 
M
I
 
I
F
 
F
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
|
E
L
 
V
T
 
T
P
 
P
W
 
L
S
 
T
G
 
A
E
 
L
A
 
K
V
 
L
M
 
A
R
 
E
L
 
I
W
 
Y
Q
 
T
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
N
 
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
T
G
 
G
-
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
T
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
W
L
 
L
S
 
T
A
 
E
L
 
H
E
 
P
D
 
L
L
 
I
D
 
E
G
 
K
L
 
I
L
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
x
G
A
x
T
N
x
S
T
|
T
G
 
G
Y
 
K
Q
 
K
L
 
V
H
 
M
R
 
A
Q
 
S
L
 
A
S
 
S
G
 
S
Q
 
S
P
 
S
E
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
T
L
 
M
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P