SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 16147 FitnessBrowser__Keio:16147 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1h5tA Thymidylyltransferase complexed with thymidylyldiphosphate-glucose (see paper)
100% identity, 99% coverage: 2:291/293 of query aligns to 1:290/290 of 1h5tA

query
sites
1h5tA
K
 
K
M
 
M
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
D
|
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
|
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
K
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
M
 
M
T
 
T
K
 
K
D
 
D

1h5rA Thymidylyltransferase complexed with thimidine and glucose-1-phospate (see paper)
100% identity, 99% coverage: 2:291/293 of query aligns to 1:290/290 of 1h5rA

query
sites
1h5rA
K
 
K
M
 
M
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
|
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
K
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
M
 
M
T
 
T
K
 
K
D
 
D

1h5sB Thymidylyltransferase complexed with tmp (see paper)
99% identity, 99% coverage: 1:291/293 of query aligns to 1:291/291 of 1h5sB

query
sites
1h5sB
M
 
M
K
 
K
M
 
M
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
|
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
D
|
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
L
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
|
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
F
R
|
R
K
 
K
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
K
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
M
 
Q
T
 
T
K
 
K
D
 
D

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
93% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 1:290/292 of P26393

query
sites
P26393
M
 
M
K
 
K
M
 
T
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
K
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
|
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
S
K
 
K
N
 
N
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
L
K
 
K
M
 
M
T
 
V
K
 
K

3pkpA Q83s variant of s. Enterica rmla with datp (see paper)
92% identity, 99% coverage: 1:290/293 of query aligns to 1:290/290 of 3pkpA

query
sites
3pkpA
M
 
M
K
 
K
M
 
T
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
|
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
x
S
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
|
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
K
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
S
K
 
K
N
 
N
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
L
K
 
K
M
 
M
T
 
V
K
 
K

1iinA Thymidylyltransferase complexed with udp-glucose (see paper)
92% identity, 99% coverage: 1:289/293 of query aligns to 1:289/289 of 1iinA

query
sites
1iinA
M
 
M
K
 
K
M
 
T
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
|
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
K
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
S
K
 
K
N
 
N
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
L
K
 
K
M
 
M
T
 
V

1iimA Thymidylyltransferase complexed with ttp (see paper)
92% identity, 99% coverage: 1:289/293 of query aligns to 1:289/289 of 1iimA

query
sites
1iimA
M
 
M
K
 
K
M
 
T
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
Q
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
D
 
D
L
 
L
P
|
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
K
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
|
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
S
K
 
K
N
 
N
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
L
K
 
K
M
 
M
T
 
V

3pkpB Q83s variant of s. Enterica rmla with datp (see paper)
92% identity, 99% coverage: 2:290/293 of query aligns to 1:289/289 of 3pkpB

query
sites
3pkpB
K
 
K
M
 
T
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
|
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
x
S
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
|
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
K
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
|
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
S
K
 
K
N
 
N
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
L
K
 
K
M
 
M
T
 
V
K
 
K

3pkqA Q83d variant of s. Enterica rmla with dgtp (see paper)
92% identity, 98% coverage: 4:290/293 of query aligns to 2:285/285 of 3pkqA

query
sites
3pkqA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
T
 
T
M
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
Q
x
D
P
 
P
S
|
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
H
D
 
D
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
|
L
G
|
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
D
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
M
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
|
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
S
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
K
G
 
N
F
 
F
I
 
I
D
 
N
V
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
R
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
G
P
 
P
L
 
L
I
 
S
K
 
K
N
 
N
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
L
K
 
K
M
 
M
T
 
V
K
 
K

5fuhA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 8:296/298 of 5fuhA

query
sites
5fuhA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
x
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

4b4bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 8:296/298 of 4b4bA

query
sites
4b4bA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 12:300/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
R
 
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

3zllA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 7:295/297 of 3zllA

query
sites
3zllA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

3zlkA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 7:295/297 of 3zlkA

query
sites
3zlkA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
Y
R
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

5fu8A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 7:295/297 of 5fu8A

query
sites
5fu8A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
x
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

4b2wA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 7:295/297 of 4b2wA

query
sites
4b2wA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
S
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

5fyeA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 6:294/296 of 5fyeA

query
sites
5fyeA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

5fu0A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 6:294/296 of 5fu0A

query
sites
5fu0A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
x
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
R
 
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

5ftvA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 6:294/296 of 5ftvA

query
sites
5ftvA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
x
F
P
 
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
F
 
Y
R
|
R
K
x
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

5ftsA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
76% identity, 99% coverage: 4:292/293 of query aligns to 6:294/296 of 5ftsA

query
sites
5ftsA
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
M
 
L
A
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
K
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
N
D
 
D
D
 
L
C
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
L
 
F
P
x
H
K
 
E
L
 
L
M
 
L
E
 
G
A
 
S
A
 
A
V
 
S
N
 
Q
K
 
R
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
N
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
K
 
Q
N
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
E
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
I
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
V
 
V
A
 
E
M
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
Q
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
G
N
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
|
V
S
x
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
F
 
Y
R
 
R
K
 
Q
G
 
K
F
 
W
I
 
I
D
 
D
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
A
K
 
K
N
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
K
K
 
R
M
 
L
T
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
T

Query Sequence

>16147 FitnessBrowser__Keio:16147
MKMRKGIILAGGSGTRLYPVTMAVSKQLLPIYDKPMIYYPLSTLMLAGIRDILIISTPQD
TPRFQQLLGDGSQWGLNLQYKVQPSPDGLAQAFIIGEEFIGGDDCALVLGDNIFYGHDLP
KLMEAAVNKESGATVFAYHVNDPERYGVVEFDKNGTAISLEEKPLEPKSNYAVTGLYFYD
NDVVQMAKNLKPSARGELEITDINRIYLEQGRLSVAMMGRGYAWLDTGTHQSLIEASNFI
ATIEERQGLKVSCPEEIAFRKGFIDVEQVRKLAVPLIKNNYGQYLYKMTKDSN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory