SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 16166 FitnessBrowser__Keio:16166 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
38% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 105:232/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
L
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
R
K
 
Q
K
 
S
N
 
R
V
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
L
L
 
A
Y
 
L
R
 
H
I
 
S
I
 
R
T
 
I
E
 
A
C
 
N
F
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
G
F
 
I
T
 
L
I
 
F
H
 
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
x
L
H
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
T
G
 
G
A
 
G
D
 
D
N
 
R
M
 
H
A
 
-
C
 
-
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
K
L
 
I
G
 
G
N
 
E
N
 
G
V
 
A
T
x
K
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
D
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
R
A
 
T
L
 
T
V
 
A
V
|
V
G
 
G
E
 
N
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
L

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
37% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 112:242/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
L
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
R
K
 
Q
K
 
S
N
 
R
V
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
L
L
 
A
Y
 
L
R
 
H
I
 
S
I
 
R
T
 
I
E
 
A
C
 
N
F
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
G
F
 
I
T
 
L
I
 
F
H
 
D
H
 
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
T
G
 
G
A
 
K
-
 
V
D
 
G
N
 
G
M
 
D
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
K
L
 
I
G
 
G
N
 
E
N
 
G
V
 
A
T
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
R
A
 
T
L
 
T
V
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
N
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
L

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
42% identity, 63% coverage: 56:157/162 of query aligns to 139:241/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
F
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
Y
R
 
G
F
 
L
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
N
F
 
I
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
 
G
R
 
S
G
 
G
A
 
K
D
 
E
N
 
G
M
 
G
-
 
D
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
A
I
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
D
 
S
S
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
S
A
 
I
L
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
K

Sites not aligning to the query:

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
42% identity, 63% coverage: 56:157/162 of query aligns to 141:243/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
F
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
Y
R
 
G
F
 
L
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
N
F
 
I
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
S
G
 
G
A
 
K
D
 
E
N
 
G
-
 
G
M
 
D
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
A
I
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
D
 
S
S
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
S
A
 
I
L
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
K

Sites not aligning to the query:

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
34% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 112:242/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
F
 
W
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
N
K
 
K
K
 
G
N
 
R
V
 
R
L
 
A
N
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
F
Y
 
L
R
 
Q
I
 
N
I
 
Q
T
 
V
E
 
S
C
 
V
F
 
S
F
 
F
G
 
Q
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
N
x
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
x
T
G
 
G
A
 
K
D
 
T
N
 
S
M
 
G
-
 
D
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
|
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
T
x
K
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
D
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
A
 
T
L
 
T
V
 
A
V
x
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
34% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 113:243/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
F
 
W
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
N
K
 
K
K
 
G
N
 
R
V
 
R
L
 
A
N
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
F
Y
 
L
R
 
Q
I
 
N
I
 
Q
T
 
V
E
 
S
C
 
V
F
 
S
F
 
F
G
 
Q
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
L
H
 
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
x
L
H
x
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
 
G
R
 
T
G
 
G
A
 
K
D
 
T
N
 
S
M
 
G
-
 
D
A
 
R
C
 
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
A
 
T
L
x
T
V
 
A
V
x
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
34% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 109:239/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
F
 
W
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
N
K
 
K
K
 
G
N
 
R
V
 
R
L
 
A
N
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
F
Y
 
L
R
 
Q
I
 
N
I
 
Q
T
 
V
E
 
S
C
 
V
F
 
S
F
 
F
G
 
Q
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
T
G
 
G
A
 
K
D
 
T
N
 
S
M
 
G
-
 
D
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
A
 
T
L
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
35% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 116:246/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
F
 
W
C
 
-
S
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
L
 
L
W
 
W
A
 
A
A
 
Q
-
 
D
-
 
R
-
 
K
P
 
A
L
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
Y
Y
 
L
R
 
Q
I
 
N
I
 
Q
T
 
V
E
 
S
C
 
V
F
 
A
F
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
C
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
 
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
V
G
 
E
D
 
N
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
|
G
N
x
G
R
 
T
G
 
G
A
 
K
D
 
T
N
 
S
-
 
G
M
 
D
A
x
R
C
 
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
A
N
 
H
A
 
T
L
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
34% identity, 85% coverage: 21:158/162 of query aligns to 110:239/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
Y
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
A
H
 
N
F
 
W
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
R
K
 
Q
-
 
G
K
 
R
N
 
K
V
 
A
L
 
L
N
 
A
N
 
T
L
x
Y
W
 
F
A
 
Q
A
 
N
P
x
Q
L
 
I
L
 
S
V
 
V
L
 
A
Y
 
C
R
 
Q
I
 
V
I
 
-
T
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
V
G
 
E
D
 
D
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
Q
G
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
T
G
 
G
A
 
K
D
 
E
N
 
-
M
 
-
A
 
-
C
 
C
-
 
G
-
 
D
-
x
R
-
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
E
N
 
G
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
A
 
T
L
 
T
V
 
V
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
32% identity, 91% coverage: 12:158/162 of query aligns to 105:243/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
L
 
L
R
 
K
P
 
G
C
 
F
C
 
H
M
 
A
V
 
I
L
 
Q
A
 
T
Y
 
H
R
 
R
V
 
L
A
 
A
H
 
H
F
 
W
C
 
L
S
 
Y
V
 
K
W
 
Q
R
 
G
K
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
F
L
 
A
N
 
Y
N
 
Y
L
 
L
W
 
Q
A
 
S
A
 
R
P
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
S
E
 
S
C
 
S
F
 
I
F
 
F
G
 
Q
Y
 
T
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
S
R
 
G
F
 
L
T
 
F
I
 
L
H
 
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
L
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
V
G
 
E
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
 
G
R
 
T
G
 
G
-
 
K
A
 
S
D
 
S
N
 
G
M
 
D
A
 
R
C
 
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
L
L
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
Q
L
 
V
G
 
G
N
 
Q
N
 
C
V
 
S
T
 
K
V
 
I
G
x
A
A
|
A
G
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
K
S
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
H
N
 
N
A
 
V
L
x
T
V
 
V
V
x
A
G
|
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
33% identity, 86% coverage: 20:158/162 of query aligns to 113:243/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
G
H
 
H
F
 
W
C
 
-
S
 
-
V
 
L
W
 
W
R
 
-
K
 
-
K
 
-
N
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
N
L
 
Q
W
 
G
A
 
R
A
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
F
Y
 
L
R
 
Q
I
 
N
I
 
Q
T
 
V
E
 
S
C
 
V
F
 
T
F
 
F
G
 
Q
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
L
H
x
D
H
 
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
T
G
 
G
-
 
K
A
 
S
D
 
G
N
 
G
M
 
D
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
K
I
 
I
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
A
 
T
L
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
32% identity, 87% coverage: 18:158/162 of query aligns to 107:239/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
V
 
I
L
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
R
 
R
V
 
I
A
 
T
H
 
H
F
 
Y
C
 
L
S
 
W
V
 
N
W
 
Q
R
 
N
K
 
R
K
 
K
N
 
S
V
 
L
L
 
A
N
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
Y
 
Q
R
 
N
I
 
Q
I
 
I
T
 
S
E
 
-
C
 
V
F
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
H
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
F
H
x
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
 
L
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
 
G
R
 
T
G
 
G
A
 
K
D
 
E
N
 
S
-
 
G
M
 
D
A
 
R
C
 
H
P
 
P
H
 
K
I
 
V
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
K
N
 
Y
V
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
N
S
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
A
 
A
L
 
T
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
31% identity, 79% coverage: 31:158/162 of query aligns to 85:232/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
R
 
R
K
 
H
K
 
R
N
 
D
V
 
P
L
 
A
N
 
V
N
 
E
L
 
L
W
 
W
A
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
I
 
T
T
 
H
E
 
Y
C
 
L
F
 
W
-
 
N
-
 
Q
-
 
N
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
Y
-
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
A
F
 
F
G
 
D
Y
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
H
R
 
G
F
 
I
T
 
M
I
 
F
H
 
D
H
|
H
G
 
A
Y
 
T
A
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
F
 
V
T
 
S
I
 
I
R
x
L
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
G
R
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
M
 
-
A
x
T
C
 
H
P
 
P
H
 
K
I
 
V
G
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
M
L
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
L
|
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
E
L
 
V
G
 
G
N
 
K
N
 
Y
V
 
A
T
x
K
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
N
S
 
S
V
|
V
V
 
V
L
|
L
D
 
N
S
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
A
 
A
L
x
T
V
 
A
V
x
A
G
 
G
E
x
V
K
x
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
32% identity, 65% coverage: 57:162/162 of query aligns to 163:269/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
G
 
G
Y
 
I
E
 
D
I
 
I
Q
 
H
A
 
P
A
 
G
A
 
T
T
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
N
R
 
H
F
 
F
T
 
F
I
 
I
H
x
D
H
|
H
G
 
G
Y
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
G
K
 
E
N
 
T
V
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
W
F
 
C
T
 
R
I
 
V
R
 
Y
H
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
G
N
x
A
R
 
M
G
 
S
A
 
F
D
 
K
-
 
G
N
 
N
M
 
K
A
x
R
C
x
H
P
 
P
H
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
F
V
 
V
E
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
T
L
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
N
S
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
T
D
 
Q
S
 
N
V
 
I
P
 
D
D
 
Q
N
 
D
A
 
Q
L
 
I
V
 
V
V
 
F
G
 
I
E
 
S
K
 
E
A
 
H
R
 
P
V
 
S
K
 
Q
V
 
I
I
 
T
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
36% identity, 61% coverage: 60:158/162 of query aligns to 25:139/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
I
 
I
Q
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
N
F
 
C
T
 
N
I
 
I
H
x
C
H
x
A
G
 
N
Y
 
-
A
 
-
V
 
S
V
 
L
I
 
I
N
 
E
K
 
N
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
S
G
|
G
V
 
V
T
 
Q
I
 
I
-
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
x
F
-
 
I
-
 
G
G
 
P
N
|
N
R
 
V
G
 
T
A
 
F
D
x
T
N
|
N
M
x
D
A
x
K
C
 
Q
P
|
P
H
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
I
I
 
V
G
 
K
N
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
S
L
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
V
 
S
I
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
P
D
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
I
G
 
G
N
 
E
N
 
N
V
 
A
T
 
M
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
L
x
T
D
x
K
S
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
A
L
 
I
V
 
V
V
x
I
G
 
G
E
 
N
K
 
P
A
 
G
R
|
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4mzuF Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
36% identity, 61% coverage: 60:158/162 of query aligns to 25:140/294 of 4mzuF

query
sites
4mzuF
I
 
I
Q
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
T
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
N
F
 
C
T
 
N
I
 
I
H
 
-
H
 
-
G
x
C
Y
 
A
A
 
N
V
 
S
V
 
L
I
 
I
N
 
E
K
 
N
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
T
I
 
I
R
 
K
H
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
I
 
I
-
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
G
G
 
P
N
 
N
R
 
V
G
 
T
A
 
F
D
 
T
N
|
N
M
x
D
A
x
K
C
 
Q
P
 
P
H
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
I
I
 
V
G
 
K
N
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
S
L
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
V
 
S
I
 
T
I
 
I
L
|
L
G
 
P
D
 
G
I
 
I
T
 
L
L
 
I
G
 
G
N
 
E
N
 
N
V
 
A
T
 
M
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
L
x
T
D
x
K
S
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
A
L
 
I
V
 
V
V
x
I
G
 
G
E
x
N
K
 
P
A
 
G
R
|
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
25% identity, 91% coverage: 12:158/162 of query aligns to 26:180/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
L
 
L
R
 
R
P
 
G
C
 
K
C
 
T
M
 
L
V
 
M
L
 
Y
A
 
E
Y
 
F
R
 
N
V
 
H
A
 
S
H
 
H
F
 
P
C
 
S
S
 
E
V
 
V
W
 
E
R
 
K
K
 
R
K
 
E
N
 
S
V
 
L
L
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
F
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
G
N
 
E
N
 
N
L
 
A
W
 
W
A
 
V
A
 
E
P
 
P
L
 
P
L
 
V
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
Y
 
Y
E
 
-
I
 
-
Q
 
G
A
 
S
A
 
N
A
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
N
F
 
F
T
 
Y
I
 
A
H
x
N
H
 
F
G
 
N
Y
 
L
A
 
T
V
 
I
V
 
V
I
 
D
N
 
D
K
 
Y
N
 
T
V
 
V
V
 
T
A
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
L
I
|
I
R
x
A
H
x
P
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
S
-
 
V
-
x
T
-
 
G
-
x
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
N
 
R
R
 
K
G
 
N
A
 
G
D
 
E
N
 
M
M
 
Y
A
 
S
C
 
F
P
 
P
-
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
 
N
V
 
V
E
 
W
L
 
I
G
|
G
A
x
S
N
 
H
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
x
N
G
 
P
D
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
T
 
V
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
T
D
 
K
S
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
A
V
x
A
G
 
G
E
 
V
K
x
P
A
 
C
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
25% identity, 91% coverage: 12:158/162 of query aligns to 27:181/203 of P07464

query
sites
P07464
L
 
L
R
 
R
P
 
G
C
 
K
C
 
T
M
 
L
V
 
M
L
 
Y
A
 
E
Y
 
F
R
 
N
V
 
H
A
 
S
H
 
H
F
 
P
C
 
S
S
 
E
V
 
V
W
 
E
R
 
K
K
 
R
K
 
E
N
 
S
V
 
L
L
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
F
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
G
N
 
E
N
 
N
L
 
A
W
 
W
A
 
V
A
 
E
P
 
P
L
 
P
L
 
V
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
Y
F
 
F
G
x
S
Y
 
Y
E
 
-
I
 
-
Q
 
G
A
 
S
A
 
N
A
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
N
F
 
F
T
 
Y
I
 
A
H
x
N
H
 
F
G
 
N
Y
 
L
A
 
T
V
 
I
V
 
V
I
 
D
N
x
D
K
 
Y
N
 
T
V
 
V
V
 
T
A
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
L
I
 
I
R
 
A
H
 
P
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
N
 
R
R
 
K
G
 
N
A
 
G
D
 
E
N
 
M
M
 
Y
A
 
S
C
 
F
P
 
P
-
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
 
N
V
 
V
E
 
W
L
 
I
G
 
G
A
x
S
N
 
H
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
G
 
P
D
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
x
T
D
x
K
S
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
 
P
A
 
C
R
|
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
25% identity, 91% coverage: 12:158/162 of query aligns to 26:180/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
L
 
L
R
 
R
P
 
G
C
 
K
C
 
T
M
 
L
V
 
M
L
 
Y
A
 
E
Y
 
F
R
 
N
V
 
H
A
 
S
H
 
H
F
 
P
C
 
S
S
 
E
V
 
V
W
 
E
R
 
K
K
 
R
K
 
E
N
 
S
V
 
L
L
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
F
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
G
N
 
E
N
 
N
L
 
A
W
 
W
A
 
V
A
 
E
P
 
P
L
 
P
L
 
V
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
Y
F
 
F
G
x
S
Y
 
Y
E
 
-
I
 
-
Q
 
G
A
 
S
A
 
N
A
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
N
F
 
F
T
x
Y
I
 
A
H
x
N
H
 
F
G
 
N
Y
 
L
A
 
T
V
 
I
V
|
V
I
 
D
N
x
D
K
 
Y
N
 
T
V
 
V
V
 
T
A
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
L
I
 
I
R
x
A
H
 
P
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
x
S
-
 
V
-
x
T
-
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
N
 
R
R
 
K
G
 
N
A
 
G
D
 
E
N
x
M
M
 
Y
A
 
S
C
 
F
P
 
P
-
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
 
N
V
 
V
E
x
W
L
 
I
G
|
G
A
x
S
N
 
H
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
x
N
G
 
P
D
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
T
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
T
D
 
K
S
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
x
P
A
 
C
R
|
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
25% identity, 91% coverage: 12:158/162 of query aligns to 26:180/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
L
 
L
R
 
R
P
 
G
C
 
K
C
 
T
M
 
L
V
 
M
L
 
Y
A
 
E
Y
 
F
R
 
N
V
 
H
A
 
S
H
 
H
F
 
P
C
 
S
S
 
E
V
 
V
W
 
E
R
 
K
K
 
R
K
 
E
N
 
S
V
 
L
L
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
F
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
G
N
 
E
N
 
N
L
 
A
W
|
W
A
 
V
A
 
E
P
 
P
L
 
P
L
 
V
V
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
C
 
-
F
 
Y
F
 
F
G
x
S
Y
 
Y
E
 
-
I
 
-
Q
 
G
A
 
S
A
 
N
A
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
N
F
 
F
T
x
Y
I
 
A
H
x
N
H
 
F
G
 
N
Y
 
L
A
 
T
V
 
I
V
|
V
I
 
D
N
x
D
K
 
Y
N
 
T
V
 
V
V
 
T
A
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
V
T
x
L
I
 
I
R
 
A
H
 
P
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
G
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
N
 
R
R
 
K
G
 
N
A
 
G
D
 
E
N
x
M
M
 
Y
A
 
S
C
 
F
P
 
P
-
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
N
G
 
N
V
 
V
E
x
W
L
 
I
G
|
G
A
x
S
N
 
H
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
G
 
P
D
 
G
I
 
V
T
 
T
L
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
T
 
V
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
T
D
 
K
S
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
A
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
V
K
x
P
A
 
C
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>16166 FitnessBrowser__Keio:16166
MLEDLRANSWSLRPCCMVLAYRVAHFCSVWRKKNVLNNLWAAPLLVLYRIITECFFGYEI
QAAATIGRRFTIHHGYAVVINKNVVAGDDFTIRHGVTIGNRGADNMACPHIGNGVELGAN
VIILGDITLGNNVTVGAGSVVLDSVPDNALVVGEKARVKVIK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory