SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 16330 FitnessBrowser__Keio:16330 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

9ctdB Ctfab f42ts45c mutant co-crystallized with acetyl-coa (see paper)
57% identity, 97% coverage: 2:210/216 of query aligns to 1:211/214 of 9ctdB

query
sites
9ctdB
D
 
N
A
 
P
K
|
K
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
Q
I
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
|
L
P
 
P
T
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
K
G
 
D
I
 
I
H
 
H
I
 
V
T
 
T
L
 
F
Q
 
Q
S
 
C
E
|
E
N
 
N
G
 
G
F
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
A
T
 
P
T
 
K
A
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
H
 
N
P
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
A
Q
 
S
P
 
Y
C
 
I
G
 
T
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
M
M
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
M
 
F
S
 
S
F
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
L
D
 
D
A
 
V
C
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
|
G
L
|
L
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
E
A
 
G
N
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
|
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
|
G
G
|
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
M
 
M
E
 
T
H
 
H
C
 
T
A
|
A
K
 
K
D
 
-
G
 
G
S
 
T
A
 
P
K
|
K
I
 
I
L
 
V
R
 
K
R
 
K
C
 
C
T
 
T
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
S
Q
 
I
H
 
R
A
 
K
V
 
V
H
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
I
R
 
E
F
 
P
I
 
T
D
 
D
G
 
E
K
 
G
M
 
L
W
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
D
 
K
G
 
E
C
 
T
D
 
T
L
 
L
A
 
D
T
 
E
V
 
V
R
 
L
A
 
K
K
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
K
F
 
L
E
 
I
V
 
I
A
 
A
A
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
K

9cryB Ctfab e46s active site mutant inactive (see paper)
56% identity, 97% coverage: 2:210/216 of query aligns to 1:211/214 of 9cryB

query
sites
9cryB
D
 
N
A
 
P
K
 
K
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
G
D
 
Q
I
 
L
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
K
G
 
D
I
 
I
H
 
H
I
 
V
T
 
F
L
 
F
Q
 
Q
S
 
S
E
x
S
N
 
N
G
 
G
F
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
A
T
 
P
T
 
K
A
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
H
 
N
P
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
A
Q
 
S
P
 
Y
C
 
I
G
 
T
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
M
M
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
M
 
F
S
 
S
F
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
L
D
 
D
A
 
V
C
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
E
A
 
G
N
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
|
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
A
M
 
M
E
 
T
H
 
H
C
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
-
G
 
G
S
 
T
A
 
P
K
 
K
I
 
I
L
 
V
R
 
K
R
 
K
C
 
C
T
 
T
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
S
Q
 
I
H
 
R
A
 
K
V
 
V
H
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
V
T
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
I
R
 
E
F
 
P
I
 
T
D
 
D
G
 
E
K
 
G
M
 
L
W
 
L
L
 
L
T
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
S
D
 
K
G
 
E
C
 
T
D
 
T
L
 
L
A
 
D
T
 
E
V
 
V
R
 
L
A
 
K
K
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
K
F
 
L
E
 
I
V
 
I
A
 
A
A
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
K

8i3yD Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
48% identity, 94% coverage: 2:204/216 of query aligns to 255:460/471 of 8i3yD

query
sites
8i3yD
D
 
E
A
 
V
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
A
D
 
N
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
M
 
E
V
 
S
A
 
S
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
N
I
 
V
T
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
F
T
 
P
T
 
T
A
 
E
H
 
D
P
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
A
D
 
D
L
 
W
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
P
 
T
C
 
I
G
 
S
V
 
H
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
M
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
M
D
 
D
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
L
Q
 
E
V
 
V
D
 
A
E
 
A
E
 
N
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
F
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
C
S
 
G
R
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
T
E
 
T
H
 
H
C
 
C
A
 
N
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
D
A
 
P
K
 
K
I
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
R
C
 
C
T
 
R
M
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
H
A
 
C
V
 
V
H
 
C
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
R
M
 
L
W
 
V
L
 
L
T
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
E
G
 
D
C
 
T
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
K
K
 
L
T
 
T
E
 
G
A
 
V
R
 
G
F
 
F
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8i40A Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with coa.
48% identity, 94% coverage: 2:204/216 of query aligns to 251:456/467 of 8i40A

query
sites
8i40A
D
 
E
A
 
V
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
A
D
 
N
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
x
I
P
 
P
T
 
T
M
 
E
V
 
S
A
 
S
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
N
I
 
V
T
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
F
T
 
P
T
 
T
A
 
E
H
 
D
P
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
A
D
 
D
L
 
W
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
P
 
T
C
 
I
G
 
S
V
 
H
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
M
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
M
D
 
D
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
|
G
G
 
A
L
|
L
Q
 
E
V
 
V
D
 
A
E
 
A
E
 
N
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
|
N
W
 
F
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
C
S
 
G
R
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
T
E
 
T
H
 
H
C
 
C
A
 
N
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
D
A
 
P
K
|
K
I
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
R
C
 
C
T
 
R
M
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
H
A
 
C
V
 
V
H
 
C
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
R
M
 
L
W
 
V
L
 
L
T
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
E
G
 
D
C
 
T
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
K
K
 
L
T
 
T
E
 
G
A
 
V
R
 
G
F
 
F
E
 
D

8i3yA Crystal structure of asct from trypanosoma brucei in complex with succinyl-coa.
48% identity, 93% coverage: 5:204/216 of query aligns to 248:450/459 of 8i3yA

query
sites
8i3yA
Q
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
A
D
 
N
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
 
I
P
 
P
T
 
T
M
 
E
V
 
S
A
 
S
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
G
I
 
V
H
 
N
I
 
V
T
 
V
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
F
 
L
L
 
I
G
 
G
L
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
F
T
 
P
T
 
T
A
 
E
H
 
D
P
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
A
D
 
D
L
 
W
V
 
I
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
x
K
Q
 
Q
P
 
T
C
 
I
G
 
S
V
 
H
L
 
L
P
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
M
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
M
D
 
D
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
L
Q
 
E
V
 
V
D
 
A
E
 
A
E
 
N
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
|
N
W
 
F
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
 
P
G
|
G
G
|
G
A
|
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
C
S
 
G
R
 
T
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
T
E
 
T
H
 
H
C
 
C
A
x
N
K
|
K
D
 
N
G
 
G
S
 
D
A
 
P
K
|
K
I
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
R
C
 
C
T
 
R
M
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
H
A
 
C
V
 
V
H
 
C
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
R
M
 
L
W
 
V
L
 
L
T
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
E
G
 
D
C
 
T
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
A
 
K
K
 
L
T
 
T
E
 
G
A
 
V
R
 
G
F
 
F
E
 
D

Sites not aligning to the query:

Q29551 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial; SCOT; 3-oxoacid CoA-transferase 1; Somatic-type succinyl-CoA:3-oxoacid CoA-transferase; SCOT-s; Succinate-coenzyme A transferase; Succinyl-CoA:3-oxoacid CoA transferase; EC 2.8.3.5 from Sus scrofa (Pig) (see 3 papers)
45% identity, 96% coverage: 2:209/216 of query aligns to 300:512/520 of Q29551

query
sites
Q29551
D
 
N
A
 
V
K
 
R
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
I
R
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
M
 
L
V
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
E
 
P
G
 
N
I
 
M
H
 
T
I
 
V
T
 
H
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
F
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
T
 
N
T
 
E
A
 
V
H
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
K
Q
 
E
P
 
T
C
 
V
G
 
T
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
F
 
F
D
 
S
S
 
S
A
 
D
M
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
V
D
 
N
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
E
 
K
E
 
Y
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
S
S
 
A
R
 
K
-
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
M
E
 
E
H
 
H
C
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
G
G
 
N
S
 
A
A
 
H
K
 
K
I
 
I
L
 
M
R
 
E
R
 
K
C
 
C
T
 
T
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
Q
A
 
C
V
 
V
H
 
N
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
-
I
 
V
D
 
D
G
 
S
K
 
K
M
 
K
W
 
G
L
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
W
D
 
E
G
 
G
C
 
L
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
D
V
 
I
R
 
K
A
 
K
K
 
S
T
 
T
E
 
G
A
 
C
R
 
D
F
 
F
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
P
D
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1o9lA Succinate:coenzyme-a transferase (pig heart)
45% identity, 96% coverage: 2:209/216 of query aligns to 248:460/468 of 1o9lA

query
sites
1o9lA
D
 
N
A
 
V
K
 
R
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
I
R
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
M
 
L
V
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
E
 
P
G
 
N
I
 
M
H
 
T
I
 
V
T
 
H
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
 
E
N
 
N
G
 
G
F
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
Y
T
 
P
T
 
L
A
 
Q
H
 
N
P
 
E
-
 
V
-
 
D
-
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
K
Q
 
E
P
 
T
C
 
V
G
 
T
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
F
 
F
D
 
S
S
 
S
A
 
D
M
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
V
D
 
N
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
E
 
K
E
 
Y
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
S
S
 
A
R
 
K
-
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
M
E
 
E
H
 
H
C
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
G
G
 
N
S
 
A
A
 
H
K
 
K
I
 
I
L
 
M
R
 
E
R
 
K
C
 
C
T
 
T
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
Q
A
 
C
V
 
V
H
 
N
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
-
I
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
K
M
 
K
W
 
G
L
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
W
D
 
E
G
 
G
C
 
L
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
D
V
 
I
R
 
K
A
 
K
K
 
S
T
 
T
E
 
G
A
 
C
R
 
D
F
 
F
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
P
D
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3k6mC Dynamic domains of succinyl-coa:3-ketoacid-coenzyme a transferase from pig heart. (see paper)
45% identity, 96% coverage: 2:209/216 of query aligns to 247:459/466 of 3k6mC

query
sites
3k6mC
D
 
N
A
 
V
K
 
R
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
I
R
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
L
M
 
L
V
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
E
 
P
G
 
N
I
 
M
H
 
T
I
 
V
T
 
H
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
F
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
T
 
N
T
 
E
A
 
V
H
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
 
K
Q
 
E
P
 
T
C
 
V
G
 
T
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
F
 
F
D
 
S
S
 
S
A
 
D
M
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
V
D
 
N
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
A
L
 
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
E
 
K
E
 
Y
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
N
W
 
W
V
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
|
V
T
 
S
G
 
S
S
x
A
R
 
K
-
x
T
K
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
M
E
 
E
H
 
H
C
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
G
G
 
N
S
 
A
A
 
H
K
 
K
I
 
I
L
 
M
R
 
E
R
 
K
C
 
C
T
 
T
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
Q
A
x
C
V
 
V
H
x
N
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
-
I
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
K
M
 
K
W
 
G
L
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
W
D
 
E
G
 
G
C
 
L
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
D
V
 
I
R
 
K
A
 
K
K
 
S
T
 
T
E
 
G
A
 
C
R
 
D
F
 
F
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
P
D
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3oxoE Succinyl-coa:3-ketoacid coa transferase from pig heart covalently bound to coa (see paper)
45% identity, 95% coverage: 5:209/216 of query aligns to 246:455/462 of 3oxoE

query
sites
3oxoE
Q
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
I
R
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
R
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
M
I
 
Y
V
 
A
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
|
I
G
|
G
L
x
I
P
 
P
T
 
L
M
 
L
V
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
F
L
 
I
P
 
S
E
 
P
G
 
N
I
 
M
H
 
T
I
 
V
T
 
H
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
E
|
E
N
 
N
G
 
G
F
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
T
 
N
T
 
E
A
 
V
H
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
K
Q
 
E
P
 
T
C
 
V
G
 
T
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
S
M
 
Y
F
 
F
D
 
S
S
 
S
A
 
D
M
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
H
 
H
I
 
V
D
 
N
A
 
L
C
 
T
V
 
M
L
 
L
G
|
G
G
 
A
L
x
M
Q
 
Q
V
 
V
D
 
S
E
 
K
E
 
Y
A
 
G
N
 
D
L
 
L
A
 
A
N
|
N
W
 
W
V
 
M
V
x
I
P
 
P
G
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
M
|
M
G
 
G
G
 
G
A
|
A
M
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
S
S
 
A
R
 
K
-
 
T
K
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
T
M
 
M
E
 
E
H
 
H
C
 
S
A
 
A
K
|
K
D
 
G
G
 
N
S
 
A
A
 
H
K
 
K
I
 
I
L
 
M
R
 
E
R
 
K
C
 
C
T
 
T
M
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
K
H
 
Q
A
 
C
V
 
V
H
 
N
M
 
R
L
 
I
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
K
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
D
F
 
-
I
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
K
M
 
K
W
 
G
L
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
W
D
 
E
G
 
G
C
 
L
D
 
T
L
 
V
A
 
D
T
 
D
V
 
I
R
 
K
A
 
K
K
 
S
T
 
T
E
 
G
A
 
C
R
 
D
F
 
F
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
P
D
 
K
L
 
L

2ahvA Crystal structure of acyl-coa transferase from e. Coli o157:h7 (ydif)- thioester complex with coa- 1 (see paper)
25% identity, 89% coverage: 1:192/216 of query aligns to 275:474/512 of 2ahvA

query
sites
2ahvA
M
 
L
D
 
N
A
 
Q
K
x
R
Q
 
K
R
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
A
A
 
L
Q
 
F
E
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
K
G
 
G
D
 
A
I
 
V
V
 
G
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
x
V
G
|
G
L
x
I
P
 
A
T
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
N
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
D
G
 
G
I
 
I
H
 
G
I
 
L
T
 
V
L
 
A
Q
 
R
S
 
E
E
 
E
-
 
G
-
 
C
-
 
A
N
 
D
G
 
D
F
 
F
L
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
V
G
x
E
L
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
T
 
-
T
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
G
Q
 
I
P
 
T
C
 
A
G
 
N
V
 
V
L
 
-
P
 
N
G
 
T
A
 
R
A
 
A
M
 
I
F
 
L
D
 
D
S
 
M
A
 
T
M
 
S
S
 
Q
F
 
F
A
 
D
L
 
F
I
 
Y
R
 
H
G
 
G
G
 
G
H
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
V
C
 
C
V
 
Y
L
 
L
G
x
S
G
 
F
L
x
A
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
E
 
Q
E
 
H
A
 
G
N
 
N
L
 
V
A
 
G
N
 
V
W
 
H
V
 
K
V
x
F
P
 
N
G
 
G
K
 
K
M
 
I
V
 
M
P
 
-
G
 
G
M
x
T
G
 
G
G
 
G
A
x
F
M
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
S
T
 
A
G
 
T
S
 
S
R
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
I
I
 
F
A
 
C
M
 
G
E
 
T
H
 
L
C
 
T
A
|
A
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
I
-
 
V
K
 
Q
D
 
E
G
 
G
S
 
R
A
 
V
K
 
K
I
 
K
L
 
F
R
 
I
R
 
R
C
 
E
T
 
L
M
 
P
P
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
F
Q
 
S
H
 
G
A
 
K
V
 
I
H
 
A
M
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
R
L
 
Y
V
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
T
F
 
L
I
 
K
D
 
E
G
 
D
K
 
G
M
 
L
W
 
H
L
 
L
T
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
P
G
 
G
C
 
V
D
 
D
L
 
L

Query Sequence

>16330 FitnessBrowser__Keio:16330
MDAKQRIARRVAQELRDGDIVNLGIGLPTMVANYLPEGIHITLQSENGFLGLGPVTTAHP
DLVNAGGQPCGVLPGAAMFDSAMSFALIRGGHIDACVLGGLQVDEEANLANWVVPGKMVP
GMGGAMDLVTGSRKVIIAMEHCAKDGSAKILRRCTMPLTAQHAVHMLVTELAVFRFIDGK
MWLTEIADGCDLATVRAKTEARFEVAADLNTQRGDL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory