SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 16525 FitnessBrowser__Keio:16525 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6qheA Alcohol dehydrogenase from arthrobacter sp. Ts-15 in complex with NAD+
43% identity, 99% coverage: 1:260/263 of query aligns to 2:261/261 of 6qheA

query
sites
6qheA
M
 
M
G
 
I
K
 
N
L
 
M
T
 
R
G
 
N
K
 
R
T
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
L
 
A
Q
x
M
G
|
G
I
x
M
G
 
G
E
 
N
G
 
G
I
 
C
A
 
A
R
 
R
T
 
K
F
 
L
A
 
A
R
 
E
H
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
|
D
I
x
R
S
 
S
P
 
N
E
 
L
I
 
V
E
 
A
K
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
Q
E
 
D
L
 
M
C
 
R
G
 
E
R
 
A
G
 
G
H
 
L
R
 
N
C
 
A
T
 
N
A
 
H
V
 
V
V
 
Q
A
 
V
D
|
D
V
x
I
R
 
T
D
 
D
P
 
Q
A
 
E
S
 
S
V
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
Y
K
 
D
R
 
G
A
 
I
K
 
A
E
 
A
K
 
E
E
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
C
 
G
R
 
D
L
 
S
G
 
R
S
 
M
F
 
F
L
 
L
D
 
D
M
 
V
S
 
D
D
 
D
D
 
A
D
 
H
R
 
Y
D
 
K
F
 
K
H
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
I
 
V
K
 
R
G
 
G
V
 
T
W
 
W
N
 
N
V
 
S
T
 
C
K
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
H
M
 
M
I
 
L
A
 
S
R
 
N
K
 
K
D
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
F
S
 
G
S
|
S
V
 
I
T
 
S
G
 
G
D
 
P
M
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
P
G
 
G
E
 
W
T
 
T
A
 
V
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
F
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
Q
 
G
S
 
Q
G
 
N
I
 
I
R
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
L
P
|
P
G
|
G
Y
 
S
V
x
M
R
 
D
T
|
T
P
|
P
M
|
M
A
 
M
E
 
R
S
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
D
S
 
T
N
 
N
P
 
P
E
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
S
 
S
V
 
V
L
 
I
T
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
A
K
 
A
A
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
T
P
 
I
L
 
D
E
 
D
V
 
A
G
 
G
E
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
A
N
 
I
V
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
S
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
A
E
 
E
T
 
Y
V
 
Q
S
 
S

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 1:255/263 of query aligns to 1:245/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
M
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
S
A
 
A
R
 
L
T
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
A
L
 
T
D
 
D
I
 
I
S
 
N
P
 
E
E
 
S
I
 
-
E
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
Q
D
 
E
E
 
L
L
 
E
C
 
S
G
 
Y
R
 
R
G
 
G
H
 
I
R
 
Q
C
 
T
T
 
R
A
 
V
V
 
L
-
 
D
V
 
V
A
 
T
D
 
K
V
 
K
R
 
R
D
 
Q
P
 
I
A
 
D
S
 
Q
V
 
F
A
 
A
A
 
S
A
 
E
I
 
I
K
 
E
R
 
R
A
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
F
C
 
V
R
 
H
L
 
H
G
 
G
S
 
T
F
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
C
S
 
E
D
 
E
D
 
K
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
F
H
 
S
I
 
M
D
 
N
I
 
L
N
 
N
I
 
V
K
 
R
G
 
S
V
 
M
W
 
F
N
 
L
V
 
M
T
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
K
M
 
M
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
T
 
A
G
 
S
D
 
S
M
 
I
V
 
K
A
 
G
D
 
V
P
 
E
G
 
N
E
 
R
T
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
L
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
A
E
 
D
Y
 
F
A
 
I
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
R
 
D
T
 
T
P
 
P
-
 
S
M
 
L
A
 
Q
E
 
E
S
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
A
Q
 
R
S
 
D
N
 
N
P
 
P
E
 
K
D
 
E
P
 
A
E
 
L
S
 
K
V
 
T
L
 
F
T
 
L
E
 
N
M
 
R
A
 
Q
K
 
K
A
 
T
I
 
-
P
 
-
M
 
-
R
 
G
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
S
P
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
E
 
L
L
 
L
A
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
Q
 
P
N
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
W
T
 
S
L
 
L

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 1:255/263 of query aligns to 1:245/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
M
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
S
A
 
A
R
 
L
T
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
A
L
 
T
D
 
D
I
 
I
S
 
N
P
 
E
E
 
A
I
 
K
E
 
L
K
 
Q
L
 
E
A
 
L
D
 
E
E
 
N
L
 
Y
C
 
P
G
 
G
R
 
I
G
 
Q
H
 
T
R
 
R
C
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
D
 
K
P
 
K
A
 
R
S
 
Q
V
 
I
A
 
D
A
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
Q
R
 
F
A
 
A
K
 
S
E
 
E
K
 
I
E
 
E
G
 
-
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
F
C
 
V
R
 
H
L
 
H
G
 
G
S
 
T
F
 
I
L
 
L
D
 
D
M
 
C
S
 
E
D
 
E
D
 
K
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
F
H
 
S
I
 
M
D
 
N
I
 
L
N
 
N
I
 
V
K
 
R
G
 
S
V
 
M
W
 
Y
N
 
L
V
 
M
T
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
K
M
 
M
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
T
 
A
G
 
S
D
 
S
M
 
I
V
 
K
A
 
G
D
 
V
P
 
E
G
 
N
E
 
R
T
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
L
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
A
E
 
D
Y
 
F
A
 
I
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
R
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
S
A
 
L
E
 
Q
S
 
E
I
 
-
A
 
-
R
 
R
Q
 
I
S
 
Q
N
 
A
P
 
R
E
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
K
S
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
K
E
 
A
M
 
F
A
 
L
K
 
N
A
 
R
I
 
Q
P
 
K
M
 
T
R
 
G
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
S
P
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
E
 
L
L
 
L
A
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Q
 
P
N
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
W
T
 
S
L
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 4:255/263 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
K
 
R
T
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
L
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
R
 
L
T
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
N
D
|
D
I
 
I
S
 
D
P
 
A
E
 
E
-
 
K
I
 
V
E
 
R
K
 
A
L
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
F
C
 
S
G
 
A
R
 
R
G
 
G
H
 
H
R
 
R
C
 
V
T
 
L
A
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
P
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
M
I
 
V
K
 
K
R
 
Q
A
 
T
K
 
I
E
 
D
K
 
A
E
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
M
C
 
E
R
 
R
L
 
A
G
 
G
S
 
A
F
 
L
L
 
R
D
 
K
M
 
L
S
 
S
D
 
E
D
 
A
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
V
H
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L
V
 
C
T
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
E
 
H
M
 
M
I
 
V
A
 
E
R
 
N
K
 
K
D
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
M
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
R
T
 
A
G
 
-
D
 
-
M
 
W
V
 
L
A
 
G
D
 
G
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
L
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
Q
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
V
 
I
R
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
A
 
W
E
 
D
S
 
E
I
 
L
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
D
 
K
P
 
D
E
 
Q
S
 
Q
V
 
F
L
 
L
T
 
L
E
 
S
M
 
R
A
 
Q
K
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
P
M
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
D
E
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
T
A
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
S
 
S
S
 
G
Y
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
V
N
 
L
V
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
S
 
R
T
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 96% coverage: 4:255/263 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
K
 
R
T
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
L
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
R
 
L
T
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
N
D
|
D
I
|
I
S
 
D
P
 
A
E
 
E
-
 
K
I
 
V
E
 
R
K
 
A
L
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
F
C
 
S
G
 
A
R
 
R
G
 
G
H
 
H
R
 
R
C
 
V
T
 
L
A
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
P
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
M
I
 
V
K
 
K
R
 
Q
A
 
T
K
 
I
E
 
D
K
 
A
E
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
M
C
 
E
R
 
R
L
 
A
G
 
G
S
 
A
F
 
L
L
 
R
D
 
K
M
 
L
S
 
S
D
 
E
D
 
A
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
V
H
 
T
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L
V
 
C
T
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
E
 
H
M
 
M
I
 
V
A
 
E
R
 
N
K
 
K
D
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
M
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
R
T
 
A
G
 
-
D
 
-
M
 
W
V
 
L
A
 
G
D
 
G
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
L
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
Q
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
V
x
I
R
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
A
 
W
E
 
D
S
 
E
I
 
L
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
P
E
 
E
D
 
K
P
 
D
E
 
Q
S
 
Q
V
 
F
L
 
L
T
 
L
E
 
S
M
 
R
A
 
Q
K
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
P
M
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
L
 
D
E
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
T
A
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
E
 
D
S
 
S
S
 
G
Y
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
V
N
 
L
V
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
S
 
R
T
 
S
L
 
L

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 96% coverage: 1:252/263 of query aligns to 2:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
G
 
S
K
 
R
L
 
L
T
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
L
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
G
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
V
F
 
F
A
 
M
R
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
A
D
|
D
I
x
F
S
 
N
P
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
K
 
A
L
 
A
A
 
G
D
 
K
E
 
E
L
 
A
C
 
V
G
 
E
R
 
A
G
 
N
H
 
P
R
 
G
C
 
V
T
 
V
A
 
F
V
 
I
V
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
P
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
H
A
 
R
A
 
L
I
 
V
K
 
E
R
 
N
A
 
V
K
 
A
E
 
E
K
 
R
E
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
 
T
R
 
R
L
x
D
G
 
S
S
 
M
F
 
L
L
 
S
D
x
K
M
 
M
S
 
T
D
 
V
D
 
D
D
 
Q
R
 
F
D
 
Q
F
 
Q
H
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
I
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
H
V
 
C
T
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
Y
M
 
M
I
 
A
A
 
E
R
 
Q
K
 
G
D
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
T
M
 
Y
V
 
-
A
 
G
D
x
N
P
x
V
G
 
G
E
x
Q
T
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
L
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
V
x
T
R
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
A
 
V
E
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
A
E
 
E
D
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
K
V
 
V
L
 
I
T
 
E
E
x
K
M
 
M
A
 
K
K
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
K
P
 
P
L
 
E
E
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
A
A
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
L
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
Q
 
V
N
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 95% coverage: 3:252/263 of query aligns to 2:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
-
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
S
Q
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
Q
F
 
L
A
 
A
R
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
L
 
V
I
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
Y
L
 
A
D
 
G
I
 
S
S
 
K
P
 
E
E
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
I
C
 
K
G
 
A
R
 
K
G
 
G
H
 
V
R
 
D
C
 
S
T
 
F
A
 
A
V
 
I
V
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
R
 
E
A
 
V
K
 
V
E
 
S
K
 
Q
E
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
C
 
T
R
 
R
L
 
D
G
 
N
S
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
E
D
 
Q
D
 
E
R
 
W
D
 
D
F
 
D
H
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
N
V
 
C
T
 
I
K
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
R
 
Q
K
 
R
D
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
T
 
V
G
 
G
D
 
-
M
 
A
V
 
V
A
 
G
D
 
N
P
 
P
G
 
G
E
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
L
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
Q
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
R
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
A
 
T
E
 
D
S
 
A
I
 
L
A
 
S
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
D
E
 
E
D
 
L
P
 
K
E
 
E
S
 
Q
V
 
M
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
M
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
D
 
Q
P
 
D
L
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
T
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
S
 
A
S
 
K
Y
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
T
N
 
I
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
39% identity, 96% coverage: 2:254/263 of query aligns to 1:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
G
 
G
K
 
I
L
 
L
T
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
L
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
H
T
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
V
L
 
S
D
|
D
I
|
I
S
 
N
P
 
E
E
 
D
I
 
H
-
 
G
E
 
N
K
 
K
L
 
A
A
 
V
D
 
E
E
 
D
L
 
I
C
 
K
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
H
 
G
R
 
E
C
 
A
T
 
S
A
 
F
V
 
V
V
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
R
 
S
D
 
N
P
 
P
A
 
E
S
 
E
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
L
I
 
V
K
 
K
R
 
R
A
 
T
K
 
V
E
 
E
K
 
I
E
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
C
 
G
R
 
G
L
 
E
G
 
Q
S
 
A
F
 
L
L
 
A
-
 
G
D
 
D
M
 
Y
S
 
G
D
 
L
D
 
D
D
 
S
R
 
W
D
 
R
F
 
K
H
 
V
I
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
N
I
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
Y
V
 
G
T
 
C
K
 
K
A
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
E
 
Q
M
 
M
I
 
E
A
 
K
R
 
N
K
 
G
D
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
M
 
N
M
|
M
S
 
A
S
|
S
V
 
I
T
 
H
G
 
G
D
 
-
M
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
A
P
 
P
G
 
L
E
 
S
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
L
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
L
 
I
A
 
G
V
 
A
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
S
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
Y
|
Y
V
x
I
R
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
A
 
L
E
 
E
S
 
S
I
 
L
A
 
T
R
 
K
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
E
D
 
M
P
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
L
L
 
I
T
 
S
E
 
K
M
 
H
A
 
-
K
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
K
P
 
P
L
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
S
 
S
S
 
S
Y
 
F
L
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
G
Q
 
Y
N
 
Y
V
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
T
 
T

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
38% identity, 95% coverage: 4:252/263 of query aligns to 3:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
T
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
L
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
F
 
L
A
 
V
R
 
A
H
 
R
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
G
L
 
T
D
 
A
I
x
T
S
 
S
P
 
E
E
 
S
-
 
G
I
 
A
E
 
Q
K
 
A
L
 
I
A
 
S
D
 
D
E
 
Y
L
 
L
C
 
G
G
 
A
R
 
N
G
 
G
H
 
K
R
 
-
C
 
-
T
 
-
A
 
G
V
 
L
V
 
M
A
x
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
V
I
 
L
K
 
E
R
 
N
A
 
V
K
 
R
E
 
A
K
 
E
E
 
F
G
 
G
R
 
E
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
 
T
R
 
R
L
 
D
G
 
N
S
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
R
 
W
D
 
N
F
 
D
H
 
I
I
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
I
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
W
 
F
N
 
R
V
 
L
T
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
P
 
R
E
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
D
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
M
 
T
M
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
V
G
 
G
D
 
T
M
 
M
V
 
-
A
 
G
D
 
N
P
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
L
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
Q
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
R
 
E
T
 
T
P
 
D
M
 
M
A
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
T
R
 
R
Q
 
A
S
 
L
N
 
T
P
 
D
E
 
E
D
 
Q
P
 
R
E
 
A
S
 
G
V
 
T
L
 
L
T
 
A
E
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
A
I
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
T
P
 
P
L
 
N
E
 
E
V
 
I
G
 
A
E
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
Q
 
T
N
 
L
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
37% identity, 94% coverage: 7:252/263 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
L
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
Q
F
 
L
A
 
A
R
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
Y
N
 
N
L
 
V
I
 
A
L
 
V
-
x
N
-
x
Y
L
x
A
D
x
G
I
x
S
S
 
K
P
 
E
E
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
I
C
 
K
G
 
A
R
 
K
G
 
G
H
 
V
R
 
D
C
 
S
T
 
F
A
 
A
V
 
I
V
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
M
I
 
I
K
 
K
R
 
E
A
 
V
K
 
V
E
 
S
K
 
Q
E
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
C
 
T
R
 
R
L
 
D
G
 
N
S
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
E
D
 
Q
D
 
E
R
 
W
D
 
D
F
 
D
H
 
V
I
 
I
D
 
D
I
x
T
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
N
V
 
C
T
 
I
K
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
I
 
L
A
 
R
R
 
Q
K
 
R
D
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
T
 
V
G
 
G
D
 
-
M
 
A
V
 
V
A
 
G
D
 
N
P
 
P
G
 
G
E
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
L
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
Q
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
V
 
I
R
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
A
 
T
E
 
D
S
 
E
I
 
L
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
K
E
 
E
S
 
Q
V
 
M
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
M
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
D
 
Q
P
 
D
L
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
T
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
S
 
A
S
 
K
Y
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
T
N
 
I
V
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
34% identity, 97% coverage: 3:258/263 of query aligns to 6:254/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
K
 
S
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
S
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
L
x
S
Q
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
E
T
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
H
 
A
G
 
G
A
 
V
N
 
D
L
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
T
D
x
G
I
x
R
S
x
N
P
 
Q
E
 
D
-
 
D
I
 
L
E
 
D
K
 
R
L
 
T
A
 
V
D
 
A
E
 
D
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
T
G
 
R
H
 
G
R
 
K
C
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
E
S
 
D
V
 
A
A
 
R
A
 
R
A
 
T
I
 
V
K
 
A
R
 
E
A
 
T
K
 
V
E
 
S
K
 
R
E
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
C
x
F
R
 
P
L
 
S
G
 
G
S
 
R
F
 
L
L
 
E
D
 
D
M
 
L
S
 
T
D
 
P
D
 
D
D
 
D
R
 
I
D
 
E
F
 
Q
H
 
V
I
 
L
D
 
G
I
 
V
N
 
N
I
 
F
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
V
N
 
Y
V
 
I
T
 
V
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
Q
E
 
A
M
 
L
I
 
T
A
 
A
R
 
S
K
 
G
D
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
M
 
V
M
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
I
T
|
T
G
 
G
D
 
P
M
 
I
V
 
T
A
 
G
D
 
Y
P
 
P
G
 
G
E
x
W
T
 
S
A
 
H
Y
|
Y
A
 
G
L
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
Q
V
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
L
K
 
R
S
 
T
L
 
A
A
 
A
V
 
M
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
Q
 
P
S
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
Y
x
N
V
x
I
R
 
M
T
|
T
P
 
E
M
x
G
A
x
L
E
 
D
S
 
E
I
 
M
A
 
G
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
Q
S
 
D
V
 
Y
L
 
L
T
 
D
E
 
Q
M
 
M
A
 
A
K
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
S
P
 
V
L
 
A
E
 
D
V
 
I
G
 
G
E
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
T
N
 
L
V
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
T
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
S

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
38% identity, 95% coverage: 3:252/263 of query aligns to 1:251/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
K
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
L
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
H
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
T
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
N
D
x
G
I
x
F
S
 
G
P
 
-
E
 
D
I
 
V
E
 
D
K
 
A
L
 
A
A
 
K
D
 
D
E
 
A
L
 
V
C
 
A
G
 
Q
R
 
Y
G
 
G
H
 
K
R
 
T
C
 
P
T
 
G
A
 
Y
V
 
H
V
 
G
A
 
A
D
 
D
V
x
L
R
 
S
D
 
D
P
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
M
I
 
M
K
 
R
R
 
Y
A
 
A
K
 
E
E
 
S
K
 
E
E
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
C
 
Q
R
 
H
L
 
V
G
 
S
S
 
P
F
 
I
L
 
E
D
 
T
M
 
F
S
 
P
D
 
V
D
 
D
D
 
K
R
 
W
D
 
N
F
 
A
H
 
I
I
 
I
D
 
A
I
 
I
N
 
N
I
 
L
K
 
S
G
 
S
V
 
V
W
 
F
N
 
H
V
 
T
T
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
G
M
 
M
I
 
R
A
 
A
R
 
R
K
 
N
D
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
I
S
x
A
S
 
S
V
 
V
T
 
H
G
 
G
D
 
-
M
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
S
P
 
K
G
 
E
E
 
K
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
L
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
L
E
 
E
Y
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
T
G
 
E
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
W
V
|
V
R
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
L
A
 
V
E
 
Q
S
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
E
Q
 
G
S
 
A
N
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
A
P
 
A
E
 
R
S
 
D
V
 
A
L
 
L
T
 
-
E
 
-
M
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
K
I
 
Q
P
 
P
M
 
S
R
 
R
R
 
E
L
 
F
A
 
V
D
 
T
P
 
P
L
 
E
E
 
Q
V
 
L
G
 
G
E
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
D
E
 
G
S
 
A
S
 
A
Y
 
Q
L
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
V
Q
 
A
N
 
W
V
 
N
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 96% coverage: 4:255/263 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
L
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
I
T
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
I
I
 
F
L
 
F
-
x
N
L
x
Y
D
x
N
I
x
G
S
|
S
P
 
P
E
 
E
I
 
A
-
 
A
E
 
E
K
 
E
L
 
T
A
 
A
D
 
K
E
 
L
L
 
V
C
 
A
G
 
E
R
 
H
G
 
G
H
 
V
R
 
E
C
 
V
T
 
E
A
 
A
V
 
M
V
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
I
P
 
A
A
 
E
S
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
F
I
 
F
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
K
 
I
E
 
E
K
 
R
E
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
C
 
T
R
 
R
L
 
D
G
 
N
S
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
D
 
E
D
 
D
D
 
E
R
 
W
D
 
D
F
 
D
H
 
V
I
 
I
D
 
N
I
|
I
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L
V
 
C
T
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
E
 
T
M
 
M
I
 
M
A
 
K
R
 
Q
K
 
R
D
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
T
 
V
G
 
G
D
 
-
M
 
L
V
 
I
A
 
G
D
 
N
P
 
A
G
 
G
E
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
V
L
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
Q
 
P
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
F
V
x
I
R
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
A
 
T
E
 
D
S
 
K
I
 
L
A
 
D
R
 
E
Q
 
K
S
 
T
N
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
K
E
 
E
S
 
A
V
 
M
L
 
L
T
 
A
E
 
Q
M
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
I
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
A
L
 
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
L
 
E
E
 
D
V
 
I
G
 
A
E
 
N
L
 
A
A
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
T
N
 
L
V
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
M
T
 
V
L
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
36% identity, 96% coverage: 3:255/263 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
K
 
K
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
L
 
A
Q
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
A
L
 
G
D
|
D
I
x
L
S
 
G
P
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
D
L
 
L
C
 
T
G
 
Y
R
 
S
G
 
H
H
 
P
R
 
N
C
 
V
T
 
E
A
 
G
V
 
M
V
 
Y
A
x
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
D
P
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
V
A
 
E
A
 
K
A
 
F
I
 
Y
K
 
Q
R
 
S
A
 
V
K
 
I
E
 
D
K
 
K
E
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
C
 
T
R
 
K
L
 
D
G
 
A
S
 
M
F
 
T
L
 
R
D
 
K
M
 
M
S
 
T
D
 
E
D
 
A
D
 
Q
R
 
W
D
 
D
F
 
A
H
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
W
 
F
N
 
N
V
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
L
V
 
V
L
 
G
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
I
 
Q
A
 
T
R
 
N
K
 
G
D
 
Y
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
T
 
V
G
 
G
D
 
-
M
 
V
V
 
F
A
 
G
D
 
N
P
 
I
G
 
G
E
 
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
A
 
A
L
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
M
S
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
Y
 
F
A
 
A
Q
 
L
S
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
V
x
I
R
 
M
T
|
T
P
 
D
M
 
I
A
 
L
E
 
K
S
 
T
I
 
V
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
Q
S
 
D
V
 
L
L
 
L
T
 
D
E
 
K
M
 
F
A
 
A
K
 
A
A
 
L
I
 
T
P
 
M
M
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
P
 
P
L
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
E
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
T
N
 
I
V
 
N
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
S
 
M
T
 
R
L
 
L

2ag5A Crystal structure of human dhrs6 (see paper)
39% identity, 97% coverage: 1:255/263 of query aligns to 1:245/246 of 2ag5A

query
sites
2ag5A
M
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
I
L
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
G
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
A
L
 
T
D
|
D
I
|
I
S
 
N
P
 
E
E
 
S
I
 
K
E
 
L
K
 
Q
L
 
E
A
 
L
D
 
E
E
 
K
L
 
Y
C
 
P
G
 
G
R
 
I
G
 
Q
H
 
T
R
 
R
C
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
A
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
K
P
 
K
A
 
K
S
 
Q
V
 
I
A
 
D
A
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
Q
R
 
F
A
 
A
K
 
N
E
 
E
K
 
V
E
 
E
G
 
-
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
x
V
A
 
A
G
|
G
V
 
F
C
 
V
R
 
H
L
 
H
G
 
G
S
 
T
F
 
V
L
 
L
D
 
D
M
 
C
S
 
E
D
 
E
D
 
K
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
F
H
 
S
I
 
M
D
 
N
I
x
L
N
 
N
I
 
V
K
 
R
G
 
S
V
 
M
W
 
Y
N
 
L
V
 
M
T
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
K
M
 
M
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
T
 
A
G
 
S
D
 
S
M
 
V
V
 
K
A
 
G
D
 
V
P
 
V
G
 
N
E
x
R
T
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
L
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
A
E
 
D
Y
 
F
A
 
I
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
Y
 
T
V
|
V
R
 
D
T
|
T
P
 
P
-
x
S
M
 
L
A
 
Q
E
 
E
S
x
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
A
Q
x
R
S
 
G
N
 
N
P
 
P
E
 
E
D
 
E
P
 
A
E
 
R
S
 
N
V
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
D
M
x
F
A
 
L
K
 
K
A
x
R
I
 
Q
P
 
K
M
 
T
R
 
G
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
T
P
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
Q
 
P
N
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
W
T
 
S
L
 
L

Q9BUT1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
39% identity, 97% coverage: 1:255/263 of query aligns to 1:245/245 of Q9BUT1

query
sites
Q9BUT1
M
 
M
G
 
G
K
 
R
L
 
L
T
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
I
L
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
G
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
A
L
 
T
D
|
D
I
 
I
S
 
N
P
 
E
E
 
S
I
 
K
E
 
L
K
 
Q
L
 
E
A
 
L
D
 
E
E
 
K
L
 
Y
C
 
P
G
 
G
R
 
I
G
 
Q
H
 
T
R
 
R
C
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
A
 
L
D
|
D
V
 
V
R
 
T
D
 
K
P
 
K
A
 
K
S
 
Q
V
 
I
A
 
D
A
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
Q
R
 
F
A
 
A
K
x
N
E
 
E
K
 
V
E
 
E
G
 
-
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
F
C
 
V
R
 
H
L
 
H
G
 
G
S
 
T
F
 
V
L
 
L
D
 
D
M
 
C
S
 
E
D
 
E
D
 
K
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
F
H
 
S
I
 
M
D
 
N
I
 
L
N
 
N
I
 
V
K
 
R
G
 
S
V
 
M
W
 
Y
N
 
L
V
 
M
T
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
K
M
 
M
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
K
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
M
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
T
 
A
G
 
S
D
 
S
M
 
V
V
 
K
A
 
G
D
 
V
P
 
V
G
 
N
E
 
R
T
 
C
A
 
V
Y
 
Y
A
 
S
L
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
A
E
 
D
Y
 
F
A
 
I
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
T
V
|
V
R
x
D
T
|
T
P
|
P
-
x
S
M
 
L
A
 
Q
E
 
E
S
 
R
I
 
I
A
 
Q
R
 
A
Q
 
R
S
 
G
N
 
N
P
 
P
E
 
E
D
 
E
P
 
A
E
 
R
S
 
N
V
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
D
M
 
F
A
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
Q
P
 
K
M
 
T
R
 
G
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
T
P
 
A
L
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
E
 
M
L
 
L
A
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
Q
 
P
N
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
W
T
 
S
L
 
L

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 96% coverage: 3:255/263 of query aligns to 5:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
K
 
K
L
 
L
T
 
A
G
 
S
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
L
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
R
L
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
A
D
|
D
I
x
R
S
 
D
P
 
A
E
 
H
I
 
G
E
 
E
K
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
A
E
 
S
L
 
L
C
 
R
G
 
E
R
 
S
G
 
G
H
 
A
R
 
Q
C
 
A
T
 
L
A
 
F
V
 
I
V
 
S
A
x
C
D
 
N
V
x
I
R
 
A
D
 
E
P
 
K
A
 
T
S
 
Q
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
L
I
 
F
K
 
S
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
E
K
 
A
E
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
C
 
N
R
 
R
L
 
D
G
 
A
S
 
M
F
 
L
L
 
H
D
 
K
M
 
L
S
 
T
D
 
E
D
 
A
D
 
D
R
 
W
D
 
D
F
 
T
H
 
V
I
 
I
D
 
D
I
x
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
W
 
F
N
 
L</