SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 17155 FitnessBrowser__Keio:17155 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

3w7uA Escherichia coli k12 ygjk complexed with galactose (see paper)
100% identity, 97% coverage: 24:783/783 of query aligns to 1:760/760 of 3w7uA

query
sites
3w7uA
N
 
N
A
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
M
 
M
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
F
 
F
M
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
T
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
W
 
W
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
H
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
I
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
H
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
W
 
W
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
N
 
N
W
 
W
R
 
R
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
F
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
W
|
W
P
 
P
W
 
W
D
 
D
T
 
T
W
 
W
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
|
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
N
 
N
E
 
E
R
 
R
N
 
N
T
 
T
K
|
K
P
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
T
 
T
W
 
W
V
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
W
 
W
W
 
W
L
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
D
|
D
H
 
H
N
|
N
G
 
G
N
|
N
G
 
G
V
|
V
P
 
P
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
 
F
T
 
T
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
K
 
K
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
W
|
W
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
S
 
S
D
 
D
W
 
W
T
 
T
V
 
V
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
E
|
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
N
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
T
 
T
C
 
C
M
 
M
F
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
E
 
E
F
 
F
N
 
N
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
R
V
 
V
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
F
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
M
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
F
 
F
F
 
F
R
 
R
H
 
H
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
S
 
S
W
 
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
F
 
F
F
 
F
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q

3w7tA Escherichia coli k12 ygjk complexed with mannose (see paper)
100% identity, 97% coverage: 24:783/783 of query aligns to 1:760/760 of 3w7tA

query
sites
3w7tA
N
 
N
A
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
M
 
M
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
F
 
F
M
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
V
W
|
W
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
T
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
|
V
W
 
W
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
H
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
I
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
A
H
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
W
 
W
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
N
 
N
W
 
W
R
 
R
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
F
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
T
 
T
P
|
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
W
 
W
F
|
F
S
 
S
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
W
|
W
P
 
P
W
|
W
D
|
D
T
 
T
W
 
W
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
|
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
N
 
N
E
 
E
R
 
R
N
 
N
T
 
T
K
|
K
P
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
T
 
T
W
 
W
V
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
W
 
W
W
 
W
L
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
D
|
D
H
 
H
N
|
N
G
 
G
N
|
N
G
 
G
V
|
V
P
 
P
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
 
F
T
 
T
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
K
 
K
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
W
|
W
E
 
E
S
 
S
G
|
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
S
 
S
D
 
D
W
 
W
T
 
T
V
 
V
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
E
|
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
N
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
T
 
T
C
 
C
M
 
M
F
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
E
 
E
F
 
F
N
 
N
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
R
V
 
V
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
F
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
M
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
F
 
F
F
 
F
R
 
R
H
 
H
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
S
 
S
W
|
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
F
 
F
F
 
F
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q

3w7sA Escherichia coli k12 ygjk complexed with glucose (see paper)
100% identity, 97% coverage: 24:783/783 of query aligns to 1:760/760 of 3w7sA

query
sites
3w7sA
N
 
N
A
 
A
D
|
D
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
M
 
M
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
F
 
F
M
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
|
V
Q
 
Q
K
|
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
T
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
W
 
W
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
H
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
I
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
H
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
W
 
W
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
N
 
N
W
 
W
R
 
R
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
F
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
W
|
W
P
 
P
W
 
W
D
 
D
T
 
T
W
 
W
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
D
|
D
I
 
I
A
 
A
K
|
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
S
|
S
W
|
W
Q
|
Q
I
|
I
Q
|
Q
P
 
P
G
 
G
D
|
D
S
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
|
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
R
|
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
N
|
N
E
 
E
R
 
R
N
 
N
T
 
T
K
|
K
P
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
T
 
T
W
 
W
V
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
W
 
W
W
 
W
L
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
D
|
D
H
 
H
N
|
N
G
 
G
N
|
N
G
 
G
V
|
V
P
 
P
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
 
F
T
 
T
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
K
 
K
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
W
|
W
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
D
|
D
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
S
 
S
D
 
D
W
 
W
T
 
T
V
 
V
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
E
|
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
N
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
T
 
T
C
 
C
M
 
M
F
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
E
 
E
F
 
F
N
 
N
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
R
V
 
V
W
 
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
F
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
M
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
F
 
F
F
 
F
R
 
R
H
 
H
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
S
 
S
W
 
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
F
 
F
F
 
F
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q

5gw7B Crystal structure of the glycosynthase mutant e727a of escherichia coli gh63 glycosidase in complex with glucose and lactose (see paper)
100% identity, 97% coverage: 24:783/783 of query aligns to 1:760/760 of 5gw7B

query
sites
5gw7B
N
 
N
A
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
M
 
M
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
F
 
F
M
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
T
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
W
 
W
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
H
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
I
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
H
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
W
 
W
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
N
 
N
W
 
W
R
 
R
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
F
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
T
 
T
P
|
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
W
 
W
F
|
F
S
 
S
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
W
|
W
P
 
P
W
|
W
D
|
D
T
 
T
W
 
W
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
|
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
N
|
N
E
 
E
R
 
R
N
 
N
T
 
T
K
|
K
P
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
T
 
T
W
 
W
V
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
W
 
W
W
 
W
L
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
D
|
D
H
 
H
N
|
N
G
 
G
N
|
N
G
 
G
V
|
V
P
 
P
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
 
F
T
 
T
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
K
 
K
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
W
|
W
E
 
E
S
 
S
G
|
G
R
 
R
D
|
D
D
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
S
 
S
D
 
D
W
 
W
T
 
T
V
 
V
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
R
 
R
S
 
S
Q
 
Q
D
|
D
G
 
G
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
E
|
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
N
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
E
M
 
M
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
T
 
T
C
 
C
M
 
M
F
 
F
D
 
D
P
 
P
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
D
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
K
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
E
 
E
F
 
F
N
 
N
T
 
T
F
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
Y
|
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
R
V
 
V
W
|
W
V
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
W
 
W
F
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
M
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
T
 
T
F
 
F
F
 
F
R
 
R
H
 
H
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
Q
 
Q
E
 
A
N
 
N
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
|
F
S
 
S
W
|
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
F
 
F
F
 
F
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q

6xuxA Crystal structure of megabody mb-nb207-cygjk_no (see paper)
100% identity, 59% coverage: 24:484/783 of query aligns to 309:769/879 of 6xuxA

query
sites
6xuxA
N
 
N
A
 
A
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
K
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
Y
 
Y
M
 
M
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
N
T
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
N
 
N
F
 
F
M
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
N
F
 
F
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
T
K
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
W
 
W
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
S
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
G
 
G
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
W
 
W
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
H
 
H
K
 
K
S
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
I
 
I
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
F
 
F
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
H
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
S
 
S
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
W
 
W
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
N
G
 
G
N
 
N
W
 
W
R
 
R
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
F
 
F
N
 
N
T
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
S
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
T
 
T
W
 
W
P
 
P
W
 
W
D
 
D
T
 
T
W
 
W
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
W
 
W
N
 
N
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
N
 
N
E
 
E
R
 
R
N
 
N
T
 
T
K
 
K
P
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
W
 
W
S
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
T
 
T
W
 
W
V
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
W
 
W
W
 
W
L
 
L
R
 
R
N
 
N
R
 
R
D
|
D
H
 
H
N
|
N
G
 
G
N
|
N
G
 
G
V
|
V
P
 
P
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
T
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
M
L
 
L
F
 
F
T
 
T
V
 
V
K
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4wvcA Crystal structure of gh63 mannosylglycerate hydrolase from thermus thermophilus hb8 in complex with tris and d-glycerate (see paper)
34% identity, 17% coverage: 640:770/783 of query aligns to 283:406/413 of 4wvcA

query
sites
4wvcA
C
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
I
V
 
A
E
 
V
R
 
K
G
 
T
K
 
S
G
 
A
P
 
-
E
 
-
G
 
G
W
 
F
S
 
L
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
P
T
 
H
Q
 
Q
A
 
G
N
 
R
A
 
A
D
 
S
A
 
L
V
 
L
V
 
A
K
 
Q
V
 
E
M
 
A
L
 
E
D
 
R
P
 
W
K
 
G
E
 
E
F
 
K
N
 
A
T
 
R
F
 
Y
V
 
L
P
 
-
L
 
L
G
 
P
T
 
S
A
 
V
A
 
D
L
 
P
T
 
T
N
 
S
P
 
P
A
 
F
F
 
F
G
 
E
A
 
P
D
 
G
I
 
R
Y
|
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
P
V
 
V
W
 
W
V
 
I
D
 
N
Q
 
V
F
 
N
W
 
W
F
 
M
G
 
V
L
 
A
K
 
E
G
 
G
M
 
F
E
 
R
R
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
F
R
 
A
D
 
A
D
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
R
L
 
L
-
 
K
A
 
A
D
 
D
T
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
A
K
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
M
A
 
E
D
 
R
G
 
E
P
 
G
I
 
F
Q
 
R
E
 
E
N
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
G
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
P
 
E
N
 
G
F
 
F
S
 
S
W
 
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4wvbA Crystal structure of gh63 mannosylglycerate hydrolase from thermus thermophilus hb8 in complex with glucose (see paper)
35% identity, 17% coverage: 640:770/783 of query aligns to 264:387/394 of 4wvbA

query
sites
4wvbA
C
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
P
I
 
I
V
 
A
E
 
V
R
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
T
P
 
S
E
 
A
G
 
G
W
 
F
S
 
L
P
 
P
L
 
L
F
 
F
N
 
A
G
 
G
A
 
T
A
 
P
T
 
H
Q
 
Q
A
 
G
N
 
R
A
 
A
D
 
S
A
 
L
V
 
L
V
 
A
K
 
Q
V
 
E
M
 
A
L
 
E
D
 
R
P
 
W
K
 
G
E
 
E
F
 
K
N
 
A
T
 
R
F
 
Y
V
 
L
P
 
-
L
 
L
G
 
P
T
 
S
A
 
V
A
 
D
L
 
P
T
 
T
N
 
S
P
 
P
A
 
F
F
 
F
G
 
E
A
 
P
D
 
G
I
 
R
Y
|
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
P
V
 
V
W
 
W
V
 
I
D
 
N
Q
 
V
F
 
N
W
 
W
F
 
M
G
 
V
L
 
A
K
 
E
G
 
G
M
 
F
E
 
R
R
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
F
R
 
A
D
 
A
D
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
R
L
 
L
-
 
K
A
 
A
D
 
D
T
 
-
F
 
-
F
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
A
K
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
M
A
 
E
D
 
R
G
 
E
P
 
G
I
 
F
Q
 
R
E
 
E
N
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
P
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
Q
 
G
Q
 
R
G
 
G
A
 
G
P
 
E
N
 
G
F
 
F
S
 
S
W
 
W
S
 
S
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6g3nA Mycobacterial hydrolase complex 14.
30% identity, 15% coverage: 656:770/783 of query aligns to 324:438/445 of 6g3nA

query
sites
6g3nA
S
 
A
P
 
P
L
 
L
F
 
L
N
 
C
G
 
G
A
 
G
A
 
L
T
 
P
Q
 
H
A
 
D
N
 
R
A
 
E
D
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
L
K
 
K
V
 
L
M
 
L
L
 
E
D
 
G
P
 
P
K
 
R
E
 
F
F
 
C
-
 
G
N
 
H
T
 
P
F
 
D
V
 
L
P
 
K
L
 
Y
G
 
G
T
 
L
A
 
I
A
 
P
L
 
S
T
 
T
N
 
S
P
 
P
A
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
D
F
 
F
G
 
R
A
 
P
D
 
R
I
 
E
Y
|
Y
W
 
W
R
 
R
G
 
G
R
 
P
V
 
V
W
 
W
V
 
P
D
 
V
Q
 
L
F
 
T
W
 
W
F
 
L
G
 
F
L
 
S
K
 
W
G
 
C
M
 
F
E
 
A
R
 
R
Y
 
R
G
 
G
Y
 
W
R
 
A
D
 
E
D
 
R
A
 
A
L
 
R
K
 
L
L
 
L
A
 
R
D
 
Q
T
 
E
F
 
G
F
 
L
R
 
R
H
 
Q
A
 
A
K
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
S
I
 
F
Q
 
A
E
 
E
N
 
Y
Y
 
Y
N
 
E
P
 
P
L
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
E
Q
 
P
Q
 
L
G
 
G
A
 
S
P
 
M
N
 
Q
F
 
F
S
 
S
W
 
W
S
 
T
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>17155 FitnessBrowser__Keio:17155
MKIKTILTPVTCALLISFSAHAANADNYKNVINRTGAPQYMKDYDYDDHQRFNPFFDLGA
WHGHLLPDGPNTMGGFPGVALLTEEYINFMASNFDRLTVWQDGKKVDFTLEAYSIPGALV
QKLTAKDVQVEMTLRFATPRTSLLETKITSNKPLDLVWDGELLEKLEAKEGKPLSDKTIA
GEYPDYQRKISATRDGLKVTFGKVRATWDLLTSGESEYQVHKSLPVQTEINGNRFTSKAH
INGSTTLYTTYSHLLTAQEVSKEQMQIRDILARPAFYLTASQQRWEEYLKKGLTNPDATP
EQTRVAVKAIETLNGNWRSPGGAVKFNTVTPSVTGRWFSGNQTWPWDTWKQAFAMAHFNP
DIAKENIRAVFSWQIQPGDSVRPQDVGFVPDLIAWNLSPERGGDGGNWNERNTKPSLAAW
SVMEVYNVTQDKTWVAEMYPKLVAYHDWWLRNRDHNGNGVPEYGATRDKAHNTESGEMLF
TVKKGDKEETQSGLNNYARVVEKGQYDSLEIPAQVAASWESGRDDAAVFGFIDKEQLDKY
VANGGKRSDWTVKFAENRSQDGTLLGYSLLQESVDQASYMYSDNHYLAEMATILGKPEEA
KRYRQLAQQLADYINTCMFDPTTQFYYDVRIEDKPLANGCAGKPIVERGKGPEGWSPLFN
GAATQANADAVVKVMLDPKEFNTFVPLGTAALTNPAFGADIYWRGRVWVDQFWFGLKGME
RYGYRDDALKLADTFFRHAKGLTADGPIQENYNPLTGAQQGAPNFSWSAAHLYMLYNDFF
RKQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory