SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 17189 FitnessBrowser__Keio:17189 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

4fwsA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with ctp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwsA

query
sites
4fwsA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
x
V
S
 
A
D
 
T
C
|
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
|
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
|
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwrA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with cmp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwrA

query
sites
4fwrA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwqA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gtp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwqA

query
sites
4fwqA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
|
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwpA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gdp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwpA

query
sites
4fwpA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
|
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
|
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
|
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
|
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwoA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gmp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwoA

query
sites
4fwoA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
|
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
|
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
|
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwnA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with adenosine tetraphosphate (ap4) (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwnA

query
sites
4fwnA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
|
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwmA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with atp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwmA

query
sites
4fwmA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
|
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

4fwkA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with amp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 4fwkA

query
sites
4fwkA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
|
D
N
|
N
I
 
I
R
 
R
R
|
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

2e1zA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with diadenosine tetraphosphate (ap4a) obtained after co- crystallization with atp (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 2e1zA

query
sites
2e1zA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
|
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

1x3nA Crystal structure of amppnp bound propionate kinase (tdcd) from salmonella typhimurium (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 1x3nA

query
sites
1x3nA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

1x3mA Crystal structure of adp bound propionate kinase (tdcd) from salmonella typhimurium (see paper)
83% identity, 98% coverage: 4:397/402 of query aligns to 1:394/394 of 1x3mA

query
sites
1x3mA
F
 
F
P
 
P
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
A
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
M
S
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
M
N
 
N
S
 
T
E
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
D
E
 
K
P
 
P
A
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
S
S
 
N
Y
 
Y
E
 
E
G
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
N
 
D
L
 
L
N
 
T
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
E
I
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
Q
S
 
S
A
 
V
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
H
L
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
A
V
 
V
T
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
T
 
T
M
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
E
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
S
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
R
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
S
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
A
W
 
W
V
 
I
A
 
A
S
 
K
Q
 
E
T
 
T
N
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
D
|
D
L
|
L
R
|
R
V
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
W
 
W
H
 
H
E
 
E
G
 
G
H
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
K
 
K
T
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
I
A
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
I
 
I
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
S
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
V
M
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
V
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
K
R
 
Q
S
 
P
N
 
N
S
 
S
C
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
S
S
 
A
E
 
N
N
 
P
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
K
 
K
M
 
M
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
K
 
N
V
 
V
N
 
K
A
 
A

7fj9A Kpacka (pduw) with amppnp complex structure
45% identity, 96% coverage: 7:392/402 of query aligns to 4:391/395 of 7fj9A

query
sites
7fj9A
V
 
I
L
 
M
V
 
A
I
 
I
N
 
N
C
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
L
K
 
K
F
 
F
S
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
N
A
 
M
S
 
P
D
 
Q
C
 
G
E
 
A
V
 
L
L
 
L
M
 
C
S
 
Q
G
 
G
I
 
L
A
 
I
D
 
E
G
 
R
I
 
I
N
 
G
S
 
L
E
 
P
N
 
E
A
 
A
F
 
R
L
 
F
S
 
T
V
 
L
N
 
K
G
 
T
G
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
-
 
Q
E
 
E
P
 
T
A
 
L
P
 
P
L
 
I
A
 
A
H
 
D
H
 
H
S
 
-
Y
 
-
E
 
H
G
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
T
A
 
L
I
 
L
A
 
L
F
 
E
E
 
A
L
 
L
E
 
T
K
 
G
R
 
R
N
 
G
L
 
I
N
 
L
D
 
S
S
 
S
V
 
L
A
 
Q
L
 
E
I
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
V
A
 
A
H
 
H
G