SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 17516 b3455 leucine/isoleucine/valine transporter subunit (NCBI) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp- binding cassette of an abc transporter (see paper)
31% identity, 98% coverage: 5:254/255 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
N
 
E
G
 
N
L
 
I
M
 
V
M
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
L
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
N
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
E
 
S
L
 
V
Y
 
N
P
 
K
Q
 
G
E
 
D
I
 
V
V
 
T
S
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
C
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
T
 
D
G
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
V
L
 
Y
L
 
F
R
 
E
D
 
N
Q
 
K
H
 
D
L
 
I
E
 
T
G
 
N
L
 
K
P
 
E
G
 
P
Q
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
Y
R
 
H
M
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
P
R
 
Q
L
 
P
F
 
L
R
 
K
E
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
G
Q
 
E
H
 
I
Q
 
C
Q
 
P
L
 
G
K
 
E
T
 
S
G
 
P
L
 
L
F
 
N
S
 
S
G
 
L
L
 
F
L
 
Y
K
 
K
T
 
-
P
 
-
S
 
K
F
 
W
R
 
I
R
 
P
A
 
K
Q
 
E
S
 
E
E
 
E
A
 
M
L
 
V
D
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
F
T
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
F
I
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
S
E
 
H
H
 
L
A
 
Y
N
 
D
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
N
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
M
T
 
T
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
M
L
 
I
M
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
P
 
P
K
 
G
E
 
L
T
 
A
K
 
H
E
 
D
L
 
I
D
 
F
E
 
N
L
 
H
I
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
K
N
 
A
H
 
-
H
 
K
N
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
K
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
G
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
Y
 
Y
V
 
V
V
 
M
N
 
F
Q
 
N
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
I
A
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
R
-
 
G
P
 
E
E
 
E
Q
 
E
I
 
I
R
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 98% coverage: 5:253/255 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
N
 
E
G
 
N
L
 
I
M
 
V
M
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
L
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
N
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
E
 
S
L
 
V
Y
 
C
P
 
K
Q
 
G
E
 
D
I
 
V
V
 
T
S
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
C
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
T
 
D
G
 
E
G
 
G
T
 
R
I
 
V
L
 
Y
L
 
F
R
 
E
D
 
N
Q
 
K
H
 
D
L
 
I
E
 
T
G
 
N
L
 
K
P
 
E
G
 
P
Q
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
Y
R
 
H
M
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
V
 
P
R
 
Q
L
 
P
F
 
L
R
 
K
E
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
G
Q
 
E
H
 
I
Q
 
N
Q
 
P
L
 
G
K
 
E
T
 
S
G
 
P
L
 
L
F
 
N
S
 
S
G
 
L
L
 
F
L
 
Y
K
 
K
T
 
-
P
 
-
S
 
K
F
 
W
R
 
I
R
 
P
A
 
K
Q
 
E
S
 
E
E
 
E
A
 
M
L
 
V
D
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
F
T
 
K
W
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
F
I
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
S
E
 
H
H
 
L
A
 
Y
N
 
D
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
N
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
M
T
 
T
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
M
L
 
I
M
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
P
 
P
K
 
G
E
 
L
T
 
A
K
 
H
E
 
D
L
 
I
D
 
F
E
 
N
L
 
H
I
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
K
N
 
A
H
 
-
H
 
K
N
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
K
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
G
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
Y
 
Y
V
 
V
V
 
M
N
 
F
Q
 
N
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
I
A
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
R
-
 
G
P
 
E
E
 
E
Q
 
E
I
 
I
R
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
N
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
V
R
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpB Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 98% coverage: 5:254/255 of query aligns to 2:236/240 of 6mjpB

query
sites
6mjpB
L
 
I
L
 
L
S
 
K
V
 
A
N
 
Q
G
 
H
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
L
 
K
A
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
Q
L
 
V
Y
 
E
P
 
S
Q
 
G
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
S
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
L
Y
 
V
K
 
A
P
 
R
T
 
D
G
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
T
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
N
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
M
Q
 
H
Q
 
S
I
 
R
A
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
|
R
E
x
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
L
 
M
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
Q
T
 
T
P
 
R
S
 
E
F
 
-
R
 
E
R
 
L
A
 
T
Q
 
H
S
 
E
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
D
 
D
R
 
K
A
 
L
A
 
E
T
 
D
W
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
-
L
 
I
E
 
Q
H
 
H
A
 
I
N
 
R
R
 
K
Q
 
S
A
 
A
S
 
G
-
 
M
N
 
A
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
Q
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
R
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
D
I
 
V
R
 
L
N
 
N
N
 
N
P
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
K
R
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 98% coverage: 5:254/255 of query aligns to 2:236/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
I
L
 
L
S
 
K
V
 
A
N
 
Q
G
 
H
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
L
 
K
A
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
Q
L
 
V
Y
 
E
P
 
S
Q
 
G
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
S
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
I
T
 
V
G
 
G
F
 
L
Y
 
V
K
 
A
P
 
R
T
 
D
G
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
T
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
N
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
M
Q
 
H
Q
 
S
I
 
R
A
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
K
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
L
 
M
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
A
L
 
V
L
 
L
K
 
Q
T
 
T
P
 
R
S
 
E
F
 
-
R
 
E
R
 
L
A
 
T
Q
 
H
S
x
E
E
 
E
A
 
R
L
 
Q
D
|
D
R
 
K
A
 
L
A
 
E
T
 
D
W
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
-
L
 
I
E
 
Q
H
 
H
A
 
I
N
 
R
R
 
K
Q
 
S
A
 
A
S
 
G
-
 
M
N
 
A
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
Q
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
R
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
D
I
 
V
R
 
L
N
 
N
N
 
N
P
 
E
D
 
Q
V
 
V
I
 
K
R
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
30% identity, 100% coverage: 1:255/255 of query aligns to 2:240/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
M
 
V
S
 
S
Q
 
D
P
 
I
L
 
V
L
 
L
S
 
E
V
 
V
N
 
Q
G
 
S
L
 
L
M
 
H
M
 
V
R
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
x
I
L
 
H
A
|
A
V
 
I
N
 
K
N
 
G
V
 
I
N
 
D
L
 
L
E
 
K
L
 
V
Y
 
P
P
 
R
Q
 
G
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
S
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
S
C
 
A
L
 
I
T
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
V
K
 
R
P
 
A
T
 
Q
G
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
I
L
 
I
L
 
F
R
 
N
D
 
G
Q
 
Q
H
 
D
L
 
I
E
 
T
G
 
N
L
 
K
P
 
P
G
 
A
Q
 
H
Q
 
V
I
 
I
A
 
N
R
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
I
V
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
H
 
G
V
 
R
R
 
R
L
 
I
F
 
F
R
 
P
E
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
V
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
M
A
 
G
Q
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
A
F
 
Y
R
 
N
R
 
R
A
 
K
Q
 
D
S
 
K
E
 
E
A
 
G
L
 
I
D
 
K
R
 
R
A
 
D
A
 
L
T
 
E
W
 
W
L
 
I
E
 
F
R
 
S
I
 
L
-
 
F
-
 
P
G
 
R
L
 
L
L
 
K
E
 
E
H
 
R
A
 
L
N
 
K
R
 
Q
Q
 
L
A
 
G
S
 
G
N
 
T
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
M
T
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
K
I
 
L
L
 
L
M
 
M
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
P
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
A
P
 
P
K
 
I
E
 
L
T
 
V
K
 
S
E
 
E
L
 
V
D
 
F
E
 
E
L
 
V
I
 
I
A
 
Q
E
 
K
L
 
I
R
 
-
N
 
N
H
 
Q
H
 
E
N
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
K
 
L
L
 
G
V
 
A
M
 
L
G
 
K
I
 
V
S
 
A
D
 
H
R
 
Y
I
 
G
Y
 
Y
V
 
V
V
 
L
N
 
E
Q
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
V
A
 
L
N
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
S
Q
 
E
I
 
L
R
 
L
N
 
D
N
 
N
P
 
E
D
 
M
V
 
V
I
 
R
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
V
A
 
A

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
30% identity, 93% coverage: 5:241/255 of query aligns to 1:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
L
 
I
S
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
D
L
 
V
M
 
Y
M
 
K
R
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
|
L
L
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
N
 
G
V
 
V
N
 
T
L
 
L
E
 
K
L
 
V
Y
 
N
P
 
K
Q
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
S
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
C
L
 
I
T
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
x
E
K
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
K
G
 
G
T
 
E
I
 
V
L
 
F
L
 
I
R
 
D
D
 
G
Q
 
V
H
 
K
L
 
I
E
 
N
-
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
V
G
 
N
Q
 
I
Q
 
N
I
 
K
A
 
V
R
 
R
M
 
Q
G
 
K
V
 
V
V
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
P
E
 
H
M
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
L
 
T
V
 
L
A
 
A
Q
 
P
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
V
K
 
K
T
 
V
P
 
K
S
 
K
F
 
M
R
 
N
R
 
K
A
 
K
Q
 
E
S
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
L
D
 
-
R
 
-
A
 
A
A
 
V
T
 
D
W
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
D
H
 
K
A
 
K
N
 
D
R
 
Q
Q
 
Y
A
 
P
S
 
I
N
 
K
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
M
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
V
L
 
M
M
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
P
 
P
K
 
E
E
 
M
T
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
V
D
 
L
E
 
N
L
 
V
I
 
M
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
N
 
N
H
 
-
H
 
E
N
 
G
T
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
K
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
G
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
Y
 
I
V
 
F
V
 
M
N
 
D
Q
 
D
G
 
G
T
 
V
P
 
I
L
 
V
A
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
I

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:254/255 of query aligns to 3:236/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
L
 
R
A
 
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
L
Q
 
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
|
R
E
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
S
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
x
M
A
x
G
S
x
Q
N
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:254/255 of query aligns to 3:236/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
L
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
L
Q
 
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
S
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
 
M
A
 
G
S
 
Q
N
x
S
L
 
L
A
x
S
Y
 
G
G
 
G
D
x
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:254/255 of query aligns to 4:237/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
L
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
L
Q
 
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
S
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
 
M
A
 
G
S
 
Q
N
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
31% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
L
 
R
A
 
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
L
Q
 
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
S
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
 
M
A
 
G
S
 
Q
N
x
S
L
 
L
A
x
S
Y
x
G
G
|
G
D
x
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
|
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
32% identity, 94% coverage: 3:242/255 of query aligns to 2:224/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
Q
 
E
P
 
D
L
 
I
L
 
I
S
 
V
V
 
V
N
 
E
G
 
N
L
 
L
M
 
V
M
 
K
R
 
K
F
|
F
G
 
G
G
 
D
L
x
F
L
 
E
A
|
A
V
 
V
N
 
K
N
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
F
E
 
S
L
 
V
Y
 
K
P
 
K
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
F
S
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
P
|
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
I
N
 
H
C
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
T
F
 
L
Y
 
L
K
 
K
P
 
P
T
 
T
G
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
A
L
 
W
L
 
V
R
 
A
D
 
G
Q
 
H
H
 
D
L
 
V
E
 
L
G
 
K
L
 
E
P
 
P
G
 
R
Q
 
E
Q
 
V
I
 
R
A
 
R
R
 
K
M
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
V
R
 
-
T
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
V
 
Q
R
 
S
L
 
L
F
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
L
T
 
T
V
 
A
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
M
L
 
Y
V
 
I
A
 
-
Q
 
-
H
 
H
Q
 
G
Q
 
K
L
 
I
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
Y
R
 
G
R
 
Y
A
 
G
Q
 
G
S
 
E
E
 
K
A
 
L
L
 
K
D
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
L
T
 
E
W
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
F
I
 
V
G
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
H
 
F
A
 
K
N
 
D
R
 
K
Q
 
P
A
 
V
S
 
K
N
x
T
L
x
F
A
x
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
M
Q
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
S
M
 
L
V
 
I
T
 
H
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
V
L
 
L
M
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
D
P
 
P
K
 
H
E
 
T
T
 
R
K
 
A
E
 
H
L
 
M
D
 
W
E
 
E
L
 
Y
I
 
I
A
 
S
E
 
K
L
 
M
R
 
K
N
 
K
H
 
E
H
 
H
N
 
N
T
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
F
L
 
L
I
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
K
 
D
L
 
E
V
 
A
M
 
E
G
 
Q
I
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
Y
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
D
Q
 
H
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
I
A
 
A
N
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
L
R
 
K

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
32% identity, 97% coverage: 6:252/255 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
L
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
x
L
Q
x
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
x
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
H
x
E
V
x
A
R
x
S
L
 
I
F
|
F
R
|
R
E
x
R
M
x
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
x
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
S
S
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
E
Q
 
Q
S
 
R
E
 
E
A
 
-
L
 
-
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
 
M
A
 
G
S
x
Q
N
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
32% identity, 97% coverage: 6:252/255 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
L
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
L
Q
 
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
S
S
 
A
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
E
Q
 
Q
S
 
R
E
 
E
A
 
-
L
 
-
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
 
M
A
 
G
S
 
Q
N
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
L
 
R
A
x
V
V
 
V
N
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
Y
 
N
P
 
S
Q
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
T
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
K
 
P
P
 
R
T
 
D
G
 
A
G
 
G
T
 
N
I
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
D
D
 
D
Q
 
D
H
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
L
Q
 
H
Q
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
H
 
E
V
 
A
R
 
S
L
 
I
F
|
F
R
|
R
E
x
R
M
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
M
V
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
Q
 
L
Q
 
Q
L
 
I
K
 
R
T
 
D
G
 
D
L
 
L
F
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
S
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
E
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
N
T
 
E
W
 
L
L
 
M
E
 
E
R
 
E
I
 
F
G
 
H
L
 
I
L
 
E
E
 
H
H
 
L
A
 
R
N
 
D
R
 
S
Q
 
M
A
 
G
S
 
Q
N
 
S
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
L
V
 
A
T
 
A
Q
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
F
L
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
S
T
 
V
K
 
I
E
 
D
L
 
I
D
 
K
E
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
H
L
 
L
R
 
R
N
 
D
H
 
-
H
 
S
N
 
G
T
 
L
T
 
G
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
K
 
R
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
V
S
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
A
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
N
 
D
P
 
E
D
 
H
V
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 95% coverage: 2:242/255 of query aligns to 1:229/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
S
 
T
Q
 
Q
P
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
E
V
 
V
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
S
M
 
F
R
 
N
F
x
R
G
|
G
G
 
E
L
x
R
L
 
V
A
 
I
V
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
E
 
N
L
 
I
Y
 
R
P
 
R
Q
 
G
E
 
Q
I
 
I
V
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
T
 
G
G
 
G
F
 
Q
Y
x
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
G
 
Q
G
 
G
T
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
D
D
 
G
Q
 
K
H
 
D
L
 
I
E
 
A
G
 
Q
L
 
M
P
 
S
G
 
R
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
M
V
 
L
R
 
-
T
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
V
 
G
R
 
A
L
 
L
F
 
F
R
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
A
 
R
Q
 
A
H
 
H
Q
 
T
Q
 
K
L
 
L
K
 
S
T
 
E
G
 
N
L
 
L
F
 
I
S
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
V
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
L
W
 
K
L
 
L
E
 
E
R
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
E
 
G
H
 
T
A
 
E
N
 
Q
R
 
L
Q
 
M
A
 
P
S
 
T
N
x
E
L
 
L
A
x
S
Y
 
G
G
|
G
D
x
M
Q
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
I
V
 
A
T
 
L
Q
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
L
 
I
M
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
V
T
 
K
K
 
G
E
 
V
L
 
L
D
 
T
E
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
E
 
S
L
 
L
R
 
R
N
 
E
H
 
A
H
 
L
N
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
K
 
P
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
N
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
A
 
G
N
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 95% coverage: 2:242/255 of query aligns to 1:229/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
S
 
T
Q
 
Q
P
 
S
L
 
L
L
 
I
S
 
E
V
 
V
N
 
K
G
 
N
L
 
L
M
 
S
M
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
x
R
L
 
V
A
 
I
V
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
E
 
N
L
 
I
Y
 
R
P
 
R
Q
 
G
E
 
Q
I
 
I
V
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
T
 
G
G
 
G
F
 
Q
Y
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
G
 
Q
G
 
G
T
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
D
D
 
G
Q
 
K
H
 
D
L
 
I
E
 
A
G
 
Q
L
 
M
P
 
S
G
 
R
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
R
 
R
M
 
M
G
 
G
V
 
M
V
 
L
R
 
-
T
 
-
F
 
F
Q
|
Q
H
 
S
V
 
G
R
 
A
L
 
L
F
 
F
R
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
A
 
R
Q
 
A
H
 
H
Q
 
T
Q
 
K
L
 
L
K
 
S
T
 
E
G
 
N
L
 
L
F
 
I
S
 
A
G
 
E
L
 
L
L
 
V
K
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
L
W
 
K
L
 
L
E
 
E
R
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
R
E
 
G
H
 
T
A
 
E
N
 
Q
R
 
L
Q
 
M
A
 
P
S
 
T
N
 
E
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
M
Q
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
C
 
A
M
 
I
V
 
A
T
 
L
Q
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
L
 
I
M
 
M
L
 
Y
D
|
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
N
 
D
P
 
P
K
 
I
E
 
V
T
 
K
K
 
G
E
 
V
L
 
L
D
 
T
E
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
E
 
S
L
 
L
R
 
R
N
 
E
H
 
A
H
 
L
N
 
D
T
 
L
T
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
K
 
P
L
 
E
V
 
T
M
 
L
G
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
N
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
A
 
G
N
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
R
 
Q

E9Q876 Glucosylceramide transporter ABCA12; ATP-binding cassette sub-family A member 12; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
31% identity, 93% coverage: 6:242/255 of query aligns to 1346:1565/2595 of E9Q876

query
sites
E9Q876
L
 
V
S
 
A
V
 
L
N
 
H
G
 
G
L
 
V
M
 
T
M
 
K
R
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
K
L
 
T
A
 
A
V
 
V
N
 
E
N
 
N
V
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
N
L
 
F
Y
 
Y
P
 
E
Q
 
G
E
 
H
I
 
I
V
 
T
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
T
F
x
I
N
x
S
C
x
M
L
|
L
T
|
T
G
|
G
F
x
L
Y
x
F
K
x
G
P
x
A
T
|
T
G
x
A
G
|
G
T
|
T
I
|
I
L
x
F
L
x
V
R
x
Y
D
x
G
Q
x
K
H
x
D
L
x
I
E
x
K
G
x
T
L
x
D
P
x
L
G
x
N
Q
x
T
Q
x
V
I
x
R
A
x
K
R
x
N
M
|
M
G
|
G
V
|
V
V
x
C
R
 
-
T
 
-
F
x
M
Q
|
Q
H
|
H
V
x
D
R
x
V
L
|
L
F
|
F
R
x
S
E
x
Y
M
x
L
T
|
T
V
x
T
I
x
K
E
|
E
N
x
H
L
|
L
L
|
L
V
x
L
A
x
Y
Q
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
S
 
-
G
|
G
L
x
S
L
x
I
K
|
K
T
x
V
P
|
P
S
x
H
F
x
W
R
x
T
R
x
K
A
x
T
Q
|
Q
-
x
L
S
x
H
E
|
E
A
x
E
L
x
V
D
x
K
R
|
R
A
 
T
A
 
-
T
 
-
W
 
-
L
 
L
E
 
K
R
 
D
I
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
E
 
S
H
 
H
A
 
R
N
 
H
R
 
K
Q
 
R
A
 
V
S
 
G
N
 
T
L
 
L
A
 
S
Y
 
G
G
 
G
D
 
M
Q
 
K
R
 
R
R
 
K
L
 
L
E
 
S
I
 
I
A
 
S
R
 
I
C
 
A
M
 
L
V
 
I
T
 
G
Q
 
G
P
 
S
E
 
R
I
 
V
L
 
V
M
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
S
A
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
P
 
P
K
 
C
E
 
S
T
 
R
K
 
R
E
 
S
L
 
I
D
 
W
E
 
D
L
 
V
I
 
I
A
 
S
E
 
-
L
 
-
R
 
K
N
 
N
H
 
K
H
 
T
N
 
A
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
L
I
 
S
E
 
T
H
 
H
D
 
H
M
 
L
K
 
D
L
 
E
V
 
A
M
 
E
G
 
V
I
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
Y
 
A
V
 
F
V
 
L
N
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
G
P
 
L
L
 
R
A
 
C
N
 
C
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
F
Q
 
Y
I
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
27% identity, 95% coverage: 4:245/255 of query aligns to 1:227/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
L
 
I
L
 
I
S
 
R
V
 
I
N
 
R
G
 
N
L
 
L
M
 
H
M
 
K
R
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
L
|
L
L
 
H
A
x
V
V
 
L
N
 
K
N
 
G
V
 
I
N
 
H
L
 
L
E
 
E
L
 
V
Y
 
A
P
 
P
Q
 
G
E
 
E
I
 
K
V
 
L
S
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
T
L
 
I
T
 
N
G
 
R
F
 
L
Y
 
E
K
 
D
P
 
F
T
 
Q
G
 
E
G
 
G
T
 
E
I
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
D
D
 
G
Q
 
L
H
 
S
L
 
V
E
 
K
G
 
D
L
 
D
P
 
R
G
 
A
Q
 
L
Q
 
R
I
 
E
A
 
I
R
 
R
M
 
R
G
 
E
V
 
V
V
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
V
 
F
R
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
P
E
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
I
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
L
 
T
V
 
L
A
 
A
Q