SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 17768 FitnessBrowser__Keio:17768 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A853 Tryptophanase; L-tryptophan indole-lyase; TNase; EC 4.1.99.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
100% identity, 100% coverage: 1:471/471 of query aligns to 1:471/471 of P0A853

query
sites
P0A853
M
 
M
E
 
E
N
 
N
F
 
F
K
|
K
H
 
H
L
 
L
P
 
P
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
K
 
K
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
M
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
M
 
M
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
I
K
|
K
K
 
K
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
S
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
F
 
F
F
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
N
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
W
 
W
T
 
T
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
A
 
A
K
 
K
K
 
K
D
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
C
|
C
R
 
R
T
 
T
L
 
L
C
|
C
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
M
 
M
N
 
N
L
 
L
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
C
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
C
 
C
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
F
 
F
K
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
K
|
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
H
 
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V

2c44C Crystal structure of e. Coli tryptophanase (see paper)
100% identity, 99% coverage: 4:471/471 of query aligns to 1:468/468 of 2c44C

query
sites
2c44C
F
 
F
K
 
K
H
 
H
L
 
L
P
 
P
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
K
 
K
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
M
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
 
D
S
|
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
M
 
M
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
K
 
K
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
S
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
F
 
F
F
|
F
D
|
D
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
N
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
|
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
|
D
S
 
S
A
|
A
R
|
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
W
 
W
T
 
T
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
|
S
A
 
A
K
|
K
K
|
K
D
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
C
 
C
R
 
R
T
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
M
 
M
N
 
N
L
 
L
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
C
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
I
|
I
G
 
G
S
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
C
 
C
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
|
R
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
F
 
F
K
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
S
N
 
N
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
H
|
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V

5d8gA A structural view on the dissociation of e. Coli tryptophanase (see paper)
99% identity, 99% coverage: 5:471/471 of query aligns to 1:465/465 of 5d8gA

query
sites
5d8gA
K
 
K
H
 
H
L
 
L
P
 
P
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
K
 
K
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
M
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
|
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
M
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
M
 
M
R
|
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
 
-
G
 
-
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
K
 
K
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
S
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
F
 
F
F
|
F
D
|
D
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
N
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
|
D
S
 
S
A
|
A
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
W
 
W
T
 
T
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
A
 
A
K
 
K
K
|
K
D
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
C
 
C
R
 
R
T
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
E
|
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
M
 
M
N
 
N
L
 
L
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
C
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
I
|
I
G
 
G
S
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
C
 
C
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
T
|
T
I
|
I
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
F
 
F
K
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
H
|
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V

4w1yB Crystal structure of escherichia coli tryptophanase in 'semi-holo' form (see paper)
93% identity, 99% coverage: 5:471/471 of query aligns to 1:433/433 of 4w1yB

query
sites
4w1yB
K
 
K
H
 
H
L
 
L
P
 
P
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
K
 
K
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
I
K
 
K
S
 
S
G
 
G
M
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
S
E
 
E
D
 
D
V
 
V
F
 
F
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
|
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
M
 
M
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
K
 
K
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
S
K
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
A
F
 
F
S
 
S
N
 
N
Y
 
Y
F
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
G
 
-
C
 
-
T
 
T
V
 
V
R
 
R
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
F
 
F
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
N
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
S
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
|
D
S
 
S
A
|
A
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
W
 
W
T
 
T
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
M
 
M
S
|
S
A
 
A
K
|
K
K
|
K
D
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
C
 
C
R
 
R
T
 
T
L
 
L
C
 
C
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
M
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
M
 
M
N
 
N
L
 
L
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
C
 
C
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
I
P
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
I
|
I
G
 
G
S
 
S
F
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
C
P
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
F
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
F
 
F
K
 
K
H
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
I
 
I
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
H
|
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
K
E
 
E
V
 
V

5w19A Tryptophan indole-lyase complex with oxindolyl-l-alanine (see paper)
52% identity, 99% coverage: 5:471/471 of query aligns to 2:465/466 of 5w19A

query
sites
5w19A
K
 
K
H
 
R
L
 
I
P
 
V
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
K
V
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
K
V
 
I
K
 
R
R
 
V
T
 
P
T
 
S
R
 
R
A
 
E
Y
 
E
R
 
R
E
 
E
E
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
K
K
 
E
S
 
A
G
 
G
M
 
Y
N
 
N
P
 
P
F
|
F
L
 
L
L
 
L
D
 
P
S
 
S
E
 
S
D
 
A
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
|
D
S
|
S
G
 
G
T
 
T
G
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
S
Q
 
D
S
 
H
M
 
Q
Q
 
W
A
 
A
A
 
A
M
 
M
M
 
I
R
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
A
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
D
S
 
K
V
 
A
K
 
K
N
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
N
Y
 
Y
Q
 
D
Y
 
Y
T
 
I
I
 
I
P
 
P
T
 
A
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
G
A
 
A
E
|
E
Q
 
N
I
 
I
Y
 
L
I
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
L
K
 
K
K
 
Y
R
 
K
E
 
Q
Q
 
K
E
 
E
K
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
G
R
 
K
S
 
A
K
 
K
M
 
N
V
 
P
A
 
V
F
 
F
-
 
I
S
 
S
N
 
N
Y
 
F
F
 
H
F
|
F
D
|
D
T
|
T
T
|
T
Q
 
A
G
 
A
H
 
H
S
 
V
Q
 
E
I
 
L
N
 
N
G
 
G
C
 
C
T
 
K
V
 
A
R
 
I
N
 
N
V
 
I
Y
 
V
I
 
T
K
 
E
E
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
S
G
 
E
V
 
T
R
 
Y
Y
 
D
D
 
D
F
 
W
K
 
K
G
 
G
N
 
D
F
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
K
G
 
K
L
 
L
E
 
K
R
 
E
G
 
N
I
 
I
E
 
A
E
 
Q
V
 
H
G
 
G
P
 
A
N
 
D
N
 
N
V
 
I
P
 
V
Y
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
S
T
 
T
I
 
V
T
 
T
S
 
C
N
|
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
M
A
 
S
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
E
M
 
V
Y
 
Y
S
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
Q
Y
 
H
D
 
G
I
 
I
P
 
F
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
|
D
S
 
S
A
|
A
R
|
R
F
 
F
A
 
C
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
A
R
 
R
E
 
D
A
 
P
E
 
K
Y
 
Y
K
 
K
D
 
N
W
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
R
 
F
E
 
D
T
 
M
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
M
S
|
S
A
 
A
K
 
K
K
|
K
D
 
D
A
 
P
M
 
L
V
 
L
P
 
N
M
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
V
C
 
A
M
 
I
K
 
R
D
 
D
D
 
N
S
 
E
F
 
-
F
 
-
D
 
E
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
E
 
L
C
 
A
R
 
R
T
 
Q
L
 
R
C
 
C
V
 
V
V
 
P
Q
 
M
E
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
V
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
G
 
R
A
 
D
M
 
M
E
 
A
R
 
A
L
 
M
A
 
V
V
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
T
N
 
E
L
 
E
D
 
E
W
 
Y
L
 
L
A
 
H
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
G
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
V
 
G
D
 
D
G
 
R
L
 
L
E
 
R
E
 
E
I
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
P
C
 
I
Q
 
Q
-
 
Y
Q
 
P
A
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
V
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
C
G
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
V
P
 
P
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
G
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
I
C
 
N
E
 
A
L
 
L
Y
 
Y
K
 
L
V
 
E
A
 
S
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
|
V
E
 
E
I
|
I
G
 
G
S
 
S
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Q
 
Q
L
 
K
P
 
H
C
 
A
P
 
D
A
 
M
E
 
E
L
 
F
L
 
M
R
|
R
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
A
R
 
R
A
 
R
T
 
V
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
N
T
 
D
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
I
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
L
K
 
I
H
 
G
V
 
L
K
 
K
E
 
E
N
 
K
A
 
F
A
 
A
N
 
T
I
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
E
F
 
F
T
 
E
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
R
H
|
H
F
|
F
T
 
T
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
E
 
P
V
 
I

8sijA Tryptophanase 1
46% identity, 99% coverage: 5:471/471 of query aligns to 3:445/445 of 8sijA

query
sites
8sijA
K
 
K
H
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
K
V
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
I
K
 
K
R
 
M
T
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
E
Y
 
E
R
 
R
E
 
I
E
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
K
K
 
E
S
 
A
G
 
N
M
 
Y
N
 
N
P
 
L
F
 
F
L
 
N
L
 
L
D
 
K
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
|
S
G
 
G
T
 
T
G
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
S
Q
 
H
S
 
D
M
 
Q
Q
 
W
A
 
S
A
 
G
M
 
V
M
 
M
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
A
R
 
S
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
D
S
 
A
V
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
N
Y
 
Y
Q
 
G
Y
 
F
T
 
I
I
 
Q
P
 
P
T
 
V
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
Y
 
L
I
 
F
P
 
P
V
 
T
L
 
F
I
 
L
K
 
S
K
 
P
R
 
G
E
 
K
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
F
A
 
A
F
 
I
S
 
S
N
 
N
Y
 
M
F
 
F
F
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
Q
 
-
G
 
-
H
 
H
S
 
V
Q
 
I
I
 
L
N
 
A
G
 
G
C
 
A
T
 
-
V
 
-
R
 
R
N
 
P
V
 
I
Y
 
C
I
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
K
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
F
 
M
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
K
L
 
M
E
 
E
R
 
K
G
 
I
I
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
K
G
 
G
P
 
P
N
 
E
N
 
N
V
 
I
P
 
G
Y
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
M
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
N
N
 
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
I
K
 
R
A
 
E
M
 
T
Y
 
S
S
 
E
I
 
I
A
 
C
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
D
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
F
V
 
N
M
 
I
D
 
D
S
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
R
R
 
D
E
 
E
A
 
E
E
 
G
Y
 
Y
K
 
Q
D
 
N
W
 
K
T
 
S
I
 
I
E
 
K
Q
 
D
I
 
I
T
 
I
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
F
K
 
S
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
F
A
 
T
M
 
M
S
|
S
A
 
A
K
|
K
K
|
K
D
 
D
A
 
T
M
 
I
V
 
V
P
 
N
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
C
 
G
M
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
P
S
 
Q
F
 
-
F
 
S
D
 
P
V
 
L
Y
 
I
T
 
L
E
 
K
C
 
I
R
 
K
T
 
A
L
 
N
C
 
C
V
 
I
V
 
S
Q
 
Y
E
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
F
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
G
G
 
G
G
 
R
A
 
D
M
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
M
 
I
N
 
D
L
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
A
 
K
Y
 
Y
R
 
R
I
 
N
A
 
G
Q
 
Q
V
 
M
Q
 
E
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
D
 
S
G
 
R
L
 
L
E
 
D
E
 
D
I
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
A
C
 
Y
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
P
-
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
K
K
 
A
L
 
M
L
 
F
P
 
P
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
N
Q
 
E
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
I
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
I
V
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
T
V
 
C
E
 
D
I
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
Y
L
 
M
L
 
L
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
E
C
 
A
P
 
D
A
 
F
E
 
E
L
 
F
L
 
T
R
 
R
L
 
L
T
 
A
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
R
T
 
V
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
S
H
 
H
M
 
F
D
 
D
F
 
V
I
 
M
I
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
I
K
 
I
H
 
E
V
 
V
K
 
S
E
 
K
N
 
R
A
 
A
A
 
H
N
 
E
I
 
I
K
 
K
-
 
R
G
 
G
L
 
Y
T
 
K
F
 
I
T
 
I
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
I
L
 
L
R
 
R
H
 
H
F
 
F
T
 
Q
A
 
A
K
 
S
L
 
L
K
 
A
E
 
P
V
 
I

8sijB Tryptophanase 1
46% identity, 99% coverage: 5:471/471 of query aligns to 3:441/441 of 8sijB

query
sites
8sijB
K
 
K
H
 
Y
L
 
I
P
 
P
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
K
V
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
I
K
 
K
R
 
M
T
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
E
Y
 
E
R
 
R
E
 
I
E
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
K
K
 
E
S
 
A
G
 
N
M
 
Y
N
 
N
P
 
L
F
 
F
L
 
N
L
 
L
D
 
K
S
 
G
E
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
S
Q
 
H
S
 
D
M
 
Q
Q
 
W
A
 
S
A
 
G
M
 
V
M
 
M
R
 
R
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
A
R
 
S
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
D
S
 
A
V
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
I
F
 
F
G
 
N
Y
 
Y
Q
 
G
Y
 
F
T
 
I
I
 
Q
P
 
P
T
 
V
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
Y
 
L
I
 
F
P
 
P
V
 
T
L
 
F
I
 
L
K
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
K
 
P
M
 
K
V
 
F
A
 
A
F
 
I
S
 
S
N
 
N
Y
 
M
F
 
F
F
 
F
D
 
D
T
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
H
 
H
S
 
V
Q
 
I
I
 
L
N
 
A
G
 
G
C
 
A
T
 
R
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
Y
 
-
I
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
P
Y
 
C
D
 
K
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
N
F
 
M
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
K
L
 
M
E
 
E
R
 
K
G
 
I
I
 
I
E
 
L
E
 
E
V
 
K
G
 
G
P
 
P
N
 
E
N
 
N
V
 
I
P
 
G
Y
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
M
T
 
T
I
 
I
T
 
T
S
 
N
N
|
N
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
I
K
 
R
A
 
E
M
 
T
Y
 
S
S
 
E
I
 
I
A
 
C
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
D
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
F
V
 
N
M
 
I
D
|
D
S
 
A
A
|
A
R
|
R
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
R
R
 
D
E
 
E
A
 
E
E
 
G
Y
 
Y
K
 
Q
D
 
N
W
 
K
T
 
S
I
 
I
E
 
K
Q
 
D
I
 
I
T
 
I
R
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
F
K
 
S
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
M
L
 
F
A
 
T
M
 
M
S
|
S
A
 
A
K
|
K
K
|
K
D
 
D
A
 
T
M
 
I
V
 
V
P
 
N
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
C
 
G
M
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
P
S
 
Q
F
 
-
F
 
S
D
 
P
V
 
L
Y
 
I
T
 
L
E
 
K
C
 
I
R
 
K
T
 
A
L
 
N
C
 
C
V
 
I
V
 
S
Q
 
Y
E
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
F
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
G
G
 
G
G
 
R
A
 
D
M
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
M
 
I
N
 
D
L
 
E
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
A
 
K
Y
 
Y
R
 
R
I
 
N
A
 
G
Q
 
Q
V
 
M
Q
 
E
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
D
 
S
G
 
R
L
 
L
E
 
D
E
 
D
I
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
A
C
 
Y
Q
 
Q
Q
 
A
A
 
P
-
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
K
K
 
A
L
 
M
L
 
F
P
 
P
H
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
Y
D
 
N
Q
 
E
F
 
Y
P
 
P
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
I
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
I
V
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
T
V
 
C
E
 
D
I
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
Y
L
 
M
L
 
L
G
 
G
R
 
N
D
 
D
P
 
P
K
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
P
 
E
C
 
A
P
 
D
A
 
F
E
 
E
L
 
F
L
 
T
R
|
R
L
 
L
T
 
A
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
R
T
 
V
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
S
H
 
H
M
 
F
D
 
D
F
 
V
I
 
M
I
 
A
E
 
D
A
 
A
F
 
I
K
 
I
H
 
E
V
 
V
K
 
S
E
 
K
N
 
R
A
 
A
A
 
H
N
 
E
I
 
I
K
 
K
-
 
R
G
 
G
L
 
Y
T
 
K
F
 
I
T
 
I
Y
 
W
E
 
E
P
 
P
K
 
P
V
 
I
L
 
L
R
 
R
H
 
H
F
 
F
T
 
Q
A
 
A
K
 
S
L
 
L
K
 
A
E
 
P
V
 
I

1c7gA Tyrosine phenol-lyase from erwinia herbicola
44% identity, 98% coverage: 9:468/471 of query aligns to 6:453/456 of 1c7gA

query
sites
1c7gA
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
K
V
 
S
I
 
V
E
 
E
P
 
T
V
 
V
K
 
S
R
 
M
T
 
I
T
 
S
R
 
R
A
 
D
Y
 
E
R
 
R
E
 
V
E
 
K
A
 
K
I
 
M
I
 
Q
K
 
E
S
 
A
G
 
G
M
 
Y
N
 
N
P
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
N
S
 
S
E
 
K
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
S
Q
 
D
S
 
K
M
 
Q
Q
 
W
A
 
A
A
 
G
M
 
M
M
 
M
R
 
I
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
E
S
 
N
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
H
L
 
L
A
 
E
E
 
K
S
 
T
V
 
V
K
 
K
N
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
F
Q
 
K
Y
 
H
T
 
I
I
 
V
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
G
A
 
A
E
|
E
Q
 
N
I
 
L
Y
 
L
I
 
S
P
 
Q
V
 
L
L
 
A
I
 
I
K
 
K
K
 
P
R
 
G
E
 
Q
Q
 
Y
E
 
V
K
 
A
G
 
G
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
N
 
N
Y
 
M
F
 
Y
F
|
F
D
x
T
T
|
T
T
|
T
Q
 
R
G
 
F
H
 
H
S
 
Q
Q
 
E
I
 
K
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
T
V
 
F
R
 
V
N
 
D
V
 
I
Y
 
V
I
 
R
K
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
H
D
 
D
T
 
A
G
 
S
V
 
L
R
 
N
Y
 
L
D
 
P
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
D
F
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
N
G
 
K
L
 
L
E
 
A
R
 
T
G
 
L
I
 
I
E
 
K
E
 
E
V
 
K
G
 
G
P
 
A
N
 
E
N
 
N
V
 
I
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
V
 
C
A
 
L
T
 
A
I
 
V
T
 
T
S
 
V
N
 
N
S
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
V
Y
 
H
S
 
E
I
 
M
A
 
A
K
 
S
K
 
T
Y
 
Y
D
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
I
V
 
F
M
 
Y
D
|
D
S
 
A
A
x
T
R
|
R
F
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
G
Y
 
Y
K
 
E
D
 
N
W
 
V
T
 
S
I
 
I
E
 
K
Q
 
D
I
 
I
T
 
V
R
 
H
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
K
 
S
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
G
L
 
C
A
 
T
M
 
M
S
|
S
A
 
G
K
 
K
K
|
K
D
 
D
A
 
C
M
 
L
V
 
V
P
 
N
M
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
F
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
N
D
 
D
D
 
E
S
 
E
F
 
M
F
 
F
D
 
-
V
 
-
Y
 
-
T
 
S
E
 
A
C
 
A
R
 
K
T
 
E
L
 
L
C
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
Y
E
 
E
G
 
G
F
 
M
P
 
P
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
G
 
R
A
 
D
M
 
M
E
 
E
R
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
R
D
 
E
G
 
A
M
 
M
N
 
Q
L
 
Y
D
 
E
W
 
Y
L
 
I
A
 
E
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
L
V
 
G
D
 
D
G
 
K
L
 
L
E
 
R
E
 
E
I
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
P
V
 
I
C
 
V
Q
 
E
Q
 
P
A
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
V
F
 
F
V
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
R
K
 
R
L
 
F
L
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
P
 
T
A
 
Q
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
A
C
 
A
E
 
S
L
 
I
Y
 
Y
K
 
M
V
 
E
A
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
M
E
 
E
I
x
R
G
 
G
S
 
I
F
 
V
L
 
S
L
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
K
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Q
 
N
L
 
H
P
 
R
C
 
P
P
 
K
A
 
L
E
 
E
L
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
R
T
 
V
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Y
T
 
A
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
V
I
 
V
I
 
A
E
 
D
A
 
G
F
 
I
K
 
I
H
 
K
V
 
L
K
 
Y
E
 
Q
N
 
H
A
 
K
A
 
E
N
 
D
I
 
I
K
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
F
 
F
T
 
V
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
Q
L
 
L
R
 
R
H
x
F
F
 
F
T
 
T
A
 
A
K
 
R
L
 
F

6nv8B Perdeuterated tyrosine phenol-lyase from citrobacter freundii complexed with an aminoacrylate intermediate formed from s-ethyl-l- cysteine and 4-hydroxypyridine
42% identity, 98% coverage: 9:468/471 of query aligns to 5:452/455 of 6nv8B

query
sites
6nv8B
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
K
V
 
S
I
 
V
E
|
E
P
x
T
V
|
V
K
x
S
R
 
M
T
 
I
T
 
P
R
 
R
A
 
D
Y
 
E
R
 
R
E
 
L
E
 
K
A
 
K
I
 
M
I
 
Q
K
 
E
S
 
A
G
 
G
M
 
Y
N
 
N
P
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
N
S
|
S
E
x
K
D
 
D
V
x
I
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
 
D
S
|
S
G
 
G
T
 
T
G
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
S
Q
 
D
S
 
K
M
 
Q
Q
 
W
A
 
A
A
 
G
M
 
M
M
 
M
R
 
M
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
E
S
 
N
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
H
L
 
L
A
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
V
K
 
Q
N
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
F
Q
 
K
Y
 
H
T
 
I
I
 
V
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
N
I
 
L
Y
 
L
I
 
S
P
 
Q
V
 
L
L
 
A
I
 
I
K
 
K
K
 
P
R
 
G
E
 
Q
Q
 
Y
E
 
V
K
 
A
G
 
G
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
N
 
N
Y
 
M
F
 
Y
F
|
F
D
x
T
T
 
T
T
 
T
Q
 
R
G
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
E
I
 
K
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
V
V
 
F
R
 
V
N
 
D
V
 
I
Y
 
V
I
 
R
K
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
H
D
 
D
T
 
A
G
 
G
V
 
L
R
 
N
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
D
F
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
K
G
 
K
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
K
G
 
G
P
 
A
N
 
E
N
 
N
V
 
I
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
V
 
C
A
 
L
T
 
A
I
 
V
T
 
T
S
 
V
N
|
N
S
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
V
Y
 
R
S
 
E
I
 
L
A
 
T
K
 
E
K
 
A
Y
 
H
D
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
F
M
 
Y
D
|
D
S
 
A
A
x
T
R
|
R
F
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
R
 
Q
E
 
E
A
 
Q
E
 
G
Y
 
F
K
 
E
D
 
N
W
 
K
T
 
S
I
 
I
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
T
 
V
R
 
H
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
K
 
S
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
G
L
 
C
A
 
T
M
 
M
S
 
S
A
 
G
K
 
K
K
|
K
D
 
D
A
 
C
M
 
L
V
 
V
P
 
N
M
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
F
L
 
L
C
 
C
M
 
M
K
 
N
D
 
D
D
 
D
S
 
E
F
 
M
F
 
F
D
 
-
V
 
-
Y
 
-
T
 
S
E
 
S
C
 
A
R
 
K
T
 
E
L
 
L
C
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
Y
E
 
E
G
 
G
F
 
M
P
 
P
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
A
G
 
G
G
 
R
A
 
D
M
 
M
E
 
E
R
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
R
D
 
E
G
 
A
M
 
M
N
 
Q
L
 
Y
D
 
E
W
 
Y
L
 
I
A
 
E
Y
 
H
R
 
R
I
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
L
V
 
G
D
 
D
G
 
K
L
 
L
E
 
K
E
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
P
V
 
I
C
 
V
Q
 
E
Q
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
A
A
 
V
F
 
F
V
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
R
K
 
R
L
 
F
L
 
C
P
 
E
H
 
H
I
 
L
P
 
T
A
 
Q
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
A
C
 
A
E
 
S
L
 
I
Y
 
Y
K
 
V
V
 
E
A
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
S
V
 
M
E
 
E
I
x
R
G
 
G
S
 
I
F
 
I
L
 
S
L
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
N
P
 
N
K
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Q
 
H
L
 
H
P
 
R
C
 
P
P
 
K
A
 
L
E
 
E
L
 
T
L
 
V
R
|
R
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
R
T
 
V
Y
 
Y
T
 
T
Q
 
Y
T
 
A
H
 
H
M
 
M
D
 
D
F
 
V
I
 
V
I
 
A
E
 
D
A
 
G
F
 
I
K
 
I
H
 
K
V
 
L
K
 
Y
E
 
Q
N
 
H
A
 
K
A
 
E
N
 
D
I
 
I
K
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
K
F
 
F
T
 
I
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
Q
L
 
L
R
 
R
H
x
F
F
 
F
T
 
T
A
 
A
K
 
R
L
 
F

2yctA Tyrosine phenol-lyase from citrobacter freundii in complex with pyridine n-oxide and the quinonoid intermediate formed with l-alanine (see paper)
42% identity, 98% coverage: 9:468/471 of query aligns to 5:452/455 of 2yctA

query
sites
2yctA
E
 
E
P
 
P
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
K
V
x
S
I
 
V
E
 
E
P
 
T
V
 
V
K
 
S
R
 
M
T
 
I
T
 
P
R
 
R
A
 
D
Y
 
E
R
 
R
E
 
L
E
 
K
A
 
K
I
 
M
I
 
Q
K
 
E
S
 
A
G
 
G
M
 
Y
N
 
N
P
 
T
F
|
F
L
 
L
L
 
L
D
 
N
S
 
S
E
 
K
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
T
|
T
D
 
D
S
|
S
G
 
G
T
 
T
G
 
N
A
 
A
V
 
M
T
 
S
Q
 
D
S
 
K
M
 
Q
Q
x
W
A
 
A
A
 
G
M
 
M
M
 
M
R
 
M
G
 
G
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
E
S
 
N
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
H
L
 
L
A
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
V
K
 
Q
N
 
E
I
 
L
F
 
F
G
 
G
Y
 
F
Q
 
K
Y
 
H
T
 
I
I
 
V
P
 
P
T
 
T
H
 
H
Q
|
Q
G
|
G
R
|
R
G
 
G
A
 
A
E
|
E
Q
 
N
I
 
L
Y
 
L
I
 
S
P
 
Q
V
 
L
L
 
A
I
 
I
K
 
K
K
 
P
R
 
G
E
 
Q
Q
 
Y
E
 
V
K
 
A
G
 
G
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
F
 
-
S
 
-
N
 
N
Y
 
M
F
 
Y
F
|
F
D
x
T
T
|
T
T
|
T
Q
 
R
G
 
Y
H
 
H
S
 
Q
Q
 
E
I
 
K
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
V
V
 
F
R
 
V
N
 
D
V
 
I
Y
 
V
I
 
R
K
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
H
D
 
D
T
 
A
G
 
G
V
 
L
R
 
N
Y
 
I
D
 
A
F
 
F
K
 
K
G
 
G
N
 
D
F
 
I
D
 
D
L
 
L
E
 
K
G
 
K
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
K
G
 
G
P
 
A
N
 
E
N
 
N
V
 
I
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
V
 
C
A
 
L
T
 
A
I
 
V
T
 
T
S
 
V
N
|
N
S
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
V
Y
 
R
S
 
E
I
 
L
A
 
T
K
 
E
K
 
A
Y
 
H
D
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
F
M
 
Y
D
|
D
S
 
A
A
x
T
R
|
R
F
 
C
A
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
K
 
K
Q
 
E
R
 
Q
E
 
E
A
 
Q
E
 
G
Y
 
F
K
 
E
D
 
N
W
 
K
T
 
S
I
 
I
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
T
 
V
R
 
H
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
K
 
S
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
M
 
G
L
 
C
A
 
T
M
 
M
S
|
S
A
 
G
K
 
K
K
|
K
D
 
D
A
 
C
M
 
L
V
 
V
P
 
N
M
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
F
L