SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 17955 b3916 6-phosphofructokinase (NCBI) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1pfkA Crystal structure of the complex of phosphofructokinase from escherichia coli with its reaction products (see paper)
100% identity, 100% coverage: 1:320/320 of query aligns to 1:320/320 of 1pfkA

query
sites
1pfkA
M
 
M
I
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
|
G
D
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
|
R
G
 
G
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
R
 
R
M
 
M
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
 
R
Y
|
Y
S
 
S
V
 
V
S
|
S
D
|
D
M
 
M
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
|
F
P
 
P
E
 
E
F
|
F
R
|
R
D
 
D
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
Y
M
|
M
G
|
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
|
G
T
|
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
I
K
 
K
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
S
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
M
|
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
|
G
C
 
C
E
|
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
G
|
G
K
|
K
K
 
K
H
|
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
E
|
E
H
 
H
M
 
M
C
 
C
D
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
H
 
H
F
 
F
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
I
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
H
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
M
 
M
K
 
K
R
 
R
P
 
P
F
 
F
K
 
K
G
 
G
D
 
D
W
 
W
L
 
L
D
 
D
C
 
C
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y

P0A796 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 1; ATP-PFK 1; Phosphofructokinase 1; 6-phosphofructokinase isozyme I; Phosphohexokinase 1; Sedoheptulose-7-phosphate kinase; EC 2.7.1.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
100% identity, 100% coverage: 1:320/320 of query aligns to 1:320/320 of P0A796

query
sites
P0A796
M
 
M
I
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
|
R
G
|
G
V
|
V
V
|
V
R
|
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
R
 
R
M
 
M
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
R
|
R
Y
|
Y
S
|
S
V
|
V
S
|
S
D
|
D
M
 
M
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
|
F
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
Y
M
 
M
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
T
|
T
I
|
I
D
|
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
K
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
S
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
|
R
I
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
Y
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
|
G
C
|
C
E
|
E
F
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
F
 
F
S
 
S
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
N
E
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
K
G
 
G
K
|
K
K
|
K
H
|
H
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
E
|
E
H
 
H
M
 
M
C
 
C
D
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
H
 
H
F
 
F
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
T
 
T
R
|
R
A
 
A
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
|
I
Q
|
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
H
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
M
 
M
K
 
K
R
 
R
P
 
P
F
 
F
K
 
K
G
 
G
D
 
D
W
 
W
L
 
L
D
 
D
C
 
C
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y

6pfkA Phosphofructokinase, inhibited t-state (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:303/320 of query aligns to 1:302/319 of 6pfkA

query
sites
6pfkA
I
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
|
R
G
 
S
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
D
 
G
R
 
N
M
 
I
V
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
V
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
x
G
D
|
D
M
 
I
I
 
I
N
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
Y
S
 
T
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
T
E
 
E
N
 
E
I
 
G
R
 
Q
A
 
K
V
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
H
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
K
R
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
|
G
T
|
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
I
K
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
R
 
R
I
 
T
S
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
S
 
D
R
 
M
E
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
R
I
 
L
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
H
A
 
E
K
x
R
G
 
G
K
|
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
V
C
 
G
D
 
S
V
 
G
D
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
G
H
 
R
F
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
E
E
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
D
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
N
 
N

P00512 ATP-dependent 6-phosphofructokinase; ATP-PFK; Phosphofructokinase; Phosphohexokinase; EC 2.7.1.11 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
57% identity, 94% coverage: 2:303/320 of query aligns to 1:302/319 of P00512

query
sites
P00512
I
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
|
R
G
x
S
V
|
V
V
|
V
R
|
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
D
 
G
R
 
N
M
 
I
V
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
V
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
 
G
D
|
D
M
 
I
I
 
I
N
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
Y
S
 
T
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
T
E
 
E
N
 
E
I
 
G
R
 
Q
A
 
K
V
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
H
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
K
R
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
 
G
T
|
T
I
|
I
D
|
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
R
|
R
I
 
T
S
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
|
M
G
|
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
|
G
C
x
A
E
|
E
F
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
S
 
D
R
 
M
E
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
R
I
 
L
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
H
A
 
E
K
x
R
G
 
G
K
|
K
K
|
K
H
|
H
A
 
S
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
|
E
H
 
G
M
 
V
C
 
G
D
 
S
V
 
G
D
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
G
H
 
R
F
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
E
E
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
E
 
E
T
 
T
R
|
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
x
V
Q
|
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
D
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
N
 
N

1mtoA Crystal structure of a phosphofructokinase mutant from bacillus stearothermophilus bound with fructose-6-phosphate (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:303/320 of query aligns to 1:302/319 of 1mtoA

query
sites
1mtoA
I
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
G
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
D
 
G
R
 
N
M
 
I
V
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
V
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
I
I
 
I
N
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
Y
S
 
T
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
T
E
 
E
N
 
E
I
 
G
R
 
Q
A
 
K
V
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
H
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
K
R
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
|
G
T
|
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
I
K
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
R
|
R
I
 
T
S
 
W
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
|
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
Y
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
S
 
D
R
 
M
E
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
R
I
 
L
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
H
A
 
E
K
 
R
G
 
G
K
 
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
|
E
H
 
G
M
 
V
C
 
G
D
 
S
V
 
G
D
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
G
H
 
R
F
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
E
E
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
E
 
E
T
 
T
R
|
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
V
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
D
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
N
 
N

4pfkA Phosphofructokinase. Structure and control (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:303/320 of query aligns to 1:302/319 of 4pfkA

query
sites
4pfkA
I
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
|
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
G
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
|
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
D
 
G
R
 
N
M
 
I
V
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
V
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
I
I
 
I
N
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
Y
S
 
T
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
|
F
R
x
K
D
 
T
E
 
E
N
 
E
I
 
G
R
 
Q
A
 
K
V
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
H
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
G
|
G
A
 
A
M
 
K
R
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
|
G
T
|
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
I
K
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
R
 
R
I
 
T
S
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
|
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
|
G
C
 
A
E
|
E
F
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
S
 
D
R
 
M
E
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
R
I
 
L
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
H
A
 
E
K
x
R
G
|
G
K
|
K
K
 
K
H
|
H
A
 
S
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
|
E
H
 
G
M
 
V
C
 
G
D
 
S
V
 
G
D
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
G
H
 
R
F
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
E
E
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
V
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
D
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
N
 
N

3pfkA Phosphofructokinase. Structure and control (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:303/320 of query aligns to 1:302/319 of 3pfkA

query
sites
3pfkA
I
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
R
G
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
D
 
G
R
 
N
M
 
I
V
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
V
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
I
I
 
I
N
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
Y
S
 
T
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
T
E
 
E
N
 
E
I
 
G
R
 
Q
A
 
K
V
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
H
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
K
R
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
|
G
T
|
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
I
K
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
|
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
R
 
R
I
 
T
S
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
S
 
D
R
 
M
E
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
R
I
 
L
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
H
A
 
E
K
 
R
G
 
G
K
|
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
V
C
 
G
D
 
S
V
 
G
D
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
G
H
 
R
F
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
E
E
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
V
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
D
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
N
 
N

4i4iA Crystal structure of bacillus stearothermophilus phosphofructokinase mutant t156a bound to pep (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:303/320 of query aligns to 1:302/319 of 4i4iA

query
sites
4i4iA
I
 
M
K
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
|
R
G
 
S
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
H
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
E
 
A
D
 
G
R
 
N
M
 
I
V
 
K
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
V
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
x
G
D
 
D
M
 
I
I
 
I
N
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
Y
S
 
T
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
T
E
 
E
N
 
E
I
 
G
R
 
Q
A
 
K
V
 
K
A
 
G
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
R
 
H
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
M
 
K
R
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
M
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
C
I
 
V
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
|
G
T
|
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
I
K
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
|
R
D
 
D
T
 
A
S
 
A
S
 
T
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
R
 
R
I
 
T
S
 
Y
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
A
E
 
D
F
 
Y
S
 
D
R
 
M
E
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
I
N
 
A
E
 
R
I
 
L
K
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
H
A
 
E
K
x
R
G
 
G
K
|
K
K
 
K
H
|
H
A
 
S
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
V
C
 
G
D
 
S
V
 
G
D
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
G
H
 
R
F
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
E
E
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
Q
N
 
N
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
D
H
 
H
D
 
D
I
 
I
I
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
A
N
 
N

5xz9A Crystal structure of phosphofructokinase from staphylococcus aureus in complex with adenylylimidodiphosphate, the atp analogue (see paper)
50% identity, 99% coverage: 2:319/320 of query aligns to 1:320/321 of 5xz9A

query
sites
5xz9A
I
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
|
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
N
G
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
|
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
D
M
 
I
V
 
H
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
L
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
A
 
A
R
 
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
|
F
R
x
K
D
 
E
E
 
Q
N
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
Y
M
x
R
G
|
G
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
S
E
 
E
-
 
E
-
 
C
M
 
K
G
 
E
F
 
I
P
 
Q
C
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
N
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
A
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
A
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
A
M
 
M
G
 
G
R
 
R
Y
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
V
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
K
F
 
T
S
 
D
R
 
I
E
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
C
C
 
M
D
 
T
V
 
A
D
 
Q
E
 
D
L
 
C
A
 
Q
H
 
K
F
 
E
I
 
L
E
 
S
K
 
Q
E
 
Y
T
 
I
G
 
N
R
 
V
E
 
D
T
 
N
R
 
R
A
 
V
T
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
G
Y
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
G
 
G
Y
 
E
G
 
T
G
 
A
R
 
K
C
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
N
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
H
 
A
H
 
T
D
 
S
I
 
F
I
 
D
D
 
E
A
 
I
I
 
F
E
 
D
N
 
G
M
 
K
K
 
D
R
 
H
P
 
K
F
 
F
K
 
D
G
 
Y
D
 
S
W
 
L
L
 
Y
D
 
E
C
 
L
A
 
A
K
 
N
K
 
K
L
 
L

5xzaA Crystal structure of phosphofructokinase from staphylococcus aureus in complex with adp (see paper)
50% identity, 99% coverage: 2:319/320 of query aligns to 1:320/322 of 5xzaA

query
sites
5xzaA
I
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
|
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
N
G
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
|
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
D
M
 
I
V
 
H
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
L
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
|
F
R
 
K
D
 
E
E
 
Q
N
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
 
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
Y
M
x
R
G
|
G
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
S
E
 
E
-
 
E
-
 
C
M
 
K
G
 
E
F
 
I
P
 
Q
C
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
N
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
A
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
A
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
A
M
 
M
G
 
G
R
 
R
Y
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
V
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
K
F
 
T
S
 
D
R
 
I
E
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
C
C
 
M
D
 
T
V
 
A
D
 
Q
E
 
D
L
 
C
A
 
Q
H
 
K
F
 
E
I
 
L
E
 
S
K
 
Q
E
 
Y
T
 
I
G
 
N
R
 
V
E
 
D
T
 
N
R
 
R
A
 
V
T
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
G
Y
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
G
 
G
Y
 
E
G
 
T
G
 
A
R
 
K
C
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
N
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
H
 
A
H
 
T
D
 
S
I
 
F
I
 
D
D
 
E
A
 
I
I
 
F
E
 
D
N
 
G
M
 
K
K
 
D
R
 
H
P
 
K
F
 
F
K
 
D
G
 
Y
D
 
S
W
 
L
L
 
Y
D
 
E
C
 
L
A
 
A
K
 
N
K
 
K
L
 
L

Q2FXM8 ATP-dependent 6-phosphofructokinase; ATP-PFK; Phosphofructokinase; Phosphohexokinase; EC 2.7.1.11 from Staphylococcus aureus (strain NCTC 8325 / PS 47) (see paper)
50% identity, 99% coverage: 2:319/320 of query aligns to 1:320/322 of Q2FXM8

query
sites
Q2FXM8
I
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
N
G
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
D
M
 
I
V
 
H
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
L
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
E
E
 
Q
N
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
Y
M
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
S
E
 
E
-
 
E
-
 
C
M
 
K
G
 
E
F
 
I
P
 
Q
C
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
T
|
T
I
|
I
D
|
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
N
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
x
G
A
x
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
A
R
|
R
I
 
T
S
 
F
V
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
A
M
|
M
G
|
G
R
|
R
Y
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
V
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
K
F
 
T
S
 
D
R
 
I
E
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
T
 
A
E
|
E
H
 
G
M
 
C
C
 
M
D
 
T
V
 
A
D
 
Q
E
 
D
L
 
C
A
 
Q
H
 
K
F
 
E
I
 
L
E
 
S
K
 
Q
E
 
Y
T
 
I
G
 
N
R
 
V
E
 
D
T
 
N
R
|
R
A
 
V
T
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
x
V
Q
|
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
G
Y
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
G
 
G
Y
 
E
G
 
T
G
 
A
R
 
K
C
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
N
Q
 
K
L
 
I
V
 
V
H
 
A
H
 
T
D
 
S
I
 
F
I
 
D
D
 
E
A
 
I
I
 
F
E
 
D
N
 
G
M
 
K
K
 
D
R
 
H
P
 
K
F
 
F
K
 
D
G
 
Y
D
 
S
W
 
L
L
 
Y
D
 
E
C
 
L
A
 
A
K
 
N
K
 
K
L
 
L

5xz6A Crystal structure of phosphofructokinase from staphylococcus aureus in complex with adenylylimidodiphosphate, the atp analogue (see paper)
53% identity, 91% coverage: 2:293/320 of query aligns to 1:294/318 of 5xz6A

query
sites
5xz6A
I
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
N
G
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
|
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
D
M
 
I
V
 
H
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
L
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
x
K
D
 
E
E
 
Q
N
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
 
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
Y
M
x
R
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
S
E
 
E
-
 
E
-
 
C
M
 
K
G
 
E
F
 
I
P
 
Q
C
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
N
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
A
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
A
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
A
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
V
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
K
F
 
T
S
 
D
R
 
I
E
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
C
C
 
M
D
 
T
V
 
A
D
 
Q
E
 
D
L
 
C
A
 
Q
H
 
K
F
 
E
I
 
L
E
 
S
K
 
Q
E
 
Y
T
 
I
G
 
N
R
 
V
E
 
D
T
 
N
R
 
R
A
 
V
T
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
G
Y
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
G
 
G
Y
 
E
G
 
T
G
 
A
R
 
K
C
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
N
Q
 
K
L
 
I
V
 
V

5xz7A Crystal structure of phosphofructokinase from staphylococcus aureus in complex with adenylylimidodiphosphate, the atp analogue (see paper)
53% identity, 91% coverage: 2:293/320 of query aligns to 1:294/322 of 5xz7A

query
sites
5xz7A
I
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
Y
E
 
N
G
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
V
M
 
Y
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
H
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
E
 
N
D
 
D
R
 
D
M
 
I
V
 
H
Q
 
K
L
 
L
D
 
E
R
 
L
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
G
D
 
D
M
 
T
I
 
I
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
Y
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
 
C
P
 
P
E
 
E
F
 
F
R
 
K
D
 
E
E
 
Q
N
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
K
 
R
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
M
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
S
E
 
E
-
 
E
-
 
C
M
 
K
G
 
E
F
 
I
P
 
Q
C
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
 
D
I
 
I
K
 
N
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
A
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
I
R
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
A
S
 
S
S
 
S
H
 
H
Q
 
A
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
A
M
|
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
W
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
V
G
 
G
C
 
A
E
 
E
F
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
K
F
 
T
S
 
D
R
 
I
E
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
K
 
R
G
 
G
K
 
K
K
 
K
H
 
H
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
L
I
 
V
T
 
A
E
|
E
H
 
G
M
 
C
C
 
M
D
 
T
V
 
A
D
 
Q
E
 
D
L
 
C
A
 
Q
H
 
K
F
 
E
I
 
L
E
 
S
K
 
Q
E
 
Y
T
 
I
G
 
N
R
 
V
E
 
D
T
 
N
R
 
R
A
 
V
T
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
V
Q
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
T
P
 
G
Y
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
L
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
Q
G
 
G
Y
 
E
G
 
T
G
 
A
R
 
K
C
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
N
 
N
E
 
N
Q
 
K
L
 
I
V
 
V

4xyjF Crystal structure of human phosphofructokinase-1 in complex with atp and mg, northeast structural genomics consortium target hr9275 (see paper)
41% identity, 86% coverage: 3:277/320 of query aligns to 11:320/761 of 4xyjF

query
sites
4xyjF
K
 
K
K
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
|
G
D
 
D
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
|
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
M
A
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
K
V
 
V
M
 
Y
G
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
M
Y
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
G
D
 
S
R
 
N
M
 
I
V
 
A
Q
 
E
L
 
A
D
 
D
R
 
W
Y
 
E
S
 
S
V
 
V
S
|
S
D
x
S
M
 
I
I
 
L
N
 
Q
R
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
Q
E
 
A
F
|
F
R
|
R
D
 
T
E
 
R
N
 
E
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
C
N
 
N
L
 
L
K
 
L
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
T
A
 
N
L
 
L
V
 
C
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
L
M
 
T
G
|
G
A
 
A
M
 
N
R
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
F
 
L
P
 
N
C
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
|
G
T
x
S
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
F
K
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
M
D
 
T
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
C
G
|
G
C
 
A
E
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
E
E
 
E
F
 
G
S
 
W
R
 
E
E
 
E
D
 
Q
L
 
M
V
 
C
N
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
K
K
|
K
K
 
R
H
 
L
A
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
V
 
T
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
S
D
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
K
H
 
E
F
 
L
I
 
V
E
 
V
K
 
T
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
S
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4xykA Crystal structure of human phosphofructokinase-1 in complex with adp, northeast structural genomics consortium target hr9275 (see paper)
41% identity, 86% coverage: 3:277/320 of query aligns to 9:318/737 of 4xykA

query
sites
4xykA
K
 
K
K
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
|
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
M
A
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
K
V
 
V
M
 
Y
G
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
M
Y
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
G
D
 
S
R
 
N
M
 
I
V
 
A
Q
 
E
L
 
A
D
 
D
R
 
W
Y
 
E
S
 
S
V
 
V
S
|
S
D
 
S
M
 
I
I
 
L
N
 
Q
R
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
Q
E
 
A
F
 
F
R
|
R
D
 
T
E
 
R
N
 
E
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
C
N
 
N
L
 
L
K
 
L
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
T
A
 
N
L
 
L
V
 
C
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
L
M
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
N
R
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
F
 
L
P
 
N
C
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
|
G
T
x
S
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
F
K
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
M
D
 
T
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
C
G
 
G
C
 
A
E
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
E
E
 
E
F
 
G
S
 
W
R
 
E
E
 
E
D
 
Q
L
 
M
V
 
C
N
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
K
K
|
K
K
 
R
H
 
L
A
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
V
 
T
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
S
D
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
K
H
 
E
F
 
L
I
 
V
E
 
V
K
 
T
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
S
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4xyjA Crystal structure of human phosphofructokinase-1 in complex with atp and mg, northeast structural genomics consortium target hr9275 (see paper)
41% identity, 86% coverage: 3:277/320 of query aligns to 13:322/768 of 4xyjA

query
sites
4xyjA
K
 
K
K
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
|
G
D
 
D
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
|
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
M
A
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
K
V
 
V
M
 
Y
G
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
Y
|
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
M
Y
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
G
D
 
S
R
 
N
M
 
I
V
 
A
Q
 
E
L
 
A
D
 
D
R
 
W
Y
 
E
S
 
S
V
 
V
S
 
S
D
x
S
M
 
I
I
 
L
N
 
Q
R
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
Q
E
 
A
F
|
F
R
|
R
D
 
T
E
 
R
N
 
E
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
C
N
 
N
L
 
L
K
 
L
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
T
A
 
N
L
 
L
V
 
C
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
L
M
 
T
G
|
G
A
 
A
M
 
N
R
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
F
 
L
P
 
N
C
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
|
G
T
x
S
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
F
K
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
M
D
 
T
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
C
G
|
G
C
 
A
E
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
E
E
 
E
F
 
G
S
 
W
R
 
E
E
 
E
D
 
Q
L
 
M
V
 
C
N
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
K
K
|
K
K
 
R
H
 
L
A
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
V
 
T
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
S
D
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
K
H
 
E
F
 
L
I
 
V
E
 
V
K
 
T
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
S
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q01813 ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type; ATP-PFK; PFK-P; 6-phosphofructokinase type C; Phosphofructo-1-kinase isozyme C; PFK-C; Phosphohexokinase; EC 2.7.1.11 from Homo sapiens (Human) (see paper)
41% identity, 86% coverage: 3:277/320 of query aligns to 25:334/784 of Q01813

query
sites
Q01813
K
 
K
K
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
M
A
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
K
V
 
V
M
 
Y
G
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
M
Y
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
G
D
 
S
R
 
N
M
 
I
V
 
A
Q
 
E
L
 
A
D
 
D
R
 
W
Y
 
E
S
 
S
V
 
V
S
 
S
D
 
S
M
 
I
I
 
L
N
 
Q
R
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
C
P
 
Q
E
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
T
E
 
R
N
 
E
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
C
N
 
N
L
 
L
K
 
L
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
T
A
 
N
L
 
L
V
 
C
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
L
M
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
N
R
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
F
 
L
P
 
N
C
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
D
N
 
N
D
 
D
I
 
F
K
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
M
D
 
T
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
 
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
C
G
 
G
C
 
A
E
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
E
E
 
E
F
 
G
S
 
W
R
 
E
E
 
E
D
 
Q
L
 
M
V
 
C
N
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
K
K
 
K
K
 
R
H
 
L
A
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
V
 
T
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
S
D
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
K
H
 
E
F
 
L
I
 
V
E
 
V
K
 
T
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
S
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4rh3A Amppcp-bound structure of human platelet phosphofructokinase in an r- state, crystal form ii (see paper)
41% identity, 85% coverage: 5:277/320 of query aligns to 3:310/731 of 4rh3A

query
sites
4rh3A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
|
G
G
|
G
D
 
D
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
S
 
M
A
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
V
G
 
G
L
 
A
E
 
K
V
 
V
M
 
Y
G
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Q
G
 
G
L
 
M
Y
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
G
D
 
S
R
 
N
M
 
I
V
 
A
Q
 
E
L
 
A
D
 
D
R
 
W
Y
 
E
S
 
S
V
 
V
S
 
S
D
 
S
M
 
I
I
 
L
N
 
Q
R
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
|
R
F
x
C
P
 
Q
E
 
A
F
|
F
R
|
R
D
 
T
E
 
R
N
 
E
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
C
N
 
N
L
 
L
K
 
L
K
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
T
A
 
N
L
 
L
V
 
C
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
|
S
Y
 
L
M
 
T
G
|
G
A
 
A
M
 
N
R
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
L
L
 
L
T
 
E
E
 
E
M
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
F
 
L
P
 
N
C
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
P
 
V
G
|
G
T
x
S
I
 
I
D
|
D
N
 
N
D
|
D
I
 
F
K
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
M
D
 
T
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
|
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
C
G
 
G
C
 
A
E
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
F
V
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
E
E
 
E
F
 
G
S
 
W
R
 
E
E
 
E
D
 
Q
L
 
M
V
 
C
N
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
S
A
 
E
G
 
N
I
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
K
K
|
K
K
 
R
H
 
L
A
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
V
 
T
-
 
Q
-
 
N
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
S
D
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
K
H
 
E
F
 
L
I
 
V
E
 
V
K
 
T
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
S
P
 
A
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
I
L
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P08237 ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type; ATP-PFK; PFK-M; 6-phosphofructokinase type A; Phosphofructo-1-kinase isozyme A; PFK-A; Phosphohexokinase; EC 2.7.1.11 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
41% identity, 87% coverage: 3:279/320 of query aligns to 16:327/780 of P08237

query
sites
P08237
K
 
K
K
 
A
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
|
R
S
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
F
E
 
T
G
 
G
L
 
A
E
 
R
V
 
V
M
 
F
G
 
F
I
 
V
Y
 
H
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Q
G
|
G
L
 
L
Y
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
G
D
 
D
R
 
H
M
 
I
V
 
K
Q
 
E
L
 
A
D
 
T
R
 
W
Y
 
E
S
 
S
V
 
V
S
 
S
D
 
M
M
 
M
I
 
L
N
 
Q
R
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
V
L
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
C
P
 
K
E
 
D
F
 
F
R
 
R
D
 
E
E
 
R
N
 
E
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
x
R
A
 
A
I
 
A
E
 
Y
N
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
D
 
T
A
 
N
L
 
L
V
 
C
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
L
M
 
T
G
 
G
A
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
W
-
 
S
-
 
D
-
 
L
-
 
L
M
 
S
R
 
D
L
 
L
T
 
Q
E
 
K
M
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
F
 
L
P
 
N
C
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
V
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
D
N
 
N
D
 
D
I
 
F
K
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
M
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
D
T
x
S
A
 
A
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
M
E
 
E
A
 
I
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
T
T
 
T
S
 
A
S
 
Q
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
R
 
R
I
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
|
G
R
 
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
T
A
 
S
I
 
L
A
 
S
G
 
C
G
 
G
C
 
A
E
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
F
V
 
I
P
 
P
E
 
E
V
 
C
-
 
P
-
 
P
-
 
D
E
 
D
F
 
D
S
 
W
R
 
E
E
 
E
D
 
H
L
 
L
V
 
C
N
 
R
E
 
R
I
 
L
K
 
S
A
 
E
G
 
T
I
 
R
A
 
T
K
 
R
G
 
G
K
 
S
K
 
R
H
 
L
A
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
V
 
S
D
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
K
H
 
N
F
 
L
I
 
V
E
 
V
K
 
K
E
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
V
 
S
P
 
A
Y
 
F
D
|
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
G
S
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
M
L
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
G

Sites not aligning to the query:

O42938 ATP-dependent 6-phosphofructokinase; ATP-PFK; Phosphofructokinase; Phosphohexokinase; EC 2.7.1.11 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
40% identity, 86% coverage: 3:278/320 of query aligns to 195:506/942 of O42938

query
sites
O42938
K
 
K
K
 
K
I
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
M
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
V
I
 
V
R
 
R
G
 
A
V
 
V
V
 
A
R
 
R
S
 
I
A
 
A
L
 
I
T
 
H
E
 
R
G
 
G
L
 
C
E
 
D
V
 
A
M
 
F
G
 
A
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
G
 
G
Y
 
Y
L
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
E
 
Q
-
 
G
-
 
G
D
 
D
R
 
M
M
 
I
V
 
K
Q
 
Q
L
 
L
D
 
Q
R
 
W
Y
 
G
S
 
D
V
 
V
S
 
R
D
 
G
M
 
W
I
 
L
N
 
A
R
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
T
A
 
A
R
 
R
F
 
C
P
 
M
E
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
E
E
 
R
N
 
P
I
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
R
A
 
A
I
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
I
K
 
S
R
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
A
 
S
L
 
I
V
 
I
V
 
V
I
 
C
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
L
M
 
T
G
 
G
A
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
E
M
 
L
R
 
E
L
 
D
T
 
T
E
 
K
M
 
A
G
 
I
F
 
T
P
 
P
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
T
C
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
V
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
D
N
 
N
D
 
D
I
 
M
K
 
S
G
 
S
T
 
T
D
 
D
Y
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
A
F
 
F
T
 
S
A
 
S
L
 
L
S
 
H
T
 
R
V
 
I
V
 
C
E
 
E
A
 
A
I
 
V
D
 
D
R
 
S
L
 
I
R
 
S
D
 
S
T
 
T
S
 
A
S
 
I
S
 
S
H
 
H
Q
 
S
R
 
R
I
 
A
S
 
F
V
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
R
 
R
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
D
 
W
L
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
C
 
A
E
 
D
F
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
I
P
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
G
F
 
K
S
 
W
R
 
Q
E
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
C
N
 
N
E
 
S
I
 
L
K
 
S
A
 
S
G
 
V
I
 
R
A
 
K
K
 
L
G
 
G
K
 
K
K
 
R
H
 
K
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
I
I
 
V
T
 
A
E
 
E
H
 
G
M
 
A
C
 
I
D
 
D
V
 
-
D
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
N
H
 
H
F
 
I
I
 
S
E
 
P
K
 
E
E
 
D
T
 
I
G
 
K
R
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
L
E
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
V
T
 
T
V
 
T
L
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
I
P
 
P
V
 
C
P
 
A
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
I
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
T
R
 
L
M
 
Q
G
 
G
A
 
V
Y
 
D
A
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>17955 b3916 6-phosphofructokinase (NCBI)
MIKKIGVLTSGGDAPGMNAAIRGVVRSALTEGLEVMGIYDGYLGLYEDRMVQLDRYSVSD
MINRGGTFLGSARFPEFRDENIRAVAIENLKKRGIDALVVIGGDGSYMGAMRLTEMGFPC
IGLPGTIDNDIKGTDYTIGFFTALSTVVEAIDRLRDTSSSHQRISVVEVMGRYCGDLTLA
AAIAGGCEFVVVPEVEFSREDLVNEIKAGIAKGKKHAIVAITEHMCDVDELAHFIEKETG
RETRATVLGHIQRGGSPVPYDRILASRMGAYAIDLLLAGYGGRCVGIQNEQLVHHDIIDA
IENMKRPFKGDWLDCAKKLY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory