SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 17958 FitnessBrowser__Keio:17958 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
100% identity, 100% coverage: 1:255/255 of query aligns to 1:255/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
R
H
 
H
M
 
M
V
 
V
H
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
K
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
S
H
 
H
I
 
I
M
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
H
 
H
K
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
C
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
K
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
100% identity, 100% coverage: 1:255/255 of query aligns to 1:255/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
R
H
 
H
M
 
M
V
 
V
H
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
M
 
M
A
 
A
K
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
S
 
S
H
 
H
I
 
I
M
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
H
 
H
K
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
A
 
A
E
 
E
N
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
C
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
K
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
A
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
66% identity, 93% coverage: 1:237/255 of query aligns to 1:239/256 of P50921

query
sites
P50921
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
E
M
 
M
V
 
V
H
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
L
S
 
N
N
 
G
L
 
L
R
 
N
K
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
T
G
 
G
C
 
V
A
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
L
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
R
E
 
T
A
 
L
E
 
T
-
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
S
H
 
A
I
 
I
M
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
T
 
M
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
E
I
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
Y
 
H
I
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
Y
H
 
H
K
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
N
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
E
 
M
E
 
A
V
 
V
C
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
K
 
N
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
K
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
A
H
 
H
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
K
D
 
S
A
 
E
N
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
K
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
66% identity, 93% coverage: 2:237/255 of query aligns to 1:238/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
E
M
 
M
V
 
V
H
 
V
E
 
D
L
 
L
V
 
L
S
 
N
N
 
G
L
 
L
R
 
N
K
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
T
G
 
G
C
 
V
A
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
L
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
R
E
 
T
A
 
L
E
 
T
-
 
E
-
 
A
G
 
G
S
 
S
H
 
A
I
 
I
M
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
N
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
T
 
M
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
E
I
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
Y
 
H
I
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
Y
H
 
H
K
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
N
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
E
 
M
E
 
A
V
 
V
C
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
K
 
N
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
A
F
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
V
 
I
H
 
H
K
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
A
H
 
H
I
 
I
A
 
A
K
 
E
V
 
K
D
 
S
A
 
E
N
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
K
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
50% identity, 98% coverage: 2:250/255 of query aligns to 4:252/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
H
 
K
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
L
H
 
E
M
 
S
V
 
I
H
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
E
N
 
T
L
 
L
R
 
N
K
 
S
E
 
A
L
 
Q
A
 
L
G
 
D
V
 
-
A
 
P
G
 
N
C
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
I
Y
 
Y
I
 
L
D
 
P
M
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
S
E
 
K
-
 
L
A
 
K
E
 
K
G
 
P
S
 
K
H
 
E
I
 
I
M
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
C
D
 
Y
L
 
T
N
 
K
L
 
P
S
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
E
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
P
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
I
H
 
F
K
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
V
 
Y
L
 
A
K
 
L
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
E
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
M
E
 
E
V
 
V
C
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
L
A
 
K
V
 
A
L
 
I
K
 
A
T
 
D
Q
 
K
G
 
-
A
 
I
A
 
K
A
 
D
F
 
W
E
 
S
G
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
K
 
A
F
 
A
I
 
L
R
 
R
D
 
K
H
 
W
I
 
L
A
 
K
K
 
E
-
 
N
V
 
V
D
 
S
A
 
P
N
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
V
 
T
I
 
R
I
 
I
Q
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
P
A
 
E
F
 
F
A
 
V
V
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
N
A
 
A
A
 
R
E
 
Q

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
50% identity, 96% coverage: 2:245/255 of query aligns to 5:248/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
R
 
R
H
 
K
P
 
L
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
Y
H
 
S
M
 
H
V
 
I
H
 
N
E
 
T
L
 
F
V
 
F
S
 
D
N
 
T
L
 
L
R
 
Q
K
 
K
E
 
A
L
 
D
A
 
T
G
 
D
V
 
-
A
 
P
G
 
N
C
 
A
A
 
D
V
 
I
A
 
V
I
 
I
A
 
G
P
 
V
P
 
P
E
 
A
M
 
C
Y
 
Y
I
 
L
D
 
K
M
 
Y
A
 
A
K
 
Q
R
 
D
E
 
K
A
 
A
E
 
P
G
 
K
S
 
G
H
 
-
I
 
I
M
 
K
L
 
I
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
C
D
 
Y
L
 
K
N
 
V
L
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
I
S
 
S
A
 
T
A
 
E
M
 
M
L
 
I
K
 
K
D
 
D
I
 
C
G
 
G
A
 
C
Q
 
E
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
H
Y
 
I
H
 
F
K
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
N
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
G
K
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
V
 
H
L
 
A
K
 
L
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
V
V
 
I
L
 
P
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
E
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
N
E
 
D
V
 
V
C
 
C
A
 
F
R
 
A
Q
 
Q
I
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
K
T
 
N
-
 
V
Q
 
P
G
 
S
A
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
W
E
 
D
G
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
K
 
K
F
 
V
I
 
V
R
 
R
D
 
D
H
 
W
I
 
I
A
 
R
K
 
K
-
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
V
 
V
I
 
R
I
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
T
A
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
K
E
 
D
L
 
L
F
 
G
A
 
T
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
D
 
D
A
 
F
F
 
I
A
 
T
V
 
I
I
 
I

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
48% identity, 98% coverage: 2:250/255 of query aligns to 8:255/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
H
 
K
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
R
H
 
D
M
 
D
V
 
N
H
 
D
E
 
K
L
 
L
V
 
L
S
 
K
N
 
-
L
 
L
R
 
L
K
 
S
E
 
E
L
 
A
A
 
H
G
 
F
V
 
D
A
 
D
G
 
N
C
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
L
I
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
P
E
 
S
M
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
H
M
 
E
A
 
I
K
 
-
R
 
R
E
 
K
A
 
S
E
 
L
G
 
K
S
 
K
H
 
E
I
 
I
M
 
H
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
C
D
 
Y
L
 
K
N
 
V
L
 
S
S
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
L
 
I
K
 
R
D
 
D
I
 
I
G
 
G
A
 
C
Q
 
D
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
N
Y
 
I
H
 
F
K
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
Q
V
 
H
L
 
A
K
 
L
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
K
 
K
T
 
T
E
 
E
E
 
E
V
 
V
C
 
C
A
 
V
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
A
-
 
N
K
 
K
T
 
I
Q
 
K
G
 
S
A
 
A
A
 
D
A
 
E
F
 
W
E
 
K
G
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
K
 
N
F
 
F
I
 
L
R
 
R
D
 
K
H
 
W
I
 
F
A
 
K
K
 
T
V
 
N
D
 
A
A
 
P
N
 
N
-
 
G
I
 
V
A
 
D
E
 
E
Q
 
K
V
 
I
I
 
R
I
 
I
Q
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
N
 
T
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
P
 
H
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
D
 
E
A
 
-
F
 
F
A
 
T
V
 
E
I
 
I
V
 
C
K
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
Q

P00942 Triosephosphate isomerase; TIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
46% identity, 96% coverage: 2:245/255 of query aligns to 3:244/248 of P00942

query
sites
P00942
R
 
R
H
 
T
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Q
M
 
S
V
 
I
H
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
V
S
 
E
N
 
R
L
 
L
R
 
N
K
 
T
E
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
S
V
 
I
A
 
P
-
 
E
G
 
N
C
 
V
A
 
E
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
C
P
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
T
Y
 
Y
I
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
S
K
 
V
R
 
S
E
 
L
A
 
V
E
 
K
G
 
K
S
 
P
H
 
Q
I
 
V
M
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
A
D
 
Y
L
 
L
N
 
K
L
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
N
S
 
S
A
 
V
A
 
D
M
 
Q
L
 
I
K
 
K
D
 
D
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
F
I
 
I
A
 
A
K
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
K
V
 
F
L
 
A
K
 
L
E
 
G
Q
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
E
E
 
E
N
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
L
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
-
T
 
-
Q
 
E
G
 
E
A
 
V
A
 
K
A
 
D
F
 
W
E
 
T
G
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
D
V
 
I
H
 
H
K
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
K
H
 
F
I
 
L
A
 
A
-
 
S
K
 
K
V
 
L
D
 
G
A
 
D
N
 
K
I
 
A
A
 
A
E
 
S
Q
 
E
V
 
L
I
 
R
I
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
N
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
V
E
 
T
L
 
F
F
 
K
A
 
D
Q
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
D
 
E
A
 
F
F
 
V
A
 
D
V
 
I
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
47% identity, 97% coverage: 2:249/255 of query aligns to 2:249/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
H
 
K
P
 
K
L
 
F
V
 
V
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
T
S
 
T
R
 
L
H
 
A
M
 
E
V
 
A
H
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
G
S
 
A
N
 
A
L
 
V
R
 
A
K
 
K
E
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
V
 
V
A
 
T
G
 
D
-
 
D
-
 
R
C
 
V
A
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
F
P
 
P
P
 
P
E
 
Y
M
 
P
Y
 
W
I
 
L
D
 
T
M
 
A
A
 
V
K
 
G
R
 
E
E
 
V
A
 
L
E
 
K
G
 
G
S
 
S
H
 
P
I
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
S
N
 
E
L
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
V
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
L
D
 
E
I
 
T
G
 
G
A
 
C
Q
 
K
Y
 
Y
I
 
A
I
 
L
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
H
Y
 
I
H
 
I
K
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
E
E
 
T
L
 
F
I
 
I
A
 
N
K
 
H
K
 
K
F
 
V
A
 
H
V
 
T
L
 
A
K
 
L
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
L
T
 
Q
E
 
E
E
 
R
V
 
V
C
 
F
A
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
I
 
V
D
 
Y
A
 
A
V
 
A
L
 
C
K
 
A
T
 
G
Q
 
L
G
 
T
A
 
D
A
 
E
A
 
Q
F
 
F
E
 
G
G
 
R
A
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
A
H
 
H
K
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
S
H
 
K
I
 
L
A
 
R
K
 
L
V
 
L
D
 
Y
A
 
G
N
 
D
-
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
I
 
P
I
 
I
Q
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
T
A
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
T
A
 
V
E
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
S
F
 
F
A
 
L
V
 
A
I
 
I
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 2:254/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
H
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
R
 
V
H
 
Q
M
 
E
V
 
A
H
 
K
E
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
N
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
D
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
E
G
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
-
C
 
C
A
 
A
V
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
P
 
L
P
 
D
E
 
A
M
 
L
Y
 
T
I
 
T
D
 
A
M
 
V
A
 
K
K
 
E
R
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
L
H
 
E
I
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
Y
L
 
F
N
 
E
L
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
L
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
V
 
A
L
 
I
K
 
F
E
 
K
Q
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
E
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
G
R
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
K
 
A
T
 
G
Q
 
L
G
 
S
A
 
E
A
 
D
A
 
Q
F
 
L
E
 
K
G
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
K
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
D
V
 
L
D
 
S
A
 
S
N
 
K
-
 
E
I
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
T
I
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
E
 
K

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 2:254/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
H
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
R
 
V
H
 
Q
M
 
E
V
 
A
H
 
K
E
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
N
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
D
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
E
G
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
-
C
 
C
A
 
A
V
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
P
 
L
P
 
D
E
 
A
M
 
L
Y
 
T
I
 
T
D
 
A
M
 
V
A
 
K
K
 
E
R
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
L
H
 
E
I
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
Y
L
 
F
N
 
E
L
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
L
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
V
 
A
L
 
I
K
 
F
E
 
K
Q
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
E
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
G
R
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
K
 
A
T
 
G
Q
 
L
G
 
S
A
 
E
A
 
D
A
 
Q
F
 
L
E
 
K
G
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
K
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
D
V
 
L
D
 
S
A
 
S
N
 
K
-
 
E
I
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
T
I
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
E
 
K

3ypiA Electrophilic catalysis in triosephosphase isomerase: the role of histidine-95 (see paper)
45% identity, 96% coverage: 2:245/255 of query aligns to 2:243/247 of 3ypiA

query
sites
3ypiA
R
 
R
H
 
T
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Q
M
 
S
V
 
I
H
 
K
E
 
E
L
 
I
V
 
V
S
 
E
N
 
R
L
 
L
R
 
N
K
 
T
E
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
S
V
 
I
A
 
P
-
 
E
G
 
N
C
 
V
A
 
E
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
C
P
 
P
P
 
P
E
 
A
M
 
T
Y
 
Y
I
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
S
K
 
V
R
 
S
E
 
L
A
 
V
E
 
K
G
 
K
S
 
P
H
 
Q
I
 
V
M
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
A
D
 
Y
L
 
L
N
 
K
L
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
N
S
 
S
A
 
V
A
 
D
M
 
Q
L
 
I
K
 
K
D
 
D
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
x
Q
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
S
Y
 
Y
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
F
I
 
I
A
 
A
K
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
K
V
 
F
L
 
A
K
 
L
E
 
G
Q
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
E
E
 
E
N
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
L
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
E
R
 
R
Q
 
Q
I
 
L
D
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
E
T
 
E
Q
 
-
G
 
-
A
 
V
A
 
K
A
 
D
F
 
W
E
 
T
G
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
L
S
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
D
V
 
I
H
 
H
K
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
K
H
 
F
I
 
L
A
 
A
-
 
S
K
 
K
V
 
L
D
 
G
A
 
D
N
 
K
I
 
A
A
 
A
E
 
S
Q
 
E
V
 
L
I
 
R
I
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
N
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
V
E
 
T
L
 
F
F
 
K
A
 
D
Q
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
D
 
E
A
 
F
F
 
V
A
 
D
V
 
I
I
 
I

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 3:255/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
H
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
R
 
V
H
 
Q
M
 
E
V
 
A
H
 
K
E
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
N
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
D
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
E
G
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
-
C
 
C
A
 
A
V
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
P
 
L
P
 
D
E
 
A
M
 
L
Y
 
T
I
 
T
D
 
A
M
 
V
A
 
K
K
 
E
R
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
L
H
 
E
I
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
Y
L
 
F
N
 
E
L
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
L
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
V
 
A
L
 
I
K
 
F
E
 
K
Q
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
E
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
G
R
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
K
 
A
T
 
G
Q
 
L
G
 
S
A
 
E
A
 
D
A
 
Q
F
 
L
E
 
K
G
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
K
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
D
V
 
L
D
 
S
A
 
S
N
 
K
-
 
E
I
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
T
I
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
x
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
E
 
K

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 1:253/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
H
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
R
 
V
H
 
Q
M
 
E
V
 
A
H
 
K
E
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
N
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
D
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
E
G
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
-
C
 
C
A
 
A
V
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
P
 
L
P
 
D
E
 
A
M
 
L
Y
 
T
I
 
T
D
 
A
M
 
V
A
 
K
K
 
E
R
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
L
H
 
E
I
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
Y
L
 
F
N
 
E
L
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
L
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
V
 
A
L
 
I
K
 
F
E
 
K
Q
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
E
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
G
R
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
K
 
A
T
 
G
Q
 
L
G
 
S
A
 
E
A
 
D
A
 
Q
F
 
L
E
 
K
G
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
K
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
D
V
 
L
D
 
S
A
 
S
N
 
K
-
 
E
I
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
T
I
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
E
 
K

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:250/255 of query aligns to 1:253/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
M
 
M
R
 
R
H
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
L
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
R
 
V
H
 
Q
M
 
E
V
 
A
H
 
K
E
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
N
 
A
L
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
D
R
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
E
G
 
S
V
 
V
A
 
I
G
 
-
C
 
C
A
 
A
V
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
P
 
L
P
 
D
E
 
A
M
 
L
Y
 
T
I
 
T
D
 
A
M
 
V
A
 
K
K
 
E
R
 
G
E
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
L
H
 
E
I
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
D
 
Y
L
 
F
N
 
E
L
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
E
Y
 
L
H
 
F
K
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
N
K
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
V
 
A
L
 
I
K
 
F
E
 
K
Q
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
D
A
 
E
E
 
E
N
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
V
C
 
V
A
 
G
R
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
K
A
 
K
V
 
A
L
 
V
K
 
A
T
 
G
Q
 
L
G
 
S
A
 
E
A
 
D
A
 
Q
F
 
L
E
 
K
G
 
S
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
V
 
M
H
 
C
K
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
D
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
D
V
 
L
D
 
S
A
 
S
N
 
K
-
 
E
I
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
T
I
 
R
I
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
D
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
Q
I
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
E
 
K

2y63A Crystal structure of leishmanial e65q-tim complexed with bromohydroxyacetone phosphate (see paper)
43% identity, 95% coverage: 3:245/255 of query aligns to 4:245/249 of 2y63A

query
sites
2y63A
H
 
Q
P
 
P
L
 
I
V
 
A
M
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
C
N
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
T
H
 
A
M
 
S
V
 
I
H
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
S
 
Q
N
 
V
L
 
F
R
 
N
K
 
E
E
 
H
-
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
H
V
 
D
A
 
V
G
 
Q
C
 
C
A
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
-
A
 
-
P
 
P
P
 
T
E
 
F
M
 
V
Y
 
H
I
 
I
D
 
P
M
 
L
A
 
V
K
 
Q
R
 
A
E
 
K
A
 
L
E
 
R
G
 
N
S
 
P
H
 
K
I
 
Y
M
 
V
L
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
A
D
 
-
L
 
I
N
 
A
L
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
V
S
 
S
A
 
M
A
 
P
M
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
G
A
 
V
Q
 
H
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
K
 
G
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
S
V
 
E
L
 
A
K
 
C
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
T
 
M
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
Q
E
 
Q
N
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
E
 
A
E
 
K
V
 
V
C
 
V
A
 
L
R
 
S
Q
 
Q
I
 
T
D
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
A
T
 
K
Q
 
L
G
 
T
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
W
E
 
N
G
 
Q
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
K
 
L
F
 
L
I
 
L
R
 
R
D
 
K
H
 
W
I
 
V
A
 
S
K
 
E
-
 
N
V
 
I
D
 
G
A
 
T
N
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
K
V
 
L
I
 
R
I
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
N
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
D
 
E
A
 
F
F
 
R
A
 
D
V
 
I
I
 
I

2y61A Crystal structure of leishmanial e65q-tim complexed with s-glycidol phosphate (see paper)
43% identity, 95% coverage: 3:245/255 of query aligns to 4:245/249 of 2y61A

query
sites
2y61A
H
 
Q
P
 
P
L
 
I
V
 
A
M
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
C
N
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
T
H
 
A
M
 
S
V
 
I
H
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
S
 
Q
N
 
V
L
 
F
R
 
N
K
 
E
E
 
H
-
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
H
V
 
D
A
 
V
G
 
Q
C
 
C
A
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
-
A
 
-
P
 
P
P
 
T
E
 
F
M
 
V
Y
 
H
I
 
I
D
 
P
M
 
L
A
 
V
K
 
Q
R
 
A
E
 
K
A
 
L
E
 
R
G
 
N
S
 
P
H
 
K
I
 
Y
M
 
V
L
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
A
D
 
-
L
 
I
N
 
A
L
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
V
S
 
S
A
 
M
A
 
P
M
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
G
A
 
V
Q
 
H
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
K
 
G
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
S
V
 
E
L
 
A
K
 
C
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
T
 
M
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
Q
E
 
Q
N
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
E
 
A
E
 
K
V
 
V
C
 
V
A
 
L
R
 
S
Q
 
Q
I
 
T
D
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
A
T
 
K
Q
 
L
G
 
T
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
W
E
 
N
G
 
Q
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
V
 
V
H
 
H
K
 
L
F
 
L
I
 
L
R
 
R
D
 
K
H
 
W
I
 
V
A
 
S
K
 
E
-
 
N
V
 
I
D
 
G
A
 
T
N
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
A
Q
 
K
V
 
L
I
 
R
I
 
I
Q
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
N
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
D
 
E
A
 
F
F
 
R
A
 
D
V
 
I
I
 
I

2vxnA E65q-tim complexed with phosphoglycolohydroxamate at 0.82 a resolution (see paper)
43% identity, 95% coverage: 3:245/255 of query aligns to 4:245/249 of 2vxnA

query
sites
2vxnA
H
 
Q
P
 
P
L
 
I
V
 
A
M
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
C
N
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
T
H
 
A
M
 
S
V
 
I
H
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
S
 
Q
N
 
V
L
 
F
R
 
N
K
 
E
E
 
H
-
 
T
L
 
I
A
 
S
G
 
H
V
 
D
A
 
V
G
 
Q
C
 
C
A
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
-
A
 
-
P
 
P
P
 
T
E
 
F
M
 
V
Y
 
H
I
 
I
D
 
P
M
 
L
A
 
V
K
 
Q
R
 
A
E
 
K
A
 
L
E
 
R
G
 
N
S
 
P
H
 
K
I
 
Y
M
 
V
L
 
I
G
 
S
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
A
D
 
-
L
 
I
N
 
A
L
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
V
S
 
S
A
 
M
A
 
P
M
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
G
A
 
V
Q
 
H
Y
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
H
 
Y
K
 
G
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
S
V
 
E
L
 
A
K
 
C
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
L
 
F
T
 
M
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
L
A
 
Q
E
 
Q
N
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
N
K
 
Q
T
 
T
E
 
A
E
 
K
V
 
V
C
 
V
A
 
L
R
 
S
Q
 
Q
I
 
T
D
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
A
T
 
K
Q
 
L
G
 
T
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
W
E
 
N
G
 
Q
A
 
V
V
 
V
I