SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 200140 FitnessBrowser__MR1:200140 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1hyuA Crystal structure of intact ahpf (see paper)
59% identity, 97% coverage: 1:511/527 of query aligns to 1:517/521 of 1hyuA

query
sites
1hyuA
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
M
K
 
K
N
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
R
T
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
T
R
 
K
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
S
K
 
A
K
 
K
S
 
S
Q
 
A
E
 
E
L
 
I
K
 
K
S
 
E
L
 
L
V
 
L
N
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
S
T
 
D
F
 
K
V
 
V
S
 
T
L
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
D
Q
 
N
G
 
T
Q
 
L
-
 
P
-
 
V
R
 
R
T
 
K
P
 
P
A
 
S
M
 
F
T
 
L
V
 
I
V
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
G
L
 
S
N
 
Q
T
 
Q
Q
 
G
I
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
M
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
W
S
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
S
K
 
K
L
 
E
S
 
A
D
 
Q
D
 
S
I
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
N
 
D
L
 
I
P
 
D
G
 
G
K
 
D
Y
 
F
E
 
E
F
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
V
 
Y
S
 
S
L
 
L
T
 
S
C
 
C
Q
 
H
N
 
N
C
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
M
 
L
M
 
M
A
 
A
A
 
V
I
 
L
N
 
N
P
 
P
N
 
R
I
 
I
T
 
K
N
 
H
V
 
T
M
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
T
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
T
S
 
E
R
 
R
N
 
N
I
 
V
M
 
M
A
 
G
V
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
E
F
 
F
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
M
S
 
T
I
 
L
G
 
T
E
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
K
 
K
L
 
V
D
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
E
S
 
K
R
 
R
K
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
A
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
K
 
R
A
 
D
P
 
A
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
M
A
x
G
D
x
E
K
 
R
F
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
V
A
 
L
E
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
D
I
|
I
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
K
T
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
A
H
 
H
V
 
V
R
 
S
D
 
D
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
M
 
I
D
 
D
N
 
S
Q
|
Q
K
x
S
A
|
A
V
 
S
K
 
K
L
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
A
A
 
T
S
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
H
E
 
Q
L
 
I
E
 
E
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
V
L
 
L
R
 
K
S
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
R
 
K
W
|
W
R
 
R
E
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
D
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
C
|
C
P
|
P
H
 
H
C
 
C
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
F
 
F
K
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
A
S
 
P
K
 
E
L
 
M
R
 
K
A
 
A
D
 
D
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
K
A
 
V
A
 
R
S
 
S
M
 
L
G
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
L
Q
 
N
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
R
 
K
V
 
V
N
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
E
Y
 
Y
T
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
V
T
 
S
G
 
G
E
 
D
S
 
I
H
 
H
H
 
S
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
P
N
|
N
A
 
T
E
 
H
W
|
W
L
 
L
K
 
E
G
 
G
T
 
A
V
 
L
D
 
E
L
 
R
T
 
N
P
 
R
R
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
K
G
 
C
Q
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
T
 
T
N
 
T
S
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
|
K
Q
|
Q
I
|
I
I
 
I
I
 
I
A
|
A
M
 
T
G
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
R
 
R

4ykgA Crystal structure of the alkylhydroperoxide reductase subunit f (ahpf) with NAD+ from escherichia coli (see paper)
59% identity, 97% coverage: 1:511/527 of query aligns to 1:517/521 of 4ykgA

query
sites
4ykgA
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
M
K
 
K
N
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
K
T
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
T
R
 
K
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
S
K
 
A
K
 
K
S
 
S
Q
 
A
E
 
E
L
 
I
K
 
K
S
 
E
L
 
L
V
 
L
N
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
S
T
 
D
F
 
K
V
 
V
S
 
T
L
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
D
Q
 
N
G
 
S
Q
 
L
-
 
P
-
 
V
R
 
R
T
 
K
P
 
P
A
 
S
M
 
F
T
 
L
V
 
I
V
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
G
L
 
S
N
 
N
T
 
Q
Q
 
G
I
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
M
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
W
S
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
S
K
 
K
L
 
E
S
 
A
D
 
Q
D
 
S
I
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
N
 
H
L
 
I
P
 
D
G
 
G
K
 
D
Y
 
F
E
 
E
F
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
V
 
Y
S
 
S
L
 
L
T
 
S
C
 
C
Q
 
H
N
 
N
C
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
M
 
L
M
 
M
A
 
S
A
 
V
I
 
L
N
 
N
P
 
P
N
 
R
I
 
I
T
 
K
N
 
H
V
 
T
M
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
T
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
T
S
 
D
R
 
R
N
 
N
I
 
V
M
 
M
A
 
G
V
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
E
F
 
F
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
M
S
 
T
I
 
L
G
 
T
E
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
K
 
K
L
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
E
S
 
K
R
 
R
K
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
K
 
R
A
 
D
P
 
A
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
M
A
x
G
D
x
E
K
x
R
F
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
I
A
 
L
E
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
D
I
|
I
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
K
T
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
V
H
 
H
V
 
V
R
 
D
D
 
E
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
M
 
I
D
 
D
N
 
S
Q
|
Q
K
x
S
A
|
A
V
 
S
K
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
A
A
 
V
S
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
H
E
 
Q
L
 
I
E
 
E
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
V
L
 
L
R
 
K
S
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
V
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
R
 
K
W
 
W
R
 
R
E
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
D
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
C
|
C
P
 
P
H
 
H
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
F
 
F
K
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
N
|
N
S
|
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
L
L
|
L
E
|
E
F
|
F
D
x
A
S
 
P
K
 
E
L
 
M
R
x
K
A
 
A
D
 
D
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
K
A
 
L
A
 
R
S
 
S
M
 
L
G
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
L
Q
 
N
A
|
A
M
 
Q
T
 
T
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
R
 
K
V
 
V
N
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
E
Y
 
Y
T
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
V
T
 
S
G
 
G
E
 
D
S
 
I
H
 
H
H
 
N
I
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
I
|
I
G
|
G
L
|
L
V
 
L
P
 
P
N
|
N
A
 
T
E
 
N
W
|
W
L
 
L
K
 
E
G
 
G
T
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
R
T
 
N
P
 
R
R
x
M
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
K
G
 
C
Q
 
E
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
T
 
T
N
 
T
S
 
V
P
|
P
Y
 
Y
K
|
K
Q
|
Q
I
|
I
I
 
I
I
 
I
A
|
A
M
 
T
G
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
R
 
R

4ykfA Crystal structure of the alkylhydroperoxide reductase subunit f (ahpf) with nadh from escherichia coli (see paper)
59% identity, 97% coverage: 1:511/527 of query aligns to 1:517/521 of 4ykfA

query
sites
4ykfA
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
M
K
 
K
N
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
K
T
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
T
R
 
K
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
S
K
 
A
K
 
K
S
 
S
Q
 
A
E
 
E
L
 
I
K
 
K
S
 
E
L
 
L
V
 
L
N
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
S
T
 
D
F
 
K
V
 
V
S
 
T
L
 
F
K
 
K
E
 
E
A
 
D
Q
 
N
G
 
S
Q
 
L
-
 
P
-
 
V
R
 
R
T
 
K
P
 
P
A
 
S
M
 
F
T
 
L
V
 
I
V
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
G
L
 
S
N
 
N
T
 
Q
Q
 
G
I
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
M
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
W
S
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
S
K
 
K
L
 
E
S
 
A
D
 
Q
D
 
S
I
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
N
 
H
L
 
I
P
 
D
G
 
G
K
 
D
Y
 
F
E
 
E
F
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
V
 
Y
S
 
S
L
 
L
T
 
S
C
 
C
Q
 
H
N
 
N
C
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
M
 
L
M
 
M
A
 
S
A
 
V
I
 
L
N
 
N
P
 
P
N
 
R
I
 
I
T
 
K
N
 
H
V
 
T
M
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
T
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
T
S
 
D
R
 
R
N
 
N
I
 
V
M
 
M
A
 
G
V
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
E
F
 
F
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
M
S
 
T
I
 
L
G
 
T
E
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
K
 
K
L
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
E
S
 
K
R
 
R
K
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
K
 
R
A
 
D
P
 
A
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
L
V
x
M
A
x
G
D
x
E
K
x
R
F
 
F
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
I
A
 
L
E
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
D
I
|
I
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
K
T
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
V
H
 
H
V
 
V
R
 
D
D
 
E
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
M
 
I
D
 
D
N
 
S
Q
 
Q
K
x
S
A
|
A
V
 
S
K
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
A
A
 
V
S
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
H
E
 
Q
L
 
I
E
 
E
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
V
L
 
L
R
 
K
S
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
V
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
R
 
K
W
 
W
R
 
R
E
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
D
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
C
|
C
P
 
P
H
 
H
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
F
 
F
K
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
N
|
N
S
|
S
G
 
G
I
 
V
E
|
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
L
L
|
L
E
|
E
F
|
F
D
 
A
S
 
P
K
 
E
L
 
M
R
x
K
A
 
A
D
 
D
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
K
A
 
L
A
 
R
S
 
S
M
 
L
G
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
L
Q
 
N
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
R
 
K
V
 
V
N
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
E
Y
 
Y
T
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
V
T
 
S
G
 
G
E
 
D
S
 
I
H
 
H
H
 
N
I
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
I
|
I
G
|
G
L
 
L
V
 
L
P
 
P
N
|
N
A
 
T
E
 
N
W
|
W
L
 
L
K
 
E
G
 
G
T
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
R
T
 
N
P
 
R
R
x
M
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
K
G
 
C
Q
 
E
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
T
 
T
N
 
T
S
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
|
K
Q
|
Q
I
|
I
I
 
I
I
 
I
A
|
A
M
 
T
G
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
R
 
R

P35340 Alkyl hydroperoxide reductase subunit F; Alkyl hydroperoxide reductase F52A protein; EC 1.8.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
59% identity, 97% coverage: 1:511/527 of query aligns to 1:517/521 of P35340

query
sites
P35340
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
M
K
 
K
N
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
K
T
 
A
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
T
R
 
K
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
S
K
 
A
K
 
K
S
 
S
Q
 
A
E
 
E
L
 
I
K
 
K
S
 
E
L
 
L
V
 
L
N
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
S
T
 
D
F
 
K
V
 
V
S
 
T
L
 
F
K
|
K
E
 
E
A
 
D
Q
 
N
G
 
S
Q
 
L
-
 
P
-
 
V
R
 
R
T
 
K
P
 
P
A
 
S
M
 
F
T
 
L
V
 
I
V
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
G
L
 
S
N
 
N
T
 
Q
Q
 
G
I
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
S
P
 
P
M
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
F
T
 
T
S
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
W
S
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
P
 
P
I
 
S
K
 
K
L
 
E
S
 
A
D
 
Q
D
 
S
I
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
N
 
H
L
 
I
P
 
D
G
 
G
K
 
D
Y
 
F
E
 
E
F
 
F
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
V
 
Y
S
 
S
L
 
L
T
 
S
C
 
C
Q
 
H
N
 
N
C
 
C
P
 
P
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
M
 
L
M
 
M
A
 
S
A
 
V
I
 
L
N
 
N
P
 
P
N
 
R
I
 
I
T
 
K
N
 
H
V
 
T
M
 
A
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
T
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
T
S
 
D
R
 
R
N
 
N
I
 
V
M
 
M
A
 
G
V
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
E
F
 
F
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
M
S
 
T
I
 
L
G
 
T
E
 
E
I
 
I
L
 
V
N
 
A
K
 
K
L
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
E
S
 
K
R
 
R
K
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
N
Q
 
K
K
 
R
A
 
D
P
 
A
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
L
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
M
A
 
G
D
 
E
K
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
A
 
L
E
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
D
I
 
I
E
 
E
N
 
N
F
 
Y
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
P
A
 
K
T
 
T
E
 
E
G
 
G
P
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
A
A
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
V
H
 
H
V
 
V
R
 
D
D
 
E
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
D
I
 
V
M
 
I
D
 
D
N
 
S
Q
 
Q
K
 
S
A
 
A
V
 
S
K
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
A
A
 
V
S
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
H
E
 
Q
L
 
I
E
 
E
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
K
 
V
L
 
L
R
 
K
S
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
K
W
 
W
R
 
R
E
 
N
M
 
M
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
D
E
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
G
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
C
 
C
P
 
P
H
 
H
C
 
C
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
F
 
F
K
|
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
L
 
L
A
 
A
N
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
E
H
 
H
V
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
L
E
 
E
F
 
F
D
 
A
S
 
P
K
 
E
L
 
M
R
 
K
A
 
A
D
 
D
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
K
A
 
L
A
 
R
S
 
S
M
 
L
G
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
L
Q
 
N
A
 
A
M
 
Q
T
 
T
T
 
T
E
 
E
V
 
V
T
 
K
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
R
 
K
V
 
V
N
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
E
Y
 
Y
T
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
V
T
 
S
G
 
G
E
 
D
S
 
I
H
 
H
H
 
N
I
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
T
E
 
N
W
 
W
L
 
L
K
 
E
G
 
G
T
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
R
T
 
N
P
 
R
R
 
M
G
 
G
E
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
A
R
 
K
G
 
C
Q
 
E
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
C
T
 
T
N
 
T
S
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
A
M
 
T
G
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
R
 
R

3ctyB Crystal structure of t. Acidophilum thioredoxin reductase (see paper)
40% identity, 56% coverage: 211:506/527 of query aligns to 5:300/305 of 3ctyB

query
sites
3ctyB
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
V
|
V
G
|
G
G
x
A
G
|
G
P
x
A
A
|
A
G
 
G
A
 
F
A
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
S
G
 
G
L
 
F
R
 
S
T
 
V
G
 
A
I
 
I
V
x
L
A
 
-
D
|
D
K
|
K
F
 
A
-
 
V
-
x
A
G
 
G
G
|
G
Q
x
L
V
x
T
A
 
A
E
|
E
T
x
A
V
x
P
G
x
L
I
x
V
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
L
S
 
G
V
 
F
K
 
K
A
 
S
T
 
I
E
 
V
G
 
G
P
 
S
K
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
K
N
 
L
L
 
F
E
 
A
A
 
D
H
 
H
V
 
A
R
 
A
D
 
N
Y
 
Y
E
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
G
V
 
V
D
x
E
I
x
V
M
 
R
D
 
S
N
 
I
Q
 
K
K
 
K
A
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
T
D
 
Q
G
 
G
L
 
G
F
 
F
E
 
D
L
 
I
E
 
E
L
 
-
A
 
T
S
 
N
G
 
D
A
 
D
K
 
T
L
 
Y
R
 
H
S
 
A
R
 
K
T
 
Y
V
 
V
L
 
I
L
 
I
A
x
T
T
|
T
G
|
G
A
x
T
R
 
T
W
 
H
R
 
K
E
 
H
M
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
S
E
 
E
Y
 
Y
R
 
F
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
T
A
 
S
Y
 
Y
C
|
C
P
 
S
H
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
S
|
S
G
 
G
I
 
A
E
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
S
L
 
M
A
 
S
N
 
E
I
 
Y
V
 
V
E
 
K
H
 
N
V
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
I
E
 
E
F
 
Y
D
 
M
S
 
P
K
 
K
L
 
Y
R
 
M
A
 
C
D
 
E
D
 
N
V
 
A
L
 
Y
Q
 
V
R
 
Q
K
 
E
A
 
I
A
 
K
S
 
K
M
 
R
G
 
-
N
 
N
I
 
I
K
 
P
I
 
Y
I
 
I
T
 
M
Q
 
N
A
 
A
M
 
Q
T
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
I
T
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
K
R
 
K
V
 
V
N
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
K
Y
 
Y
T
 
K
D
 
D
R
 
R
A
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
E
H
 
K
H
 
L
I
 
I
A
 
E
L
 
T
A
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
I
Q
x
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
P
N
x
Q
A
 
T
E
 
S
W
x
F
L
 
L
K
 
K
G
 
D
T
 
S
-
 
G
V
 
V
D
 
K
L
 
L
T
 
D
P
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
S
R
 
R
G
 
Q
Q
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
T
N
 
S
S
 
G
P
 
N
Y
 
F
K
x
A
Q
|
Q
I
|
I
I
 
A
I
 
S
A
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
D
G
 
G
A
 
C
N
 
K
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
S
A
 
L
F
 
Y

7jypA Structure of thioredoxin reductase from the thermophilic eubacterium thermosipho africanus tcf52b
38% identity, 56% coverage: 208:501/527 of query aligns to 3:296/305 of 7jypA

query
sites
7jypA
K
 
K
A
 
D
P
 
Y
Y
 
Y
E
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
V
 
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
R
K
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
S
T
 
A
G
 
A
I
 
V
V
x
F
A
x
E
D
x
K
K
x
A
F
 
L
-
 
E
G
 
G
G
|
G
Q
x
A
V
|
V
A
 
T
E
 
Q
T
 
T
V
 
H
G
 
V
I
 
V
E
 
E
N
 
N
F
 
W
I
 
P
S
 
G
V
 
F
K
 
I
A
 
R
T
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
S
K
 
E
L
 
L
V
 
G
A
 
E
N
 
K
L
 
F
E
 
A
A
 
E
H
 
H
V
 
A
R
 
K
D
 
A
Y
 
F
E
 
G
V
 
A
D
 
E
I
 
I
M
 
I
D
 
-
N
 
T
Q
x
A
K
x
E
A
x
V
V
 
L
K
 
K
L
 
I
A
 
S
S
 
Y
D
 
D
G
 
N
L
 
E
F
 
Y
E
 
K
-
 
Y
L
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
K
K
 
K
L
 
V
R
 
K
S
 
G
R
 
K
T
 
V
V
 
L
L
 
I
L
 
Y
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
R
 
V
W
 
P
R
 
R
E
 
K
M
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
E
 
E
Y
 
F
R
 
R
G
 
G
K
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
C
 
C
P
 
A
H
 
A
C
 
C
D
 
D
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
F
 
F
K
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
D
V
 
I
A
 
V
V
 
V
I
x
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
G
 
A
I
 
C
E
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
H
D
 
F
L
 
L
A
 
A
N
 
K
I
 
M
V
 
V
E
 
K
H
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
M
L
x
V
E
x
Q
F
x
N
D
x
L
S
 
P
K
 
Y
L
 
L
R
x
T
A
 
A
D
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
R
A
 
L
A
 
L
S
 
E
M
 
N
G
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
T
 
L
Q
 
N
A
 
S
M
x
L
T
 
V
T
 
K
E
 
E
V
 
I
T
 
R
G
 
G
D
 
K
G
 
-
T
 
D
R
 
K
V
 
V
N
 
E
G
 
E
L
 
V
N
 
V
Y
 
V
T
 
V
D
 
N
R
 
N
A
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
E
H
 
T
H
 
V
I
 
I
A
 
K
L
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
I
Q
x
Y
I
x
V
G
|
G
L
 
L
V
 
V
P
 
P
N
 
K
A
 
S
E
 
D
W
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
T
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
I
T
 
N
P
 
E
R
 
Y
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
I
 
K
V
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
N
G
 
M
Q
 
E
T
 
T
S
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
R
N
 
E
S
 
K
P
 
N
Y
 
L
K
x
R
Q
|
Q
I
|
I
I
 
V
I
 
T
A
|
A
M
 
A
G
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
A
N
 
I
A
 
A

5uwyA The crystal structure of thioredoxin reductase from streptococcus pyogenes mgas5005
35% identity, 57% coverage: 209:509/527 of query aligns to 3:303/306 of 5uwyA

query
sites
5uwyA
A
 
A
P
 
M
Y
 
Y
E
 
D
V
 
T
L
 
L
V
 
I
V
 
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
S
G
 
N
L
 
L
R
 
S
T
 
V
G
 
A
I
 
I
V
x
I
A
x
E
D
x
Q
K
 
G
F
 
A
-
 
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
M
A
 
N
E
 
N
T
|
T
V
 
F
G
 
D
I
 
I
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
P
S
 
G
V
 
Y
K
 
D
A
 
H
T
 
I
E
 
S
G
 
G
P
 
P
K
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
N
 
K
L
 
M
E
 
Y
A
 
E
H
 
P
V
 
L
R
 
E
D
 
K
Y
 
F
E
 
N
V
 
V
D
 
E
I
 
-
M
 
-
D
 
-
N
 
N
Q
 
I
K
 
Y
A
x
G
V
x
I
-
x
V
-
 
Q
K
 
K
L
 
I
A
 
E
S
 
N
D
 
F
G
 
G
L
 
D
F
 
Y
E
 
K
L
 
C
E
 
V
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
D
A
 
A
K
 
S
L
 
Y
R
 
E
S
 
A
R
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
R
 
K
W
x
Y
R
 
R
E
 
V
M
 
L
N
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
E
 
Y
Y
 
Y
R
 
T
G
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
S
Y
 
Y
C
 
C
P
 
A
H
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
A
L
 
F
F
 
F
K
 
R
G
 
D
K
 
Q
R
 
D
V
 
L
A
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
G
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
Y
L
 
L
A
 
T
N
 
Q
I
 
F
V
 
A
E
 
K
H
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
V
E
 
H
F
 
R
D
 
R
S
 
D
K
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
Q
D
 
K
V
 
I
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
F
S
 
A
M
 
N
G
 
D
N
 
K
I
 
V
K
 
D
I
 
F
I
 
I
T
 
W
Q
 
D
A
 
S
M
 
V
T
 
V
T
 
K
E
 
E
V
 
I
T
 
Q
G
 
G
D
 
N
G
 
D
T
 
I
R
 
K
V
 
V
N
 
S
G
 
N
L
 
V
N
 
L
Y
 
I
T
 
E
D
 
N
R
 
V
A
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
S
 
V
H
 
T
H
 
D
I
 
H
A
 
A
L
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
I
Q
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
N
P
 
P
N
x
V
A
 
T
E
 
G
W
 
M
L
 
V
K
 
K
G
 
D
T
 
L
V
 
E
D
 
I
L
 
T
T
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
G
E
 
W
I
 
I
I
 
I
V
 
T
D
 
D
E
 
D
R
 
H
G
 
M
Q
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
R
N
 
Q
S
 
K
P
 
D
Y
 
L
K
x
R
Q
|
Q
I
|
I
I
 
T
I
 
T
A
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
D
G
 
G
A
 
A
N
 
I
A
 
A
S
 
G
L
 
Q
G
 
G
A
 
V
F
 
Y
D
 
H
Y
 
Y
L
 
L

5mh4A Crystal structure of lactococcus lactis thioredoxin reductase (fr conformation) (see paper)
33% identity, 57% coverage: 211:510/527 of query aligns to 2:301/303 of 5mh4A

query
sites
5mh4A
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
V
x
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
M
Y
 
Y
A
 
T
A
 
A
R
 
R
K
 
S
G
 
E
L
 
M
R
 
K
T
 
T
G
 
L
I
 
L
V
x
L
A
x
E
D
x
R
K
 
G
F
x
V
-
x
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
M
A
 
N
E
 
N
T
|
T
V
 
A
G
x
E
I
|
I
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
P
S
 
G
V
 
Y
K
 
E
A
 
T
T
 
I
E
 
M
G
 
G
P
 
P
K
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
M
N
 
K
L
 
M
E
 
A
A
 
E
H
 
P
V
 
L
R
 
E
D
 
G
Y
 
L
E
 
G
V
 
V
D
 
E
I
 
-
M
 
-
D
 
-
N
 
N
Q
 
A
K
 
Y
A
x
G
V
x
F
-
x
V
-
 
T
K
 
G
L
 
I
A
 
E
S
 
D
D
 
H
G
 
G
L
 
D
F
 
Y
E
 
K
L
 
K
E
 
I
L
 
I
A
 
T
S
 
E
G
 
D
A
 
D
K
 
E
L
 
F
R
 
I
S
 
T
R
 
K
T
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
R
 
N
W
 
H
R
 
R
E
 
K
M
 
L
N
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
E
 
E
Y
 
Y
R
 
G
G
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
S
Y
 
Y
C
|
C
P
 
A
H
 
V
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
A
L
 
F
F
 
F
K
 
R
G
 
N
K
 
Q
R
 
E
V
 
I
A
 
L
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
G
 
A
I
 
V
E
|
E
A
x
E
A
 
A
I
 
L
D
 
Y
L
 
L
A
 
T
N
 
R
I
 
F
V
 
G
E
 
Q
H
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
I
L
x
M
E
x
H
F
x
R
D
x
R
S
 
D
K
 
K
L
 
L
R
|
R
A
 
A
D
 
Q
D
 
E
V
 
I
L
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
F
S
 
K
M
 
E
G
 
E
N
 
K
I
 
I
K
 
N
I
 
F
I
 
I
T
 
W
Q
 
D
A
x
S
M
x
V
T
x
P
T
 
M
E
 
E
V
 
I
T
 
K
G
 
G
D
 
D
G
 
D
T
 
K
R
 
K
V
 
I
N
 
Q
G
 
S
L
 
V
N
 
V
Y
 
Y
T
 
K
D
 
N
R
 
V
A
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
V
H
 
T
H
 
E
I
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
I
Q
x
Y
I
x
V
G
|
G
L
|
L
V
 
D
P
 
P
N
x
V
A
 
A
E
 
E
W
x
F
L
 
V
K
 
S
G
 
D
T
 
L
V
 
G
D
 
I
L
 
T
T
 
D
P
 
E
R
 
A
G
 
G
E
 
W
I
 
I
I
 
I
V
 
T
D
 
D
E
 
D
R
 
H
G
 
M
Q
 
R
T
 
T
S
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
R
N
 
Q
S
 
K
P
 
D
Y
 
F
K
x
R
Q
|
Q
I
|
I
I
 
T
I
 
T
A
|
A
M
 
V
G
 
G
S
 
D
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
A
 
A
S
 
A
L
 
Q
G
 
E
A
 
A
F
 
Y
D
 
K
Y
 
F
L
 
V
I
 
V

P9WHH1 Thioredoxin reductase; TR; TRXR; EC 1.8.1.9 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
35% identity, 59% coverage: 212:523/527 of query aligns to 16:328/335 of P9WHH1

query
sites
P9WHH1
E
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
L
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
T
 
P
G
 
L
I
 
V
V
 
F
-
x
E
A
x
G
D
x
T
K
x
S
F
|
F
G
|
G
G
|
G
Q
x
A
V
 
L
A
 
M
E
 
T
T
 
T
V
 
T
G
 
D
I
 
V
E
 
E
N
|
N
F
 
Y
I
 
P
S
 
G
V
 
F
K
 
R
-
 
N
A
 
G
T
 
I
E
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
E
L
 
L
V
 
M
A
 
D
N
 
E
L
 
M
E
 
R
A
 
E
H
 
Q
V
 
A
R
 
L
D
 
R
Y
 
F
E
 
G
V
 
A
D
 
D
I
 
L
-
 
R
M
 
M
D
 
E
N
 
D
Q
x
V
K
 
E
A
 
S
V
 
V
K
 
S
L
 
L
A
 
H
S
 
G
D
 
P
G
 
-
L
 
L
F
 
K
E
 
S
L
 
V
E
 
V
L
 
T
A
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
K
 
T
L
 
H
R
 
R
S
 
A
R
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
A
W
 
A
R
 
R
E
 
Y
M
 
L
N
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Y
 
L
R
 
L
G
 
G
K
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
S
Y
 
S
C
|
C
P
 
A
H
 
T
C
|
C
D
 
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
F
 
F
K
 
R
G
 
D
K
 
Q
R
 
D
V
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
|
S
G
 
A
I
 
M
E
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
T
D
 
F
L
 
L
A
 
T
N
 
R
I
 
F
V
 
A
E
 
R
H
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
V
E
x
H
F
 
R
D
 
R
S
 
D
K
 
E
L
 
F
R
|
R
A
 
A
D
 
S
D
 
K
V
 
I
L
 
M
Q
 
L
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
R
S
 
N
M
 
N
G
 
D
N
 
K
I
 
I
K
 
R
I
 
F
I
 
L
T
 
T
Q
 
N
A
 
H
M
 
T
T
 
V
T
 
V
E
 
A
V
 
V
T
 
D
G
 
G
D
 
D
G
 
-
T
 
T
R
 
T
V
 
V
N
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
R
Y
 
V
T
 
R
D
 
D
R
 
T
A
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
A
S
 
E
H
 
T
H
 
T
I
 
L
A
 
P
L
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
V
Q
 
A
I
|
I
G
 
G
L
 
H
V
 
E
P
 
P
N
 
R
A
 
S
E
 
G
W
 
L
L
 
V
K
 
R
G
 
E
T
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
V
T
 
D
P
 
P
R
 
D
G
 
G
E
x
Y
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
Q
E
 
G
R
 
R
-
 
T
G
 
T
Q
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
L
T
 
V
N
 
D
S
 
R
P
 
T
Y
 
Y
K
x
R
Q
|
Q
I
x
A
I
x
V
I
 
T
A
 
A
M
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
C
N
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
I
G
 
D
A
 
A
F
 
E
D
 
R
Y
 
W
L
 
L
I
 
A
R
 
E
H
 
H
S
 
A
D
 
-
D
 
A
S
 
T
T
 
G
E
 
E
T
 
A
K
 
D
T
 
S
T
 
T
D
 
D

2a87A Crystal structure of m. Tuberculosis thioredoxin reductase (see paper)
36% identity, 57% coverage: 212:513/527 of query aligns to 7:310/313 of 2a87A

query
sites
2a87A
E
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
V
x
I
G
|
G
G
x
S
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
A
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
T
 
P
G
 
L
I
 
V
V
x
F
-
x
E
A
x
G
D
 
T
K
x
S
F
|
F
G
|
G
G
|
G
Q
x
A
V
x
L
A
 
M
E
 
T
T
|
T
V
 
T
G
x
D
I
x
V
E
 
E
N
|
N
F
x
Y
I
 
P
S
 
G
V
 
F
K
 
R
-
 
N
A
 
G
T
 
I
E
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
E
L
 
L
V
 
M
A
 
D
N
 
E
L
 
M
E
 
R
A
 
E
H
 
Q
V
 
A
R
 
L
D
 
R
Y
 
F
E
 
G
V
 
A
D
 
D
I
 
L
-
 
R
M
 
M
D
x
E
N
x
D
Q
x
V
K
 
E
A
 
S
V
 
V
K
 
S
L
 
L
A
 
H
S
 
G
D
 
P
G
 
-
L
 
L
F
 
K
E
 
S
L
 
V
E
 
V
L
 
T
A
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
Q
K
 
T
L
 
H
R
 
R
S
 
A
R
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
I
L
 
L
A
|
A
T
x
M
G
|
G
A
 
A
R
 
A
W
 
A
R
|
R
E
 
Y
M
x
L
N
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
Y
 
L
R
 
L
G
 
G
K
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
S
Y
 
S
C
|
C
P
 
A
H
 
T
C
|
C
D
|
D
G
 
G
P
 
F
L
 
F
F
 
F
K
 
R
G
 
D
K
 
Q
R
 
D
V
 
I
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
N
x
D
S
|
S
G
 
A
I
 
M
E
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
T
D
 
F
L
 
L
A
 
T
N
 
R
I
 
F
V
 
A
E
 
R
H
 
S
V
 
V
T
 
T
V
 
L
L
 
V
E
x
H
F
x
R
D
x
R
S
 
D
K
 
E
L
 
F
R
|
R
A
 
A
D
 
S
D
 
K
V
 
I
L
 
M
Q
 
L
R
 
D
K
 
R
A
 
A
A
 
R
S
 
N
M
 
N
G
 
D
N
 
K
I
 
I
K
 
R
I
 
F
I
 
L
T
 
T
Q
 
N
A
 
H
M
x
T
T
 
V
T
 
V
E
 
A
V
 
V
T
 
D
G
 
G
D
 
D
G
 
-
T
 
T
R
 
T
V
 
V
N
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
R
Y
 
V
T
 
R
D
 
D
R
 
T
A
 
N
T
 
T
G
 
G
E
 
A
S
 
E
H
 
T
H
 
T
I
 
L
A
 
P
L
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
V
Q
 
A
I
|
I
G
|
G
L
x
H
V
 
E
P
 
P
N
x
R
A
 
S
E
 
G
W
 
L
L
 
V
K
 
R
G
 
E
T
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
V
T
 
D
P
 
P
R
x
D
G
 
G
E
x
Y
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
Q
E
 
G
R
 
R
-
 
T
G
 
T
Q
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
L
T
 
V
N
 
D
S
x
R
P
 
T
Y
 
Y
K
x
R
Q
|
Q
I
x
A
I
x
V
I
 
T
A
|
A
M
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
C
N
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
I
G
 
D
A
 
A
F
 
E
D
 
R
Y
 
W
L
 
L
I
 
A
R
 
E
H
 
H
S
 
A

7aawA Thioredoxin reductase from bacillus cereus (see paper)
32% identity, 58% coverage: 205:509/527 of query aligns to 1:305/315 of 7aawA

query
sites
7aawA
L
 
V
S
 
S
Q
 
E
K
 
E
A
 
K
P
 
I
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
V
x
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
T
A
 
S
R
|
R
K
 
A
G