SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 200476 FitnessBrowser__MR1:200476 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
45% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 5:305/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
G
 
G
S
 
Q
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
D
 
T
L
 
K
D
 
D
S
 
Q
I
 
M
Q
 
S
T
 
H
I
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
T
M
 
L
M
 
R
P
 
M
Y
 
M
A
 
V
L
 
Q
R
 
K
E
 
E
K
 
R
R
 
S
T
 
L
K
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
A
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
M
 
-
A
 
A
S
 
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
T
L
 
M
S
 
S
T
 
C
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
H
S
 
C
R
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
V
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
T
M
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
N
 
-
I
 
V
S
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
P
E
 
S
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
V
 
V
I
 
R
S
 
A
D
 
F
I
 
V
E
 
A
N
 
S
A
 
R
G
 
G
H
 
T
S
 
K
I
 
Q
K
 
E
I
 
E
T
 
F
D
 
E
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
A
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
S
Q
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
C
R
 
F
G
 
G
K
 
Q
F
 
F
R
 
I
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
I
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
43% identity, 93% coverage: 4:319/339 of query aligns to 2:306/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
F
 
W
E
 
K
G
 
G
S
 
R
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
R
Q
 
D
L
 
F
D
 
S
L
 
K
D
 
E
S
 
D
I
 
I
Q
 
E
T
 
T
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
E
R
 
R
M
 
L
M
 
-
P
 
E
Y
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
E
K
 
K
-
 
G
R
 
Q
T
 
L
K
 
E
V
 
Y
L
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
A
V
 
V
R
 
I
E
 
G
T
 
F
T
 
A
G
 
E
M
 
A
A
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
R
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
K
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
Q
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
V
M
 
I
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
K
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
V
S
 
A
R
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
L
H
 
K
I
 
I
A
 
G
M
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
C
 
T
M
 
F
Y
 
Y
K
 
-
N
 
D
I
 
V
S
 
E
F
 
L
T
 
Y
L
 
L
I
 
I
S
 
S
P
 
P
T
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
R
Y
 
H
V
 
I
I
 
V
S
 
E
D
 
E
I
 
L
E
 
R
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
M
S
 
K
I
 
V
K
 
V
I
 
E
T
 
T
D
 
T
Q
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
D
H
 
V
L
 
I
D
 
G
K
 
K
A
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
S
 
D
Q
 
E
E
 
Q
E
 
E
A
 
Y
N
 
L
K
 
K
Y
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
S
F
 
Y
R
 
Q
L
 
V
N
 
N
R
 
L
S
 
K
I
 
V
Y
 
L
T
 
-
Q
 
E
H
 
K
C
 
A
K
 
K
S
 
D
N
 
E
T
 
L
V
 
R
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
H
N
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
N
H
 
T
P
 
K
N
 
H
L
 
A
A
 
I
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
V
D
 
F
N
 
N
G
|
G
L
 
V
L
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
44% identity, 94% coverage: 1:318/339 of query aligns to 1918:2223/2225 of P27708

query
sites
P27708
M
x
L
N
x
H
Q
x
S
F
x
L
E
x
V
G
|
G
S
x
Q
H
|
H
I
|
I
L
|
L
S
|
S
V
|
V
N
x
Q
Q
|
Q
L
x
F
D
x
T
L
x
K
D
|
D
S
x
Q
I
x
M
Q
x
S
T
x
H
I
x
L
F
|
F
N
|
N
V
|
V
A
|
A
H
|
H
R
x
T
M
x
L
M
x
R
P
x
M
Y
x
M
A
x
V
L
x
Q
R
x
K
E
|
E
K
x
R
R
x
S
T
x
L
K
x
D
V
x
I
L
|
L
E
x
K
G
|
G
A
x
K
I
x
V
L
x
M
G
x
A
N
x
S
L
x
M
F
|
F
F
x
Y
E
|
E
P
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
V
x
S
S
|
S
F
|
F
G
x
A
C
x
A
A
|
A
F
x
M
N
x
A
L
x
R
L
|
L
G
|
G
G
|
G
H
x
A
V
|
V
R
x
L
E
x
S
T
x
F
T
x
S
G
 
-
M
x
E
A
|
A
S
x
T
S
|
S
S
|
S
L
x
V
S
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
L
|
L
Y
x
A
D
|
D
T
x
S
A
x
V
R
x
Q
V
x
T
L
x
M
S
|
S
T
x
C
Y
|
Y
S
x
A
D
|
D
V
|
V
I
x
V
A
x
V
M
x
L
R
|
R
H
|
H
P
|
P
D
x
Q
S
x
P
Y
x
G
S
x
A
V
|
V
K
x
E
E
x
L
F
x
A
A
|
A
E
x
K
G
x
H
S
x
C
R
|
R
V
x
R
P
|
P
V
|
V
I
|
I
N
|
N
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
x
V
N
x
G
E
|
E
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
A
|
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
L
x
I
F
|
F
T
|
T
I
|
I
Q
x
R
K
x
E
E
|
E
L
|
L
G
|
G
H
x
T
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
x
V
D
x
N
G
|
G
M
|
M
H
x
T
I
|
I
A
x
T
M
|
M
V
|
V
G
|
G
D
|
D
L
|
L
K
|
K
F
x
H
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
|
V
H
|
H
S
|
S
L
|
L
S
x
A
R
x
C
L
|
L
L
|
L
C
x
T
M
x
Q
Y
|
Y
K
x
R
N
 
-
I
x
V
S
|
S
F
x
L
T
x
R
L
x
Y
I
x
V
S
x
A
P
|
P
T
x
P
E
x
S
L
|
L
A
x
R
M
|
M
P
|
P
D
x
P
Y
x
T
V
|
V
I
x
R
S
x
A
D
x
F
I
x
V
E
x
A
N
x
S
A
x
R
G
|
G
H
x
T
S
x
K
I
x
Q
K
x
E
I
x
E
T
x
F
D
x
E
Q
x
S
L
x
I
E
|
E
G
x
E
H
x
A
L
|
L
D
x
P
K
x
D
A
x
T
D
|
D
I
x
V
L
|
L
Y
|
Y
L
x
M
T
|
T
R
|
R
I
|
I
Q
|
Q
E
x
K
E
|
E
R
|
R
F
|
F
P
x
G
S
|
S
Q
x
T
E
x
Q
E
|
E
A
x
Y
N
x
E
K
x
A
Y
x
C
R
x
F
G
|
G
K
x
Q
F
|
F
R
x
I
L
|
L
N
x
T
R
x
P
S
x
H
I
|
I
Y
x
M
T
|
T
Q
x
R
H
 
-
C
x
A
K
|
K
S
x
K
N
x
K
T
x
M
V
|
V
I
x
V
M
|
M
H
|
H
P
|
P
L
x
M
P
|
P
R
|
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
x
V
N
|
N
E
|
E
L
x
I
D
x
S
N
x
V
D
x
E
L
x
V
N
x
D
S
|
S
H
x
D
P
|
P
N
x
R
L
x
A
A
|
A
I
x
Y
F
|
F
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
D
x
E
N
|
N
G
|
G
L
x
M
L
x
Y
I
|
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
L
|
L
F
x
L
A
|
A
L
x
T
T
x
V
L
|
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
44% identity, 94% coverage: 1:318/339 of query aligns to 1918:2223/2225 of P08955

query
sites
P08955
M
 
L
N
 
H
Q
 
S
F
 
L
E
 
V
G
 
G
S
 
Q
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
D
 
T
L
 
K
D
 
D
S
 
Q
I
 
M
Q
 
S
T
 
H
I
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
T
M
 
L
M
 
R
P
 
M
Y
 
M
A
 
V
L
 
Q
R
 
K
E
 
E
K
 
R
R
 
S
T
 
L
K
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
A
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
-
M
 
E
A
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
T
L
 
M
S
 
S
T
 
C
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
H
S
 
C
R
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
T
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
T
M
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
N
 
-
I
 
V
S
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
P
E
 
S
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
S
V
 
V
I
 
W
S
 
D
D
 
F
I
 
V
E
 
A
N
 
S
A
 
R
G
 
G
H
 
T
S
 
K
I
 
Q
K
 
E
I
 
E
T
 
F
D
 
E
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
A
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
S
Q
 
T
E
 
Q
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
C
R
 
F
G
 
G
K
 
Q
F
 
F
R
 
I
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
I
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P20054 Multifunctional protein pyr1-3; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
43% identity, 94% coverage: 2:318/339 of query aligns to 1918:2222/2225 of P20054

query
sites
P20054
N
 
N
Q
 
S
F
 
L
E
 
A
G
 
G
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
F
S
 
S
V
 
V
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
D
 
N
L
 
R
D
 
K
S
 
Q
I
 
L
Q
 
H
T
 
A
I
 
L
F
 
F
N
 
G
V
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
E
M
 
M
M
 
R
P
 
I
Y
 
L
A
 
V
L
 
K
R
 
R
E
 
S
K
 
G
R
 
G
T
 
S
K
 
D
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
T
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
-
T
 
T
T
 
V
G
 
D
M
 
N
A
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
I
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
Q
V
 
T
L
 
L
S
 
E
T
 
S
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
V
 
A
I
 
V
A
 
C
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
A
S
 
V
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
E
E
 
S
F
 
A
A
 
I
E
 
Q
G
 
V
S
 
A
R
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
T
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
A
M
 
N
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
-
I
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
N
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
S
E
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
P
D
 
T
Y
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
K
D
 
E
I
 
L
E
 
N
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
E
I
 
Q
K
 
K
I
 
E
T
 
Y
D
 
T
Q
 
N
L
 
I
E
 
E
G
 
S
H
 
I
L
 
L
D
 
P
K
 
T
A
 
T
D
 
N
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
Q
S
 
S
Q
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
V
R
 
K
G
 
D
K
 
S
F
 
F
R
 
I
L
 
I
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
T
Y
 
L
T
 
T
Q
 
K
H
 
-
C
 
A
K
 
S
S
 
D
N
 
N
T
 
M
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P07259 Multifunctional protein URA2; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
43% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 1906:2213/2214 of P07259

query
sites
P07259
N
 
N
Q
 
P
F
 
F
E
 
R
G
 
G
S
 
R
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
D
 
K
L
 
R
D
 
S
S
 
D
I
 
F
Q
 
H
T
 
V
I
 
L
F
 
F
N
 
A
V
 
V
A
 
A
H
 
Q
R
 
E
M
 
L
M
 
R
P
 
A
Y
 
A
A
 
V
L
 
A
R
 
R
E
 
E
K
 
G
R
 
V
T
 
L
K
 
D
V
 
L
L
 
M
E
 
K
G
 
G
A
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
T
N
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
C
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
I
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
E
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
R
V
 
I
R
 
V
E
 
N
T
 
V
T
 
N
G
 
P
M
 
L
A
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
-
L
 
V
S
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
S
 
A
T
 
C
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
S
D
 
E
S
 
E
Y
 
M
S
 
S
V
 
V
K
 
H
E
 
I
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
Y
S
 
S
R
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
S
 
S
N
 
R
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
 
T
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
I
H
 
T
I
 
V
A
 
T
M
 
F
V
 
M
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
C
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
M
M
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
-
I
 
V
S
 
R
F
 
I
T
 
N
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
G
V
 
L
I
 
R
S
 
E
D
 
E
I
 
L
E
 
R
N
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
V
H
 
E
S
 
S
I
 
I
K
 
E
I
 
L
T
 
T
D
 
P
Q
 
H
L
 
I
E
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
I
D
 
S
K
 
K
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
N
S
 
S
Q
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
Y
N
 
A
K
 
R
Y
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
T
F
 
Y
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
N
S
 
K
I
 
I
Y
 
L
T
 
A
Q
 
-
H
 
H
C
 
A
K
 
K
S
 
E
N
 
N
T
 
M
V
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
K
N
 
E
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
Y
H
 
D
P
 
H
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
F
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
V
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
43% identity, 91% coverage: 7:313/339 of query aligns to 2:296/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
S
 
K
H
 
H
I
 
L
L
 
I
S
 
S
V
 
M
N
 
K
Q
 
D
L
 
I
D
 
G
L
 
K
D
 
E
S
 
E
I
 
I
Q
 
L
T
 
E
I
 
I
F
 
L
N
 
D
V
 
E
A
 
A
H
 
R
R
 
K
M
 
M
M
 
E
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
L
 
N
R
 
T
E
 
K
K
 
R
R
 
P
T
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
T
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
E
V
 
V
R
 
I
E
 
T
T
 
M
T
 
T
G
 
D
M
 
L
A
 
K
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
G
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
E
G
 
Y
S
 
S
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
M
K
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
K
I
 
I
A
 
A
M
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
V
R
 
Y
L
 
A
L
 
L
C
 
S
M
 
L
Y
 
F
K
 
E
N
 
N
I
 
V
S
 
E
F
 
M
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
K
Y
 
D
V
 
I
I
 
I
S
 
E
D
 
D
I
 
L
E
 
K
N
 
A
A
 
K
G
 
N
H
 
I
S
 
K
I
 
F
K
 
Y
I
 
E
T
 
K
D
 
E
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
D
H
 
L
L
 
D
D
 
D
K
 
D
A
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
S
 
D
Q
 
P
E
 
N
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
S
F
 
Y
R
 
K
L
 
I
N
 
K
R
 
R
S
 
E
I
 
-
Y
 
Y
T
 
V
Q
 
E
H
 
G
C
 
K
K
 
K
S
 
-
N
 
-
T
 
F
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
D
N
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
D
H
 
L
P
 
P
N
 
Q
L
 
A
A
 
K
I
 
Y
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
A
 
S
D
 
F
N
 
Y
G
|
G
L
 
I
L
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
I
F
 
L

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
44% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 2:290/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
G
 
G
S
 
Q
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
D
 
T
L
 
K
D
 
D
S
 
Q
I
 
M
Q
 
S
T
 
H
I
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
T
M
 
L
M
 
R
P
 
M
Y
 
M
A
 
V
L
 
Q
R
 
K
E
 
E
K
 
R
R
 
S
T
 
L
K
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
A
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
A
V
 
V
R
 
L
E
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
M
 
-
A
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
T
L
 
M
S
 
S
T
 
C
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
H
S
 
C
R
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
V
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
T
M
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
N
 
-
I
 
V
S
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
P
E
 
S
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
V
 
V
I
 
R
S
 
A
D
 
F
I
 
V
E
 
A
N
 
S
A
 
-
G
 
G
H
 
T
S
 
K
I
 
Q
K
 
E
I
 
E
T
 
F
D
 
E
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
A
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
Q
F
 
F
R
 
I
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
I
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G

Q09794 Multifunctional protein ura1; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
44% identity, 93% coverage: 4:318/339 of query aligns to 1934:2238/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
F
 
F
E
 
Y
G
 
R
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
H
Q
 
Q
L
 
V
D
 
T
L
 
R
D
 
S
S
 
D
I
 
L
Q
 
H
T
 
V
I
 
L
F
 
F
N
 
A
V
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
Q
M
 
M
M
 
R
P
 
I
Y
 
I
A
 
V
L
 
E
R
 
R
E
 
Q
K
 
G
R
 
V
T
 
I
K
 
D
V
 
L
L
 
C
E
 
Y
G
 
G
A
 
K
I
 
L
L
 
L
G
 
C
N
 
T
L
 
M
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
D
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
K
V
 
V
R
 
V
E
 
A
T
 
V
T
 
T
G
 
A
M
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
S
S
 
-
L
 
V
S
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
S
 
G
T
 
C
Y
 
Y
S
 
G
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
I
Y
 
E
S
 
S
V
 
A
K
 
R
E
 
I
F
 
A
A
 
A
E
 
N
G
 
F
S
 
S
R
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
S
 
S
N
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
S
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
A
M
 
F
Y
 
W
K
 
-
N
 
H
I
 
V
S
 
E
F
 
L
T
 
H
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
M
 
L
P
 
P
D
 
D
Y
 
D
V
 
V
I
 
K
S
 
D
D
 
D
I
 
I
E
 
R
N
 
A
A
 
N
G
 
G
-
 
L
H
 
N
S
 
F
I
 
I
K
 
E
I
 
H
T
 
R
D
 
E
Q
 
L
L
 
T
E
 
K
G
 
E
H
 
V
L
 
V
D
 
A
K
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
A
S
 
S
Q
 
V
E
 
D
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
S
F
 
F
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
N
S
 
S
I
 
V
Y
 
L
T
 
A
Q
 
S
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
S
N
 
H
T
 
C
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
-
R
 
R
A
 
E
Q
 
I
A
 
S
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
F
D
 
D
L
 
-
N
 
-
S
 
-
H
 
Q
P
 
R
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
R
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
C
T
 
V
L
 
M
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
42% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 1917:2218/2224 of P05990

query
sites
P05990
G
 
G
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
V
N
 
D
Q
 
M
L
 
F
D
 
N
L
 
K
D
 
D
S
 
H
I
 
L
Q
 
N
T
 
D
I
 
I
F
 
F
N
 
N
V
 
L
A
 
A
H
 
Q
R
 
L
M
 
L
M
 
K
P
 
L
Y
 
R
A
 
G
L
 
T
R
 
K
E
 
D
K
 
R
R
 
P
T
 
V
-
 
D
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
L
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
R
V
 
V
R
 
I
E
 
S
T
 
M
T
 
D
G
 
N
M
 
I
A
 
-
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
S
A
 
I
R
 
K
V
 
V
L
 
V
S
 
S
T
 
S
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
S
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
T
G
 
F
S
 
S
R
 
R
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
F
G
 
G
H
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
T
M
 
L
Y
 
Y
K
 
-
N
 
N
I
 
V
S
 
N
F
 
L
T
 
Q
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
T
 
N
E
 
S
L
 
L
A
 
Q
M
 
M
P
 
P
D
 
D
Y
 
E
V
 
V
I
 
V
S
 
Q
D
 
F
I
 
V
E
 
H
N
 
Q
A
 
R
G
 
G
H
 
V
S
 
K
I
 
Q
K
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
R
Q
 
D
L
 
L
E
 
K
G
 
N
H
 
V
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
D
S
 
N
Q
 
V
E
 
E
E
 
D
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
C
R
 
C
G
 
G
K
 
H
F
 
L
R
 
V
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
E
I
 
-
Y
 
H
T
 
M
Q
 
M
H
 
R
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
R
T
 
S
V
 
I
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
R
D
 
E
L
 
I
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
Y
G
 
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
V
L
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8bplA Aspartate transcarbamoylase mutant (n2045c, r2238c) from chaetomium thermophilum cad-like bound to carbamoyl phosphate (see paper)
43% identity, 93% coverage: 2:317/339 of query aligns to 11:315/316 of 8bplA

query
sites
8bplA
N
 
S
Q
 
S
F
 
F
E
 
K
G
 
K
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
T
Q
 
Q
L
 
F
D
 
T
L
 
R
D
 
A
S
 
D
I
 
L
Q
 
H
T
 
L
I
 
L
F
 
F
N
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
Q
R
 
E
M
 
M
M
 
R
P
 
L
Y
 
G
A
 
V
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
K
 
G
R
 
V
T
 
L
K
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
C
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
A
S
 
S
F
 
F
G
 
D
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
R
V
 
T
R
 
I
E
 
P
T
 
I
T
 
Q
G
 
-
M
 
T
A
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
A
 
L
R
 
R
V
 
T
L
 
L
S
 
A
T
 
C
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
E
Y
 
K
S
 
C
V
 
V
K
 
D
E
 
V
F
 
A
A
 
K
E
 
K
G
 
Y
S
 
C
R
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
S
 
S
N
 
K
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
T
I
 
M
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
L
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
V
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
R
M
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
-
I
 
V
S
 
K
F
 
V
T
 
Q
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
P
Y
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
Q
D
 
Q
I
 
L
E
 
V
N
 
D
A
 
A
G
 
G
H
 
Q
S
 
L
I
 
L
K
 
C
I
 
E
T
 
S
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
E
 
T
G
 
P
H
 
E
-
 
I
L
 
L
D
 
G
K
 
R
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
S
 
S
Q
 
L
E
 
A
E
 
E
A
 
F
N
 
E
K
 
A
Y
 
V
R
 
K
G
 
D
K
 
S
F
 
Y
R
 
R
L
 
I
N
 
D
R
 
Y
S
 
S
I
 
T
Y
 
L
T
 
-
Q
 
K
H
 
Y
C
 
A
K
 
K
S
 
P
N
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
E
R
 
E
A
 
V
Q
 
-
A
 
A
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
F
D
 
D
L
 
Q
N
 
R
S
 
A
H
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
C
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
C
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
M

2at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral ph (see paper)
40% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 2:307/310 of 2at1A

query
sites
2at1A
N
 
N
Q
 
P
F
 
L
E
 
Y
G
 
Q
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
R
D
 
D
S
 
D
I
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
K
M
 
L
M
 
K
P
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
N
K
 
P
R
 
Q
T
 
P
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
Q
C
 
T
A
 
S
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
M
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
T
L
 
E
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
L
H
 
H
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
D
N
 
G
I
 
N
S
 
R
F
 
F
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
D
D
 
M
I
 
L
E
 
D
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
A
I
 
W
K
 
S
I
 
L
T
 
H
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
V
L
 
M
D
 
A
K
 
E
A
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
D
S
 
P
Q
 
S
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
N
 
N
K
 
-
Y
 
V
R
 
K
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
R
 
V
L
 
L
N
 
-
R
 
R
S
 
A
I
 
S
Y
 
D
T
 
L
Q
 
H
H
 
N
C
 
A
K
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
M
V
 
K
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
A
N
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
K
H
 
T
P
 
P
N
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
L
 
I
L
 
F
I
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
N
V
 
R
D
 
D

1at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral p H (see paper)
40% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 2:307/310 of 1at1A

query
sites
1at1A
N
 
N
Q
 
P
F
 
L
E
 
Y
G
 
Q
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
R
D
 
D
S
 
D
I
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
K
M
 
L
M
 
K
P
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
N
K
 
P
R
 
Q
T
 
P
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
Q
C
 
T
A
 
S
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
M
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
E
 
T
L
 
E
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
L
H
 
H
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
D
N
 
G
I
 
N
S
 
R
F
 
F
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
D
D
 
M
I
 
L
E
 
D
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
A
I
 
W
K
 
S
I
 
L
T
 
H
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
V
L
 
M
D
 
A
K
 
E
A
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
D
S
 
P
Q
 
S
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
N
 
N
K
 
-
Y
 
V
R
 
K
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
R
 
V
L
 
L
N
 
-
R
 
R
S
 
A
I
 
S
Y
 
D
T
 
L
Q
 
H
H
 
N
C
 
A
K
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
M
V
 
K
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
A
N
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
K
H
 
T
P
 
P
N
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
L
 
I
L
 
F
I
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
N
V
 
R
D
 
D

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
41% identity, 93% coverage: 4:317/339 of query aligns to 4:309/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
F
 
F
E
 
E
G
 
L
S
 
S
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
D
 
D
L
 
R
D
 
E
S
 
M
I
 
L
Q
 
S
T
 
A
I
 
I
F
 
F
N
 
D
V
 
V
A
 
A
H
 
R
R
 
E
M
 
M
M
 
E
P
 
K
Y
 
I
A
 
E
L
 
K
R
 
S
E
 
S
K
 
S
R
 
Q
T
 
S
K
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
E
V
 
V
R
 
L
E
 
T
T
 
T
T
 
E
G
 
N
M
 
A
A
 
R
S
 
E
-
 
F
S
 
S
S
|
S
L
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
S
 
S
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
S
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
F
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
I
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
E
E
 
I
L
 
V
A
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
I
 
K
S
 
D
D
 
Y
I
 
L
E
 
T
N
 
S
A
 
S
G
 
G
H
 
V
S
 
E
I
 
W
K
 
E
I
 
E
T
 
S
D
 
S
Q
 
D
L
 
L
E
 
M
G
 
E
H
 
V
L
 
A
D
 
S
K
 
K
A
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
Q
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
E
Q
 
R
E
 
L
E
 
D
A
 
L
-
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
F
 
F
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
K
S
 
D
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
Q
 
V
H
 
M
C
 
Q
K
 
K
S
 
-
N
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
T
N
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
A
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
L
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
L
L
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
41% identity, 93% coverage: 4:317/339 of query aligns to 4:309/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
F
 
F
E
 
E
G
 
L
S
 
S
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
D
 
D
L
 
R
D
 
E
S
 
M
I
 
L
Q
 
S
T
 
A
I
 
I
F
 
F
N
 
D
V
 
V
A
 
A
H
 
R
R
 
E
M
 
M
M
 
E
P
 
K
Y
 
I
A
 
E
L
 
K
R
 
S
E
 
S
K
 
S
R
 
Q
T
 
S
K
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
E
V
 
V
R
 
L
E
 
T
T
 
T
T
 
E
G
 
N
M
 
A
A
 
R
S
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
S
 
S
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
S
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
F
 
N
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
I
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
E
E
 
I
L
 
V
A
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
I
 
K
S
 
D
D
 
Y
I
 
L
E
 
T
N
 
S
A
 
S
G
 
G
H
 
V
S
 
E
I
 
W
K
 
E
I
 
E
T
 
S
D
 
S
Q
 
D
L
 
L
E
 
M
G
 
E
H
 
V
L
 
A
D
 
S
K
 
K
A
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
Q
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
E
Q
 
R
E
 
L
E
 
D
A
 
L
-
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
F
 
F
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
K
S
 
D
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
Q
 
V
H
 
M
C
 
Q
K
 
K
S
 
-
N
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
|
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
T
N
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
A
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
L
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
L
L
 
L

2hseA Structure of d236a e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-aspartate at 2.60 a resolution
40% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 2:307/310 of 2hseA

query
sites
2hseA
N
 
N
Q
 
P
F
 
L
E
 
Y
G
 
Q
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
R
D
 
D
S
 
D
I
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
K
M
 
L
M
 
K
P
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
N
K
 
P
R
 
Q
T
 
P
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
|
S
F
 
F
G
 
E
C
 
T
A
 
S
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
M
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
E
E
 
T
L
 
Q
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
L
H
 
H
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
D
N
 
G
I
 
N
S
 
R
F
 
F
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
D
D
 
M
I
 
L
E
 
D
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
A
I
 
W
K
 
S
I
 
L
T
 
H
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
V
L
 
M
D
 
A
K
 
E
A
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
A
S
 
P
Q
 
S
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
N
 
N
K
 
-
Y
 
V
R
 
K
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
R
 
V
L
 
L
N
 
-
R
 
R
S
 
A
I
 
S
Y
 
D
T
 
L
Q
 
H
H
 
N
C
 
A
K
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
M
V
 
K
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
A
N
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
K
H
 
T
P
 
P
N
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
|
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
L
 
I
L
 
F
I
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
N
V
 
R
D
 
D

2a0fA Structure of d236a mutant e. Coli aspartate transcarbamoylase in presence of phosphonoacetamide at 2.90 a resolution (see paper)
40% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 2:307/310 of 2a0fA

query
sites
2a0fA
N
 
N
Q
 
P
F
 
L
E
 
Y
G
 
Q
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
R
D
 
D
S
 
D
I
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
K
M
 
L
M
 
K
P
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
N
K
 
P
R
 
Q
T
 
P
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
T
A
 
S
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
M
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
E
E
 
T
L
 
Q
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
L
H
 
H
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
D
N
 
G
I
 
N
S
 
R
F
 
F
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
D
D
 
M
I
 
L
E
 
D
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
A
I
 
W
K
 
S
I
 
L
T
 
H
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
V
L
 
M
D
 
A
K
 
E
A
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
A
S
 
P
Q
 
S
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
N
 
N
K
 
-
Y
 
V
R
 
K
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
R
 
V
L
 
L
N
 
-
R
 
R
S
 
A
I
 
S
Y
 
D
T
 
L
Q
 
H
H
 
N
C
 
A
K
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
M
V
 
K
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
A
N
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
K
H
 
T
P
 
P
N
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
L
 
I
L
 
F
I
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
N
V
 
R
D
 
D

P0A786 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
40% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 3:308/311 of P0A786

query
sites
P0A786
N
 
N
Q
 
P
F
 
L
E
 
Y
G
 
Q
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
R
D
 
D
S
 
D
I
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
K
M
 
L
M
 
K
P
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
N
K
 
P
R
 
Q
T
 
P
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
T
A
 
S
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
M
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
E
E
 
T
L
 
Q
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
L
H
 
H
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
D
N
 
G
I
 
N
S
 
R
F
 
F
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
D
D
 
M
I
 
L
E
 
D
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
A
I
 
W
K
 
S
I
 
L
T
 
H
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
V
L
 
M
D
 
A
K
 
E
A
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
D
S
 
P
Q
 
S
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
N
 
N
K
 
-
Y
 
V
R
 
K
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
R
 
V
L
 
L
N
 
-
R
 
R
S
 
A
I
 
S
Y
 
D
T
 
L
Q
 
H
H
 
N
C
 
A
K
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
M
V
 
K
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
A
N
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
K
H
 
T
P
 
P
N
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
N
 
N
G
 
G
L
 
I
L
 
F
I
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
N
V
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
41% identity, 94% coverage: 1:317/339 of query aligns to 79:387/390 of P49077

query
sites
P49077
M
 
L
N
 
K
Q
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
L
S
 
S
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
D
 
D
L
 
R
D
 
E
S
 
M
I
 
L
Q
 
S
T
 
A
I
 
I
F
 
F
N
 
D
V
 
V
A
 
A
H
 
R
R
 
E
M
 
M
M
 
E
P
 
K
Y
 
I
A
 
E
L
 
K
R
 
S
E
 
S
K
 
S
R
 
Q
T
 
S
K
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
E
V
 
V
R
 
L
E
 
T
T
 
T
T
 
E
G
 
N
M
 
A
A
 
R
S
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
S
 
S
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
S
E
 
E
L
 
I
G
 
G
H
 
K
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
F
 
N
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
I
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
T
 
E
E
 
I
L
 
V
A
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
I
 
K
S
 
D
D
 
Y
I
 
L
E
 
T
N
 
S
A
 
S
G
 
G
H
 
V
S
 
E
I
 
W
K
 
E
I
 
E
T
 
S
D
 
S
Q
 
D
L
 
L
E
 
M
G
 
E
H
 
V
L
 
A
D
 
S
K
 
K
A
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
Q
T
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
-
S
 
-
Q
 
G
E
 
E
E
 
R
A
 
L
N
 
D
K
 
L
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
F
 
Y
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
K
S
 
D
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
Q
 
V
H
 
M
C
 
Q
K
 
K
S
 
-
N
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
T
N
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
A
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
L
L
 
L

2ipoA E. Coli aspartate transcarbamoylase complexed with n-phosphonacetyl-l- asparagine (see paper)
40% identity, 94% coverage: 2:320/339 of query aligns to 2:307/310 of 2ipoA

query
sites
2ipoA
N
 
N
Q
 
P
F
 
L
E
 
Y
G
 
Q
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
R
D
 
D
S
 
D
I
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
H
 
A
R
 
K
M
 
L
M
 
K
P
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
N
K
 
P
R
 
Q
T
 
P
K
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
I
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
T
A
 
S
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
H
 
S
V
 
V
R
 
V
E
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
M
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
T
S
 
S
L
 
L
-
 
G
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
S
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
S
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
K
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
F
S
 
S
-
 
G
R
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
E
E
 
T
L
 
Q
G
 
G
H
 
R
A
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
L
H
 
H
I
 
V
A
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
L
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
K
Y
 
F
K
 
D
N
 
G
I
 
N
S
 
R
F
 
F
T
 
Y
L
 
F
I
 
I
S
 
A
P
 
P
T
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
L
S
 
D
D
 
M
I
 
L
E
 
D
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
S
 
A
I
 
W
K
 
S
I
 
L
T
 
H
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
H
 
V
L
 
M
D
 
A
K
 
E
A
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
P
 
D
S
 
P
Q
 
S
E
 
E
E
 
Y
A
 
A
N
 
N
K
 
-
Y
 
V
R
 
K
G
 
A
K
 
Q
F
 
F
R
 
V
L
 
L
N
 
-
R
 
R
S
 
A
I
 
S
Y
 
D
T
 
L
Q
 
H
H
 
N
C
 
A
K
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
M
V
 
K
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
A
N
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
K
H
 
T
P
 
P
N
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
L
 
I
L
 
F
I
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
N
V
 
R
D
 
D

Query Sequence

>200476 FitnessBrowser__MR1:200476
MNQFEGSHILSVNQLDLDSIQTIFNVAHRMMPYALREKRTKVLEGAILGNLFFEPSTRTR
VSFGCAFNLLGGHVRETTGMASSSLSKGESLYDTARVLSTYSDVIAMRHPDSYSVKEFAE
GSRVPVINGGDGSNEHPTQALLDLFTIQKELGHASRGIDGMHIAMVGDLKFGRTVHSLSR
LLCMYKNISFTLISPTELAMPDYVISDIENAGHSIKITDQLEGHLDKADILYLTRIQEER
FPSQEEANKYRGKFRLNRSIYTQHCKSNTVIMHPLPRDSRAQANELDNDLNSHPNLAIFR
QADNGLLIRMALFALTLGVDSQLEKYECPVNWYSRKADR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory