SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 200848 FitnessBrowser__MR1:200848 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
H
 
R
N
 
V
F
 
F
A
 
M
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
V
x
F
D
 
N
Q
 
E
D
 
A
K
 
A
L
 
G
E
 
K
R
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
E
D
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
A
S
 
N
T
 
P
E
 
G
V
 
V
Q
 
V
G
 
F
Y
 
I
A
 
R
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
D
 
S
V
 
V
V
 
H
A
 
R
G
 
L
F
 
V
A
 
E
Y
 
N
I
 
V
L
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
V
 
S
K
|
K
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
M
S
 
T
F
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
P
A
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
Q
 
K
A
 
-
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
T
-
 
G
K
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
T
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
R
x
K
L
 
M
E
 
K
K
 
A
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
A
V
 
Y
R
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
-
 
S
-
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
M
L
 
M

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
43% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
H
 
L
N
 
E
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
L
 
V
A
 
V
L
 
A
I
 
W
D
|
D
V
x
L
D
 
A
Q
 
E
D
 
E
K
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
L
 
L
E
 
I
R
 
A
A
 
E
C
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
G
S
 
G
S
 
S
T
 
A
E
 
D
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
R
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
A
E
 
A
E
 
E
D
 
S
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
V
A
 
A
Y
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
V
N
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
G
 
G
M
 
Q
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
V
K
 
K
D
 
G
G
 
G
K
 
E
V
 
V
T
 
V
D
 
K
R
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
E
D
 
A
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
-
S
 
A
G
 
A
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
I
 
A
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
K
G
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
T
 
V
A
 
Q
A
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
E
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
M
E
 
V
K
 
A
L
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
R
T
 
A
V
 
Y
R
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
V
 
I
N
 
S
G
 
G
R
 
T
V
 
T
F
 
L
E
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 3:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
H
 
L
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
A
A
 
G
D
|
D
L
|
L
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
Y
S
 
S
S
 
H
T
 
P
E
 
N
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
Y
 
M
A
 
Y
L
|
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
E
 
V
E
 
T
D
 
G
V
 
V
V
 
E
A
 
K
G
 
F
F
 
Y
A
 
Q
Y
 
S
I
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
I
 
I
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
A
M
 
M
L
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
T
D
 
R
R
 
K
M
 
M
S
 
T
F
 
E
D
 
A
Q
 
Q
F
 
W
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
G
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
P
A
 
Q
M
 
M
I
 
Q
E
 
T
S
 
N
G
 
G
Q
 
Y
A
 
-
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
A
 
V
-
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
M
G
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
Y
 
K
-
 
G
-
 
A
N
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
Y
I
|
I
A
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
T
 
L
A
 
K
A
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
F
E
 
A
K
 
A
L
 
L
V
 
T
P
 
M
V
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
T
 
V
V
 
A
R
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
I
E
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
R
L
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
39% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
C
V
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
A
H
 
Q
N
 
L
F
 
M
A
 
A
Q
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
D
 
A
V
x
R
D
x
N
Q
 
L
D
 
E
K
 
G
L
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
-
T
 
-
E
 
D
V
 
H
Q
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
S
L
 
C
D
|
D
I
 
V
T
 
A
D
 
K
E
 
E
E
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
G
 
T
F
 
F
A
 
E
Y
 
E
I
x
L
L
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
E
Q
 
D
F
 
M
Q
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
L
N
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
T
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
S
 
Q
G
 
-
Q
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
L
 
I
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
N
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
M
 
F
S
 
S
V
 
R
G
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
Y
x
K
N
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
x
V
A
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
K
A
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
L
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
H
 
E
A
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
V
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
L
 
L

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 6:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
C
V
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
A
 
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
A
H
 
Q
N
 
L
F
 
M
A
 
A
Q
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
D
x
A
V
x
R
D
x
N
Q
 
L
D
 
E
K
 
G
L
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
-
T
 
-
E
 
D
V
 
H
Q
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
S
L
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
K
E
 
E
E
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
G
 
T
F
 
F
A
 
E
Y
 
E
I
 
L
L
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
E
Q
 
D
F
 
M
Q
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
L
N
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
T
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
S
 
Q
G
 
-
Q
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
L
 
I
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
|
Q
S
 
S
N
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
M
 
F
S
 
S
V
 
R
G
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
N
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
x
V
A
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
A
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
L
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
H
 
E
A
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
V
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
L
 
L

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
39% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
D
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
H
 
L
N
 
E
F
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
N
D
 
Y
V
x
A
D
x
S
Q
x
S
-
 
A
-
 
G
D
 
A
K
 
A
L
 
D
E
 
E
R
 
V
A
 
V
C
 
A
A
 
A
D
 
I
L
 
A
G
 
A
S
 
A
S
 
G
T
 
G
E
 
E
V
 
A
Q
 
F
G
 
A
Y
 
V
A
 
K
L
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
Q
E
 
E
E
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
L
N
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
M
 
L
L
 
L
V
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
F
 
R
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
L
N
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
I
M
 
M
I
 
L
E
 
K
S
 
Q
G
 
-
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
-
 
G
K
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
S
A
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
L
K
 
E
L
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
H
 
E
A
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
V
V
 
V
R
 
R
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
F
 
I
E
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
D
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
M
 
I
A
 
A
H
 
I
N
 
N
F
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
F
L
 
F
I
x
N
D
x
Y
V
x
N
D
x
G
Q
x
S
D
 
P
K
 
E
L
 
A
E
 
A
R
 
E
A
 
E
C
 
T
A
 
A
D
 
K
L
 
L
G
 
V
S
 
A
S
 
E
-
 
H
-
 
G
T
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
E
G
 
A
Y
 
M
A
 
K
L
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
E
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
D
A
 
A
G
 
F
F
 
F
A
 
K
Y
 
Q
I
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
V
 
M
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
F
 
E
D
 
D
Q
 
E
F
 
W
Q
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
M
E
 
K
S
 
Q
G
 
-
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
M
E
 
L
K
 
A
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
H
 
T
A
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
A
V
 
V
R
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
L
E
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
D
 
K
L
 
L
K
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
V
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
F
A
 
G
M
 
I
A
 
A
H
 
Q
N
 
V
F
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
I
 
A
D
|
D
V
x
R
D
 
D
Q
 
A
D
 
H
K
 
G
L
 
E
E
 
A
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
S
D
 
L
L
 
R
G
 
E
S
 
S
S
 
G
T
 
A
E
 
Q
V
 
A
Q
 
L
G
 
F
Y
 
I
A
 
S
L
x
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
E
 
K
E
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
L
F
 
F
A
 
S
Y
 
Q
I
 
A
L
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
P
I
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
A
M
 
M
L
 
L
V
 
H
K
 
K
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
L
S
 
T
F
 
E
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
T
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
M
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
R
M
 
M
I
 
R
E
 
E
S
 
R
G
 
G
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
S
K
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
N
 
G
I
 
V
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
|
T
A
 
R
A
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
R
 
I
L
 
M
E
 
V
K
 
S
L
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
H
 
E
A
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
T
 
C
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
V
L
 
L

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 4:236/240 of P73826

query
sites
P73826
M
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
V
H
 
K
N
 
L
F
 
L
A
 
Q
Q
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
T
D
 
D
V
 
L
D
 
A
Q
 
T
D
 
D
K
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
G
S
 
G
S
 
N
T
 
T
E
 
E
V
 
A
Q
 
L
G
 
G
Y
 
V
A
 
V
L
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
L
E
 
E
D
 
S
V
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
A
A
 
A
Y
 
E
I
 
I
L
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
K
 
P
I
 
V
N
 
Y
V
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
M
 
F
L
 
F
V
 
P
K
 
K
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
L
S
 
T
F
 
P
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
G
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
F
A
 
I
A
 
E
A
 
G
M
 
M
I
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
-
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
S
-
 
G
K
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
M
V
 
K
G
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
V
R
 
R
S
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
 
I
A
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
L
A
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
K
L
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
F
G
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
H
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
W
T
 
A
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
L
E
 
R
V
 
V
D
 
N
G
 
G

4o5oB X-ray crystal structure of a 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase from brucella suis
39% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 7:258/261 of 4o5oB

query
sites
4o5oB
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
K
 
E
D
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
F
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
G
 
S
G
|
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
S
H
 
K
N
 
M
F
 
A
A
 
V
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
Q
 
A
D
 
E
K
 
A
L
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
G
C
 
A
A
 
K
D
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
R
V
 
F
Q
 
Q
G
 
-
Y
 
-
A
 
R
L
 
T
D
 
D
I
 
V
T
 
A
D
 
S
E
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
G
V
 
K
A
 
A
G
 
A
F
 
I
A
 
A
Y
 
A
I
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
V
L
 
A
R
 
-
D
 
P
G
 
G
M
 
E
L
 
K
V
 
V
K
 
L
A
 
G
K
 
R
D
 
E
G
 
G
K
 
A
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
H
S
 
K
F
 
L
D
 
E
Q
 
T
F
 
F
Q
 
T
S
 
R
V
 
T
I
 
I
N
 
S
V
 
I
N
|
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
M
G
 
L
R
 
R
E
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
G
E
 
Q
S
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
F
-
 
D
G
 
G
N
 
Q
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
I
I
 
F
A
x
K
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
M
A
 
A
A
 
G
M
 
M
K
 
P
P
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
Q
E
 
D
R
 
A
L
 
L
E
 
G
K
 
A
L
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
E
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
A
T
 
L
V
 
V
R
 
H
F
 
H
I
 
I
I
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
Q
Y
 
M
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
L
R
 
R
L
 
M

Sites not aligning to the query:

O70351 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-estradiol 17-dehydrogenase; 2-methyl-3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; MHBD; 3-alpha-(17-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase (NAD(+)); 3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; 3alpha(or 20beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; Endoplasmic reticulum-associated amyloid beta-peptide-binding protein; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 5C member 1; Short-chain type dehydrogenase/reductase XH98G2; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239; EC 1.1.1.178; EC 1.1.1.53; EC 1.1.1.159 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 7:259/261 of O70351

query
sites
O70351
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
M
 
T
A
 
A
H
 
K
N
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
P
Q
 
N
D
 
S
K
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
T
A
 
E
C
 
A
A
 
K
D
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
N
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
A
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
M
 
V
L
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
T
K
 
Y
D
 
H
G
 
E
K
 
K
V
 
K
T
 
N
D
 
Q
R
 
V
M
 
H
S
 
T
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
V
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
V
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
P
M
 
L
T
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
K
 
P
P
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

1e3wD Rat brain 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase binary complex with nadh and 3-keto butyrate (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 1:253/255 of 1e3wD

query
sites
1e3wD
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
M
 
T
A
 
A
H
 
K
N
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
|
D
V
|
V
D
 
P
Q
 
N
D
 
S
K
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
T
A
 
E
C
 
A
A
 
K
D
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
N
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
A
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
M
 
V
L
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
T
K
 
Y
D
 
H
G
 
E
K
 
K
V
 
K
T
 
N
D
 
Q
R
 
V
M
 
H
S
 
T
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
|
V
N
|
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
V
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
V
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
L
I
x
F
A
 
A
T
|
T
E
 
P
M
x
L
T
 
L
A
 
T
A
x
T
M
 
L
K
 
P
P
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 98% coverage: 7:252/252 of query aligns to 3:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
H
 
L
N
 
S
F
 
L
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
K
L
 
V
A
 
L
L
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
V
D
x
N
Q
x
Y
D
x
A
K
x
R
L
x
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
V
G
 
S
S
 
K
S
 
Q
T
 
I
E
 
E
V
 
A
Q
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
T
Y
 
F
A
 
G
L
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
M
F
 
M
A
 
K
Y
 
T
I
 
A
L
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
W
G
 
G
K
 
T
I
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
M
 
L
L
 
L
V
 
I
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
F
 
K
D
 
S
Q
 
Q
F
 
W
Q
 
D
S
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
A
 
I
M
 
M
I
 
M
E
 
K
S
 
K
G
 
-
Q
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
F
S
 
S
V
 
K
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
N
S
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
x
S
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
A
A
 
K
M
 
L
K
 
G
P
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
I
E
 
L
K
 
G
L
 
T
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
H
 
Q
A
 
P
E
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
L
V
 
V
R
 
E
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
L
N
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
F
 
F
E
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
A
L
 
I

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 4:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
L
 
L
K
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
S
H
 
V
N
 
R
F
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
I
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
D
Q
 
R
D
 
A
K
 
A
L
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
C
 
V
A
 
R
D
 
L
L
 
L
G
 
P
S
 
P
S
 
R
T
 
G
E
 
N
V
 
H
Q
 
A
G
 
A
Y
 
F
A
 
Q
L
x
A
D
 
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
E
 
A
E
 
R
D
 
A
V
 
A
V
 
R
A
 
C
G
 
L
F
 
L
A
 
E
Y
 
Q
I
 
V
L
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
K
 
R
I
 
P
-
 
P
N
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
M
 
F
L
 
L
V
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
H
M
 
M
S
 
S
F
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
C
A
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
-
 
V
A
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
Q
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
C
A
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
x
P
M
|
M
T
|
T
A
 
Q
A
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
E
L
 
M
V
 
I
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
S
F
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L

O08756 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-estradiol 17-dehydrogenase; 2-methyl-3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; MHBD; 3-alpha-(17-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase (NAD(+)); 3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; 3alpha(or 20beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; Endoplasmic reticulum-associated amyloid beta-peptide-binding protein; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 5C member 1; Short-chain type dehydrogenase/reductase XH98G2; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239; EC 1.1.1.178; EC 1.1.1.53; EC 1.1.1.159 from Mus musculus (Mouse)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 7:259/261 of O08756

query
sites
O08756
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
P
G
 
W
L
 
L
A
 
A
M
 
T
A
 
A
H
 
K
N
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
P
Q
 
D
D
 
S
K
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
S
A
 
Q
C
 
A
A
 
K
D
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
E
S
 
S
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
I
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
A
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
M
 
V
L
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
T
K
 
Y
D
 
H
G
 
Q
K
 
K
V
 
K
T
 
N
D
 
K
R
 
I
M
 
H
S
 
T
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
E
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
 
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
A
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
D
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
T
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
V
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
P
M
 
L
T
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

Sites not aligning to the query:

1e6wC Rat brain 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase binary complex with nadh and estradiol (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 1:246/248 of 1e6wC

query
sites
1e6wC
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
M
 
T
A
 
A
H
 
K
N
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
|
D
V
|
V
D
 
P
Q
 
N
D
 
S
K
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
T
A
 
E
C
 
A
A
 
K
D
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
N
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
A
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
M
 
V
L
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
T
K
 
Y
D
 
H
G
 
E
K
 
K
V
 
K
T
 
N
D
 
Q
R
 
V
M
 
H
S
 
T
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
V
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
V
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
L
I
x
F
A
 
A
T
|
T
E
 
-
M
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
P
E
x
L
A
x
L
L
 
T
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

7onuC Structure of human mitochondrial rnase p in complex with mitochondrial pre-tRNA-tyr (see paper)
37% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 1:253/255 of 7onuC

query
sites
7onuC
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
T
A
 
A
H
 
E
N
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
|
D
V
x
L
D
 
P
Q
 
N
D
 
S
K
 
G
L
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
Q
C
 
A
A
 
K
D
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
N
T
 
C
E
 
V
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
 
D
I
x
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
G
D
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
V
N
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
x
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
A
R
 
V
D
 
A
G
x
S
M
x
K
L
 
T
V
 
Y
K
 
N
A
 
L
K
 
K
D
 
K
G
 
G
K
 
Q
V
 
T
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
H
S
 
T
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
M
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
E
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
x
F
A
 
G
T
|
T
E
 
P
M
 
L
T
 
L
A
 
T
A
 
S
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
C
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

Q99714 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-estradiol 17-dehydrogenase; 2-methyl-3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; MHBD; 3-alpha-(17-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase (NAD(+)); 3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; 3alpha(or 20beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; Endoplasmic reticulum-associated amyloid beta-peptide-binding protein; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 5C member 1; Short-chain type dehydrogenase/reductase XH98G2; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239; EC 1.1.1.178; EC 1.1.1.53; EC 1.1.1.159 from Homo sapiens (Human) (see 14 papers)
37% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 7:259/261 of Q99714

query
sites
Q99714
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
|
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
 
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
T
A
 
A
H
 
E
N
 
R
F
 
L
A
 
V
Q
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
|
D
V
 
L
D
 
P
Q
 
N
D
 
S
K
 
G
L
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
Q
C
 
A
A
 
K
D
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
N
S
 
N
T
 
C
E
 
V
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
G
D
 
K
F
 
F
G
 
G
K
 
R
I
 
V
N
x
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
x
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
A
R
 
V
D
 
A
G
 
S
M
 
K
L
 
T
V
 
Y
K
 
N
A
 
L
K
 
K
D
 
K
G
 
G
K
 
Q
V
 
T
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
H
S
 
T
F
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
M
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
|
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
E
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
x
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
x
F
A
 
G
T
|
T
E
 
P
M
 
L
T
 
L
A
 
T
A
 
S
M
 
L
K
x
P
P
 
E
E
x
K
A
 
V
L
 
C
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
|
R
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
|
N
G
 
G
R
x
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 6:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
L
 
L
K
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
S
H
 
V
N
 
R
F
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
I
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
D
Q
 
R
D
 
A
K
 
A
L
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
C
 
V
A
 
R
D
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
P
-
 
G
T
 
S
E
 
N
V
 
H
Q
 
A
G
 
A
Y
 
F
A
 
Q
L
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
E
 
A
E
 
R
D
 
A
V
 
A
V
 
R
A
 
C
G
 
L
F
 
L
A
 
E
Y
 
Q
I
 
V
L
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
K
 
R
I
 
P
-
 
P
N
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
M
 
F
L
 
L
V
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
H
M
 
M
S
 
S
F
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
C
A
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
-
 
V
A
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
Q
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
C
A
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
P
M
|
M
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
E
L
 
M
V
 
I
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
S
F
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L

Q92506 (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8; 17-beta-HSD 8; HSD17B8; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase alpha subunit; KAR alpha subunit; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8; Protein Ke6; Ke6; Short chain dehydrogenase/reductase family 30C member 1; Testosterone 17-beta-dehydrogenase 8; EC 1.1.1.n12; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
35% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 9:259/261 of Q92506

query
sites
Q92506
L
 
L
K
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
V
 
A
V
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
A
x
G
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
S
H
 
V
N
 
R
F
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
I
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
D
Q
 
R
D
 
A
K
 
A
L
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
C
 
V
A
 
R
D
 
L
L
 
L
G
 
G
S
 
G
S
 
P
T
 
G
E
 
S
V
 
K
Q
 
E
G
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
A
Y
 
F
A
 
Q
L
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
E
 
A
E
 
R
D
 
A
V
 
A
V
 
R
A
 
C
G
 
L
F
 
L
A
 
E
Y
 
Q
I
 
V
L
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
K
 
R
I
 
P
-
 
P
N
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
M
 
F
L
 
L
V
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
H
M
 
M
S
 
S
F
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
C
A
x
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
 
S
L
 
I
-
x
V
A
 
G
K
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
Q
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
|
R
Y
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
C
A
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
|
A
T
|
T
E
 
P
M
 
M
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
E
L
 
M
V
 
I
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
S
F
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L

Query Sequence

>200848 FitnessBrowser__MR1:200848
MDLKDKVVVITGGAGGLGLAMAHNFAQAGAKLALIDVDQDKLERACADLGSSTEVQGYAL
DITDEEDVVAGFAYILEDFGKINVLVNNAGILRDGMLVKAKDGKVTDRMSFDQFQSVINV
NLTGTFLCGREAAAAMIESGQAGVIVNISSLAKAGNVGQSNYAASKAGVAAMSVGWAKEL
ARYNIRSAAVAPGVIATEMTAAMKPEALERLEKLVPVGRLGHAEEIASTVRFIIENDYVN
GRVFEVDGGIRL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory