SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 202039 FitnessBrowser__MR1:202039 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1tuuA Acetate kinase crystallized with atpgs (see paper)
49% identity, 98% coverage: 6:397/399 of query aligns to 3:396/399 of 1tuuA

query
sites
1tuuA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
|
K
F
 
Y
A
 
Q
V
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
M
Q
 
T
T
 
N
G
 
E
D
 
S
D
 
A
Q
 
L
I
 
A
S
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
C
E
 
E
C
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
D
D
 
N
S
 
S
R
 
I
I
 
I
-
 
T
K
 
Q
W
 
K
K
 
K
I
 
F
N
 
D
G
 
G
E
 
K
K
 
K
H
 
L
E
 
E
S
 
K
S
 
-
L
 
L
G
 
T
A
 
D
F
 
L
T
 
P
A
 
T
H
 
H
R
 
K
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
E
F
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
K
 
A
I
 
L
L
 
T
A
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
I
E
 
K
L
 
D
A
 
M
A
 
G
Q
 
E
I
 
I
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
T
R
 
T
S
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
Y
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
V
I
 
E
K
 
K
G
 
A
I
 
I
E
 
K
E
 
D
C
 
C
S
 
F
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
P
H
 
N
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
C
M
 
A
A
 
E
S
 
I
F
 
M
P
 
P
K
 
G
L
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
M
P
 
P
E
 
P
R
 
Y
S
 
A
F
 
Y
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
E
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
K
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
R
 
E
E
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
L
V
 
M
L
 
L
K
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
A
A
 
E
E
 
E
T
 
T
N
 
K
V
 
I
I
 
I
C
 
T
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
 
N
G
|
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
V
D
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
F
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
C
G
 
G
D
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
A
I
 
I
I
 
V
Y
 
P
H
 
F
L
 
L
V
 
M
H
 
E
Q
 
K
L
 
E
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
L
 
T
E
 
R
E
 
E
V
 
I
N
 
D
N
 
T
L
 
L
M
 
M
N
 
N
K
 
K
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
N
D
|
D
C
x
F
R
|
R
G
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
G
 
G
H
 
N
K
 
R
G
 
K
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
K
Y
 
F
I
 
I
A
 
G
S
 
E
Y
 
Y
T
 
S
V
 
A
P
 
V
L
 
L
G
 
N
R
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
A
I
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
I
L
 
L
N
 
T
M
 
G
L
 
L
Q
 
D
I
 
G
F
 
I
N
 
G
F
 
I
H
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
D
E
 
E
R
 
K
N
 
N
K
 
K
A
 
-
A
 
I
R
 
R
F
 
G
G
 
Q
K
 
E
K
 
I
G
 
D
I
 
I
I
 
S
T
 
T
A
 
P
D
 
D
N
 
A
S
 
K
T
 
V
V
 
R
A
 
V
M
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
V
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
E
S
 
T
I
 
K
K
 
E
L
 
I
I
 
V

1tuuB Acetate kinase crystallized with atpgs (see paper)
49% identity, 98% coverage: 6:397/399 of query aligns to 3:396/398 of 1tuuB

query
sites
1tuuB
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
A
 
Q
V
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
M
Q
 
T
T
 
N
G
 
E
D
 
S
D
 
A
Q
 
L
I
 
A
S
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
C
E
 
E
C
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
D
D
 
N
S
 
S
R
 
I
I
 
I
-
 
T
K
 
Q
W
 
K
K
 
K
I
 
F
N
 
D
G
 
G
E
 
K
K
 
K
H
 
L
E
 
E
S
 
K
S
 
-
L
 
L
G
 
T
A
 
D
F
 
L
T
 
P
A
 
T
H
 
H
R
 
K
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
E
F
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
K
 
A
I
 
L
L
 
T
A
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
I
E
 
K
L
 
D
A
 
M
A
 
G
Q
 
E
I
 
I
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
T
R
 
T
S
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
Y
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
V
I
 
E
K
 
K
G
 
A
I
 
I
E
 
K
E
 
D
C
 
C
S
 
F
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
P
H
 
N
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
C
M
 
A
A
 
E
S
 
I
F
 
M
P
 
P
K
 
G
L
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
M
P
 
P
E
 
P
R
 
Y
S
 
A
F
 
Y
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
E
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
K
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
R
 
E
E
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
L
V
 
M
L
 
L
K
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
A
A
 
E
E
 
E
T
 
T
N
 
K
V
 
I
I
 
I
C
 
T
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
 
N
G
|
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
V
D
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
F
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
C
G
 
G
D
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
A
I
 
I
I
 
V
Y
 
P
H
 
F
L
 
L
V
 
M
H
 
E
Q
 
K
L
 
E
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
L
 
T
E
 
R
E
 
E
V
 
I
N
 
D
N
 
T
L
 
L
M
 
M
N
 
N
K
 
K
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
N
D
|
D
C
 
F
R
|
R
G
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
G
 
G
H
 
N
K
 
R
G
 
K
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
K
Y
 
F
I
 
I
A
 
G
S
 
E
Y
 
Y
T
 
S
V
 
A
P
 
V
L
 
L
G
 
N
R
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
|
S
D
 
A
I
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
I
L
 
L
N
 
T
M
 
G
L
 
L
Q
 
D
I
 
G
F
 
I
N
 
G
F
 
I
H
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
D
E
 
E
R
 
K
N
 
N
K
 
K
A
 
-
A
 
I
R
 
R
F
 
G
G
 
Q
K
 
E
K
 
I
G
 
D
I
 
I
I
 
S
T
 
T
A
 
P
D
 
D
N
 
A
S
 
K
T
 
V
V
 
R
A
 
V
M
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
V
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
E
S
 
T
I
 
K
K
 
E
L
 
I
I
 
V

P38502 Acetate kinase; Acetokinase; EC 2.7.2.1 from Methanosarcina thermophila (see 5 papers)
49% identity, 98% coverage: 6:397/399 of query aligns to 3:396/408 of P38502

query
sites
P38502
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
A
G
 
G
S
|
S
S
 
S
S
|
S
L
 
L
K
|
K
F
 
Y
A
 
Q
V
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
M
Q
 
T
T
 
N
G
 
E
D
 
S
D
 
A
Q
 
L
I
 
A
S
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
C
E
 
E
C
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
D
D
 
N
S
 
S
R
 
I
I
 
I
-
 
T
K
 
Q
W
 
K
K
 
K
I
 
F
N
 
D
G
 
G
E
 
K
K
 
K
H
 
L
E
 
E
S
 
K
S
 
-
L
 
L
G
 
T
A
 
D
F
 
L
T
 
P
A
 
T
H
 
H
R
 
K
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
E
F
 
E
I
 
V
V
 
V
N
 
K
K
 
A
I
 
L
L
 
T
A
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
I
E
 
K
L
 
D
A
 
M
A
 
G
Q
 
E
I
 
I
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
V
V
|
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
F
T
 
T
R
 
T
S
 
S
V
 
A
I
 
L
I
 
Y
D
 
D
E
 
E
H
 
G
V
 
V
I
 
E
K
 
K
G
 
A
I
 
I
E
 
K
E
 
D
C
 
C
S
 
F
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
|
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
P
H
 
N
L
 
M
I
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
C
M
 
A
A
 
E
S
 
I
F
 
M
P
 
P
K
 
G
L
 
T
P
 
P
Q
 
M
V
 
V
A
 
I
V
 
V
F
 
F
D
|
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
M
P
 
P
E
 
P
R
 
Y
S
 
A
F
 
Y
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
K
 
D
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
E
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
M
x
F
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
K
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
R
 
E
E
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
L
V
 
M
L
 
L
K
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
A
A
 
E
E
 
E
T
 
T
N
 
K
V
 
I
I
 
I
C
 
T
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
 
G
A
 
S
S
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
V
K
 
E
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
V
D
 
E
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
F
T
 
T
P
|
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
A
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
C
G
 
G
D
 
S
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
A
I
 
I
I
 
V
Y
 
P
H
 
F
L
 
L
V
 
M
H
 
E
Q
 
K
L
 
E
G
 
G
Y
 
L
T
 
T
L
 
T
E
 
R
E
 
E
V
 
I
N
 
D
N
 
T
L
 
L
M
 
M
N
 
N
K
 
K
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
N
D
 
D
C
 
F
R
 
R
G
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
A
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
G
 
G
H
 
N
K
 
R
G
 
K
A
 
A
T
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
F
C
 
A
Y
 
Y
R
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
K
Y
 
F
I
 
I
A
 
G
S
 
E
Y
 
Y
T
 
S
V
 
A
P
 
V
L
 
L
G
 
N
R
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
A
I
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
K
K
 
R
V
 
I
L
 
L
N
 
T
M
 
G
L
 
L
Q
 
D
I
 
G
F
 
I
N
 
G
F
 
I
H
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
D
E
 
E
R
 
K
N
 
N
K
 
K
A
 
-
A
 
I
R
 
R
F
 
G
G
 
Q
K
 
E
K
 
I
G
 
D
I
 
I
I
 
S
T
 
T
A
 
P
D
 
D
N
 
A
S
 
K
T
 
V
V
 
R
A
 
V
M
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
V
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
E
S
 
T
I
 
K
K
 
E
L
 
I
I
 
V

4fwsA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with ctp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwsA

query
sites
4fwsA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
x
V
Q
 
A
T
 
T
G
x
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
|
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
|
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwrA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with cmp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwrA

query
sites
4fwrA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwqA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gtp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwqA

query
sites
4fwqA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
|
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwpA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gdp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwpA

query
sites
4fwpA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
|
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
|
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
|
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
|
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwoA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with gmp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwoA

query
sites
4fwoA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
x
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
x
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
|
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwnA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with adenosine tetraphosphate (ap4) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwnA

query
sites
4fwnA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
|
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwmA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with atp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwmA

query
sites
4fwmA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
|
H
L
 
L
G
 
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

4fwkA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with amp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 4fwkA

query
sites
4fwkA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
x
D
G
x
N
I
 
I
E
 
R
E
x
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

2e1zA Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with diadenosine tetraphosphate (ap4a) obtained after co- crystallization with atp (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 2e1zA

query
sites
2e1zA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
|
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

1x3nA Crystal structure of amppnp bound propionate kinase (tdcd) from salmonella typhimurium (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 1x3nA

query
sites
1x3nA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

1x3mA Crystal structure of adp bound propionate kinase (tdcd) from salmonella typhimurium (see paper)
46% identity, 98% coverage: 5:396/399 of query aligns to 3:389/394 of 1x3mA

query
sites
1x3mA
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
I
K
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
T
 
T
G
 
C
D
 
D
D
 
V
Q
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
E
 
D
C
 
G
F
 
M
G
 
N
L
 
T
E
 
E
D
 
N
S
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
S
W
 
-
K
 
-
I
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
D
K
 
K
H
 
P
E
 
I
S
 
N
S
 
L
L
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
H
T
 
S
A
 
N
H
 
Y
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
K
F
 
A
I
 
I
V
 
A
N
 
F
K
 
E
I
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
E
Q
 
K
P
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
T
A
 
D
Q
 
S
I
 
V
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
I
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
L
F
 
F
T
 
T
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
I
D
 
T
E
 
D
H
 
E
V
 
I
I
 
I
K
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
R
C
 
V
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
Y
A
 
A
H
 
N
L
 
L
I
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
R
A
 
H
S
 
L
F
 
F
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
S
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
E
L
 
Y
Y
 
F
R
 
S
E
 
S
H
 
L
G
 
G
I
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Y
K
 
E
V
 
L
L
 
L
K
 
D
K
 
L
P
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
S
N
 
G
V
 
L
I
 
I
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
I
T
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
R
G
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
D
 
D
P
 
F
S
 
G
I
 
A
I
 
M
Y
 
A
H
 
W
L
 
I
V
 
A
H
 
K
Q
 
E
L
 
T
G
 
G
Y
 
Q
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
V
 
L
N
 
E
N
 
R
L
 
V
M
 
V
N
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
E
 
G
L
 
L
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
L
R
|
R
G
 
V
I
 
L
E
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
W
A
 
H
D
 
E
G
 
G
H
 
H
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
K
I
 
T
F
 
F
C
 
V
Y
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
R
Y
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
H
T
 
A
V
 
A
P
 
S
L
 
L
G
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
V
 
I
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
|
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
V
I
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
K
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
E
M
 
H
L
 
L
Q
 
G
I
 
V
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
V
E
 
E
R
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
Q
A
 
P
R
 
N
F
 
S
G
 
H
K
 
G
K
 
E
G
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
N
N
 
P
S
 
S
T
 
Q
V
 
V
-
 
I
A
 
C
M
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
K
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
L
D
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
H
L
 
L

7fj9A Kpacka (pduw) with amppnp complex structure
44% identity, 98% coverage: 6:396/399 of query aligns to 4:391/395 of 7fj9A

query
sites
7fj9A
V
 
I
L
 
M
V
 
A
L
 
I
N
 
N
C
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
F
 
F
A
 
Q
V
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
M
Q
 
P
T
 
Q
G
 
G
D
 
A
D
 
L
Q
 
L
I
 
C
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
E
C
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
P
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
F
K
 
T
W
 
L
K
 
K
I
 
T
N
 
S
G
 
A
E
 
Q
K
 
K
H
 
W
E
 
Q
S
 
E
S
 
T
L
 
L
G
 
-
A
 
P
F
 
I
T
 
A
A
 
D
H
 
H
R
 
H
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
T
F
 
L
I
 
L
V
 
L
N
 
-
K
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
Q
 
R
P
 
G
E
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
S
-
 
L
-
 
Q
Q
 
E
I
 
I
Q
 
D
A
 
G
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
V
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
F
 
F
T
 
K
R
 
D
S
 
A
V
 
A
I
 
L
I
 
V
D
 
C
E
 
D
H
 
D
V
 
T
I
 
L
K
 
R
G
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
R
C
 
L
S
 
A
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
V
H
 
N
L
 
A
I
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
L
A
 
F
M
 
R
A
 
Q
S
 
L
F
 
L
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
W
I
 
L
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
E
 
E
H
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
H
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
S
E
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
E
V
 
K
L
 
L
K
 
G
K
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
A
T
 
L
N
 
R
V
 
V
I
 
V
C
 
S
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
|
G
A
 
C
S
 
S
V
 
V
T
 
C
A
 
A
V
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
N
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
F
T
 
T
P
 
P
L
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
V
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
L
Y
 
P
H
 
W
L
 
L
V
 
V
H
 
E
Q
 
K
L
 
E
G
 
G
Y
 
K
T
 
S
L
 
A
E
 
Q
E
 
Q
V
 
L
N
 
S
N
 
Q
L
 
L
M
 
L
N
 
N
K
 
N
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
S
E
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
Y
R
|
R
G
 
D
I
 
V
E
 
E
E
 
Q
G
 
A
Y
 
A
A
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
S
I
 
L
F
 
F
C
 
A
Y
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
R
K
 
A
Y
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
V
 
M
P
 
Q
L
 
M
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
A
I
 
R
I
 
A
R
 
R
E
 
A
K
 
A
V
 
I
L
 
C
N
 
R
M
 
N
L
 
L
Q
 
H
I
 
F
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
A
V
 
L
D
 
D
S
 
D
E
 
E
R
 
K
N
 
N
-
 
Q
K
 
R
A
 
S
A
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
I
 
I
T
 
Q
A
 
A
D
 
D
N
 
N
S
 
A
T
 
L
V
 
V
A
 
K
M
 
V
-
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
N
T
 
T
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
D
S
 
V
I
 
M
K
 
R
L
 
L

7fj8A Kpacka (pduw) with amp complex structure
44% identity, 98% coverage: 6:396/399 of query aligns to 4:391/395 of 7fj8A

query
sites
7fj8A
V
 
I
L
 
M
V
 
A
L
 
I
N
 
N
C
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
F
 
F
A
 
Q
V
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
M
Q
 
P
T
 
Q
G
 
G
D
 
A
D
 
L
Q
 
L
I
 
C
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
E
C
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
P
D
 
E
S
 
A
R
 
R
I
 
F
K
 
T
W
 
L
K
 
K
I
 
T
N
 
S
G
 
A
E
 
Q
K
 
K
H
 
W
E
 
Q
S
 
E
S
 
T
L
 
L
G
 
-
A
 
P
F
 
I
T
 
A
A
 
D
H
 
H
R
 
H
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
T
F
 
L
I
 
L
V
 
L
N
 
-
K
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
G
Q
 
R
P
 
G
E
 
I
L
 
L
A
 
S
A
 
S
-
 
L
-
 
Q
Q
 
E
I
 
I
Q
 
D
A
 
G
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
V
V
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
F
 
F
T
 
K
R
 
D
S
 
A
V
 
A
I
 
L
I
 
V
D
 
C
E
 
D
H
 
D
V
 
T
I
 
L
K
 
R
G
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
R
C
 
L
S
 
A
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
V
H
 
N
L
 
A
I
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
L
A
 
F
M
 
R
A
 
Q
S
 
L
F
 
L
P
 
P
K
 
A
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
L
P
 
A
E
 
P
R
 
E
S
 
A
F
 
W
I
 
L
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
K
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
E
 
E
H
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
H
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
S
E
 
A
A
 
L
A
 
A
K
 
E
V
 
K
L
 
L
K
 
G
K
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
A
T
 
L
N
 
R
V
 
V
I
 
V
C
 
S
A
 
C
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
V
 
V
T
 
C
A
 
A
V
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
N
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
F
T
 
T
P
 
P
L
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
V
V
 
M
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
L
Y
 
P
H
 
W
L
 
L
V
 
V
H
 
E
Q
 
K
L
 
E
G
 
G
Y
 
K
T
 
S
L
 
A
E
 
Q
E
 
Q
V
 
L
N
 
S
N
 
Q
L
 
L
M
 
L
N
 
N
K
 
N
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
S
E
 
G
L
 
V
T
 
S
N
 
S
D
|
D
C
x
Y
R
|
R
G
 
D
I
 
V
E
 
E
E
 
Q
G
 
A
Y
 
A
A
 
D
D
 
A
G
 
G
H
 
N
K
 
E
G
 
R
A
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
S
I
 
L
F
 
F
C
 
A
Y
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
R
K
 
A
Y
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
V
 
M
P
 
Q
L
 
M
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
I
F
 
F
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
 
S
D
 
A
I
 
R
I
 
A
R
 
R
E
 
A
K
 
A
V
 
I
L
 
C
N
 
R
M
 
N
L
 
L
Q
 
H
I
 
F
F
 
L
N
 
G
F
 
L
H
 
A
V
 
L
D
 
D
S
 
D
E
 
E
R
 
K
N
 
N
-
 
Q
K
 
R
A
 
S
A
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
I
 
I
T
 
Q
A
 
A
D
 
D
N
 
N
S
 
A
T
 
L
V
 
V
A
 
K
M
 
V
-
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
N
T
 
T
N
 
N
E
 
E
E
 
E
W
 
L
V
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
D
S
 
V
I
 
M
K
 
R
L
 
L

9dv9A The amp-bound structure of acka from treponema vincentii (see paper)
42% identity, 98% coverage: 5:397/399 of query aligns to 6:404/453 of 9dv9A

query
sites
9dv9A
L
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
N
C
 
C
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
K
 
K
F
 
Y
A
 
Q
V
 
V
I
 
Y
D
 
D
A
 
W
Q
 
D
T
 
N
G
 
H
D
 
S
D
 
V
Q
 
L
I
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
V
E
 
E
C
 
R
F
 
V
G
 
T
L
 
Q
E
 
P
D
 
G
S
 
S
R
 
V
I
 
I
K
 
T
W
 
H
K
 
E
I
 
A
N
 
K
G
 
G
E
 
K
K
 
D
H
 
K
E
 
Y
S
 
V
S
 
L
L
 
E
G
 
S
A
 
P
F
 
C
T
 
P
A
 
S
H
 
H
R
 
T
E
 
H
A
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
K
K
 
T
I
 
L
L
 
T
A
 
-
G
 
-
Q
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
G
A
 
V
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
M
-
 
N
Q
 
V
I
 
I
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
V
V
 
T
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
D
K
 
K
F
 
F
T
 
I
R
 
K
S
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
V
D
 
T
E
 
P
H
 
E
V
 
I
I
 
L
K
 
N
G
 
T
I
 
F
E
 
R
E
 
E
C
 
V
S
 
Q
S
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
A
H
 
N
L
 
I
I
 
M
G
 
G
I
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
A
 
K
S
 
V
F
 
L
P
 
P
K
 
N
L
 
V
P
 
P
Q
 
H
V
 
C
A
 
A
V
 
I
F
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
W
H
 
H
Q
 
Q
S
 
T
M
 
M
P
 
P
E
 
E
R
 
T
S
 
S
F
 
F
I
 
M
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
P
 
P
Y
 
H
K
 
E
L
 
W
Y
 
Y
R
 
E
E
 
K
H
 
Y
G
 
S
I
 
A
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
F
L
 
L
F
 
Y
V
 
T
S
 
A
R
 
K
E
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
V
V
 
I
L
 
L
K
 
G
K
 
K
P
 
K
L
 
P
A
 
E
E
 
D
T
 
T
N
 
N
V
 
I
I
 
I
C
 
I
A
 
A
H
 
H
L
 
I
G
|
G
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
M
T
 
C
A
 
C
V
 
V
K
 
K
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
C
V
 
F
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
 
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
C
D
 
D
P
 
P
S
 
A
I
 
L
I
 
P
Y
 
F
H
 
Y
L
 
I
V
 
M
H
 
R
Q
 
K
L
 
T
G
 
G
Y
 
M
T
 
T
L
 
P
E
 
A
E
 
E
V
 
M
N
 
D
N
 
T
L
 
A
M
 
L
N
 
N
K
 
K
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
T
E
 
G
L
 
Q
T
 
Y
N
 
V
D
|
D
C
x
R
R
|
R
G
 
D
I
 
V
E
 
S
E
 
K
G
 
A
Y
 
M
A
 
G
D
 
E
G
 
G
H
 
D
K
 
K
G
 
R
A
 
A
T
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
F
E
 
N
I
 
M
F
 
E
C
 
V
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
I
 
F
A
 
G
S
 
A
Y
 
Y
T
 
I
V
 
A
P
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
Q
R
 
K
L
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
x
A
G
|
G
I
 
V
G
 
G
E
 
E
N
x
F
S
 
G
D
 
F
I
 
D
I
 
T
R
 
R
E
 
L
K
 
A
V
 
V
L
 
C
N
 
E
M
 
G
L
 
L
Q
 
T
I
 
H
F
 
L
N
 
G
F
 
I
H
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
P
E
 
K
R
 
K
N
 
N
K
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
T
-
 
R
G
 
N
K
 
A
K
 
E
G
 
T
I
 
C
I
 
I
T
 
S
A
 
A
D
 
D
N
 
D
S
 
S
T
 
P
V
 
V
A
 
K
M
 
I
-
 
F
V
 
V
I
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
D
E
 
E
E
 
E
W
 
L
V
 
V
I
 
M
A
 
T
E
 
E
D
 
D
S
 
A
I
 
Y
K
 
A
L
 
L
I
 
M

4ijnA Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium smegmatis bound to amp and sulfate (see paper)
41% identity, 96% coverage: 6:390/399 of query aligns to 4:370/376 of 4ijnA

query
sites
4ijnA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
V
N
|
N
C
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
I
 
V
D
 
R
A
 
P
Q
 
A
T
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
F
Q
 
L
I
 
A
S
 
D
G
 
G
L
 
I
A
 
I
E
 
E
C
 
E
F
 
I
G
 
G
L
 
S
E
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
W
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
F
 
V
T
 
P
A
 
D
H
 
H
R
 
D
E
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
R
F
 
A
I
 
A
V
 
F
N
 
D
K
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
G
P
 
L
E
 
H
L
 
L
A
 
E
-
 
D
A
 
L
Q
 
D
I
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
M
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
Y
R
 
K
S
 
P
V
 
S
I
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
D
H
 
E
V
 
L
I
 
I
K
 
A
G
 
K
I
 
A
E
 
R
E
 
E
C
 
L
S
 
S
S
 
P
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
P
H
 
A
L
 
I
I
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
E
A
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
K
S
 
L
F
 
L
P
 
P
K
 
D
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
F
 
F
H
 
F
Q
 
H
S
 
D
M
 
L
P
 
P
E
 
A
R
 
P
S
 
A
F
 
S
I
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
P
 
D
Y
 
R
K
 
E
L
 
L
Y
 
A
R
 
E
E
 
T
H
 
W
G
 
H
I
 
I
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
E
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
I
V
 
F
L
 
L
K
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
E
 
S
T
 
L
N
 
N
V
 
Q
I
 
I
C
 
V
A
 
L
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
A
T
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
S
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
M
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
G
I
 
V
I
 
I
Y
 
M
H
 
Y
L
 
L
V
 
W
H
 
R
Q
 
T
L
 
A
G
 
G
Y
 
M
T
 
S
L
 
V
E
 
D
E
 
D
V
 
I
N
 
E
N
 
S
L
 
M
M
 
L
N
 
N
K
 
R
Q
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
G
E
 
G
L
 
-
T
 
A
N
 
S
D
|
D
C
x
F
R
|
R
G
 
K
I
 
L
E
 
R
E
 
E
G
 
L
Y
 
I
A
 
E
D
 
S
G
 
G
H
 
D
K
 
E
G
 
H
A
 
A
T
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
Y
E
 
D
I
 
V
F
 
Y
C
 
I
Y
 
H
R
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
K
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
S
 
A
Y
 
Y
T
 
M
V
 
A
P
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
I
V
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
|
G
I
x
V
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
x
V
D
 
P
I
 
P
I
 
V
R
 
R
E
 
R
K
 
D
V
 
A
L
 
L
N
 
A
M
 
G
L
 
L
Q
 
G
I
 
G
F
 
L
N
 
G
F
 
I
H
 
E
V
 
I
D
 
D
S
 
D
E
 
A
R
 
L
N
 
N
K
 
S
A
 
A
A
 
K
R
 
S
F
 
D
G
 
E
K
 
P
K
 
R
G
 
L
I
 
I
I
 
S
T
 
T
A
 
P
D
 
D
N
 
S
S
 
R
T
 
V
V
 
T
A
 
V
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
V
 
A
I
 
I
A
 
A

4iz9A Crystal structure of an acetate kinase from mycobacterium avium bound to an unknown acid-apcpp conjugate and manganese (see paper)
41% identity, 99% coverage: 4:397/399 of query aligns to 4:379/381 of 4iz9A

query
sites
4iz9A
K
 
R
L
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
|
N
C
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
L
K
|
K
F
 
F
A
 
Q
V
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
P
Q
 
E
T
 
S
G
 
G
D
 
V
D
 
A
Q
 
A
I
 
S
S
 
T
G
 
G
L
 
I
A
 
V
E
 
E
C
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
-
E
 
-
D
 
E
S
 
S
R
 
P
I
 
V
K
 
P
W
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
D
H
 
H
E
 
D
S
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
R
E
 
R
A
 
A
V
 
F
E
 
D
F
 
M
I
 
L
V
 
A
N
 
G
K
 
D
I
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
V
P
 
D
E
 
L
L
 
N
A
 
T
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
Q
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
I
 
V
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
N
K
 
T
F
 
F
T
 
Y
R
 
R
S
 
P
V
 
T
I
 
V
I
 
L
D
 
D
E
 
D
H
 
A
V
 
V
I
 
I
K
 
A
G
 
R
I
 
L
E
 
H
E
 
E
C
 
L
S
 
S
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
P
H
 
A
L
 
L
I
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
E
A
 
V
A
 
A
M
 
R
A
 
R
S
 
L
F
 
L
P
 
P
K
 
G
L
 
I
P
 
A
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
G
F
 
F
H
 
F
Q
 
H
S
 
D
M
 
L
P
 
P
E
 
P
R
 
A
S
 
A
F
 
A
I
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
P
 
D
Y
 
R
K
 
E
L
 
L
Y
 
A
R
 
D
E
 
R
H
 
W
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
M
 
F
H
|
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
R
F
 
Y
V
 
V
S
 
S
R
 
E
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
D
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
R
E
 
G
T
 
L
N
 
K
V
 
Q
I
 
I
C
 
V
A
 
L
H
 
H
L
 
L
G
|
G
N
|
N
G
 
G
A
 
C
S
 
S
V
 
A
T
 
S
A
 
A
V
 
I
K
 
A
G
 
G
G
 
T
K
 
R
S
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
S
 
S
M
 
M
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
T
 
T
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
I
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
V
I
 
V
Y
 
S
H
 
Y
L
 
L
V
 
C
H
 
H
Q
 
T
L
 
A
G
 
G
Y
 
M
T
 
G
L
 
V
E
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
E
N
 
S
L
 
M
M
 
L
N
 
N
K
 
H
Q
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
L
S
 
S
E
 
G
L
 
V
T
 
-
N
 
R
D
|
D
C
x
F
R
|
R
G
 
R
I
 
L
E
 
R
E
 
E
G
 
L
Y
 
I
A
 
E
D
 
S
G
 
G
H
 
D
K
 
G
G
 
A
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Y
E
 
S
I
 
V
F
 
F
C
 
T
Y
 
H
R
 
R
L
 
L
A
 
R
K
 
K
Y
 
Y
I
 
I
A
 
G
S
 
A
Y
 
Y
T
 
L
V
 
A
P
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
H
L
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
I
V
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
E
N
|
N
S
x
D
D
 
A
I
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
R
K
 
D
V
 
A
L
 
V
N
 
S
M
 
G
L
 
M
Q
 
E
I
 
E
F
 
L
N
 
G
F
 
I
H
 
V
V
 
L
D
 
D
S
 
E
E
 
R
R
 
R
N
 
N
K
 
L
A
 
P
A
 
G
R
 
A
F
 
K
G
 
G
K
 
A
K
 
R
G
 
Q
I
 
I
I
 
S
T
 
A
A
 
D
D
 
D
N
 
S
S
 
P
T
 
I
V
 
T
A
 
V
M
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
P
T
 
T
N
 
N
E
|
E
E
 
E
W
 
L
V
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
D
 
D
S
 
C
I
 
V
K
 
R
L
 
V
I
 
L

1sazA Membership in the askha superfamily: enzymological properties and crystal structure of butyrate kinase 2 from thermotoga maritima (see paper)
25% identity, 41% coverage: 175:339/399 of query aligns to 149:312/375 of 1sazA

query
sites
1sazA
R
 
R
R
 
K
Y
 
S
G
 
I
M
 
F
H
|
H
G
 
A
T
 
L
S
 
N
H
 
Q
L
 
K
F
 
T
V
 
V
S
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
V
A
 
A
K
 
R
V
 
M
L
 
M
K
 
N
K
 
K
P
 
R
L
 
Y
A
 
E
E
 
E
T
 
M
N
 
N
V
 
L
I
 
V
C
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
M
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
 
I
S
 
S
V
 
I
T
 
A
A
 
A
V
 
H
K
 
R
G
 
K
G
 
G
K
 
R
S
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
V
S
 
N
M
 
N
G
 
A
L
 
L
T
 
D
P
 
G
L
 
-
E
 
D
G
 
G
L
 
P
V
 
F
M
 
T
G
 
P
T
 
E
R
|
R
C
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
L
D
 
P
P
 
L
S
 
T
I
 
Q
I
 
L
Y
 
V
H
 
D
L
 
L
V
 
C
H
 
F
Q
 
S
L
 
G
G
 
K
Y
 
F
T
 
T
L
 
Y
E
 
E
E
 
E
V
 
M
N
 
K
N
 
K
L
 
R
M
 
I
N
 
V
K
 
G
Q
 
N
S
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
V
G
 
A
I
 
Y
S
 
L
E
 
G
L
 
-
T
 
T
N
x
S
D
|
D
C
x
A
R
|
R
G
 
E
I
 
V
E
 
V
E
 
R
G
 
R
Y
 
I
A
 
K
D
 
Q
G
 
G
H
 
D
K
 
E
G
 
W
A
 
A
T
 
K
L
 
R
A
 
V
L
 
Y
E
 
R
I
 
A
F
 
M
C
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
L
 
I
A
 
A
K
 
K
Y
 
W
I
 
I
A
 
G
S
 
K
Y
 
M
T
 
A
V
 
A
P
 
V
L
 
L
-
 
K
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
A
 
F
V
 
I
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
G
|
G
I
x
L
G
 
A
E
x
H
N
 
E
S
 
K
D
 
E
I
 
F
I
 
L

Query Sequence

>202039 FitnessBrowser__MR1:202039
MSNKLVLVLNCGSSSLKFAVIDAQTGDDQISGLAECFGLEDSRIKWKINGEKHESSLGAF
TAHREAVEFIVNKILAGQPELAAQIQAVGHRIVHGGEKFTRSVIIDEHVIKGIEECSSLA
PLHNPAHLIGIRAAMASFPKLPQVAVFDTAFHQSMPERSFIYALPYKLYREHGIRRYGMH
GTSHLFVSREAAKVLKKPLAETNVICAHLGNGASVTAVKGGKSVDTSMGLTPLEGLVMGT
RCGDIDPSIIYHLVHQLGYTLEEVNNLMNKQSGLLGISELTNDCRGIEEGYADGHKGATL
ALEIFCYRLAKYIASYTVPLGRLDAVVFTGGIGENSDIIREKVLNMLQIFNFHVDSERNK
AARFGKKGIITADNSTVAMVIPTNEEWVIAEDSIKLITK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory