SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 202296 FitnessBrowser__MR1:202296 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1mc3A Crystal structure of rffh (see paper)
73% identity, 95% coverage: 14:303/304 of query aligns to 1:290/291 of 1mc3A

query
sites
1mc3A
N
 
H
T
 
M
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
K
|
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
K
S
 
G
S
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
F
G
 
G
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
A
V
 
E
Q
|
Q
V
 
P
T
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
T
F
 
F
I
 
L
G
 
N
N
 
G
D
 
E
N
 
P
V
 
S
C
 
C
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
F
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
P
 
P
I
 
K
L
 
L
K
 
R
K
 
H
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
P
 
T
T
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
K
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
D
D
 
N
L
 
F
K
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
K
K
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
W
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
S
R
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
E
I
 
Y
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
V
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
I
N
 
N
Q
 
Q
A
 
M
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
A
G
 
G
K
 
N
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
|
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
T
F
 
F
V
 
V
E
 
Q
T
 
T
I
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
I
 
I
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
W
R
 
R
N
 
N
H
 
G
W
 
W
L
 
L
S
 
D
N
 
D
E
 
E
Q
 
G
I
 
V
L
 
K
K
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
S
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
T
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
R
I
 
A
K
 
R

P61887 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase 2; G1P-TT 2; dTDP-glucose pyrophosphorylase 2; dTDP-glucose synthase 2; EC 2.7.7.24 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
74% identity, 95% coverage: 16:303/304 of query aligns to 2:289/293 of P61887

query
sites
P61887
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
I
T
 
T
K
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
K
S
 
G
S
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
F
G
 
G
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
A
V
 
E
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
T
F
 
F
I
 
L
G
 
N
N
 
G
D
 
E
N
 
P
V
 
S
C
 
C
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
F
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
S
P
 
P
I
 
K
L
 
L
K
 
R
K
 
H
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
P
 
T
T
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
K
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
D
D
 
N
L
 
F
K
 
R
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
K
K
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
W
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
S
R
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
E
I
 
Y
A
 
A
K
 
K
N
 
Q
V
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
S
I
 
I
N
 
N
Q
 
Q
A
 
M
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
A
G
 
G
K
 
N
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
|
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
T
F
 
F
V
 
V
E
 
Q
T
 
T
I
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
F
K
 
K
I
 
I
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
W
R
 
R
N
 
N
H
 
G
W
 
W
L
 
L
S
 
D
N
 
D
E
 
E
Q
 
G
I
 
V
L
 
K
K
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
S
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
T
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
L
V
 
L
E
 
R
I
 
A
K
 
R

4ho9A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with udp-galactose and utp
72% identity, 95% coverage: 16:304/304 of query aligns to 2:290/294 of 4ho9A

query
sites
4ho9A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
T
 
T
K
 
K
G
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
V
 
S
T
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
|
G
Q
x
H
G
|
G
F
 
F
S
x
T
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
R
P
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
L
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
E
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
G
|
G
F
 
F
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
S
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
M
H
 
G
W
 
Y
L
 
I
S
 
S
N
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
P
M
 
L
S
 
M
K
 
K
N
 
N
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
L
V
 
A
E
 
H
I
 
R
K
 
S
K
 
K

4ho4A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with thymidine and glucose-1-phosphate
72% identity, 94% coverage: 16:301/304 of query aligns to 2:287/289 of 4ho4A

query
sites
4ho4A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
T
 
T
K
 
K
G
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
S
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
|
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
F
 
F
S
 
T
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
R
P
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
|
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
L
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
E
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
S
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
M
H
 
G
W
 
Y
L
 
I
S
 
S
N
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
P
M
 
L
S
 
M
K
 
K
N
 
N
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
L
V
 
A
E
 
H

4ho6A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with udp-glucose and utp
73% identity, 93% coverage: 16:299/304 of query aligns to 2:285/288 of 4ho6A

query
sites
4ho6A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
T
 
T
K
 
K
G
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
V
 
S
T
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
x
Y
G
|
G
Q
x
H
G
|
G
F
 
F
S
x
T
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
R
P
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
L
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
E
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
S
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
M
H
 
G
W
 
Y
L
 
I
S
 
S
N
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
P
M
 
L
S
 
M
K
 
K
N
 
N
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
L

4ho5A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with tdp-glucose
73% identity, 93% coverage: 16:299/304 of query aligns to 2:285/288 of 4ho5A

query
sites
4ho5A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
T
 
T
K
 
K
G
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
V
 
S
T
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
x
Y
G
|
G
Q
x
H
G
|
G
F
|
F
S
x
T
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
R
P
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
|
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
L
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
E
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
G
|
G
F
 
F
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
S
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
M
H
 
G
W
 
Y
L
 
I
S
 
S
N
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
P
M
 
L
S
 
M
K
 
K
N
 
N
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
L

4ho3A Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with thymidine triphosphate
73% identity, 93% coverage: 16:299/304 of query aligns to 2:285/288 of 4ho3A

query
sites
4ho3A
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
T
 
T
K
 
K
G
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
V
 
S
T
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
x
Y
G
|
G
Q
x
H
G
|
G
F
|
F
S
x
T
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
R
P
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
L
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
E
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
 
R
G
 
G
E
|
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
S
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
N
 
M
H
 
G
W
 
Y
L
 
I
S
 
S
N
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
P
M
 
L
S
 
M
K
 
K
N
 
N
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
L

4hocA Crystal structure of glucose 1-phosphate thymidylyltransferase from aneurinibacillus thermoaerophilus complexed with udp-n- acetylglucosamine
73% identity, 93% coverage: 16:299/304 of query aligns to 2:283/286 of 4hocA

query
sites
4hocA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
S
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
T
 
T
K
 
K
G
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
K
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
E
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
V
 
S
T
 
S
P
|
P
D
 
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
D
D
 
D
N
 
N
V
 
V
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
F
 
F
S
 
T
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
R
 
R
P
 
K
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
E
D
 
K
L
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
E
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
I
K
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
-
R
 
-
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
L
G
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
F
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
E
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
S
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
M
H
 
G
W
 
Y
L
 
I
S
 
S
N
 
R
E
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
P
M
 
L
S
 
M
K
 
K
N
 
N
S
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
L

3zllA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 5:288/297 of 3zllA

query
sites
3zllA
H
 
H
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
N
 
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

3zlkA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 5:288/297 of 3zlkA

query
sites
3zlkA
H
 
H
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
|
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
x
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fyeA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 4:287/296 of 5fyeA

query
sites
5fyeA
H
 
H
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
|
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
 
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
N
 
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fu0A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 4:287/296 of 5fu0A

query
sites
5fu0A
H
 
H
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
|
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
x
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
x
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
x
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5ftvA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 4:287/296 of 5ftvA

query
sites
5ftvA
H
 
H
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
|
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
x
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
|
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
N
x
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5ftsA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 4:287/296 of 5ftsA

query
sites
5ftsA
H
 
H
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
|
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
 
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
x
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4arwA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
68% identity, 93% coverage: 13:296/304 of query aligns to 2:285/294 of 4arwA

query
sites
4arwA
H
 
H
N
 
H
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
|
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
x
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
 
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
65% identity, 94% coverage: 16:301/304 of query aligns to 5:290/292 of P26393

query
sites
P26393
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
M
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
H
D
 
D
N
 
D
V
 
C
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
L
S
 
P
P
 
K
I
 
L
L
 
M
K
 
E
K
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
N
R
 
K
P
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
K
L
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
E
I
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
|
T
S
 
D
I
 
I
N
 
N
Q
 
R
A
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
N
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
S
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
F
R
 
R
N
 
K
H
 
N
W
 
F
L
 
I
S
 
N
N
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
K
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
E
 
P
M
 
L
S
 
S
K
 
K
N
 
N
S
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
K
L
 
M
V
 
V
E
 
K

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
66% identity, 96% coverage: 4:296/304 of query aligns to 1:293/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
N
 
H
T
 
H
Q
 
H
H
 
H
S
 
H
T
 
G
L
 
S
K
 
M
T
 
A
H
 
M
N
 
K
T
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
 
R
N
x
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

5fuhA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
66% identity, 96% coverage: 6:296/304 of query aligns to 2:289/298 of 5fuhA

query
sites
5fuhA
Q
 
H
H
 
H
S
 
H
T
 
H
L
 
M
K
 
K
T
 
R
H
 
-
N
 
-
T
 
-
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
x
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
W
 
Y
G
|
G
Q
 
H
G
 
D
F
|
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
N
x
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4b4bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
66% identity, 96% coverage: 6:296/304 of query aligns to 2:289/298 of 4b4bA

query
sites
4b4bA
Q
 
H
H
 
H
S
 
H
T
 
H
L
 
M
K
 
K
T
 
R
H
 
-
N
 
-
T
 
-
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
I
 
A
T
 
T
K
 
L
G
 
A
V
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
N
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
P
T
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
N
 
L
V
 
S
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
F
S
 
H
P
 
E
I
 
L
L
 
L
K
 
G
K
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
P
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
G
L
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
Q
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
D
I
 
I
A
 
A
K
 
R
N
 
D
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
V
N
 
N
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
M
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
L
 
I
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
L
E
 
E
K
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
A
 
A
W
 
Y
R
|
R
N
 
Q
H
 
K
W
 
W
L
 
I
S
 
D
N
 
A
E
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
E
K
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
P
M
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

1iinA Thymidylyltransferase complexed with udp-glucose (see paper)
65% identity, 94% coverage: 16:300/304 of query aligns to 5:289/289 of 1iinA

query
sites
1iinA
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
|
R
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
I
 
V
T
 
T
K
 
M
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
S
 
S
V
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
Q
 
T
S
 
P
S
 
R
F
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
W
G
 
G
I
 
L
S
 
N
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
V
 
V
Q
|
Q
V
 
P
T
 
S
P
|
P
D
|
D
G
|
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
E
 
E
F
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
H
D
 
D
N
 
D
V
 
C
C
 
A
L
 
L
A
 
V
L
|
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
Q
 
H
G
 
D
F
 
L
S
 
P
P
 
K
I
 
L
L
 
M
K
 
E
K
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
N
R
 
K
P
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
V
 
V
K
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
D
 
K
L
 
G
K
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
P
K
 
K
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
R
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
E
I
 
M
A
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
E
 
A
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
S
 
D
I
 
I
N
 
N
Q
 
R
A
 
I
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
M
 
Q
G
 
G
K
 
R
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
A
L
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
W
|
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
H
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
N
F
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
E
K
 
E
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
S
C
 
C
L
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
W
 
F
R
 
R
N
 
K
H
 
N
W
 
F
L
 
I
S
 
N
N
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
K
 
E
V
 
L
A
 
A
N
 
G
E
 
P
M
 
L
S
 
S
K
 
K
N
 
N
S
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
G
 
K
L
 
M
V
 
V

Query Sequence

>202296 FitnessBrowser__MR1:202296
MELNTQHSTLKTHNTKGIILAGGSGTRLYPITKGVSKQLLPVYDKPMIYYPISVLMLAGI
RDILIITTPEDQSSFQRLLGDGSDFGISLQYAVQVTPDGLAQAFIIGEEFIGNDNVCLAL
GDNIFWGQGFSPILKKAAARPTGASVFGYQVKDPERFGVVEFDQDLKAISIEEKPLKPKS
NFAVTGLYFYDNRVVNIAKNVKPSERGELEITSINQAYLEMGKLNVELLGRGFAWLDTGT
YESLLEAASFVETIEKRQGYKIACLEEIAWRNHWLSNEQILKVANEMSKNSYGQYLLGLV
EIKK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory