SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 202608 SO3507 conserved hypothetical protein (NCBI ptt file) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

2e2oA Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with glucose (see paper)
32% identity, 79% coverage: 11:246/300 of query aligns to 3:238/299 of 2e2oA

query
sites
2e2oA
L
 
I
F
 
I
I
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
K
 
K
C
 
T
R
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
A
Y
 
Y
T
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
T
 
N
V
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
G
V
 
S
A
 
S
G
 
G
R
 
P
A
 
G
N
 
N
P
 
Y
L
 
H
H
 
N
-
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
T
Q
 
R
T
 
A
F
 
I
E
 
E
S
 
N
I
 
I
E
 
K
A
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
A
M
 
K
K
 
G
A
 
E
T
 
A
D
 
D
S
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
G
|
G
V
 
L
N
x
D
V
 
S
P
 
K
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
F
N
 
D
W
 
W
Q
 
E
H
 
N
-
 
F
-
 
T
P
 
P
F
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
L
Y
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
I
V
 
I
T
 
Q
T
x
H
D
|
D
L
 
G
H
 
V
T
 
I
A
 
A
C
 
L
I
 
F
G
 
A
A
 
E
H
 
T
R
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
A
G
 
G
T
 
T
G
|
G
S
|
S
C
x
V
G
 
V
Y
 
E
A
 
G
H
 
Y
V
 
N
G
 
G
D
 
K
A
 
E
S
 
F
L
 
L
S
 
R
I
 
V
G
 
G
G
|
G
H
 
R
G
 
G
F
 
W
A
 
L
L
 
L
G
 
S
D
|
D
K
 
D
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
Y
W
 
W
L
 
V
G
 
G
L
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
R
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
M
L
 
M
D
 
D
G
 
G
F
 
L
A
 
E
T
 
N
P
 
K
T
 
T
A
 
I
L
 
L
T
 
Y
E
 
N
M
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
K
H
 
T
L
 
I
G
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
L
L
 
D
G
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
-
H
 
-
L
 
M
A
 
W
G
 
S
K
 
Y
S
 
T
S
 
S
S
 
S
C
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
L
Y
 
V
A
 
A
Q
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
K
N
 
A
V
 
V
L
 
D
D
 
E
C
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
 
K
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
I
 
L
S
 
A
E
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
I

2e2pA Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with adp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 11:246/300 of query aligns to 3:238/298 of 2e2pA

query
sites
2e2pA
L
 
I
F
 
I
I
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
K
 
K
C
 
T
R
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
A
Y
 
Y
T
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
T
 
N
V
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
G
V
 
S
A
 
S
G
 
G
R
 
P
A
 
G
N
 
N
P
 
Y
L
 
H
H
 
N
-
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
T
Q
 
R
T
 
A
F
 
I
E
 
E
S
 
N
I
 
I
E
 
K
A
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
A
M
 
K
K
 
G
A
 
E
T
 
A
D
 
D
S
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
 
D
V
 
S
P
 
K
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
F
N
 
D
W
 
W
Q
 
E
H
 
N
-
 
F
-
 
T
P
 
P
F
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
L
Y
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
I
V
 
I
T
 
Q
T
 
H
D
 
D
L
 
G
H
 
V
T
 
I
A
 
A
C
 
L
I
 
F
G
 
A
A
 
E
H
 
T
R
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
A
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
S
C
 
V
G
 
V
Y
 
E
A
 
G
H
 
Y
V
 
N
G
 
G
D
 
K
A
 
E
S
 
F
L
 
L
S
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
H
 
R
G
 
G
F
 
W
A
 
L
L
 
L
G
 
S
D
 
D
K
 
D
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
Y
W
 
W
L
 
V
G
 
G
L
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
R
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
M
L
 
M
D
 
D
G
 
G
F
 
L
A
 
E
T
 
N
P
 
K
T
 
T
A
 
I
L
 
L
T
 
Y
E
 
N
M
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
K
H
 
T
L
 
I
G
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
L
L
 
D
G
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
-
H
 
-
L
 
M
A
 
W
G
 
S
K
 
Y
S
 
T
S
 
S
S
 
S
C
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
L
Y
 
V
A
|
A
Q
 
S
L
 
I
A
|
A
R
x
K
N
 
A
V
 
V
L
x
D
D
 
E
C
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
 
K
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
I
 
L
S
 
A
E
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

2e2qA Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with xylose, mg2+, and adp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 11:246/300 of query aligns to 3:238/297 of 2e2qA

query
sites
2e2qA
L
 
I
F
 
I
I
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
|
G
G
|
G
S
x
T
K
|
K
C
 
T
R
x
K
A
 
A
T
 
V
I
 
A
Y
 
Y
T
 
D
A
 
C
D
 
E
G
 
G
T
 
N
V
 
F
L
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
G
V
 
S
A
 
S
G
 
G
R
 
P
A
 
G
N
 
N
P
 
Y
L
 
H
H
 
N
-
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
T
Q
 
R
T
 
A
F
 
I
E
 
E
S
 
N
I
 
I
E
 
K
A
 
-
S
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
D
 
I
A
 
A
G
 
A
M
 
K
K
 
G
A
 
E
T
 
A
D
 
D
S
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
x
D
V
 
S
P
 
K
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
F
N
 
D
W
 
W
Q
 
E
H
 
N
-
 
F
-
 
T
P
 
P
F
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
L
Y
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
I
V
 
I
T
 
Q
T
x
H
D
|
D
L
 
G
H
 
V
T
 
I
A
 
A
C
 
L
I
 
F
G
 
A
A
 
E
H
 
T
R
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
A
G
|
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
C
 
V
G
 
V
Y
 
E
A
 
G
H
 
Y
V
 
N
G
 
G
D
 
K
A
 
E
S
 
F
L
 
L
S
 
R
I
 
V
G
 
G
G
|
G
H
 
R
G
 
G
F
 
W
A
 
L
L
 
L
G
 
S
D
|
D
K
 
D
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
Y
W
 
W
L
 
V
G
 
G
L
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
R
H
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
M
L
 
M
D
 
D
G
 
G
F
 
L
A
 
E
T
 
N
P
 
K
T
 
T
A
 
I
L
 
L
T
 
Y
E
 
N
M
 
K
L
 
V
L
 
L
S
 
K
H
 
T
L
 
I
G
 
N
V
 
V
K
 
K
D
 
D
A
 
L
L
 
D
G
 
E
I
 
L
V
 
V
E
 
-
H
 
-
L
 
M
A
 
W
G
 
S
K
 
Y
S
 
T
S
 
S
S
 
S
C
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
L
Y
 
V
A
|
A
Q
x
S
L
 
I
A
|
A
R
x
K
N
 
A
V
 
V
L
x
D
D
 
E
C
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
 
K
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Y
 
L
I
 
L
S
 
A
E
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
M
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9UJ70 N-acetyl-D-glucosamine kinase; N-acetylglucosamine kinase; GlcNAc kinase; Muramyl dipeptide kinase; N-acetyl-D-mannosamine kinase; EC 2.7.1.59; EC 2.7.1.-; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
25% identity, 81% coverage: 11:254/300 of query aligns to 4:258/344 of Q9UJ70

query
sites
Q9UJ70
L
 
I
F
 
Y
I
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
T
K
 
R
C
 
S
R
 
E
A
 
V
T
 
L
I
 
L
Y
 
V
T
 
S
A
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
E
G
 
A
V
 
D
A
 
G
G
 
L
R
 
S
A
 
T
N
|
N
P
 
H
-
x
W
L
 
L
H
 
I
G
 
G
L
 
T
A
 
D
Q
 
K
T
 
C
F
 
V
E
 
E
S
 
R
I
 
I
E
 
N
A
 
E
S
 
M
A
 
V
H
 
N
Q
 
R
A
 
A
L
 
K
L
 
R
D
 
K
A
|
A
G
 
G
M
 
V
K
 
D
A
 
P
T
 
L
D
 
-
S
 
V
H
 
P
L
 
L
L
 
R
V
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
A
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
Q
V
 
E
N
 
D
V
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
L
Q
 
I
D
 
E
V
 
E
V
 
L
N
 
R
W
 
D
Q
 
R
H
 
F
P
 
P
F
 
Y
-
 
L
A
 
S
A
 
E
M
 
S
Y
 
Y
V
 
L
T
 
I
T
 
T
D
 
T
L
x
D
H
 
A
T
 
A
A
 
G
C
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
T
H
 
A
R
 
T
G
 
P
A
 
D
D
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
|
S
-
x
N
C
 
C
G
 
R
Y
 
L
A
 
I
H
 
N
V
 
P
G
 
D
D
 
G
A
 
S
S
 
E
L
 
S
S
 
G
I
 
C
G
 
G
G
|
G
H
x
W
G
|
G
F
 
H
A
 
M
L
 
M
G
 
G
D
|
D
K
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
Y
W
 
W
L
 
I
G
 
A
L
 
H
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
E
 
K
H
 
I
V
 
V
L
 
F
L
 
D
A
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
N
F
 
L
-
 
E
A
 
A
T
 
A
P
 
P
T
 
H
A
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
T
 
K
E
 
Q
M
 
A
L
 
M
L
 
F
S
 
H
H
 
Y
L
 
F
G
 
Q
V
 
V
K
 
P
D
 
D
A
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
E
 
T
H
 
H
L
 
L
A
x
Y
G
 
R
K
 
D
S
 
F
S
 
D
S
 
K
C
 
C
-
 
R
Y
 
F
A
 
A
Q
 
G
L
 
F
A
 
C
R
 
R
N
 
K
V
 
I
L
 
A
D
 
E
C
 
G
A
 
A
N
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
V
 
L
A
 
S
I
 
R
A
 
Y
I
 
I
V
 
F
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
A
 
G
D
 
E
Y
 
M
I
 
L
-
 
G
S
 
R
E
 
H
M
 
I
A
 
V
R
 
A
K
 
V
L
 
L
F
 
P
M
 
E
L
 
I
N
 
D
P
 
P
V
 
V
R
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2ch6A Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with adp and glucose (see paper)
25% identity, 81% coverage: 11:254/300 of query aligns to 3:257/343 of 2ch6A

query
sites
2ch6A
L
 
I
F
 
Y
I
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
K
 
R
C
 
S
R
 
E
A
 
V
T
 
L
I
 
L
Y
 
V
T
 
S
A
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
E
G
 
A
V
 
D
A
 
G
G
 
L
R
 
S
A
 
T
N
 
N
P
 
H
-
 
W
L
 
L
H
 
I
G
 
G
L
 
T
A
 
D
Q
 
K
T
 
C
F
 
V
E
 
E
S
 
R
I
 
I
E
 
N
A
 
E
S
 
M
A
 
V
H
 
N
Q
 
R
A
 
A
L
 
K
L
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
D
A
 
P
T
 
L
D
 
-
S
 
V
H
 
P
L
 
L
L
 
R
V
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
A
 
S
G
 
G
-
x
G
-
 
D
-
 
Q
V
 
E
N
 
D
V
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
L
Q
 
I
D
 
E
V
 
E
V
 
L
N
 
R
W
 
D
Q
 
R
H
 
F
P
 
P
F
 
Y
-
 
L
A
 
S
A
 
E
M
 
S
Y
 
Y
V
 
L
T
 
I
T
 
T
D
 
T
L
x
D
H
 
A
T
 
A
A
 
G
C
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
T
H
 
A
R
 
T
G
 
P
A
 
D
D
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
S
G
|
G
T
|
T
G
|
G
S
|
S
-
x
N
C
 
C
G
 
R
Y
 
L
A
 
I
H
 
N
V
 
P
G
 
D
D
 
G
A
 
S
S
 
E
L
 
S
S
 
G
I
 
C
G
 
G
G
|
G
H
 
W
G
|
G
F
 
H
A
 
M
L
 
M
G
 
G
D
|
D
K
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
Y
W
 
W
L
 
I
G
 
A
L
 
H
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
E
 
K
H
 
I
V
 
V
L
 
F
L
 
D
A
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
N
F
 
L
-
 
E
A
 
A
T
 
A
P
 
P
T
 
H
A
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
T
 
K
E
 
Q
M
 
A
L
 
M
L
 
F
S
 
H
H
 
Y
L
 
F
G
 
Q
V
 
V
K
 
P
D
 
D
A
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
E
 
T
H
 
H
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
K
 
D
S
 
F
S
 
D
S
 
K
C
 
C
-
 
R
Y
 
F
A
|
A
Q
 
G
L
 
F
A
x
C
R
|
R
N
 
K
V
 
I
L
 
A
D
 
E
C
 
G
A
 
A
N
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
V
 
L
A
 
S
I
 
R
A
 
Y
I
 
I
V
 
F
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
A
 
G
D
 
E
Y
 
M
I
 
L
-
 
G
S
 
R
E
 
H
M
 
I
A
 
V
R
 
A
K
 
V
L
 
L
F
 
P
M
 
E
L
 
I
N
 
D
P
 
P
V
 
V
R
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P81799 N-acetyl-D-glucosamine kinase; N-acetylglucosamine kinase; GlcNAc kinase; Muramyl dipeptide kinase; N-acetyl-D-mannosamine kinase; EC 2.7.1.59; EC 2.7.1.-; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
26% identity, 81% coverage: 11:254/300 of query aligns to 4:258/343 of P81799

query
sites
P81799
L
 
L
F
 
Y
I
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
T
K
 
R
C
 
S
R
 
K
A
 
V
T
 
L
I
 
L
Y
 
L
T
 
S
A
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
V
 
I
L
 
L
G
 
A
T
 
E
G
 
A
V
 
D
A
 
G
G
 
L
R
 
S
A
 
T
N
 
N
P
 
H
-
 
W
L
 
L
H
 
I
G
 
G
L
 
T
A
 
G
Q
 
T
T
 
C
F
 
V
E
 
E
S
 
R
I
 
I
E
 
N
A
 
E
S
 
M
A
 
V
H
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
K
L
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
D
A
 
P
T
 
L
D
 
-
S
 
V
H
 
P
L
 
L
L
 
R
V
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
L
 
L
A
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
V
 
E
N
 
D
V
 
A
P
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
Q
 
M
D
 
E
V
 
E
V
 
L
N
 
R
W
 
D
Q
 
R
H
 
F
P
 
P
F
 
Y
-
 
L
-
 
S
A
 
E
A
 
S
M
 
Y
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
T
 
T
D
 
D
L
 
A
H
 
-
T
 
A
A
 
G
C
 
S
I
 
I
G
 
A
A
 
T
H
 
A
R
 
T
G
 
P
A
 
D
D
 
G
G
 
G
A
 
I
V
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
-
 
N
C
 
C
G
 
R
Y
 
L
A
 
I
H
 
N
V
 
P
G
 
D
D
 
G
A
 
S
S
 
E
L
 
S
S
 
G
I
 
C
G
 
G
G
 
G
H
 
W
G
 
G
F
 
H
A
 
M
L
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
Y
W
 
W
L
 
I
G
 
A
L
 
H
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
E
 
K
H
 
I
V
 
V
L
 
F
L
 
D
A
 
S
L
 
I
D
 
D
G
 
N
F
 
L
-
 
E
A
 
A
T
 
A
P
 
P
T
 
H
A
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
H
-
 
V
T
 
K
E
 
Q
M
 
A
L
 
M
L
 
F
S
 
N
H
 
Y
L
 
F
G
 
Q
V
 
V
K
 
P
D
 
D
A
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
E
 
T
H
 
H
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
K
 
D
-
 
F
S
 
D
S
 
K
S
 
S
C
 
K
Y
 
F
A
 
A
Q
 
G
L
 
F
A
 
C
R
 
Q
N
 
K
V
 
I
L
 
A
D
 
E
C
 
G
A
 
A
N
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
Q
 
P
V
 
L
A
 
S
I
 
R
A
 
F
I
 
I
V
 
F
Q
 
R
E
 
K
G
 
A
A
 
G
D
 
E
Y
 
M
I
 
L
-
 
G
S
 
R
E
 
H
M
 
V
A
 
V
R
 
A
K
 
V
L
 
L
F
 
P
M
 
E
L
 
I
N
 
D
P
 
P
V
 
V
R
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>202608 SO3507 conserved hypothetical protein (NCBI ptt file)
MGLVQTNDQQLFIGVDGGGSKCRATIYTADGTVLGTGVAGRANPLHGLAQTFESIEASAH
QALLDAGMKATDSHLLVAGLGLAGVNVPRLYQDVVNWQHPFAAMYVTTDLHTACIGAHRG
ADGAVIITGTGSCGYAHVGDASLSIGGHGFALGDKGSGAWLGLKAAEHVLLALDGFATPT
ALTEMLLSHLGVKDALGIVEHLAGKSSSCYAQLARNVLDCANAGDQVAIAIVQEGADYIS
EMARKLFMLNPVRFSMIGGLAEPLQAWLGSDVVAKISETLAPPELGAMYYAQQQFNSATV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory