SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 203460 FitnessBrowser__MR1:203460 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7caxD Crystal structure of bacterial reductase
63% identity, 100% coverage: 2:241/241 of query aligns to 1:238/238 of 7caxD

query
sites
7caxD
N
 
T
N
 
R
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
F
D
 
D
I
 
V
A
 
T
L
 
V
H
|
H
Y
 
A
H
x
R
S
|
S
N
x
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
A
 
A
D
 
E
A
 
Q
S
 
V
A
 
V
A
 
Q
E
 
E
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
N
 
N
V
 
S
S
 
H
L
 
Y
L
 
L
K
 
M
F
 
F
D
|
D
V
|
V
A
 
N
D
 
E
R
 
R
V
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
 
Q
A
 
Q
A
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
D
 
D
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
N
 
T
R
 
H
D
 
D
N
 
G
A
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
L
S
 
T
E
 
D
A
 
Q
E
 
D
W
 
W
D
 
D
S
 
E
V
 
V
I
 
I
H
 
S
T
 
T
N
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
I
 
L
H
 
K
P
 
P
C
 
L
V
 
I
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
I
Q
 
H
A
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
R
K
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
C
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
L
I
|
I
E
 
E
T
 
T
D
 
E
M
 
M
V
 
-
A
 
-
D
 
D
I
 
E
P
 
V
K
 
K
D
 
E
M
 
H
V
 
A
E
 
L
Q
 
K
L
 
M
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
Q
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
Q
P
 
V
N
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
K
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
I

4iiuA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase from escherichia coli strain cft073 complexed with NADP+ at 2.1 a resolution
62% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 1:243/243 of 4iiuA

query
sites
4iiuA
M
 
M
N
 
S
N
 
R
R
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
R
K
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
D
G
 
G
H
 
F
D
 
N
I
 
I
A
 
G
L
 
V
H
|
H
Y
 
Y
H
|
H
S
 
R
N
x
D
Q
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
D
 
Q
A
 
E
S
 
T
A
 
L
A
 
N
E
 
A
L
 
I
R
 
V
A
 
A
L
 
N
G
 
G
V
 
G
N
 
N
V
 
G
S
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
S
F
 
F
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
N
R
 
R
V
 
E
A
 
Q
V
 
C
R
 
R
A
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
H
D
 
E
I
 
I
E
 
A
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
A
 
A
Y
 
W
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
A
R
 
R
D
 
D
N
 
A
A
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
L
S
 
S
E
 
N
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
H
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
S
F
 
F
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
I
 
I
H
 
Q
P
 
P
C
 
C
V
 
I
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
I
Q
 
G
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
R
K
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
C
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
L
I
|
I
E
 
D
T
|
T
D
 
G
M
|
M
V
x
I
A
 
E
D
 
M
I
 
E
P
 
E
K
 
S
D
 
A
M
 
L
V
 
K
E
 
E
-
 
A
-
 
M
Q
 
S
L
 
M
V
 
I
P
 
P
M
 
M
R
 
K
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
Q
P
 
A
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
M
 
M
S
 
S
D
 
D
D
 
I
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
L

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
47% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 5:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
H
 
Y
D
 
N
I
 
V
A
 
A
L
 
V
H
x
N
Y
|
Y
H
x
A
S
x
G
N
x
S
Q
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
K
A
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
S
S
 
F
L
 
A
L
 
I
K
 
Q
F
x
A
D
x
N
V
|
V
A
 
A
D
 
D
R
 
A
V
 
D
A
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
M
L
 
I
E
 
K
A
 
E
D
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
Q
N
 
F
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
Y
 
D
G
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
H
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
V
Y
 
F
N
 
N
V
 
C
I
 
I
H
 
Q
P
 
K
C
 
A
V
 
T
M
 
P
P
 
Q
M
 
M
V
 
L
Q
 
R
A
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
-
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
D
 
E
I
 
L
P
 
K
K
 
E
D
 
Q
M
 
M
V
 
L
E
 
T
Q
 
Q
L
 
-
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
N
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
T
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
A
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
46% identity, 100% coverage: 1:240/241 of query aligns to 3:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
N
 
T
N
 
K
R
 
S
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
H
 
Y
D
 
N
I
 
V
A
 
A
L
 
V
H
 
N
Y
 
Y
H
 
A
S
 
G
N
 
S
Q
 
K
A
 
E
A
 
K
A
 
A
D
 
E
A
 
A
S
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
K
A
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
S
S
 
F
L
 
A
L
 
I
K
 
Q
F
 
A
D
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
A
V
 
D
A
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
M
L
 
I
E
 
K
A
 
E
D
 
V
I
 
V
E
 
S
A
 
Q
N
 
F
G
 
G
A
 
S
Y
 
L
Y
 
D
G
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
H
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
V
Y
 
F
N
 
N
V
 
C
I
 
I
H
 
Q
P
 
K
C
 
A
V
 
T
M
 
P
P
 
Q
M
 
M
V
 
L
Q
 
R
A
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
-
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
A
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
D
 
A
I
 
L
P
 
S
K
 
D
D
 
E
M
 
L
V
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
N
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
T
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
K
A
 
A
A
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
I
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
39% identity, 97% coverage: 6:239/241 of query aligns to 5:241/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
S
 
M
R
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
K
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
S
L
 
I
K
 
R
L
 
L
A
 
N
A
 
D
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
H
 
T
Y
|
Y
H
x
S
S
 
P
N
 
N
Q
x
N
A
 
T
A
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
R
S
 
W
A
 
L
A
 
T
E
 
E
L
 
M
R
 
H
A
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
R
N
 
E
V
 
F
S
 
H
L
 
A
L
 
Y
K
 
P
F
x
V
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
D
R
 
H
V
 
D
A
 
S
V
 
C
R
 
Q
A
 
Q
A
 
C
L
 
I
E
 
E
A
 
K
D
 
I
I
 
V
E
 
R
A
 
D
N
 
V
G
 
G
A
 
P
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
M
A
 
T
F
 
L
P
 
R
A
 
K
M
 
L
S
 
D
E
 
K
A
 
V
E
x
N
W
 
W
D
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
R
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
S
F
 
V
Y
 
F
N
 
N
V
 
M
I
 
T
H
 
K
P
 
P
C
 
V
V
 
C
M
 
D
P
 
G
M
 
M
V
 
V
Q
 
E
A
 
-
R
 
R
K
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
T
 
N
L
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
S
 
N
G
 
G
I
 
S
A
 
K
G
 
G
N
 
S
R
 
V
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
I
 
H
G
 
G
A
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
K
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
T
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
I
 
L
E
 
A
T
 
T
D
 
K
M
 
M
V
 
V
A
 
T
D
 
A
I
 
I
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
M
 
I
V
 
L
E
 
D
Q
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
P
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
M
 
C
S
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
R
 
G
Q
 
S
V
 
N
I
 
I
S
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
45% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 16:251/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
A
D
 
-
I
 
V
A
 
V
L
 
I
H
 
G
Y
 
T
H
 
A
S
x
T
N
 
S
Q
 
A
A
 
S
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
K
S
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
N
G
 
G
V
 
V
N
 
E
V
 
G
S
 
A
L
 
G
L
 
L
K
 
V
F
x
L
D
|
D
V
|
V
A
 
S
D
 
S
R
 
D
V
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
H
D
 
I
I
 
Q
E
 
Q
A
 
H
N
 
L
G
 
G
A
 
Q
Y
 
P
Y
 
L
G
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
V
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
F
S
 
D
V
 
V
I
 
V
H
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
N
G
 
S
F
 
L
Y
 
Y
N
 
R
V
 
L
I
 
S
H
 
K
P
 
A
C
 
V
V
 
L
M
 
R
P
 
G
M
 
M
V
 
T
Q
 
K
A
 
A
R
 
R
K
 
W
G
 
G
G
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
x
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
G
 
G
A
 
F
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
K
 
S
R
 
R
K
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
V
x
T
A
 
R
D
 
E
I
 
L
P
 
P
K
 
E
D
 
A
M
 
Q
V
 
R
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
A
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
R
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:240/241 of query aligns to 4:242/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
C
D
 
K
I
 
V
A
 
L
L
 
V
H
x
N
Y
|
Y
H
x
A
S
x
R
N
x
S
Q
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
E
S
 
V
A
 
S
A
 
K
E
 
Q
L
 
I
R
 
E
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
V
 
G
N
 
Q
V
 
A
S
 
I
L
 
T
L
 
F
K
 
G
F
 
G
D
|
D
V
|
V
A
 
S
D
 
K
R
 
E
V
 
A
A
 
D
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
M
L
 
M
E
 
K
A
 
T
D
 
A
I
 
I
E
 
D
A
 
A
N
 
W
G
 
G
A
 
T
Y
 
I
Y
 
D
G
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
T
A
 
L
F
 
L
P
 
I
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
K
A
 
S
E
 
Q
W
 
W
D
 
D
S
 
E
V
 
V
I
 
I
H
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
F
 
V
Y
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
T
H
 
Q
P
 
A
C
 
A
V
 
T
M
 
K
P
 
I
M
 
M
V
 
M
Q
 
K
A
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
R
 
I
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
T
L
 
A
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
N
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
C
 
V
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
E
 
A
T
x
S
D
 
D
M
|
M
V
 
T
A
 
A
D
 
K
I
 
L
P
 
G
K
 
E
D
 
D
M
 
M
V
 
E
E
 
K
Q
 
K
L
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
T
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
N
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
E
F
 
F
L
 
L
-
 
A
M
 
L
S
 
S
D
 
P
D
 
A
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
Q
V
 
A
I
 
F
S
 
T
V
 
I
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 9:241/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
L
x
T
H
 
S
Y
 
E
H
 
S
S
 
G
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
N
V
 
G
S
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
M
F
x
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
R
 
P
V
 
A
A
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
S
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
N
D
 
V
I
 
R
E
 
A
A
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
E
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
F
 
V
Y
 
F
N
 
R
V
 
-
I
 
L
H
 
S
P
 
K
C
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
R
M
 
A
V
 
M
Q
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
A
V
 
L
A
 
T
D
 
D
I
 
E
P
 
Q
K
 
R
D
 
A
M
 
G
V
 
T
E
 
L
Q
 
A
L
 
A
V
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
T
P
 
P
N
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 8:240/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
L
x
T
H
 
S
Y
 
E
H
 
N
S
 
G
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
N
V
 
G
S
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
M
F
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
R
 
P
V
 
A
A
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
S
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
I
I
 
R
E
 
A
A
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
E
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
E
E
|
E
W
 
W
D
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
F
 
V
Y
 
F
N
 
R
V
 
-
I
 
L
H
 
S
P
 
K
C
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
R
M
 
A
V
 
M
Q
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
G
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
V
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
D
 
A
I
 
L
P
 
S
K
 
D
D
 
D
M
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
G
V
 
I
E
 
L
Q
 
A
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
G
P
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
x
E
V
x
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
44% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 9:241/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
x
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
L
x
T
H
 
S
Y
 
E
H
 
N
S
 
G
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
N
V
 
G
S
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
M
F
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
R
 
P
V
 
A
A
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
S
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
I
I
 
R
E
 
A
A
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
E
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
F
 
V
Y
 
F
N
 
R
V
 
-
I
 
L
H
 
S
P
 
K
C
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
R
M
 
A
V
 
M
Q
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
|
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
D
 
A
I
 
L
P
 
S
K
 
D
D
 
D
M
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
G
V
 
I
E
 
L
Q
 
A
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
G
P
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
x
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 22:252/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
A
 
L
G
 
G
H
 
-
D
 
A
I
 
V
A
 
V
L
 
I
H
 
G
Y
 
T
H
 
A
S
 
T
N
 
S
Q
 
A
A
 
S
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
K
S
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
N
G
 
G
V
 
V
N
 
E
V
 
G
S
 
A
L
 
G
L
 
L
K
 
V
F
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
R
 
D
V
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
H
D
 
I
I
 
Q
E
 
Q
A
 
H
N
 
L
G
 
G
A
 
Q
Y
 
P
Y
 
L
G
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
V
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
F
S
 
D
V
 
V
I
x
V
H
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
D
 
N
G
 
S
F
 
L
Y
 
Y
N
 
R
V
 
L
I
 
S
H
 
K
P
 
A
C
 
V
V
 
L
M
 
R
P
 
G
M
 
M
V
 
T
Q
 
K
A
 
A
R
 
R
K
 
W
G
 
G
G
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
 
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
G
|
G
A
x
F
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
K
 
S
R
 
R
K
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
D
 
E
I
 
A
P
 
Q
K
 
R
D
 
E
M
 
A
V
 
L
E
 
L
Q
 
G
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
A
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
R
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
S
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 8:240/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
|
A
L
x
T
H
 
S
Y
 
E
H
 
N
S
 
G
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
N
V
 
G
S
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
M
F
x
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
R
 
P
V
 
A
A
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
S
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
K
D
 
I
I
 
R
E
 
A
A
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
E
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
F
 
V
Y
 
F
N
 
R
V
 
-
I
 
L
H
 
S
P
 
K
C
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
R
M
 
A
V
 
M
Q
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
G
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
G
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
x
F
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
D
 
A
I
 
L
P
 
S
K
 
D
D
 
D
M
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
G
V
 
I
E
 
L
Q
 
A
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
G
P
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
44% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 9:241/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
A
 
I
L
 
G
H
 
T
Y
 
A
H
 
T
S
 
S
N
 
E
Q
 
N
A
 
G
A
 
A
A
 
K
D
 
N
A
 
I
S
 
S
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
A
N
 
N
V
 
G
S
 
K
L
 
G
L
 
L
K
 
M
F
 
L
D
 
N
V
 
V
A
 
T
D
 
D
R
 
P
V
 
A
A
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
S
A
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
N
D
 
I
I
 
R
E
 
A
A
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
E
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
D
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
H
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
F
 
V
Y
 
F
N
 
R
V
 
-
I
 
L
H
 
S
P
 
K
C
 
A
V
 
V
M
 
M
P
 
R
M
 
A
V
x
M
Q
 
M
A
 
K
R
 
K
K
 
R
G
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
S
K
 
K
A
 
S
L
 
L
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
R
D
 
A
I
 
L
P
 
S
K
 
D
D
 
D
M
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
G
V
 
I
E
 
L
Q
 
A
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
G
P
 
A
N
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
x
A
S
|
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
43% identity, 98% coverage: 6:241/241 of query aligns to 9:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
I
K
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
G
H
 
A
D
 
N
I
 
I
A
 
F
L
 
F
H
x
N
Y
|
Y
H
x
N
S
x
G
N
x
S
Q
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
E
S
 
T
A
 
A
A
 
K
E
 
L
L
 
V
R
 
A
A
 
E
L
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
E
V
 
V
S
 
E
L
 
A
L
 
M
K
 
K
F
 
A
D
x
N
V
|
V
A
 
A
D
 
I
R
 
A
V
 
E
A
 
D
V
 
V
R
 
D
A
 
A
A
 
F
L
 
F
E
 
K
A
 
Q
D
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
R
N
 
F
G
 
G
A
 
R
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
H
 
N
T
x
I
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
T
Y
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
T
H
 
K
P
 
A
C
 
V
V
 
S
M
 
R
P
 
T
M
 
M
V
 
M
Q
 
K
A
 
Q
R
 
R
K
 
-
G
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
 
M
A
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
T
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
P
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
D
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
D
 
K
I
 
L
P
 
D
K
 
E
D
 
K
M
 
T
V
 
K
E
 
E
Q
 
A
L
 
M
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
T
N
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
A
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
A
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
Q
V
 
T
I
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
I
 
V

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 12:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
L
x
T
H
 
S
Y
 
E
H
 
S
S
 
G
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
S
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
V
 
D
N
 
N
V
 
G
S
 
K
L
 
G
L
 
M
K
 
A
F
 
L
D
x
N
V
|
V
A
 
T
D
 
N
R
 
P
V
 
E
A
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
K
A
 
A
D
 
I
I
 
T
E
 
D
A
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
G
Y
 
V
Y
 
D
G
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
M
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
E
A
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
S
S
 
D
V
 
I
I
 
M
H
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
F
 
I
Y
 
F
N
 
R
V
 
L
I
 
S
H
 
K
P
 
A
C
 
V
V
 
L
M
 
R
P
 
G
M
 
M
V
 
M
Q
 
K
A
 
K
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
G
 
-
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
 
V
A
x
G
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
M
S
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
M
 
M
V
 
-
A
 
N
D
 
D
I
 
E
P
 
Q
K
 
R
D
 
T
M
 
A
V
 
T
E
 
L
Q
 
A
L
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
N
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
E
V
 
T
I
 
L
S
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
39% identity, 98% coverage: 6:240/241 of query aligns to 5:242/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
S
 
M
R
x
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
S
L
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
D
A
 
A
G
 
G
H
 
M
D
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
V
H
 
S
Y
x
H
H
x
S
S
 
E
N
 
R
Q
x
N
A
 
D
A
 
H
A
 
V
D
 
S
A
 
T
S
 
W
A
 
L
A
 
M
E
 
H
L
 
E
R
 
R
A
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
R
N
 
D
V
 
F
S
 
K
L
 
A
L
 
Y
K
 
A
F
x
V
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
D
R
 
F
V
 
E
A
 
S
V
 
C
R
 
E
A
 
R
A
 
C
L
 
A
E
 
E
A
 
K
D
 
V
I
 
L
E
 
A
A
 
D
N
 
F
G
 
G
A
 
K
Y
 
V
Y
 
D
G
 
V
V
 
L
V
 
I
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
A
A
 
T
F
 
F
P
 
M
A
 
K
M
 
M
S
 
T
E
 
K
A
 
G
E
x
D
W
 
W
D
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
M
H
 
R
T
 
T
N
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
A
F
 
M
Y
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
T
H
 
K
P
 
Q
C
 
F
V
 
I
M
 
A
P
 
G
M
 
M
V
 
V
Q
 
E
A
 
-
R
 
R
K
 
R
G
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
T
 
N
L
x
I
A
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
N
G
 
G
I
 
S
A
 
R
G
 
G
N
 
A
R
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
H
G
 
G
A
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
L
S
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
K
 
K
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
L
x
Y
I
x
L
E
 
A
T
|
T
D
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
E
D
 
A
I
 
V
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
M
 
V
V
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
L
Q
 
P
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
M
 
V
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
N
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
R
 
G
Q
 
A
V
 
D
I
 
L
S
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
45% identity, 100% coverage: 1:241/241 of query aligns to 3:238/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
N
 
T
N
 
D
R
 
R
V
 
I
-
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
H
 
A
D
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
V
H
 
N
Y
 
Y
H
x
A
S
|
S
N
x
S
Q
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
S
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
G
N
 
E
V
 
A
S
 
F
L
 
A
L
 
V
K
 
K
F
x
A
D
|
D
V
|
V
A
 
S
D
 
Q
R
 
E
V
 
S
A
 
E
V
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
L
L
 
F
E
 
A
A
 
A
D
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
R
N
 
W
G
 
G
A
 
R
Y
 
L
Y
 
D
G
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
N
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
T
A
 
L
F
 
L
P
 
L
A
 
R
M
 
M
S
 
K
E
 
R
A
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
L
H
 
D
T
x
L
N
 
N
L
 
L
D
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
F
N
 
L
V
 
C
I
 
S
H
 
R
P
 
A
C
 
A
V
 
A
M
 
K
P
 
I
M
 
M
V
 
L
Q
 
K
A
 
Q
R
 
R
K
 
S
G
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
T
 
N
L
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
R
 
P
G
 
G
Q
|
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
V
S
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
S
R
 
R
K
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
C
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
D
 
D
M
|
M
V
 
T
A
 
S
D
 
L
I
 
L
P
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
E
L
 
V
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
E
P
 
A
N
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
V
A
 
R
F
 
F
L
 
L
M
 
A
S
 
A
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
R
 
G
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
N
V
 
I
N
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
I
 
V