SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 206505 DVU1070 branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
35% identity, 91% coverage: 34:509/524 of query aligns to 4:484/501 of P04983

query
sites
P04983
V
 
L
V
 
L
R
 
Q
L
 
L
E
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
S
 
A
F
 
F
G
 
P
P
 
G
V
 
V
R
 
K
A
 
A
N
 
L
H
 
S
D
 
G
I
 
A
T
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
V
V
 
Y
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
V
K
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
M
 
M
S
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
I
L
 
Y
A
 
T
Q
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
I
 
T
I
 
L
H
 
L
V
 
W
D
 
L
G
 
G
E
 
K
A
 
E
V
 
T
R
 
T
F
 
F
R
 
T
S
 
G
P
 
P
K
 
K
D
 
S
A
 
S
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
I
V
 
I
Y
 
H
Q
 
Q
H
 
E
F
 
L
M
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
P
S
 
Q
M
 
L
T
 
T
V
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
L
 
F
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
S
 
E
G
 
F
A
 
V
-
 
N
W
 
R
L
 
F
S
 
G
P
 
K
V
 
I
H
 
D
M
 
W
S
 
K
R
 
T
V
 
M
V
 
Y
A
 
A
E
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
R
I
 
F
D
 
K
P
 
S
A
 
D
A
 
K
R
 
L
V
 
V
C
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
S
M
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
A
K
 
K
L
 
V
L
 
L
Y
 
S
R
 
F
D
 
E
S
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
D
G
 
T
E
 
E
T
 
T
E
 
E
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
E
 
R
A
 
V
L
 
I
H
 
R
R
 
E
M
 
L
A
 
K
E
 
S
N
 
Q
G
 
G
K
 
R
A
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
Y
I
 
I
S
 
S
H
 
H
K
 
R
M
 
M
Q
 
K
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
E
L
 
I
A
 
C
D
 
D
E
 
D
I
 
V
A
 
T
I
 
V
L
 
F
R
 
R
R
 
D
G
 
G
E
 
Q
V
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
E
F
 
-
H
 
R
E
 
E
S
 
V
E
 
A
V
 
S
P
 
L
G
 
T
E
 
E
A
 
D
E
 
S
L
 
L
A
 
I
N
 
E
R
 
M
M
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
R
E
 
K
V
 
L
I
 
E
L
 
D
E
 
Q
V
 
Y
A
 
P
A
 
H
E
 
L
P
 
D
L
 
K
E
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
I
V
 
R
L
 
L
H
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
N
L
 
L
A
 
C
G
 
G
D
 
P
G
 
G
L
 
V
K
 
N
G
 
D
L
 
V
S
 
S
F
 
F
E
 
T
V
 
L
R
 
R
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
L
A
 
G
I
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
M
G
 
G
N
 
A
G
 
G
Q
 
R
R
 
T
E
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
K
C
 
V
V
 
L
T
 
Y
G
 
G
L
 
A
R
 
L
R
 
P
P
 
R
A
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
Y
V
 
V
E
 
T
L
 
L
L
 
D
G
 
G
I
 
-
P
 
-
W
 
-
R
 
H
Q
 
E
F
 
V
F
 
V
T
 
T
K
 
R
A
 
S
P
 
P
R
 
Q
Q
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
N
G
 
G
L
 
I
A
 
V
Y
 
Y
I
 
I
P
 
S
E
 
E
D
 
D
R
 
R
Q
 
K
G
 
R
L
 
D
A
 
G
T
 
L
C
 
V
L
 
L
S
 
G
L
 
M
D
 
S
L
 
V
V
 
K
D
 
E
N
 
N
F
 
M
L
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
R
 
L
G
 
R
C
 
Y
F
 
F
T
 
S
R
 
R
-
 
A
G
 
G
P
 
G
F
 
S
L
 
L
D
 
K
R
 
H
K
 
A
S
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
V
R
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
I
A
 
R
E
 
L
Y
 
F
N
 
N
V
 
V
Q
 
K
P
 
T
G
 
P
R
 
S
A
 
M
E
 
E
A
 
Q
P
 
A
A
 
I
R
 
G
S
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
V
 
A
V
 
I
G
 
A
R
 
R
E
 
G
F
 
L
Y
 
M
R
 
T
K
 
R
P
 
P
S
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
L
E
 
D
N
 
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
G
A
 
A
T
 
K
E
 
K
E
 
E
V
 
I
W
 
Y
A
 
Q
R
 
L
L
 
I
L
 
N
E
 
Q
V
 
F
R
 
K
S
 
A
H
 
D
A
 
G
-
 
L
G
 
S
V
 
I
L
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
S
D
 
E
L
 
M
N
 
P
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
I
V
 
V
M
 
M
Y
 
H
R
 
E
G
 
G
C
 
H
F
 
L
I
 
S
G
 
G
L
 
E
L
 
F
D
 
T
R
 
R
S
 
E
D
 
Q
T
 
A
N
 
T
K
 
Q

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
30% identity, 42% coverage: 33:254/524 of query aligns to 1:223/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
V
 
I
V
 
I
R
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
N
I
 
L
G
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
R
 
H
A
x
V
N
 
L
H
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
H
L
 
L
D
 
E
I
 
V
V
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
E
I
 
K
K
 
L
A
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
R
I
 
T
L
 
I
S
 
N
G
 
R
R
 
L
L
 
E
A
 
D
Q
 
F
D
 
Q
T
 
E
G
 
G
I
 
E
I
 
V
H
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
L
A
 
S
V
 
V
R
 
K
F
 
D
R
 
D
S
 
R
P
 
A
K
 
L
D
 
R
A
 
E
L
 
I
K
 
R
A
 
R
G
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
T
L
 
L
G
 
A
Q
 
P
S
 
M
G
 
R
A
 
V
W
 
R
L
 
R
S
 
W
P
 
P
V
 
R
H
 
E
M
 
K
S
 
A
R
 
E
V
 
K
V
 
K
A
 
A
-
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
E
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
L
 
I
D
 
-
I
 
L
D
 
D
P
 
Q
A
 
A
A
 
R
R
 
K
V
 
Y
-
 
P
C
 
A
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
M
D
 
E
S
 
P
R
 
K
V
 
I
L
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
V
 
A
L
 
L
T
 
D
P
 
P
G
 
E
E
 
M
T
 
V
E
 
G
Q
 
E
L
 
V
F
 
L
E
 
D
A
 
V
L
 
M
H
 
R
R
 
D
M
 
L
A
 
A
E
 
Q
N
 
G
G
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
M
 
M
Q
 
G
E
 
F
V
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
F
L
 
M
R
 
D
R
 
G
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
E
F
 
G
H
 
R
E
 
P
S
 
E
E
 
E
V
 
I

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 46% coverage: 34:273/524 of query aligns to 1:249/343 of P30750

query
sites
P30750
V
 
M
V
 
I
R
 
K
L
 
L
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
T
K
 
K
S
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
H
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
R
I
 
C
L
 
V
S
 
N
G
 
L
R
 
L
L
 
E
A
 
R
Q
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
I
 
S
I
 
V
H
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
R
 
T
F
 
T
R
 
L
S
 
S
P
 
E
K
 
S
D
 
E
A
 
L
L
 
T
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
A
L
 
L
G
 
P
Q
 
L
S
 
E
G
 
L
A
 
D
W
 
N
L
 
T
S
 
P
P
 
K
V
 
D
H
 
E
M
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
R
V
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
S
R
 
L
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
G
I
 
D
D
 
K
P
 
H
A
 
D
A
 
S
R
 
Y
V
 
P
C
 
S
D
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
V
 
A
L
 
L
T
 
D
P
 
P
G
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
Q
 
S
L
 
I
F
 
L
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
K
R
 
D
M
 
I
A
 
N
E
 
R
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
L
A
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
K
 
E
M
 
M
Q
 
D
E
 
V
V
 
V
L
 
K
A
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
E
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
F
 
D
H
 
T
E
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
G
 
S
E
 
H
A
 
P
E
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
R
 
K
M
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
S
E
 
T
V
 
L
I
 
H
L
 
L
E
 
D
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
30% identity, 46% coverage: 34:273/524 of query aligns to 2:250/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
V
 
M
V
 
I
R
 
K
L
 
L
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
H
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
R
I
 
C
L
 
V
S
 
N
G
 
L
R
 
L
L
 
E
A
 
R
Q
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
I
 
S
I
 
V
H
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
R
 
T
F
 
T
R
 
L
S
 
S
P
 
E
K
 
S
D
 
E
A
 
L
L
 
T
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
A
L
 
L
G
 
P
Q
 
L
S
 
E
G
 
L
A
 
D
W
 
N
L
 
T
S
 
P
P
 
K
V
 
D
H
 
E
M
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
R
V
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
S
R
 
L
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
G
I
 
D
D
 
K
P
 
H
A
 
D
A
 
S
R
 
Y
V
 
P
C
 
S
D
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
V
 
A
L
 
L
T
 
D
P
 
P
G
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
Q
 
S
L
 
I
F
 
L
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
K
R
 
D
M
 
I
A
 
N
E
 
R
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
L
A
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
K
 
E
M
 
M
Q
 
D
E
 
V
V
 
V
L
 
K
A
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
E
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
F
 
D
H
 
T
E
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
G
 
S
E
 
H
A
 
P
E
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
R
 
K
M
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
S
E
 
T
V
 
L
I
 
H
L
 
L
E
 
D
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
30% identity, 46% coverage: 34:273/524 of query aligns to 2:250/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
V
 
M
V
 
I
R
 
K
L
 
L
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
H
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
R
I
 
C
L
 
V
S
 
N
G
 
L
R
 
L
L
 
E
A
 
R
Q
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
I
 
S
I
 
V
H
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
R
 
T
F
 
T
R
 
L
S
 
S
P
 
E
K
 
S
D
 
E
A
 
L
L
 
T
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
A
L
 
L
G
 
P
Q
 
L
S
 
E
G
 
L
A
 
D
W
 
N
L
 
T
S
 
P
P
 
K
V
 
D
H
 
E
M
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
R
V
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
S
R
 
L
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
G
I
 
D
D
 
K
P
 
H
A
 
D
A
 
S
R
 
Y
V
 
P
C
 
S
D
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
V
 
A
L
 
L
T
 
D
P
 
P
G
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
Q
 
S
L
 
I
F
 
L
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
K
R
 
D
M
 
I
A
 
N
E
 
R
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
L
A
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
K
 
E
M
 
M
Q
 
D
E
 
V
V
 
V
L
 
K
A
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
E
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
F
 
D
H
 
T
E
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
G
 
S
E
 
H
A
 
P
E
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
R
 
K
M
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
S
E
 
T
V
 
L
I
 
H
L
 
L
E
 
D
V
 
I

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
30% identity, 46% coverage: 34:273/524 of query aligns to 2:250/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
V
 
M
V
 
I
R
 
K
L
 
L
E
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
P
 
T
V
x
I
R
 
Q
A
 
A
N
 
L
H
 
N
D
 
N
I
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
P
P
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
R
I
 
C
L
 
V
S
 
N
G
 
L
R
 
L
L
 
E
A
 
R
Q
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
I
 
S
I
 
V
H
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
R
 
T
F
 
T
R
 
L
S
 
S
P
 
E
K
 
S
D
 
E
A
 
L
L
 
T
K
 
K
A
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
A
L
 
L
G
 
P
Q
 
L
S
 
E
G
 
L
A
 
D
W
 
N
L
 
T
S
 
P
P
 
K
V
 
D
H
 
E
M
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
R
V
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
S
R
 
L
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
G
I
 
D
D
 
K
P
 
H
A
 
D
A
 
S
R
 
Y
V
 
P
C
 
S
D
x
N
L
 
L
S
|
S
M
 
G
G
 
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
S
D
 
N
S
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
V
 
A
L
 
L
T
 
D
P
 
P
G
 
A
E
 
T
T
 
T
E
 
R
Q
 
S
L
 
I
F
 
L
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
K
R
 
D
M
 
I
A
 
N
E
 
R
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
L
A
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
H
|
H
K
 
E
M
 
M
Q
 
D
E
 
V
V
 
V
L
 
K
A
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
E
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
F
 
D
H
 
T
E
 
V
S
 
S
E
 
E
V
 
V
P
 
F
G
 
S
E
 
H
A
 
P
E
 
K
-
 
T
-
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
R
 
K
M
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
S
E
 
T
V
 
L
I
 
H
L
 
L
E
 
D
V
 
I

7roqA Alternative structure of human abca1
31% identity, 37% coverage: 53:245/524 of query aligns to 790:979/1831 of 7roqA

query
sites
7roqA
I
 
L
T
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
F
V
 
Y
P
 
E
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
F
A
 
P
Q
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
A
H
 
Y
V
 
I
D
 
L
G
 
G
E
 
K
A
 
D
V
 
I
R
 
R
F
 
-
R
 
-
S
 
S
P
 
E
K
 
M
D
 
S
A
 
T
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
G
 
N
I
 
L
G
 
G
M
 
V
V
 
C
Y
 
P
Q
 
Q
H
 
H
F
 
N
M
 
V
L
 
L
V
 
F
D
 
D
S
 
M
M
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
E
N
 
H
V
 
I
L
 
W
L
 
F
G
 
Y
Q
 
A
S
 
R
G
 
L
A
 
K
W
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
V
 
K
H
 
H
M
 
V
S
 
K
R
 
A
V
 
E
V
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
L
R
 
D
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
S
D
 
K
P
 
L
A
 
K
A
 
S
R
 
K
V
 
T
C
 
S
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
Q
Q
 
R
R
 
K
V
 
L
E
 
S
I
 
V
L
 
A
K
 
L
L
 
A
L
 
F
Y
 
V
R
 
G
D
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
V
 
G
L
 
V
T
 
D
P
 
P
G
 
Y
E
 
S
T
 
R
E
 
R
Q
 
G
L
 
I
F
 
W
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
L
R
 
K
M
 
Y
A
 
R
E
 
Q
N
 
-
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
S
S
 
T
H
 
H
K
 
H
M
 
M
Q
 
D
E
 
E
V
 
A
L
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
G
D
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
S
R
 
H
G
 
G
E
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
25% identity, 45% coverage: 34:270/524 of query aligns to 4:248/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
V
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
N
I
 
I
G
 
V
K
 
K
S
 
Y
F
|
F
G
 
G
P
 
E
V
x
F
R
 
K
A
 
A
N
 
L
H
 
D
D
 
G
I
 
V
T
 
S
L
 
I
D
 
S
I
 
V
V
 
C
P
 
K
G
 
G
R
 
D
I
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
N
I
 
V
L
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
F
L
 
L
A
 
K
Q
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
R
I
 
V
H
 
Y
V
 
F
D
 
E
G
 
N
E
 
K
A
 
D
V
 
I
R
 
T
F
 
N
R
 
K
S
 
E
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
L
L
 
Y
K
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
M
 
R
V
 
T
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
T
F
 
P
M
 
Q
L
 
P
V
 
L
D
 
K
S
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
G
Q
 
E
S
 
I
G
 
N
A
 
P
W
 
G
L
 
E
S
 
S
P
 
P
V
 
L
H
 
N
M
 
-
S
 
S
R
 
L
V
 
F
V
 
Y
A
 
K
E
 
K
L
 
W
A
 
I
A
 
P
R
 
K
Y
 
E
G
 
E
L
 
E
D
 
M
I
 
V
D
 
E
P
 
K
A
 
A
A
 
F
R
 
K
V
 
I
C
 
L
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
G
D
 
E
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
M
Q
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
M
R
 
T
D
 
N
S
 
P
R
 
K
V
 
M
L
 
I
I
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
L
T
 
A
E
 
H
Q
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
N
A
 
H
L
 
V
H
 
L
R
 
E
M
 
L
A
 
K
E
 
A
N
 
K
G
 
G
K
 
I
A
 
T
I
 
F
V
 
L
F
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
K
 
R
M
 
L
Q
 
D
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
E
 
H
I
 
L
A
 
Y
I
 
V
L
 
M
R
 
F
R
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
D
 
-
E
 
-
F
 
-
H
 
-
E
 
-
S
 
A
E
 
E
V
 
G
P
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
K
N
 
N
R
 
V
M
 
L
V
 
S
G
 
D
R
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
V

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
25% identity, 45% coverage: 34:270/524 of query aligns to 4:248/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
V
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
N
I
 
I
G
 
V
K
 
K
S
 
Y
F
|
F
G
 
G
P
 
E
V
x
F
R
 
K
A
 
A
N
 
L
H
 
D
D
 
G
I
 
V
T
 
S
L
 
I
D
 
S
I
 
V
V
 
N
P
 
K
G
 
G
R
 
D
I
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
I
S
 
N
I
 
V
L
 
I
S
 
T
G
 
G
R
 
F
L
 
L
A
 
K
Q
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
R
I
 
V
H
 
Y
V
 
F
D
 
E
G
 
N
E
 
K
A
 
D
V
 
I
R
 
T
F
 
N
R
 
K
S
 
E
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
L
L
 
Y
K
 
H
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
M
 
R
V
 
T
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
T
F
 
P
M
 
Q
L
 
P
V
 
L
D
 
K
S
 
E
M
 
M
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
G
Q
 
E
S
 
I
G
 
C
A
 
P
W
 
G
L
 
E
S
 
S
P
 
P
V
 
L
H
 
N
M
 
-
S
 
S
R
 
L
V
 
F
V
 
Y
A
 
K
E
 
K
L
 
W
A
 
I
A
 
P
R
 
K
Y
 
E
G
 
E
L
 
E
D
 
M
I
 
V
D
 
E
P
 
K
A
 
A
A
 
F
R
 
K
V
 
I
C
 
L
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
H
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
G
D
 
E
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
M
Q
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
A
L
 
L
Y
 
M
R
 
T
D
 
N
S
 
P
R
 
K
V
 
M
L
 
I
I
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
L
T
 
A
E
 
H
Q
 
D
L
 
I
F
 
F
E
 
N
A
 
H
L
 
V
H
 
L
R
 
E
M
 
L
A
 
K
E
 
A
N
 
K
G
 
G
K
 
I
A
 
T
I
 
F
V
 
L
F
 
I
I
 
I
S
 
E
H
 
H
K
 
R
M
 
L
Q
 
D
E
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
E
 
H
I
 
L
A
 
Y
I
 
V
L
 
M
R
 
F
R
 
N
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
I
D
 
-
E
 
-
F
 
-
H
 
-
E
 
-
S
 
A
E
 
E
V
 
G
P
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
K
N
 
N
R
 
V
M
 
L
V
 
S
G
 
D
R
 
P
E
 
K
V
 
V
I
 
V

O95477 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1; ATP-binding cassette sub-family A member 1; ATP-binding cassette transporter 1; ABC-1; ATP-binding cassette 1; Cholesterol efflux regulatory protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 35 papers)
31% identity, 37% coverage: 53:245/524 of query aligns to 919:1109/2261 of O95477

query
sites
O95477
I
 
L
T
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
F
V
 
Y
P
 
E
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
x
T
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
H
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
F
A
 
P
Q
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
A
H
 
Y
V
 
I
D
 
L
G
 
G
E
 
K
A
 
D
V
 
I
R
 
-
F
 
-
R
 
R
S
 
S
P
 
E
K
 
M
D
 
S
A
 
T
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
G
 
N
I
 
L
G
 
G
M
 
V
V
 
C
Y
 
P
Q
 
Q
H
 
H
F
 
N
M
 
V
L
 
L
V
 
F
D
 
D
S
 
M
M
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
E
N
 
H
V
 
I
L
 
W
L
 
F
G
 
Y
Q
 
A
S
 
R
G
 
L
A
 
K
W
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
V
 
K
H
 
H
M
 
V
S
 
K
R
 
A
V
 
E
V
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
L
R
 
D
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
P
I
 
S
D
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
K
A
 
S
R
 
K
V
 
T
C
 
S
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
Q
Q
 
R
R
 
K
V
 
L
E
x
S
I
 
V
L
 
A
K
 
L
L
 
A
L
 
F
Y
 
V
R
 
G
D
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
V
 
G
L
 
V
T
 
D
P
|
P
G
 
Y
E
 
S
T
 
R
E
 
R
Q
 
G
L
 
I
F
 
W
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
L
R
 
K
M
 
Y
A
 
R
E
 
Q
N
 
-
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
S
S
 
T
H
 
H
K
 
H
M
|
M
Q
 
D
E
 
E
V
 
A
L
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
G
D
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
S
R
 
H
G
 
G
E
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

A0R6H8 Mycobactin import ATP-binding/permease protein IrtA; EC 7.2.2.- from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
33% identity, 42% coverage: 28:247/524 of query aligns to 602:822/860 of A0R6H8

query
sites
A0R6H8
R
 
K
H
 
R
D
 
D
V
 
G
T
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
V
R
 
V
L
 
F
E
 
D
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
F
S
 
G
F
 
Y
G
 
R
P
 
P
-
 
D
V
 
I
R
 
P
A
 
V
N
 
L
H
 
H
D
 
D
I
 
I
T
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
P
G
 
G
R
 
T
I
 
V
K
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
A
S
 
A
I
 
L
L
 
L
S
 
A
G
 
R
R
 
F
L
 
H
A
 
D
Q
 
V
D
 
D
T
 
A
G
 
G
I
 
A
I
 
I
H
 
R
V
 
L
D
 
G
G
 
G
E
 
R
A
 
D
V
 
I
R
 
R
F
 
T
R
 
L
S
 
T
P
 
-
K
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
K
 
Y
A
 
R
G
 
Q
I
 
V
G
 
G
M
 
F
V
 
V
Y
 
L
Q
 
Q
H
 
D
F
 
T
M
 
Q
L
 
L
V
 
V
D
 
G
S
 
G
M
 
-
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
L
 
A
L
 
L
G
 
A
Q
 
D
S
 
P
G
 
D
A
 
A
W
 
S
L
 
I
S
 
E
P
 
R
V
 
I
H
 
Q
M
 
D
S
 
A
R
 
A
V
 
R
V
 
D
A
 
A
E
 
Q
L
 
I
A
 
H
A
 
D
R
 
R
Y
 
I
-
 
M
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
N
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
I
 
T
D
 
-
P
 
P
A
 
L
A
 
G
R
 
A
V
 
A
C
 
S
D
 
S
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
E
 
T
I
 
I
L
 
A
K
 
R
L
 
A
L
 
I
Y
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
T
R
 
P
V
 
V
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
F
L
 
A
T
 
D
P
 
P
G
 
-
E
 
E
T
 
S
E
 
E
Q
 
Y
L
 
L
F
 
V
-
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
N
R
 
R
M
 
L
A
 
T
E
 
R
N
 
D
G
 
-
K
 
R
A
 
T
I
 
V
V
 
L
F
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
K
 
R
M
 
L
Q
 
H
E
 
T
V
 
I
L
 
-
A
 
T
L
 
H
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
E
R
 
G
G
 
G
E
 
R
V
 
I
V
 
V
D
 
E

Sites not aligning to the query:

4hluC Structure of the ecfa-a' heterodimer bound to adp (see paper)
31% identity, 41% coverage: 51:263/524 of query aligns to 21:238/249 of 4hluC

query
sites
4hluC
H
 
K
D
 
D
I
 
V
T
 
N
L
 
A
D
 
E
I
 
F
V
 
E
P
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
K
 
Y
A
 
V
L
 
V
L
 
V
G
 
G
E
 
K
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
M
 
L
S
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
D
 
-
T
 
A
G
 
G
I
 
E
I
 
I
H
 
F
V
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
S
P
 
P
K
 
A
D
 
D
A
 
P
-
 
F
-
 
L
L
 
L
K
 
R
A
 
K
G
 
N
I
 
V
G
 
G
M
 
Y
V
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
N
-
 
P
F
 
S
M
 
S
L
 
Q
V
 
I
D
 
I
S
 
G
M
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
E
N
 
D
V
 
V
L
 
A
L
 
F
G
 
S
Q
 
L
S
 
E
G
 
I
A
 
M
W
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
E
V
 
S
H
 
E
M
 
M
S
 
R
R
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
K
E
 
K
L
 
V
A
 
L
A
 
E
R
 
L
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
G
D
 
L
P
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
D
V
 
P
C
 
L
D
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
E
 
A
I
 
I
L
 
A
K
 
S
L
 
M
L
 
L
Y
 
A
R
 
R
D
 
D
S
 
T
R
 
R
V
 
F
L
 
L
I
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
V
A
 
S
V
 
M
L
 
L
T
 
D
P
 
P
G
 
P
E
 
S
T
 
Q
E
 
R
Q
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
A
 
V
L
 
L
H
 
E
R
 
S
M
 
L
A
 
K
E
 
N
N
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
G
I
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
E
M
 
L
Q
 
-
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
A
 
D
L
 
D
A
 
M
D
 
D
E
 
F
I
 
I
A
 
L
I
 
H
L
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
G
-
 
S
-
 
W
-
 
E
E
 
E
V
 
F
V
 
V
D
 
E
-
 
R
E
 
E
F
 
F
H
 
D
E
 
D
S
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
F
E
 
K
A
 
W
E
 
K
L
 
L
A
 
W
N
 
K
R
 
K

Sites not aligning to the query:

P41233 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1; ATP-binding cassette sub-family A member 1; ATP-binding cassette transporter 1; ABC-1; ATP-binding cassette 1; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
31% identity, 37% coverage: 53:245/524 of query aligns to 919:1109/2261 of P41233

query
sites
P41233
I
 
L
T
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
F
V
 
Y
P
 
E
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
F
A
 
P
Q
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
A
H
 
Y
V
 
I
D
 
L
G
 
G
E
 
K
A
 
D
V
 
I
R
 
-
F
 
-
R
 
R
S
 
S
P
 
E
K
 
M
D
 
S
A
 
S
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
G
 
N
I
 
L
G
 
G
M
 
V
V
 
C
Y
 
P
Q
 
Q
H
 
H
F
 
N
M
 
V
L
 
L
V
 
F
D
 
D
S
 
M
M
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
E
N
 
H
V
 
I
L
 
W
L
 
F
G
 
Y
Q
 
A
S
 
R
G
 
L
A
 
K
W
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
V
 
K
H
 
H
M
 
V
S
 
K
R
 
A
V
 
E
V
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
L
R
 
D
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
P
I
 
P
D
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
K
A
 
S
R
 
K
V
 
T
C
 
S
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
Q
Q
 
R
R
 
K
V
 
L
E
 
S
I
 
V
L
 
A
K
 
L
L
 
A
L
 
F
Y
 
V
R
 
G
D
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
V
 
G
L
 
V
T
 
D
P
 
P
G
 
Y
E
 
S
T
 
R
E
 
R
Q
 
G
L
 
I
F
 
W
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
L
R
 
K
M
 
Y
A
 
R
E
 
Q
N
 
-
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
S
S
 
T
H
 
H
K
 
H
M
 
M
Q
 
D
E
 
E
V
 
A
L
 
D
A
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
S
R
 
H
G
 
G
E
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7tbyA The structure of human abca1 in nanodisc (see paper)
31% identity, 37% coverage: 53:245/524 of query aligns to 701:891/1788 of 7tbyA

query
sites
7tbyA
I
 
L
T
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
F
V
 
Y
P
 
E
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
R
 
L
L
 
F
A
 
P
Q
 
P
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
T
I
 
A
H
 
Y
V
 
I
D
 
L
G
 
G
E
 
K
A
 
D
V
 
I
R
 
-
F
 
-
R
 
R
S
 
S
P
 
E
K
 
M
D
 
S
A
 
T
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
G
 
N
I
 
L
G
 
G
M
 
V
V
 
C
Y
 
P
Q
 
Q
H
 
H
F
 
N
M
 
V
L
 
L
V
 
F
D
 
D
S
 
M
M
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
E
N
 
H
V
 
I
L
 
W
L
 
F
G
 
Y
Q
 
A
S
 
R
G
 
L
A
 
K
W
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
V
 
K
H
 
H
M
 
V
S
 
K
R
 
A
V
 
E
V
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
L
R
 
D
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
P
I
 
S
D
 
S
P
 
K
-
 
L
A
 
K
A
 
S
R
 
K
V
 
T
C
 
S
D
 
Q
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
Q
Q
 
R
R
 
K
V
 
L
E
 
S
I
 
V
L
 
A
K
 
L
L
 
A
L
 
F
Y
 
V
R
 
G
D
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
V
 
G
L
 
V
T
 
D
P
 
P
G
 
Y
E
 
S
T
 
R
E
 
R
Q
 
G
L
 
I
F
 
W
E
 
E
A
 
L
L
 
L
H
 
L
R
 
K
M
 
Y
A
 
R
E
 
Q
N
 
-
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
L
I
 
S
S
 
T
H
 
H
K
 
H
M
 
M
Q
 
D
E
 
E
V
 
A
L
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
G
D
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
S
R
 
H
G
 
G
E
 
K
V
 
L

Sites not aligning to the query:

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
31% identity, 40% coverage: 35:245/524 of query aligns to 3:211/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
P
 
E
V
 
V
R
 
V
A
x
V
N
 
S
H
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
H
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
F
K
 
V
A
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
S
 
R
I
 
M
L
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
E
A
 
T
Q
 
I
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
D
I
 
L
H
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
M
R
 
N
F
 
D
R
 
T
S
 
P
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
L
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
K
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
K
L
 
K
S
 
E
P
 
V
V
 
I
H
 
N
-
 
Q
-
 
R
M
 
V
S
 
N
R
 
Q
V
 
V
V
 
A
A
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
R
 
A
Y
 
H
G
 
L
L
 
L
D
 
D
I
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
K
A
 
A
R
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
D
 
E
S
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
A
G
 
A
E
 
L
T
 
R
E
 
V
Q
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
A
 
E
L
 
I
H
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
H
E
 
K
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
M
 
Q
Q
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
31% identity, 40% coverage: 35:245/524 of query aligns to 1:209/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
P
 
E
V
 
V
R
 
V
A
 
V
N
 
S
H
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
H
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
F
K
 
V
A
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
S
 
R
I
 
M
L
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
E
A
 
T
Q
 
I
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
D
I
 
L
H
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
M
R
 
N
F
 
D
R
 
T
S
 
P
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
L
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
K
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
K
L
 
K
S
 
E
P
 
V
V
 
I
H
 
N
-
 
Q
-
 
R
M
 
V
S
 
N
R
 
Q
V
 
V
V
 
A
A
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
R
 
A
Y
 
H
G
 
L
L
 
L
D
 
D
I
x
R
D
 
K
P
 
P
A
 
K
A
|
A
R
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
S
|
S
M
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
D
 
E
S
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
A
G
 
A
E
 
L
T
 
R
E
 
V
Q
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
A
 
E
L
 
I
H
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
H
E
 
K
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
M
 
Q
Q
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
31% identity, 40% coverage: 35:245/524 of query aligns to 4:212/371 of P68187

query
sites
P68187
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
W
G
 
G
P
 
E
V
 
V
R
 
V
A
 
V
N
 
S
H
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
H
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
F
K
 
V
A
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
R
I
 
M
L
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
E
A
 
T
Q
 
I
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
D
I
 
L
H
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
M
R
 
N
F
 
D
R
 
T
S
 
P
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
M
x
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
L
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
K
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
W
x
K
L
 
K
S
 
E
P
 
V
V
 
I
H
 
N
-
 
Q
-
 
R
M
x
V
S
 
N
R
 
Q
V
|
V
V
 
A
A
x
E
E
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
R
x
A
Y
 
H
G
 
L
L
 
L
D
 
D
I
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
K
A
 
A
R
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
S
 
S
M
 
G
G
|
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
D
 
E
S
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
A
G
 
A
E
 
L
T
 
R
E
 
V
Q
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
A
 
E
L
 
I
H
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
H
E
 
K
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
K
 
D
M
 
Q
Q
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
31% identity, 40% coverage: 35:245/524 of query aligns to 3:211/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
P
 
E
V
 
V
R
 
V
A
 
V
N
 
S
H
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
H
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
F
K
 
V
A
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
S
 
R
I
 
M
L
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
E
A
 
T
Q
 
I
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
D
I
 
L
H
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
M
R
 
N
F
 
D
R
 
T
S
 
P
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
H
 
S
F
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
L
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
K
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
K
L
 
K
S
 
E
P
 
V
V
 
I
H
 
N
-
 
Q
-
 
R
M
 
V
S
 
N
R
 
Q
V
 
V
V
 
A
A
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
R
 
A
Y
 
H
G
 
L
L
 
L
D
 
D
I
x
R
D
 
K
P
 
P
A
 
K
A
|
A
R
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
S
|
S
M
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
D
 
E
S
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
A
G
 
A
E
 
L
T
 
R
E
 
V
Q
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
A
 
E
L
 
I
H
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
H
E
 
K
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
M
 
Q
Q
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
31% identity, 40% coverage: 35:245/524 of query aligns to 3:211/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
P
 
E
V
 
V
R
 
V
A
 
V
N
 
S
H
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
H
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
F
K
 
V
A
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
S
 
R
I
 
M
L
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
E
A
 
T
Q
 
I
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
D
I
 
L
H
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
M
R
 
N
F
 
D
R
 
T
S
 
P
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
H
 
S
F
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
L
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
K
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
K
L
 
K
S
 
E
P
 
V
V
 
I
H
 
N
-
 
Q
-
 
R
M
 
V
S
 
N
R
 
Q
V
 
V
V
 
A
A
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
R
 
A
Y
 
H
G
 
L
L
 
L
D
 
D
I
x
R
D
 
K
P
 
P
A
 
K
A
 
A
R
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
S
|
S
M
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
D
 
E
S
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
A
G
 
A
E
 
L
T
 
R
E
 
V
Q
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
A
 
E
L
 
I
H
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
H
E
 
K
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
M
 
Q
Q
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
31% identity, 40% coverage: 35:245/524 of query aligns to 3:211/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
E
 
Q
G
 
N
I
 
V
G
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
P
 
E
V
 
V
R
 
V
A
x
V
N
 
S
H
 
K
D
 
D
I
 
I
T
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
H
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
F
K
 
V
A
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
L
S
 
R
I
 
M
L
 
I
S
 
A
G
 
G
R
 
L
L
 
E
A
 
T
Q
 
I
D
 
T
T
 
S
G
 
G
I
 
D
I
 
L
H
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
E
 
K
A
 
R
V
 
M
R
 
N
F
 
D
R
 
T
S
 
P
P
 
P
K
 
A
D
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
R
G
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
Y
 
F
Q
|
Q
H
 
S
F
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
L
 
S
L
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
K
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
K
L
 
K
S
 
E
P
 
V
V
 
I
H
 
N
-
 
Q
-
 
R
M
 
V
S
 
N
R
 
Q
V
 
V
V
 
A
A
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
L
R
 
A
Y
 
H
G
 
L
L
 
L
D
 
D
I
x
R
D
 
K
P
 
P
A
 
K
A
|
A
R
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
L
S
|
S
M
x
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
A
D
 
E
S
 
P
R
 
S
V
 
V
L
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
A
G
 
A
E
 
L
T
 
R
E
 
V
Q
 
Q
L
 
M
F
 
R
E
 
I
A
 
E
L
 
I
H
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
H
E
 
K
N
 
R
-
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
|
H
K
 
D
M
 
Q
Q
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
R
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
V

Query Sequence

>206505 DVU1070 branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein
MTVANANDTAPHADSTTPQTGRTGRALRHDVTPVVRLEGIGKSFGPVRANHDITLDIVPG
RIKALLGENGAGKSTLMSILSGRLAQDTGIIHVDGEAVRFRSPKDALKAGIGMVYQHFML
VDSMTVAENVLLGQSGAWLSPVHMSRVVAELAARYGLDIDPAARVCDLSMGERQRVEILK
LLYRDSRVLILDEPTAVLTPGETEQLFEALHRMAENGKAIVFISHKMQEVLALADEIAIL
RRGEVVDEFHESEVPGEAELANRMVGREVILEVAAEPLEPGDRVLHVDGLAGDGLKGLSF
EVRKGEVFAIAGVAGNGQRELVECVTGLRRPAEGEVELLGIPWRQFFTKAPRQGGLAYIP
EDRQGLATCLSLDLVDNFLLTARGCFTRGPFLDRKSADAAARDILAEYNVQPGRAEAPAR
SLSGGNLQKLVVGREFYRKPSLIVAENPTQGLDIAATEEVWARLLEVRSHAGVLLVSGDL
NEVLALADRVAVMYRGCFIGLLDRSDTNKVDAIGLMMAGVSCEG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory