SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 207249 MicrobesOnline__882:207249 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3asvA The closed form of serine dehydrogenase complexed with NADP+ (see paper)
60% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 3:247/248 of 3asvA

query
sites
3asvA
I
 
V
C
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
|
T
A
 
A
G
|
G
F
|
F
G
 
G
E
 
E
A
 
C
C
 
I
A
 
T
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
I
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
C
 
H
R
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
T
G
 
G
R
|
R
R
|
R
K
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
D
D
 
N
R
 
L
C
 
Y
L
 
I
P
 
A
L
 
Q
V
 
-
F
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
N
R
 
R
K
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
E
A
 
M
F
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
E
F
 
W
A
 
C
N
 
N
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
A
H
 
H
R
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
D
 
D
W
 
W
E
 
E
T
 
T
M
 
M
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
N
K
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
V
Y
 
Y
C
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
E
 
E
R
 
R
G
 
N
K
 
H
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
G
 
G
S
|
S
I
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Y
 
W
P
 
P
Y
 
Y
P
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
V
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
F
 
F
V
 
V
M
 
R
Q
 
Q
F
 
F
S
 
S
R
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
R
A
 
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
G
 
G
T
 
T
G
 
A
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
D
I
 
I
E
 
E
P
 
P
G
|
G
L
 
L
-
x
V
A
 
G
E
 
G
S
x
T
E
|
E
F
|
F
S
 
S
V
 
N
I
 
V
R
 
R
F
 
F
K
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
D
S
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
E
G
 
K
V
 
T
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
N
T
 
T
E
 
V
P
 
A
L
 
L
R
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
A
I
 
V
H
 
W
F
 
W
A
 
V
V
 
S
T
 
T
C
 
L
P
 
P
A
 
A
H
 
H
V
 
V
N
 
N
I
 
I
N
 
N
R
 
T
I
 
L
E
 
E
V
 
M
M
 
M
P
 
P
T
 
V
C
 
T
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
A
 
G
L
 
L
P
 
N
V
 
V
H
 
H
R
 
R

6ixjA The crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from klebsiella oxytoca (see paper)
52% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 4:250/251 of 6ixjA

query
sites
6ixjA
I
 
V
C
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
|
T
A
x
S
G
|
G
F
|
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
R
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
D
E
 
A
G
 
G
C
 
W
R
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
L
T
 
S
G
 
G
R
|
R
R
|
R
K
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
K
K
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
A
E
 
S
D
 
Q
R
 
V
C
 
P
L
 
V
P
 
H
L
 
I
V
 
I
-
 
E
F
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
R
D
 
D
R
 
S
K
 
D
A
 
S
V
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
D
F
 
F
A
 
A
N
 
D
V
 
I
D
 
T
V
 
T
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
P
E
 
Q
P
 
P
A
 
A
H
 
Q
R
 
K
A
 
V
S
 
D
L
 
L
E
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
K
T
 
T
M
 
M
I
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
V
K
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
V
Y
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
T
M
 
L
V
 
I
E
 
N
R
 
H
G
 
G
K
 
A
G
 
G
-
 
A
H
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
G
 
G
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
Q
Y
 
W
P
 
P
Y
|
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
S
N
 
H
T
 
V
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
F
 
F
V
 
V
M
 
K
Q
 
Q
F
 
F
S
 
S
R
 
Y
N
 
N
L
 
L
R
 
R
A
 
C
D
 
D
L
 
L
H
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
D
I
 
L
E
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
I
A
|
A
E
 
E
S
x
T
E
|
E
F
|
F
S
 
T
V
 
L
I
 
V
R
 
R
F
 
T
K
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
Q
S
 
A
K
 
A
A
 
S
A
 
D
G
 
N
V
 
L
Y
 
Y
K
 
R
G
 
G
T
 
T
E
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
S
P
 
A
V
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
I
 
M
H
 
F
F
 
Y
A
 
I
V
 
A
T
 
T
C
 
L
P
 
P
A
 
D
H
 
H
V
 
M
N
 
N
I
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
V
M
 
M
P
 
P
T
 
V
C
 
R
Q
 
Q
S
 
A
F
 
W
G
 
Q
A
 
P
L
 
F
P
 
A
V
 
I
H
 
D
R
 
R

Q9P7B4 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.381 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
45% identity, 98% coverage: 4:252/253 of query aligns to 8:259/259 of Q9P7B4

query
sites
Q9P7B4
T
 
T
I
 
I
C
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
S
G
 
G
F
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
S
C
 
T
A
 
A
R
 
F
R
 
E
F
 
I
A
 
A
-
 
K
A
 
V
E
 
A
G
 
K
C
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
L
T
 
A
G
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
F
E
x
S
R
x
T
L
 
V
E
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
E
-
 
S
-
 
K
-
 
Y
E
 
E
D
 
V
R
 
S
C
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
K
F
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
S
D
 
D
R
 
L
K
 
K
A
 
S
V
 
I
E
 
P
A
 
G
A
 
V
F
 
I
A
 
E
A
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
K
A
 
E
F
 
F
A
 
A
N
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
T
E
 
D
P
 
K
A
 
V
H
 
I
R
 
D
A
 
L
S
 
N
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
A
E
 
V
T
 
T
M
 
M
I
 
I
D
 
T
T
 
T
N
 
N
L
 
V
K
 
L
G
 
G
L
 
M
M
 
M
Y
 
A
C
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
F
V
 
Y
E
 
S
R
 
K
G
 
N
K
 
K
G
 
G
H
 
D
V
 
I
V
 
L
N
 
N
L
 
V
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
R
Y
 
E
P
 
S
Y
 
Y
P
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
S
T
 
V
Y
 
Y
G
 
C
A
 
S
T
 
T
K
 
K
A
 
S
F
 
A
V
 
L
M
 
A
Q
 
Q
F
 
F
S
 
T
R
 
S
N
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
D
 
E
L
 
T
H
 
I
G
 
D
T
 
T
G
 
R
V
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
M
N
 
E
I
 
V
E
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
E
 
E
S
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
V
I
 
V
R
 
R
F
 
F
K
 
H
G
 
G
D
 
D
A
 
K
S
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
D
G
 
N
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
G
 
N
T
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
V
I
 
I
H
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
R
P
 
R
A
 
E
H
 
N
V
 
V
N
 
V
I
 
I
N
 
A
R
 
D
I
 
T
E
 
L
V
 
V
M
 
F
P
 
P
T
 
S
C
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
-
G
 
G
A
 
A
L
 
N
P
 
H
V
 
V
H
 
Y
R
 
R
T
 
K
E
 
Q
A
 
A

Q05016 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.381 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
37% identity, 95% coverage: 2:241/253 of query aligns to 13:259/267 of Q05016

query
sites
Q05016
Q
 
K
A
 
K
T
 
T
I
 
V
C
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
E
F
 
Y
-
 
L
-
 
E
A
 
A
A
 
S
E
 
N
G
 
G
-
 
D
C
 
M
R
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
L
T
 
A
G
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
K
E
 
T
L
 
I
G
 
D
E
 
Q
D
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
A
R
 
K
C
 
V
L
 
H
P
 
V
L
 
A
V
 
Q
F
 
L
D
 
D
V
 
I
R
 
T
D
 
Q
R
 
A
K
 
E
A
 
K
V
 
I
E
 
K
A
 
P
A
 
F
F
 
I
A
 
E
A
 
N
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
A
 
E
F
 
F
A
 
K
N
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
S
E
 
D
P
 
R
A
 
V
H
 
G
R
 
Q
A
 
I
S
 
A
L
 
T
E
 
E
D
 
D
W
 
I
E
 
Q
T
 
D
M
 
V
I
 
F
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
V
K
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
I
Y
 
N
C
 
I
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
F
V
 
Q
E
 
A
R
 
K
G
 
N
K
 
S
G
 
G
H
 
D
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
R
Y
 
D
P
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
T
G
 
G
N
 
S
T
 
I
Y
|
Y
G
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
F
 
A
V
 
V
M
 
G
Q
 
A
F
 
F
S
 
T
R
 
D
N
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
K
D
 
E
L
 
L
H
 
I
G
 
N
T
 
T
G
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
I
N
 
L
I
 
I
E
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
V
E
 
E
S
 
T
E
 
E
F
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
V
R
 
R
F
 
Y
K
 
R
G
 
G
D
 
N
A
 
E
S
 
E
K
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
N
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
G
 
D
T
 
T
E
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
M
P
 
A
V
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
I
H
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
T
T
 
S
C
 
R
P
 
K
A
 
Q
H
 
N
V
 
T
N
 
V
I
 
I
N
 
A
R
 
D
I
 
T
E
 
L
V
 
I
M
 
F
P
 
P
T
 
T
C
 
N
Q
 
Q
S
 
A

3rkuA Substrate fingerprint and the structure of NADP+ dependent serine dehydrogenase from saccharomyces cerevisiae complexed with NADP+
37% identity, 95% coverage: 2:241/253 of query aligns to 14:260/268 of 3rkuA

query
sites
3rkuA
Q
 
K
A
 
K
T
 
T
I
 
V
C
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
A
 
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
C
 
T
A
 
A
R
 
L
R
 
E
F
 
Y
-
 
L
-
 
E
A
 
A
A
 
S
E
 
N
G
 
G
-
 
D
C
 
M
R
 
K
L
 
L
I
 
I
I
 
L
T
 
A
G
 
A
R
|
R
R
|
R
K
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
K
E
 
T
L
 
I
G
 
D
E
 
Q
D
 
E
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
A
R
 
K
C
 
V
L
 
H
P
 
V
L
 
A
V
 
Q
F
 
L
D
|
D
V
x
I
R
 
T
D
 
Q
R
 
A
K
 
E
A
 
K
V
 
I
E
 
K
A
 
P
A
 
F
F
 
I
A
 
E
A
 
N
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
A
 
E
F
 
F
A
 
K
N
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
K
A
|
A
L
 
L
G
 
G
L
 
S
E
 
D
P
 
R
A
 
V
H
 
G
R
 
Q
A
 
I
S
 
A
L
 
T
E
 
E
D
 
D
W
 
I
E
 
Q
T
 
D
M
 
V
I
 
F
D
 
D
T
 
T
N
|
N
L
 
V
K
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
I
Y
 
N
C
 
I
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
F
V
 
Q
E
 
A
R
 
K
G
 
N
K
 
S
G
 
G
H
 
D
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
R
Y
 
D
P
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
T
G
 
G
N
 
S
T
 
I
Y
|
Y
G
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
F
 
A
V
 
V
M
 
G
Q
 
A
F
 
F
S
 
T
R
 
D
N
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
K
D
 
E
L
 
L
H
 
I
G
 
N
T
 
T
G
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
I
N
 
L
I
 
I
E
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
L
A
x
V
E
 
E
S
x
T
E
|
E
F
|
F
S
 
S
V
 
L
I
 
V
R
 
R
F
 
Y
K
 
R
G
 
G
D
x
N
A
 
E
S
 
E
K
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
N
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
G
 
D
T
 
T
E
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
M
P
 
A
V
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
I
H
 
V
F
 
Y
A
 
A
V
 
T
T
 
S
C
 
R
P
 
K
A
 
Q
H
 
N
V
 
T
N
 
V
I
 
I
N
 
A
R
 
D
I
 
T
E
 
L
V
 
I
M
 
F
P
 
P
T
 
T
C
 
N
Q
 
Q
S
 
A

2ehdB Crystal structure analysis of oxidoreductase
36% identity, 94% coverage: 1:238/253 of query aligns to 3:213/213 of 2ehdB

query
sites
2ehdB
M
 
M
Q
 
K
A
 
G
T
 
A
I
 
V
C
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
 
R
G
 
G
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
L
F
 
L
A
 
H
A
 
A
E
 
K
G
 
G
C
 
Y
R
 
R
L
 
V
I
 
G
I
 
L
T
 
M
G
 
A
R
|
R
R
x
D
K
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
K
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
-
E
 
-
D
 
E
R
 
G
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
P
F
 
G
D
 
D
V
 
V
R
 
R
D
 
E
R
 
E
K
 
G
A
 
D
V
 
W
E
 
A
A
 
R
A
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
M
P
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
G
N
 
E
V
 
L
D
 
S
V
 
A
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
-
L
 
M
E
 
K
P
 
P
A
 
V
H
 
H
R
 
E
A
 
L
S
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
R
T
 
L
M
 
V
I
 
L
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
L
 
A
M
 
F
Y
 
L
C
 
G
T
 
I
R
 
R
A
 
H
L
 
A
L
 
V
P
 
P
G
 
A
M
 
L
V
 
L
E
 
R
R
 
R
G
 
G
K
 
G
G
 
G
H
 
T
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
V
G
|
G
S
 
S
I
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
K
Y
 
N
P
 
P
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
G
 
G
N
 
A
T
 
A
Y
|
Y
G
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
F
 
G
V
 
L
M
 
L
Q
 
G
F
 
L
S
 
A
R
 
G
N
 
A
L
 
A
R
 
M
A
 
L
D
 
D
L
 
L
H
 
R
G
 
E
T
 
A
G
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
V
N
 
N
I
 
V
E
 
L
P
 
P
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
F
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
F
 
-
K
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
K
 
-
G
 
G
T
 
S
E
 
V
P
 
K
L
 
L
R
 
K
P
 
P
V
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
I
 
A
I
 
V
H
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
L
T
 
E
C
 
M
P
 
P
A
 
G
H
 
H
V
 
A
N
 
M
I
 
V
N
 
S
R
 
E
I
 
I
E
 
E
V
 
L
M
 
R
P
 
P
T
 
T

2japA Clavulanic acid dehydrogenase: structural and biochemical analysis of the final step in the biosynthesis of the beta- lactamase inhibitor clavulanic acid (see paper)
42% identity, 93% coverage: 6:240/253 of query aligns to 9:244/245 of 2japA

query
sites
2japA
C
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
A
x
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
A
L
 
V
I
 
A
I
 
I
T
 
A
G
x
A
R
|
R
R
|
R
K
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
R
K
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
T
E
 
A
D
 
A
-
 
G
-
 
A
R
 
K
C
 
V
L
 
H
P
 
V
L
 
L
V
 
E
F
x
L
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
D
R
 
R
K
 
Q
A
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
G
N
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
x
M
L
 
L
G
 
-
L
 
L
E
 
G
P
 
P
A
 
V
H
 
E
R
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
T
E
 
T
D
 
D
W
 
W
E
 
T
T
 
R
M
 
M
I
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
M
Y
 
Y
C
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
R
G
 
S
K
 
K
G
 
G
H
 
T
V
 
V
V
 
V
N
 
Q
L
x
M
G
x
S
S
|
S
I
 
I
A
|
A
G
 
G
S
 
R
Y
 
V
P
 
N
Y
 
V
P
 
R
G
 
N
G
 
A
N
 
A
T
 
V
Y
|
Y
G
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
F
 
G
V
 
V
M
 
N
Q
 
A
F
 
F
S
 
S
R
 
E
N
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
D
 
E
L
 
V
H
 
T
G
 
E
T
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
V
N
 
V
I
 
I
E
 
E
P
|
P
G
 
G
L
x
T
A
x
T
E
 
D
S
x
T
E
|
E
F
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
F
x
L
K
 
R
G
 
G
D
 
H
A
 
I
S
 
T
K
 
H
A
 
T
A
|
A
G
 
T
-
 
K
-
 
E
V
 
M
Y
|
Y
K
 
E
-
 
Q
-
x
R
-
 
I
-
 
S
G
 
Q
T
 
I
E
 
R
P
 
K
L
 
L
R
 
Q
P
 
A
V
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
A
I
 
V
H
 
R
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
C
 
A
P
 
P
A
 
H
H
 
H
V
 
A
N
 
T
I
 
V
N
 
H
R
 
E
I
 
I
E
 
F
V
 
I
M
 
R
P
 
P
T
 
T
C
 
D
Q
 
Q

2jahC Biochemical and structural analysis of the clavulanic acid dehydeogenase (cad) from streptomyces clavuligerus (see paper)
42% identity, 93% coverage: 6:240/253 of query aligns to 10:245/246 of 2jahC

query
sites
2jahC
C
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
A
x
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
A
L
 
V
I
 
A
I
 
I
T
 
A
G
x
A
R
|
R
R
|
R
K
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
R
K
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
T
E
 
A
D
 
A
-
 
G
-
 
A
R
 
K
C
 
V
L
 
H
P
 
V
L
 
L
V
 
E
F
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
D
R
 
R
K
 
Q
A
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
G
N
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
 
M
L
 
L
G
 
-
L
 
L
E
 
G
P
 
P
A
 
V
H
 
E
R
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
T
E
 
T
D
 
D
W
 
W
E
 
T
T
 
R
M
 
M
I
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
M
Y
 
Y
C
 
M
T
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
R
G
 
S
K
 
K
G
 
G
H
 
T
V
 
V
V
 
V
N
 
Q
L
x
M
G
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
R
Y
 
V
P
 
N
Y
 
V
P
 
R
G
 
N
G
 
A
N
 
A
T
 
V
Y
|
Y
G
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
F
 
G
V
 
V
M
 
N
Q
 
A
F
 
F
S
 
S
R
 
E
N
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
D
 
E
L
 
V
H
 
T
G
 
E
T
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
V
N
 
V
I
 
I
E
 
E
P
|
P
G
|
G
L
x
T
A
x
T
E
 
D
S
x
T
E
|
E
F
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
F
x
L
K
 
R
G
 
G
D
 
H
A
 
I
S
 
T
K
 
H
A
 
T
A
|
A
G
 
T
-
 
K
-
 
E
V
 
M
Y
 
Y
K
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
I
-
 
S
G
 
Q
T
 
I
E
 
R
P
 
K
L
 
L
R
 
Q
P
 
A
V
 
Q
D
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
A
I
 
V
H
 
R
F
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
C
 
A
P
 
P
A
 
H
H
 
H
V
 
A
N
 
T
I
 
V
N
 
H
R
 
E
I
 
I
E
 
F
V
 
I
M
 
R
P
 
P
T
 
T
C
 
D
Q
 
Q

A0A1U8QWA2 Glycine betaine reductase ATRR; Nonribosomal peptide synthetase-like protein ATRR; EC 1.2.1.-; EC 1.1.1.- from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
35% identity, 92% coverage: 6:237/253 of query aligns to 1033:1265/1270 of A0A1U8QWA2

query
sites
A0A1U8QWA2
C
x
V
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
T
x
S
A
x
S
G
|
G
F
x
I
G
|
G
E
x
A
A
|
A
C
x
V
A
|
A
R
x
T
R
x
A
F
x
L
A
|
A
A
x
R
E
|
E
G
|
G
C
x
A
R
x
H
L
x
V
I
x
A
I
x
L
T
x
G
G
x
A
R
|
R
R
|
R
K
x
L
E
x
D
R
x
A
L
|
L
E
|
E
K
x
S
L
|
L
A
x
K
A
x
E
E
x
K
L
|
L
G
x
S
E
x
A
D
x
S
-
x
G
-
x
V
R
x
K
C
x
V
L
x
V
P
x
T
L
x
C
V
x
K
F
x
T
D
|
D
V
|
V
R
x
T
D
|
D
R
|
R
K
|
K
A
x
Q
V
|
V
E
|
E
A
x
G
A
x
L
F
x
V
A
x
K
A
|
A
L
x
A
P
x
T
E
|
E
A
x
E
F
x
L
A
x
G
N
x
P
V
|
V
D
|
D
V
x
I
L
|
L
I
x
V
N
x
A
N
x
C
A
|
A
G
|
G
L
x
V
A
x
M
L
x
Y
G
x
F
L
x
T
E
x
M
P
x
M
A
|
A
H
x
N
R
 
-
A
x
T
S
x
Q
L
x
M
E
x
D
D
x
E
W
|
W
E
|
E
T
x
R
M
x
T
I
x
V
D
|
D
T
x
V
N
|
N
L
x
C
K
|
K
G
|
G
L
x
I
M
x
L
Y
x
N
C
x
S
T
x
L
R
x
A
A
x
S
L
x
T
L
x
V
P
|
P
G
|
G
M
|
M
V
x
L
E
x
A
R
|
R
G
|
G
K
|
K
G
|
G
H
|
H
V
|
V
V
|
V
N
x
A
L
x
I
G
x
S
S
|
S
I
x
D
A
|
A
G
|
G
S
x
R
Y
x
K
P
x
V
Y
x
F
P
|
P
G
|
G
G
x
L
N
x
G
T
x
V
Y
|
Y
G
x
S
A
|
A
T
x
S
K
|
K
A
x
F
F
|
F
V
|
V
M
x
E
Q
x
A
F
x
T
S
x
L
R
x
Q
N
x
A
L
|
L
R
|
R
A
x
L
D
x
E
L
x
T
H
x
A
G
|
G
T
x
Q
G
|
G
V
x
L
R
|
R
V
|
V
T
|
T
N
x
A
I
x
V
E
x
Q
P
|
P
G
|
G
L
x
N
A
x
T
E
x
A
S
x
T
E
x
D
F
x
L
S
x
L
V
x
G
I
x
M
R
x
S
F
x
T
K
x
D
G
x
A
D
x
E
A
|
A
S
x
I
K
|
K
A
x
K
A
x
Y
G
|
G
V
x
E
Y
x
P
K
x
S
G
|
G
T
x
A
E
x
Q
P
x
I
L
|
L
R
x
D
P
|
P
V
x
E
D
|
D
I
x
V
A
|
A
D
x
N
I
x
S
I
|
I
H
x
I
F
x
Y
A
|
A
V
x
L
T
x
R
C
x
Q
P
|
P
A
x
E
H
|
H
V
|
V
N
 
A
I
 
M
N
 
N
R
 
E
I
 
I
E
 
L
V
 
I
M
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1xg5C Structure of human putative dehydrogenase mgc4172 in complex with nadp
32% identity, 92% coverage: 7:238/253 of query aligns to 15:255/257 of 1xg5C

query
sites
1xg5C
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
A
 
G
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
A
 
Q
E
 
Q
G
 
G
C
 
L
R
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
G
T
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
T
K
 
V
E
 
G
R
 
N
L
 
I
E
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
C
G
 
K
E
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
P
D
 
G
R
 
T
C
 
L
L
 
I
P
 
P
L
 
Y
V
 
R
F
 
C
D
|
D
V
x
L
R
 
S
D
 
N
R
 
E
K
 
E
A
 
D
V
 
I
E
 
L
A
 
S
A
 
M
F
 
F
A
 
S
A
 
A
L
 
I
P
 
R
E
 
S
A
 
Q
F
 
H
A
 
S
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
C
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
L
A
 
A
L
 
R
G
 
P
L
 
-
E
 
D
P
 
T
A
 
L
H
 
L
R
 
S
A
 
G
S
 
S
L
 
T
E
 
S
D
 
G
W
 
W
E
 
K
T
 
D
M
 
M
I
 
F
D
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
S
Y
 
I
C
 
C
T
 
T
R
 
R
A
 
E
L
 
A
L
 
Y
P
 
Q
G
 
S
M
 
M
V
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
N
-
 
V
-
 
D
K
 
D
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
G
 
N
S
|
S
I
 
M
A
 
S
G
 
G
S
 
H
Y
 
R
P
 
V
Y
 
L
P
 
P
G
 
L
G
 
S
N
 
V
T
 
T
-
 
H
-
 
F
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
Y
F
 
A
V
 
V
M
 
T
Q
 
A
F
 
L
S
 
T
R
 
E
N
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
D
 
E
L
 
L
H
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
Q
T
 
T
G
 
H
V
 
I
R
 
R
V
 
A
T
 
T
N
 
C
I
 
I
E
 
S
P
 
P
G
|
G
L
 
V
A
x
V
E
 
E
S
x
T
E
 
Q
F
|
F
S
 
A
V
 
F
I
x
K
R
 
L
F
 
H
K
 
D
G
 
K
D
 
D
A
 
P
S
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
T
Y
 
Y
K
 
E
G
 
Q
T
 
M
E
 
K
P
 
C
L
 
L
R
 
K
P
 
P
V
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
E
I
 
A
I
 
V
H
 
I
F
 
Y
A
 
V
V
 
L
T
 
S
C
 
T
P
 
P
A
 
A
H
 
H
V
 
I
N
 
Q
I
 
I
N
 
G
R
 
D
I
 
I
E
 
Q
V
 
M
M
 
R
P
 
P
T
 
T

3p19A Improved NADPH-dependent blue fluorescent protein (see paper)
33% identity, 95% coverage: 1:241/253 of query aligns to 1:238/239 of 3p19A

query
sites
3p19A
M
 
M
Q
 
K
A
 
K
T
 
L
I
 
V
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
A
x
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
E
E
 
E
G
 
G
C
 
H
R
 
P
L
 
L
I
 
L
I
 
L
T
 
L
G
x
A
R
|
R
R
|
R
K
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
K
K
 
A
L
 
L
A
 
-
A
 
-
E
 
N
L
 
L
G
 
P
E
 
N
D
 
T
R
 
L
C
 
C
L
 
A
P
 
Q
L
 
V
V
 
-
F
 
-
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
D
R
 
K
K
 
Y
A
 
T
V
 
F
E
 
D
A
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
T
A
 
R
L
 
A
P
 
E
E
 
K
A
 
I
F
 
Y
A
 
G
N
 
P
V
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
M
A
 
M
L
 
L
G
 
-
L
 
L
E
 
G
P
 
Q
A
 
I
H
 
D
R
 
T
A
 
Q
S
 
E
L
 
A
E
 
N
D
 
E
W
 
W
E
 
Q
T
 
R
M
 
M
I
 
F
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
L
Y
 
N
C
 
G
T
 
M
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
A
G
 
P
M
 
M
V
 
K
E
 
A
R
 
R
G
 
N
K
 
C
G
 
G
H
 
T
V
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
G
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
K
Y
 
K
P
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
D
G
 
H
N
 
A
T
 
A
Y
|
Y
G
 
C
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
F
F
 
A
V
 
V
M
 
H
Q
 
A
F
 
I
S
 
S
R
 
E
N
 
N
L
 
V
R
 
R
A
 
E
D
 
E
L
 
V
H
 
A
G
 
A
T
 
S
G
 
N
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
M
N
 
T
I
 
I
E
 
A
P
|
P
G
 
S
L
x
A
A
x
V
E
 
K
S
x
T
E
|
E
F
x
L
-
 
L
-
 
S
-
 
H
S
 
T
V
 
T
I
 
S
R
 
Q
F
 
Q
K
 
I
G
 
K
D
 
D
A
 
G
S
 
Y
K
 
D
A
 
A
A
 
W
G
 
R
V
 
V
Y
 
D
K
 
M
G
 
G
T
 
G
E
 
-
P
 
V
L
 
L
R
 
A
P
 
A
V
 
D
D
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
R
I
 
A
I
 
V
H
 
L
F
 
F
A
 
A
V
 
Y
T
 
Q
C
 
Q
P
 
P
A
 
Q
H
 
N
V
 
V
N
 
C
I
 
I
N
 
R
R
 
E
I
 
I
E
 
A
V
 
L
M
 
A
P
 
P
T
 
T
C
 
K
Q
 
Q
S
 
Q

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
34% identity, 73% coverage: 4:188/253 of query aligns to 7:189/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
T
 
V
I
 
V
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
G
A
x
N
G
|
G
F
x
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
I
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
A
G
x
D
R
x
W
R
x
A
K
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
V
E
 
D
K
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
K
D
 
G
R
 
R
C
 
A
L
 
M
P
 
A
L
 
V
V
 
H
F
x
I
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
 
H
K
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
P
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
A
 
G
N
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
V
A
 
H
L
 
V
G
 
A
L
 
-
E
 
G
P
 
S
A
 
V
H
 
L
R
 
E
A
 
T
S
 
S
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
T
 
R
M
 
I
I
 
A
D
 
G
T
x
V
N
 
D
L
 
I
K
 
D
G
 
G
L
 
V
M
 
V
Y
 
F
C
 
C
T
 
S
R
 
K
A
 
F
L
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
K
 
K
G
 
G
H
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
T
G
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
L
Y
 
G
P
 
G
Y
 
D
P
 
W
G
 
G
G
 
A
N
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
F
 
A
V
 
V
M
 
V
Q
 
N
F
 
L
S
 
T
R
 
R
N
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
H
H
 
G
G
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
T
 
N
N
 
S
I
 
V
E
 
C
P
|
P
G
x
S
L
|
L
A
x
V
E
 
K
S
x
T
E
x
N
F
x
M
S
x
T

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
34% identity, 73% coverage: 4:188/253 of query aligns to 7:189/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
T
 
V
I
 
V
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
G
A
x
N
G
 
G
F
x
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
I
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
A
G
x
D
R
 
W
R
 
A
K
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
V
E
 
D
K
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
K
D
 
G
R
 
R
C
 
A
L
 
M
P
 
A
L
 
V
V
 
H
F
 
I
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
 
H
K
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
P
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
A
 
G
N
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
H
L
 
V
G
 
A
L
 
-
E
 
G
P
 
S
A
 
V
H
 
L
R
 
E
A
 
T
S
 
S
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
T
 
R
M
 
I
I
 
A
D
 
G
T
 
V
N
 
D
L
 
I
K
 
D
G
 
G
L
 
V
M
 
V
Y
 
F
C
 
C
T
 
S
R
 
K
A
 
F
L
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
K
 
K
G
 
G
H
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
T
G
 
A
S
|
S
I
x
V
A
x
S
G
 
G
S
 
L
Y
 
G
P
 
G
Y
 
D
P
 
W
G
 
G
G
 
A
N
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
F
 
A
V
 
V
M
 
V
Q
 
N
F
 
L
S
 
T
R
 
R
N
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
H
H
 
G
G
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
T
 
N
N
 
S
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
 
S
L
 
L
A
x
V
E
 
K
S
x
T
E
 
N
F
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
34% identity, 73% coverage: 4:188/253 of query aligns to 9:191/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
T
 
V
I
 
V
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
G
A
x
N
G
|
G
F
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
I
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
A
G
x
D
R
x
W
R
 
A
K
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
V
E
 
D
K
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
K
D
 
G
R
 
R
C
 
A
L
 
M
P
 
A
L
 
V
V
 
H
F
x
I
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
 
H
K
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
P
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
A
 
G
N
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
L
 
V
A
 
H
L
 
V
G
 
A
L
 
-
E
 
G
P
 
S
A
 
V
H
 
L
R
 
E
A
 
T
S
 
S
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
T
 
R
M
 
I
I
 
A
D
 
G
T
 
V
N
 
D
L
 
I
K
 
D
G
 
G
L
 
V
M
 
V
Y
 
F
C
 
C
T
 
S
R
 
K
A
 
F
L
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
K
 
K
G
 
G
H
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
T
G
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
L
Y
 
G
P
 
G
Y
 
D
P
 
W
G
 
G
G
 
A
N
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
A
V
 
V
M
 
V
Q
 
N
F
 
L
S
 
T
R
 
R
N
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
H
H
 
G
G
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
T
 
N
N
 
S
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
 
S
L
 
L
A
 
V
E
 
K
S
 
T
E
 
N
F
 
M
S
 
T

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
34% identity, 73% coverage: 4:188/253 of query aligns to 7:189/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
T
 
V
I
 
V
C
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
G
A
x
N
G
|
G
F
x
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
I
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
A
G
x
D
R
x
W
R
x
A
K
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
V
E
 
D
K
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
K
D
 
G
R
 
R
C
 
A
L
 
M
P
 
A
L
 
V
V
 
H
F
x
I
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
 
H
K
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
A
 
M
F
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
P
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
A
 
G
N
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
A
 
H
L
 
V
G
 
A
L
 
-
E
 
G
P
 
S
A
 
V
H
 
L
R
 
E
A
 
T
S
 
S
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
R
T
 
R
M
 
I
I
 
A
D
 
G
T
x
V
N
 
D
L
 
I
K
 
D
G
 
G
L
 
V
M
 
V
Y
 
F
C
 
C
T
 
S
R
 
K
A
 
F
L
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
L
V
 
L
E
 
-
R
 
K
G
 
T
K
 
K
G
 
G
H
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
T
G
 
A
S
|
S
I
 
V
A
x
S
G
 
G
S
 
L
Y
 
G
P
 
G
Y
 
D
P
 
W
G
 
G
G
 
A
N
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
F
 
A
V
 
V
M
 
V
Q
 
N
F
 
L
S
 
T
R
 
R
N
 
A
L
 
M
R
 
A
A
 
L
D
 
D
L
 
H
H
 
G
G
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
T
 
N
N
 
S
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
x
S
L
|
L
A
x
V
E
 
K
S
x
T
E
x
N
F
x
M
S
x
T

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
34% identity, 76% coverage: 1:192/253 of query aligns to 1:197/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
M
 
M
Q
 
S
A
 
R
T
 
V
I
 
A
C
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
S
A
x
S
G
|
G
F
x
N
G
 
G
E
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
G
C
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
A
I
 
A
T
 
L
G
x
D
R
x
L
R
 
S
K
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
T
L
 
H
G
 
W
E
 
H
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
D
 
D
R
 
K
C
 
V
L
 
L
P
 
R
L
 
V
V
 
R
F
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
D
R
 
E
K
 
G
A
 
D
V
 
V
E
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
T
P
 
M
E
 
E
A
 
Q
F
 
F
A
 
G
N
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
S
E
 
E
P
 
A
A
 
G
-
 
V
-
 
L
H
 
H
R
 
T
A
 
T
S
 
P
L
 
V
E
 
E
D
 
Q
W
 
F
E
 
D
T
 
K
M
 
V
I
 
M
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
I
M
 
F
Y
 
L
C
 
G
T
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
V
 
L
E
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
G
H
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
I
G
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
S
S
 
L
Y
 
V
P
 
A
Y
x
F
P
 
P
G
 
G
G
x
R
N
 
S
T
 
A
Y
|
Y
G
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
F
 
A
V
 
V
M
 
L
Q
 
Q
F
 
L
S
 
T
R
 
K
N
 
S
L
 
V
R
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
Y
H
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
T
 
N
N
 
A
I
 
V
E
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
M
A
x
I
E
 
E
S
x
T
E
x
P
F
x
M
S
x
T
V
 
Q
I
x
W
R
|
R
F
 
L

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
34% identity, 76% coverage: 1:192/253 of query aligns to 1:197/250 of Q56840

query
sites
Q56840
M
|
M
Q
 
S
A
 
R
T
 
V
I
 
A
C
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
A
x
S
G
|
G
F
x
N
G
 
G
E
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
T
R
 
R
F
 
F
A
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
G
C
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
A
I
 
A
T
 
L
G
x
D
R
 
L
R
 
S
K
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
R
E
 
T
L
 
H
G
 
W
E
 
H
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
D
 
D
R
 
K
C
 
V
L
 
L
P
 
R
L
 
V
V
 
R
F
 
A
D
|
D
V
|
V
R
 
A
D
 
D
R
 
E
K
 
G
A
 
D
V
 
V
E
 
N
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
T
P
 
M
E
 
E
A
 
Q
F
 
F
A
 
G
N
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
L
 
G
G
 
N
L
 
S
E
 
E
P
 
A
A
 
G
-
 
V
-
 
L
H
 
H
R
 
T
A
 
T
S
 
P
L
 
V
E
 
E
D
 
Q
W
 
F
E
 
D
T
 
K
M
 
V
I
 
M
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
I
M
 
F
Y
 
L
C
 
G
T
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
V
 
L
E
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
A
G
 
G
H
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
G
 
S
S
 
L
Y
 
V
P
 
A
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
G
x
R
N
 
S
T
 
A
Y
|
Y
G
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
F
 
A
V
 
V
M
 
L
Q
 
Q
F
 
L
S
 
T
R
 
K
N
 
S
L
 
V
R
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
Y
H
 
A
G
 
G
T
 
S
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
C
T
 
N
N
 
A
I
 
V
E
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
M
A
x
I
E
|
E
S
x
T
E
x
P
F
x
M
S
 
T
V
 
Q
I
x
W
R
|
R
F
 
L

Sites not aligning to the query:

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
36% identity, 70% coverage: 4:181/253 of query aligns to 8:179/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
T
 
T
I
 
A
C
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
T
 
T
A
 
S
G
|
G
F
 
I
G
 
G
E
 
L
A
 
E
C
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
L
F
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
D
L
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
R
|
R
R
x
D
K
 
A
E
 
Q
R
|
R
L
 
G
E
 
E
K
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
I
G
 
G
E
 
H
D
 
G
R
 
A
C
 
R
L
 
F
P
 
-
L
 
V
V
 
Q
F
 
A
D
|
D
V
x
L
R
 
G
D
 
D
R
 
L
K
 
D
A
 
S
V
 
V
E
 
A
A
 
D
A
 
L
F
 
A
A
 
A
A
 
Q
L
 
A
P
 
P
E
 
D
A
 
-
F
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
E
x
Y
P
 
P
A
 
Q
H
 
A
R
 
S
A
 
T
S
 
F
L
 
D
E
 
Q
D
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
G
W
 
F
E
 
Q
T
 
Q
M
 
L
I
 
F
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
T
M
 
Y
Y
 
F
C
 
L
T
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
A
P
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
H
G
 
G
H
 
S
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
I
G
 
T
S
x
T
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
H
Y
 
K
P
 
G
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
G
x
T
N
 
S
T
 
V
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
F
 
A
V
 
L
M
 
E
Q
 
S
F
 
L
S
 
T
R
 
R
N
 
T
L
 
W
R
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
F
H
 
G
G
 
A
T
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
N
N
 
S
I
 
V
E
 
S
P
|
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
34% identity, 71% coverage: 6:185/253 of query aligns to 11:187/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
C
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
 
A
A
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
E
 
L
A
 
E
C
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
C
 
A
R
 
K
L
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
-
G
 
A
R
x
D
R
x
F
K
 
N
E
 
E
R
 
A
L
 
A
E
 
G
K
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
N
E
 
P
D
 
G
R
 
V
C
 
V
L
 
F
P
 
I
L
 
R
V
|
V
F
 
-
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
R
 
R
K
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
H
A
 
R
A
 
L
F
 
V
A
 
E
A
 
N
L
 
V
P
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
G
N
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
A
 
T
L
 
R
G
x
D
L
 
-
E
 
S
P
 
M
A
 
L
H
 
S
R
x
K
A
 
M
S
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
Q
W
 
F
E
 
Q
T
 
Q
M
 
V
I
 
I
D
 
N
T
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
L
 
V
M
 
F
Y
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
H
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
G
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
T
G
 
G
S
 
T
Y
 
Y
P
 
G
Y
x
N
P
x
V
G
 
G
G
x
Q
N
 
T
T
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
F
 
G
V
 
V
M
 
I
Q
 
G
F
 
M
S
 
T
R
 
K
N
 
T
L
 
W
R
 
A
A
 
K
D
 
E
L
 
L
H
 
A
G
 
R
T
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
T
 
N
N
 
A
I
 
V
E
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
A
x
T
E
 
E
S
x
T

Sites not aligning to the query:

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
30% identity, 72% coverage: 6:188/253 of query aligns to 12:192/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
C
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
A
x
R
G
 
G
F
x
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
C
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
C
 
A
R
 
K
L
 
V
I
 
I
I
 
G
T
 
T
G
 
A
R
x
T
R
 
S
K
 
E
E
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
K
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
-
D
 
D
R
 
N
C
 
G
L
 
K
P
 
G
L
 
M
V
 
A
F
 
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
N
R
 
P
K
 
E
A
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
V
F
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
I
P
 
T
E
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
G
N
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
x
I
A
 
T
L
 
R
G
 
D
L
 
-
E
 
N
P
 
L
A
 
L
H
 
M
R
 
R
A
 
M
S
 
K
L
 
E
E
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
S
T
 
D
M
 
I
I
 
M
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
L
 
I
M
 
F
Y
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
R
G
 
G
M
 
M
V
 
M
E
 
K
R
 
K
G
 
R
K
 
Q
G
 
G
H
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
V
G
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
T
Y
 
M
P
 
G
Y
 
N
P
 
A
G
 
G
G
 
Q
N
 
A
T
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
F
 
G
V
 
V
M
 
I
Q
 
G
F
 
F
S
 
T
R
 
K
N
 
S
L
 
M
R
 
A
A
 
R
D
 
E
L
 
V
H
 
A
G
 
S
T
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
T
 
N
N
 
T
I
 
V
E
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
A
x
I
E
 
E
S
x
T
E
 
D
F
x
M
S
 
T

Query Sequence

>207249 MicrobesOnline__882:207249
MQATICITGATAGFGEACARRFAAEGCRLIITGRRKERLEKLAAELGEDRCLPLVFDVRD
RKAVEAAFAALPEAFANVDVLINNAGLALGLEPAHRASLEDWETMIDTNLKGLMYCTRAL
LPGMVERGKGHVVNLGSIAGSYPYPGGNTYGATKAFVMQFSRNLRADLHGTGVRVTNIEP
GLAESEFSVIRFKGDASKAAGVYKGTEPLRPVDIADIIHFAVTCPAHVNINRIEVMPTCQ
SFGALPVHRTEAD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory