SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 208656 MicrobesOnline__882:208656 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3pk0B Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from mycobacterium smegmatis (see paper)
58% identity, 99% coverage: 1:256/258 of query aligns to 5:260/262 of 3pk0B

query
sites
3pk0B
M
 
M
F
 
F
S
 
D
G
 
-
M
 
L
Q
 
Q
D
 
G
R
 
R
R
 
S
V
 
V
M
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
T
K
 
K
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
R
R
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
F
 
A
L
 
V
A
 
A
D
 
G
L
 
R
S
 
S
A
 
T
E
 
A
H
 
D
V
 
I
E
 
D
A
 
A
T
 
C
G
 
V
N
 
A
A
 
D
F
 
L
R
x
D
A
 
Q
K
 
L
G
|
G
Y
 
S
N
x
G
V
 
K
A
 
V
W
 
I
G
 
G
V
 
V
-
 
Q
A
 
T
D
 
D
V
 
V
K
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
A
S
 
Q
V
 
C
E
 
D
Q
 
A
V
 
L
A
 
A
S
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
V
C
 
C
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
F
 
F
P
 
P
A
 
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
E
 
A
T
 
T
M
 
M
T
 
T
E
 
P
E
 
E
Q
 
Q
W
 
L
D
 
N
T
 
G
V
 
I
L
 
F
D
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
N
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
Y
T
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
I
 
L
P
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
I
E
 
A
S
 
S
T
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
L
T
 
T
S
 
S
S
|
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
W
|
W
C
 
S
H
 
H
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
M
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
M
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
H
G
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
Q
 
M
P
 
P
G
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
L
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
M
 
I
A
 
A
S
 
S
M
 
M
A
 
A
S
 
R
S
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
G
A
 
H
A
 
L
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
I
 
I
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
I

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
52% identity, 99% coverage: 1:256/258 of query aligns to 3:258/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
M
 
M
F
 
F
S
 
T
G
 
S
M
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
R
R
 
S
V
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
x
S
K
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
T
F
 
F
A
 
A
S
 
N
R
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
V
 
V
F
 
V
L
 
I
A
 
T
D
x
G
L
x
R
S
x
N
A
 
Q
E
 
D
H
 
D
V
 
L
E
 
D
A
 
R
T
 
T
G
 
V
N
 
A
A
 
D
F
 
L
R
 
S
A
 
G
K
 
T
G
 
R
Y
 
G
N
 
K
V
 
V
A
 
T
W
 
A
G
 
V
V
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
K
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
E
S
 
D
V
 
A
E
 
R
Q
 
R
V
 
T
A
 
V
S
 
A
K
 
E
A
 
T
V
 
V
E
 
S
Q
 
R
L
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
V
C
 
C
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
F
|
F
P
 
P
A
 
S
A
 
G
P
 
R
L
 
L
E
 
E
T
 
D
M
 
L
T
 
T
E
 
P
E
 
D
Q
 
D
W
 
I
D
 
E
T
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
F
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
V
L
 
Y
T
 
I
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
C
 
A
I
 
L
P
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
T
E
 
A
S
 
S
T
 
G
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
 
I
T
|
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
W
|
W
C
 
S
H
 
H
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
M
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
K
G
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
L
P
|
P
G
|
G
N
|
N
I
|
I
A
 
M
T
|
T
E
 
E
G
|
G
L
|
L
Q
 
D
E
 
E
Q
 
M
G
 
G
E
 
Q
A
 
D
Y
 
Y
M
 
L
A
 
D
S
 
Q
M
 
M
A
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
S
P
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
G
A
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
A
S
 
T
P
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
L
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
S
L
 
H
E
 
L
A
 
A
L
 
I

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
41% identity, 95% coverage: 4:249/258 of query aligns to 2:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
D
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
M
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
E
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
F
 
V
L
 
I
A
 
N
D
|
D
L
 
I
S
 
D
A
 
A
E
 
E
H
 
K
V
 
V
E
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
V
N
 
D
A
 
E
F
 
F
R
 
S
A
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
H
N
 
R
V
 
V
A
 
L
W
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
K
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
M
A
 
V
S
 
K
K
 
Q
A
 
T
V
 
I
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
F
 
E
P
 
R
A
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
L
E
 
R
T
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
V
V
 
T
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
I
 
H
P
 
G
A
 
H
L
 
M
K
 
V
E
 
E
S
 
N
T
 
K
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
N
T
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
-
T
 
-
G
 
R
P
 
A
V
 
W
T
 
L
G
 
G
Y
 
G
P
 
A
G
 
G
W
 
Q
C
 
T
H
 
P
Y
|
Y
G
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
M
I
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
L
I
 
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
G
 
M
L
 
W
Q
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
P
E
 
E
A
 
K
Y
 
D
M
 
Q
A
 
Q
S
 
F
M
 
L
A
 
L
S
 
S
S
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
A
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
D
D
 
D
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
V
I
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:249/258 of query aligns to 1:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
D
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
A
M
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
A
K
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
I
 
T
A
 
A
E
 
L
A
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
F
 
V
L
 
I
A
 
N
D
|
D
L
x
I
S
 
D
A
 
A
E
 
E
H
 
K
V
 
V
E
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
V
N
 
D
A
 
E
F
 
F
R
 
S
A
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
H
N
 
R
V
 
V
A
 
L
W
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
K
 
G
D
 
N
K
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
M
A
 
V
S
 
K
K
 
Q
A
 
T
V
 
I
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
F
 
E
P
 
R
A
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
L
E
 
R
T
 
K
M
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
V
V
 
T
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
I
 
H
P
 
G
A
 
H
L
 
M
K
 
V
E
 
E
S
 
N
T
 
K
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
-
T
 
-
G
 
R
P
 
A
V
 
W
T
 
L
G
 
G
Y
 
G
P
 
A
G
 
G
W
 
Q
C
 
T
H
 
P
Y
|
Y
G
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
M
I
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
L
I
|
I
A
 
H
T
 
T
E
 
P
G
 
M
L
 
W
Q
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
P
E
 
E
A
 
K
Y
 
D
M
 
Q
A
 
Q
S
 
F
M
 
L
A
 
L
S
 
S
S
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
E
P
 
P
A
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
A
 
L
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
D
D
 
D
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
V
I
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
S
L
 
L

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 96% coverage: 2:249/258 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
F
 
M
S
 
S
G
 
R
M
 
L
Q
 
Q
D
 
D
R
 
K
R
 
V
V
 
A
M
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
K
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
G
 
E
I
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
S
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
V
L
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
F
S
 
N
A
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
-
E
 
E
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
E
F
 
A
R
 
V
A
 
E
K
 
A
G
 
N
Y
 
P
N
 
G
V
 
V
A
 
V
W
 
F
G
 
I
V
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
K
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
E
S
 
S
V
 
V
E
 
H
Q
 
R
V
 
L
A
 
V
S
 
E
K
 
N
A
 
V
V
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
F
 
T
P
 
R
A
x
D
A
 
S
P
 
M
L
 
L
E
 
S
T
x
K
M
 
M
T
 
T
E
 
V
E
 
D
Q
 
Q
W
 
F
D
 
Q
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
C
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
C
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
M
K
 
A
E
 
E
S
 
Q
T
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
T
 
T
G
 
G
P
 
T
V
 
Y
T
 
-
G
 
G
Y
x
N
P
x
V
G
 
G
W
x
Q
C
 
T
H
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
M
I
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
 
G
N
x
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
E
 
A
G
x
M
L
 
V
Q
 
A
E
 
E
Q
 
V
G
 
P
E
 
E
A
 
K
Y
 
V
M
 
I
A
 
E
S
x
K
M
 
M
A
 
K
S
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
H
D
 
E
A
 
S
G
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
G
 
V
I
 
L
I
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
I
I
 
M
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
41% identity, 94% coverage: 8:249/258 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
R
 
S
V
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
S
K
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
F
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
F
 
A
L
 
V
A
 
N
D
 
Y
L
 
A
-
 
G
S
 
S
A
 
K
E
 
E
H
 
K
V
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
G
 
V
N
 
E
A
 
E
F
 
I
R
 
K
A
 
A
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
N
 
D
V
 
S
A
 
F
W
 
A
G
 
I
V
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
K
 
A
D
 
D
K
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
E
 
K
Q
 
A
V
 
M
A
 
I
S
 
K
K
 
E
A
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
Q
Q
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
C
V
 
I
Q
 
Q
A
 
K
C
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
L
E
 
R
S
 
Q
T
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
A
V
 
V
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
G
 
G
W
x
Q
C
 
A
H
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
L
I
 
T
R
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
G
 
M
L
 
T
Q
 
D
E
 
A
Q
 
L
G
 
S
E
 
D
A
 
E
Y
 
L
M
 
K
A
 
E
S
 
Q
M
 
M
A
 
L
S
 
T
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
K
A
 
A
G
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
I
I
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
Y
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
42% identity, 94% coverage: 8:249/258 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
R
 
S
V
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
G
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
F
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
F
 
A
L
 
V
A
x
N
D
x
Y
L
x
A
-
x
G
S
|
S
A
 
K
E
 
E
H
 
K
V
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
G
 
V
N
 
E
A
 
E
F
 
I
R
 
K
A
 
A
K
 
K
G
 
G
Y
 
V
N
 
D
V
 
S
A
 
F
W
 
A
G
 
I
V
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
K
 
A
D
 
D
K
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
E
 
K
Q
 
A
V
 
M
A
 
I
S
 
K
K
 
E
A
 
V
V
 
V
E
 
S
Q
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
Q
Q
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
C
V
 
I
Q
 
Q
A
 
K
C
 
A
I
 
T
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
L
E
 
R
S
 
Q
T
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
A
V
 
V
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
G
 
G
W
x
Q
C
 
A
H
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
L
I
 
T
R
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
N
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
G
 
M
L
 
T
Q
 
D
E
 
E
Q
 
L
G
 
K
E
 
E
A
 
-
Y
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
Q
M
 
M
A
 
L
S
 
T
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
K
A
 
A
G
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
I
I
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
Y
L
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
41% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 6:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
L
Q
 
A
D
 
S
R
 
K
R
 
T
V
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
F
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
A
S
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
I
L
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
R
S
 
D
A
 
A
E
 
-
H
 
H
V
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
A
G
 
A
N
 
A
A
 
S
F
 
L
R
 
R
A
 
E
K
 
S
G
 
G
Y
 
A
N
 
Q
V
 
A
A
 
L
W
 
F
G
 
I
V
 
S
A
x
C
D
 
N
V
x
I
K
 
A
D
 
E
K
 
K
A
 
T
S
 
Q
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
L
A
 
F
S
 
S
K
 
Q
A
 
A
V
 
E
E
 
E
Q
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
F
 
N
P
 
R
A
 
D
A
 
A
P
 
M
L
 
L
E
 
H
T
 
K
M
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
A
Q
 
D
W
 
W
D
 
D
T
 
T
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
V
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
C
 
A
I
 
A
P
 
I
A
 
R
L
 
M
K
 
R
E
 
E
S
 
R
T
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
T
 
S
G
 
W
P
 
-
V
 
-
T
 
L
G
 
G
Y
 
N
P
 
V
G
 
G
W
 
Q
C
 
T
H
 
N
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
V
G
 
G
F
 
M
I
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
C
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
Q
 
C
P
 
P
G
 
G
N
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
G
 
M
L
x
T
Q
 
R
E
 
G
Q
 
V
G
 
P
E
 
E
A
 
N
Y
 
V
M
 
W
A
 
Q
S
 
I
M
 
M
A
 
V
S
 
S
S
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
L
 
E
P
 
A
A
 
K
D
 
D
I
 
V
A
 
G
A
 
E
A
 
C
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
G
 
V
I
 
I
I
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
V
L
 
L

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:249/258 of query aligns to 3:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
F
 
F
S
 
M
G
 
N
M
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
L
 
G
A
 
T
D
 
A
L
x
T
S
 
S
A
 
E
E
 
S
H
 
G
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
I
G
 
S
N
 
D
A
 
Y
F
 
L
R
 
G
A
 
D
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
N
 
G
V
 
M
A
 
A
W
 
L
G
 
-
V
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
K
 
T
D
 
N
K
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
A
 
L
S
 
K
K
 
A
A
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
M
 
I
F
 
F
L
 
R
T
 
L
V
 
S
Q
 
K
A
 
A
C
 
V
I
 
L
P
 
R
A
 
G
L
 
M
K
 
M
E
 
K
S
 
K
T
 
R
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
M
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
A
G
 
G
W
x
Q
C
 
A
H
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
T
R
 
K
T
 
S
A
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
N
 
F
I
 
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
G
 
M
L
 
N
Q
 
D
E
 
E
Q
 
Q
G
 
R
E
 
T
A
 
A
Y
 
T
M
 
L
A
 
A
S
 
-
M
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
T
I
 
L
I
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
Y
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
L
Q
 
Q
D
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
M
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
x
S
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
G
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
A
S
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
F
 
F
L
 
F
A
x
N
-
x
Y
D
x
N
L
x
G
S
|
S
A
 
P
E
 
E
H
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
E
T
 
T
G
 
A
N
 
K
A
 
L
F
 
V
R
 
A
A
 
E
K
 
H
G
 
G
Y
 
V
N
 
E
V
 
V
A
 
E
W
 
A
G
 
M
V
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
K
 
A
D
 
I
K
 
A
A
 
E
S
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
F
A
 
F
S
 
K
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
V
 
T
Q
 
K
A
 
A
C
 
V
I
 
S
P
 
R
A
 
T
L
 
M
K
 
M
E
 
K
S
 
Q
T
 
R
S
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
L
V
 
I
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
A
G
 
G
W
x
Q
C
 
A
H
 
N
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
L
I
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
 
G
N
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
G
 
M
L
 
T
Q
 
D
E
 
K
Q
 
L
G
 
D
E
 
E
A
 
K
Y
 
T
M
 
K
A
 
E
S
 
A
M
 
M
A
 
L
S
 
A
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
L
 
T
P
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
A
A
 
S
G
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
L
I
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
V
L
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 96% coverage: 2:249/258 of query aligns to 3:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
F
 
F
S
 
M
G
 
N
M
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
K
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
L
F
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
L
 
G
A
 
T
D
 
A
L
x
T
S
 
S
A
 
E
E
 
S
H
 
G
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
I
G
 
S
N
 
D
A
 
Y
F
 
L
R
 
G
A
 
D
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
N
 
G
V
 
M
A
 
A
W
 
L
G
 
-
V
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
K
 
T
D
 
N
K
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
E
Q
 
A
V
 
V
A
 
L
S
 
K
K
 
A
A
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
M
 
I
F
 
F
L
 
R
T
 
L
V
 
S
Q
 
K
A
 
A
C
 
V
I
 
L
P
 
R
A
 
G
L
 
M
K
 
M
E
 
K
S
 
K
T
 
R
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
M
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
A
G
 
G
W
 
Q
C
 
A
H
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
T
R
 
K
T
 
S
A
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
N
 
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
G
x
M
L
 
T
Q
 
K
E
 
A
Q
 
L
G
 
N
E
 
D
A
 
E
Y
 
Q
M
 
R
A
 
T
S
 
A
M
 
T
A
 
L
S
 
A
S
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
T
I
 
L
I
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
Y
L
 
M

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 1:248/258 of query aligns to 1:247/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
M
|
M
F
 
T
S
 
Q
G
 
R
M
 
L
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
R
 
L
V
 
A
M
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
A
K
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
V
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
F
 
A
L
 
I
A
 
A
D
|
D
L
 
L
-
 
V
S
 
P
A
 
A
E
 
P
H
 
E
V
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
-
G
 
-
N
 
-
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
N
K
 
L
G
 
G
Y
 
R
N
 
R
V
 
V
A
 
L
W
 
T
G
 
V
V
 
K
A
x
C
D
|
D
V
|
V
K
 
S
D
 
Q
K
 
P
A
 
G
S
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
F
A
 
G
S
 
K
K
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
S
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
x
Y
P
 
P
A
 
L
A
 
I
P
 
P
L
 
F
E
 
D
T
 
E
M
 
L
T
 
T
E
 
F
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
D
 
K
T
 
K
V
 
T
L
 
F
D
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
S
M
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
M
V
 
A
Q
 
K
A
 
A
C
 
F
I
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
M
K
 
K
E
 
R
S
 
N
T
 
G
S
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
L
S
 
T
S
 
S
I
 
T
T
 
T
G
 
Y
P
 
W
V
 
L
T
 
K
G
 
-
Y
 
I
P
 
E
G
 
A
W
 
Y
C
 
T
H
 
H
Y
 
Y
G
 
I
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
N
M
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
P
|
P
G
x
S
N
x
L
I
x
V
A
 
R
T
 
T
E
 
A
G
x
T
L
 
T
Q
 
E
E
 
A
Q
 
S
G
 
A
E
 
L
A
 
S
Y
 
A
M
 
M
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
L
A
 
P
S
 
N
M
 
M
A
 
L
S
 
Q
S
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
-
R
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
L
 
V
P
 
P
A
 
L
D
 
D
I
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
V

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
37% identity, 95% coverage: 5:248/258 of query aligns to 3:245/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
M
 
L
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
R
 
L
V
 
A
M
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
 
A
K
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
V
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
F
 
A
L
 
I
A
 
A
D
|
D
L
|
L
-
 
V
S
 
P
A
 
A
E
 
P
H
 
E
V
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
-
G
 
-
N
 
-
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
N
K
 
L
G
 
G
Y
 
R
N
 
R
V
 
V
A
 
L
W
 
T
G
 
V
V
 
K
A
x
C
D
|
D
V
|
V
K
 
S
D
 
Q
K
 
P
A
 
G
S
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
V
 
F
A
 
G
S
 
K
K
 
Q
A
 
V
V
 
I
E
 
S
Q
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
F
 
Y
P
 
P
A
 
L
A
 
I
P
 
P
L
 
F
E
 
D
T
 
E
M
 
L
T
 
T
E
 
F
E
 
E
Q
 
Q
W
 
W
D
 
K
T
 
K
V
 
T
L
 
F
D
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
S
M
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
M
V
 
A
Q
 
K
A
 
A
C
 
F
I
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
M
K
 
K
E
 
R
S
 
N
T
 
G
S
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
 
L
S
 
T
S
|
S
I
 
T
T
 
T
G
 
Y
P
 
W
V
 
L
T
 
K
G
 
-
Y
 
I
P
 
E
G
 
A
W
x
Y
C
 
T
H
 
H
Y
|
Y
G
 
I
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
N
M
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
P
|
P
G
x
S
N
x
L
I
x
V
A
 
R
T
 
T
E
 
A
G
x
T
L
 
T
Q
 
E
E
 
A
Q
 
S
G
 
A
E
 
L
A
 
S
Y
 
A
M
 
M
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
L
A
 
P
S
 
N
M
 
M
A
 
L
S
 
Q
S
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
-
R
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
L
 
V
P
 
P
A
 
L
D
 
D
I
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
V

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
38% identity, 93% coverage: 10:249/258 of query aligns to 7:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
V
 
V
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
K
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
T
F
 
F
A
 
V
S
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
L
 
G
A
 
T
D
 
A
L
x
T
S
 
S
A
 
E
E
 
S
H
 
G
V
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
I
G
 
S
N
 
G
A
 
Y
F
 
L
R
 
G
A
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
N
 
G
V
 
F
A
 
-
W
 
-
G
 
-
V
 
M
A
 
L
D
x
N
V
|
V
K
 
K
D
 
D
K
 
A
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
D
Q
 
S
V
 
V
A
 
L
S
 
A
K
 
S
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
E
T
 
D
V
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
M
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
L
V
 
S
Q
 
K
A
 
A
C
 
V
I
 
M
P
 
C
A
 
A
L
 
M
K
 
M
E
 
K
S
 
K
T
 
R
S
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
T
T
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
M
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
A
G
 
G
W
 
Q
C
 
A
H
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
L
M
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
S
R
 
K
T
 
S
A
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
N
 
Y
I
 
I
A
 
E
T
 
T
E
 
D
G
 
M
L
 
T
Q
 
R
E
 
A
Q
 
L
G
 
T
E
 
D
A
 
D
Y
 
Q
M
 
R
A
 
A
S
 
G
M
 
I
A
 
L
S
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
L
 
D
P
 
A
A
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
G
 
T
I
 
L
I
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
Y
L
 
M

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
40% identity, 93% coverage: 8:246/258 of query aligns to 8:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
R
 
R
R
 
K
V
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
S
K
|
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
D
S
 
K
R
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
F
 
A
L
 
I
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
D
A
 
V
E
 
M
H
 
A
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
V
G
 
V
N
 
A
A
 
G
F
 
L
R
 
E
A
 
N
K
 
G
G
 
G
Y
 
F
N
 
A
V
 
V
A
 
E
W
 
-
G
 
-
V
 
-
A
x
V
D
|
D
V
|
V
K
 
T
D
 
K
K
 
R
A
 
A
S
 
S
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
V
 
A
A
 
M
S
 
Q
K
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
C
 
C
A
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
F
 
S
P
 
T
A
 
M
A
 
R
P
 
P
L
 
A
E
 
V
T
 
D
M
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
E
Q
 
E
W
 
W
D
 
D
T
 
F
V
 
N
L
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
A
K
 
R
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
A
V
 
N
Q
 
Q
-
 
I
A
 
A
C
 
C
I
 
R
P
 
H
A
 
F
L
 
L
K
 
A
E
 
S
S
 
N
T
 
T
S
 
K
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
V
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
I
 
L
T
 
A
G
 
A
P
 
K
V
 
V
T
 
-
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
G
 
L
W
x
L
C
 
A
H
 
H
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
A
Q
 
V
M
 
F
G
 
G
F
 
W
I
 
T
R
 
Q
T
 
A
A
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
M
A
 
A
R
 
P
Y
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
R
I
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
Q
 
C
P
 
P
G
|
G
N
 
F
I
x
V
A
 
K
T
|
T
E
 
-
G
 
A
L
x
M
Q
 
Q
E
 
E
Q
 
R
G
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
W
-
x
E
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
V
M
 
R
A
 
A
S
 
E
M
 
Y
A
 
V
S
 
S
S
 
L
I
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
E
L
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
A
A
 
A
G
 
R
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
38% identity, 95% coverage: 5:249/258 of query aligns to 3:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
M
 
L
Q
 
E
D
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
M
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
E
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
-
 
A
-
 
G
-
x
D
L
|
L
A
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
T
A
 
Y
E
 
S
H
 
H
V
 
P
E
 
N
A
 
V
T
 
E
G
 
G
N
 
M
A
 
Y
F
x
L
R
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
Y
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
D
x
N
V
|
V
K
 
T
D
 
D
K
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
V
 
F
A
 
Y
S
 
Q
K
 
S
A
 
V
V
 
I
E
 
D
Q
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
F
 
T
P
 
K
A
 
D
A
 
A
P
 
M
L
 
T
E
 
R
T
 
K
M
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
A
Q
 
Q
W
 
W
D
 
D
T
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
M
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
L
V
 
T
Q
 
R
A
 
L
C
 
V
I
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
K
 
Q
E
 
T
S
 
N
T
 
G
S
 
Y
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
V
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
-
V
 
V
T
 
F
G
 
G
Y
 
N
P
 
I
G
 
G
W
 
Q
C
 
A
H
 
N
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
V
M
 
I
G
 
G
F
 
L
I
 
T
R
 
M
T
 
T
A
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
Y
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
T
 
R
I
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
N
 
Y
I
|
I
A
 
M
T
|
T
E
 
D
G
 
I
L
 
L
Q
 
K
E
 
T
Q
 
V
G
 
P
E
 
Q
A
 
D
Y
 
L
M
 
L
A
 
D
S
 
K
M
 
F
A
 
A
S
 
A
S
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
D
 
D
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
I
I
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
I
 
R
L
 
L

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
36% identity, 93% coverage: 11:249/258 of query aligns to 9:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
K
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
T
F
 
L
A
 
V
S
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
L
 
G
A
 
T
D
 
A
L
x
T
S
 
S
A
 
E
E
 
S
H
 
G
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
I
G
 
S
N
 
D
A
 
Y
F
 
L
R
 
G
A
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
N
 
G
V
 
L
A
 
-
W
 
-
G
 
-
V
 
M
A
x
L
D
x
N
V
|
V
K
 
T
D
 
D
K
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
A
 
L
S
 
E
K
 
N
A
 
V
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
F
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
T
 
R
M
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
D
 
N
T
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
M
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
L
V
 
S
Q
 
K
A
 
A
C
 
V
I
 
M
P
 
R
A
 
A
L
 
M
K
 
M
E
 
K
S
 
K
T
 
R
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
T
T
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
T
 
V
G
 
G
P
 
T
V
 
M
T
 
-
G
 
G
Y
 
N
P
 
A
G
 
G
W
 
Q