SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 208876 MicrobesOnline__882:208876 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

6n2oC 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus with 2-oxoglutarate, coenzyme a and succinyl-coa bound (see paper)
28% identity, 89% coverage: 4:321/357 of query aligns to 195:540/572 of 6n2oC

query
sites
6n2oC
E
 
E
K
 
P
T
 
K
E
 
D
R
 
V
I
 
I
F
 
I
I
 
M
K
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
G
H
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
I
A
 
L
A
 
G
G
 
G
C
 
L
R
 
E
C
 
F
Y
 
F
F
 
S
G
 
A
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
T
D
 
E
I
 
V
P
 
A
E
 
K
M
 
Y
M
 
V
S
 
A
S
 
T
A
 
H
I
 
L
P
 
P
A
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
F
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
|
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
I
N
 
A
M
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
V
 
K
R
 
K
A
 
S
F
 
M
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
A
 
M
I
 
L
S
 
G
Y
 
M
M
 
A
A
 
H
G
 
M
S
 
S
E
 
E
L
 
T
P
 
P
G
 
C
V
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
D
M
 
V
N
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
S
L
 
T
G
 
G
-
 
L
D
x
P
I
x
T
G
 
K
P
 
H
S
 
E
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
Y
 
L
F
 
F
Q
 
L
S
 
A
V
 
I
K
 
H
G
 
-
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
D
Y
 
S
R
 
P
T
 
R
Y
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
V
A
 
E
T
 
D
C
 
V
Q
 
K
E
 
D
C
 
C
Y
 
I
D
 
S
M
 
M
M
 
T
F
 
V
E
 
D
A
 
G
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
S
D
 
D
A
 
G
I
 
S
V
 
L
G
 
A
Q
 
F
M
 
S
K
 
T
E
 
Q
P
 
T
V
 
I
T
 
P
P
 
R
W
 
P
K
 
K
R
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
T
P
 
I
A
 
I
T
 
N
E
 
R
G
 
K
A
 
T
D
 
-
W
 
W
R
 
D
L
 
G
Q
 
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
Y
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
M
-
 
A
A
 
A
K
 
P
G
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
N
R
 
A
L
 
K
L
 
H
K
 
I
S
 
A
L
 
T
F
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
H
G
 
G
A
 
E
L
 
T
A
 
G
G
 
A
Q
 
P
N
 
N
R
 
Y
N
 
S
L
 
-
Q
 
P
A
 
A
K
 
N
Y
 
H
E
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
H
E
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
F
A
 
Y
E
 
K
C
 
N
F
 
M
E
 
E
T
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
T
G
 
I
R
 
G
I
 
V
A
 
V
K
 
R
S
 
E
A
 
A
I
 
M
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
T
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
H
 
L
K
 
K
V
 
V
G
 
K
L
 
A
V
 
M
R
 
Y
P
 
P
V
 
K
T
 
L
L
 
L
F
 
W
P
 
P
F
 
M
P
 
P
E
 
V
K
 
A
V
 
D
L
 
Y
Q
 
D
D
 
A
L
 
F
A
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
C
K
 
K
R
 
K
F
 
V
L
 
I
T
 
V
I
 
P
E
 
E
H
 
V
N
 
N
C
 
F
-
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
L
V
 
S
D
 
H
D
 
F
V
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6n2oA 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus with 2-oxoglutarate, coenzyme a and succinyl-coa bound (see paper)
28% identity, 89% coverage: 4:321/357 of query aligns to 195:540/572 of 6n2oA

query
sites
6n2oA
E
 
E
K
 
P
T
 
K
E
 
D
R
 
V
I
 
I
F
 
I
I
 
M
K
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
G
H
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
I
A
 
L
A
 
G
G
 
G
C
 
L
R
 
E
C
 
F
Y
 
F
F
 
S
G
 
A
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
T
D
 
E
I
 
V
P
 
A
E
 
K
M
 
Y
M
 
V
S
 
A
S
 
T
A
 
H
I
 
L
P
 
P
A
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
F
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
|
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
I
N
 
A
M
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
V
 
K
R
 
K
A
 
S
F
 
M
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
A
 
M
I
 
L
S
 
G
Y
 
M
M
 
A
A
 
H
G
 
M
S
 
S
E
 
E
L
 
T
P
 
P
G
 
C
V
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
D
M
 
V
N
 
Q
R
|
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
S
L
x
T
G
 
G
-
 
L
D
x
P
I
 
T
G
 
K
P
 
H
S
 
E
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
Y
 
L
F
 
F
Q
 
L
S
 
A
V
 
I
K
 
H
G
 
-
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
D
Y
 
S
R
 
P
T
 
R
Y
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
V
A
 
E
T
 
D
C
 
V
Q
 
K
E
 
D
C
 
C
Y
 
I
D
 
S
M
 
M
M
 
T
F
 
V
E
 
D
A
 
G
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
S
D
 
D
A
 
G
I
 
S
V
 
L
G
 
A
Q
 
F
M
 
S
K
 
T
E
 
Q
P
 
T
V
 
I
T
 
P
P
 
R
W
 
P
K
 
K
R
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
T
P
 
I
A
 
I
T
 
N
E
 
R
G
 
K
A
 
T
D
 
-
W
 
W
R
 
D
L
 
G
Q
 
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
Y
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
M
-
 
A
A
 
A
K
 
P
G
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
N
R
 
A
L
 
K
L
 
H
K
 
I
S
 
A
L
 
T
F
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
H
G
 
G
A
 
E
L
 
T
A
 
G
G
 
A
Q
 
P
N
 
N
R
 
Y
N
 
S
L
 
-
Q
 
P
A
 
A
K
 
N
Y
 
H
E
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
H
E
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
F
A
 
Y
E
 
K
C
 
N
F
 
M
E
 
E
T
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
T
G
 
I
R
 
G
I
 
V
A
 
V
K
 
R
S
 
E
A
 
A
I
 
M
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
T
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
H
 
L
K
 
K
V
 
V
G
 
K
L
 
A
V
 
M
R
 
Y
P
 
P
V
 
K
T
 
L
L
 
L
F
 
W
P
 
P
F
 
M
P
 
P
E
 
V
K
 
A
V
 
D
L
 
Y
Q
 
D
D
 
A
L
 
F
A
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
C
K
 
K
R
 
K
F
 
V
L
 
I
T
 
V
I
 
P
E
 
E
H
 
V
N
 
N
C
 
F
-
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
L
V
 
S
D
 
H
D
 
F
V
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6n2nA Crystal structure of 2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase from magnetococcus marinus (see paper)
28% identity, 89% coverage: 4:321/357 of query aligns to 195:540/572 of 6n2nA

query
sites
6n2nA
E
 
E
K
 
P
T
 
K
E
 
D
R
 
V
I
 
I
F
 
I
I
 
M
K
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
G
H
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
I
A
 
L
A
 
G
G
 
G
C
 
L
R
 
E
C
 
F
Y
 
F
F
 
S
G
 
A
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
T
D
 
E
I
 
V
P
 
A
E
 
K
M
 
Y
M
 
V
S
 
A
S
 
T
A
 
H
I
 
L
P
 
P
A
 
K
A
 
C
G
 
G
G
 
G
E
 
D
F
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
|
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
I
N
 
A
M
 
Q
L
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
V
 
K
R
 
K
A
 
S
F
 
M
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
A
 
M
I
 
L
S
 
G
Y
 
M
M
 
A
A
 
H
G
 
M
S
 
S
E
 
E
L
 
T
P
 
P
G
 
C
V
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
D
M
 
V
N
 
Q
R
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
S
L
 
T
G
 
G
-
 
L
D
 
P
I
 
T
G
 
K
P
 
H
S
 
E
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
Y
 
L
F
 
F
Q
 
L
S
 
A
V
 
I
K
 
H
G
 
-
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
D
Y
 
S
R
 
P
T
 
R
Y
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
V
A
 
E
T
 
D
C
 
V
Q
 
K
E
 
D
C
 
C
Y
 
I
D
 
S
M
 
M
M
 
T
F
 
V
E
 
D
A
 
G
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
S
D
 
D
A
 
G
I
 
S
V
 
L
G
 
A
Q
 
F
M
 
S
K
 
T
E
 
Q
P
 
T
V
 
I
T
 
P
P
 
R
W
 
P
K
 
K
R
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
T
P
 
I
A
 
I
T
 
N
E
 
R
G
 
K
A
 
T
D
 
-
W
 
W
R
 
D
L
 
G
Q
 
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
Y
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
P
-
 
M
-
 
A
A
 
A
K
 
P
G
 
G
R
 
T
P
 
P
A
 
N
R
 
A
L
 
K
L
 
H
K
 
I
S
 
A
L
 
T
F
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
H
G
 
G
A
 
E
L
 
T
A
 
G
G
 
A
Q
 
P
N
 
N
R
 
Y
N
 
S
L
 
-
Q
 
P
A
 
A
K
 
N
Y
 
H
E
 
E
A
 
L
M
 
M
K
 
H
E
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
N
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
V
L
 
L
A
 
D
R
 
F
A
 
Y
E
 
K
C
 
N
F
 
M
E
 
E
T
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
G
V
 
I
V
 
I
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
T
G
 
I
R
 
G
I
 
V
A
 
V
K
 
R
S
 
E
A
 
A
I
 
M
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
T
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
H
 
L
K
 
K
V
 
V
G
 
K
L
 
A
V
 
M
R
 
Y
P
 
P
V
 
K
T
 
L
L
 
L
F
 
W
P
 
P
F
 
M
P
 
P
E
 
V
K
 
A
V
 
D
L
 
Y
Q
 
D
D
 
A
L
 
F
A
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
C
K
 
K
R
 
K
F
 
V
L
 
I
T
 
V
I
 
P
E
 
E
H
 
V
N
 
N
C
 
F
-
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
L
V
 
S
D
 
H
D
 
F
V
 
I
R
 
R

Q96XT2 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2, subunit alpha; OFOR2; EC 1.2.7.11 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see paper)
29% identity, 86% coverage: 7:312/357 of query aligns to 229:573/628 of Q96XT2

query
sites
Q96XT2
E
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Q
I
 
V
K
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
I
I
 
S
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
L
R
 
R
C
 
F
Y
 
Q
F
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
I
 
I
P
 
E
E
 
A
M
 
N
M
 
Q
S
 
N
S
 
L
A
 
D
I
 
M
P
 
I
A
 
V
A
 
E
G
 
G
G
 
N
E
 
E
F
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
N
M
 
M
L
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
S
F
 
A
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
A
 
G
I
 
I
S
 
S
Y
 
W
M
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
N
E
 
E
L
 
V
P
 
P
G
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
N
 
Y
M
 
Y
N
 
M
R
|
R
G
 
G
G
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
L
I
 
P
G
 
T
P
 
R
S
 
S
Q
 
G
G
 
Q
D
 
A
Y
 
D
F
 
L
Q
 
K
S
 
F
V
 
A
K
 
L
G
 
N
G
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
R
 
P
T
 
R
Y
 
I
V
 
V
L
 
I
A
 
A
P
 
S
A
 
G
T
 
D
C
 
H
Q
 
V
E
 
E
C
 
I
Y
 
F
D
 
W
M
 
D
M
 
A
F
 
I
E
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
V
 
S
G
 
V
Q
 
F
M
 
E
K
 
E
E
 
E
P
 
L
V
 
I
T
 
T
-
 
N
-
 
R
P
 
P
W
 
Y
-
 
V
-
 
I
K
 
E
R
 
R
D
 
G
D
 
K
L
 
I
D
 
V
P
 
K
A
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
D
A
 
Y
D
 
F
W
 
N
R
 
R
L
 
F
Q
 
E
G
 
V
A
 
T
K
 
E
-
 
D
G
 
G
R
 
I
P
 
S
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
K
 
A
S
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
N
E
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
T
G
 
E
Q
 
N
N
 
S
R
 
I
N
 
N
L
 
R
Q
 
M
A
 
K
K
 
M
Y
 
Y
E
 
E
A
 
K
M
 
R
K
 
N
-
 
K
-
 
K
-
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
D
A
 
K
E
 
E
C
 
I
F
 
P
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
V
-
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
L
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
P
G
 
K
R
 
G
I
 
A
A
 
I
K
 
L
S
 
D
A
 
A
I
 
M
R
 
E
K
 
E
L
 
L
R
 
S
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
H
 
I
K
 
K
V
 
T
G
 
M
L
 
M
V
 
V
R
 
Q
P
 
V
V
 
K
T
 
M
L
 
F
F
 
N
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
E
 
K
K
 
N
V
 
L
L
 
M
Q
 
K
D
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
S
K
 
G
G
 
K
K
 
S
R
 
K
F
 
I
L
 
I
T
 
A
I
 
V
E
 
E
H
 
N
N
 
N

5b47A 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2 from sulfolobus tokodai - pyruvate complex (see paper)
29% identity, 86% coverage: 7:312/357 of query aligns to 228:572/627 of 5b47A

query
sites
5b47A
E
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Q
I
 
V
K
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
I
I
 
S
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
L
R
 
R
C
 
F
Y
 
Q
F
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
I
 
I
P
 
E
E
 
A
M
 
N
M
 
Q
S
 
N
S
 
L
A
 
D
I
 
M
P
 
I
A
 
V
A
 
E
G
 
G
G
 
N
E
 
E
F
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
|
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
N
M
 
M
L
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
S
F
 
A
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
A
 
G
I
 
I
S
 
S
Y
 
W
M
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
N
E
 
E
L
 
V
P
 
P
G
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
N
 
Y
M
 
Y
N
 
M
R
|
R
G
 
G
G
 
A
P
 
P
G
 
A
L
x
T
G
 
G
D
 
L
I
x
P
G
 
T
P
 
R
S
 
S
Q
 
G
G
 
Q
D
 
A
Y
 
D
F
 
L
Q
 
K
S
 
F
V
 
A
K
 
L
G
 
N
G
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
R
 
P
T
 
R
Y
 
I
V
 
V
L
 
I
A
 
A
P
 
S
A
 
G
T
 
D
C
 
H
Q
 
V
E
 
E
C
 
I
Y
 
F
D
 
W
M
 
D
M
 
A
F
 
I
E
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
V
 
S
G
 
V
Q
 
F
M
 
E
K
 
E
E
 
E
P
 
L
V
 
I
T
 
T
-
 
N
-
 
R
P
 
P
W
 
Y
-
 
V
-
 
I
K
 
E
R
 
R
D
 
G
D
 
K
L
 
I
D
 
V
P
 
K
A
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
D
A
 
Y
D
 
F
W
 
N
R
 
R
L
 
F
Q
 
E
G
 
V
A
 
T
K
 
E
-
 
D
G
 
G
R
 
I
P
 
S
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
K
 
A
S
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
N
E
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
T
G
 
E
Q
 
N
N
 
S
R
 
I
N
 
N
L
 
R
Q
 
M
A
 
K
K
 
M
Y
 
Y
E
 
E
A
 
K
M
 
R
K
 
N
-
 
K
-
 
K
-
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
D
A
 
K
E
 
E
C
 
I
F
 
P
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
V
-
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
L
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
P
G
 
K
R
 
G
I
 
A
A
 
I
K
 
L
S
 
D
A
 
A
I
 
M
R
 
E
K
 
E
L
 
L
R
 
S
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
H
 
I
K
 
K
V
 
T
G
 
M
L
 
M
V
 
V
R
 
Q
P
 
V
V
 
K
T
 
M
L
 
F
F
 
N
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
E
 
K
K
 
N
V
 
L
L
 
M
Q
 
K
D
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
S
K
 
G
G
 
K
K
 
S
R
 
K
F
 
I
L
 
I
T
 
A
I
 
V
E
 
E
H
 
N
N
 
N

Sites not aligning to the query:

5b46A 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 2 from sulfolobus tokodai - ligand free form (see paper)
29% identity, 86% coverage: 7:312/357 of query aligns to 228:572/627 of 5b46A

query
sites
5b46A
E
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
Q
I
 
V
K
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
I
I
 
S
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
L
R
 
R
C
 
F
Y
 
Q
F
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
Y
I
 
I
P
 
E
E
 
A
M
 
N
M
 
Q
S
 
N
S
 
L
A
 
D
I
 
M
P
 
I
A
 
V
A
 
E
G
 
G
G
 
N
E
 
E
F
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
|
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
N
M
 
M
L
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
S
F
 
A
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
S
E
 
E
A
 
G
I
 
I
S
 
S
Y
 
W
M
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
N
E
 
E
L
 
V
P
 
P
G
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
N
 
Y
M
 
Y
N
 
M
R
 
R
G
 
G
G
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
L
I
 
P
G
 
T
P
 
R
S
 
S
Q
 
G
G
 
Q
D
 
A
Y
 
D
F
 
L
Q
 
K
S
 
F
V
 
A
K
 
L
G
 
N
G
 
V
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
R
 
P
T
 
R
Y
 
I
V
 
V
L
 
I
A
 
A
P
 
S
A
 
G
T
 
D
C
 
H
Q
 
V
E
 
E
C
 
I
Y
 
F
D
 
W
M
 
D
M
 
A
F
 
I
E
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
K
V
 
T
L
 
L
G
 
A
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
V
 
S
G
 
V
Q
 
F
M
 
E
K
 
E
E
 
E
P
 
L
V
 
I
T
 
T
-
 
N
-
 
R
P
 
P
W
 
Y
-
 
V
-
 
I
K
 
E
R
 
R
D
 
G
D
 
K
L
 
I
D
 
V
P
 
K
A
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
D
A
 
Y
D
 
F
W
 
N
R
 
R
L
 
F
Q
 
E
G
 
V
A
 
T
K
 
E
-
 
D
G
 
G
R
 
I
P
 
S
A
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
K
 
A
S
 
S
L
 
I
F
 
F
L
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
N
E
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
T
G
 
E
Q
 
N
N
 
S
R
 
I
N
 
N
L
 
R
Q
 
M
A
 
K
K
 
M
Y
 
Y
E
 
E
A
 
K
M
 
R
K
 
N
-
 
K
-
 
K
-
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
D
A
 
K
E
 
E
C
 
I
F
 
P
E
 
E
T
 
E
E
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
V
-
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
V
 
L
V
 
L
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
P
G
 
K
R
 
G
I
 
A
A
 
I
K
 
L
S
 
D
A
 
A
I
 
M
R
 
E
K
 
E
L
 
L
R
 
S
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
H
 
I
K
 
K
V
 
T
G
 
M
L
 
M
V
 
V
R
 
Q
P
 
V
V
 
K
T
 
M
L
 
F
F
 
N
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
E
 
K
K
 
N
V
 
L
L
 
M
Q
 
K
D
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
S
K
 
G
G
 
K
K
 
S
R
 
K
F
 
I
L
 
I
T
 
A
I
 
V
E
 
E
H
 
N
N
 
N

P72578 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase subunit alpha; OFOR; EC 1.2.7.11 from Sulfolobus sp. (see 2 papers)
26% identity, 92% coverage: 2:331/357 of query aligns to 223:588/632 of P72578

query
sites
P72578
S
 
S
S
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
R
E
 
R
R
 
R
I
 
F
F
 
W
I
 
L
K
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
I
G
 
G
A
 
K
L
 
I
A
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
V
R
 
R
C
 
F
Y
 
Q
F
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
|
T
P
|
P
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
I
 
E
P
 
S
E
 
V
M
 
Y
M
 
I
S
 
E
S
 
A
A
 
H
I
 
Q
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
D
P
 
P
A
 
I
A
 
T
G
 
G
G
 
D
E
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
V
F
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
N
M
 
M
L
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
L
S
 
G
Y
 
W
M
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
N
E
 
E
L
 
V
P
 
P
G
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
N
 
Y
M
 
Y
N
 
I
R
|
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
S
L
 
T
G
 
G
-
 
L
D
 
P
I
x
T
G
 
R
P
 
T
S
 
A
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
Y
 
L
F
 
I
Q
 
F
S
 
P
V
 
I
K
 
-
G
 
F
G
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
R
 
P
T
 
K
Y
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
S
A
 
G
T
 
D
C
 
H
Q
 
A
E
 
E
C
 
A
Y
 
F
D
 
K
M
 
D
M
 
A
F
 
I
E
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
H
L
 
L
G
 
V
D
 
E
A
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
Q
 
N
M
 
S
K
 
Y
E
 
S
P
 
T
V
 
I
T
 
-
P
 
P
W
 
Y
K
 
E
R
 
E
D
 
L
D
 
E
L
 
L
D
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
G
P
 
K
A
 
I
T
 
V
E
 
E
G
 
S
A
 
G
D
 
D
W
 
I
R
 
S
L
 
Y
Q
 
K
G
 
R
A
 
F
K
 
K
G
 
F
R
 
T
P
 
E
A
 
D
R
 
G
L
 
I
L
 
S
K
 
P
S
 
R
L
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
M
-
 
Y
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
N
E
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
S
G
 
E
Q
 
D
N
 
V
R
 
V
N
 
N
L
 
R
Q
 
T
A
 
M
K
 
M
Y
 
Y
E
 
E
A
 
K
-
 
R
M
 
M
K
 
K
E
 
K
L
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
E
A
 
S
R
 
R
A
 
V
E
 
K
C
 
I
F
 
Y
E
 
G
T
 
D
E
 
L
D
 
N
A
 
S
D
 
R
L
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
P
G
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
L
K
 
R
S
 
D
A
 
I
I
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
E
A
 
E
Q
 
S
G
 
N
H
 
F
K
 
D
V
 
F
G
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
Q
P
 
I
V
 
R
T
 
M
L
 
F
F
 
S
P
 
P
F
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
N
V
 
L
L
 
V
Q
 
S
D
 
K
L
 
L
A
 
M
A
 
E
K
 
G
G
 
R
K
 
D
R
 
K
F
 
I
L
 
I
T
 
T
I
 
V
E
 
E
H
 
-
N
 
-
C
 
-
G
 
G
Q
 
N
M
 
Y
V
 
L
D
 
A
D
 
Q
V
 
T
R
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
V
R
 
K
A
 
M
Y
 
Y
C
 
T
D
 
G
S
 
K
D
 
D

Q96Y66 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 1, subunit alpha; OFOR1; EC 1.2.7.11 from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see paper)
26% identity, 92% coverage: 2:331/357 of query aligns to 223:588/627 of Q96Y66

query
sites
Q96Y66
S
 
S
S
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
R
E
 
R
R
 
R
I
 
F
F
 
W
I
 
L
K
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
I
G
 
G
A
 
K
L
 
I
A
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
V
R
 
R
C
 
F
Y
 
Q
F
 
S
G
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
I
 
E
P
 
S
E
 
V
M
 
Y
M
 
I
S
 
E
S
 
A
A
 
H
I
 
Q
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
D
P
 
P
A
 
I
A
 
T
G
 
G
G
 
D
E
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
V
F
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
N
M
 
M
L
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
L
S
 
G
Y
 
W
M
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
N
E
 
E
L
 
V
P
 
P
G
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
N
 
Y
M
 
Y
N
 
I
R
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
S
L
x
T
G
 
G
-
 
L
D
 
P
I
 
T
G
 
R
P
 
T
S
 
A
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
Y
 
L
F
 
I
Q
 
F
S
 
P
V
 
I
K
 
-
G
 
F
G
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
R
 
P
T
 
K
Y
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
S
A
 
G
T
 
D
C
 
H
Q
 
A
E
 
E
C
 
A
Y
 
F
D
 
K
M
 
D
M
 
A
F
 
I
E
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
H
L
 
L
G
 
V
D
 
E
A
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
A
Q
 
N
M
 
S
K
 
Y
E
 
S
P
 
T
V
 
I
T
 
-
P
 
P
W
 
Y
K
 
E
R
 
E
D
 
L
D
 
E
L
 
L
D
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
G
P
 
K
A
 
I
T
 
V
E
 
E
G
 
S
A
 
G
D
 
D
W
 
I
R
 
S
L
 
Y
Q
 
K
G
 
R
A
 
F
K
 
K
G
 
F
R
 
T
P
 
E
A
 
D
R
 
G
L
 
I
L
 
S
K
 
P
S
 
R
L
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
M
-
 
Y
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
x
D
-
 
E
-
 
H
-
 
N
E
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
H
L
 
I
A
 
S
G
 
E
Q
 
D
N
 
V
R
 
V
N
 
N
L
 
R
Q
 
T
A
 
M
K
 
M
Y
 
Y
E
 
E
A
 
K
-
 
R
M
 
M
K
 
K
E
 
K
L
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
E
A
 
S
R
 
R
A
 
V
E
 
K
C
 
I
F
 
Y
E
 
G
T
 
D
E
 
L
D
 
N
A
 
S
D
 
R
L
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
T
F
 
W
G
 
G
S
 
S
I
 
P
G
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
L
K
 
R
S
 
D
A
 
I
I
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
E
A
 
E
Q
 
S
G
 
N
H
 
F
K
 
D
V
 
F
G
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
Q
P
 
I
V
 
R
T
 
M
L
 
F
F
 
S
P
 
P
F
 
F
P
 
P
E
 
K
K
 
N
V
 
L
L
 
V
Q
 
S
D
 
K
L
 
L
A
 
M
A
 
E
K
 
G
G
 
R
K
 
D
R
 
K
F
 
I
L
 
I
T
 
T
I
 
V
E
 
E
H
 
-
N
 
-
C
 
-
G
 
G
Q
 
N
M
 
Y
V
 
L
D
 
A
D
 
Q
V
 
T
R
 
S
L
 
L
A
 
L
V
 
V
R
 
K
A
 
M
Y
 
Y
C
 
T
D
 
G
S
 
K
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5b48A 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase 1 from sulfolobus tokodai (see paper)
36% identity, 46% coverage: 8:172/357 of query aligns to 197:373/576 of 5b48A

query
sites
5b48A
R
 
R
I
 
F
F
 
W
I
 
L
K
 
D
G
 
G
N
 
N
E
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
I
G
 
G
A
 
K
L
 
I
A
 
Y
A
 
G
G
 
G
C
 
V
R
 
R
C
 
F
Y
 
Q
F
 
S
G
 
Y
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
I
 
E
P
 
S
E
 
V
M
 
Y
M
 
I
S
 
E
S
 
A
A
 
H
I
 
Q
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
D
P
 
P
A
 
I
A
 
T
G
 
G
G
 
D
E
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
V
F
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
S
 
D
E
|
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
N
 
N
M
 
M
L
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
L
C
 
T
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
A
T
 
T
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
G
P
|
P
G
 
G
V
 
F
S
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
L
S
 
G
Y
 
W
M
 
A
A
 
G
G
 
M
S
 
N
E
 
E
L
 
V
P
 
P
G
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
N
 
Y
M
 
Y
N
 
I
R
|
R
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
S
L
 
T
G
 
G
-
 
L
D
x
P
I
 
T
G
 
R
P
 
T
S
 
A
Q
 
Q
G
 
S
D
 
D
Y
 
L
F
 
I
Q
 
F
S
 
P
V
 
I
K
 
-
G
 
F
G
 
A
G
 
G
H
 
H
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
R
 
P
T
 
K
Y
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
A
P
 
S
A
 
G
T
 
D
C
 
H
Q
 
A
E
 
E
C
 
A
Y
 
F
D
 
K
M
 
D
M
 
A
F
 
I
E
 
W
A
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
K
F
 
Y
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
H
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5exeA Crystal structure of oxalate oxidoreductase from moorella thermoacetica bound with carboxy-tpp adduct (see paper)
26% identity, 95% coverage: 11:348/357 of query aligns to 6:369/394 of 5exeA

query
sites
5exeA
I
 
I
K
 
S
G
 
G
N
 
C
E
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
D
C
 
V
R
 
D
C
 
V
Y
 
I
F
 
C
G
 
S
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
x
R
P
 
P
Q
 
Y
N
 
T
D
 
G
I
 
I
P
 
M
E
 
S
M
 
E
M
 
L
S
 
A
S
 
R
A
 
M
I
 
V
P
 
A
A
 
D
A
 
G
-
 
E
-
 
L
G
 
D
G
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
E
 
E
S
 
G
E
|
E
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
L
N
 
S
M
 
V
L
 
V
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
A
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
G
P
x
V
G
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
Y
M
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
Y
S
 
S
Y
 
P
M
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
E
E
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
V
V
 
Q
I
 
M
V
 
A
N
 
I
M
 
A
N
 
D
R
|
R
G
 
T
G
 
L
P
 
D
G
 
P
L
 
P
G
 
G
D
 
D
I
x
F
G
 
G
P
 
E
S
 
E
Q
 
H
G
 
T
D
 
D
Y
 
A
F
 
E
Q
 
C
S
 
C
V
 
R
K
 
D
G
 
Q
G
 
G
G
 
W
H
 
I
G
 
Q
D
 
G
Y
 
W
R
 
A
T
 
S
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
P
Q
 
Q
E
 
E
C
 
A
Y
 
L
D
 
D
M
 
N
M
 
T
F
 
L
E
 
I
A
 
Y
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
A
 
G
Y
 
E
R
 
D
F
 
Q
R
 
R
T
 
V
P
 
L
V
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
Y
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
V
-
 
S
L
 
H
V
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
P
A
 
V
I
 
D
V
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
E
G
 
A
Q
 
Q
M
 
V
K
 
K
E
 
E
P
 
F
V
 
L
T
 
P
P
 
P
W
 
Y
K
 
K
R
 
N
D
 
H
D
 
H
-
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
K
E
 
P
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
Q
L
 
I
Q
 
I
G
 
G
A
 
P
K
 
Q
G
 
I
R
 
E
P
 
P
A
 
A
R
 
M
L
 
G
L
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
Q
F
 
Y
L
 
Q
E
 
R
D
 
Y
G
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
G
Q
 
V
N
 
H
R
 
K
N
 
V
L
 
L
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
E
A
 
A
M
 
C
K
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
L
E
 
D
C
 
E
F
 
Y
E
 
L
T
 
T
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
I
V
 
I
V
 
F
A
 
G
F
 
Q
G
 
G
S
 
A
I
 
H
G
 
M
R
 
E
I
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
V
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
N
Q
 
L
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
A
R
 
R
P
 
L
V
 
R
T
 
T
L
 
F
F
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
E
 
T
K
 
E
V
 
Q
L
 
I
Q
 
K
D
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
S
K
 
K
G
 
F
K
 
K
R
 
A
F
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
N
L
 
F
T
 
G
I
 
I
E
 
S
H
 
C
N
 
S
C
 
G
G
 
G
Q
 
V
M
 
L
V
 
L
D
 
S
D
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
Y
A
 
D
Y
 
Y
C
 
G
D
 
D
S
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
V
D
 
G
F
 
F
Y
 
V
G
 
A
H
 
G
M
 
L
P
 
G
G
 
G
E
 
E
L
 
V
P
 
V
G
 
T
S
 
H
D
 
D
D
 
E
F
 
F
L
 
Y
K
 
R

5exdD Crystal structure of oxalate oxidoreductase from moorella thermoacetica bound with carboxy-di-oxido-methyl-tpp (coom-tpp) intermediate (see paper)
26% identity, 95% coverage: 11:348/357 of query aligns to 6:369/394 of 5exdD

query
sites
5exdD
I
 
I
K
 
S
G
 
G
N
 
C
E
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
D
C
 
V
R
 
D
C
 
V
Y
 
I
F
 
C
G
 
S
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
x
R
P
 
P
Q
 
Y
N
 
T
D
 
G
I
 
I
P
 
M
E
 
S
M
 
E
M
 
L
S
 
A
S
 
R
A
 
M
I
 
V
P
 
A
A
 
D
A
 
G
-
 
E
-
 
L
G
 
D
G
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
E
 
E
S
 
G
E
|
E
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
L
N
 
S
M
 
V
L
 
V
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
A
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
G
P
x
V
G
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
Y
M
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
Y
S
 
S
Y
 
P
M
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
E
E
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
V
V
 
Q
I
 
M
V
 
A
N
 
I
M
 
A
N
 
D
R
|
R
G
 
T
G
 
L
P
 
D
G
 
P
L
 
P
G
 
G
D
|
D
I
 
F
G
 
G
P
 
E
S
 
E
Q
 
H
G
 
T
D
 
D
Y
 
A
F
 
E
Q
 
C
S
 
C
V
 
R
K
 
D
G
 
Q
G
 
G
G
 
W
H
 
I
G
 
Q
D
 
G
Y
 
W
R
 
A
T
 
S
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
P
Q
 
Q
E
 
E
C
 
A
Y
 
L
D
 
D
M
 
N
M
 
T
F
 
L
E
 
I
A
 
Y
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
A
 
G
Y
 
E
R
 
D
F
 
Q
R
 
R
T
 
V
P
 
L
V
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
Y
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
V
-
 
S
L
 
H
V
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
P
A
 
V
I
 
D
V
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
E
G
 
A
Q
 
Q
M
 
V
K
 
K
E
 
E
P
 
F
V
 
L
T
 
P
P
 
P
W
 
Y
K
 
K
R
 
N
D
 
H
D
 
H
-
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
K
E
 
P
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
Q
L
 
I
Q
 
I
G
 
G
A
 
P
K
 
Q
G
 
I
R
 
E
P
 
P
A
 
A
R
 
M
L
 
G
L
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
Q
F
 
Y
L
 
Q
E
 
R
D
 
Y
G
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
G
Q
 
V
N
 
H
R
 
K
N
 
V
L
 
L
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
E
A
 
A
M
 
C
K
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
L
E
 
D
C
 
E
F
 
Y
E
 
L
T
 
T
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
I
V
 
I
V
 
F
A
 
G
F
 
Q
G
 
G
S
 
A
I
 
H
G
 
M
R
 
E
I
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
V
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
N
Q
 
L
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
A
R
 
R
P
 
L
V
 
R
T
 
T
L
 
F
F
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
E
 
T
K
 
E
V
 
Q
L
 
I
Q
 
K
D
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
S
K
 
K
G
 
F
K
 
K
R
 
A
F
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
N
L
 
F
T
 
G
I
 
I
E
 
S
H
 
C
N
 
S
C
 
G
G
 
G
Q
 
V
M
 
L
V
 
L
D
 
S
D
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
Y
A
 
D
Y
 
Y
C
 
G
D
 
D
S
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
V
D
 
G
F
 
F
Y
 
V
G
 
A
H
 
G
M
 
L
P
 
G
G
 
G
E
 
E
L
 
V
P
 
V
G
 
T
S
 
H
D
 
D
D
 
E
F
 
F
L
 
Y
K
 
R

5c4iA Structure of an oxalate oxidoreductase (see paper)
26% identity, 95% coverage: 11:348/357 of query aligns to 6:369/394 of 5c4iA

query
sites
5c4iA
I
 
I
K
 
S
G
 
G
N
 
C
E
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
R
A
 
L
A
 
A
G
 
D
C
 
V
R
 
D
C
 
V
Y
 
I
F
 
C
G
 
S
Y
|
Y
P
|
P
I
|
I
T
x
R
P
 
P
Q
 
Y
N
 
T
D
 
G
I
 
I
P
 
M
E
 
S
M
 
E
M
 
L
S
 
A
S
 
R
A
 
M
I
 
V
P
 
A
A
 
D
A
 
G
-
 
E
-
 
L
G
 
D
G
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
E
 
E
S
 
G
E
|
E
V
 
H
A
 
A
A
 
Q
A
 
L
N
 
S
M
 
V
L
 
V
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
A
 
V
F
 
F
T
 
T
S
 
G
S
 
S
S
 
S
S
 
G
P
x
V
G
 
G
V
 
V
S
 
T
L
x
Y
M
 
A
Q
 
M
E
 
E
A
 
V
I
 
Y
S
 
S
Y
 
P
M
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
E
E
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
V
V
 
Q
I
 
M
V
 
A
N
 
I
M
 
A
N
 
D
R
|
R
G
 
T
G
 
L
P
 
D
G
 
P
L
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
F
G
 
G
P
 
E
S
 
E
Q
 
H
G
 
T
D
 
D
Y
 
A
F
 
E
Q
 
C
S
 
C
V
 
R
K
 
D
G
 
Q
G
 
G
G
 
W
H
 
I
G
 
Q
D
 
G
Y
 
W
R
 
A
T
 
S
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
T
C
 
P
Q
 
Q
E
 
E
C
 
A
Y
 
L
D
 
D
M
 
N
M
 
T
F
 
L
E
 
I
A
 
Y
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
A
 
G
Y
 
E
R
 
D
F
 
Q
R
 
R
T
 
V
P
 
L
V
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
Y
-
 
A
-
 
C
-
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
V
-
 
S
L
 
H
V
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
P
A
 
V
I
 
D
V
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
E
G
 
A
Q
 
Q
M
 
V
K
 
K
E
 
E
P
 
F
V
 
L
T
 
P
P
 
P
W
 
Y
K
 
K
R
 
N
D
 
H
D
 
H
-
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
K
E
 
P
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
R
 
Q
L
 
I
Q
 
I
G
 
G
A
 
P
K
 
Q
G
 
I
R
 
E
P
 
P
A
 
A
R
 
M
L
 
G
L
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
Q
F
 
Y
L
 
Q
E
 
R
D
 
Y
G
 
Q
A
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
G
Q
 
V
N
 
H
R
 
K
N
 
V
L
 
L
Q
 
E
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
E
A
 
A
M
 
C
K
 
D
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
L
E
 
D
C
 
E
F
 
Y
E
 
L
T
 
T
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
I
V
 
I
V
 
F
A
 
G
F
 
Q
G
 
G
S
 
A
I
 
H
G
 
M
R
 
E
I
 
T
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
V
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
N
Q
 
L
G
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
A
R
 
R
P
 
L
V
 
R
T
 
T
L
 
F
F
 
R
P
 
P
F
 
F
P
 
P
E
 
T
K
 
E
V
 
Q
L
 
I
Q
 
K
D
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
S
K
 
K
G
 
F
K
 
K
R
 
A
F
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
N
L
 
F
T
 
G
I
 
I
E
 
S
H
 
C
N
 
S
C
 
G
G
 
G
Q
 
V
M
 
L
V
 
L
D
 
S
D
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
L
R
 
Y
A
 
D
Y
 
Y
C
 
G
D
 
D
S
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
V
D
 
G
F
 
F
Y
 
V
G
 
A
H
 
G
M
 
L
P
 
G
G
 
G
E
 
E
L
 
V
P
 
V
G
 
T
S
 
H
D
 
D
D
 
E
F
 
F
L
 
Y
K
 
R

Query Sequence

>208876 MicrobesOnline__882:208876
MSSEKTERIFIKGNEAIAHGALAAGCRCYFGYPITPQNDIPEMMSSAIPAAGGEFVQAES
EVAAANMLLGAAACGVRAFTSSSSPGVSLMQEAISYMAGSELPGVIVNMNRGGPGLGDIG
PSQGDYFQSVKGGGHGDYRTYVLAPATCQECYDMMFEAFDVAYRFRTPVLVLGDAIVGQM
KEPVTPWKRDDLDPATEGADWRLQGAKGRPARLLKSLFLEDGALAGQNRNLQAKYEAMKE
LARAECFETEDADLVVVAFGSIGRIAKSAIRKLRAQGHKVGLVRPVTLFPFPEKVLQDLA
AKGKRFLTIEHNCGQMVDDVRLAVRAYCDSDFYGHMPGELPGSDDFLKPILDALGRK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory