SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 209328 FitnessBrowser__DvH:209328 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gdeA Crystal structure of pyrococcus protein a-1 e-form (see paper)
38% identity, 95% coverage: 7:384/399 of query aligns to 2:378/388 of 1gdeA

query
sites
1gdeA
V
 
L
S
 
S
R
 
D
R
 
R
V
 
L
Q
 
E
Q
 
L
I
 
V
R
 
S
I
 
A
S
 
S
A
 
E
T
 
I
K
 
R
L
 
K
M
 
L
P
 
F
M
 
D
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
M
G
 
K
G
 
D
C
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
G
Q
 
I
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
H
 
H
I
 
I
V
 
K
E
 
E
A
 
Y
V
 
A
C
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
-
D
 
D
K
 
K
A
 
G
D
 
-
A
 
L
G
 
T
R
 
H
Y
 
Y
T
 
G
L
 
P
Q
 
N
P
 
I
G
 
G
M
 
L
P
 
L
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
K
R
 
Q
K
 
N
G
 
G
Y
 
I
M
 
E
V
 
A
N
 
D
P
 
P
D
 
K
S
 
T
E
 
E
V
 
I
G
 
M
V
 
V
T
 
L
V
 
L
G
|
G
A
|
A
M
x
N
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
M
A
 
G
L
 
L
L
 
S
T
 
A
V
 
F
V
 
L
D
 
K
R
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
T
P
 
P
G
 
A
Y
x
F
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
P
-
 
T
L
 
Y
R
 
E
A
 
E
D
 
D
D
 
E
W
 
F
G
 
R
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
E
I
 
L
R
 
K
A
 
K
A
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
D
R
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
L
I
 
I
V
 
I
C
x
N
N
 
S
P
 
P
G
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
L
D
 
T
D
 
K
A
 
K
D
 
D
V
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
I
C
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
L
M
 
I
L
 
V
I
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
 
V
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
F
V
 
I
Y
 
Y
G
 
D
G
 
D
G
 
A
E
 
R
P
 
H
L
 
Y
S
 
S
P
 
I
A
 
A
S
 
S
L
 
L
P
 
D
E
 
G
M
 
M
R
 
F
R
 
E
H
 
R
V
 
T
I
 
I
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
F
S
|
S
K
|
K
K
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
C
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
P
A
 
S
A
 
W
W
 
I
M
 
I
G
 
E
E
 
R
L
 
M
L
 
V
K
 
K
V
 
F
H
 
Q
D
 
M
A
 
Y
A
 
N
A
 
A
I
 
T
C
 
C
A
 
P
P
 
V
A
 
T
V
 
F
S
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
G
 
D
P
 
E
Q
 
R
-
 
S
-
 
W
D
 
K
C
 
A
V
 
V
D
 
E
D
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
S
 
D
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
K
L
 
L
A
 
V
C
 
W
A
 
K
R
 
R
L
 
L
D
 
N
A
 
E
M
 
M
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
P
Y
 
T
V
 
V
Q
 
K
P
 
P
R
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
M
 
F
A
 
P
R
 
R
Y
 
I
T
 
R
F
 
D
T
 
T
D
 
G
A
 
L
P
 
T
S
 
S
D
 
K
M
 
K
V
 
F
A
 
S
R
 
E
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
S
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
K
T
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
G
H
 
Y
L
 
V
R
|
R
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
A
E
 
Y
A
 
E
E
 
K
L
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
M
D
 
D
R
 
R
M
 
M

1gd9A Crystall structure of pyrococcus protein-a1 (see paper)
38% identity, 95% coverage: 7:384/399 of query aligns to 2:378/388 of 1gd9A

query
sites
1gd9A
V
 
L
S
 
S
R
 
D
R
 
R
V
 
L
Q
 
E
Q
 
L
I
 
V
R
 
S
I
 
A
S
 
S
A
 
E
T
 
I
K
 
R
L
 
K
M
 
L
P
 
F
M
 
D
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
M
G
 
K
G
 
D
C
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
G
Q
 
I
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
H
 
H
I
 
I
V
 
K
E
 
E
A
 
Y
V
 
A
C
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
-
D
 
D
K
 
K
A
 
G
D
 
-
A
 
L
G
 
T
R
 
H
Y
 
Y
T
 
G
L
 
P
Q
 
N
P
 
I
G
 
G
M
 
L
P
 
L
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
K
A
 
K
R
 
Q
K
 
N
G
 
G
Y
 
I
M
 
E
V
 
A
N
 
D
P
 
P
D
 
K
S
 
T
E
 
E
V
 
I
G
 
M
V
 
V
T
 
L
V
 
L
G
|
G
A
|
A
M
x
N
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
M
A
 
G
L
 
L
L
 
S
T
 
A
V
 
F
V
 
L
D
 
K
R
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
T
P
 
P
G
 
A
Y
x
F
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
A
E
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
P
-
 
T
L
 
Y
R
 
E
A
 
E
D
 
D
D
 
E
W
 
F
G
 
R
L
 
L
D
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
E
I
 
L
R
 
K
A
 
K
A
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
D
R
 
K
T
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
L
I
 
I
V
 
I
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
L
D
 
T
D
 
K
A
 
K
D
 
D
V
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
I
C
 
A
E
 
D
L
 
F
A
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
L
M
 
I
L
 
V
I
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
x
V
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
F
V
 
I
Y
 
Y
G
 
D
G
 
D
G
 
A
E
 
R
P
 
H
L
 
Y
S
 
S
P
 
I
A
 
A
S
 
S
L
 
L
P
 
D
E
 
G
M
 
M
R
 
F
R
 
E
H
 
R
V
 
T
I
 
I
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
F
S
|
S
K
|
K
K
 
T
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
C
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
P
A
 
S
A
 
W
W
 
I
M
 
I
G
 
E
E
 
R
L
 
M
L
 
V
K
 
K
V
 
F
H
 
Q
D
 
M
A
 
Y
A
 
N
A
 
A
I
 
T
C
 
C
A
 
P
P
 
V
A
 
T
V
 
F
S
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
G
 
D
P
 
E
Q
 
R
-
 
S
-
 
W
D
 
K
C
 
A
V
 
V
D
 
E
D
 
E
M
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
S
 
D
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
K
L
 
L
A
 
V
C
 
W
A
 
K
R
 
R
L
 
L
D
 
N
A
 
E
M
 
M
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
P
Y
 
T
V
 
V
Q
 
K
P
 
P
R
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
I
M
 
F
A
 
P
R
 
R
Y
 
I
T
 
R
F
 
D
T
 
T
D
 
G
A
 
L
P
 
T
S
 
S
D
 
K
M
 
K
V
 
F
A
 
S
R
 
E
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
S
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
K
T
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
G
H
 
Y
L
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
A
E
 
Y
A
 
E
E
 
K
L
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
M
D
 
D
R
 
R
M
 
M

1j32A Aspartate aminotransferase from phormidium lapideum
35% identity, 97% coverage: 6:392/399 of query aligns to 2:388/388 of 1j32A

query
sites
1j32A
R
 
K
V
 
L
S
 
A
R
 
A
R
 
R
V
 
V
Q
 
E
Q
 
S
I
 
V
R
 
S
I
 
P
S
 
S
A
 
M
T
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
A
K
 
K
L
 
A
M
 
K
P
 
A
M
 
M
L
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
G
V
 
I
G
 
D
G
 
V
C
 
C
V
 
-
S
 
S
L
 
F
G
 
S
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
N
T
 
T
P
 
P
E
 
K
H
 
H
I
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
K
R
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
R
Y
 
Y
T
 
G
L
 
P
Q
 
A
P
 
A
G
 
G
M
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
Q
D
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
R
R
 
D
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
C
V
 
Y
N
 
G
P
 
A
D
 
D
S
 
N
E
 
-
V
 
I
G
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
N
G
|
G
A
x
G
M
x
K
E
 
Q
A
 
S
L
 
I
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
M
L
 
L
T
 
A
V
 
M
V
 
I
D
 
E
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
A
P
 
P
G
 
F
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
K
M
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
T
P
 
P
V
 
V
H
 
I
V
 
L
P
 
P
L
 
T
R
 
T
A
 
V
D
 
E
-
 
T
D
 
Q
W
 
F
G
 
K
L
 
V
D
 
S
V
 
P
D
 
E
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
K
T
 
T
R
 
K
A
 
L
V
 
L
I
 
V
V
 
F
C
 
N
N
 
T
P
 
P
G
 
S
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
D
 
T
D
 
P
A
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
I
C
 
A
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
A
N
 
G
I
 
L
M
 
W
L
 
V
I
 
L
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
x
I
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
K
M
 
I
V
 
L
Y
 
Y
G
 
D
G
 
D
G
 
A
E
 
Q
P
 
H
L
 
L
S
 
S
-
 
I
P
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
A
R
 
Y
R
 
E
H
 
R
V
 
S
I
 
V
V
 
V
V
 
C
N
 
S
S
 
G
F
 
F
S
 
A
K
|
K
K
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
C
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
P
A
 
V
A
 
P
W
 
L
M
 
V
G
 
K
E
 
A
L
 
A
L
 
T
K
 
K
V
 
I
-
 
Q
-
 
G
H
 
H
D
 
S
A
 
T
A
 
S
A
 
N
I
 
V
C
 
C
A
 
-
P
 
-
A
 
T
V
 
F
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
T
 
E
G
 
N
P
 
S
Q
 
Q
D
 
D
C
 
C
V
 
V
D
 
Q
D
 
E
M
 
M
R
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
F
S
 
A
A
 
E
R
 
R
R
 
R
N
 
R
L
 
Y
A
 
M
C
 
L
A
 
D
R
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
-
P
 
P
H
 
G
F
 
L
D
 
E
Y
 
C
V
 
P
Q
 
K
P
 
P
R
 
D
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
M
M
 
F
A
 
P
R
 
S
Y
 
I
T
 
A
F
 
K
T
 
T
D
 
G
A
 
R
P
 
S
S
 
S
D
 
L
M
 
D
V
 
F
A
 
C
R
 
S
R
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
Q
G
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
A
T
 
T
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
-
T
 
-
G
 
A
E
 
D
R
 
D
H
 
C
L
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
D
E
 
L
A
 
D
E
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
R
A
 
G
F
 
M
D
 
E
R
 
R
M
 
L
A
 
E
A
 
K
W
 
F
T
 
L
Q
 
H
R
 
G
V
 
I
V
 
L

1bkgA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus with maleate (see paper)
38% identity, 95% coverage: 7:385/399 of query aligns to 4:379/382 of 1bkgA

query
sites
1bkgA
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
M
R
 
K
I
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
V
L
 
A
M
 
V
-
 
N
-
 
A
P
 
K
M
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
L
R
 
R
V
 
R
G
 
Q
G
 
G
C
 
V
-
 
D
-
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
A
L
 
P
Q
 
P
P
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
S
V
 
V
N
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
x
G
M
x
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
F
L
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
P
A
 
E
D
 
E
D
 
G
W
 
F
G
 
V
L
 
P
D
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
C
x
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
F
M
 
Y
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
x
I
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
H
L
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
R
L
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
E
M
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
C
A
 
G
D
 
P
A
 
K
A
 
E
W
 
V
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
S
D
 
S
A
 
Q
A
 
S
A
 
T
I
 
T
C
 
S
A
 
P
P
 
D
A
 
T
V
 
I
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
D
 
A
C
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
M
M
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
S
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
L
C
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
K
Y
 
A
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
M
 
L
A
 
M
R
 
D
Y
 
-
T
 
T
F
 
S
T
 
P
D
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
E
M
 
V
-
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
-
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
D
F
 
F
G
 
A
P
 
A
T
 
F
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
H
L
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
N
L
 
L
D
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
F
A
 
A

1bjwA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus (see paper)
38% identity, 95% coverage: 7:385/399 of query aligns to 4:379/382 of 1bjwA

query
sites
1bjwA
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
M
R
 
K
I
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
V
L
 
A
M
 
V
-
 
N
-
 
A
P
 
K
M
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
L
R
 
R
V
 
R
G
 
Q
G
 
G
C
 
V
-
 
D
-
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
G
|
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
A
L
 
P
Q
 
P
P
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
S
V
 
V
N
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
G
M
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
F
L
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
P
A
 
E
D
 
E
D
 
G
W
 
F
G
 
V
L
 
P
D
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
F
M
 
Y
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
x
I
Y
 
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
H
L
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
R
L
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
E
M
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
C
A
 
G
D
 
P
A
 
K
A
 
E
W
 
V
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
S
D
 
S
A
 
Q
A
 
S
A
 
T
I
 
T
C
 
S
A
 
P
P
 
D
A
 
T
V
 
I
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
D
 
A
C
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
M
M
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
S
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
L
C
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
K
Y
 
A
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
M
 
L
A
 
M
R
 
D
Y
 
-
T
 
T
F
 
S
T
 
P
D
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
E
M
 
V
-
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
-
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
D
F
 
F
G
 
A
P
 
A
T
 
F
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
H
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
N
L
 
L
D
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
F
A
 
A

P58350 Aspartate aminotransferase; AAT; AspAT; Putative 2-aminoadipate transaminase; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.39 from Rhizobium meliloti (strain 1021) (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
35% identity, 90% coverage: 33:391/399 of query aligns to 44:409/410 of P58350

query
sites
P58350
V
 
I
S
 
I
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
C
 
S
R
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
D
 
R
K
 
G
A
 
E
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
T
L
 
A
Q
 
L
P
 
D
G
 
G
M
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
Q
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
A
V
 
Y
N
 
E
P
 
L
D
 
D
S
 
-
E
 
E
V
 
I
G
 
T
V
 
V
T
 
A
V
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
K
E
 
Q
A
 
I
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
A
L
 
M
L
 
M
T
 
A
V
 
S
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
T
P
 
P
G
 
Y
Y
 
W
A
 
T
S
 
S
H
 
Y
A
 
S
E
 
D
Q
 
I
V
 
V
L
 
H
M
 
I
A
 
C
E
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
L
V
 
I
P
 
A
L
 
C
R
 
D
A
 
A
D
 
S
D
 
S
-
 
G
W
 
F
G
 
R
L
 
L
D
 
T
V
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
W
V
 
V
I
 
L
V
 
L
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
T
 
A
V
 
A
Y
 
Y
D
 
S
D
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
Y
R
 
R
A
 
P
L
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
L
L
 
L
E
 
R
R
 
H
-
 
P
N
 
H
I
 
V
M
 
W
L
 
L
I
 
L
S
 
V
D
 
D
E
 
D
T
 
M
Y
 
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
D
G
 
G
G
 
F
E
 
R
P
 
F
L
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
Q
L
 
L
-
 
E
P
 
P
E
 
G
M
 
L
R
 
K
R
 
N
H
 
R
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
V
S
 
S
K
|
K
K
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
G
A
 
G
D
 
P
A
 
R
A
 
E
W
 
L
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
V
V
 
V
H
 
Q
D
 
S
A
 
Q
A
 
A
A
 
T
I
 
S
C
 
C
A
 
P
P
 
S
A
 
S
V
 
I
S
 
S
Q
 
Q
Y
 
A
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
C
 
F
V
 
L
D
 
K
D
 
E
M
 
R
R
 
T
A
 
E
A
 
S
L
 
F
S
 
Q
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
V
C
 
V
A
 
N
R
 
G
L
 
L
D
 
N
A
 
A
M
 
I
A
 
-
P
 
D
H
 
G
F
 
L
D
 
D
Y
 
C
V
 
R
Q
 
V
P
 
P
R
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
G
I
 
V
M
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
V
T
 
T
F
 
P
T
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
I
D
 
K
A
 
T
P
 
D
S
 
T
D
 
D
M
 
F
V
 
C
A
 
A
R
 
-
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
D
G
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
S
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
T
 
S
G
 
-
E
 
-
R
 
P
H
 
F
L
 
F
R
 
R
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
A
T
 
C
Q
 
D
R
 
R
V
 
L

Q56232 Aspartate/prephenate aminotransferase; AspAT / PAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.78 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 3 papers)
38% identity, 95% coverage: 7:385/399 of query aligns to 4:379/385 of Q56232

query
sites
Q56232
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
M
R
x
K
I
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
V
L
 
A
M
 
V
-
 
N
-
 
A
P
 
K
M
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
L
R
 
R
V
 
R
G
 
Q
G
 
G
C
 
V
-
 
D
-
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
A
L
 
P
Q
 
P
P
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
S
V
 
V
N
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
G
M
 
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
F
L
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
Y
 
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
P
A
 
E
D
 
E
D
 
G
W
 
F
G
 
V
L
 
P
D
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
F
M
 
Y
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
H
L
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
R
L
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
E
M
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
C
A
 
G
D
 
P
A
 
K
A
 
E
W
 
V
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
S
D
 
S
A
 
Q
A
 
S
A
 
T
I
 
T
C
 
S
A
 
P
P
 
D
A
 
T
V
 
I
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
D
 
A
C
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
M
M
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
S
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
L
C
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
K
Y
 
A
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
M
 
L
A
 
M
R
 
D
Y
 
-
T
 
T
F
 
S
T
 
P
D
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
E
M
 
V
-
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
-
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
D
F
 
F
G
 
A
P
 
A
T
 
F
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
H
L
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
N
L
 
L
D
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
F
A
 
A

1b5oA Thermus thermophilus aspartate aminotransferase single mutant 1 (see paper)
38% identity, 95% coverage: 7:385/399 of query aligns to 4:379/382 of 1b5oA

query
sites
1b5oA
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
M
R
 
K
I
 
P
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
V
L
 
A
M
 
V
-
 
N
-
 
A
P
 
K
M
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
L
R
 
R
V
 
R
G
 
Q
G
 
G
C
 
V
-
 
D
-
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
A
L
 
P
Q
 
P
P
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
S
V
 
V
N
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
x
G
M
x
S
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
F
L
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
P
A
 
E
D
 
E
D
 
G
W
 
F
G
 
V
L
 
P
D
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
F
M
 
Y
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
x
I
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
H
L
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
R
L
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
E
M
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
A
S
x
A
K
|
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
C
A
 
G
D
 
P
A
 
K
A
 
E
W
 
V
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
S
D
 
S
A
 
Q
A
 
S
A
 
T
I
 
T
C
 
S
A
 
P
P
 
D
A
 
T
V
 
I
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
D
 
A
C
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
M
M
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
S
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
L
C
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
K
Y
 
A
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
V
M
 
L
A
 
M
R
 
D
Y
 
-
T
 
T
F
 
S
T
 
P
D
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
E
M
 
V
-
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
-
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
D
F
 
F
G
 
A
P
 
A
T
 
F
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
H
L
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
N
L
 
L
D
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
F
A
 
A

6f35A Crystal structure of the aspartate aminotranferase from rhizobium meliloti (see paper)
35% identity, 90% coverage: 33:391/399 of query aligns to 34:399/400 of 6f35A

query
sites
6f35A
V
 
I
S
 
I
L
 
L
G
 
G
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
C
 
S
R
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
D
 
R
K
 
G
A
 
E
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
T
L
 
A
Q
 
L
P
 
D
G
 
G
M
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
Q
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
A
V
 
Y
N
 
E
P
 
L
D
 
D
S
 
-
E
 
E
V
 
I
G
 
T
V
 
V
T
 
A
V
 
T
G
|
G
A
|
A
M
x
K
E
 
Q
A
 
I
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
A
L
 
M
L
 
M
T
 
A
V
 
S
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
T
P
 
P
G
 
Y
Y
 
W
A
 
T
S
 
S
H
 
Y
A
 
S
E
 
D
Q
 
I
V
 
V
L
 
H
M
 
I
A
 
C
E
 
E
G
 
G
V
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
L
V
 
I
P
 
A
L
 
C
R
 
D
A
 
A
D
 
S
D
 
S
-
 
G
W
 
F
G
 
R
L
 
L
D
 
T
V
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
W
V
 
V
I
 
L
V
 
L
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
T
 
A
V
 
A
Y
 
Y
D
 
S
D
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
Y
R
 
R
A
 
P
L
 
L
C
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
L
L
 
L
E
 
R
R
 
H
-
 
P
N
 
H
I
 
V
M
 
W
L
 
L
I
 
L
S
 
V
D
|
D
E
 
D
T
x
M
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
I
V
 
V
Y
 
Y
G
 
D
G
 
G
G
 
F
E
 
R
P
 
F
L
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
Q
L
 
L
-
 
E
P
 
P
E
 
G
M
 
L
R
 
K
R
 
N
H
 
R
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
V
S
|
S
K
|
K
K
 
A
Y
 
Y
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
G
A
 
G
D
 
P
A
 
R
A
 
E
W
 
L
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
V
V
 
V
H
 
Q
D
 
S
A
 
Q
A
 
A
A
 
T
I
 
S
C
 
C
A
 
P
P
 
S
A
 
S
V
 
I
S
 
S
Q
 
Q
Y
 
A
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
N
G
 
G
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
C
 
F
V
 
L
D
 
K
D
 
E
M
 
R
R
 
T
A
 
E
A
 
S
L
 
F
S
 
Q
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
V
C
 
V
A
 
N
R
 
G
L
 
L
D
 
N
A
 
A
M
 
I
A
 
-
P
 
D
H
 
G
F
 
L
D
 
D
Y
 
C
V
 
R
Q
 
V
P
 
P
R
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
G
I
 
V
M
 
L
A
 
G
R
 
K
Y
 
V
T
 
T
F
 
P
T
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
I
D
 
K
A
 
T
P
 
D
S
 
T
D
 
D
M
 
F
V
 
C
A
 
A
R
 
-
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
D
G
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
S
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
T
 
S
G
 
-
E
 
-
R
 
P
H
 
F
L
 
F
R
 
R
L
 
I
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
A
T
 
C
Q
 
D
R
 
R
V
 
L

1o4sB Crystal structure of aspartate aminotransferase (tm1255) from thermotoga maritima at 1.90 a resolution (see paper)
35% identity, 95% coverage: 7:387/399 of query aligns to 10:381/384 of 1o4sB

query
sites
1o4sB
V
 
V
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
I
Q
 
S
Q
 
E
I
 
I
R
 
P
I
 
I
S
 
S
A
 
K
T
 
T
K
 
M
L
 
E
M
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
A
P
 
K
M
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
K
R
 
K
V
 
G
G
 
E
G
 
D
C
 
V
V
 
I
S
 
N
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
A
C
 
V
R
 
R
A
 
F
L
 
L
R
 
Q
D
 
-
K
 
K
A
 
G
D
 
E
A
 
V
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
T
L
 
D
Q
 
P
P
 
R
G
 
G
M
 
I
P
 
Y
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
K
D
 
R
L
 
I
A
 
G
A
 
E
R
 
R
K
 
Y
G
 
K
Y
 
K
M
 
D
V
 
I
N
 
S
P
 
P
D
 
D
S
 
-
E
 
Q
V
 
V
G
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
N
G
|
G
A
|
A
M
x
K
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
A
L
 
F
L
 
M
T
 
A
V
 
L
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
F
S
 
S
P
 
P
G
 
V
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
I
E
 
P
Q
 
Q
V
 
I
L
 
I
M
 
L
A
 
A
E
 
G
G
 
G
-
 
T
V
 
V
P
 
N
V
 
V
H
 
V
V
 
E
P
 
T
L
 
F
R
 
M
A
 
S
D
 
K
D
 
N
W
 
F
G
 
Q
L
 
P
D
 
S
V
 
L
D
 
E
A
 
E
I
 
V
R
 
E
A
 
G
A
 
L
V
 
L
T
 
V
P
 
G
R
 
K
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
I
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
V
V
 
V
Y
 
Y
D
 
R
D
 
R
A
 
E
D
 
F
V
 
L
R
 
E
A
 
G
L
 
L
C
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
K
R
 
R
N
 
N
I
 
F
M
 
Y
L
 
I
I
 
I
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
x
V
Y
|
Y
D
 
D
Y
 
S
M
 
L
V
 
V
Y
 
Y
G
 
-
G
 
T
G
 
D
E
 
E
P
 
F
L
 
T
S
 
S
P
 
I
A
 
L
S
 
D
L
 
V
P
 
S
E
 
E
M
 
G
R
 
F
R
 
D
H
 
R
V
 
I
I
 
V
V
 
Y
V
 
I
N
 
N
S
 
G
F
 
F
S
|
S
K
|
K
K
 
S
Y
 
H
A
 
S
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
C
 
L
A
 
I
A
 
S
D
 
S
A
 
E
A
 
K
W
 
V
M
 
A
G
 
T
E
 
A
L
 
V
L
 
S
K
 
K
V
 
I
H
 
Q
D
 
S
A
 
H
A
 
T
A
 
T
I
 
S
C
 
C
A
 
I
P
 
N
A
 
T
V
 
V
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
E
G
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
C
 
-
V
 
V
D
 
D
D
 
N
-
 
S
-
 
Y
M
 
M
R
 
V
A
 
Q
A
 
T
L
 
F
S
 
K
A
 
E
R
 
R
R
 
K
N
 
N
L
 
F
A
 
V
C
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
K
M
 
M
A
 
G
P
 
V
H
 
K
F
 
F
D
 
-
Y
 
-
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
R
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
I
 
L
M
 
F
A
 
F
R
 
K
Y
 
V
T
 
R
F
 
G
T
 
D
D
 
D
A
 
V
P
 
K
S
 
-
D
 
-
M
 
-
V
 
F
A
 
C
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
K
R
 
K
V
 
V
I
 
A
T
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
S
S
 
A
F
 
F
G
 
L
P
 
K
T
 
P
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
F
L
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
I
A
 
E
E
 
R
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
D
R
 
R
M
 
I
A
 
E
A
 
D
W
 
F

1gc4A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with aspartate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 7:385/399 of query aligns to 4:379/382 of 1gc4A

query
sites
1gc4A
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
M
R
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
A
I
 
V
S
 
V
A
 
A
T
 
V
K
 
N
L
 
A
M
 
K
P
 
A
M
 
L
L
 
E
A
 
L
A
 
R
R
 
R
V
 
Q
G
 
G
-
 
V
G
 
D
C
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
T
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
|
Y
T
 
A
L
 
P
Q
 
P
P
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
S
V
 
V
N
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
x
G
M
x
S
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
F
L
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
P
A
 
E
D
 
E
D
 
G
W
 
F
G
 
V
L
 
P
D
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
F
M
 
Y
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
 
I
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
H
L
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
R
L
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
E
M
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
 
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
C
A
 
G
D
 
P
A
 
K
A
 
E
W
 
V
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
S
D
x
R
A
 
Q
A
 
S
A
 
T
I
 
T
C
 
S
A
 
P
P
 
D
A
 
T
V
 
I
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
D
 
A
C
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
M
M
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
S
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
L
C
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
K
Y
 
A
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
|
Y
I
 
V
M
 
L
A
 
M
R
 
D
Y
 
-
T
 
T
F
 
S
T
 
P
D
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
E
M
 
V
-
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
G
R
 
-
V
 
V
I
 
A
T
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
T
S
 
D
F
 
F
G
 
A
P
 
A
T
 
F
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
H
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
M
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
E
E
 
N
L
 
L
D
 
R
E
 
K
A
 
A
F
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
F
A
 
A

1gc3A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with tryptophan (see paper)
37% identity, 95% coverage: 7:385/399 of query aligns to 4:379/382 of 1gc3A

query
sites
1gc3A
V
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
I
 
M
R
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
A
I
x
V
S
 
V
A
 
A
T
 
V
K
x
N
L
 
A
M
 
K
P
 
A
M
 
L
L
 
E
A
 
L
A
 
R
R
 
R
V
 
Q
G
 
G
-
 
V
G
 
D
C
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
x
T
Q
x
A
G
|
G
V
x
E
P
 
P
S
 
D
F
 
F
R
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
A
C
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
Q
K
 
G
A
 
K
D
 
T
A
 
-
G
 
-
R
 
K
Y
 
Y
T
 
A
L
 
P
Q
 
P
P
 
A
G
 
G
M
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
E
K
 
N
G
 
G
Y
 
L
M
 
S
V
 
V
N
 
T
P
 
P
D
 
E
S
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
-
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
x
G
M
x
S
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
F
M
 
N
A
 
L
L
 
F
L
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
R
 
P
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
Y
Y
x
W
A
 
V
S
 
S
H
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
M
V
 
V
L
 
R
M
 
F
A
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
V
V
 
V
H
 
E
V
 
V
P
 
E
-
 
T
L
 
L
R
 
P
A
 
E
D
 
E
D
 
G
W
 
F
G
 
V
L
 
P
D
 
D
V
 
P
D
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
R
A
 
A
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
V
C
 
N
N
 
S
P
 
P
G
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
E
D
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
H
N
 
D
I
 
F
M
 
Y
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
|
D
E
 
E
T
 
I
Y
|
Y
D
 
E
Y
 
H
M
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
-
G
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
H
L
 
F
S
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
R
L
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
E
M
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
H
V
 
T
I
 
L
V
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
A
 
C
A
 
G
D
 
P
A
 
K
A
 
E
W
 
V
M
 
I
G
 
K
E
 
A
L
 
M
L
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
S
D
 
R
A
 
Q
A
 
S
A
 
T
I
 
T
C
 
S
A
 
P
P
 
D
A
 
T
V
 
I
S
 
A
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
N
P
 
Q
Q
 
E
D
 
A
C
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
V
 
V
D
 
E
D
 
M
M
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
S
 
R
A
 
R
R
 
R
R
 
R
N
 
D
L
 
L
A
 
L
C
 
L
A
 
E
R
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
G
P
 
-
H
 
-
F
 
L
D
 
K
Y
 
A
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
R
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
Y
|
Y
I
 
V
M
 
L
A
 
M
R
 
D
Y
 
-
T
 
T
F
 
S
T
 
P
D
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
D
D
 
E
M
 
V
-
 
R
V
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
L