SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 349961 FitnessBrowser__Btheta:349961 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
28% identity, 90% coverage: 36:397/402 of query aligns to 25:383/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
K
E
 
E
L
 
S
D
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
P
P
 
A
T
 
S
V
 
I
T
 
T
K
 
K
F
 
I
I
 
T
G
 
R
E
 
E
M
 
L
C
 
I
E
 
D
D
 
A
G
 
H
Y
 
L
I
 
I
N
 
H
D
 
E
Y
 
T
G
 
T
K
 
V
L
 
Q
E
 
E
T
 
A
-
 
I
S
 
S
G
 
R
G
 
G
R
 
R
H
 
P
P
 
A
N
 
V
L
 
G
Y
 
L
G
 
Q
L
 
T
N
 
N
P
 
N
E
 
L
S
 
G
G
 
W
Y
 
Q
F
 
F
I
 
L
G
 
S
V
 
M
D
 
R
I
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
G
A
 
Y
V
 
L
N
 
T
I
 
I
G
 
A
L
 
L
I
 
H
N
 
E
F
 
L
K
 
G
G
 
G
D
 
E
-
 
V
M
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
T
K
 
K
M
 
I
N
 
D
I
 
I
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
F
 
-
E
 
-
N
 
H
S
 
E
I
 
I
E
 
D
G
 
Q
M
 
D
N
 
D
E
 
V
L
 
L
C
 
A
K
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
F
N
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
E
F
 
F
I
 
F
K
 
Q
K
 
T
L
 
Y
P
 
A
I
 
A
N
 
Q
K
 
L
E
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
T
N
 
S
I
 
I
N
 
A
V
 
I
N
 
T
V
 
L
S
 
P
G
 
G
W
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
S
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
-
 
I
-
 
V
Y
 
L
S
 
Q
F
 
M
S
 
P
Q
 
H
F
 
Y
N
 
N
F
 
V
E
 
K
E
 
N
R
 
L
P
 
A
L
 
L
A
 
G
D
 
P
V
 
E
L
 
I
S
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
T
G
 
G
H
 
L
K
 
P
V
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
W
T
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
K
M
 
L
Q
 
F
G
 
G
C
 
H
V
 
S
K
 
Q
G
 
D
E
 
V
K
 
D
D
 
N
I
 
S
I
 
V
F
 
L
V
 
I
N
 
S
V
 
I
S
 
H
W
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
Y
 
L
T
 
Q
G
 
G
K
 
R
S
 
H
G
 
G
F
 
N
S
 
I
G
 
G
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
I
N
 
Q
A
 
I
Y
 
D
D
 
P
N
 
Q
E
 
G
I
 
K
I
 
R
C
|
C
H
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
N
K
 
Y
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
S
S
 
Q
A
 
A
L
 
I
H
 
R
R
 
D
I
 
Q
L
 
V
L
 
T
E
 
A
R
 
R
I
 
I
K
 
Q
S
 
A
G
 
G
E
 
E
S
 
P
S
 
S
I
 
C
L
 
L
S
 
A
T
 
T
R
 
V
I
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
E
P
 
E
I
 
I
T
 
S
L
 
I
D
 
E
E
 
D
I
 
I
I
 
C
T
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
A
K
 
D
E
 
G
D
 
D
L
 
P
L
 
L
C
 
A
I
 
V
E
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
Q
E
 
Q
I
 
L
G
 
G
Q
 
R
K
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
A
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
I
L
 
V
I
 
I
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
V
L
 
I
S
 
N
L
 
Q
T
 
A
G
 
K
D
 
S
Y
 
I
I
 
L
T
 
Y
Q
 
P
P
 
S
I
 
I
K
 
E
T
 
Q
A
 
C
V
 
I
R
 
R
K
 
E
Y
 
Q
S
 
S
L
 
L
N
 
P
L
 
V
V
 
Y
N
 
H
K
 
Q
D
 
D
S
 
L
A
 
K
I
 
L
I
 
V
T
 
E
S
 
S
K
 
R
L
 
F
K
 
Y
D
 
K
K
 
Q
A
 
A
G
 
T
I
 
M
V
 
P
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
K
R
 
Q
S
 
A

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
25% identity, 89% coverage: 36:394/402 of query aligns to 35:390/406 of P50456

query
sites
P50456
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
R
E
 
L
L
 
A
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
V
 
P
P
 
A
T
 
S
V
 
I
T
 
T
K
 
K
F
 
I
I
 
V
G
x
R
E
 
E
M
 
M
C
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
H
Y
 
L
I
 
V
N
 
Q
D
 
E
Y
 
L
G
 
-
K
 
E
L
 
I
E
 
K
T
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
N
R
 
R
H
 
G
P
 
R
N
 
P
L
 
A
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
-
 
V
-
 
V
N
 
E
P
 
T
E
 
E
S
 
A
G
 
W
Y
x
H
F
 
Y
I
 
L
G
 
S
V
 
L
D
 
R
I
 
I
K
 
S
R
 
R
F
 
G
A
 
E
V
 
I
N
 
F
I
 
L
G
 
A
L
 
L
I
 
R
N
 
D
F
 
L
K
 
S
G
 
S
D
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
E
M
 
E
N
 
S
I
 
Q
P
 
E
Y
 
L
K
 
A
F
 
L
E
 
K
N
 
D
S
 
D
I
 
L
E
 
P
G
 
L
M
 
L
N
 
D
E
 
R
L
 
I
C
 
I
K
 
S
L
 
H
I
 
I
L
 
D
N
 
Q
F
 
F
I
x
F
K
 
I
K
 
R
L
 
H
P
 
Q
I
 
K
N
 
K
K
 
L
E
 
E
K
 
R
I
 
L
L
 
T
N
 
S
I
 
I
N
 
A
V
 
I
N
 
T
V
 
L
S
 
P
G
 
G
W
 
I
V
 
I
N
 
D
P
 
T
E
 
E
S
 
N
G
 
G
Y
 
I
S
 
V
F
 
H
S
 
R
Q
 
M
F
 
P
N
 
F
F
 
Y
E
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
K
E
 
E
R
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
A
L
 
L
S
 
E
E
 
Q
K
 
H
L
 
T
G
 
G
H
 
V
K
 
P
V
 
V
T
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
T
 
I
R
 
S
A
 
A
M
 
W
T
 
T
Y
 
M
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
Q
 
F
G
 
G
C
 
A
V
 
S
K
 
R
G
 
G
E
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
V
I
 
I
F
 
Q
V
 
V
N
 
V
V
 
I
S
 
D
W
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
I
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
H
V
 
L
Y
 
L
T
 
H
G
 
A
K
 
G
S
 
S
G
 
S
F
 
S
S
 
L
G
 
V
E
 
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
Q
V
 
V
N
 
D
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
N
 
K
E
 
R
I
 
-
I
 
-
C
|
C
H
 
Y
C
|
C
G
 
G
K
 
N
K
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
V
S
 
D
A
 
S
L
 
I
H
 
L
R
 
E
I
 
L
L
 
A
L
 
Q
E
 
L
R
 
R
I
 
L
K
 
N
S
 
Q
G
 
S
E
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
M
L
 
L
S
 
H
T
 
G
R
 
Q
I
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
P
I
 
L
T
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
S
I
 
L
I
 
C
T
 
Q
A
 
A
V
 
A
N
 
L
K
x
R
E
 
G
D
 
D
L
 
L
L
|
L
C
 
A
I
 
K
E
 
D
I
 
I
V
 
I
E
 
T
E
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
A
K
 
H
L
 
V
G
 
G
K
 
R
Q
 
I
I
 
L
A
 
A
G
 
I
L
 
M
I
 
V
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
S
T
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
K
T
 
A
G
 
A
D
 
D
Y
 
I
I
 
L
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
I
 
I
K
 
S
T
 
D
A
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
Y
 
Q
S
 
A
L
 
L
N
 
P
L
 
A
V
 
Y
N
 
S
K
 
Q
D
 
H
S
 
I
A
 
S
I
 
V
I
 
E
T
 
S
S
 
T
K
 
Q
L
 
F
K
 
S
D
 
N
K
 
Q
A
 
G
G
 
T
I
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
L
L
 
V

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
25% identity, 89% coverage: 36:394/402 of query aligns to 24:366/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
D
 
D
L
 
L
S
 
S
K
 
R
E
 
L
L
 
A
D
 
Q
L
 
L
S
 
A
V
 
P
P
 
A
T
 
S
V
 
I
T
 
T
K
 
K
F
 
I
I
 
V
G
 
H
E
 
E
M
 
M
C
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
H
Y
 
L
I
 
V
N
 
Q
D
 
E
Y
 
L
G
 
G
K
 
L
L
 
V
E
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
V
N
 
E
P
 
T
E
 
E
S
 
A
G
 
W
Y
 
H
F
 
Y
I
 
L
G
 
S
V
 
L
D
 
R
I
 
I
K
 
S
R
 
R
F
 
G
A
 
E
V
 
I
N
 
F
I
 
L
G
 
A
L
 
L
I
 
R
N
 
D
F
 
L
K
 
S
G
 
S
D
 
K
M
 
L
V
 
V
E
 
-
L
 
V
K
 
E
M
 
E
N
 
S
I
 
Q
P
 
E
Y
 
L
K
 
A
F
 
L
E
 
K
N
 
D
S
 
D
I
 
L
E
 
P
G
 
L
M
 
L
N
 
D
E
 
R
L
 
I
C
 
I
K
 
S
L
 
H
I
 
I
L
 
D
N
 
Q
F
 
F
I
 
F
K
 
I
K
 
R
L
 
H
P
 
Q
I
 
K
N
 
K
K
 
L
E
 
E
K
 
R
I
 
L
L
 
T
N
 
S
I
 
I
N
 
A
V
 
I
N
 
T
V
 
L
S
 
P
G
 
G
W
 
I
V
 
I
N
 
D
P
 
T
E
 
E
S
 
N
G
 
G
Y
 
I
S
 
V
F
 
H
S
 
R
Q
 
M
F
 
P
N
 
F
F
 
Y
E
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
K
E
 
E
R
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
A
L
 
L
S
 
E
E
 
Q
K
 
H
L
 
T
G
 
G
H
 
V
K
 
P
V
 
V
T
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
T
 
I
R
 
S
A
 
A
M
 
W
T
 
T
Y
 
M
G
 
A
E
 
E
Y
 
A
M
 
L
Q
 
F
G
 
G
C
 
A
V
 
S
K
 
R
G
 
G
E
 
A
K
 
R
D
 
D
I
 
V
I
 
I
F
 
Q
V
 
V
N
 
V
V
 
I
S
 
D
W
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
I
 
T
D
 
D
G
 
G
K
 
H
V
 
L
Y
 
L
T
 
H
G
 
A
K
 
G
S
 
S
G
 
S
F
 
S
S
 
L
G
 
V
E
 
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
-
 
T
-
 
Q
V
 
V
N
 
D
A
 
P
Y
 
Y
D
 
G
N
 
K
E
 
R
I
 
-
I
 
-
C
|
C
H
 
Y
C
|
C
G
 
G
K
 
N
K
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
V
S
 
D
A
 
S
L
 
I
H
 
L
R
 
E
I
 
L
L
 
A
L
 
Q
E
 
L
R
 
R
I
 
L
K
 
N
S
 
Q
G
 
S
E
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
M
L
 
L
S
 
H
T
 
G
R
 
Q
I
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
P
I
 
L
T
 
T
L
 
V
D
 
D
E
 
S
I
 
L
I
 
C
T
 
Q
A
 
A
V
 
A
N
 
L
K
 
R
E
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
C
 
A
I
 
K
E
 
D
I
 
I
V
 
I
E
 
T
E
 
G
I
 
V
G
 
G
Q
 
A
K
 
H
L
 
V
G
 
G
K
 
R
Q
 
I
I
 
L
A
 
A
G
 
I
L
 
M
I
 
V
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
S
T
 
P
L
 
L
S
 
S
L
 
K
T
 
A
G
 
A
D
 
D
Y
 
I
I
 
L
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
I
 
I
K
 
S
T
 
D
A
 
S
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
Y
 
Q
S
 
A
L
 
L
N
 
P
L
 
A
V
 
Y
N
 
S
K
 
Q
D
 
H
S
 
I
A
 
S
I
 
V
I
 
E
T
 
S
S
 
T
K
 
Q
L
 
F
K
 
S
D
 
N
K
 
Q
A
 
G
G
 
T
I
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
L
L
 
V

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
26% identity, 93% coverage: 30:401/402 of query aligns to 27:391/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
G
 
G
S
 
E
S
 
I
T
 
T
I
 
R
P
x
T
D
 
E
L
 
I
S
 
A
K
 
K
E
 
K
L
 
C
D
 
D
L
 
F
S
 
G
V
 
M
P
x
S
T
|
T
V
 
L
T
 
T
K
 
Y
F
 
I
I
 
L
G
 
D
E
 
D
M
 
L
C
 
Q
E
 
Q
D
 
E
G
 
G
Y
 
I
I
 
I
N
 
L
D
 
E
Y
 
G
G
 
A
K
 
E
L
 
T
E
 
S
T
 
S
S
x
T
G
|
G
G
|
G
R
|
R
H
x
R
P
x
A
N
x
K
L
 
L
Y
 
V
G
 
R
L
 
F
N
 
N
P
 
K
E
 
D
S
 
Y
G
 
G
Y
 
F
F
 
V
I
 
V
G
 
S
V
 
V
D
 
K
I
 
V
K
 
E
R
 
E
F
 
E
A
 
Q
V
 
L
N
 
L
I
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
T
N
 
D
F
 
L
K
 
N
G
 
A
D
 
E
M
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
-
K
 
N
M
 
T
N
 
S
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
K
 
S
F
 
S
E
 
E
N
 
K
S
 
K
I
 
P
E
 
E
G
 
-
M
 
-
N
 
-
E
 
E
L
 
A
C
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
L
 
A
N
 
K
F
 
N
I
 
V
K
 
K
K
 
K
L
 
M
P
 
C
I
 
G
N
 
N
K
 
R
E
 
D
-
 
M
-
 
N
K
 
H
I
 
L
L
 
L
N
 
G
I
 
V
N
 
G
V
 
I
N
 
A
V
 
I
S
 
S
G
 
G
W
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
F
 
I
-
 
R
-
 
S
S
 
T
Q
 
M
F
 
L
N
 
G
F
 
W
E
 
E
E
 
N
R
 
V
P
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
A
V
 
M
L
 
L
S
 
H
E
 
A
K
 
H
L
 
F
G
 
P
H
 
D
-
 
I
K
 
P
V
 
V
T
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
D
 
N
T
 
I
R
 
N
A
 
C
M
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
M
 
W
Q
 
L
G
 
G
C
 
E
V
 
G
K
 
K
G
 
Q
E
 
S
K
 
N
D
 
N
I
 
F
I
 
A
F
 
T
V
 
V
N
 
S
V
 
V
S
 
G
W
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
S
I
 
V
I
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
R
K
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
T
 
Y
G
 
G
K
 
A
S
 
Q
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
T
A
 
I
Y
 
Q
D
 
P
N
 
G
E
 
G
I
 
Y
I
 
K
C
|
C
H
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
M
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
G
 
-
S
 
E
A
 
F
L
 
Y
H
 
F
R
 
R
I
 
N
L
 
R
L
 
G
E
 
E
R
 
E
I
 
L
K
 
K
S
 
E
G
 
A
E
 
Y
S
 
P
S
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
T
G
 
S
E
 
E
E
 
L
D
 
N
P
 
D
I
 
F
T
 
H
L
 
F
D
 
D
E
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
K
A
 
S
V
 
A
N
 
R
K
 
A
E
 
G
D
 
D
L
 
E
L
 
M
C
 
A
I
 
T
E
 
E
I
 
L
V
 
M
E
 
G
E
 
K
I
 
M
G
 
G
Q
 
E
K
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
Y
Q
 
G
I
 
I
A
 
R
G
 
N
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
V
G
 
G
T
 
E
L
 
G
S
 
L
L
 
H
T
 
H
G
 
R
D
 
D
Y
 
L
I
 
F
T
 
L
Q
 
T
P
 
K
I
 
I
K
 
D
T
 
E
A
 
I
V
 
A
R
 
S
K
 
Q
Y
 
N
S
 
F
L
 
F
N
 
S
L
 
G
V
 
A
N
 
G
K
 
F
D
 
E
S
 
T
A
 
E
I
 
I
I
 
T
T
 
T
S
 
T
K
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
G
 
W
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
I
S
 
H
R
 
Q
M
 
L
F
 
F
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
28% identity, 78% coverage: 85:396/402 of query aligns to 1:310/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
G
 
G
Y
 
L
F
 
T
I
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
K
x
G
R
 
G
F
x
T
A
x
K
V
 
I
N
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
N
 
D
F
 
E
K
 
E
G
 
G
D
 
R
M
 
I
V
 
L
E
 
S
-
 
T
L
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
A
I
 
T
P
 
P
Y
 
P
K
 
T
F
 
A
E
 
E
N
 
G
S
 
I
I
 
V
E
 
-
G
 
-
M
 
-
N
 
D
E
 
A
L
 
I
C
 
C
K
 
A
L
 
A
I
 
V
L
 
A
N
 
G
F
 
A
I
 
S
K
 
E
K
 
G
L
 
-
P
 
-
I
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
H
K
 
D
I
 
V
L
 
E
N
 
A
I
 
V
N
 
G
V
 
I
N
 
G
V
 
A
S
 
A
G
|
G
W
 
Y
V
 
V
N
 
D
P
 
D
E
 
K
S
 
R
G
 
A
Y
 
T
S
 
V
F
 
L
S
 
F
Q
 
A
F
x
P
N
 
N
F
 
I
E
 
D
E
 
W
R
 
R
-
 
H
-
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
K
L
 
V
S
 
E
E
 
Q
K
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
L
K
 
P
V
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
E
N
|
N
D
|
D
T
 
A
R
 
N
A
 
A
M
 
A
T
 
A
Y
 
W
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
M
 
R
Q
 
F
G
 
G
C
 
A
V
 
G
K
 
Q
G
 
G
E
 
H
K
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
I
F
 
C
V
 
I
N
 
T
V
 
L
S
x
G
W
x
T
G
 
G
V
x
L
G
|
G
I
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
G
G
 
N
K
 
K
V
 
L
Y
 
R
T
 
R
G
 
G
K
 
R
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
A
G
 
A
E
|
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
I
N
 
R
A
 
V
Y
 
V
D
 
P
N
 
D
E
 
G
I
 
L
I
 
L
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
S
K
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
T
 
Q
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
V
R
 
R
I
 
Y
L
 
A
L
 
K
E
 
Q
R
 
R
I
 
A
K
 
N
S
 
A
G
 
T
E
 
P
-
 
E
-
 
N
S
 
A
S
 
A
I
 
V
L
 
L
S
 
L
T
 
G
R
 
L
I
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
S
E
 
V
D
 
D
P
 
G
I
 
I
T
 
E
L
x
G
D
 
K
E
 
H
I
 
I
I
x
S
T
 
E
A
 
A
V
 
A
N
 
R
K
 
Q
E
 
G
D
 
D
L
 
P
L
 
V
C
 
A
I
 
V
E
 
D
I
 
S
V
 
F
E
 
R
E
 
E
I
 
L
G
 
A
Q
 
R
K
 
W
L
 
A
G
 
G
K
 
A
Q
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
A
V
 
F
I
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
x
G
L
x
V
S
 
S
L
 
D
T
x
E
G
 
G
D
 
E
Y
 
L
I
 
V
T
 
L
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
R
T
 
K
A
 
S
V
 
F
R
 
R
K
 
R
Y
 
W
S
 
L
L
 
I
N
 
G
L
 
G
V
 
E
N
 
W
K
 
R
D
 
P
S
 
H
A
 
A
-
 
Q
I
 
V
I
 
L
T
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
L
K
 
G
D
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
28% identity, 78% coverage: 85:396/402 of query aligns to 1:310/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
G
 
G
Y
 
L
F
 
T
I
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
K
 
G
R
 
G
F
 
T
A
 
K
V
 
I
N
 
A
I
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
V
N
 
D
F
 
E
K
 
E
G
 
G
D
 
R
M
 
I
V
 
L
E
 
S
-
 
T
L
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
A
I
 
T
P
 
P
Y
 
P
K
 
T
F
 
A
E
 
E
N
 
G
S
 
I
I
 
V
E
 
-
G
 
-
M
 
-
N
 
D
E
 
A
L
 
I
C
 
C
K
 
A
L
 
A
I
 
V
L
 
A
N
 
G
F
 
A
I
 
S
K
 
E
K
 
G
L
 
-
P
 
-
I
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
H
K
 
D
I
 
V
L
 
E
N
 
A
I
 
V
N
 
G
V
 
I
N
 
G
V
 
A
S
 
A
G
 
G
W
 
Y
V
 
V
N
 
D
P
 
D
E
 
K
S
 
R
G
 
A
Y
 
T
S
 
V
F
 
L
S
 
F
Q
 
A
F
 
P
N
 
N
F
 
I
E
 
D
E
 
W
R
 
R
-
 
H
-
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
D
V
 
K
L
 
V
S
 
E
E
 
Q
K
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
L
K
 
P
V
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
N
A
 
A
M
 
A
T
 
A
Y
 
W
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
M
 
R
Q
 
F
G
 
G
C
 
A
V
 
G
K
 
Q
G
 
G
E
 
H
K
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
I
F
 
C
V
 
I
N
 
T
V
 
L
S
 
G
W
 
T
G
 
G
V
 
L
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
G
G
 
N
K
 
K
V
 
L
Y
 
R
T
 
R
G
 
G
K
 
R
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
I
N
 
R
A
 
V
Y
 
V
D
 
P
N
 
D
E
 
G
I
 
L
I
 
L
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
S
K
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
T
 
Q
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
V
R
 
R
I
 
Y
L
 
A
L
 
K
E
 
Q
R
 
R
I
 
A
K
 
N
S
 
A
G
 
T
E
 
P
-
 
E
-
 
N
S
 
A
S
 
A
I
 
V
L
 
L
S
 
L
T
 
G
R
 
L
I
 
G
S
 
D
G
 
G
E
 
S
E
 
V
D
 
D
P
 
G
I
 
I
T
 
E
L
 
G
D
 
K
E
 
H
I
 
I
I
 
S
T
 
E
A
 
A
V
 
A
N
 
R
K
 
Q
E
 
G
D
 
D
L
 
P
L
 
V
C
 
A
I
 
V
E
 
D
I
 
S
V
 
F
E
 
R
E
 
E
I
 
L
G
 
A
Q
 
R
K
 
W
L
 
A
G
 
G
K
 
A
Q
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
A
V
 
F
I
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
D
T
 
E
G
 
G
D
 
E
Y
 
L
I
 
V
T
 
L
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
R
T
 
K
A
 
S
V
 
F
R
 
R
K
 
R
Y
 
W
S
 
L
L
 
I
N
 
G
L
 
G
V
 
E
N
 
W
K
 
R
D
 
P
S
 
H
A
 
A
-
 
Q
I
 
V
I
 
L
T
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
L
K
 
G
D
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
27% identity, 77% coverage: 88:395/402 of query aligns to 9:319/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
I
 
I
G
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
L
K
 
G
R
 
G
F
 
T
A
 
T
V
 
I
N
 
K
I
 
F
G
 
A
L
 
I
I
 
L
N
 
T
F
 
T
K
 
D
G
 
G
D
 
-
M
 
V
V
 
V
E
 
Q
L
 
Q
K
 
K
M
 
W
N
 
S
I
 
I
P
 
E
Y
 
T
K
 
N
-
 
I
F
 
L
E
 
E
N
 
D
S
 
G
I
 
K
E
 
H
G
 
I
M
 
V
N
 
P
E
 
S
L
 
I
C
 
I
K
 
E
L
 
S
I
 
I
L
 
R
N
 
H
F
 
R
I
 
I
K
 
D
K
 
L
L
 
Y
P
 
N
I
 
M
N
 
K
K
 
K
E
 
E
K
 
D
I
 
F
L
 
V
N
 
G
I
 
I
N
 
G
V
 
M
N
 
G
V
 
T
S
 
P
G
 
G
W
 
S
V
 
V
N
 
D
P
 
I
E
 
E
S
 
K
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
F
 
V
S
 
G
Q
 
A
F
 
Y
N
 
N
F
 
L
E
 
N
E
 
W
-
 
T
-
 
T
-
 
V
R
 
Q
P
 
P
L
 
V
A
 
K
D
 
E
V
 
Q
L
 
I
S
 
E
E
 
S
K
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
I
K
 
P
V
 
F
T
 
A
I
 
L
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
A
R
x
N
A
 
V
M
 
A
T
 
A
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
Y
 
R
M
 
W
Q
 
K
G
 
G
C
 
A
V
 
G
K
 
E
G
 
N
E
 
N
K
 
P
D
 
D
I
 
V
I
 
I
F
 
F
V
 
I
N
 
T
V
 
L
S
 
G
W
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
x
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
I
 
A
D
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
L
Y
 
L
T
 
H
G
 
G
K
 
V
S
 
A
G
 
G
F
 
C
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
N
 
T
A
 
V
Y
 
D
D
 
P
N
 
N
E
 
G
I
 
F
I
 
D
C
|
C
H
 
T
C
|
C
G
 
G
K
 
K
K
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
V
A
 
S
S
 
S
G
 
A
S
 
T
A
 
G
L
 
V
H
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
A
-
 
R
-
 
H
L
 
L
E
 
S
R
 
E
I
 
E
K
 
F
S
 
A
G
 
G
E
 
D
S
 
S
S
 
E
I
 
L
L
 
K
S
 
Q
T
 
A
R
 
I
I
 
D
S
 
D
G
 
G
E
 
Q
E
 
D
D
 
-
P
 
-
I
 
V
T
 
S
L
 
S
D
 
K
E
 
D
I
 
V
I
 
F
T
 
E
A
 
F
V
 
A
N
 
E
K
 
K
E
 
G
D
 
D
L
 
H
L
 
F
C
 
A
I
 
L
E
 
M
I
 
V
V
 
V
E
 
D
E
 
R
I
 
V
G
 
C
Q
 
F
K
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
L
Q
 
A
I
 
T
A
 
G
G
 
N
L
 
L
I
 
G
N
 
N
I
 
T
F
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
L
 
S
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
A
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
I
 
L
T
 
R
Q
 
S
P
 
R
I
 
V
K
 
E
T
 
K
A
 
Y
V
 
F
R
 
Q
K
 
E
Y
 
F
S
 
T
L
 
F
N
 
P
L
 
Q
V
 
V
N
 
R
K
 
N
D
 
S
S
 
T
A
 
K
I
 
I
I
 
K
T
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
L
K
 
G
D
 
N
K
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
S
L
 
L
A
 
A

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
27% identity, 79% coverage: 85:400/402 of query aligns to 1:306/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
G
 
G
Y
 
F
F
 
V
I
 
V
G
 
S
V
 
V
D
x
K
I
 
V
K
 
E
R
x
E
F
 
E
A
 
Q
V
 
L
N
 
L
I
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
T
N
 
D
F
 
L
K
 
N
G
 
A
D
 
E
M
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
-
K
 
N
M
 
T
N
 
S
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
K
 
S
F
 
S
E
 
E
N
 
K
S
 
K
I
 
P
E
 
E
G
 
-
M
 
-
N
 
-
E
 
E
L
 
A
C
 
I
K
 
E
L
 
L
I
 
I
L
 
A
N
 
K
F
 
N
I
 
V
K
 
K
K
 
K
L
 
M
P
 
C
I
 
G
N
 
N
K
 
R
E
 
D
-
 
M
-
 
N
K
 
H
I
 
L
L
 
L
N
 
G
I
 
V
N
 
G
V
 
I
N
 
A
V
 
I
S
 
S
G
|
G
W
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
Y
 
T
S
 
V
F
 
I
-
 
R
-
 
S
S
 
T
Q
 
M
F
 
L
N
 
G
F
 
W
E
 
E
E
 
N
R
 
V
P
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
A
V
 
M
L
 
L
S
 
H
E
 
A
K
 
H
L
 
F
G
 
P
H
 
D
-
 
I
K
 
P
V
 
V
T
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
D
x
N
T
 
I
R
 
N
A
 
C
M
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
M
 
W
Q
 
L
G
 
G
C
 
E
V
 
G
K
 
K
G
 
Q
E
 
S
K
 
N
D
 
N
I
 
F
I
 
A
F
 
T
V
 
V
N
x
S
V
|
V
S
 
G
W
 
A
G
|
G
V
x
L
G
|
G
I
 
L
G
 
S
I
 
V
I
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
R
K
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
T
 
Y
G
 
G
K
 
A
S
 
Q
G
 
G
F
 
G
S
 
A
G
 
G
E
|
E
F
 
F
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
T
A
 
I
Y
 
Q
D
 
P
N
 
G
E
 
G
I
 
Y
I
 
K
C
|
C
H
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
T
 
M
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
G
 
-
S
 
E
A
 
F
L
 
Y
H
 
F
R
 
R
I
 
N
L
 
R
L
 
G
E
 
E
R
 
E
I
 
L
K
 
K
S
 
-
G
 
-
E
 
E
S
 
A
S
 
Y
I
 
P
L
 
L
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
N
P
 
D
I
 
F
T
 
H
L
 
F
D
 
D
E
 
K
I
 
V
I
 
A
T
 
K
A
 
S
V
 
A
N
 
R
K
 
A
E
 
G
D
 
D
L
 
E
L
 
M
C
 
A
I
 
T
E
 
E
I
 
L
V
 
M
E
 
G
E
 
K
I
 
M
G
 
G
Q
 
E
K
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
Y
Q
 
G
I
 
I
A
 
R
G
 
N
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
V
G
 
G
T
x
E
L
 
G
S
 
L
L
 
H
T
 
H
G
 
R
D
 
D
Y
 
L
I
 
F
T
 
L
Q
 
T
P
 
K
I
 
I
K
 
D
T
 
E
A
 
I
V
 
A
R
 
S
K
 
Q
Y
 
N
S
 
F
L
 
F
N
 
S
L
 
G
V
 
A
N
 
G
K
 
F
D
 
E
S
 
T
A
 
E
I
 
I
I
 
T
T
 
T
S
 
T
K
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
D
K
 
P
A
 
A
G
x
W
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
V
R
 
I
S
 
H
R
 
Q
M
 
L
F
 
F

6jdbA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac-6p and adp from haemophilus influenzae
27% identity, 73% coverage: 109:400/402 of query aligns to 22:290/290 of 6jdbA

query
sites
6jdbA
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
K
 
R
M
 
Q
N
 
Q
I
 
I
P
 
H
Y
 
T
K
 
P
F
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
V
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
M
N
 
H
E
 
Q
-
 
A
L
 
L
C
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
A
N
 
D
F
 
Y
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
I
 
F
K
 
D
K
 
Y
L
 
V
P
 
A
I
 
V
N
 
A
K
 
S
E
x
T
K
x
G
I
 
I
L
 
-
N
 
-
I
 
I
N
 
N
V
 
N
N
 
G
V
 
I
S
 
L
G
 
S
W
x
A
V
x
L
N
|
N
P
 
P
E
 
K
S
x
N
G
 
L
Y
 
G
S
 
G
F
 
L
S
 
A
Q
 
E
F
 
F
N
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
A
V
 
S
L
 
I
S
 
A
E
 
K
K
 
H
L
 
T
G
 
D
H
 
K
K
 
P
V
 
I
T
 
G
I
 
L
D
 
L
N
|
N
D
|
D
T
 
A
R
 
Q
A
 
A
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
G
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
Q
Q
 
L
G
 
Q
C
 
N
V
 
F
K
 
E
G
 
Q
E
 
V
K
 
S
D
 
N
I
 
F
I
 
V
F
 
F
V
 
I
N
 
T
V
 
V
S
|
S
W
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
I
 
L
D
 
N
G
 
Q
K
 
I
V
 
L
Y
 
Q
T
 
T
G
 
G
K
 
S
S
 
R
G
 
G
F
 
I
S
 
A
G
 
G
E
x
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
L
A
 
A
Y
 
D
D
 
P
N
 
N
E
 
G
I
 
A
I
 
I
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
R
K
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
|
E
T
 
A
E
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
I
H
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
S
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
S
G
 
Q
E
 
W
E
 
E
D
 
D
P
 
P
I
 
C
T
 
D
L
x
P
D
x
K
E
 
E
I
 
V
I
 
F
T
 
E
A
 
R
V
 
F
N
 
R
K
 
K
E
 
N
D
 
D
L
 
E
L
 
K
C
 
A
I
 
T
E
 
A
I
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
R
I
 
S
G
 
A
Q
 
K
K
 
A
L
 
I
G
 
A
K
 
N
Q
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
V
N
 
I
I
 
S
F
 
L
N
 
D
P
 
I
E
 
Q
L
 
K
V
 
I
I
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
T
x
S
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
G
Y
 
Y
I
 
L
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
I
 
-
K
 
-
T
 
S
A
 
L
V
 
V
R
 
E
K
 
K
Y
 
Y
S
 
L
L
 
Q
N
 
D
L
 
F
V
 
P
N
 
S
-
 
I
K
 
Y
D
 
C
S
 
C
A
 
E
I
 
I
I
 
E
T
 
T
S
 
A
K
 
K
L
 
F
K
 
G
D
 
Q
K
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
Y
L
 
W
A
 
V
R
 
K
S
 
D
R
 
V
M
 
L
F
 
L

Sites not aligning to the query:

6jdcA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac from haemophilus influenzae
31% identity, 43% coverage: 109:279/402 of query aligns to 23:195/269 of 6jdcA

query
sites
6jdcA
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
K
 
R
M
 
Q
N
 
Q
I
 
I
P
 
H
Y
 
T
K
 
P
F
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
V
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
M
N
 
H
E
 
Q
-
 
A
L
 
L
C
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
A
N
 
D
F
 
Y
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
I
 
F
K
 
D
K
 
Y
L
 
V
P
 
A
I
 
V
N
 
A
K
 
S
E
 
T
K
 
G
I
 
I
L
 
-
N
 
-
I
 
I
N
 
N
V
 
N
N
 
G
V
 
I
S
 
L
G
 
S
W
 
A
V
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
L
Y
 
G
S
 
G
F
 
L
S
 
A
Q
 
E
F
 
F
N
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
A
V
 
S
L
 
I
S
 
A
E
 
K
K
 
H
L
 
T
G
 
D
H
 
K
K
 
P
V
 
I
T
 
G
I
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
Q
A
 
A
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
G
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
Q
Q
 
L
G
 
Q
C
 
N
V
 
F
K
 
E
G
 
Q
E
 
V
K
 
S
D
 
N
I
 
F
I
 
V
F
 
F
V
 
I
N
 
T
V
 
V
S
 
S
W
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
I
 
L
D
 
N
G
 
Q
K
 
I
V
 
L
Y
 
Q
T
 
T
G
 
G
K
 
S
S
 
R
G
 
G
F
 
I
S
 
A
G
 
G
E
 
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
L
A
 
A
Y
 
D
D
 
P
N
 
N
E
 
G
I
 
A
I
 
I
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
R
K
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
 
E
T
 
A
E
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
I
H
 
E
R
 
A
I
 
V
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
R

4db3A 1.95 angstrom resolution crystal structure of n-acetyl-d-glucosamine kinase from vibrio vulnificus.
29% identity, 55% coverage: 174:394/402 of query aligns to 94:307/311 of 4db3A

query
sites
4db3A
R
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
R
D
 
A
V
 
D
L
 
L
S
 
E
E
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
H
 
R
K
 
S
V
 
V
T
 
K
I
 
I
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
N
A
 
C
M
 
F
T
 
A
Y
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
M
 
W
Q
 
D
G
 
E
C
 
E
V
 
L
K
 
Q
G
 
D
E
 
A
K
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
M
F
 
G
V
 
L
N
 
I
V
 
L
S
 
G
W
 
T
G
 
G
V
 
F
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
Y
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Y
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
N
G
 
N
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
-
 
M
-
 
R
-
 
L
-
 
P
V
 
L
N
 
D
A
 
A
Y
 
W
-
 
F
-
 
H
-
 
L
-
 
G
D
 
D
N
 
N
E
 
A
I
 
P
I
 
L
-
 
L
-
 
G
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
K
K
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
D
T
 
S
E
 
Y
A
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
H
 
E
R
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
L
L
 
L
S
 
Y
T
 
A
R
 
H
I
 
Y
S
 
Y
G
 
G
E
 
E
E
 
E
D
 
K
P
 
K
I
 
A
T
 
I
L
 
-
D
 
-
E
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
K
A
 
A
V
 
N
N
 
A
K
 
A
E
 
G
D
 
D
L
 
E
L
 
K
C
 
A
I
 
A
E
 
E
I
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
R
I
 
F
G
 
M
Q
 
E
K
 
L
L
 
L
G
 
A
K
 
I
Q
 
C
I
 
F
A
 
G
G
 
N
L
 
I
I
 
F
N
 
T
I
 
A
F
 
N
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
-
T
 
N
G
 
F
D
 
E
Y
 
L
I
 
I
T
 
Y
Q
 
E
P
 
E
I
 
M
K
 
P
T
 
K
A
 
R
V
 
V
R
 
P
K
 
K
Y
 
Y
S
 
L
L
 
L
N
 
S
L
 
-
V
 
V
N
 
A
K
 
K
D
 
C
S
 
P
A
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
K
S
 
A
K
 
K
L
 
H
K
 
G
D
 
D
K
 
S
A
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
F
L
 
L

6jdoA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase with amp-pnp from pasteurella multocida
25% identity, 51% coverage: 150:355/402 of query aligns to 66:250/293 of 6jdoA

query
sites
6jdoA
I
 
I
N
 
N
V
 
H
N
 
G
V
 
V
S
 
L
G
 
T
W
 
A
V
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
L
Y
 
G
S
 
G
F
 
L
S
 
A
Q
 
E
F
 
F
N
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
E
V
 
S
L
 
I
S
 
A
E
 
R
K
 
H
L
 
T
G
 
D
H
 
K
K
 
P
V
 
I
T
 
G
I
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
T
 
V
R
 
Q
A
 
A
M
 
A
T
 
A
Y
 
C
G
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
K
Q
 
D
G
 
E
C
 
D
V
 
K
K
 
N
G
 
A
E
 
V
K
 
Q
D
 
N
I
 
F
I
 
V
F
 
F
V
 
I
N
 
T
V
 
V
S
|
S
W
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
L
D
 
E
G
 
R
K
 
R
V
 
L
Y
 
L
T
 
T
G
 
E
K
 
P
S
 
N
G
 
G
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
L
A
 
A
Y
 
D
D
 
P
N
 
N
E
 
G
I
 
P
I
 
V
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
x
R
K
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
V
E
 
E
T
 
A
E
 
V
A
 
A
S
 
A
G
|
G
S
 
R
A
 
A
L
 
I
H
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
S
S
 
S
G
 
Q
E
 
W
E
 
N
D
 
P
P
 
P
I
 
C
T
 
T
L
x
P
D
 
K
E
 
Q
I
 
A
I
x
F
T
 
E
A
 
L
V
 
F
N
 
R
K
 
K
E
 
N
D
 
D
L
 
E
L
 
K
C
 
A
I
 
T
E
 
A
I
 
L
V
 
I
E
 
Q
E
 
R
I
 
S
G
 
A
Q
 
S
K
 
A
L
 
I
G
 
A
K
 
N
Q
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
V
N
 
I
I
 
G
F
 
L
N
 
D
P
 
V
E
 
Q
L
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
x
S
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
G
Y
 
Y
I
 
L

6jdhA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase from pasteurella multocida
25% identity, 51% coverage: 150:355/402 of query aligns to 66:250/293 of 6jdhA

query
sites
6jdhA
I
 
I
N
 
N
V
 
H
N
 
G
V
 
V
S
 
L
G
 
T
W
 
A
V
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
K
S
 
N
G
 
L
Y
 
G
S
 
G
F
 
L
S
 
A
Q
 
E
F
 
F
N
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
E
V
 
S
L
 
I
S
 
A
E
 
R
K
 
H
L
 
T
G
 
D
H
 
K
K
 
P
V
 
I
T
 
G
I
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
T
 
V
R
 
Q
A
 
A
M
 
A
T
 
A
Y
 
C
G
 
A
E
 
E
Y
 
Y
M
 
K
Q
 
D
G
 
E
C
 
D
V
 
K
K
 
N
G
 
A
E
 
V
K
 
Q
D
 
N
I
 
F
I
 
V
F
 
F
V
 
I
N
 
T
V
 
V
S
 
S
W
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
L
D
 
E
G
 
R
K
 
R
V
 
L
Y
 
L
T
 
T
G
 
E
K
 
P
S
 
N
G
 
G
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
H
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
L
A
 
A
Y
 
D
D
 
P
N
 
N
E
 
G
I
 
P
I
 
V
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
R
K
 
V
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
 
E
T
 
A
E
 
V
A
 
A
S
 
A
G
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
I
H
 
E
R
 
A
I
 
V
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
S
S
 
S
G
 
Q
E
 
W
E
 
N
D
 
P
P
 
P
I
 
C
T
 
T
L
 
P
D
 
K
E
 
Q
I
 
A
I
 
F
T
 
E
A
 
L
V
 
F
N
 
R
K
 
K
E
 
N
D
 
D
L
 
E
L
 
K
C
 
A
I
 
T
E
 
A
I
 
L
V
 
I
E
 
Q
E
 
R
I
 
S
G
 
A
Q
 
S
K
 
A
L
 
I
G
 
A
K
 
N
Q
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
D
L
 
L
I
 
V
N
 
I
I
 
G
F
 
L
N
 
D
P
 
V
E
 
Q
L
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
A
G
 
E
D
 
G
Y
 
Y
I
 
L

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 53% coverage: 180:394/402 of query aligns to 93:301/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
L
 
L
S
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
L
G
 
Q
H
 
R
K
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
D
 
E
N
|
N
D
|
D
T
 
A
R
 
N
A
 
C
M
 
F
T
 
A
Y
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
M
 
W
Q
 
D
G
 
E
C
 
D
V
 
L
K
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
G
V
 
L
N
 
I
V
 
L
S
x
G
W
x
T
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Y
 
H
T
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
A
G
 
N
F
 
I
S
 
A
G
 
G
E
|
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
R
-
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
N
 
N
E
 
A
I
 
P
I
 
I
-
 
F
-
 
P
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
K
K
 
N
K
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
x
D
T
 
N
E
 
Y
A
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
H
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
Y
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
D
S
 
H
I
 
Y
L
 
F
S
 
S
T
 
E
R
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
A
E
 
P
E
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
|
E
I
 
I
I
 
I
T
 
A
A
x
H
V
 
Y
N
 
E
K
 
Q
E
 
G
D
 
E
L
 
R
L
 
R
C
 
A
I
 
V
E
 
Q
I
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
R
I
 
F
G
 
M
Q
 
E
K
 
L
L
 
L
G
 
A
K
 
I
Q
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
N
L
 
I
I
 
F
N
 
T
I
 
C
F
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
-
T
 
N
G
 
F
D
 
E
Y
 
L
I
 
I
T
 
Y
Q
 
Q
P
 
E
I
 
L
K
 
P
T
 
K
A
 
R
V
 
L
R
 
P
K
 
A
Y
 
H
S
 
L
L
 
L
N
 
H
L
 
-
V
 
V
N
 
A
K
 
K
D
 
L
S
 
P
A
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
K
S
 
A
K
 
R
L
 
H
K
 
G
D
 
D
K
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 53% coverage: 180:394/402 of query aligns to 94:302/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
L
 
L
S
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
L
G
 
Q
H
 
R
K
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
N
A
 
C
M
 
F
T
 
A
Y
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
M
 
W
Q
 
D
G
 
E
C
 
D
V
 
L
K
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
G
V
 
L
N
 
I
V
 
L
S
x
G
W
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Y
 
H
T
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
A
G
 
N
F
 
I
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
R
-
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
N
 
N
E
 
A
I
 
P
I
 
I
-
 
F
-
 
P
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
K
K
 
N
K
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
T
 
N
E
 
Y
A
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
H
x
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
Y
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
D
S
 
H
I
 
Y
L
 
F
S
 
S
T
 
E
R
 
K
I
 
L
S
 
S
G
x
A
E
 
P
E
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
|
E
I
 
I
I
 
I
T
 
A
A
x
H
V
 
Y
N
 
E
K
 
Q
E
 
G
D
 
E
L
 
R
L
 
R
C
 
A
I
 
V
E
 
Q
I
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
R
I
 
F
G
 
M
Q
 
E
K
 
L
L
 
L
G
 
A
K
 
I
Q
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
N
L
 
I
I
 
F
N
 
T
I
 
C
F
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
G
|
G
T
x
G
L
 
L
S
 
S
L
 
-
T
x
N
G
 
F
D
 
E
Y
 
L
I
 
I
T
 
Y
Q
 
Q
P
 
E
I
 
L
K
 
P
T
 
K
A
 
R
V
 
L
R
 
P
K
 
A
Y
 
H
S
 
L
L
 
L
N
 
H
L
 
-
V
 
V
N
 
A
K
 
K
D
 
L
S
 
P
A
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
K
S
 
A
K
 
R
L
 
H
K
 
G
D
 
D
K
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7p7wBBB Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
27% identity, 53% coverage: 180:394/402 of query aligns to 96:304/306 of 7p7wBBB

query
sites
7p7wBBB
L
 
L
S
 
E
E
 
E
K
 
R
L
 
L
G
 
Q
H
 
R
K
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
N
A
 
C
M
 
F
T
 
A
Y
 
L
G
 
S
E
 
E
Y
 
A
M
 
W
Q
 
D
G
 
E
C
 
D
V
 
L
K
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
G
V
 
L
N
 
I
V
 
L
S
x
G
W
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
Y
 
H
T
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
A
G
 
N
F
 
I
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
T
N
 
R
-
 
L
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
N
 
N
E
 
A
I
 
P
I
 
I
-
 
F
-
 
P
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
K
K
 
N
K
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
T
 
N
E
 
Y
A
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
R
A
 
G
L
 
F
H
x
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
Y
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
D
S
 
H
I
 
Y
L
 
F
S
 
S
T
 
E
R
 
K
I
 
L
S
 
S
G
 
A
E
 
P
E
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
E
I
 
I
I
 
I
T
 
A
A
 
H
V
 
Y
N
 
E
K
 
Q
E
 
G
D
 
E
L
 
R
L
 
R
C
 
A
I
 
V
E
 
Q
I
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
R
I
 
F
G
 
M
Q
 
E
K
 
L
L
 
L
G
 
A
K
 
I
Q
 
C
I
 
L
A
 
A
G
 
N
L
 
I
I
 
F
N
 
T
I
 
C
F
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
G
|
G
T
x
G
L
 
L
S
 
S
L
 
-
T
x
N
G
 
F
D
 
E
Y
 
L
I
 
I
T
 
Y
Q
 
Q
P
 
E
I
 
L
K
 
P
T
 
K
A
 
R
V
 
L
R
 
P
K
 
A
Y
 
H
S
 
L
L
 
L
N
 
H
L
 
-
V
 
V
N
 
A
K
 
K
D
 
L
S
 
P
A
 
K
I
 
I
I
 
I
T
 
K
S
 
A
K
 
R
L
 
H
K
 
G
D
 
D
K
 
A
A
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
F
L
 
L

P32718 D-allose kinase; Allokinase; EC 2.7.1.55 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
24% identity, 56% coverage: 176:400/402 of query aligns to 98:301/309 of P32718

query
sites
P32718
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
K
L
 
L
S
 
E
E
 
N
K
 
T
L
 
L
G
 
N
H
 
C
K
 
P
V
 
V
T
 
E
I
 
F
D
 
S
N
 
R
D
 
D
T
 
V
R
 
N
A
 
L
M
 
Q
T
 
L
Y
 
S
G
 
W
E
 
D
Y
 
V
M
 
V
Q
 
E
G
 
N
C
 
R
V
 
L
K
 
T
G
 
-
E
 
Q
K
 
Q
D
 
L
I
 
V
I
 
L
F
 
A
V
 
A
N
 
Y
V
 
L
S
 
G
W
 
T
G
 
G
V
 
M
G
 
G
I
x
F
G
 
A
I
 
V
I
 
W
I
 
M
D
 
N
G
 
G
K
 
A
V
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
K
 
A
S
 
H
G
 
G
F
 
V
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
I
N
 
P
A
 
L
Y
 
G
D
 
D
N
 
M
E
 
T
I
 
Q
I
 
H
C
 
C
H
 
A
C
 
C
G
 
G
K
 
N
K
 
P
G
 
G
C
 
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
N
A
 
C
S
 
S
G
 
G
S
 
M
A
 
A
L
 
L
H
 
R
R
 
R
I
 
W
L
 
Y
L
 
E
E
 
Q
R
 
Q
I
 
P
K
 
R
S
 
N
G
 
-
E
 
-
S
 
Y
S
 
P
I
 
L
L
 
R
S
 
D
T
 
L
R
 
F
I
 
V
S
 
H
G
 
A
E
 
E
E
 
N
D
 
A
P
 
P
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
C
 
-
I
 
-
E
 
-
I
 
F
V
 
V
E
 
Q
E
 
S
I
 
L
G
 
L
Q
 
E
K
 
N
L
 
A
G
 
A
K
 
R
Q
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
T
L
 
S
I
 
I
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
D
-
 
M
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
R
-
 
E
-
 
T
T
 
L
L
 
V
S
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
D
 
K
Y
 
Y
I
 
L
T
 
R
Q
 
R
P
 
P
I
 
L
K
 
P
T
 
H
A
 
Q
V
 
V
R
 
V
K
 
R
Y
 
F
S
 
-
L
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
I
T
 
A
S
 
A
K
 
S
L
 
S
K
 
S
D
 
D
K
 
F
A
 
N
G
 
G
I
 
A
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
H
S
 
Q
R
 
R
M
 
F
F
 
L

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
25% identity, 70% coverage: 88:368/402 of query aligns to 6:280/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
I
 
L
G
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
L
K
 
G
R
 
G
F
 
T
A
 
N
V
 
L
N
 
R
I
 
V
G
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
S
F
 
M
K
 
K
G
 
G
D
 
E
M
 
I
V
 
V
E
 
K
L
 
K
K
 
Y
M
 
T
N
 
Q
I
 
F
-
 
N
P
 
P
Y
 
K
K
 
T
F
 
Y
E
 
E
N
 
E
S
 
R
I
 
I
E
 
N
G
 
L
M
 
I
N
 
L
E
 
Q
L
 
M
C
 
C
K
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
E
N
 
A
F
 
A
I
 
A
K
 
E
K
 
A
L
 
V
P
 
K
I
 
L
N
 
N
K
 
C
E
 
-
K
 
R
I
 
I
L
 
L
N
 
G
I
 
V
N
 
G
V
 
I
N
 
S
V
 
T
S
 
G
G
 
G
W
 
R
V
 
V
N
 
N
P
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
Y
 
I
S
 
V
F
 
L
S
 
H
Q
 
S
F
 
T
N
 
K
F
 
L
E
 
I
E
 
Q
R
 
E
-
 
W
-
 
N
-
 
S
-
 
V
P
 
D
L
 
L
A
 
R
D
 
T
V
 
P
L
 
L
S
 
S
E
 
D
K
 
T
L
 
L
G
 
H
H
 
L
K
 
P
V
 
V
T
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
G
R
x
N
A
 
C
M
 
A
T
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
R
M
 
K
Q
 
F
G
 
G
C
 
Q
V
 
G
K
 
K
G
 
G
E
 
L
K
 
E
D
 
N
I
 
F
I
 
V
F
 
T
V
 
L
N
 
I
V
 
T
S
 
G
W
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
x
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
H
D
 
Q
G
 
H
K
 
E
V
 
L
Y
 
I
T
 
H
G
 
G
K
 
S
S
 
S
G
 
F
F
 
C
S
 
A
G
x
A
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
N
 
V
A
 
V
Y
 
S
D
 
L
N
 
N
E
 
G
I
 
P
I
 
D
C
|
C
H
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
K
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
T
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
M
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
R
 
R
I
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
A
I
 
K
K
 
K
S
 
L
G
 
H
E
 
D
S
 
E
S
 
D
I
 
L
L
 
L
S
 
-
T
 
-
R
 
L
I
 
V
S
 
E
G
 
G
E
 
M
E
 
S
D
 
V
P
 
A
I
 
V
T
 
G
L
 
A
D
 
L
E
 
H
I
 
L
I
 
I
T
 
Q
A
 
A
V
 
A
N
 
K
K
 
L
E
 
G
D
 
N
L
 
A
L
 
K
C
 
A
I
 
Q
E
 
S
I
 
I
V
 
L
E
 
R
E
 
T
I
 
A
G
 
G
Q
 
T
K
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
L
Q
 
G
I
 
V
A
 
V
G
 
N
L
 
I
I
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
S
G
 
G
T
 
V
L
 
L
S
 
A
L
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
S
Y
 
H
I
 
Y
T
 
I
Q
 
H
P
 
I
I
 
V
K
 
K
T
 
D
A
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
Q
Y
 
Q
S
 
A
L
 
L

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
27% identity, 55% coverage: 175:395/402 of query aligns to 87:291/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
P
 
P
L
 
I
A
 
R
D
 
R
V
 
I
L
 
L
S
 
E
E
 
E
K
 
A
L
 
T
G
 
G
H
 
R
K
 
P
V
 
V
T
 
F
I
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
R
 
N
A
 
A
M
 
A
T
 
A
Y
 
L
G
 
A
E
 
E
Y
 
H
M
 
H
Q
 
L
G
 
G
C
 
A
V
 
A
K
 
Q
G
 
G
E
 
E
K
 
E
D
 
S
I
 
S
I
 
L
F
 
Y
V
 
L
N
 
T
V
 
V
S
 
S
W
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
V
I
 
L
D
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
Y
 
L
T
 
R
G
 
G
K
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
Q
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
L
N
 
T
A
 
L
Y
 
L
D
 
P
N
 
G
E
 
G
I
 
P
I
 
A
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
L
K
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
A
E
 
L
A
 
A
S
 
A
G
 
G
S
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
E
R
 
R
I
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
D
S
 
A
S
 
T
I
 
Y
L
 
A
S
 
F
T
 
Q
R
 
R
I
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
P
I
 
V
T
 
D
L
 
T
D
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
F
T
 
R
A
 
L
V
 
F
N
 
Q
K
 
A
E
 
G
D
 
D
L
 
P
L
 
K
C
 
A
I
 
E
E
 
R
I
 
L
V
 
V
E
 
L
E
 
Q
I
 
A
G
 
A
Q
 
R
K
 
Y
L
 
V
G
 
G
K
 
I
Q
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
K
I
 
A
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
G
L
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
V
S
 
A
L
 
L
T
 
N
G
 
A
-
 
P
D
 
E
Y
 
G
I
 
Y
T
 
W
Q
 
E
P
 
A
I
 
L
K
 
L
T
 
E
A
 
A
V
 
Y
R
 
R
K
 
R
Y
 
Y
S
 
L
L
 
Q
N
 
G
L
 
W
V
 
-
N
 
-
K
 
E
D
 
A
S
 
P
A
 
P
I
 
L
I
 
R
T
 
R
S
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
G
D
 
A
K
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
A
M
 
L
L
 
T
A
 
A

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
23% identity, 70% coverage: 88:368/402 of query aligns to 410:688/722 of O35826

query
sites
O35826
I
x
L
G
x
A
V
|
V
D
|
D
I
x
L
K
x
G
R
x
G
F
x
T
A
x
N
V
x
L
N
x
R
I
x
V
G
x
A
L
x
I
I
x
V
N
x
S
F
x
M
K
|
K
G
|
G
D
x
E
M
x
I
V
|
V
E
x
K
L
x
K
K
x
Y
M
x
T
N
x
Q
I
x
F
-
x
N
P
|
P
Y
x
K
K
x
T
F
x
Y
E
|
E
N
x
E
S
x
R
I
|
I
E
x
S
G
x
L
M
x
I
N
x
L
E
x
Q
L
x
M
C
|
C
K
x
V
L
x
E
I
x
A
L
x
A
N
x
A
F
x
E
I
x
A
K
x
V
K
|
K
L
|
L
P
x
N
I
x
C
N
 
-
K
 
-
E
 
-
K
x
R
I
|
I
L
|
L
N
x
G
I
x
V
N
x
G
V
x
I
N
x
S
V
x
T
S
x
G
G
|
G
W
x
R
V
|
V
N
|
N
P
|
P
E
x
Q
S
x
E
G
|
G
Y
x
V
S
x
V
F
x
L
S
x
H
Q
x
S
F
x
T
N
x
K
F
x
L
E
x
I
E
x
Q
R
x
E
-
x
W
-
x
N
-
x
S
-
x
V
P
x
D
L
|
L
A
x
R
D
x
T
V
x
P
L
|
L
S
|
S
E
x
D
K
x
T
L
|
L
G
x
H
H
x
L
K
x
P
V
|
V
T
x
W
I
x
V
D
|
D
N
|
N
D
|
D
T
x
G
R
x
N
A
x
C
M
x
A
T
x
A
Y
x
M
G
x
A
E
|
E
Y
x
R
M
x
K
Q
x
F
G
|
G
C
x
Q
V
x
G
K
|
K
G
|
G
E
x
Q
K
x
E
D
x
N
I
x
F
I
x
V
F
x
T
V
x
L
N
x
I
V
x
T
S
x
G
W
x
T
G
|
G
V
x
I
G
|
G
I
x
G
G
|
G
I
|
I
I
|
I
I
x
H
D
x
Q
G
x
H
K
x
E
V
x
L
Y
x
I
T
x
H
G
|
G
K
x
S
S
|
S
G
x
F
F
x
C
S
x
A
G
x
A
E
|
E
F
x
L
G
|
G
H
|
H
V
x
L
N
x
V
A
x
V
Y
x
S
D
x
L
N
x
D
E
x
G
I
x
P
I
x
D
C
|
C
H
x
S
C
|
C
G
|
G
K
x
S
K
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
T
x
A
E
x
Y
A
|
A
S
|
S
G
|
G
S
x
M
A
|
A
L
|
L
H
x
Q
R
|
R
I
 
-
L
x
E
L
x
A
E
x
K
R
x
K
I
x
L
K
x
H
S
x
D
G
x
E
E
x
D
S
x
L
S
x
L
I
x
L
L
x
V
S
x
E
T
x
G
R
x
M
I
x
S
S
x
V
G
x
P
E
x
K
E
x
D
D
x
E
P
x
A
I
x
V
T
x
G
L
x
A
D
x
L
E
x
H
I
x
L
I
|
I
T
x
Q
A
|
A
V
x
A
N
x
K
K
x
L
E
x
G
D
x
N
L
x
V
L
x
K
C
x
A
I
x
Q
E
x
S
I
|
I
V
x
L
E
x
R
E
x
T
I
x
A
G
|
G
Q
x
T
K
x
A
L
|
L
G
|
G
K
x
L
Q
x
G
I
x
V
A
x
V
G
x
N
L
x
I
I
x
L
N
x
H
I
x
T
F
x
M
N
|
N
P
|
P
E
x
S
L
|
L
V
|
V
I
|
I
I
x
L
G
x
S
G
|
G
T
x
V
L
|
L
S
x
A
L
 
-
T
 
-
G
 
-
D
x
S
Y
x
H
I
x
Y
T
x
I
Q
x
H
P
x
I
I
x
V
K
x
R
T
x
D
A
x
V
V
x
I
R
|
R
K
x
Q
Y
x
Q
S
x
A
L
|
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>349961 FitnessBrowser__Btheta:349961
MNQQFLKEIEMGSKNALVKKRIITHYIYNGSSTIPDLSKELDLSVPTVTKFIGEMCEDGY
INDYGKLETSGGRHPNLYGLNPESGYFIGVDIKRFAVNIGLINFKGDMVELKMNIPYKFE
NSIEGMNELCKLILNFIKKLPINKEKILNINVNVSGWVNPESGYSFSQFNFEERPLADVL
SEKLGHKVTIDNDTRAMTYGEYMQGCVKGEKDIIFVNVSWGVGIGIIIDGKVYTGKSGFS
GEFGHVNAYDNEIICHCGKKGCLETEASGSALHRILLERIKSGESSILSTRISGEEDPIT
LDEIITAVNKEDLLCIEIVEEIGQKLGKQIAGLINIFNPELVIIGGTLSLTGDYITQPIK
TAVRKYSLNLVNKDSAIITSKLKDKAGIVGACMLARSRMFES

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory