SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 350266 FitnessBrowser__Btheta:350266 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q5SI56 Serine hydroxymethyltransferase; SHMT; Serine methylase; EC 2.1.2.1 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
56% identity, 96% coverage: 1:411/426 of query aligns to 5:398/407 of Q5SI56

query
sites
Q5SI56
M
 
L
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
E
L
 
A
I
 
L
F
 
F
D
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
A
K
 
L
E
 
E
H
 
E
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
Q
 
E
A
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
Q
 
R
S
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
|
G
A
x
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
V
 
L
L
 
M
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
L
M
 
M
G
 
G
L
 
M
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
K
I
 
L
Y
 
Y
T
 
K
P
 
V
C
 
V
E
 
S
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
R
Q
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
R
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
R
 
A
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
V
I
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
H
|
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
L
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
I
M
 
L
M
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
S
K
 
N
T
 
D
P
 
P
K
 
E
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
L
S
 
G
Q
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
Y
 
F
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
Q
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
K
Y
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
D
S
 
A
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
P
R
 
K
S
 
P
A
 
P
F
 
R
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
T
E
 
P
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
P
E
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
L
I
 
I
E
 
D
T
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
L
N
 
E
V
 
G
E
 
P
N
 
S
E
 
E
E
 
A
V
 
L
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
V
 
V
R
 
R

1kl2A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine and 5-formyl tetrahydrofolate (see paper)
58% identity, 97% coverage: 2:414/426 of query aligns to 6:400/405 of 1kl2A

query
sites
1kl2A
K
 
Q
R
 
Q
D
 
D
D
 
P
L
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
H
 
R
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
H
K
 
A
G
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
S
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
A
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
R
 
V
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
D
M
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
R
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
K
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
A
Q
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
|
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
K
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
Q
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
Q
Y
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
D
S
 
E
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
|
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
P
R
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
G
E
 
L
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
E
 
G
N
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

1kl1A Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with glycine (see paper)
58% identity, 97% coverage: 2:414/426 of query aligns to 6:400/405 of 1kl1A

query
sites
1kl1A
K
 
Q
R
 
Q
D
 
D
D
 
P
L
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
H
 
R
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
H
K
 
A
G
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
S
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
A
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
R
 
V
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
D
M
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
R
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
A
G
x
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
K
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
A
Q
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
K
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
Q
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
Q
Y
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
D
S
 
E
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
P
R
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
G
E
 
L
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
E
 
G
N
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

1kkpA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase complexed with serine (see paper)
58% identity, 97% coverage: 2:414/426 of query aligns to 6:400/405 of 1kkpA

query
sites
1kkpA
K
 
Q
R
 
Q
D
 
D
D
 
P
L
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
H
 
R
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
H
K
 
A
G
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
S
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
A
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
R
 
V
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
D
M
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
R
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
K
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
A
Q
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
K
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
Q
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
Q
Y
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
D
S
 
E
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
P
R
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
G
E
 
L
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
E
 
G
N
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

1kkjA Crystal structure of serine hydroxymethyltransferase from b.Stearothermophilus (see paper)
58% identity, 97% coverage: 2:414/426 of query aligns to 6:400/405 of 1kkjA

query
sites
1kkjA
K
 
Q
R
 
Q
D
 
D
D
 
P
L
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
H
 
R
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
H
K
 
A
G
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
S
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
A
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
R
 
V
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
D
M
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
R
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
K
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
A
Q
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
K
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
Q
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
Q
Y
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
D
S
 
E
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
P
R
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
G
E
 
L
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
E
 
G
N
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

8suiB Joint x-ray/neutron structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (tthshmt) in internal aldimine state with l- ser bound in a pre-michalis complex (see paper)
56% identity, 96% coverage: 2:411/426 of query aligns to 1:393/402 of 8suiB

query
sites
8suiB
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
E
L
 
A
I
 
L
F
 
F
D
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
A
K
 
L
E
 
E
H
 
E
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
Q
 
E
A
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
Q
 
R
S
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
V
 
L
L
 
M
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
L
M
 
M
G
 
G
L
 
M
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
K
I
 
L
Y
 
Y
T
 
K
P
 
V
C
 
V
E
 
S
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
R
Q
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
R
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
R
 
A
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
V
I
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
L
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
K
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
I
M
 
L
M
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
S
K
 
N
T
 
D
P
 
P
K
 
E
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
L
S
 
G
Q
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
Y
 
F
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
Q
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
K
Y
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
D
S
 
A
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
P
R
 
K
S
 
P
A
 
P
F
 
R
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
T
E
 
P
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
P
E
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
L
I
 
I
E
 
D
T
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
L
N
 
E
V
 
G
E
 
P
N
 
S
E
 
E
E
 
A
V
 
L
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
V
 
V
R
 
R

8ssyA Room-temperature x-ray structure of thermus thermophilus serine hydroxymethyltransferase (shmt) bound with d-ser in a pseudo- michaelis complex (see paper)
56% identity, 96% coverage: 2:411/426 of query aligns to 1:393/402 of 8ssyA

query
sites
8ssyA
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
E
L
 
A
I
 
L
F
 
F
D
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
A
K
 
L
E
 
E
H
 
E
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
Q
 
E
A
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
Q
 
R
S
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
V
 
L
L
 
M
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
L
M
 
M
G
 
G
L
 
M
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
K
I
 
L
Y
 
Y
T
 
K
P
 
V
C
 
V
E
 
S
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
R
Q
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
R
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
R
 
A
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
V
I
 
V
D
 
D
M
 
M
A
 
A
H
|
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
L
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
I
M
 
L
M
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
S
K
 
N
T
 
D
P
 
P
K
 
E
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
L
S
 
G
Q
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
Y
 
F
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
Q
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
K
Y
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
D
S
 
A
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
P
R
 
K
S
 
P
A
 
P
F
 
R
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
T
E
 
P
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
P
E
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
L
I
 
I
E
 
D
T
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
L
N
 
E
V
 
G
E
 
P
N
 
S
E
 
E
E
 
A
V
 
L
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
V
 
V
R
 
R

2dkjA Crystal structure of t.Th.Hb8 serine hydroxymethyltransferase
56% identity, 96% coverage: 2:411/426 of query aligns to 1:393/402 of 2dkjA

query
sites
2dkjA
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
E
L
 
A
I
 
L
F
 
F
D
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
A
K
 
L
E
 
E
H
 
E
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
K
Q
 
Q
V
 
V
M
 
R
Q
 
E
A
 
A
M
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
A
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
D
Q
 
R
S
 
V
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
A
W
 
W
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
x
S
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
V
 
L
L
 
M
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
L
M
 
M
G
 
G
L
 
M
N
 
D
L
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
K
I
 
L
Y
 
Y
T
 
K
P
 
V
C
 
V
E
 
S
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
R
Q
 
P
E
 
D
T
 
T
G
 
E
R
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
E
 
R
E
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
F
W
 
W
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
R
 
A
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
 
H
P
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
L
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
T
|
T
T
 
T
H
|
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
I
M
 
L
M
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
S
K
 
N
T
 
D
P
 
P
K
 
E
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
L
S
 
G
Q
 
K
L
 
R
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
F
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
Y
 
F
K
 
K
E
 
E
Y
 
Y
A
 
S
K
 
R
Q
 
L
V
 
V
Q
 
V
K
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
F
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
K
Y
 
-
P
 
-
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
D
S
 
A
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
P
R
 
K
S
 
P
A
 
P
F
 
R
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
T
E
 
P
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
P
E
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
M
 
L
I
 
I
E
 
D
T
 
R
V
 
A
L
 
L
S
 
L
N
 
E
V
 
G
E
 
P
N
 
S
E
 
E
E
 
A
V
 
L
I
 
R
A
 
E
Q
 
E
V
 
V
R
 
R

2vmyA Crystal structure of f351gbsshmt in complex with gly and fthf (see paper)
57% identity, 97% coverage: 2:414/426 of query aligns to 6:400/405 of 2vmyA

query
sites
2vmyA
K
 
Q
R
 
Q
D
 
D
D
 
P
L
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
H
 
R
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
H
K
 
A
G
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
|
Y
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
S
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
|
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
|
G
H
|
H
L
|
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
A
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
R
 
V
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
D
M
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
R
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
K
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
A
Q
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
x
K
A
 
A
V
 
I
F
|
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
|
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
K
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
Q
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
Q
Y
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
D
S
 
E
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
|
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
P
R
 
E
S
|
S
A
x
P
F
x
G
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
G
E
 
L
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
E
 
G
N
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

2vmxA Crystal structure of f351gbsshmt in complex with l-allo-thr (see paper)
57% identity, 97% coverage: 2:414/426 of query aligns to 6:400/405 of 2vmxA

query
sites
2vmxA
K
 
Q
R
 
Q
D
 
D
D
 
P
L
 
Q
I
 
V
F
 
F
D
 
A
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
E
H
 
R
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
L
 
H
K
 
A
G
 
K
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
|
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
R
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
 
I
S
 
V
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
A
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
E
P
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
G
G
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
A
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
P
E
 
E
T
 
T
G
 
H
R
 
V
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
D
M
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
K
A
 
A
L
 
R
R
 
L
E
 
H
K
 
R
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
A
S
|
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
P
R
 
R
E
 
I
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
A
R
 
K
M
 
F
R
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
|
A
H
|
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
P
Y
 
Y
A
 
A
H
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
Q
K
 
E
D
 
Q
F
 
F
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
A
Q
 
K
L
 
Q
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
M
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
K
 
K
E
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
Q
 
V
K
 
D
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
Q
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
L
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
S
 
P
K
 
Q
Y
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
V
L
 
L
V
 
D
S
 
E
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
P
R
 
E
S
 
S
A
 
P
F
 
G
Q
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
L
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
A
 
F
K
 
G
E
 
L
D
 
E
L
 
E
M
 
M
I
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
G
T
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
E
 
G
N
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
V
 
V

3pgyB Serine hydroxymethyltransferase from staphylococcus aureus, s95p mutant.
55% identity, 99% coverage: 2:424/426 of query aligns to 6:404/404 of 3pgyB

query
sites
3pgyB
K
 
K
R
 
Q
D
 
D
D
 
K
L
 
V
I
 
I
F
 
A
D
 
E
I
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
R
E
 
E
H
 
F
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
N
K
 
S
G
 
N
I
 
I
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
E
N
 
N
F
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
E
Q
 
A
V
 
V
M
 
M
Q
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
S
 
S
C
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
K
 
K
Y
|
Y
A
 
A
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
 
E
V
 
F
V
 
V
D
 
D
Q
 
V
S
 
T
E
 
E
Q
 
S
I
 
I
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
E
W
 
H
A
 
V
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
P
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
M
A
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
V
V
 
A
L
 
L
N
 
E
P
 
M
G
 
G
D
 
D
K
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
M
N
 
N
L
 
L
A
 
S
H
 
H
G
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
A
L
 
P
V
 
V
N
 
N
T
 
F
S
 
S
G
 
G
I
 
K
I
 
F
Y
 
Y
T
 
N
P
 
F
C
 
V
E
 
E
Y
 
Y
N
 
G
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
E
R
 
R
V
 
I
D
 
N
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
E
M
 
V
E
 
R
E
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
H
K
 
K
P
 
P
K
 
K
M
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
T
W
 
I
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
R
 
K
M
 
F
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
E
V
 
V
G
 
N
A
 
A
I
 
K
L
 
L
M
 
M
I
 
V
D
|
D
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
P
N
 
N
P
 
P
V
 
V
K
 
E
Y
 
Y
A
 
A
H
 
D
I
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
T
T
|
T
T
 
T
H
 
H
K
|
K
T
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
P
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
M
I
 
I
M
 
L
M
 
C
G
 
K
K
 
E
D
 
E
F
 
Y
P
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
M
 
-
M
 
-
S
 
K
Q
 
K
L
 
D
L
 
I
D
 
D
S
 
K
A
 
T
V
 
I
F
 
F
P
 
P
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
L
Q
 
E
P
 
N
E
 
N
Y
 
F
K
 
K
E
 
T
Y
 
Y
A
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
V
K
 
K
N
 
N
A
 
A
A
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
H
 
H
S
 
L
M
 
V
L
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
V
R
 
K
S
 
G
K
 
S
Y
 
I
P
 
-
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
D
S
|
S
A
 
V
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
K
 
K
N
 
N
M
 
T
V
 
I
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
Q
R
 
E
S