SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 350403 FitnessBrowser__Btheta:350403 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5h8iC Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with n-(dihydroxymethyl)putrescine (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:288/294 of query aligns to 7:291/301 of 5h8iC

query
sites
5h8iC
K
 
R
K
 
K
I
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
F
S
 
A
N
 
C
T
 
T
A
 
D
D
 
D
I
 
V
R
 
S
V
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
T
N
 
T
L
 
A
A
 
E
K
 
R
S
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
H
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
I
I
 
V
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
E
S
 
G
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
T
 
A
E
 
Q
N
 
R
T
 
E
N
 
D
L
 
F
F
 
I
D
 
Q
L
 
R
A
 
A
E
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
K
G
 
D
-
 
H
P
 
P
S
 
T
T
 
I
G
 
M
F
 
R
Y
 
L
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
P
A
 
V
S
 
S
L
 
F
F
 
F
E
 
E
K
 
E
R
 
-
A
 
A
P
 
N
G
 
N
L
 
A
Y
 
H
H
 
Y
N
|
N
T
 
S
A
 
I
V
 
A
V
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
I
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
S
H
 
H
I
 
I
P
|
P
D
 
D
D
 
G
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
Y
 
E
E
|
E
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
T
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
K
P
 
V
I
 
F
Q
 
Q
T
 
T
S
 
K
L
 
Y
G
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
I
C
|
C
W
|
W
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
|
A
I
 
I
G
 
G
W
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
S
D
x
E
T
 
P
D
 
H
D
 
D
E
 
Q
K
 
S
A
 
I
R
 
D
Q
 
S
L
 
R
N
 
D
A
 
H
W
 
W
I
 
K
I
 
R
S
 
V
Q
 
M
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
L
L
 
V
P
 
P
V
 
L
I
 
V
S
 
A
V
 
S
N
 
N
R
 
R
V
 
I
G
 
G
H
 
N
E
 
E
-
 
I
P
 
I
D
 
E
P
 
T
S
 
E
G
 
H
Q
 
G
T
 
K
N
 
S
G
 
E
I
 
I
Q
 
K
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
N
 
N
S
 
S
F
 
F
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
D
N
 
D
D
 
K
H
 
E
P
 
E
E
 
A
N
 
V
M
 
L
V
 
I
V
 
A
E
 
E
I
 
F
D
 
N
M
 
L
E
 
D
R
 
K
S
 
I
E
 
K
N
 
S
V
 
M
R
 
R
R
 
H
W
 
C
W
 
W
P
 
G
F
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
P
D
 
D
E
 
L
Y
 
Y
D
 
K
G
 
V
L
 
L

5h8jB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with cadaverine (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:288/294 of query aligns to 3:287/297 of 5h8jB

query
sites
5h8jB
K
 
R
K
 
K
I
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
F
S
 
A
N
 
C
T
 
T
A
 
D
D
 
D
I
 
V
R
 
S
V
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
T
N
 
T
L
 
A
A
 
E
K
 
R
S
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
H
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
I
I
 
V
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
E
S
 
G
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
T
 
A
E
 
Q
N
 
R
T
 
E
N
 
D
L
 
F
F
 
I
D
 
Q
L
 
R
A
 
A
E
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
K
G
 
D
-
 
H
P
 
P
S
 
T
T
 
I
G
 
M
F
 
R
Y
 
L
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
P
A
 
V
S
 
S
L
 
F
F
 
F
E
 
E
K
 
E
R
 
-
A
 
A
P
 
N
G
 
N
L
 
A
Y
 
H
H
 
Y
N
|
N
T
 
S
A
 
I
V
 
A
V
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
I
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
S
H
 
H
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
G
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
Y
 
E
E
 
E
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
T
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
K
P
 
V
I
 
F
Q
 
Q
T
 
T
S
 
K
L
 
Y
G
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
I
C
|
C
W
 
W
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
|
A
I
 
I
G
 
G
W
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
S
D
x
E
T
 
P
D
 
H
D
 
D
E
 
Q
K
 
S
A
 
I
R
 
D
Q
 
S
L
 
R
N
 
D
A
 
H
W
 
W
I
 
K
I
 
R
S
 
V
Q
 
M
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
L
L
 
V
P
 
P
V
 
L
I
 
V
S
 
A
V
 
S
N
 
N
R
 
R
V
 
I
G
 
G
H
 
N
E
 
E
-
 
I
P
 
I
D
 
E
P
 
T
S
 
E
G
 
H
Q
 
G
T
 
K
N
 
S
G
 
E
I
 
I
Q
 
K
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
N
 
N
S
 
S
F
 
F
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
D
N
 
D
D
 
K
H
 
E
P
 
E
E
 
A
N
 
V
M
 
L
V
 
I
V
 
A
E
 
E
I
 
F
D
 
N
M
 
L
E
 
D
R
 
K
S
 
I
E
 
K
N
 
S
V
 
M
R
 
R
R
 
H
W
 
C
W
 
W
P
 
G
F
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
P
D
 
D
E
 
L
Y
 
Y
D
 
K
G
 
V
L
 
L

5h8lB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) c158s mutant in complex with putrescine (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:288/294 of query aligns to 4:288/298 of 5h8lB

query
sites
5h8lB
K
 
R
K
 
K
I
 
V
K
 
V
V
 
V
G
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
F
S
 
A
N
 
C
T
 
T
A
 
D
D
 
D
I
 
V
R
 
S
V
 
T
N
 
N
L
 
V
M
 
T
N
 
T
L
 
A
A
 
E
K
 
R
S
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
A
C
 
A
A
 
H
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
I
I
 
V
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
E
S
 
G
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
T
 
A
E
 
Q
N
 
R
T
 
E
N
 
D
L
 
F
F
 
I
D
 
Q
L
 
R
A
 
A
E
 
K
P
 
P
I
 
Y
P
 
K
G
 
D
-
 
H
P
 
P
S
 
T
T
 
I
G
 
M
F
 
R
Y
 
L
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
P
A
 
V
S
 
S
L
 
F
F
 
F
E
 
E
K
 
E
R
 
-
A
 
A
P
 
N
G
 
N
L
 
A
Y
 
H
H
 
Y
N
|
N
T
 
S
A
 
I
V
 
A
V
 
I
F
 
I
D
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
I
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
S
H
 
H
I
 
I
P
 
P
D
 
D
D
 
G
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
Y
 
E
E
|
E
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
T
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
T
G
 
G
F
 
F
E
 
K
P
 
V
I
 
F
Q
 
Q
T
 
T
S
 
K
L
 
Y
G
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
V
 
I
C
x
S
W
 
W
D
 
D
Q
 
Q
W
 
W
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
F
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
|
A
I
 
I
G
 
G
W
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
S
D
x
E
T
 
P
D
 
H
D
 
D
E
 
Q
K
 
S
A
 
I
R
 
D
Q
 
S
L
 
R
N
 
D
A
 
H
W
 
W
I
 
K
I
 
R
S
 
V
Q
 
M
R
 
Q
A
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
L
L
 
V
P
 
P
V
 
L
I
 
V
S
 
A
V
 
S
N
 
N
R
 
R
V
 
I
G
 
G
H
 
N
E
 
E
-
 
I
P
 
I
D
 
E
P
 
T
S
 
E
G
 
H
Q
 
G
T
 
K
N
 
S
G
 
E
I
 
I
Q
 
K
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
N
 
N
S
 
S
F
 
F
V
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
D
N
 
D
D
 
K
H
 
E
P
 
E
E
 
A
N
 
V
M
 
L
V
 
I
V
 
A
E
 
E
I
 
F
D
 
N
M
 
L
E
 
D
R
 
K
S
 
I
E
 
K
N
 
S
V
 
M
R
 
R
R
 
H
W
 
C
W
 
W
P
 
G
F
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
P
D
 
D
E
 
L
Y
 
Y
D
 
K
G
 
V
L
 
L

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
34% identity, 96% coverage: 4:285/294 of query aligns to 9:267/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
I
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
-
 
M
Q
 
E
S
 
P
N
 
K
T
 
I
A
 
L
D
 
E
I
 
L
R
 
D
V
 
K
N
 
N
L
 
Y
M
 
S
N
 
K
L
 
A
A
 
E
K
 
K
S
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
E
C
 
A
A
 
S
A
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
D
S
 
T
L
 
G
Y
 
Y
F
 
N
C
 
F
Q
 
E
T
 
S
E
 
R
N
 
E
T
 
-
N
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
Q
P
 
Q
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
P
 
E
S
 
T
T
 
T
G
 
T
F
 
F
Y
 
L
S
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
L
V
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
T
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
S
A
 
G
P
 
N
G
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
H
 
-
N
 
N
T
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
D
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
 
Y
I
 
I
A
 
-
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
x
F
Y
 
Y
Y
 
R
E
|
E
K
 
K
F
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
K
P
 
V
I
 
F
Q
 
D
T
 
I
S
 
G
L
 
F
G
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
I
C
x
A
W
x
F
D
 
D
Q
x
W
W
 
F
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
I
x
L
G
x
V
W
x
M
E
 
P
S
 
Y
S
 
A
D
 
P
T
 
R
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
A
Q
 
M
R
 
P
A
 
I
H
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
N
 
N
G
 
R
L
 
V
P
 
Y
V
 
T
I
 
I
S
 
T
V
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
R
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
F
 
F
W
 
I
G
 
G
N
 
K
S
 
S
F
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
Q
 
K
G
 
A
E
 
E
F
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
E
D
 
T
H
 
E
P
 
E
E
 
E
N
 
I
M
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
N
R
 
L
S
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
N
R
 
D
W
 
M
W
 
N
P
 
D
F
 
I
L
 
F
R
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
E
D
 
E
E
 
Y
Y
 
Y

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
34% identity, 96% coverage: 4:285/294 of query aligns to 3:261/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
I
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
-
 
M
Q
 
E
S
 
P
N
 
K
T
 
I
A
 
L
D
 
E
I
 
L
R
 
D
V
 
K
N
 
N
L
 
Y
M
 
S
N
 
K
L
 
A
A
 
E
K
 
K
S
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
E
C
 
A
A
 
S
A
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
D
S
 
T
L
 
G
Y
 
Y
F
 
N
C
 
F
Q
 
E
T
 
S
E
 
R
N
 
E
T
 
-
N
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
Q
P
 
Q
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
P
 
E
S
 
T
T
 
T
G
 
T
F
 
F
Y
 
L
S
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
L
V
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
T
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
S
A
 
G
P
 
N
G
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
H
 
-
N
 
N
T
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
D
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
 
Y
I
 
I
A
 
-
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
x
F
Y
 
Y
Y
 
R
E
 
E
K
 
K
F
 
V
Y
 
F
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
K
P
 
V
I
 
F
Q
 
D
T
 
I
S
 
G
L
 
F
G
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
I
C
x
A
W
x
F
D
 
D
Q
 
W
W
 
F
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
I
 
L
G
 
V
W
 
M
E
 
P
S
 
Y
S
 
A
D
 
P
T
 
R
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
A
Q
 
M
R
 
P
A
 
I
H
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
N
 
N
G
 
R
L
 
V
P
 
Y
V
 
T
I
 
I
S
 
T
V
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
R
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
F
 
F
W
 
I
G
 
G
N
 
K
S
 
S
F
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
Q
 
K
G
 
A
E
 
E
F
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
S
 
S
N
 
E
D
 
T
H
 
E
P
 
E
E
 
E
N
 
I
M
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
N
R
 
L
S
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
K
R
 
R
-
 
L
-
 
N
R
 
D
W
 
M
W
 
N
P
 
D
F
 
I
L
 
F
R
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
E
D
 
E
E
 
Y
Y
 
Y

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
34% identity, 90% coverage: 20:285/294 of query aligns to 18:259/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
N
 
N
L
 
Y
M
 
S
N
 
K
L
 
A
A
 
E
K
 
K
S
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
E
C
 
A
A
 
S
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
D
S
 
T
L
 
G
Y
 
Y
F
 
N
C
 
F
Q
 
E
T
 
T
E
 
R
N
 
E
T
 
-
N
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
P
 
E
S
 
T
T
 
T
G
 
T
F
 
F
Y
 
L
S
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
D
N
 
T
K
 
G
V
 
V
V
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
T
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
D
A
 
G
P
 
D
G
 
V
L
 
L
Y
 
Y
H
 
-
N
|
N
T
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
D
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
x
F
I
 
I
A
 
-
G
 
G
K
|
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
F
Y
 
Y
Y
 
R
E
|
E
K
 
K
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
R
P
 
V
I
 
F
Q
 
D
T
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
I
C
|
C
W
 
F
D
 
D
Q
 
W
W
 
F
Y
 
F
P
 
P
E
|
E
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
I
x
L
G
 
V
W
x
M
E
 
P
S
 
Y
S
 
A
D
 
P
T
 
R
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
A
Q
 
M
R
 
P
A
 
I
H
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
N
 
N
G
 
K
L
 
V
P
 
Y
V
 
T
I
 
V
S
 
T
V
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
R
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
F
 
F
W
 
I
G
 
G
N
 
K
S
 
S
F
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
Q
 
K
G
 
A
E
 
E
F
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
E
D
 
T
H
 
E
P
 
E
E
 
E
N
 
V
M
 
G
V
 
V
V
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
S
-
 
L
-
 
V
R
 
R
S
 
N
E
 
K
N
 
R
V
 
I
R
 
N
R
 
D
W
 
L
W
 
N
P
 
D
F
 
I
L
 
F
R
 
K
D
 
D
R
|
R
R
 
R
I
x
E
D
 
E
E
 
Y
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
34% identity, 90% coverage: 20:285/294 of query aligns to 18:259/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
N
 
N
L
 
Y
M
 
S
N
 
K
L
 
A
A
 
E
K
 
K
S
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
E
C
 
A
A
 
S
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
F
N
 
D
S
 
T
L
 
G
Y
 
Y
F
 
N
C
 
F
Q
 
E
T
 
T
E
 
R
N
 
E
T
 
-
N
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
P
 
E
S
 
T
T
 
T
G
 
T
F
 
F
Y
 
L
S
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
D
N
 
T
K
 
G
V
 
V
V
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
T
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
D
A
 
G
P
 
D
G
 
V
L
 
L
Y
 
Y
H
 
-
N
|
N
T
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
D
x
G
R
x
P
D
x
R
G
 
G
S
x
F
I
|
I
A
 
-
G
|
G
K
|
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
F
Y
 
Y
Y
 
R
E
|
E
K
 
K
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
R
P
 
V
I
 
F
Q
 
D
T
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
I
C
|
C
W
 
F
D
 
D
Q
 
W
W
 
F
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
I
x
L
G
 
V
W
x
M
E
 
P
S
 
Y
S
 
A
D
 
P
T
 
R
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
A
Q
 
M
R
 
P
A
 
I
H
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
N
 
N
G
 
K
L
 
V
P
 
Y
V
 
T
I
 
V
S
 
T
V
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
R
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
F
 
F
W
 
I
G
 
G
N
 
K
S
 
S
F
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
Q
 
K
G
 
A
E
 
E
F
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
E
D
 
T
H
 
E
P
 
E
E
 
E
N
 
V
M
 
G
V
 
V
V
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
S
-
 
L
-
 
V
R
 
R
S
 
N
E
 
K
N
 
R
V
 
I
R
 
N
R
 
D
W
 
L
W
 
N
P
 
D
F
 
I
L
 
F
R
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
E
D
 
E
E
 
Y
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
34% identity, 90% coverage: 20:285/294 of query aligns to 19:260/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
N
 
N
L
 
Y
M
 
S
N
 
K
L
 
A
A
 
E
K
 
K
S
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
E
C
 
A
A
 
S
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
F
N
 
D
S
 
T
L
 
G
Y
 
Y
F
 
N
C
 
F
Q
 
E
T
 
T
E
 
R
N
 
E
T
 
-
N
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
P
-
 
E
G
 
G
P
 
E
S
 
T
T
 
T
G
 
T
F
 
F
Y
 
L
S
 
M
E
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
D
N
 
T
K
 
G
V
 
V
V
 
Y
L
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
G
L
 
T
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
D
A
 
G
P
 
D
G
 
V
L
 
L
Y
 
Y
H
 
-
N
 
N
T
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
D
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
 
F
I
 
I
A
 
-
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
-
D
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
F
Y
 
Y
Y
 
R
E
 
E
K
 
K
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
R
P
 
V
I
 
F
Q
 
D
T
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
I
C
|
C
W
 
F
D
 
D
Q
 
W
W
 
F
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
A
A
 
N
I
 
L
G
 
V
W
 
M
E
 
P
S
 
Y
S
 
A
D
 
P
T
 
R
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
A
Q
 
M
R
 
P
A
 
I
H
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
N
 
N
G
 
K
L
 
V
P
 
Y
V
 
T
I
 
V
S
 
T
V
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
R
G
 
G
I
 
L
Q
 
K
F
 
F
W
 
I
G
 
G
N
 
K
S
 
S
F
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
Q
 
K
G
 
A
E
 
E
F
 
V
L
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
S
 
S
N
 
E
D
 
T
H
 
E
P
 
E
E
 
E
N
 
V
M
 
G
V
 
V
V
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
Y
-
 
L
-
 
V
R
 
R
S
 
N
E
 
K
N
 
R
V
 
I
R
 
N
R
 
D
W
 
L
W
 
N
P
 
D
F
 
I
L
 
F
R
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
I
 
E
D
 
E
E
 
Y
Y
 
Y

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
29% identity, 97% coverage: 1:285/294 of query aligns to 1:269/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
M
 
M
K
 
T
K
 
S
I
 
F
K
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
L
S
 
Q
N
 
I
T
 
S
A
 
S
D
 
I
I
 
K
R
 
S
V
 
D
N
 
N
L
 
V
M
 
T
N
 
R
L
 
A
A
 
C
K
 
S
S
 
F
I
 
I
E
 
R
A
 
E
C
 
A
A
 
A
A
 
T
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
I
 
V
V
 
S
L
 
L
Q
 
P
E
|
E
L
 
C
H
 
F
N
 
N
S
 
S
L
 
P
Y
 
Y
F
 
-
C
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
N
 
G
T
 
A
N
 
K
L
 
Y
F
 
F
-
 
P
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
E
S
 
S
T
 
T
G
 
Q
F
 
K
Y
 
L
S
 
S
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
E
N
 
C
K
 
S
V
 
I
V
 
Y
L
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
G
L
 
S
F
 
I
E
 
P
K
 
E
R
 
E
A
 
D
P
 
A
G
 
G
L
 
K
Y
 
L
H
 
Y
N
 
N
T
 
T
A
 
C
V
 
A
V
 
V
F
 
F
D
 
G
R
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
T
I
 
L
A
 
L
G
 
A
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
-
 
L
-
x
F
-
x
D
-
x
I
-
x
D
I
x
V
P
|
P
D
x
G
D
x
K
P
x
I
A
x
T
Y
x
F
Y
x
Q
E
|
E
K
 
S
F
 
K
Y
 
T
F
 
L
T
 
S
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
-
G
 
S
F
 
F
E
 
S
P
 
T
I
 
F
Q
 
D
T
 
T
S
 
P
L
 
Y
G
 
C
K
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
G
V
 
I
C
|
C
W
 
Y
D
 
D
Q
 
M
W
 
R
Y
 
F
P
 
A
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
L
 
I
M
 
Y
A
 
A
L
 
Q
K
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
T
 
G
A
 
A
I
 
F
G
 
N
W
 
L
E
 
T
S
 
T
S
 
G
D
 
P
T
 
A
D
 
H
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
W
 
W
I
 
E
I
 
L
S
 
L
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
H
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
D
N
 
N
G
 
Q
L
 
V
P
 
Y
V
 
V
I
 
A
S
 
T
V
 
A
N
 
S
R
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
-
P
 
P
D
 
A
P
 
R
S
 
D
G
 
D
Q
 
K
T
 
A
N
 
S
G
 
Y
I
 
V
Q
 
A
F
 
-
W
 
W
G
 
G
N
 
H
S
 
S
F
 
T
V
 
V
A
 
V
G
 
N
P
 
P
Q
 
W
G
 
G
E
 
E
F
x
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
N
 
T
D
 
E
H
 
-
P
 
-
E
 
E
N
 
A
M
 
I
V
 
V
V
 
Y
-
 
S
E
 
D
I
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
K
R
 
K
S
 
L
E
 
A
N
 
E
V
 
I
R
 
R
R
 
Q
W
 
Q
W
 
I
P
 
P
F
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
Q
R
 
K
R
 
R
I
 
S
D
 
D
E
 
L
Y
 
Y

Q9UBR1 Beta-ureidopropionase; BUP-1; Beta-alanine synthase; N-carbamoyl-beta-alanine amidohydrolase; EC 3.5.1.6 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
28% identity, 88% coverage: 28:285/294 of query aligns to 104:365/384 of Q9UBR1

query
sites
Q9UBR1
I
 
V
E
 
E
A
 
V
C
 
A
A
 
A
A
 
M
H
 
C
G
 
G
A
 
V
Q
 
N
L
 
I
I
 
I
V
 
C
L
 
F
Q
 
Q
E
 
E
L
 
A
H
 
W
N
 
T
S
 
M
L
 
P
Y
 
F
-
 
A
F
 
F
C
 
C
Q
 
T
T
x
R
E
 
E
N
x
K
T
 
L
N
 
P
L
 
W
F
 
T
D
 
E
L
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
S
I
 
A
P
 
E
-
 
D
G
 
G
P
 
P
S
 
T
T
 
T
G
 
R
F
 
F
Y
 
C
S
 
Q
E
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
N
N
 
H
K
 
D
V
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
S
S
 
P
L
 
I
F
 
L
E
 
E
K
 
R
R
 
D
A
 
S
P
 
E
-
 
H
-
 
G
G
 
D
L
 
V
Y
 
L
H
 
W
N
 
N
T
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
D
 
S
R
 
N
D
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
V
A
 
L
G
 
G
K
 
K
Y
 
T
R
 
R
K
 
K
M
 
N
H
 
H
I
 
I
P
 
P
D
 
R
D
 
V
P
 
G
A
 
D
Y
 
F
Y
 
N
E
 
E
K
x
S
F
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
M
P
 
E
G
 
G
D
 
N
I
 
L
G
 
G
F
 
H
E
 
P
P
 
V
I
 
F
Q
 
Q
T
 
T
S
 
Q
L
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
N
V
 
I
C
|
C
W
 
Y
D
x
G
Q
x
R
W
 
H
Y
 
H
P
 
P
E
 
L
A
 
N
A
 
W
R
 
L
L
 
M
M
 
Y
A
 
S
L
 
I
K
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
F
Y
 
N
P
 
P
T
 
S
A
 
A
I
 
T
G
 
I
W
 
G
E
 
A
S
 
L
S
|
S
D
 
E
T
 
S
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
L
W
 
W
I
 
P
I
 
I
S
x
E
Q
 
A
R
 
R
A
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
G
 
H
L
 
C
P
 
F
V
 
T
I
 
C
S
 
A
V
x
I
N
 
N
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
T
E
 
E
P
 
H
D
 
F
P
 
P
S
 
N
G
 
E
Q
 
F
T
|
T
N
 
S
G
 
G
I
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
Q
-
 
D
-
 
F
-
 
G
Q
 
Y
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
N
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
A
P
 
P
Q
 
D
G
 
S
E
 
S
F
x
R
L
 
T
A
 
P
Q
 
G
A
 
L
S
 
S
N
 
R
D
 
S
H
 
R
P
 
D
E
 
G
N
 
L
M
 
L
V
 
V
V
 
A
E
 
K
I
 
L
D
 
D
M
 
L
E
 
N
R
 
L
S
 
C
E
 
Q
N
 
Q
V
 
V
R
 
N
R
 
D
W
 
V
W
 
W
P
 
N
F
 
F
L
 
K
R
 
M
D
x
T
R
 
G
R
 
R
I
 
Y
D
 
E
E
 
M
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q964D8 Beta-ureidopropionase; Beta-alanine synthase; N-carbamoyl-beta-alanine amidohydrolase; EC 3.5.1.6 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
27% identity, 99% coverage: 4:294/294 of query aligns to 75:377/391 of Q964D8

query
sites
Q964D8
I
 
V
K
 
R
V
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
N
S
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
E
N
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
P
I
 
I
R
 
Q
V
 
D
N
 
Q
L
 
Y
M
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
A
N
 
K
L
 
I
A
 
E
K
 
K
S
 
M
I
 
I
E
 
D
A
 
A
C
 
A
A
 
G
A
 
A
H
 
M
G
 
G
A
 
V
Q
 
N
L
 
V
I
 
L
V
 
C
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
L
 
T
-
 
W
H
 
H
N
 
M
S
 
P
L
 
F
Y
 
A
F
 
F
C
 
C
Q
 
T
T
 
R
E
 
E
N
 
K
T
 
Y
N
 
P
L
 
W
F
 
V
D
 
E
L
 
F
A
 
A
E
 
E
P
 
S
I
 
A
P
 
S
-
 
T
G
 
G
P
 
Q
S
 
S
T
 
I
G
 
K
F
 
F
Y
 
I
S
 
Q
E
 
R
L
 
M
A
 
A
A
 
R
A
 
K
N
 
Y
K
 
N
V
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
I
A
 
S
S
 
P
L
 
M
F
 
L
E
 
E
K
 
R
R
 
D
-
 
D
-
 
V
A
 
H
P
 
A
G
 
S
L
 
T
Y
 
I
H
 
H
N
 
N
T
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
V
D
 
G
R
 
N
D
 
N
G
 
G
S
 
N
I
 
I
A
 
I
G
 
G
K
 
K
Y
 
S
R
 
R
K
 
K
M
 
N
H
 
H
I
 
I
P
 
P
D
 
R
D
 
T
P
 
G
A
 
D
Y
 
F
Y
 
N
E
 
E
K
 
S
F
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
M
P
 
E
G
 
S
D
 
T
I
 
L
G
 
G
F
 
H
E
 
P
P
 
V
I
 
F
Q
 
E
T
 
T
S
 
I
L
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
I
G
 
A
V
 
I
L
 
N
V
 
I
C
 
C
W
 
Y
D
 
G
Q
 
R
W
 
H
Y
 
H
P
 
N
E
 
L
A
 
N
A
 
W
R
 
L
L
 
A
M
 
Y
A
 
G
L
 
L
K
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
V
I
 
F
Y
 
N
P
 
P
T
 
S
A
 
A
I
 
T
G
 
V
W
 
G
E
 
E
S
 
L
S
 
S
D
 
E
T
 
P
D
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
M
W
 
W
I
 
G
I
 
V
S
 
E
Q
 
A
R
 
R
A
 
N
H
 
A
A
 
A
V
 
M
A
 
T
N
 
N
G
 
N
L
 
Y
P
 
F
V
 
V
I
 
G
S
 
S
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
V
G
 
G
H
 
T
E
 
E
P
 
H
D
 
F
P
 
P
S
 
N
G
 
E
Q
 
F
T
 
T
N
 
S
G
 
G
I
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
D
-
 
F
-
 
G
Q
 
H
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
N
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
F
A
 
S
G
 
S
P
 
P
Q
 
D
G
 
N
E
 
C
F
 
C
L
 
T
A
 
P
Q
 
S
A
 
L
S
 
S
N
 
R
D
 
V
H
 
S
P
 
D
E
 
G
N
 
L
M
 
N
V
 
I
V
 
S
E
 
E
I
 
V
D
 
D
M
 
L
E
 
N
R
 
L
S
 
C
E
 
Q
N
 
Q
V
 
V
R
 
K
R
 
D
W
 
K
W
 
W
P
 
N
F
 
F
L
 
Q
R
 
M
D
 
T
R
 
A
R
 
R
I
 
Y
D
 
E
E
 
L
Y
 
Y
D
 
A
G
 
K
L
 
F
T
 
L
K
 
T
R
 
D
F
 
Y
L
 
I
D
 
N

Sites not aligning to the query:

Q44185 N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase; D-N-alpha-carbamilase; EC 3.5.1.77 from Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens) (Agrobacterium radiobacter) (see paper)
28% identity, 89% coverage: 32:292/294 of query aligns to 36:304/304 of Q44185

query
sites
Q44185
A
 
A
A
 
S
H
 
R
G
 
G
A
 
V
Q
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
A
N
 
L
S
 
T
L
 
T
Y
 
F
F
 
F
C
 
P
Q
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
E
T
 
A
N
 
E
L
 
L
F
 
D
D
 
S
L
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
T
-
 
E
I
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
V
G
 
R
F
 
P
Y
 
L
S
 
F
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
I
V
 
G
L
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
G
V
 
Y
A
 
A
S
 
E
L
 
L
F
 
V
E
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
R
Y
 
R
H
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
S
V
 
I
V
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
A
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
M
 
I
H
|
H
I
 
L
P
 
P
D
 
G
D
 
H
P
 
K
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
x
H
Y
 
L
E
 
E
K
 
K
F
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
P
P
 
V
I
 
Y
Q
 
D
T
 
V
S
 
D
L
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
M
L
 
F
V
 
I
C
 
C
W
 
N
D
 
D
Q
 
R
W
 
R
Y
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
T
A
 
W
R
 
R
L
 
V
M
 
M
A
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
C
G
 
G
W
 
G
E
 
Y
S
 
N
S
 
T
D
 
P
T
 
T
D
 
H
D
 
N
E
 
P
K
 
P
A
 
V
R
 
P
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
L
 
L
N
 
T
A
 
S
W
 
F
-
x
H
-
 
H
I
 
L
I
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
A
P
 
W
V
 
S
I
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
G
H
 
M
E
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
E
G
 
G
I
 
C
Q
 
M
F
 
L
W
 
L
G
 
G
N
 
H
S
 
S
F
 
C
V
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
N
 
T
D
 
L
H
 
E
P
 
D
E
 
E
N
 
V
M
 
I
V
 
T
V
 
A
E
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
L
E
 
D
R
 
R
S
 
C
E
 
R
N
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
H
W
 
I
P
 
F
F
 
N
L
 
F
R
 
K
D
 
A
R
 
H
R
 
R
I
 
Q
D
 
P
E
 
Q
Y
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
L
T
 
I
K
 
A
R
 
E
F
 
F

8hpcC Crystal structure of c171a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-hydroxyphenylglycine
27% identity, 91% coverage: 21:288/294 of query aligns to 24:299/303 of 8hpcC

query
sites
8hpcC
L
 
V
M
 
V
N
 
R
L
 
L
A
 
L
K
 
D
S
 
M
I
 
L
E
 
T
A
 
K
C
 
A
A
 
A
A
 
S
H
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
A
N
 
L
S
 
T
L
 
T
Y
 
F
F
 
F
C
 
P
Q
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
E
T
 
A
N
 
E
L
 
L
F
 
D
D
 
S
L
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
T
-
 
E
I
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
V
G
 
R
F
 
P
Y
 
L
S
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
I
V
 
G
L
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
G
V
 
Y
A
 
A
S
 
E
L
 
L
F
 
V
E
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
R
Y
 
R
H
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
S
V
 
I
V
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
A
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
|
P
D
 
G
D
 
H
P
 
K
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
x
H
Y
 
L
E
|
E
K
 
K
F
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
P
P
 
V
I
 
Y
Q
 
D
T
 
V
S
 
D
L
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
M
L
 
F
V
 
I
C
x
A
W
x
N
D
 
D
Q
 
R
W
x
R
Y
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
W
R
 
R
L
 
V
M
 
M
A
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
C
G
 
G
W
 
G
E
 
Y
S
x
N
S
 
T
D
 
P
T
 
T
D
 
H
D
x
N
E
 
P
K
 
P
A
 
V
R
 
P
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
L
 
L
N
 
T
A
 
S
W
 
F
-
 
H
-
 
H
I
 
L
I
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
A
P
 
W
V
 
S
I
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
G
H
 
M
E
 
E
P
 
E
D
 
N
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
C
Q
 
M
F
 
L
W
 
L
G
 
G
N
 
H
S
 
S
F
 
C
V
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
N
 
T
D
 
L
H
 
E
P
 
D
E
 
E
N
 
V
M
 
I
V
 
T
V
 
A
E
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
L
E
 
D
R
 
R
S
 
C
E
 
R
N
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
H
W
 
I
P
 
F
F
 
N
L
 
F
R
 
K
D
 
Q
R
 
H
R
 
R
I
 
Q
D
 
P
E
 
Q
Y
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
L

1uf8A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-phenylalanine
27% identity, 91% coverage: 21:288/294 of query aligns to 24:299/303 of 1uf8A

query
sites
1uf8A
L
 
V
M
 
V
N
 
R
L
 
L
A
 
L
K
 
D
S
 
M
I
 
L
E
 
T
A
 
K
C
 
A
A
 
A
A
 
S
H
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
A
N
 
L
S
 
T
L
 
T
Y
 
F
F
 
F
C
 
P
Q
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
E
T
 
A
N
 
E
L
 
L
F
 
D
D
 
S
L
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
T
-
 
E
I
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
V
G
 
R
F
 
P
Y
 
L
S
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
I
V
 
G
L
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
G
V
 
Y
A
 
A
S
 
E
L
 
L
F
 
V
E
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
R
Y
 
R
H
 
F
N
|
N
T
 
T
A
 
S
V
 
I
V
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
A
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
 
P
D
 
G
D
 
H
P
 
K
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
x
H
Y
 
L
E
|
E
K
 
K
F
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
P
P
 
V
I
 
Y
Q
 
D
T
 
V
S
 
D
L
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
M
L
 
F
V
 
I
C
x
A
W
x
N
D
 
D
Q
x
R
W
x
R
Y
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
W
R
 
R
L
 
V
M
 
M
A
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
C
G
 
G
W
 
G
E
 
Y
S
x
N
S
 
T
D
 
P
T
 
T
D
 
H
D
 
N
E
 
P
K
 
P
A
 
V
R
 
P
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
L
 
L
N
 
T
A
 
S
W
 
F
-
 
H
-
 
H
I
 
L
I
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
A
P
 
W
V
 
S
I
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
R
 
K
V
 
A
G
 
G
H
 
M
E
 
E
P
 
E
D
 
N
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
C
Q
 
M
F
 
L
W
 
L
G
 
G
N
 
H
S
 
S
F
 
C
V
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
N
 
T
D
 
L
H
 
E
P
 
D
E
 
E
N
 
V
M
 
I
V
 
T
V
 
A
E
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
L
E
 
D
R
 
R
S
 
C
E
 
R
N
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
H
W
 
I
P
 
F
F
 
N
L
 
F
R
 
K
D
 
Q
R
 
H
R
 
R
I
 
Q
D
 
P
E
 
Q
Y
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
L

1uf7A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-valine
27% identity, 91% coverage: 21:288/294 of query aligns to 24:299/303 of 1uf7A

query
sites
1uf7A
L
 
V
M
 
V
N
 
R
L
 
L
A
 
L
K
 
D
S
 
M
I
 
L
E
 
T
A
 
K
C
 
A
A
 
A
A
 
S
H
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
A
N
 
L
S
 
T
L
 
T
Y
 
F
F
 
F
C
 
P
Q
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
E
T
 
A
N
 
E
L
 
L
F
 
D
D
 
S
L
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
T
-
 
E
I
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
V
G
 
R
F
 
P
Y
 
L
S
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
I
V
 
G
L
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
G
V
 
Y
A
 
A
S
 
E
L
 
L
F
 
V
E
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
R
Y
 
R
H
 
F
N
|
N
T
 
T
A
 
S
V
 
I
V
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
A
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
|
P
D
 
G
D
 
H
P
 
K
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
 
H
Y
 
L
E
|
E
K
 
K
F
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
P
P
 
V
I
 
Y
Q
 
D
T
 
V
S
 
D
L
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
M
L
 
F
V
 
I
C
x
A
W
x
N
D
 
D
Q
 
R
W
x
R
Y
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
W
R
 
R
L
 
V
M
 
M
A
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
C
G
 
G
W
 
G
E
 
Y
S
x
N
S
 
T
D
 
P
T
 
T
D
 
H
D
 
N
E
 
P
K
 
P
A
 
V
R
 
P
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
L
 
L
N
 
T
A
 
S
W
 
F
-
 
H
-
 
H
I
 
L
I
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
A
P
 
W
V
 
S
I
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
R
 
K
V
 
A
G
 
G
H
 
M
E
 
E
P
 
E
D
 
N
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
C
Q
 
M
F
 
L
W
 
L
G
 
G
N
 
H
S
 
S
F
 
C
V
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
N
 
T
D
 
L
H
 
E
P
 
D
E
 
E
N
 
V
M
 
I
V
 
T
V
 
A
E
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
L
E
 
D
R
 
R
S
 
C
E
 
R
N
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
H
W
 
I
P
 
F
F
 
N
L
 
F
R
 
K
D
 
Q
R
 
H
R
 
R
I
 
Q
D
 
P
E
 
Q
Y
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
L

1uf5A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-methionine
27% identity, 91% coverage: 21:288/294 of query aligns to 24:299/303 of 1uf5A

query
sites
1uf5A
L
 
V
M
 
V
N
 
R
L
 
L
A
 
L
K
 
D
S
 
M
I
 
L
E
 
T
A
 
K
C
 
A
A
 
A
A
 
S
H
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
L
 
F
I
 
I
V
 
V
L
 
F
Q
 
P
E
|
E
L
 
L
H
 
A
N
 
L
S
 
T
L
 
T
Y
 
F
F
 
F
C
 
P
Q
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
E
T
 
A
N
 
E
L
 
L
F
 
D
D
 
S
L
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
T
-
 
E
I
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
V
T
 
V
G
 
R
F
 
P
Y
 
L
S
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
N
 
L
K
 
G
V
 
I
V
 
G
L
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
G
V
 
Y
A
 
A
S
 
E
L
 
L
F
 
V
E
 
V
K
 
E
R
 
G
A
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
R
Y
 
R
H
 
F
N
|
N
T
 
T
A
 
S
V
 
I
V
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
A
 
V
G
 
G
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
M
 
I
H
 
H
I
 
L
P
|
P
D
 
G
D
 
H
P
 
K
A
 
E
Y
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
 
H
Y
 
L
E
|
E
K
 
K
F
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
P
P
 
V
I
 
Y
Q
 
D
T
 
V
S
 
D
L
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
M
L
 
F
V
 
I
C
x
A
W
x
N
D
 
D
Q
 
R
W
x
R
Y
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
W
R
 
R
L
 
V
M
 
M
A
 
G
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
C
G
 
G
W
 
G
E
 
Y
S
x
N
S
x
T
D
 
P
T
 
T
D
 
H
D
 
N
E
 
P
K
 
P
A
 
V
R
 
P
Q
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
H
L
 
L
N
 
T
A
 
S
W
 
F
-
 
H
-
 
H
I
 
L
I
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
A
 
A
H
 
G
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
A
P
 
W
V
 
S
I
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
R
 
K
V
 
A
G
 
G
H
 
M
E
 
E
P
 
E
D
 
N
P
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
C
Q
 
M
F
 
L
W
 
L
G
 
G
N
 
H
S
 
S
F
 
C
V
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
S
 
T
N
 
T
D
 
L
H
 
E
P
 
D
E
 
E
N
 
V
M
 
I
V
 
T
V
 
A
E
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
L
E
 
D
R
 
R
S
 
C
E
 
R
N
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
H
W
 
I
P
 
F
F
 
N
L
 
F
R
 
K
D
 
Q
R
 
H
R
 
R
I
 
Q
D
 
P
E
 
Q
Y
 
H
D
 
Y
G
 
G
L
 
L