SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 350423 FitnessBrowser__Btheta:350423 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
45% identity, 97% coverage: 6:292/297 of query aligns to 2:290/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
L
 
F
K
 
R
G
 
G
M
 
V
G
 
G
V
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
K
E
 
N
D
 
G
E
 
E
S
 
-
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
Y
M
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
R
Y
 
Y
L
 
Q
L
 
L
Q
 
E
N
 
N
N
 
G
A
 
V
D
 
N
F
 
A
L
 
L
C
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
V
T
 
N
E
 
E
E
 
D
E
 
E
K
 
R
K
 
E
T
 
K
I
 
L
K
 
V
K
 
S
M
 
R
V
 
T
I
 
L
D
 
E
R
 
I
V
 
V
N
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
T
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
E
A
 
K
I
 
T
V
 
L
E
 
K
T
 
L
L
 
V
K
 
K
N
 
Q
D
 
A
D
 
E
F
 
K
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
N
A
 
G
I
 
V
L
 
L
S
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
Y
I
 
I
S
 
S
E
 
E
A
 
R
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
N
M
 
V
T
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
A
L
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
A
N
 
D
F
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
S
 
N
G
 
P
N
x
D
I
|
I
T
x
D
Q
 
Q
M
 
I
D
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
V
D
 
S
I
 
L
I
 
T
K
 
K
N
 
Q
K
 
A
P
 
R
D
 
S
N
 
D
F
 
F
N
 
M
V
 
V
I
 
W
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
G
 
D
I
 
R
T
 
T
F
 
F
P
 
Y
L
 
L
I
 
L
T
 
C
L
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
S
N
 
N
A
 
V
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
Q
F
 
M
S
 
V
R
 
E
M
 
L
T
 
C
R
 
A
L
 
E
A
 
Y
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
D
 
N
F
 
L
A
 
E
N
 
K
A
 
S
L
 
R
T
 
E
I
 
V
H
 
H
H
 
R
R
 
K
F
 
L
T
 
R
E
 
P
L
 
L
F
 
M
D
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
E
G
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
A
M
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
L
M
 
M
G
 
G
M
 
F
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
E
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
A
R
 
S
I
 
E
T
 
K
T
 
T
F
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
V
L
 
L
N
 
K
E
 
E

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
45% identity, 97% coverage: 6:292/297 of query aligns to 3:291/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
L
 
F
K
 
R
G
 
G
M
 
V
G
 
G
V
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
K
E
 
N
D
 
G
E
 
E
S
 
-
V
 
L
D
 
D
Y
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
Y
M
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
R
Y
 
Y
L
 
Q
L
 
L
Q
 
E
N
 
N
N
 
G
A
 
V
D
 
N
F
 
A
L
 
L
C
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
V
T
 
N
E
 
E
E
 
D
E
 
E
K
 
R
K
 
E
T
 
K
I
 
L
K
 
V
K
 
S
M
 
R
V
 
T
I
 
L
D
x
E
R
 
I
V
 
V
N
x
D
G
 
G
R
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
T
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
E
A
 
K
I
 
T
V
 
L
E
 
K
T
 
L
L
 
V
K
 
K
N
 
Q
D
 
A
D
 
E
F
 
K
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
N
A
 
G
I
 
V
L
 
L
S
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
Y
I
 
I
S
 
S
E
 
E
A
 
R
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
N
M
 
V
T
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
A
L
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
A
R
 
A
N
 
D
F
 
L
S
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
S
 
N
G
 
P
N
 
D
I
 
I
T
 
D
Q
 
Q
M
 
I
D
 
D
-
 
R
-
 
T
-
 
V
D
 
S
I
 
L
I
 
T
K
 
K
N
 
Q
K
 
A
P
 
R
D
 
S
N
 
D
F
 
F
N
 
M
V
 
V
I
 
W
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
G
 
D
I
 
R
T
 
T
F
 
F
P
 
Y
L
 
L
I
 
L
T
 
C
L
 
A
G
 
G
A
 
G
V
 
D
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
S
N
 
N
A
 
V
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
Q
F
 
M
S
 
V
R
 
E
M
 
L
T
 
C
R
 
A
L
 
E
A
 
Y
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
D
 
N
F
 
L
A
 
E
N
 
K
A
 
S
L
 
R
T
 
E
I
 
V
H
 
H
H
 
R
R
 
K
F
 
L
T
 
R
E
 
P
L
 
L
F
 
M
D
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
E
G
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
A
M
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
L
M
 
M
G
 
G
M
 
F
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
E
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
A
R
 
S
I
 
E
T
 
K
T
 
T
F
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
V
L
 
L
N
 
K
E
 
E

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
41% identity, 98% coverage: 6:295/297 of query aligns to 2:290/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
M
 
S
G
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
W
L
 
H
L
 
I
Q
 
E
N
 
Q
N
 
G
A
 
T
D
 
N
F
 
S
L
 
I
C
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
A
P
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
I
K
 
K
M
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
T
K
 
K
N
 
A
D
 
A
D
 
K
F
 
D
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
L
 
L
S
 
L
V
 
V
V
x
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
|
N
V
|
V
P
|
P
G
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
T
 
S
A
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
P
Q
 
R
M
 
G
D
 
K
D
 
A
I
 
L
I
 
I
K
 
D
N
 
A
K
 
L
P
 
N
D
 
G
N
 
K
F
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
L
 
L
I
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
I
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
E
A
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
K
T
 
T
I
 
L
H
 
N
H
 
N
R
 
K
F
 
I
T
 
A
E
 
N
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
L
N
 
H
A
 
E
M
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
D
N
 
T
K
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
L
R
 
A
I
 
E
T
 
Q
T
 
Y
F
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
D
L
 
A
N
 
G
I
 
I

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
41% identity, 98% coverage: 6:295/297 of query aligns to 2:290/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
M
 
S
G
 
I
V
 
V
A
|
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
W
L
 
H
L
 
I
Q
 
E
N
 
Q
N
 
G
A
 
T
D
 
N
F
 
S
L
 
I
C
 
V
V
 
A
L
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
A
 
G
E
 
E
T
 
A
P
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
I
K
 
K
M
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
T
K
 
K
N
 
A
D
 
A
D
 
K
F
 
D
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
L
|
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
T
 
S
A
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
P
Q
 
R
M
 
G
D
 
K
D
 
A
I
 
L
I
 
I
K
 
D
N
 
A
K
 
L
P
 
N
D
 
G
N
 
K
F
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
L
 
L
I
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
I
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
E
A
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
K
T
 
T
I
 
L
H
 
N
H
 
N
R
 
K
F
 
I
T
 
A
E
 
N
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
L
N
 
H
A
 
E
M
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
D
N
 
T
K
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
L
R
 
A
I
 
E
T
 
Q
T
 
Y
F
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
D
L
 
A
N
 
G
I
 
I

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
41% identity, 98% coverage: 6:295/297 of query aligns to 2:290/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
M
 
S
G
 
I
V
 
V
A
|
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
W
L
 
H
L
 
I
Q
 
E
N
 
Q
N
 
G
A
 
T
D
 
N
F
 
S
L
 
I
C
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
G
E
 
E
T
 
A
P
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
I
K
 
K
M
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
T
K
 
K
N
 
A
D
 
A
D
 
K
F
 
D
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
L
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
T
 
S
A
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
P
Q
 
R
M
 
G
D
 
K
D
 
A
I
 
L
I
 
I
K
 
D
N
 
A
K
 
L
P
 
N
D
 
G
N
 
K
F
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
L
 
L
I
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
I
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
E
A
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
K
T
 
T
I
 
L
H
 
N
H
 
N
R
 
K
F
 
I
T
 
A
E
 
N
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
L
N
 
H
A
 
E
M
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
D
N
 
T
K
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
L
R
 
A
I
 
E
T
 
Q
T
 
Y
F
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
D
L
 
A
N
 
G
I
 
I

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
41% identity, 98% coverage: 6:295/297 of query aligns to 2:290/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
M
 
S
G
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
W
L
 
H
L
 
I
Q
 
E
N
 
Q
N
 
G
A
 
T
D
 
N
F
 
S
L
 
I
C
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
A
P
x
S
T
 
T
L
|
L
T
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
K
x
H
K
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
I
K
 
K
M
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
T
K
 
K
N
 
A
D
 
A
D
 
K
F
 
D
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
L
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
T
 
S
A
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
P
Q
 
R
M
 
G
D
 
K
D
 
A
I
 
L
I
 
I
K
 
D
N
 
A
K
 
L
P
 
N
D
 
G
N
 
K
F
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
L
 
L
I
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
I
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
E
A
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
K
T
 
T
I
 
L
H
 
N
H
 
N
R
 
K
F
 
I
T
 
A
E
 
N
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
L
N
 
H
A
 
E
M
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
D
N
 
T
K
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
L
R
 
A
I
 
E
T
 
Q
T
 
Y
F
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
D
L
 
A
N
 
G
I
 
I

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
41% identity, 98% coverage: 6:295/297 of query aligns to 2:290/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
M
 
S
G
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
W
L
 
H
L
 
I
Q
 
E
N
 
Q
N
 
G
A
 
T
D
 
N
F
 
S
L
 
I
C
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
A
P
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
I
K
 
K
M
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
T
K
 
K
N
 
A
D
 
A
D
 
K
F
 
D
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
L
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
T
 
S
A
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
P
Q
 
R
M
 
G
D
 
K
D
 
A
I
 
L
I
 
I
K
 
D
N
 
A
K
 
L
P
 
N
D
 
G
N
 
K
F
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
S
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
L
 
L
I
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
I
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
E
A
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
K
T
 
T
I
 
L
H
 
N
H
 
N
R
 
K
F
 
I
T
 
A
E
 
N
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
I
L
 
L
F
|
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
L
N
 
H
A
 
E
M
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
D
N
 
T
K
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
L
R
 
A
I
 
E
T
 
Q
T
 
Y
F
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
D
L
 
A
N
 
G
I
 
I

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
41% identity, 98% coverage: 6:295/297 of query aligns to 2:290/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
I
K
 
Q
G
 
G
M
 
S
G
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
L
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
G
V
 
V
D
 
D
Y
 
W
D
 
K
A
 
S
L
 
L
M
 
E
R
 
K
L
 
L
V
 
V
D
 
E
Y
 
W
L
 
H
L
 
I
Q
 
E
N
 
Q
N
 
G
A
 
T
D
 
N
F
 
S
L
 
I
C
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
A
P
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
M
E
 
E
E
 
E
K
 
H
K
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
I
K
 
K
M
 
E
V
 
I
I
 
I
D
 
R
R
 
V
V
 
A
N
 
N
G
 
K
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
T
K
 
K
N
 
A
D
 
A
D
 
K
F
 
D
T
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
A
L
 
L
S
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
T
 
S
A
 
N
E
 
D
T
 
T
T
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
D
I
 
V
T
 
P
Q
 
R
M
 
G
D
 
K
D
 
A
I
 
L
I
 
I
K
 
D
N
 
A
K
 
L
P
 
N
D
 
G
N
 
K
F
 
M
N
 
A
V
 
V
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
L
 
L
I
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
I
F
 
A
P
 
P
R
 
K
E
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
E
M
 
V
T
 
C
R
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
I
Q
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
E
A
 
Q
N
 
Q
A
 
A
L
 
K
T
 
T
I
 
L
H
 
N
H
 
N
R
 
K
F
 
I
T
 
A
E
 
N
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
I
L
 
L
F
|
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
|
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
L
N
 
H
A
 
E
M
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
D
N
 
T
K
 
G
L
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
T
 
L
R
 
A
I
 
E
T
 
Q
T
 
Y
F
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
N
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
D
L
 
A
N
 
G
I
 
I

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
43% identity, 94% coverage: 12:290/297 of query aligns to 13:290/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
A
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
H
E
 
E
D
 
D
E
 
G
S
 
S
V
 
I
D
 
N
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
I
M
 
P
R
 
A
L
 
L
V
 
I
D
 
E
Y
 
H
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
N
 
H
N
 
H
A
 
T
D
 
D
F
 
G
L
 
I
C
 
L
V
 
L
L
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
T
x
S
P
|
P
T
 
T
L
|
L
T
 
T
E
x
H
E
 
D
E
 
E
K
x
E
K
 
L
T
 
E
I
 
L
K
 
F
K
 
A
M
 
A
V
 
V
I
 
Q
D
 
K
R
 
V
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
P
 
P
I
 
L
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
N
 
D
T
 
T
R
 
R
A
 
D
I
 
S
V
 
I
E
 
E
T
 
F
L
 
V
K
 
K
N
 
E
-
 
V
D
 
A
D
 
E
F
 
F
T
 
G
G
 
G
V
 
F
D
 
A
A
 
A
I
 
G
L
 
L
S
 
A
V
 
I
V
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
D
A
 
A
T
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
Y
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
V
G
 
V
V
 
V
N
 
E
M
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
M
L
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
-
N
 
D
F
 
H
S
 
P
N
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
C
S
 
T
G
 
-
N
 
S
I
 
L
T
 
A
Q
 
N
M
 
M
D
 
A
D
 
Y
I
 
L
I
 
I
K
 
E
N
 
H
K
 
K
P
 
P
D
 
E
N
 
E
F
 
F
N
 
L
V
 
I
I
 
Y
S
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
G
 
G
I
 
D
T
 
A
F
 
F
P
 
H
L
 
A
I
 
M
T
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
N
 
H
A
 
T
F
 
N
P
 
G
R
 
D
E
 
E
F
 
M
S
 
H
R
 
E
M
 
M
T
 
F
R
 
T
L
 
A
A
 
I
L
 
A
Q
 
E
G
 
S
D
 
D
F
 
M
A
 
K
N
 
K
A
 
A
L
 
A
T
 
A
I
 
I
H
 
Q
H
 
R
R
 
K
F
 
F
T
 
I
E
 
P
L
 
K
F
 
V
D
 
N
L
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
S
D
 
Y
G
 
P
N
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
A
M
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
Y
M
 
M
G
 
G
M
 
F
I
 
E
E
 
A
N
 
G
K
 
P
L
 
T
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
A
R
 
P
I
 
E
T
 
E
T
 
D
F
 
V
E
 
K
A
 
R
I
 
I
R
 
I
K
 
K
V
 
V
L
 
V

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
39% identity, 96% coverage: 11:295/297 of query aligns to 7:291/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
D
E
 
E
D
 
K
E
 
G
S
 
N
V
 
V
D
 
C
Y
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
L
 
H
L
 
V
Q
 
A
N
 
S
N
 
G
A
 
T
D
 
S
F
 
A
L
 
I
C
 
V
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
S
P
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
N
E
x
H
E
 
D
E
 
E
K
x
H
K
 
A
T
 
D
I
 
V
K
 
V
K
 
M
M
 
M
V
 
T
I
 
L
D
 
D
R
 
L
V
 
A
N
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
|
N
N
 
A
T
 
T
R
 
A
A
x
E
I
 
A
V
 
I
E
 
S
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
N
 
R
D
 
F
D
 
N
F
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
H
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
L
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
K
N
 
-
F
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
T
Q
 
R
M
 
V
D
 
N
D
 
Q
I
 
I
I
 
K
K
 
E
N
 
L
K
 
V
P
 
S
D
 
D
N
 
D
F
 
F
N
 
V
V
 
L
I
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
L
 
F
I
 
M
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
F
 
A
P
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
M
S
 
A
R
 
Q
M
 
M
T
 
C
R
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
D
 
H
F
 
F
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
R
T
 
V
I
 
I
H
 
N
H
 
Q
R
 
R
F
 
L
T
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
E
G
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
C
N
 
K
A
 
E
M
 
L
G
 
G
M
 
L
I
 
V
E
 
A
-
 
T
N
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
T
 
I
R
 
T
I
 
D
T
 
S
T
 
G
F
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
V
R
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
H
L
 
A
N
 
G
I
 
L

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
39% identity, 96% coverage: 11:295/297 of query aligns to 7:291/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
D
E
 
E
D
 
K
E
 
G
S
 
N
V
 
V
D
 
C
Y
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
L
 
H
L
 
V
Q
 
A
N
 
S
N
 
G
A
 
T
D
 
S
F
 
A
L
 
I
C
 
V
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
N
E
 
H
E
 
D
E
 
E
K
 
H
K
 
A
T
 
D
I
 
V
K
 
V
K
 
M
M
 
M
V
 
T
I
 
L
D
 
D
R
 
L
V
 
A
N
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
R
 
A
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
S
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
N
 
R
D
 
F
D
 
N
F
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
H
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
L
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
K
N
 
-
F
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
T
Q
 
R
M
 
V
D
 
N
D
 
Q
I
 
I
I
 
K
K
 
E
N
 
L
K
 
V
P
 
S
D
 
D
N
 
D
F
 
F
N
 
V
V
 
L
I
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
L
 
F
I
 
M
T
 
Q
L
|
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
F
 
A
P
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
M
S
 
A
R
 
Q
M
 
M
T
 
C
R
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
D
 
H
F
 
F
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
R
T
 
V
I
 
I
H
 
N
H
 
Q
R
 
R
F
 
L
T
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
E
G
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
C
N
 
K
A
 
E
M
 
L
G
 
G
M
 
L
I
 
V
E
 
A
-
 
T
N
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
T
 
I
R
 
T
I
 
D
T
 
S
T
 
G
F
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
V
R
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
H
L
 
A
N
 
G
I
 
L

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
39% identity, 96% coverage: 11:295/297 of query aligns to 8:292/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
D
E
 
E
D
 
K
E
 
G
S
 
N
V
 
V
D
 
C
Y
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
L
 
H
L
 
V
Q
 
A
N
 
S
N
 
G
A
 
T
D
 
S
F
 
A
L
 
I
C
 
V
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
 
S
P
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
N
E
x
H
E
 
D
E
 
E
K
 
H
K
 
A
T
 
D
I
 
V
K
 
V
K
 
M
M
 
M
V
 
T
I
 
L
D
 
D
R
 
L
V
 
A
N
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
|
N
N
 
A
T
 
T
R
 
A
A
x
E
I
 
A
V
 
I
E
 
S
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
N
 
R
D
 
F
D
 
N
F
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
H
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
L
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
K
N
 
-
F
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
T
Q
 
R
M
 
V
D
 
N
D
 
Q
I
 
I
I
 
K
K
 
E
N
 
L
K
 
V
P
 
S
D
 
D
N
 
D
F
 
F
N
 
V
V
 
L
I
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
L
 
F
I
 
M
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
F
 
A
P
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
M
S
 
A
R
 
Q
M
 
M
T
 
C
R
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
D
 
H
F
 
F
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
R
T
 
V
I
 
I
H
 
N
H
 
Q
R
 
R
F
 
L
T
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
E
G
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
C
N
 
K
A
 
E
M
 
L
G
 
G
M
 
L
I
 
V
E
 
A
-
 
T
N
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
T
 
I
R
 
T
I
 
D
T
 
S
T
 
G
F
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
V
R
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
H
L
 
A
N
 
G
I
 
L

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
39% identity, 96% coverage: 11:295/297 of query aligns to 7:291/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
V
 
V
A
|
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
K
 
D
E
 
E
D
 
K
E
 
G
S
 
N
V
 
V
D
 
C
Y
 
R
D
 
A
A
 
S
L
 
L
M
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
L
 
H
L
 
V
Q
 
A
N
 
S
N
 
G
A
 
T
D
 
S
F
 
A
L
 
I
C
 
V
V
 
S
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
G
E
 
E
T
 
S
P
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
N
E
 
H
E
 
D
E
 
E
K
 
H
K
 
A
T
 
D
I
 
V
K
 
V
K
 
M
M
 
M
V
 
T
I
 
L
D
 
D
R
 
L
V
 
A
N
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
R
 
A
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
S
T
 
L
L
 
T
K
 
Q
N
 
R
D
 
F
D
 
N
F
 
D
T
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
A
 
G
I
 
C
L
 
L
S
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
S
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
A
 
H
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
Q
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
L
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
K
N
 
-
F
 
V
S
 
K
N
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
I
K
x
R
E
 
E
A
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
T
Q
 
R
M
 
V
D
 
N
D
 
Q
I
 
I
I
 
K
K
 
E
N
 
L
K
 
V
P
 
S
D
 
D
N
 
D
F
 
F
N
 
V
V
 
L
I
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
L
 
F
I
 
M
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
N
 
N
A
 
V
F
 
A
P
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
M
S
 
A
R
 
Q
M
 
M
T
 
C
R
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
G
 
G
D
 
H
F
 
F
A
 
A
N
 
E
A
 
A
L
 
R
T
 
V
I
 
I
H
 
N
H
 
Q
R
 
R
F
 
L
T
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
H
D
 
N
L
 
K
L
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
E
G
 
P
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
V
K
 
K
S
 
W
M
 
A
L
 
C
N
 
K
A
 
E
M
 
L
G
 
G
M
 
L
I
 
V
E
 
A
-
 
T
N
 
D
K
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
T
P
 
P
T
 
I
R
 
T
I
 
D
T
 
S
T
 
G
F
 
R
E
 
E
A
 
T
I
 
V
R
 
R
K
 
A
V
 
A
L
 
L
N
 
K
E
 
H
L
 
A
N
 
G
I
 
L

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
38% identity, 97% coverage: 8:296/297 of query aligns to 6:294/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
G
 
G
M
 
A
G
 
M
V
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
K
E
 
N
D
 
G
E
 
K
S
 
-
V
 
V
D
 
D
Y
 
E
D
 
Q
A
 
S
L
 
Y
M
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
Q
L
 
I
Q
 
E
N
 
N
N
 
G
A
 
I
D
 
D
F
 
A
L
 
V
C
 
V
V
 
P
L
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
x
S
P
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
T
E
 
H
E
 
E
E
 
E
K
|
K
K
 
R
T
 
T
I
 
C
K
 
I
K
 
E
M
 
I
V
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
T
V
 
C
N
 
K
G
 
G
-
 
T
R
 
K
I
 
V
P
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
S
N
|
N
N
 
A
T
 
T
R
 
H
A
x
E
I
 
A
V
 
V
E
 
G
T
 
L
L
 
A
K
 
K
N
 
F
D
 
A
D
 
K
F
 
E
T
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
Q
A
 
S
T
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
E
M
 
I
T
 
S
A
 
T
E
 
D
T
 
T
T
 
I
L
 
I
R
 
K
I
 
L
A
 
F
R
 
R
N
 
D
F
 
C
S
 
E
N
 
N
V
 
I
I
 
Y
A
 
G
I
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
I
T
 
D
Q
 
K
M
 
C
D
 
V
D
 
D
I
 
L
I
 
L
K
 
A
N
 
H
K
 
E
P
 
P
D
 
-
N
 
R
F
 
M
N
 
M
V
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
G
 
A
I
 
I
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
I
I
 
L
T
 
S
L
 
N
G
 
G
A
 
G
V
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
S
N
 
N
A
 
L
F
 
L
P
 
P
R
 
D
E
 
M
F
 
I
S
 
S
R
 
A
M
 
L
T
 
T
R
 
H
L
 
F
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
G
 
E
D
 
N
F
 
Y
A
 
K
N
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
K
I
 
I
H
 
N
H
 
D
R
 
E
F
 
L
T
 
Y
E
 
N
L
 
I
F
 
N
D
 
K
L
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
C
D
 
E
G
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
I
K
 
K
S
 
T
M
 
A
L
 
M
N
 
Y
A
 
L
M
 
A
G
 
G
M
 
L
I
 
I
E
 
E
N
 
S
-
 
L
K
 
E
L
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
C
P
 
S
T
 
P
R
 
S
I
 
K
T
 
E
T
 
N
F
 
F
E
 
A
A
 
K
I
 
I
R
 
E
K
 
E
V
 
V
L
 
M
N
 
K
E
 
K
L
 
Y
N
 
K
I
 
I
K
 
K

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
39% identity, 96% coverage: 12:295/297 of query aligns to 11:294/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
A
 
A
L
 
M
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
K
E
 
A
D
 
D
E
 
G
S
 
S
V
 
V
D
 
N
Y
 
Y
D
 
A
A
 
V
L
 
A
M
 
A
R
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
A
Y
 
H
L
 
L
L
 
V
Q
 
D
N
 
N
N
 
G
A
 
T
D
 
D
F
 
T
L
 
L
C
 
V
V
 
V
L
 
C
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
x
S
P
 
P
T
 
T
L
|
L
T
 
S
E
 
W
E
 
D
E
 
E
K
x
E
K
 
Y
T
 
N
I
 
L
K
 
F
K
 
V
M
x
E
V
 
V
I
 
L
D
x
Q
R
 
T
V
 
V
N
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
A
P
 
K
I
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
G
V
 
C
G
 
G
G
 
S
N
 
N
N
 
S
T
 
T
R
 
K
A
 
E
I
 
A
V
 
I
E
 
A
T
 
A
L
 
T
K
 
Q
N
 
K
D
 
A
D
 
A
F
 
K
T
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
H
A
 
G
I
 
T
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
P
Q
 
Q
E
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
F
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
C
-
 
P
E
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
N
 
N
M
 
L
T
 
S
A
 
P
E
 
E
T
 
T
T
 
V
L
 
V
R
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
N
 
-
F
 
I
S
 
D
N
 
N
V
 
I
I
 
I
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
D
Q
 
Q
M
 
A
D
 
G
D
 
E
I
 
I
I
 
R
K
 
R
N
 
S
K
 
T
P
 
P
D
 
K
N
 
E
F
 
F
N
 
Q
V
 
I
I
 
Y
S
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
S
I
 
L
T
 
T
F
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
L
T
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
K
G
 
G
V
 
V
I
x
V
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
N
 
H
A
 
L
F
 
V
P
 
G
R
 
N
E
 
Q
F
 
L
S
 
Q
R
 
Q
M
 
M
T
 
I
R
 
Q
L
 
A
A
 
F
L
 
N
Q
 
S
G
 
G
D
 
Q
F
 
V
A
 
T
N
 
V
A
 
A
L
 
S
T
 
D
I
 
I
H
 
H
H
 
L
R
 
R
F
 
L
T
 
L
E
 
P
L
 
L
F
 
F
D
 
K
L
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
I
D
 
T
G
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
I
G
 
P
V
 
I
K
 
K
S
 
Q
M
 
A
L
 
L
N
 
K
A
 
L
M
 
Q
G
 
G
M
 
W
I
 
E
E
 
V
N
 
G
K
 
S
L
 
T
R
 
R
L
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
S
P
 
D
T
 
A
R
 
D
I
 
A
T
 
E
T
 
V
F
 
S
E
 
Q
A
 
K
I
 
L
R
 
E
K
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
K
E
 
H
L
 
L
N
 
N
I
 
L

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
38% identity, 97% coverage: 8:296/297 of query aligns to 6:294/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
G
 
G
M
 
A
G
 
M
V
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
K
 
K
E
 
N
D
 
G
E
 
K
S
 
-
V
 
V
D
 
D
Y
 
E
D
 
Q
A
 
S
L
 
Y
M
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
Q
L
 
I
Q
 
E
N
 
N
N
 
G
A
 
I
D
 
D
F
 
A
L
 
V
C
 
V
V
 
P
L
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
A
 
G
E
 
E
T
x
S
P
x
A
T
 
T
L
|
L
T
 
T
E
x
H
E
 
E
E
 
E
K
x
H
K
 
R
T
 
T
I
 
C
K
 
I
K
 
E
M
 
I
V
 
A
I
 
V
D
 
E
R
 
T
V
 
C
N
 
K
G
 
G
-
 
T
R
 
K
I
 
V
P
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
S
N
|
N
N
 
A
T
 
T
R
 
H
A
x
E
I
 
A
V
 
V
E
 
G
T
 
L
L
 
A
K
 
K
N
 
F
D
 
A
D
 
K
F
 
E
T
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
H
Y
 
Y
K
 
K
A
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
Q
A
 
S
T
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
E
M
 
I
T
 
S
A
 
T
E
 
D
T
 
T
T
 
I
L
 
I
R
 
K
I
 
L
A
 
F
R
 
R
N
 
D
F
 
C
S
 
E
N
 
N
V
 
I
I
 
Y
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
G
N