SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 350802 FitnessBrowser__Btheta:350802 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

6voqA Crystal structure of ygbl, a putative aldolase/epimerase/decarboxylase from klebsiella pneumoniae
33% identity, 84% coverage: 26:203/212 of query aligns to 27:207/207 of 6voqA

query
sites
6voqA
S
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
S
W
 
L
R
 
L
I
 
L
G
 
P
E
 
D
E
 
G
A
 
N
L
 
L
I
 
L
S
 
A
G
 
T
-
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
A
W
 
C
V
 
L
P
 
G
T
 
E
L
 
L
A
 
Q
K
 
A
E
 
Q
K
 
R
V
 
L
S
 
S
I
 
V
C
 
V
N
 
T
I
 
L
A
 
-
S
 
Q
G
 
G
T
 
E
P
 
W
T
 
I
N
 
S
G
 
G
V
 
D
K
 
K
P
 
P
S
 
S
M
 
K
E
|
E
S
 
V
T
 
T
F
 
F
H
 
H
L
 
R
G
 
A
V
 
V
L
 
Y
R
 
L
E
 
H
R
 
N
P
 
P
D
 
A
V
 
C
N
 
K
V
 
A
V
 
I
L
 
V
H
|
H
F
 
L
Q
x
H
S
 
S
E
 
H
Y
 
Y
A
 
L
T
 
T
A
 
A
I
 
L
S
 
S
C
 
C
M
 
L
K
 
Q
N
 
G
-
 
L
K
 
D
P
 
P
T
 
H
N
 
N
-
 
C
-
 
I
F
 
R
N
 
P
V
 
F
T
 
T
A
 
P
E
x
Y
I
 
V
P
 
V
C
 
M
H
 
R
V
 
V
G
 
G
S
 
-
E
 
D
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
G
 
G
S
 
D
P
 
D
E
 
R
L
 
I
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
L
V
 
A
E
 
G
A
 
L
M
 
A
L
 
P
K
 
R
H
 
Y
N
 
N
S
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
N
H
|
H
G
 
G
Q
 
P
V
 
V
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
S
D
 
S
F
 
L
D
 
R
Q
 
E
V
 
A
Y
 
T
E
 
N
R
 
N
A
 
T
T
 
E
F
 
E
F
 
L
E
 
E
M
 
E
A
 
T
C
 
A
R
 
R
I
 
L
I
 
I
V
 
F
Q
 
T
S
 
L
G
 
G
G
 
N
-
 
R
D
 
E
Y
 
I
S
 
R
V
 
Y
L
 
L
T
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
V
E
 
K
D
 
E
L
 
L
E
 
R

Q58813 L-fuculose phosphate aldolase; L-fuculose-1-phosphate aldolase; EC 4.1.2.17 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii)
28% identity, 82% coverage: 10:183/212 of query aligns to 6:172/181 of Q58813

query
sites
Q58813
F
 
F
L
 
I
A
 
K
Q
 
I
A
 
C
H
 
R
R
 
K
Y
 
L
G
 
Y
D
 
D
A
 
R
K
 
K
L
 
Y
M
 
V
L
 
V
C
 
G
S
 
S
S
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
V
S
 
S
W
 
V
R
 
K
I
 
E
G
 
G
E
 
D
E
 
K
A
 
I
L
 
Y
I
 
L
S
 
T
G
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
W
 
I
V
 
L
P
 
G
T
 
F
L
 
L
A
 
K
K
 
E
E
 
D
K
 
D
V
 
I
S
 
A
I
 
E
C
 
M
N
 
D
I
 
L
A
 
-
S
 
D
G
 
G
T
 
N
P
 
V
T
 
I
N
 
K
G
 
G
V
 
-
K
 
K
P
 
P
S
 
T
M
 
S
E
 
E
S
 
K
T
 
N
F
 
L
H
 
H
L
 
L
G
 
M
V
 
I
L
 
Y
R
 
R
E
 
K
R
 
R
P
 
N
D
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
A
V
 
I
L
 
I
H
 
H
F
 
T
Q
 
H
S
 
S
E
 
L
Y
 
I
A
 
S
T
 
T
A
 
F
I
 
L
S
 
S
C
 
T
M
 
I
K
 
-
N
 
N
K
 
K
P
 
E
T
 
I
N
 
E
F
 
L
N
 
-
V
 
L
T
 
T
A
 
P
E
 
E
I
 
G
P
 
K
C
 
I
H
 
F
V
 
L
G
 
-
S
 
K
E
 
K
I
 
I
P
 
G
V
 
Y
I
 
V
P
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
E
P
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
T
V
 
-
E
 
-
A
 
A
M
 
K
L
 
R
K
 
D
H
 
E
N
 
D
S
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
T
 
K
N
 
N
H
 
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
V
 
C
C
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
D
F
 
L
D
 
I
Q
 
D
V
 
A
Y
 
Y
E
 
I
R
 
K
A
 
V
T
 
E
F
 
V
F
 
L
E
 
E
M
 
E
A
 
Q
C
 
A
R
 
K
I
 
L

P0DTQ0 5-deoxy-D-ribulose 1-phosphate aldolase; 5-deoxyribose disposal aldolase; EC 4.1.2.- from Bacillus thuringiensis serovar kurstaki (strain ATCC 35866 / NRRL B-4488 / HD73) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 1:202/212 of query aligns to 1:203/213 of P0DTQ0

query
sites
P0DTQ0
M
 
M
I
 
L
T
 
L
D
 
Q
E
 
K
H
 
E
I
 
R
E
 
E
L
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
Y
A
 
G
H
 
K
R
 
K
Y
 
M
G
 
I
D
 
S
A
 
S
K
 
G
L
 
L
M
 
T
L
 
K
C
 
G
S
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
S
 
S
W
 
I
R
 
F
I
 
N
G
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
G
L
 
L
-
 
V
-
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
L
W
 
E
V
 
Y
P
 
Y
T
 
E
L
 
T
A
 
K
K
 
P
E
 
E
K
 
D
V
 
V
S
 
V
I
 
I
C
 
L
N
 
N
I
 
L
A
 
D
S
 
G
G
 
E
T
 
V
P
 
I
T
 
E
N
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
K
P
 
P
S
 
S
M
 
S
E
|
E
S
 
L
T
 
D
F
 
M
H
 
H
L
 
L
G
 
I
V
 
Y
L
 
Y
R
 
R
E
 
K
R
 
R
P
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
A
V
 
L
L
 
V
H
|
H
F
 
T
Q
x
H
S
 
S
E
 
P
Y
 
Y
A
 
A
T
 
K
A
 
T
I
 
I
S
 
A
C
 
S
M
 
L
K
 
G
N
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
W
N
 
E
F
 
L
N
 
P
V
 
A
T
 
V
A
 
S
E
 
Y
I
 
L
P
 
I
C
 
A
H
 
F
V
 
A
G
 
G
S
 
P
E
 
N
I
 
V
P
 
R
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
E
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
A
V
 
F
E
 
E
A
 
G
M
 
M
L
 
I
K
 
D
H
 
R
N
 
R
S
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
N
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
G
G
 
A
K
 
N
D
 
N
F
 
I
D
 
K
Q
 
M
V
 
A
Y
 
F
E
 
T
R
 
V
A
 
A
T
 
E
F
 
E
F
 
I
E
 
E
M
 
F
A
 
C
C
 
A
R
 
Q
I
 
I
I
 
Y
V
 
Y
Q
 
Q
-
 
T
-
 
K
S
 
S
G
 
I
G
 
G
D
 
E
Y
 
P
S
 
K
V
 
L
L
 
L
T
 
P
P
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
M
E
 
E
D
 
N
L
 
L

6btgA Crystal structure of deoxyribose-phosphate aldolase bound with dhap from bacillus thuringiensis (see paper)
27% identity, 95% coverage: 1:202/212 of query aligns to 1:203/207 of 6btgA

query
sites
6btgA
M
 
M
I
 
L
T
 
L
D
 
Q
E
 
K
H
 
E
I
 
R
E
 
E
L
 
E
F
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
Y
A
 
G
H
 
K
R
 
K
Y
 
M
G
 
I
D
 
S
A
 
S
K
 
G
L
 
L
M
 
T
L
 
K
C
 
G
S
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
I
S
 
S
W
 
I
R
 
F
I
 
N
G
 
R
E
 
E
E
 
Q
A
 
G
L
 
L
-
 
V
-
 
A
I
 
I
S
 
S
G
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
L
W
 
E
V
 
Y
P
 
Y
T
 
E
L
 
T
A
 
K
K
 
P
E
 
E
K
 
D
V
 
V
S
 
V
I
 
I
C
 
L
N
 
N
I
 
L
A
 
D
S
 
G
G
 
E
T
 
V
P
 
I
T
 
E
N
 
G
G
 
E
V
 
R
K
 
K
P
 
P
S
 
S
M
 
S
E
|
E
S
 
L
T
 
D
F
 
M
H
 
H
L
 
L
G
 
I
V
 
Y
L
 
Y
R
 
R
E
 
K
R
 
R
P
 
E
D
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
A
V
 
L
L
 
V
H
|
H
F
 
T
Q
x
H
S
 
S
E
 
P
Y
 
Y
A
 
A
T
 
K
A
 
T
I
 
I
S
 
A
C
 
S
M
 
L
K
 
G
N
 
-
K
 
-
P
 
-
T
 
W
N
 
E
F
 
L
N
 
P
V
 
A
T
 
V
A
 
S
E
x
Y
I
 
L
P
 
I
C
 
A
H
 
F
V
 
A
G
 
G
S
 
P
E
 
N
I
 
V
P
 
R
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
E
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
A
V
 
F
E
 
E
A
 
G
M
 
M
L
 
I
K
 
D
H
 
R
N
 
R
S
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
N
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
G
G
 
A
K
 
N
D
 
N
F
 
I
D
 
K
Q
 
M
V
 
A
Y
 
F
E
 
T
R
 
V
A
 
A
T
 
E
F
 
E
F
 
I
E
 
E
M
 
F
A
 
C
C
 
A
R
 
Q
I
 
I
I
 
Y
V
 
Y
Q
 
Q
-
 
T
-
 
K
S
 
S
G
 
I
G
 
G
D
 
E
Y
 
P
S
 
K
V
 
L
L
 
L
T
 
P
P
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
M
E
 
E
D
 
N
L
 
L

4fuaA L-fuculose-1-phosphate aldolase complex with pgh (see paper)
27% identity, 82% coverage: 26:199/212 of query aligns to 26:199/206 of 4fuaA

query
sites
4fuaA
S
 
T
S
 
A
G
|
G
N
|
N
L
 
V
S
 
S
W
 
V
R
 
R
I
 
Y
G
 
Q
E
 
D
E
 
G
A
 
M
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
P
T
|
T
G
 
G
S
 
I
W
 
P
V
 
Y
P
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
T
K
 
E
E
 
S
K
 
H
V
 
I
S
 
V
I
 
F
C
 
I
N
 
D
I
 
-
A
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
H
T
 
E
N
 
E
G
 
G
V
 
K
K
 
L
P
 
P
S
|
S
M
x
S
E
|
E
S
 
W
T
 
R
F
 
F
H
 
H
L
 
M
G
 
A
V
 
A
L
 
Y
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
L
 
V
H
|
H
F
 
N
Q
x
H
S
 
A
E
 
V
Y
 
H
A
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
C
 
I
M
 
L
K
 
N
N
 
R
K
 
S
P
 
I
T
 
P
N
 
A
F
 
I
N
 
H
V
x
Y
T
 
M
A
 
-
E
 
-
I
 
I
P
 
A
C
x
A
H
 
A
V
 
G
G
 
G
S
 
N
E
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
E
A
 
H
V
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
A
M
 
L
L
 
K
K
 
N
H
 
R
N
 
K
S
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
N
 
H
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
C
G
 
E
K
 
V
D
 
N
F
 
L
D
 
E
Q
 
K
V
 
A
Y
 
L
E
 
W
R
 
L
A
 
A
T
 
H
F
 
E
F
 
V
E
 
E
M
 
V
A
 
L
C
 
A
R
 
Q
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
Q
 
T
S
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
I
G
 
T
G
 
D
D
 
P
Y
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I

P0AB87 L-fuculose phosphate aldolase; D-ribulose-phosphate aldolase; L-fuculose-1-phosphate aldolase; EC 4.1.2.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
27% identity, 82% coverage: 26:199/212 of query aligns to 26:199/215 of P0AB87

query
sites
P0AB87
S
x
T
S
x
A
G
|
G
N
|
N
L
 
V
S
 
S
W
 
V
R
 
R
I
 
Y
G
 
Q
E
 
D
E
 
G
A
 
M
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
P
T
|
T
G
|
G
S
 
I
W
 
P
V
 
Y
P
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
T
K
 
E
E
 
S
K
 
H
V
 
I
S
 
V
I
 
F
C
 
I
N
 
D
I
 
-
A
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
H
T
 
E
N
 
E
G
 
G
V
 
K
K
 
L
P
 
P
S
|
S
M
x
S
E
|
E
S
 
W
T
 
R
F
 
F
H
 
H
L
 
M
G
 
A
V
 
A
L
 
Y
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
L
 
V
H
|
H
F
 
N
Q
x
H
S
 
A
E
 
V
Y
 
H
A
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
C
 
I
M
 
L
K
 
N
N
 
R
K
 
S
P
 
I
T
 
P
N
 
A
F
 
I
N
 
H
V
x
Y
T
 
M
A
 
-
E
 
-
I
 
I
P
 
A
C
 
A
H
 
A
V
 
G
G
 
G
S
 
N
E
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
A
R
 
T
P
x
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
E
A
 
H
V
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
A
M
 
L
L
 
K
K
 
N
H
 
R
N
 
K
S
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
N
 
H
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
C
G
 
E
K
 
V
D
 
N
F
 
L
D
 
E
Q
 
K
V
 
A
Y
 
L
E
 
W
R
 
L
A
 
A
T
 
H
F
 
E
F
 
V
E
 
E
M
 
V
A
 
L
C
 
A
R
 
Q
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
Q
 
T
S
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
I
G
 
T
G
 
D
D
 
P
Y
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1dzuP L-fuculose-1-phosphate aldolase from escherichia coli mutant t26a (see paper)
27% identity, 82% coverage: 26:199/212 of query aligns to 26:199/209 of 1dzuP

query
sites
1dzuP
S
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
S
 
S
W
 
V
R
 
R
I
 
Y
G
 
Q
E
 
D
E
 
G
A
 
M
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
I
W
 
P
V
 
Y
P
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
T
K
 
E
E
 
S
K
 
H
V
 
I
S
 
V
I
 
F
C
 
I
N
 
D
I
 
-
A
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
H
T
 
E
N
 
E
G
 
G
V
 
K
K
 
L
P
 
P
S
 
S
M
 
S
E
|
E
S
 
W
T
 
R
F
 
F
H
 
H
L
 
M
G
 
A
V
 
A
L
 
Y
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
L
 
V
H
|
H
F
 
N
Q
x
H
S
 
A
E
 
V
Y
 
H
A
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
C
 
I
M
 
L
K
 
N
N
 
R
K
 
S
P
 
I
T
 
P
N
 
A
F
 
I
N
 
H
V
 
Y
T
 
M
A
 
-
E
 
-
I
 
I
P
 
A
C
 
A
H
 
A
V
 
G
G
 
G
S
 
N
E
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
E
A
 
H
V
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
A
M
 
L
L
 
K
K
 
N
H
 
R
N
 
K
S
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
N
 
H
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
C
G
 
E
K
 
V
D
 
N
F
 
L
D
 
E
Q
 
K
V
 
A
Y
 
L
E
 
W
R
 
L
A
 
A
T
 
H
F
 
E
F
 
V
E
 
E
M
 
V
A
 
L
C
 
A
R
 
Q
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
Q
 
T
S
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
I
G
 
T
G
 
D
D
 
P
Y
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I

2fuaA L-fuculose 1-phosphate aldolase crystal form t with cobalt (see paper)
27% identity, 82% coverage: 26:199/212 of query aligns to 26:199/210 of 2fuaA

query
sites
2fuaA
S
 
T
S
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
S
 
S
W
 
V
R
 
R
I
 
Y
G
 
Q
E
 
D
E
 
G
A
 
M
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
I
W
 
P
V
 
Y
P
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
T
K
 
E
E
 
S
K
 
H
V
 
I
S
 
V
I
 
F
C
 
I
N
 
D
I
 
-
A
 
G
S
 
N
G
 
G
T
 
K
P
 
H
T
 
E
N
 
E
G
 
G
V
 
K
K
 
L
P
 
P
S
 
S
M
 
S
E
|
E
S
 
W
T
 
R
F
 
F
H
 
H
L
 
M
G
 
A
V
 
A
L
 
Y
R
 
Q
E
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
L
 
V
H
|
H
F
 
N
Q
x
H
S
 
A
E
 
V
Y
 
H
A
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
C
 
I
M
 
L
K
 
N
N
 
R
K
 
S
P
 
I
T
 
P
N
 
A
F
 
I
N
 
H
V
x
Y
T
 
M
A
 
-
E
 
-
I
 
I
P
 
A
C
x
A
H
 
A
V
 
G
G
 
G
S
 
N
E
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
E
A
 
H
V
 
V
V
 
A
E
 
L
A
 
A
M
 
L
L
 
K
K
 
N
H
 
R
N
 
K
S
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
N
 
H
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
C
G
 
E
K
 
V
D
 
N
F
 
L
D
 
E
Q
 
K
V
 
A
Y
 
L
E
 
W
R
 
L
A
 
A
T
 
H
F
 
E
F
 
V
E
 
E
M
 
V
A
 
L
C
 
A
R
 
Q
I
 
L
I
 
Y
V
 
L
Q
 
T
S
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
I
G
 
T
G
 
D
D
 
P
Y
 
V
S
 
P
V
 
V
L
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7x78A L-fuculose 1-phosphate aldolase (see paper)
31% identity, 68% coverage: 26:169/212 of query aligns to 23:163/203 of 7x78A

query
sites
7x78A
S
 
N
S
 
A
G
 
G
N
|
N
L
 
V
S
 
S
W
 
V
R
 
R
I
 
Y
G
 
Q
E
 
G
E
 
G
A
 
M
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
P
T
|
T
G
 
G
S
 
I
W
 
P
V
 
Y
P
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
T
K
 
E
E
 
D
K
 
K
V
 
I
S
 
V
I
 
F
C
 
I
N
 
D
I
 
-
A
 
A
S
 
D
G
 
G
T
 
Q
P
x
H
T
 
E
N
x
Q
G
 
G
V
 
K
K
 
L
P
 
P
S
|
S
M
x
S
E
|
E
S
 
W
T
 
R
F
 
F
H
 
H
L
 
Q
G
 
A
V
 
A
L
 
Y
R
 
Q
E
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
A
N
 
Q
V
 
A
V
 
V
L
 
V
H
|
H
F
 
N
Q
x
H
S
 
A
E
 
V
Y
 
H
A
 
C
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
S
C
 
I
M
 
L
K
 
-
N
 
N
K
 
R
P
 
P
T
 
I
N
 
P
F
 
-
N
 
A
V
 
I
T
 
H
A
 
Y
E
 
M
I
 
I
P
 
A
C
 
A
H
 
A
V
 
G
G
 
G
S
 
N
E
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
C
I
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
A
R
 
T
P
 
F
G
 
G
S
 
T
P
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
K
 
E
A
 
H
V
 
V
V
 
A
E
 
V
A
 
A
M
 
L
L
 
K
K
 
H
H
 
R
N
 
K
S
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
N
 
H
H
|
H
G
 
G
Q
 
L
V
 
I
V
 
A
C
 
C
G
 
E
K
 
A
D
 
S
F
 
L
D
 
E
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

4c25A L-fuculose 1-phosphate aldolase (see paper)
27% identity, 83% coverage: 26:200/212 of query aligns to 29:204/212 of 4c25A

query
sites
4c25A
S
 
T
S
x
G
G
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
S
W
 
V
R
 
F
I
 
D
G
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
Q
L
 
L
I
 
M
S
 
A
G
 
I
T
 
T
G
 
P
S
 
S
W
 
G
V
 
I
P
 
D
T
 
F
L
 
F
A
 
E
-
 
I
K
 
K
E
 
E
K
 
S
V
 
D
S
 
I
I
 
V
C
 
V
N
 
M
I
 
D
A
 
I
S
 
N
G
 
G
T
 
N
P
 
V
T
 
V
N
 
E
G
 
G
V
 
E
K
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
M
 
S
E
|
E
S
 
W
T
 
Y
F
 
M
H
 
H
L
 
L
G
 
I
V
 
Q
L
 
Y
R
 
Q
E
 
T
R
 
R
P
 
D
D
 
D
V
 
I
N
 
D
V
 
A
V
 
I
L
 
I
H
|
H
F
 
A
Q
x
H
S
 
T
E
 
T
Y
 
Y
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
L
S
 
A
C
 
C
M
 
L
K
 
R
N
 
E
K
 
P
-
 
L
P
 
P
T
 
A
N
 
S
F
 
H
N
x
Y
V
 
M
T
 
I
A
 
A
E
 
V
I
 
-
P
 
-
C
 
-
H
 
-
V
 
A
G
 
G
S
 
K
E
 
D
I
 
V
P
 
R
V
 
V
I
 
A
P
 
E
Y
 
Y
Y
 
A
R
 
T
P
 
Y
G
 
G
S
 
T
P
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
V
A
 
N
V
 
A
V
 
A
E
 
K
A
 
A
M
 
M
L
 
E
K
 
G
H
 
R
N
 
R
S
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
N
H
|
H
G
 
G
Q
 
I
V
 
L
V
 
A
C
 
G
G
 
A
K
 
Q
D
 
N
F
 
L
D
 
L
Q
 
N
V
 
A
Y
 
F
E
 
N
R
 
I
A
 
V
T
 
E
F
 
E
F
 
V
E
 
E
M
 
Y
A
 
C
C
 
A
R
 
K
I
 
I
-
 
Y
-
 
C
I
 
L
V
 
A
Q
 
K
S
 
N
G
 
F
G
 
G
D
 
E
Y
 
P
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
P
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
M
E
 
E

2z7bA Crystal structure of mesorhizobium loti 3-hydroxy-2-methylpyridine-4, 5-dicarboxylate decarboxylase (see paper)
27% identity, 64% coverage: 66:200/212 of query aligns to 67:210/237 of 2z7bA

query
sites
2z7bA
T
 
T
N
 
S
G
 
D
V
 
N
K
 
R
P
 
P
S
 
S
-
 
Y
M
 
L
E
|
E
S
 
R
T
 
Y
F
 
I
H
 
H
L
 
S
G
 
E
V
 
I
L
 
Y
R
 
K
E
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
V
N
 
Q
V
 
C
V
 
V
L
 
L
H
|
H
F
 
T
Q
x
H
S
 
S
E
 
P
Y
 
-
A
 
A
T
 
V
A
 
L
I
 
P
S
 
Y
C
 
C
M
 
F
K
 
V
N
 
D
K
 
T
P
 
P
T
 
-
N
 
-
F
 
L
N
 
R
V
 
P
T
 
V
A
 
T
E
 
H
I
 
M
P
 
G
C
 
A
H
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
E
E
 
S
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
Y
P
 
E
Y
 
I
Y
 
R
R
 
D
P
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
C
K
 
A
A
 
D
V
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
L
 
G
K
 
S
H
 
Q
N
 
T
S
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
M
T
 
A
N
 
R
H
|
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
V
 
N
C
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
S
F
 
V
D
 
R
Q
 
E
V
 
V
Y
 
V
E
 
F
R
 
R
A
 
A
T
 
F
F
 
Y
F
 
L
E
 
E
M
 
Q
A
 
E
C
 
A
R
 
A
I
 
A
I
 
L
V
 
T
Q
 
A
S
 
G
G
 
L
-
 
K
-
 
I
G
 
G
D
 
N
Y
 
V
S
 
K
V
 
Y
L
 
L
T
 
S
P
 
P
E
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
K

Q988D0 3-hydroxy-2-methylpyridine-4,5-dicarboxylate 4-decarboxylase; HMPDdc; EC 4.1.1.51 from Mesorhizobium japonicum (strain LMG 29417 / CECT 9101 / MAFF 303099) (Mesorhizobium loti (strain MAFF 303099)) (see paper)
27% identity, 64% coverage: 66:200/212 of query aligns to 64:207/234 of Q988D0

query
sites
Q988D0
T
 
T
N
 
S
G
 
D
V
 
N
K
 
R
P
 
P
S
 
S
-
 
Y
M
 
L
E
|
E
S
 
R
T
 
Y
F
 
I
H
 
H
L
 
S
G
 
E
V
 
I
L
 
Y
R
 
K
E
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
D
V
 
V
N
 
Q
V
 
C
V
 
V
L
 
L
H
|
H
F
 
T
Q
x
H
S
 
S
E
 
P
Y
 
-
A
 
A
T
 
V
A
 
L
I
 
P
S
 
Y
C
 
C
M
 
F
K
 
V
N
 
D
K
 
T
P
 
P
T
 
-
N
 
-
F
 
L
N
 
R
V
 
P
T
 
V
A
 
T
E
 
H
I
 
M
P
 
G
C
 
A
H
 
F
V
 
I
G
 
G
S
 
E
E
 
S
I
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
Y
P
 
E
Y
 
I
Y
 
R
R
 
D
P
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
C
K
 
A
A
 
D
V
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
S
M
 
L
L
 
G
K
 
S
H
 
Q
N
 
T
S
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
M
T
 
A
N
 
R
H
|
H
G
 
G
Q
 
V
V
 
V
V
 
N
C
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
S
F
 
V
D
 
R
Q
 
E
V
 
V
Y
 
V
E
 
F
R
 
R
A
 
A
T
 
F
F
 
Y
F
 
L
E
 
E
M
 
Q
A
 
E
C
 
A
R
 
A
I
 
A
I
 
L
V
 
T
Q
 
A
S
 
G
G
 
L
-
 
K
-
 
I
G
 
G
D
 
N
Y
 
V
S
 
K
V
 
Y
L
 
L
T
 
S
P
 
P
E
 
G
E
 
E
I
 
I
E
 
K

Query Sequence

>350802 FitnessBrowser__Btheta:350802
MITDEHIELFLAQAHRYGDAKLMLCSSGNLSWRIGEEALISGTGSWVPTLAKEKVSICNI
ASGTPTNGVKPSMESTFHLGVLRERPDVNVVLHFQSEYATAISCMKNKPTNFNVTAEIPC
HVGSEIPVIPYYRPGSPELAKAVVEAMLKHNSVLLTNHGQVVCGKDFDQVYERATFFEMA
CRIIVQSGGDYSVLTPEEIEDLEIYVLGKKTK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory