SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 351409 FitnessBrowser__Btheta:351409 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8swtA Structure of bacteroides fragilis pnp bound to transition state analog immucillin h and sulfate (see paper)
97% identity, 100% coverage: 1:269/269 of query aligns to 10:278/278 of 8swtA

query
sites
8swtA
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
M
 
M
H
 
H
T
 
T
S
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
N
E
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
I
 
I
K
 
K
Y
 
Y
S
 
E
D
 
D
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
E
G
 
G
H
 
H
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
 
K
D
 
E
I
 
I
M
 
M
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
K
 
K
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
F
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
|
A
S
|
S
G
|
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
E
 
P
A
 
E
F
 
F
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
E
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
S
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Y
|
Y
K
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
H
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
T
 
T
D
|
D
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
M
 
M
T
 
T
T
 
T
I
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
A

P46354 Purine nucleoside phosphorylase 1; PNP 1; Inosine phosphorylase; Inosine-guanosine phosphorylase; Purine nucleoside phosphorylase I; PNP I; Pu-NPase I; EC 2.4.2.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:266/269 of query aligns to 1:267/271 of P46354

query
sites
P46354
M
 
M
L
 
K
E
 
D
K
 
R
I
 
I
Q
 
E
E
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
K
 
K
G
 
Q
K
 
N
M
 
L
H
 
P
T
 
E
S
 
S
P
 
P
E
 
K
T
 
I
A
 
G
I
 
L
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
E
E
 
N
K
 
P
Y
 
V
E
 
K
I
 
L
K
 
K
Y
 
Y
S
 
E
D
 
D
I
 
I
P
 
P
N
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
E
G
 
G
H
 
H
S
 
A
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
F
 
L
G
 
G
K
 
T
L
 
L
G
 
E
N
 
G
K
 
V
D
 
S
I
 
V
M
 
I
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
 
H
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
K
 
E
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
A
L
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
V
N
 
N
E
 
T
A
 
E
F
 
F
E
 
R
I
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
I
I
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
Y
 
F
F
 
M
P
 
G
E
 
T
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
I
G
 
G
K
 
P
N
 
N
-
 
E
I
 
A
P
 
D
Y
 
F
G
 
G
P
 
A
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
S
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
E
 
D
L
 
L
I
 
S
R
 
S
K
 
L
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
K
 
L
G
 
N
I
 
I
K
 
P
V
 
I
Q
 
Q
H
 
K
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
I
 
T
G
 
A
T
 
V
Q
 
T
G
 
G
P
 
P
T
 
S
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
K
 
R
L
 
F
F
 
L
H
 
R
I
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
H
C
 
A
G
 
G
I
 
M
K
 
R
V
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
V
 
C
I
 
I
T
 
S
D
 
N
L
 
A
G
 
A
V
 
A
E
 
G
G
 
I
K
 
L
I
 
D
V
 
Q
E
 
P
V
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
M
K
 
E
A
 
V
A
 
T
D
 
E
A
 
K
A
 
V
Q
 
K
P
 
A
K
 
G
M
 
F
T
 
L
T
 
K
I
 
L
M
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
I
I
 
V

4lnaA Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase i from spirosoma linguale dsm 74, nysgrc target 029362
53% identity, 100% coverage: 1:268/269 of query aligns to 2:268/269 of 4lnaA

query
sites
4lnaA
M
 
M
L
 
F
E
 
E
K
 
Q
I
 
I
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
A
 
T
A
 
Q
F
 
F
L
 
I
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
M
 
I
H
 
T
T
 
L
S
 
R
P
 
P
E
 
A
T
 
I
A
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
|
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
T
D
 
N
E
 
E
I
 
L
T
 
D
E
 
I
K
 
D
Y
 
T
E
 
T
I
 
I
K
 
P
Y
 
Y
S
 
E
D
 
T
I
 
I
P
 
P
N
 
H
F
 
F
P
 
P
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
L
F
 
I
G
 
G
K
 
T
L
 
L
G
 
G
N
 
G
K
 
K
D
 
S
I
 
V
M
 
V
A
 
V
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
M
 
M
K
 
Q
E
 
Q
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
H
E
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
T
 
T
L
 
L
F
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
M
N
 
N
E
 
P
A
 
T
F
 
F
E
 
Q
I
 
T
G
 
S
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
V
I
 
I
T
 
D
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
S
Y
 
L
F
 
L
-
 
L
P
 
P
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
I
G
 
C
K
 
P
N
 
N
I
 
P
P
 
P
-
 
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
D
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
S
E
 
E
A
 
P
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
E
 
S
L
 
L
I
 
I
R
 
D
K
 
L
A
 
A
D
 
F
E
 
S
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
D
I
 
I
K
 
P
V
 
L
Q
 
K
H
 
R
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
I
 
V
G
 
S
T
 
V
Q
 
T
G
 
G
P
 
P
T
 
Q
F
 
L
E
|
E
T
 
T
P
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
R
L
 
M
F
 
L
H
 
R
I
 
Q
L
 
W
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Q
C
 
L
G
 
G
I
 
M
K
 
D
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
T
 
T
D
|
D
L
 
L
G
x
C
V
 
F
E
 
P
G
 
D
K
 
T
I
 
L
V
 
E
E
 
K
V
 
A
S
 
E
H
x
L
E
 
V
E
 
K
V
 
I
Q
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
M
 
L
T
 
T
T
 
M
I
 
L
M
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
M
I
 
I
N
 
G
R
 
R

8swuA Structure of clostridium perfringens pnp bound to transition state analog immucillin h and sulfate (see paper)
51% identity, 98% coverage: 4:266/269 of query aligns to 7:266/269 of 8swuA

query
sites
8swuA
K
 
K
I
 
I
Q
 
K
E
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
E
F
 
Y
L
 
I
K
 
K
G
 
G
K
 
K
M
 
S
H
 
K
T
 
Y
S
 
N
P
 
P
E
 
T
T
 
I
A
 
G
I
 
L
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
D
K
 
A
Y
 
E
E
 
Y
I
 
F
K
 
P
Y
 
Y
S
 
N
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
T
 
T
V
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
F
G
 
Q
N
 
G
K
 
K
D
 
E
I
 
V
M
 
V
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
 
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
K
 
Q
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
C
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
A
T
 
V
N
 
N
E
 
K
A
 
D
F
 
Y
E
 
T
I
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
I
I
 
I
T
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
N
 
N
Y
 
L
F
 
S
P
 
G
E
 
S
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
L
-
 
N
P
 
E
Y
 
F
G
 
G
P
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
S
E
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
E
 
D
L
 
L
I
 
R
R
 
A
K
 
Q
A
 
V
D
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
N
K
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
E
V
 
V
Q
 
R
H
 
E
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
I
 
A
G
 
M
T
 
F
Q
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
T
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
K
 
R
L
 
M
F
 
A
H
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
I
A
 
A
N
 
N
H
 
H
C
 
S
G
 
G
I
 
M
K
 
K
V
 
V
F
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
S
V
 
C
I
 
M
T
 
T
D
x
N
L
 
M
G
 
A
V
 
A
E
 
G
G
 
I
K
 
L
I
 
E
V
 
Q
E
 
P
V
 
L
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
|
V
Q
 
M
K
 
E
A
 
T
A
 
S
D
 
A
A
 
K
A
 
V
Q
 
R
P
 
K
K
 
T
M
 
F
T
 
I
T
 
E
I
 
L
M
 
M
R
 
T
E
 
N
L
 
I
I
 
I

4nsnA Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase from porphyromonas gingivalis atcc 33277, nysgrc target 030972, orthorhombic symmetry
56% identity, 97% coverage: 6:266/269 of query aligns to 9:270/273 of 4nsnA

query
sites
4nsnA
Q
 
H
E
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
F
L
 
L
K
 
S
G
 
S
K
 
R
M
 
L
H
 
P
T
 
G
S
 
D
P
 
A
E
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
T
 
E
E
 
N
K
 
K
Y
 
T
E
 
V
I
 
I
K
 
P
Y
 
Y
S
 
N
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
H
F
 
F
P
 
A
V
 
Q
S
 
A
T
 
T
V
 
A
E
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
K
G
 
G
K
 
N
L
 
I
I
 
I
F
 
G
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
G
K
 
T
D
 
P
I
 
V
M
 
V
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
K
 
D
E
 
Q
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
K
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
N
L
 
L
F
 
F
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
I
N
 
N
E
 
T
A
 
S
F
 
F
E
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
I
I
 
I
T
 
C
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
Y
 
N
F
 
L
P
 
P
E
 
-
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
I
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
M
P
 
D
-
 
M
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
T
E
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
E
L
 
F
I
 
I
R
 
A
K
 
K
A
 
A
D
 
K
E
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
K
 
L
G
 
N
I
 
I
K
 
P
V
 
V
Q
 
K
H
 
E
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
T
 
L
Q
 
T
G
 
G
P
 
P
T
 
S
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Y
|
Y
K
 
K
L
 
F
F
 
W
H
 
G
I
 
Q
L
 
V
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
I
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
T
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
M
S
 
S
V
 
V
I
 
I
T
|
T
D
x
N
L
 
E
G
 
G
V
 
Y
E
 
H
G
 
F
K
 
A
I
 
D
V
 
D
E
 
F
V
 
V
S
 
N
H
 
D
E
|
E
E
 
Q
-
 
D
V
 
V
Q
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
P
 
E
K
 
K
M
 
M
T
 
G
T
 
A
I
 
I
M
 
F
R
 
A
E
 
R
L
 
L
I
 
I

4m1eB Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase i from planctomyces limnophilus dsm 3776, nysgrc target 029364.
47% identity, 99% coverage: 4:268/269 of query aligns to 6:271/273 of 4m1eB

query
sites
4m1eB
K
 
R
I
 
I
Q
 
D
E
 
Q
T
 
A
A
 
T
A
 
A
F
 
K
L
 
I
K
 
S
G
 
Q
K
 
L
M
 
W
H
 
Q
T
 
G
S
 
E
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
G
I
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
|
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
E
E
 
Q
I
 
I
T
 
E
E
 
Q
K
 
D
Y
 
I
E
 
A
I
 
I
K
 
P
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
I
 
I
P
 
P
N
 
H
F
 
F
P
 
P
V
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
 
S
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
C
G
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
R
N
 
G
K
 
I
D
 
P
I
 
I
M
 
V
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
L
K
 
E
E
 
Q
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
K
E
 
A
L
 
M
G
 
G
I
 
V
K
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
L
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
I
N
|
N
E
 
P
A
x
Q
F
 
L
E
 
D
I
 
L
G
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
E
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
Y
 
L
F
 
M
P
 
P
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
D
-
 
E
P
 
E
Y
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
S
E
 
H
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
K
 
C
E
 
Q
L
 
H
I
 
M
R
 
E
K
 
V
A
 
A
D
x
R
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
I
K
x
H
V
 
C
Q
x
P
H
 
K
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
I
 
V
G
 
A
T
 
V
Q
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
 
L
E
|
E
T
 
T
P
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
K
 
R
L
 
M
F
 
L
H
 
K
I
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
V
H
 
H
C
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
V
I
 
V
T
 
T
D
|
D
L
 
L
G
x
C
V
 
L
E
 
P
G
 
D
K
 
A
I
 
L
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
E
H
x
L
E
 
N
E
 
K
V
 
I
Q
 
L
K
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
R
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
K
 
K
M
 
L
T
 
A
T
 
R
I
 
L
M
 
I
R
 
P
E
 
E
L
 
I
I
 
L
N
 
P
R
 
R

4ns1A Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase from porphyromonas gingivalis atcc 33277, nysgrc target 30972
54% identity, 97% coverage: 6:266/269 of query aligns to 9:265/268 of 4ns1A

query
sites
4ns1A
Q
 
H
E
 
E
T
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
F
L
 
L
K
 
S
G
 
S
K
 
R
M
 
L
H
 
P
T
 
G
S
 
D
P
 
A
E
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
T
 
E
E
 
N
K
 
K
Y
 
T
E
 
V
I
 
I
K
 
P
Y
 
Y
S
 
N
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
H
F
 
F
P
 
A
V
 
Q
S
 
A
T
 
K
V
 
G
E
 
N
G
 
I
H
 
I
S
 
G
G
 
G
K
 
I
L
 
L
I
 
G
F
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
G
K
 
T
D
 
P
I
 
V
M
 
V
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
M
 
M
K
 
D
E
 
Q
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
R
 
K
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
N
L
 
L
F
 
F
V
 
V
S
 
S
N
 
N
A
|
A
S
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
I
N
 
N
E
 
T
A
 
S
F
 
F
E
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
M
 
M
I
 
I
I
 
I
T
 
C
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
Y
 
N
F
 
L
P
 
P
E
 
-
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
I
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
M
P
 
D
-
 
M
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
D
M
 
M
S
 
T
E
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
E
L
 
F
I
 
I
R
 
A
K
 
K
A
 
A
D
 
K
E
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
K
 
L
G
 
N
I
 
I
K
 
P
V
 
V
Q
 
K
H
 
E
G
 
G
I
 
V
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
T
 
L
Q
 
T
G
 
G
P
 
P
T
 
S
F
 
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Y
|
Y
K
 
K
L
 
F
F
 
W
H
 
G
I
 
Q
L
 
V
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
A
V
x
I
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
T
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
M
S
 
S
V
 
V
I
 
I
T
|
T
D
x
N
L
 
E
G
 
G
V
 
Y
E
 
H
G
 
F
K
 
A
I
 
D
V
 
D
E
 
F
V
 
V
S
 
N
H
 
D
E
|
E
E
 
Q
-
 
D
V
 
V
Q
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
P
 
E
K
 
K
M
 
M
T
 
G
T
 
A
I
 
I
M
 
F
R
 
A
E
 
R
L
 
L
I
 
I

1a9sA Bovine purine nucleoside phosphorylase complexed with inosine and sulfate (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 8:279/282 of 1a9sA

query
sites
1a9sA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
I
 
E
K
 
Q
-
 
R
-
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
|
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
T
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
|
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1a9qA Bovine purine nucleoside phosphorylase complexed with inosine (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 8:279/282 of 1a9qA

query
sites
1a9qA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
I
 
E
K
 
Q
-
 
R
-
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
T
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1a9tA Bovine purine nucleoside phosphorylase complexed with 9-deazainosine and phosphate (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 8:279/284 of 1a9tA

query
sites
1a9tA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
|
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
I
 
E
K
 
Q
-
 
R
-
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
T
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
|
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1b8oA Purine nucleoside phosphorylase (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 6:277/280 of 1b8oA

query
sites
1b8oA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
|
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
|
N
A
|
A
S
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
I
 
E
K
 
Q
-
 
R
-
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
Y
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
|
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1b8nA Purine nucleoside phosphorylase (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 7:278/278 of 1b8nA

query
sites
1b8nA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
Y
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
|
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1a9pA Bovine purine nucleoside phosphorylase complexed with 9-deazainosine and phosphate (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 8:279/289 of 1a9pA

query
sites
1a9pA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
|
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
|
N
A
|
A
S
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
T
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
|
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1a9oA Bovine purine nucleoside phosphorylase complexed with phosphate (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 8:279/289 of 1a9oA

query
sites
1a9oA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
|
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
|
N
A
|
A
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
 
F
E
 
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
x
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
T
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

P55859 Purine nucleoside phosphorylase; PNP; Inosine phosphorylase; Inosine-guanosine phosphorylase; EC 2.4.2.1 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
49% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 8:279/289 of P55859

query
sites
P55859
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
|
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
 
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
-
x
N
-
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
M
D
 
D
L
 
Y
G
 
E
V
 
S
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1fxuA Purine nucleoside phosphorylase from calf spleen in complex with n(7)- acycloguanosine inhibitor and a phosphate ion (see paper)
48% identity, 98% coverage: 3:266/269 of query aligns to 5:273/278 of 1fxuA

query
sites
1fxuA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
|
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
|
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
I
 
E
K
 
Q
-
 
R
-
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
|
T
D
x
N
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
K
I
x
V
V
 
I
-
 
M
-
 
D
-
 
T
-
 
G
E
 
K
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
|
V
Q
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L
T
 
E
T
 
Q
I
 
F
M
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
I
 
M

1lv8A Crystal structure of calf spleen purine nucleoside phosphorylase in a new space group with full trimer in the asymmetric unit (see paper)
52% identity, 86% coverage: 3:232/269 of query aligns to 6:241/265 of 1lv8A

query
sites
1lv8A
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
K
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
E
T
 
Q
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
L
 
C
G
|
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
T
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
|
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
x
E
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
I
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
F
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
|
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
N
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
E
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
H
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
L
Q
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
N
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
H
 
R
I
 
N
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
 
T
D
x
N

3inyA Crystal structure of human purine nucleoside phosphorylase in complex with 7-deazaguanine (see paper)
48% identity, 95% coverage: 3:258/269 of query aligns to 7:270/288 of 3inyA

query
sites
3inyA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
K
E
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
E
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
K
T
 
H
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
T
D
 
D
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
I
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
R
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
F
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
L
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
H
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
K
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
D
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
D
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
T
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
L
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
V
Q
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
S
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
V
F
 
L
H
 
Q
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
|
T
D
x
N
L
 
K
G
x
V
V
 
I
E
 
M
G
 
D
-
 
Y
-
 
E
K
 
S
I
 
L
V
 
E
E
 
K
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L

3d1vA Crystal structure of human pnp complexed with 2-mercapto(3h) quinazolinone (see paper)
48% identity, 95% coverage: 3:258/269 of query aligns to 7:270/288 of 3d1vA

query
sites
3d1vA
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
K
E
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
E
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
K
T
 
H
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
T
D
 
D
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
I
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
R
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
F
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
L
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
H
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
 
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
K
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
D
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
D
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
T
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
L
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
V
Q
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
S
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
V
F
 
L
H
 
Q
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
|
T
D
x
N
L
 
K
G
x
V
V
 
I
E
 
M
G
 
D
-
 
Y
-
 
E
K
 
S
I
 
L
V
 
E
E
 
K
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L

1yryE Crystal structure of human pnp complexed with mesg (see paper)
48% identity, 95% coverage: 3:258/269 of query aligns to 7:270/288 of 1yryE

query
sites
1yryE
E
 
E
K
 
D
I
 
Y
Q
 
K
E
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
E
F
 
W
L
 
L
K
 
L
G
 
S
K
 
H
M
 
T
H
 
K
T
 
H
S
 
R
P
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
C
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
A
 
T
D
 
D
E
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
A
Y
 
Q
E
 
I
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
R
S
 
S
T
 
T
V
 
V
E
 
P
G
 
G
H
|
H
S
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
F
L
 
L
G
 
N
N
 
G
K
 
R
D
 
A
I
 
C
M
 
V
A
 
M
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
F
H
|
H
Y
 
M
Y
|
Y
E
|
E
G
 
G
Y
 
Y
S
 
P
M
 
L
K
 
W
E
 
K
V
 
V
T
 
T
F
 
F
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
H
E
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
K
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
A
|
A
S
x
A
G
|
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
P
A
 
K
F
 
F
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
M
 
M
I
 
L
I
 
I
T
 
R
D
 
D
H
 
H
I
 
I
N
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
F
 
S
P
 
G
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
G
K
 
P
N
 
N
I
 
D
P
 
E
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
P
 
D
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
M
 
M
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
R
E
 
T
L
 
M
I
 
R
R
 
Q
K
 
R
A
 
A
D
 
L
E
 
S
I
 
T
A
 
W
Q
 
K
E
 
Q
K
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
I
 
R
K
 
E
V
 
L
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
I
 
V
G
 
M
T
 
V
Q
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
S
F
 
F
E
|
E
T
 
T
P
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
C
K
 
R
L
 
V
F
 
L
H
 
Q
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
A
N
 
R
H
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
L
K
 
R
V
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
S
V
 
L
I
 
I
T
|
T
D
x
N
L
 
K
G
 
V
V
 
I
E
 
M
G
 
D
-
 
Y
-
 
E
K
 
S
I
 
L
V
 
E
E
 
K
V
 
A
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
K
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
A
P
 
Q
K
 
K
M
 
L

Query Sequence

>351409 FitnessBrowser__Btheta:351409
MLEKIQETAAFLKGKMHTSPETAIILGTGLGSLADEITEKYEIKYSDIPNFPVSTVEGHS
GKLIFGKLGNKDIMAMQGRFHYYEGYSMKEVTFPVRVMRELGIKTLFVSNASGGTNEAFE
IGDLMIITDHINYFPEHPLRGKNIPYGPRFPDMSEAYDKELIRKADEIAQEKGIKVQHGI
YIGTQGPTFETPAEYKLFHILGADAVGMSTVPEVIVANHCGIKVFGISVITDLGVEGKIV
EVSHEEVQKAADAAQPKMTTIMRELINRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory