SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 351657 FitnessBrowser__Btheta:351657 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 2 hits to proteins with known functional sites (download)

12asA Asparagine synthetase mutant c51a, c315a complexed with l-asparagine and amp (see paper)
48% identity, 92% coverage: 23:340/345 of query aligns to 9:326/327 of 12asA

query
sites
12asA
I
 
I
K
 
S
Q
 
F
I
 
V
K
 
K
E
 
S
F
 
H
F
 
F
Q
 
S
L
 
R
N
 
Q
L
 
L
S
 
E
S
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
L
 
L
R
 
I
R
 
E
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
V
 
S
L
 
R
K
 
V
G
 
G
M
 
D
G
 
G
I
 
T
N
 
Q
D
|
D
D
 
N
L
 
L
N
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
E
R
 
K
P
 
A
V
 
V
S
 
Q
F
 
V
P
 
K
I
 
V
K
 
K
D
 
A
L
 
L
G
 
P
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
V
H
 
H
S
|
S
L
 
L
A
|
A
K
 
K
W
 
W
K
|
K
R
 
R
L
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
Y
 
H
N
 
D
I
 
F
E
 
S
P
 
A
G
 
G
Y
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
T
 
T
D
 
H
M
 
M
N
 
K
A
 
A
I
 
L
R
|
R
S
 
P
D
 
D
E
 
E
E
 
D
-
 
R
L
 
L
G
 
S
N
 
P
L
|
L
H
 
H
S
|
S
L
 
V
Y
 
Y
V
|
V
D
 
D
Q
|
Q
W
 
W
D
|
D
W
 
W
E
 
E
R
 
R
V
 
V
I
 
M
T
 
G
N
 
D
E
 
G
D
 
E
R
 
R
N
 
Q
V
 
F
E
 
S
F
 
T
L
 
L
K
 
K
E
 
S
I
 
T
V
 
V
N
 
E
R
 
A
I
 
I
Y
 
W
A
 
A
A
 
G
M
 
I
I
 
K
R
 
A
T
 
T
E
 
E
Y
 
A
M
 
A
V
 
V
Y
 
S
E
 
E
M
 
E
Y
 
F
P
 
-
Q
 
G
I
 
L
K
 
A
P
 
P
C
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
K
 
Q
L
 
I
H
 
H
F
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
S
L
 
R
Y
 
Y
P
 
P
N
 
D
L
 
L
E
 
D
P
 
A
K
 
K
C
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
Q
 
K
K
 
D
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
F
I
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
G
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
H
K
 
R
H
 
H
D
 
D
G
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
|
Y
D
 
D
D
 
D
Y
 
W
T
 
S
S
 
T
T
 
P
G
 
S
L
 
E
N
 
L
N
 
G
L
 
H
P
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
L
 
I
L
 
L
L
 
V
W
 
W
D
 
N
D
 
P
V
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
D
S
 
A
I
 
F
E
|
E
L
|
L
S
|
S
S
|
S
M
 
M
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
D
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
H
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
E
 
L
E
 
T
N
 
G
E
 
D
E
 
E
E
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
E
L
 
L
Y
 
E
F
 
W
H
 
H
K
 
Q
R
 
A
L
 
L
M
 
L
D
 
R
D
 
G
T
 
E
L
 
M
P
 
P
L
 
Q
S
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
I
 
I
G
|
G
Q
 
Q
S
 
S
R
|
R
L
 
L
C
 
T
M
 
M
F
 
L
Y
 
L
L
 
L
R
 
Q
K
 
L
A
 
P
H
 
H
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
I
 
V
W
 
W
P
 
P
E
 
A
D
 
A
M
 
V
R
 
R
K
 
E
E
 
S
C
 
V
E
 
P
E
 
S
L
 
L

11asA Asparagine synthetase mutant c51a, c315a complexed with l-asparagine (see paper)
48% identity, 92% coverage: 23:340/345 of query aligns to 9:326/327 of 11asA

query
sites
11asA
I
 
I
K
 
S
Q
 
F
I
 
V
K
 
K
E
 
S
F
 
H
F
 
F
Q
 
S
L
 
R
N
 
Q
L
 
L
S
 
E
S
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
L
 
L
R
 
I
R
 
E
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
V
 
S
L
 
R
K
 
V
G
 
G
M
 
D
G
 
G
I
 
T
N
 
Q
D
|
D
D
 
N
L
 
L
N
 
S
G
 
G
I
 
A
E
 
E
R
 
K
P
 
A
V
 
V
S
 
Q
F
 
V
P
 
K
I
 
V
K
 
K
D
 
A
L
 
L
G
 
P
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
F
E
 
E
V
 
V
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
|
A
K
 
K
W
 
W
K
 
K
R
 
R
L
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
G
D
 
Q
Y
 
H
N
 
D
I
 
F
E
 
S
P
 
A
G
 
G
Y
 
E
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
T
 
T
D
 
H
M
 
M
N
 
K
A
 
A
I
 
L
R
|
R
S
 
P
D
 
D
E
 
E
E
 
D
-
 
R
L
 
L
G
 
S
N
 
P
L
 
L
H
 
H
S
 
S
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
Q
|
Q
W
 
W
D
 
D
W
 
W
E
 
E
R
 
R
V
 
V
I
 
M
T
 
G
N
 
D
E
 
G
D
 
E
R
 
R
N
 
Q
V
 
F
E
 
S
F
 
T
L
 
L
K
 
K
E
 
S
I
 
T
V
 
V
N
 
E
R
 
A
I
 
I
Y
 
W
A
 
A
A
 
G
M
 
I
I
 
K
R
 
A
T
 
T
E
 
E
Y
 
A
M
 
A
V
 
V
Y
 
S
E
 
E
M
 
E
Y
 
F
P
 
-
Q
 
G
I
 
L
K
 
A
P
 
P
C
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
K
 
Q
L
 
I
H
 
H
F
 
F
I
 
V
H
 
H
S
 
S
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
S
L
 
R
Y
 
Y
P
 
P
N
 
D
L
 
L
E
 
D
P
 
A
K
 
K
C
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
Q
 
K
K
 
D
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
F
I
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
G
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
H
K
 
R
H
 
H
D
 
D
G
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
D
Y
|
Y
D
 
D
D
 
D
Y
 
W
T
 
S
S
 
T
T
 
P
G
 
S
L
 
E
N
 
L
N
 
G
L
 
H
P
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
L
 
I
L
 
L
L
 
V
W
 
W
D
 
N
D
 
P
V
 
V
L
 
L
Q
 
E
R
 
D
S
 
A
I
 
F
E
|
E
L
 
L
S
 
S
S
|
S
M
 
M
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
D
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
H
Q
 
Q
L
 
L
K
 
A
E
 
L
E
 
T
N
 
G
E
 
D
E
 
E
E
 
D
R
 
R
L
 
L
K
 
E
L
 
L
Y
 
E
F
 
W
H
 
H
K
 
Q
R
 
A
L
 
L
M
 
L
D
 
R
D
 
G
T
 
E
L
 
M
P
 
P
L
 
Q
S
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
R
 
R
L
 
L
C
 
T
M
 
M
F
 
L
Y
 
L
L
 
L
R
 
Q
K
 
L
A
 
P
H
 
H
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
I
 
V
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
I
 
V
W
 
W
P
 
P
E
 
A
D
 
A
M
 
V
R
 
R
K
 
E
E
 
S
C
 
V
E
 
P
E
 
S
L
 
L

Query Sequence

>351657 FitnessBrowser__Btheta:351657
MSYLIKPKNYKPLLDLKQTELGIKQIKEFFQLNLSSELRLRRVTAPLFVLKGMGINDDLN
GIERPVSFPIKDLGDAQAEVVHSLAKWKRLTLADYNIEPGYGIYTDMNAIRSDEELGNLH
SLYVDQWDWERVITNEDRNVEFLKEIVNRIYAAMIRTEYMVYEMYPQIKPCLPQKLHFIH
SEELRQLYPNLEPKCREHAICQKYGAVFIIGIGCKLSDGKKHDGRAPDYDDYTSTGLNNL
PGLNGDLLLWDDVLQRSIELSSMGVRVDREALQRQLKEENEEERLKLYFHKRLMDDTLPL
SIGGGIGQSRLCMFYLRKAHIGEIQASIWPEDMRKECEELDIHLI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory