SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607199 FitnessBrowser__Dino:3607199 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 95% coverage: 1:238/250 of query aligns to 5:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
L
T
 
Q
S
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
V
L
 
F
L
 
M
E
 
K
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
V
M
 
I
I
 
A
D
|
D
R
x
F
D
 
N
G
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
G
A
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
G
 
A
L
 
N
D
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
V
G
 
F
I
 
I
D
 
R
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
P
 
R
E
 
E
A
 
S
V
 
V
E
 
H
G
 
R
M
 
L
I
 
V
A
 
E
E
 
N
T
 
V
L
 
A
R
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
T
D
 
R
F
x
D
G
 
S
P
 
M
I
 
L
E
 
S
E
x
K
T
 
M
S
 
T
F
 
V
A
 
D
R
 
Q
W
 
F
K
 
Q
T
 
Q
V
 
V
M
 
I
E
 
N
T
 
V
N
|
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
T
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
M
-
 
A
K
 
E
A
 
Q
T
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
T
R
 
Y
A
 
G
S
x
N
T
x
V
L
 
G
R
x
Q
V
 
T
A
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
L
 
K
Q
 
T
Q
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
V
x
T
R
 
E
T
|
T
K
 
A
L
x
M
A
 
V
M
 
A
A
 
E
V
 
V
H
 
-
S
 
P
Q
 
E
E
 
K
I
 
V
I
 
I
D
 
E
A
x
K
Y
 
M
H
 
K
D
 
A
A
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
N
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
S
 
K
E
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
H
R
 
E
A
 
S
S
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
A
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 94% coverage: 3:238/250 of query aligns to 4:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
S
 
T
K
 
K
T
 
S
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
T
 
I
T
 
A
K
 
L
L
 
Q
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
E
G
 
G
W
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
V
I
 
N
D
 
Y
R
 
A
D
 
G
G
 
S
P
 
K
A
 
E
L
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
Q
 
K
G
 
G
L
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
-
H
 
F
G
 
A
I
 
I
D
 
Q
C
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
D
 
D
P
 
A
E
 
D
A
 
E
V
 
V
E
 
K
G
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
K
E
 
E
T
 
V
L
 
V
R
 
S
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
D
 
R
F
 
D
G
 
N
P
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
F
 
E
A
 
Q
R
 
E
W
 
W
K
 
D
T
 
D
V
 
V
M
 
I
E
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
V
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
-
 
M
L
 
L
K
 
R
A
 
Q
T
 
R
K
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
G
S
 
N
T
 
P
L
 
G
R
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
V
T
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
S
Q
 
A
A
 
A
V
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
V
 
I
R
 
V
T
 
S
K
 
D
L
 
M
A
 
T
M
 
D
A
 
A
V
 
L
H
 
-
S
 
S
Q
 
D
E
 
E
I
 
L
I
 
K
D
 
E
A
 
Q
Y
 
M
H
 
L
D
 
T
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
A
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
S
 
Q
E
 
D
Q
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
T
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
A
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 96% coverage: 1:240/250 of query aligns to 5:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
L
T
 
T
S
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
T
 
A
T
 
V
K
 
Q
L
 
A
L
 
F
L
 
L
E
 
G
R
 
Q
G
 
Q
W
 
A
K
 
N
V
 
V
A
 
V
M
 
V
I
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
D
G
 
-
P
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
M
-
 
V
-
 
R
-
 
K
Q
 
E
G
 
N
L
 
N
D
 
D
G
 
R
V
 
L
H
 
H
G
 
F
I
 
V
D
 
Q
C
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
P
 
E
E
 
A
A
 
A
V
 
C
E
 
Q
G
 
H
M
 
A
I
 
V
A
 
E
E
 
S
T
 
A
L
 
V
R
 
H
E
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
A
 
E
D
 
I
F
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
D
W
 
W
K
 
N
T
 
K
V
 
V
M
 
L
E
 
Q
T
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
V
 
S
Q
 
K
A
 
H
A
 
A
T
 
L
P
 
K
-
 
H
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
T
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
I
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
V
A
 
A
S
 
W
T
 
P
L
 
D
R
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
G
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
S
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
-
x
I
-
x
I
-
 
D
-
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
N
T
 
E
K
 
K
L
 
S
A
 
F
M
 
L
A
 
E
V
 
N
H
 
N
S
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
K
D
 
K
A
 
E
Y
 
K
H
 
A
D
 
K
A
 
V
I
 
N
P
 
P
L
 
L
N
 
L
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
S
 
K
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
T
A
 
A

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
36% identity, 94% coverage: 3:238/250 of query aligns to 1:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
S
 
T
K
 
K
T
 
S
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
T
 
I
T
 
A
K
 
L
L
 
Q
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
E
G
 
G
W
 
Y
K
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
V
I
x
N
D
x
Y
R
x
A
D
x
G
G
x
S
P
 
K
A
 
E
L
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
Q
 
K
G
 
G
L
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
-
H
 
F
G
 
A
I
 
I
D
 
Q
C
x
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
D
P
 
A
E
 
D
A
 
E
V
 
V
E
 
K
G
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
K
E
 
E
T
 
V
L
 
V
R
 
S
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
T
D
 
R
F
 
D
G
 
N
P
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
F
 
E
A
 
Q
R
 
E
W
 
W
K
 
D
T
 
D
V
 
V
M
 
I
E
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
V
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
-
 
M
L
 
L
K
 
R
A
 
Q
T
 
R
K
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
G
S
 
N
T
 
P
L
 
G
R
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
V
T
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
S
Q
 
A
A
 
A
V
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
 
I
R
 
V
T
 
S
K
 
D
L
 
M
A
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
T
Q
 
D
E
 
E
I
 
L
I
 
K
D
 
E
A
 
Q
Y
 
M
H
 
L
D
 
T
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
A
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
S
 
Q
E
 
D
Q
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
T
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
A
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
36% identity, 96% coverage: 1:240/250 of query aligns to 5:226/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
M
 
L
T
 
T
S
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
T
 
A
T
 
V
K
 
Q
L
 
A
L
 
F
L
 
L
E
 
G
R
 
Q
G
 
Q
W
 
A
K
 
N
V
 
V
A
 
V
M
 
V
I
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
D
G
 
-
P
 
E
A
 
A
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
M
-
 
V
-
 
R
-
 
K
Q
 
E
G
 
N
L
 
N
D
 
D
G
 
R
V
 
L
H
 
H
G
 
F
I
 
V
D
 
Q
C
x
T
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
P
 
E
E
 
A
A
 
A
V
 
C
E
 
Q
G
 
H
M
 
A
I
 
V
A
 
E
E
 
S
T
 
A
L
 
V
R
 
H
E
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
E
D
 
I
F
 
V
G
 
A
P
 
P
I
 
I
E
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
D
W
 
W
K
 
N
T
 
K
V
 
V
M
 
L
E
 
Q
T
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
V
 
S
Q
 
K
A
 
H
A
 
A
T
 
L
P
 
K
-
 
H
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
T
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
I
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
V
A
 
A
S
 
W
T
 
P
L
 
D
R
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
G
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
S
Q
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
I
I
|
I
D
 
D
A
 
T
Y
 
L
H
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
S
 
K
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
A
L
 
I
A
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
T
A
 
A

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
37% identity, 96% coverage: 3:241/250 of query aligns to 7:246/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
S
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
M
 
L
I
 
A
D
|
D
R
x
W
D
 
A
G
 
K
P
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
K
-
 
G
-
 
R
V
 
A
H
 
M
G
 
A
I
 
V
D
 
H
C
x
I
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
K
M
 
M
I
 
M
A
 
N
E
 
E
T
 
V
L
 
A
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
 
V
A
 
H
D
 
V
F
 
A
G
 
G
P
 
S
I
 
V
E
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
I
A
 
D
R
 
D
W
 
W
K
 
R
T
 
R
V
 
I
M
 
A
E
 
G
T
 
V
N
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
V
 
S
Q
 
K
A
 
F
A
 
A
T
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
G
A
 
G
S
 
D
T
 
W
L
 
G
R
 
A
V
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
T
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
R
Q
 
A
Q
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
V
 
V
R
 
K
T
 
T
K
 
N
L
 
M
A
 
T
M
 
N
A
 
G
V
 
-
H
 
W
S
 
P
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
R
D
 
D
A
 
K
Y
 
F
H
 
N
D
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
N
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
S
 
E
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
A
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
A
E
 
T
A
 
A
T
 
S

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
37% identity, 96% coverage: 3:241/250 of query aligns to 5:244/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
S
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
M
 
L
I
 
A
D
|
D
R
x
W
D
x
A
G
 
K
P
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
K
-
 
G
-
 
R
V
 
A
H
 
M
G
 
A
I
 
V
D
 
H
C
x
I
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
K
M
 
M
I
 
M
A
 
N
E
 
E
T
 
V
L
 
A
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
A
 
H
D
 
V
F
 
A
G
 
G
P
 
S
I
 
V
E
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
I
A
 
D
R
 
D
W
 
W
K
 
R
T
 
R
V
 
I
M
 
A
E
 
G
T
x
V
N
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
V
 
S
Q
 
K
A
 
F
A
 
A
T
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
G
A
 
G
S
 
D
T
 
W
L
 
G
R
 
A
V
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
R
Q
 
A
Q
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
S
P
x
L
V
|
V
R
 
K
T
|
T
K
x
N
L
x
M
A
x
T
M
 
N
A
 
G
V
 
-
H
 
W
S
 
P
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
R
D
 
D
A
 
K
Y
 
F
H
 
N
D
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
N
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
S
 
E
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
A
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
A
E
 
T
A
 
A
T
 
S

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 3:241/250 of query aligns to 5:244/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
S
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
M
 
L
I
 
A
D
|
D
R
x
W
D
x
A
G
 
K
P
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
K
-
 
G
-
 
R
V
 
A
H
 
M
G
 
A
I
 
V
D
 
H
C
x
I
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
K
M
 
M
I
 
M
A
 
N
E
 
E
T
 
V
L
 
A
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
V
A
 
H
D
 
V
F
 
A
G
 
G
P
 
S
I
 
V
E
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
I
A
 
D
R
 
D
W
 
W
K
 
R
T
 
R
V
 
I
M
 
A
E
 
G
T
x
V
N
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
V
 
S
Q
 
K
A
 
F
A
 
A
T
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
S
|
S
G
 
G
L
 
L
R
 
G
A
 
G
S
 
D
T
 
W
L
 
G
R
 
A
V
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
R
Q
 
A
Q
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
S
P
x
L
V
|
V
R
 
K
T
|
T
K
x
N
L
x
M
A
x
T
M
 
N
A
 
G
V
 
-
H
 
W
S
 
P
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
R
D
 
D
A
 
K
Y
 
F
H
 
N
D
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
N
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
S
 
E
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
A
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
A
E
 
T
A
 
A
T
 
S

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
37% identity, 96% coverage: 3:241/250 of query aligns to 5:244/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
S
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
R
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
R
L
 
F
L
 
S
E
 
A
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
I
V
 
V
A
 
V
M
 
L
I
 
A
D
|
D
R
 
W
D
 
A
G
 
K
P
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
P
G
 
K
-
 
G
-
 
R
V
 
A
H
 
M
G
 
A
I
 
V
D
 
H
C
 
I
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
P
 
H
E
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
K
M
 
M
I
 
M
A
 
N
E
 
E
T
 
V
L
 
A
R
 
E
E
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
H
D
 
V
F
 
A
G
 
G
P
 
S
I
 
V
E
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
S
F
 
I
A
 
D
R
 
D
W
 
W
K
 
R
T
 
R
V
 
I
M
 
A
E
 
G
T
 
V
N
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
V
L
 
F
C
 
C
V
 
S
Q
 
K
A
 
F
A
 
A
T
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
T
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
C
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
|
S
I
x
V
S
|
S
G
 
G
L
 
L
R
 
G
A
 
G
S
 
D
T
 
W
L
 
G
R
 
A
V
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
G
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
R
Q
 
A
Q
 
M
A
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
H
G
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
V
|
V
R
 
K
T
|
T
K
 
N
L
 
M
A
 
T
M
 
N
A
 
G
V
 
-
H
 
W
S
 
P
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
x
R
D
|
D
A
x
K
Y
 
F
H
 
N
D
 
E
A
 
R
I
 
I
P
 
A
L
 
L
N
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
S
 
E
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
L
 
I
A
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
A
E
 
T
A
 
A
T
 
S

Sites not aligning to the query:

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
38% identity, 95% coverage: 3:240/250 of query aligns to 2:249/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
S
 
S
K
 
R
T
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
R
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
T
 
A
K
 
T
L
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
A
R
 
R
G
 
G
W
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
A
I
 
L
D
|
D
R
x
L
D
 
S
G
 
A
P
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
T
L
 
A
Q
 
R
G
 
T
-
 
H
-
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
L
 
A
D
 
D
G
 
K
V
 
V
H
 
L
G
 
R
I
 
V
D
 
R
C
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
D
 
D
P
 
E
E
 
G
A
 
D
V
 
V
E
 
N
G
 
A
M
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
A
T
 
T
L
 
M
R
 
E
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
A
 
S
D
 
E
F
 
A
G
 
G
P
 
V
I
 
L
E
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
F
 
V
A
 
E
R
 
Q
W
 
F
K
 
D
T
 
K
V
 
V
M
 
M
E
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
D
 
R
G
 
G
P
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
G
V
 
C
Q
 
R
A
 
A
A
 
V
T
 
L
P
 
P
-
 
H
A
 
M
L
 
L
K
 
L
A
 
Q
T
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
A
G
 
S
L
 
L
R
 
V
A
 
A
S
x
F
T
 
P
L
 
G
R
|
R
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
S
Q
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
E
 
G
H
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
P
x
M
V
x
I
R
 
E
T
|
T
K
x
P
L
x
M
A
x
T
M
 
Q
A
x
W
V
x
R
H
 
L
S
 
D
Q
 
Q
-
 
P
E
 
E
I
 
L
I
 
R
D
 
D
A
 
Q
Y
 
V
H
 
L
D
 
A
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
N
 
K
R
 
E
Y
 
I
G
 
G
S
 
T
E
 
A
Q
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
G
E
 
E
R
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
F
 
Y
E
 
T
A
 
A

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
38% identity, 95% coverage: 3:240/250 of query aligns to 2:249/250 of Q56840

query
sites
Q56840
S
 
S
K
 
R
T
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
T
 
A
K
 
T
L
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
A
R
 
R
G
 
G
W
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
A
M
 
A
I
 
L
D
|
D
R
 
L
D
 
S
G
 
A
P
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
T
L
 
A
Q
 
R
G
 
T
-
 
H
-
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
L
 
A
D
 
D
G
 
K
V
 
V
H
 
L
G
 
R
I
 
V
D
 
R
C
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
D
 
D
P
 
E
E
 
G
A
 
D
V
 
V
E
 
N
G
 
A
M
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
A
T
 
T
L
 
M
R
 
E
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
A
 
S
D
 
E
F
 
A
G
 
G
P
 
V
I
 
L
E
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
F
 
V
A
 
E
R
 
Q
W
 
F
K
 
D
T
 
K
V
 
V
M
 
M
E
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
D
 
R
G
 
G
P
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
G
V
 
C
Q
 
R
A
 
A
A
 
V
T
 
L
P
 
P
-
 
H
A
 
M
L
 
L
K
 
L
A
 
Q
T
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
A
G
 
S
L
 
L
R
 
V
A
 
A
S
 
F
T
 
P
L
 
G
R
|
R
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
S
Q
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
E
 
G
H
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
M
V
x
I
R
x
E
T
|
T
K
x
P
L
x
M
A
 
T
M
 
Q
A
x
W
V
x
R
H
 
L
S
 
D
Q
 
Q
-
 
P
E
 
E
I
 
L
I
x
R
D
 
D
A
 
Q
Y
 
V
H
 
L
D
 
A
A
x
R
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
N
 
K
R
 
E
Y
 
I
G
 
G
S
 
T
E
 
A
Q
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
G
E
 
E
R
 
D
A
 
A
S
 
T
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
F
 
Y
E
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5ha5D Crystal structure of an NAD-bound oxidoreductase from brucella ovis
38% identity, 96% coverage: 1:240/250 of query aligns to 4:243/244 of 5ha5D

query
sites
5ha5D
M
 
L
T
 
K
S
 
E
K
 
K
T
 
L
A
 
V
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
|
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
A
A
 
A
T
 
I
T
 
S
K
 
S
L
 
G
L
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
W
 
A
K
 
R
V
 
V
A
 
I
M
 
L
I
 
V
D
|
D
R
x
I
D
 
D
G
 
G
P
 
T
A
 
A
L
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
Q
 
T
G
 
A
L
 
K
D
 
G
G
 
F
V
 
V
-
 
A
H
 
E
G
 
G
I
 
H
D
 
A
C
x
L
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
A
M
 
L
I
 
A
A
 
D
E
 
D
T
 
I
L
 
L
R
 
S
E
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
D
 
G
F
 
R
G
 
A
P
 
A
I
 
F
E
 
D
E
 
Q
-
 
P
T
 
E
S
 
A
F
 
V
A
 
E
R
 
V
W
 
W
K
 
D
T
 
R
V
 
V
M
 
I
E
 
G
T
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
E
G
 
G
P
 
A
F
 
F
L
 
N
C
 
V
V
 
S
Q
 
H
A
 
A
A
 
L
T
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
V
V
 
V
N
 
H
I
 
L
A
 
C
S
|
S
I
 
V
S
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
V
A
 
S
S
 
G
T
 
G
L
 
S
R
 
T
V
 
A
A
 
G
Y
|
Y
G
 
V
T
 
V
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
R
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
Q
 
V
Q
 
M
A
 
A
V
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
A
E
 
P
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
|
G
P
 
I
V
x
M
R
 
M
T
x
S
K
 
E
L
 
M
A
 
A
M
 
V
A
 
A
V
 
G
H
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
I
 
T
D
 
D
A
 
W
Y
 
F
H
 
M
D
 
N
A
 
R
I
 
V
P
 
M
L
 
M
N
 
K
R
 
R
Y
 
I
G
 
G
S
 
E
E
 
T
Q
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
P
I
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
P
R
 
M
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
L
A
 
A

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
36% identity, 96% coverage: 1:240/250 of query aligns to 8:252/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
M
 
L
T
 
A
S
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
G
K
 
R
L
 
R
L
 
L
L
 
R
E
 
A
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
T
V
 
V
A
 
V
M
 
V
I
 
G
D
|
D
R
x
I
D
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
T
G
 
G
P
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
F
I
 
V
D
 
P
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
E
P
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
D
G
 
N
M
 
L
I
 
F
A
 
D
E
 
T
T
 
A
L
 
A
R
 
S
E
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
S
-
 
P
-
 
P
D
 
E
F
 
D
G
 
D
P
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
N
T
 
T
S
 
D
F
 
L
A
 
P
R
 
A
W
 
W
K
 
Q
T
 
R
V
 
V
M
 
Q
E
 
D
T
 
I
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
S
P
 
V
F
 
Y
L
 
L
-
 
S
C
 
C
V
 
R
Q
 
A
A
 
A
A
 
L
T
 
R
P
 
H
A
 
M
L
 
V
K
 
P
A
 
A
T
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
F
S
 
V
G
 
A
L
 
V
R
 
M
A
 
G
S
 
S
-
 
A
T
 
T
L
 
S
R
x
Q
V
 
I
A
 
S
Y
|
Y
G
 
T
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
Q
 
A
L
 
M
T
 
S
L
 
R
Q
 
E
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
L
 
Y
G
 
A
E
 
R
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
 
G
P
|
P
V
|
V
R
 
N
T
 
T
K
 
P
L
 
L
A
 
L
M
 
Q
A
 
E
V
 
L
H
 
F
S
 
A
Q
 
K
E
 
D
I
 
P
I
 
E
D
 
R
A
 
A
Y
 
A
H
 
R
D
 
R
-
 
L
-
 
V
A
 
H
I
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
G
R
 
R
Y
 
F
G
 
A
S
 
E
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
T
L
 
F
A
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
E
 
S
A
 
S

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
34% identity, 96% coverage: 1:241/250 of query aligns to 4:252/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
M
 
L
T
 
R
S
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
R
|
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
F
A
 
G
T
 
I
T
 
A
K
 
Q
L
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
E
R
 
A
G
 
G
W
 
C
K
 
S
V
 
V
A
 
V
M
 
V
I
 
A
D
x
S
R
|
R
D
 
N
G
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
A
A
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
G
 
K
L
 
L
D
 
T
G
 
E
V
 
K
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
D
 
E
-
 
T
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
R
C
|
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
N
P
 
Y
E
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
K
G
 
K
M
 
L
I
 
L
A
 
E
E
 
A
T
 
V
L
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
V
x
I
A
 
N
D
 
R
F
 
R
G
 
H
P
 
P
I
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
F
S
 
P
F
 
L
A
 
D
R
 
E
W
 
F
K
 
R
T
 
Q
V
 
V
M
 
I
E
 
E
T
x
V
N
 
N
L
 
L
D
 
F
G
 
G
P
 
T
-
 
Y
F
 
Y
L
 
V
C
 
C
V
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
F
T
 
S
P
 
L
A
 
L
L
 
R
K
 
E
A
 
S
T
 
D
K
 
N
G
 
P
A
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
I
 
L
S
 
T
G
 
V
L
 
E
R
 
E
A
 
V
S
 
T
T
 
M
L
 
P
R
 
N
V
x
I
-
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
A
Q
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
W
G
 
G
E
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
I
C
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
W
V
x
Y
R
 
R
T
|
T
K
 
K
L
x
M
A
x
T
M
 
E
A
 
A
V
 
V
H
 
F
S
 
S
Q
 
D
-
 
P
E
 
E
I
 
K
I
 
L
D
 
D
A
 
Y
Y
 
M
H
 
L
D
 
K
A
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
G
R
 
R
Y
 
T
G
 
G
S
 
V
E
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
K
E
 
G
A
 
V
I
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
E
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
F
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
E
 
T
A
 
A
T
 
N

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
35% identity, 96% coverage: 1:240/250 of query aligns to 3:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
M
 
L
T
 
D
S
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
V
T
 
A
K
 
H
L
 
S
L
 
Y
L
 
A
E
 
K
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
I
M
 
V
I
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
N
G
 
E
P
 
D
A
 
H
L
 
G
A
 
N
E
 
K
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
G
 
D
L
 
I
D
 
K
G
 
A
V
 
Q
H
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
F
I
 
V
D
 
K
C
x
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
D
 
N
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
V
E
 
E
G
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
K
E
 
R
T
 
T
L
 
V
R
 
E
E
 
I
F
 
Y
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
A
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
P
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
-
F
 
L
A
 
D
R
 
S
W
 
W
K
 
R
T
 
K
V
 
V
M
 
L
E
 
S
T
 
I
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
Y
-
 
G
C
 
C
V
 
K
Q
 
Y
A
 
E
A
 
L
T
 
E
P
 
Q
A
 
M
L
 
E
K
 
K
A
 
N
T
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
I
 
I
S
 
H
G
 
G
L
 
I
R
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
P
L
 
L
R
 
S
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
N
Q
 
I
A
 
G
V
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
E
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
P
x
Y
V
x
I
R
 
E
T
 
T
K
 
P
L
|
L
A
 
L
M
 
E
A
 
S
V
 
L
H
 
-
S
 
T
Q
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
L
H
 
I
D
 
S
A
 
K
I
 
H
P
 
P
L
 
M
N
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
S
 
K
E
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
L
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
E
 
E
R
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
L
 
Y
A
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
T
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 95% coverage: 1:238/250 of query aligns to 3:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
L
T
 
Q
S
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
T
 
I
T
 
A
K
 
I
L
 
N
L
 
L
L
 
A
E
 
K
R
 
E
G
 
G
W
 
A
K
 
N
V
 
I
A
 
F
M
 
F
I
x
N
D
x
Y
R
x
N
D
x
G
G
x
S
P
 
P
A
 
E
L
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
T
Q
 
A
G
 
K
L
 
L
D
 
V
G
 
A
V
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
V
D
 
E
C
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
K
-
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
I
P
 
A
E
 
E
A
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
A
M
 
F
I
 
F
A
 
K
E
 
Q
T
 
A
L
 
I
R
 
E
E
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
A
 
T
D
 
R
F
 
D
G
 
N
P
 
L
I
 
L
E
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
F
 
E
A
 
D
R
 
E
W
 
W
K
 
D
T
 
D
V
 
V
M
 
I
E
 
N
T
x
I
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
V
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
T
 
S
-
 
R
P
 
T
A
 
M
L
 
M
K
 
K
A
 
Q
T
 
R
K
 
A
G
 
G
A
 
K
V
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
I
A
 
G
S
 
N
T
 
A
L
 
G
R
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
V
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
Q
 
T
Q
 
T
A
 
A
V
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
V
x
I
R
 
T
T
|
T
K
 
D
L
 
M
A
 
T
M
 
D
A
 
K
V
 
L
H
 
-
S
 
D
Q
 
E
E
 
K
I
 
T
I
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
M
H
 
L
D
 
A
A
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
G
R
 
A
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
T
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
E
 
D
R
 
A
A
 
S
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
S
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
34% identity, 95% coverage: 1:238/250 of query aligns to 5:245/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
M
 
L
T
 
R
S
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
I
T
 
A
K
 
E
L
 
R
L
 
F
L
 
V
E
 
D
R
 
E
G
 
G
W
 
S
K
 
K
V
 
V
A
 
I
M
 
D
I
 
L
D
 
S
R
 
I
D
 
H
G
 
D
P
 
P
A
 
G
L
 
E
A
 
A
E
 
K
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
Y
H