SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607217 FitnessBrowser__Dino:3607217 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

3u9eB The crystal structure of a possible phosphate acetyl/butaryl transferase (from listeria monocytogenes egd-e) in complex with coa.
43% identity, 47% coverage: 246:467/471 of query aligns to 69:286/288 of 3u9eB

query
sites
3u9eB
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
C
 
G
A
 
A
V
 
I
R
 
L
L
 
A
V
 
V
H
 
K
E
 
N
G
 
K
R
 
E
A
 
A
K
 
D
A
 
I
I
 
L
M
 
V
K
 
K
G
 
G
H
 
F
L
 
I
H
 
P
T
|
T
D
x
A
V
 
T
L
 
L
L
 
M
S
 
H
A
 
H
I
 
V
L
|
L
K
|
K
K
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
G
 
T
T
 
D
R
 
Q
R
x
L
L
|
L
S
 
S
H
 
Q
V
 
I
F
 
A
V
 
I
M
 
F
D
 
D
V
 
I
P
 
P
G
 
T
L
 
Y
D
 
H
H
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
D
 
D
A
 
C
A
 
A
I
x
M
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
T
K
 
K
T
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
A
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
H
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
T
M
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
E
T
x
E
V
 
V
N
 
T
P
 
A
A
 
K
I
 
M
P
 
P
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
I
 
E
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
M
 
H
A
 
F
E
 
-
R
 
G
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
T
 
S
G
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
D
N
 
V
A
 
A
V
 
I
D
 
S
L
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
H
K
|
K
G
 
G
I
 
I
I
 
T
S
 
D
K
 
S
V
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
V
 
A
P
 
P
N
 
N
M
 
I
E
 
E
A
 
T
G
 
G
N
|
N
M
 
A
L
 
L
A
 
Y
K
|
K
Q
 
S
L
 
L
T
 
V
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
H
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
A
V
 
V
M
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
C
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
x
I
N
x
S
S
|
S
R
|
R
A
 
N
D
|
D
N
 
S
D
 
P
K
 
E
A
 
N
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
C
 
F
A
 
I
I
 
L
A
 
T
A
 
V
L
 
R
L
 
L
V
 
V

3uf6A The crystal structure of a possible phosphate acetyl/butaryl transferase (from listeria monocytogenes egd-e) in complex with cod (3'-dephosphocoenzyme a)
43% identity, 47% coverage: 246:467/471 of query aligns to 67:284/285 of 3uf6A

query
sites
3uf6A
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
C
 
G
A
 
A
V
 
I
R
 
L
L
 
A
V
 
V
H
 
K
E
 
N
G
 
K
R
 
E
A
 
A
K
 
D
A
 
I
I
 
L
M
 
V
K
 
K
G
 
G
H
 
F
L
 
I
H
 
P
T
|
T
D
 
A
V
 
T
L
 
L
L
 
M
S
 
H
A
 
H
I
 
V
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
E
G
 
N
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
T
T
 
D
R
 
Q
R
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
Q
V
 
I
F
 
A
V
 
I
M
 
F
D
 
D
V
 
I
P
 
P
G
 
T
L
 
Y
D
 
H
H
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
T
D
 
D
A
 
C
A
|
A
I
x
M
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
T
K
 
K
T
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
A
I
 
I
T
 
T
Q
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
L
D
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
H
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
T
M
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
V
N
 
T
P
 
A
A
 
K
I
 
M
P
 
P
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
I
 
E
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
M
 
H
A
 
F
E
 
-
R
 
G
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
T
 
S
G
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
D
N
 
V
A
 
A
V
 
I
D
 
S
L
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
H
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
T
S
 
D
K
 
S
V
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
V
 
A
P
 
P
N
 
N
M
 
I
E
 
E
A
 
T
G
 
G
N
 
N
M
 
A
L
 
L
A
x
Y
K
|
K
Q
 
S
L
 
L
T
 
V
Y
 
Y
L
 
F
A
 
A
H
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
V
G
 
G
G
x
S
I
 
A
V
 
V
M
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
C
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
x
I
N
 
S
S
|
S
R
 
R
A
 
N
D
 
D
N
 
S
D
 
P
K
 
E
A
 
N
R
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
C
 
F
A
 
I
I
 
L
A
 
T
A
 
V
L
 
R
L
 
L
V
 
V

Q8ZND6 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.222; EC 2.3.1.8 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
27% identity, 54% coverage: 191:444/471 of query aligns to 406:686/714 of Q8ZND6

query
sites
Q8ZND6
V
 
V
V
 
V
A
 
L
P
 
P
E
 
E
-
 
G
-
 
D
E
 
E
P
 
P
D
 
R
A
 
T
L
 
V
A
 
K
G
 
A
T
 
A
I
 
A
L
 
I
G
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
R
T
 
G
L
 
I
I
 
A
T
 
T
P
 
C
L
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
P
D
 
D
R
 
E
I
 
I
A
 
N
A
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
K
 
Q
G
 
G
I
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
A
Y
 
G
E
 
I
I
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
D
P
 
P
H
 
E
H
 
V
K
 
V
A
 
R
A
 
E
A
 
S
A
 
Y
C
 
V
A
 
A
V
 
-
R
 
R
L
 
L
V
 
V
H
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
S
E
 
K
G
 
G
R
 
M
A
 
T
K
 
E
A
 
P
I
 
V
M
 
A
K
 
R
G
 
E
H
 
Q
L
 
L
H
 
E
T
 
D
D
 
N
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
G
A
 
T
I
 
L
L
 
M
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
D
K
 
E
K
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
L
L
 
V
R
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
H
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
N
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
G
T
 
S
R
 
S
R
 
L
L
 
V
S
 
S
H
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
F
M
 
M
D
 
L
V
 
L
P
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
E
H
 
Q
P
 
V
L
 
Y
F
 
V
I
 
Y
S
 
G
D
 
D
A
 
C
A
 
A
I
 
I
N
 
N
I
 
P
A
 
D
P
 
P
D
 
T
L
 
A
K
 
E
T
 
Q
K
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
I
T
 
A
Q
 
I
N
 
Q
A
 
S
I
 
A
D
 
D
L
 
S
A
 
A
L
 
I
A
 
A
I
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
E
M
 
-
P
 
P
K
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
Y
V
 
S
E
 
T
T
 
G
V
 
T
N
 
S
P
 
G
A
 
A
I
 
G
P
 
S
S
 
D
T
 
V
L
 
E
D
 
K
A
 
V
A
 
R
I
 
E
L
 
A
S
 
T
K
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
E
G
 
K
Q
 
R
I
 
-
T
 
P
G
 
D
G
 
L
L
 
M
V
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
Q
M
 
Y
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
M
L
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
A
R
 
K
T
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
P
I
 
N
S
 
S
K
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
D
 
T
I
 
V
L
 
F
I
 
I
V
 
F
P
 
P
N
 
D
M
 
L
E
 
N
A
 
T
G
 
G
N
 
N
M
 
T
L
 
T
A
 
Y
K
 
K
Q
 
A
L
 
V
T
 
Q
Y
 
R
L
 
S
A
 
A
H
 
D
-
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
I
G
 
G
G
 
P
I
 
M
V
 
L
M
 
Q
G
 
G
A
 
M
Q
 
R
C
 
K
P
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

O32472 (R)-specific enoyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.119 from Aeromonas caviae (Aeromonas punctata) (see 2 papers)
35% identity, 28% coverage: 23:152/471 of query aligns to 4:134/134 of O32472

query
sites
O32472
D
 
Q
D
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
Q
T
 
K
A
 
A
E
 
R
T
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
R
C
 
F
R
 
G
E
 
A
E
 
A
D
 
E
L
 
V
I
 
A
V
 
A
F
 
F
A
 
A
N
 
A
A
 
L
S
 
S
G
 
E
N
x
D
F
 
F
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
x
H
V
 
L
P
 
D
D
 
P
Q
 
A
D
 
F
G
 
A
D
 
A
G
 
T
D
 
T
G
 
A
V
 
F
P
 
E
E
 
R
A
 
P
V
 
I
A
 
V
P
 
H
A
 
G
M
 
M
W
 
L
V
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
F
S
|
S
S
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
Q
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
K
G
 
G
M
 
S
R
 
I
Y
 
Y
R
 
L
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
F
 
S
F
 
F
R
 
K
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
F
A
 
V
G
 
G
E
 
D
T
 
E
V
 
V
V
 
T
A
 
A
R
 
E
V
 
V
K
 
E
L
 
V
L
 
T
E
 
A
K
 
L
K
 
R
A
 
E
D
 
D
R
 
K
-
 
P
V
 
I
V
 
A
R
 
T
L
 
L
E
 
T
T
 
T
I
 
R
V
 
I
E
 
F
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
A
R
 
L
L
 
A
L
 
V
D
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
E
 
V
V
 
V
I
 
K
A
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P86397 Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial; HsHTD2; 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase; EC 4.2.1.59 from Homo sapiens (Human) (see paper)
27% identity, 28% coverage: 24:153/471 of query aligns to 35:164/168 of P86397

query
sites
P86397
D
 
H
L
 
I
E
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
D
T
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
L
S
 
R
R
 
R
L
 
A
C
 
F
R
 
T
E
 
Q
E
 
T
D
 
D
L
 
V
I
 
A
V
 
T
F
 
F
A
 
S
N
 
E
A
 
L
S
 
T
G
 
G
N
x
D
F
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
x
H
V
 
L
P
 
N
D
 
E
Q
 
D
D
 
F
G
 
A
D
 
K
G
 
H
D
 
T
G
 
K
V
 
F
P
 
G
E
 
N
A
 
T
V
 
I
A
 
V
P
 
H
A
 
G
M
 
V
W
 
L
V
 
I
A
 
N
S
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
S
S
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
T
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
C
R
 
V
Y
 
F
R
 
L
A
 
S
Q
 
Q
S
 
E
L
 
I
F
 
S
F
 
F
R
 
P
A
 
A
P
 
P
V
 
L
L
 
Y
A
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
R
 
S
V
 
A
K
 
E
L
 
V
L
 
-
E
 
-
K
 
K
K
 
K
A
 
L
D
 
K
R
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
A
L
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
S
E
 
C
T
 
S
I
 
V
V
 
I
E
 
E
T
 
S
Q
 
K
G
 
-
G
 
-
R
 
K
R
 
T
L
 
V
L
 
M
D
 
E
G
 
G
E
 
W
A
 
V
E
 
K
V
 
V
I
 
M
A
 
V
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

A0A3Q7HWE4 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase FERN, mitochondrial; 3-hydroxyl-ACP dehydratase FERN; Protein FERN-LIKE; SlFERN; EC 4.2.1.59 from Solanum lycopersicum (Tomato) (Lycopersicon esculentum) (see paper)
27% identity, 27% coverage: 25:153/471 of query aligns to 23:152/165 of A0A3Q7HWE4

query
sites
A0A3Q7HWE4
L
 
L
E
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
S
T
 
V
A
 
L
E
 
K
T
 
Q
S
 
A
R
 
R
L
 
T
C
 
F
R
 
A
E
 
D
E
 
D
D
 
D
L
 
V
I
 
L
V
 
G
F
 
Y
A
 
S
N
 
K
A
 
L
S
 
T
G
 
H
N
 
D
F
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
H
V
 
F
P
 
D
D
 
A
Q
 
E
D
 
C
G
 
A
D
 
K
G
 
N
D
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
T
E
 
D
A
 
C
V
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
G
M
 
M
W
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
F
S
 
P
S
 
R
V
 
I
L
 
I
G
 
A
N
 
A
K
 
H
L
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
A
G
 
-
M
 
-
R
 
I
Y
 
Y
R
 
V
A
 
S
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
F
 
H
F
 
F
R
 
K
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
Y
A
 
I
G
 
G
E
 
D
T
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
A
R
 
E
V
 
V
K
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
S
L
 
I
L
 
R
E
 
Q
K
 
I
K
 
K
A
 
N
D
 
K
R
 
Y
V
 
I
V
 
A
R
 
K
L
 
L
E
 
S
T
 
T
I
 
K
V
x
C
E
 
I
T
 
K
Q
 
R
G
 
D
G
 
G
R
 
P
R
 
L
L
 
V
L
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
A
 
A
E
 
T
V
 
A
I
 
M
A
 
L
P
 
P
E
 
S

1xcoD Crystal structure of a phosphotransacetylase from bacillus subtilis in complex with acetylphosphate (see paper)
28% identity, 52% coverage: 207:452/471 of query aligns to 39:309/325 of 1xcoD

query
sites
1xcoD
A
 
A
E
 
G
H
 
N
T
 
K
L
 
V
I
 
L
T
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
E
D
 
N
R
 
E
I
 
I
A
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
E
K
 
L
G
 
N
I
 
L
D
 
T
L
 
L
A
 
G
P
 
G
Y
 
V
E
 
K
I
 
I
I
 
Y
A
 
-
E
 
D
P
 
P
H
 
H
H
 
T
-
 
Y
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
x
R
-
x
R
-
 
K
-
 
G
K
|
K
A
 
A
A
 
T
A
 
E
A
 
E
C
 
Q
A
 
A
V
 
R
R
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
M
L
 
L
V
 
V
H
 
Y
E
 
K
G
 
G
R
 
L
A
 
A
K
 
D
A
 
G
I
 
L
M
 
V
K
 
S
G
 
G
H
 
A
L
 
A
H
 
H
T
 
S
-
x
T
-
 
A
D
 
D
V
 
T
L
 
V
L
 
R
S
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
Q
I
 
I
L
 
I
K
|
K
K
 
T
D
 
K
G
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
K
G
 
K
T
 
T
R
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
S
H
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
M
 
M
D
 
-
V
 
A
P
 
R
G
 
G
L
 
E
D
 
E
H
 
Q
P
 
Y
L
 
V
F
 
F
I
 
-
S
 
A
D
 
D
A
 
C
A
 
A
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
S
K
 
Q
T
 
D
K
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
I
T
 
A
Q
 
I
N
 
E
A
 
S
I
 
A
D
 
N
L
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
M
I
 
F
G
 
D
V
 
I
T
 
E
M
 
-
P
 
P
K
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
F
V
 
S
E
 
T
T
 
K
V
 
G
N
 
S
P
 
A
A
 
K
I
 
S
P
 
D
S
 
E
T
 
T
L
 
E
D
 
K
A
 
V
A
 
A
I
 
D
L
 
A
S
 
V
K
 
K
M
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
E
G
 
K
-
 
A
-
 
P
Q
 
E
I
 
L
T
 
T
G
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
F
A
 
Q
M
 
F
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
F
D
 
V
L
 
P
A
 
S
A
 
V
A
 
A
R
 
E
T
 
K
K
 
K
G
 
A
I
 
P
I
 
D
S
 
S
K
 
E
V
 
I
A
 
K
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
I
 
V
V
 
F
P
 
P
N
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
N
M
 
I
L
 
G
A
x
Y
K
|
K
Q
 
I
L
 
A
T
 
Q
Y
 
R
L
 
L
A
 
G
H
 
N
A
 
F
D
 
E
A
 
A
-
 
V
G
 
G
G
 
P
I
 
I
V
 
L
M
 
Q
G
 
G
A
 
L
Q
x
N
C
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
N
L
 
D
N
 
L
S
|
S
R
|
R
A
 
G
D
 
C
N
 
N

6ioxA Crystal structure of porphyromonas gingivalis phosphotransacetylase in complex with acetyl-coa (see paper)
25% identity, 60% coverage: 191:471/471 of query aligns to 22:331/339 of 6ioxA

query
sites
6ioxA
V
 
I
V
 
V
A
 
L
P
 
P
E
 
E
-
 
G
-
 
L
E
 
E
P
 
P
D
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
E
G
 
A
T
 
A
I
 
D
L
 
R
G
 
L
A
 
M
E
 
A
H
 
D
T
 
K
L
 
V
I
 
V
T
 
N
P
 
I
L
 
I
L
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
N
P
 
V
D
 
D
R
 
S
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
I
 
L
D
 
K
L
 
N
A
 
L
P
 
D
Y
 
E
E
 
A
I
 
V
I
 
I
A
 
I
E
 
D
P
 
P
H
 
N
H
 
N
K
 
H
A
 
P
A
 
K
A
 
K
A
 
Q
C
 
Q
A
 
Y
V
 
T
R
 
D
L
 
L
V
 
L
H
 
L
E
 
Q
G
 
I
R
 
R
A
 
Q
K
 
K
A
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
E
I
 
L
M
 
V
K
 
E
G
 
N
H
 
P
L
 
L
H
 
Y
T
 
L
D
 
G
V
 
C
L
 
L
L
 
I
S
 
V
A
 
K
I
 
S
L
 
G
K
 
D
K
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
L
L
 
I
R
 
A
G
 
G
T
 
A
R
 
Q
R
 
N
-
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
P
-
 
A
-
x
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
M
-
 
T
-
x
S
L
x
V
S
 
S
H
 
G
V
 
T
F
 
F
V
 
L
M
 
L
D
 
F
V
 
T
P
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
L
 
K
D
 
D
H
 
G
P
 
L
L
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
A
D
 
D
A
 
C
A
|
A
I
x
V
N
 
I
I
 
P
A
 
N
P
 
P
D
 
T
L
 
A
K
 
D
T
 
E
K
 
L
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
T
 
A
Q
 
V
N
 
A
A
 
T
I
 
A
D
 
R
L
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
A
V
 
D
T
 
I
M
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
-
V
 
F
E
 
S
T
 
T
V
 
K
N
 
G
P
 
S
A
 
A
I
 
K
P
 
H
S
 
E
T
 
M
L
 
T
D
 
D
A
 
K
A
 
V
I
 
V
L
 
E
S
 
A
K
 
T
M
 
R
A
 
M
E
 
A
R
 
Q
G
 
E
Q
 
M
I
 
A
T
 
P
G
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
M
A
 
Q
M
 
A
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
V
L
 
E
A
 
R
A
 
V
A
 
A
R
 
A
T
 
L
K
 
K
G
 
A
I
 
P
I
 
G
S
 
S
K
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
L
I
 
V
V
 
F
P
 
P
N
 
T
M
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
I
L
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
L
L
 
V
T
 
E
Y
 
R
L
 
L
A
 
G
H
 
H
A
 
A
D
 
E
A
 
A
-
 
V
G
 
G
G
 
P
I
 
I
V
 
L
M
 
Q
G
 
G
A
 
M
Q
 
A
C
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
-
L
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
N
D
 
D
K
 
L
A
 
S
R
 
R
L
 
G
A
 
C
S
 
S
C
 
V
A
 
E
I
 
D
A
 
I
A
 
Y
L
 
R
L
 
M
V
 
V
G
 
A
A
 
I
T
 
T
A
 
A

P38503 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.8 from Methanosarcina thermophila (see 2 papers)
27% identity, 58% coverage: 199:469/471 of query aligns to 55:330/333 of P38503

query
sites
P38503
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
D
I
 
L
L
 
D
G
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
A
T
 
K
L
 
I
I
 
V
T
 
D
P
 
P
L
 
K
L
 
T
I
 
Y
G
 
E
D
 
K
P
 
K
D
 
D
R
 
E
I
 
Y
A
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
F
A
 
Y
E
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
H
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
T
L
 
L
A
 
E
-
 
N
P
 
A
Y
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
M
A
 
S
E
 
D
P
 
Y
H
 
V
H
 
Y
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
M
L
 
M
V
 
A
H
 
K
E
 
L
G
 
G
R
 
E
A
 
V
K
 
D
A
 
G
I
 
V
M
 
V
K
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
A
H
 
H
L
 
S
H
 
S
T
 
S
D
 
D
V
 
T
L
 
L
L
 
R
S
 
P
A
 
A
-
 
V
-
 
Q
I
 
I
L
 
V
K
 
K
K
 
T
D
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
A
R
 
A
R
 
L
L
 
A
S
 
S
H
 
A
V
 
F
F
 
F
V
 
I
M
 
I
D
 
S
V
 
V
P
 
P
-
 
D
-
x
C
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
L
 
S
D
 
D
H
 
G
P
 
T
L
 
F
F
 
L
I
 
F
S
 
A
D
 
D
A
 
S
A
 
G
I
 
M
N
 
V
I
 
E
A
 
M
P
 
P
D
 
S
L
 
V
K
 
E
T
 
D
K
 
V
A
 
A
D
 
N
I
 
I
T
 
A
Q
 
V
N
 
I
A
 
S
I
 
A
D
 
K
L
 
T
A
 
F
L
 
E
A
 
L
I
 
L
G
 
V
V
 
Q
T
 
D
M
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
A
I
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
-
V
 
Y
E
 
S
T
 
T
V
 
K
N
 
G
P
 
S
A
 
A
I
 
K
P
 
S
S
 
K
T
 
L
L
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
T
I
 
I
L
 
A
S
 
S
K
 
T
M
 
K
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
G
 
E
Q
 
L
I
 
A
T
 
P
G
 
D
G
 
I
L
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
Q
M
 
V
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
V
L
 
P
A
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
A
T
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
P
I
 
G
S
 
S
K
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
I
 
I
V
 
F
P
 
P
N
 
D
M
 
L
E
 
N
A
 
C
G
 
G
N
 
N
M
 
I
L
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
I
L
 
A
T
 
Q
Y
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
K
A
 
A
D
 
E
A
 
A
G
 
Y
G
 
G
-
 
P
I
 
I
V
 
T
M
 
Q
G
 
G
A
 
L
Q
 
A
C
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
N
L
 
D
N
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
G
D
 
C
N
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
D
R
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
A
C
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
C
L
 
V
L
 
Q
V
 
A
G
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2af3C Phosphotransacetylase from methanosarcina thermophila soaked with coenzyme a (see paper)
27% identity, 58% coverage: 199:469/471 of query aligns to 54:329/332 of 2af3C

query
sites
2af3C
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
D
I
 
L
L
 
D
G
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
A
T
 
K
L
 
I
I
 
V
T
 
D
P
 
P
L
 
K
L
 
T
I
 
Y
G
 
E
D
 
K
P
 
K
D
 
D
R
 
E
I
 
Y
A
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
F
A
 
Y
E
 
E
-
 
L
-
x
R
-
 
K
-
 
H
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
T
L
 
L
A
 
E
-
 
N
P
 
A
Y
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
M
A
 
S
E
 
D
P
 
Y
H
 
V
H
 
Y
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
F
A
 
A
V
 
V
R
 
M
L
 
M
V
 
A
H
 
K
E
 
L
G
 
G
R
 
E
A
 
V
K
 
D
A
 
G
I
 
V
M
 
V
K
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
A
H
 
H
L
 
S
H
x
S
T
 
S
D
 
D
V
 
T
L
|
L
L
 
R
S
 
P
A
 
A
-
x
V
-
 
Q
I
 
I
L
 
V
K
 
K
K
 
T
D
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
A
R
 
K
G
 
G
T
 
A
R
 
A
R
x
L
L
x
A
S
 
S
H
 
A
V
 
F
F
 
F
V
 
I
M
 
I
D
 
S
V
 
V
P
 
P
-
 
D
-
 
C
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
L
 
S
D
 
D
H
 
G
P
 
T
L
 
F
F
 
L
I
 
F
S
 
A
D
 
D
A
 
S
A
x
G
I
x
M
N
x
V
I
x
E
A
 
M
P
 
P
D
 
S
L
 
V
K
 
E
T
 
D
K
 
V
A
 
A
D
 
N
I
 
I
T
 
A
Q
 
V
N
 
I
A
 
S
I
 
A
D
 
K
L
 
T
A
 
F
L
 
E
A
 
L
I
 
L
G
 
V
V
 
Q
T
 
D
M
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
G
 
A
I
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
-
V
 
Y
E
 
S
T
 
T
V
 
K
N
 
G
P
 
S
A
 
A
I
 
K
P
 
S
S
 
K
T
 
L
L
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
T
I
 
I
L
 
A
S
 
S
K
 
T
M
 
K
A
 
L
E
 
A
R
 
Q
G
 
E
Q
 
L
I
 
A
T
 
P
G
 
D
G
 
I
L
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
Q
M
 
V
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
V
L
 
P
A
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
A
T
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
P
I
 
G
S
 
S
K
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
I
 
I
V
 
F
P
 
P
N
 
D
M
 
L
E
 
N
A
 
C
G
 
G
N
|
N
M
 
I
L
 
A
A
x
Y
K
|
K
Q
 
I
L
 
A
T
x
Q
Y
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
K
A
 
A
D
 
E
A
 
A
G
 
Y
G
|
G
-
x
P
I
 
I
V
x
T
M
 
Q
G
 
G
A
 
L
Q
 
A
C
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
N
L
x
D
N
x
L
S
|
S
R
 
R
A
 
G
D
 
C
N
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
D
R
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
A
C
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
C
L
 
V
L
 
Q
V
 
A
G
 
A
A
 
A

P76558 NADP-dependent malic enzyme; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
24% identity, 55% coverage: 188:444/471 of query aligns to 442:731/759 of P76558

query
sites
P76558
P
 
P
T
 
K
A
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
G
P
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
R
I
 
V
L
 
L
G
 
H
A
 
A
E
 
T
H
 
Q
T
 
E
L
 
L
I
 
V
T
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
K
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
R
P
 
P
D
 
N
R
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
M
A
 
R
A
 
I
A
 
Q
E
 
K
K
 
L
G
 
G
I
 
L
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
D
Y
 
F
E
 
E
I
 
I
I
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
E
A
 
S
E
 
D
P
 
P
H
 
R
H
 
F
K
 
K
A
 
E
A
 
Y
A
 
W
A
 
T
C
 
E
A
 
Y
V
 
F
R
 
Q
-
 
I
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
N
-
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
Q
E
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
A
K
 
D
A
 
A
I
 
M
M
 
I
K
 
C
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
Y
H
 
H
L
 
E
H
 
H
T
 
F
D
 
S
V
 
V
L
 
V
L
 
K
S
 
N
A
 
V
I
 
F
L
 
G
K
 
Y
K
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
V
R
 
H
R
 
T
L
 
A
S
 
G
H
 
A
V
 
M
F
 
N
V
 
A
M
 
L
D
 
L
V
 
L
P
 
P
G
 
S
L
 
G
D
 
N
H
 
-
P
 
-
L
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
Y
I
 
V
N
 
N
I
 
D
A
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
A
K
 
E
T
 
E
K
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
I
T
 
T
Q
 
L
N
 
M
A
 
A
I
 
A
D
 
E
L
 
T
A
 
V
L
 
R
A
 
R
I
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
E
M
 
-
P
 
P
K
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
H
V
 
S
E
 
N
T
 
F
V
 
G
N
 
S
P
 
S
A
 
D
I
 
C
P
 
P
S
 
S
T
 
S
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
S
K
 
K
M
 
M
A
 
R
E
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
V
R
 
R
G
 
E
Q
 
R
I
 
A
T
 
P
G
 
E
G
 
L
L
 
M
V
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
M
A
 
H
M
 
G
D
 
D
N
 
A
A
 
A
V
 
L
D
 
V
L
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
R
R
 
N
T
 
D
K
 
R
G
 
M
I
 
P
I
 
D
S
 
S
K
 
S
V
 
L
A
 
K
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
D
 
N
I
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
M
P
 
P
N
 
N
M
 
M
E
 
E
A
 
A
G
 
A
N
 
R
M
 
-
L
 
I
A
 
S
K
 
Y
Q
 
N
L
 
L
T
 
L
Y
 
R
L
 
V
A
 
S
H
 
S
A
 
S
D
 
E
A
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
V
G
 
G
G
 
P
I
 
V
V
 
L
M
 
M
G
 
G
A
 
V
Q
 
A
C
 
K
P
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3607217 FitnessBrowser__Dino:3607217
MCPRTLPAEPRLAEGRPMSSVFDDLEIGATAETSRLCREEDLIVFANASGNFNPLTVPDQ
DGDGDGVPEAVAPAMWVASLISSVLGNKLPGPGMRYRAQSLFFRAPVLAGETVVARVKLL
EKKADRVVRLETIVETQGGRRLLDGEAEVIAPETRIMLDAANVPGLLVQRHVHFERMILR
AEPLPPFPTAVVAPEEPDALAGTILGAEHTLITPLLIGDPDRIAAAAAEKGIDLAPYEII
AEPHHKAAAACAVRLVHEGRAKAIMKGHLHTDVLLSAILKKDGGLRGTRRLSHVFVMDVP
GLDHPLFISDAAINIAPDLKTKADITQNAIDLALAIGVTMPKVGILSAVETVNPAIPSTL
DAAILSKMAERGQITGGLVDGPLAMDNAVDLAAARTKGIISKVAGQADILIVPNMEAGNM
LAKQLTYLAHADAGGIVMGAQCPVILNSRADNDKARLASCAIAALLVGATA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory