SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607265 FitnessBrowser__Dino:3607265 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dlkA Crystal structure of atp-ca++ complex of purk: n5- carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 1:353/380 of 4dlkA

query
sites
4dlkA
M
 
M
T
 
T
E
 
R
P
 
I
L
 
I
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
M
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
C
 
I
H
 
A
I
 
V
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
K
A
 
N
P
 
S
P
 
P
A
 
C
G
 
A
Q
|
Q
V
 
V
A
|
A
E
 
D
A
 
I
V
 
E
T
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
R
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
|
E
F
|
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
D
T
 
Y
A
 
R
A
 
C
L
 
L
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
H
R
 
A
P
 
Y
I
 
L
H
 
P
P
 
Q
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
K
S
 
T
Q
 
Q
D
 
N
R
|
R
L
 
F
T
 
T
E
 
E
K
 
K
E
 
N
F
 
A
L
 
I
R
 
E
G
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
P
T
 
V
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
A
 
R
P
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
N
A
 
Q
A
 
E
G
 
Q
L
 
L
E
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
S
T
 
Y
P
 
P
A
 
S
I
 
V
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
T
R
 
T
L
 
G
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
T
 
V
R
 
V
L
 
L
T
 
R
A
 
S
P
 
E
G
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
R
A
 
K
A
 
L
M
 
A
A
 
N
G
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
E
 
P
F
|
F
S
 
E
H
 
K
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
S
Q
 
V
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
T
A
 
K
C
 
V
F
 
F
D
 
P
P
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
H
 
H
R
 
V
D
 
N
G
 
N
I
 
I
L
 
L
A
 
H
T
 
E
T
 
S
T
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
T
H
 
E
A
 
E
Q
 
L
R
 
S
T
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
K
R
 
V
I
 
L
L
 
A
N
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
E
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
E
|
E
L
 
M
F
|
F
V
 
A
T
 
T
R
 
A
G
 
D
G
 
G
L
 
E
I
 
I
-
 
Y
V
 
I
N
|
N
E
|
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
R
|
R
V
 
P
H
|
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
D
G
 
A
C
 
C
V
 
E
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
C
G
 
N
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
T
Q
 
N
R
 
L
H
 
L
A
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
E
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
H
M
 
I
D
 
E
R
 
G
V
 
V
-
 
L
P
 
R
E
 
Q
L
 
V
A
 
N
A
 
R
A
 
L
R
 
T
D
 
G
V
 
C
A
 
Y
L
 
L
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
|
K
A
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
Q
R
|
R
K
|
K
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
V
N
 
N

3r5hA Crystal structure of adp-air complex of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 1:353/383 of 3r5hA

query
sites
3r5hA
M
 
M
T
 
T
E
 
R
P
 
I
L
 
I
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
M
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
C
 
I
H
 
A
I
 
V
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
K
A
 
N
P
 
S
P
 
P
A
 
C
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
E
T
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
R
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
|
E
F
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
D
T
 
Y
A
 
R
A
 
C
L
 
L
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
H
R
 
A
P
 
Y
I
 
L
H
 
P
P
 
Q
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
K
S
 
T
Q
 
Q
D
 
N
R
|
R
L
 
F
T
 
T
E
 
E
K
 
K
E
 
N
F
 
A
L
 
I
R
 
E
G
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
P
T
 
V
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
A
 
R
P
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
N
A
 
Q
A
 
E
G
 
Q
L
 
L
E
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
S
T
 
Y
P
 
P
A
 
S
I
 
V
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
T
R
 
T
L
 
G
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
T
 
V
R
 
V
L
 
L
T
 
R
A
 
S
P
 
E
G
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
R
A
 
K
A
 
L
M
 
A
A
 
N
G
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
E
 
P
F
|
F
S
 
E
H
 
K
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
S
Q
 
V
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
T
A
 
K
C
 
V
F
 
F
D
 
P
P
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
H
 
H
R
 
V
D
 
N
G
x
N
I
 
I
L
 
L
A
 
H
T
 
E
T
 
S
T
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
T
H
 
E
A
 
E
Q
 
L
R
 
S
T
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
K
R
 
V
I
 
L
L
 
A
N
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
E
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
M
F
|
F
V
 
A
T
 
T
R
 
A
G
 
D
G
 
G
L
 
E
I
 
I
-
 
Y
V
 
I
N
|
N
E
|
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
R
|
R
V
 
P
H
 
H
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
D
G
 
A
C
 
C
V
 
E
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
C
G
 
N
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
T
Q
 
N
R
 
L
H
 
L
A
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
E
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
H
M
 
I
D
 
E
R
 
G
V
 
V
-
 
L
P
 
R
E
 
Q
L
 
V
A
 
N
A
 
R
A
 
L
R
 
T
D
 
G
V
 
C
A
 
Y
L
 
L
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
|
K
A
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
Q
R
|
R
K
 
K
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
V
N
 
N

3v4sB Crystal structure of adp-atp complex of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 2:354/381 of 3v4sB

query
sites
3v4sB
M
 
M
T
 
T
E
 
R
P
 
I
L
 
I
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
M
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
C
 
I
H
 
A
I
 
V
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
K
A
 
N
P
 
S
P
 
P
A
 
C
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
E
T
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
R
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
D
T
 
Y
A
 
R
A
 
C
L
 
L
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
H
R
 
A
P
 
Y
I
 
L
H
 
P
P
 
Q
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
K
S
x
T
Q
 
Q
D
 
N
R
|
R
L
 
F
T
 
T
E
|
E
K
 
K
E
 
N
F
 
A
L
 
I
R
 
E
G
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
P
T
 
V
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
A
 
R
P
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
N
A
 
Q
A
 
E
G
 
Q
L
 
L
E
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
S
T
 
Y
P
 
P
A
 
S
I
 
V
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
T
R
 
T
L
 
G
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
T
 
V
R
 
V
L
 
L
T
 
R
A
 
S
P
 
E
G
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
R
A
 
K
A
 
L
M
 
A
A
 
N
G
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
E
 
P
F
|
F
S
 
E
H
 
K
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
S
Q
 
V
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
T
A
 
K
C
 
V
F
 
F
D
 
P
P
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
H
|
H
R
 
V
D
 
N
G
x
N
I
 
I
L
 
L
A
 
H
T
 
E
T
 
S
T
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
T
H
 
E
A
 
E
Q
 
L
R
 
S
T
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
K
R
 
V
I
 
L
L
 
A
N
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
E
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
E
|
E
L
 
M
F
|
F
V
 
A
T
 
T
R
 
A
G
 
D
G
 
G
L
 
E
I
 
I
-
 
Y
V
 
I
N
 
N
E
|
E
I
x
L
A
 
A
P
 
P
R
|
R
V
 
P
H
|
H
N
|
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
D
G
 
A
C
 
C
V
 
E
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
C
G
 
N
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
T
Q
 
N
R
 
L
H
 
L
A
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
E
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
H
M
 
I
D
 
E
R
 
G
V
 
V
-
 
L
P
 
R
E
 
Q
L
 
V
A
 
N
A
 
R
A
 
L
R
 
T
D
 
G
V
 
C
A
 
Y
L
 
L
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
Q
R
 
R
K
 
K
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
V
N
 
N

3q2oB Crystal structure of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:351/357 of query aligns to 1:353/377 of 3q2oB

query
sites
3q2oB
M
 
M
T
 
T
E
 
R
P
 
I
L
 
I
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
M
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
C
 
I
H
 
A
I
 
V
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
K
A
 
N
P
 
S
P
 
P
A
 
C
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
E
T
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
R
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
D
T
 
Y
A
 
R
A
 
C
L
 
L
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
H
R
 
A
P
 
Y
I
 
L
H
 
P
P
 
Q
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
K
S
x
T
Q
 
Q
D
 
N
R
 
R
L
 
F
T
 
T
E
|
E
K
 
K
E
 
N
F
 
A
L
 
I
R
 
E
G
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
P
T
 
V
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
A
 
R
P
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
N
A
 
Q
A
 
E
G
 
Q
L
 
L
E
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
S
T
 
Y
P
 
P
A
 
S
I
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
T
R
 
T
R
 
T
L
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
R
 
V
L
 
L
T
 
R
A
 
S
P
 
E
G
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
R
A
 
K
A
 
L
M
 
A
A
 
N
G
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
K
F
 
W
V
 
V
E
 
P
F
 
F
S
 
E
H
 
K
E
 
E
V
 
V
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
S
Q
 
V
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
T
A
 
K
C
 
V
F
 
F
D
 
P
P
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
H
 
H
R
 
V
D
 
N
G
 
N
I
 
I
L
 
L
A
 
H
T
 
E
T
 
S
T
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
T
H
 
E
A
 
E
Q
 
L
R
 
S
T
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
K
R
 
V
I
 
L
L
 
A
N
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
E
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
M
F
 
F
V
 
A
T
 
T
R
 
A
G
 
D
G
 
G
L
 
E
I
 
I
-
 
Y
V
 
I
N
 
N
E
 
E
I
x
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
P
H
 
H
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
D
G
 
A
C
 
C
V
 
E
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
C
G
 
N
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
T
Q
 
N
R
 
L
H
 
L
A
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
E
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
H
M
 
I
D
 
E
R
 
G
V
 
V
-
 
L
P
 
R
E
 
Q
L
 
V
A
 
N
A
 
R
A
 
L
R
 
T
D
 
G
V
 
C
A
 
Y
L
 
L
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
Q
R
 
R
K
 
K
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
V
N
 
N

3v4sA Crystal structure of adp-atp complex of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
42% identity, 98% coverage: 2:351/357 of query aligns to 1:352/380 of 3v4sA

query
sites
3v4sA
T
 
T
E
 
R
P
 
I
L
 
I
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
M
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
C
 
I
H
 
A
I
 
V
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
K
A
 
N
P
 
S
P
 
P
A
 
C
G
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
E
T
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
R
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
I
V
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
D
T
 
Y
A
 
R
A
 
C
L
 
L
D
 
Q
V
 
W
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
H
R
 
A
P
 
Y
I
 
L
H
 
P
P
 
Q
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
K
S
 
T
Q
 
Q
D
 
N
R
|
R
L
 
F
T
 
T
E
 
E
K
 
K
E
 
N
F
 
A
L
 
I
R
 
E
G
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
P
T
 
V
A
 
A
P
 
T
F
 
Y
A
 
R
P
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
N
A
 
Q
A
 
E
G
 
Q
L
 
L
E
 
T
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
S
T
 
Y
P
 
P
A
 
S
I
 
V
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
T
R
 
T
L
 
G
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
T
 
V
R
 
V
L
 
L
T
 
R
A
 
S
P
 
E
G
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
R
A
 
K
A
 
L
M
 
A
A
 
N
G
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
E
 
P
F
 
F
S
 
E
H
 
K
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
S
Q
 
V
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
T
A
 
K
C
 
V
F
 
F
D
 
P
P
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
H
 
H
R
 
V
D
 
N
G
x
N
I
 
I
L
 
L
A
 
H
T
 
E
T
 
S
T
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
T
H
 
E
A
 
E
Q
 
L
R
 
S
T
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
K
R
 
V
I
 
L
L
 
A
N
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
E
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
M
F
|
F
V
 
A
T
 
T
R
 
A
G
 
D
G
 
G
L
 
E
I
 
I
-
 
Y
V
 
I
N
|
N
E
|
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
R
|
R
V
 
P
H
|
H
N
|
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
T
 
D
G
 
A
C
 
C
V
 
E
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
G
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
C
G
 
N
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
T
Q
 
N
R
 
L
H
 
L
A
 
K
D
 
P
V
 
V
V
 
V
M
 
M
E
 
V
N
 
N
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
E
D
 
H
M
 
I
D
 
E
R
 
G
V
 
V
-
 
L
P
 
R
E
 
Q
L
 
V
A
 
N
A
 
R
A
 
L
R
 
T
D
 
G
V
 
C
A
 
Y
L
 
L
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
E
E
 
E
T
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
Q
R
 
R
K
 
K
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
V
N
 
N

3aw8A Crystal structure of n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase from thermus thermophilus hb8
46% identity, 92% coverage: 21:349/357 of query aligns to 12:332/360 of 3aw8A

query
sites
3aw8A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
Y
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
S
C
 
F
H
 
R
I
 
F
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
P
A
 
E
P
 
A
P
 
C
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
G
E
 
E
A
 
L
V
 
V
T
 
V
T
 
G
A
 
E
G
 
F
Y
 
L
D
 
D
D
 
E
L
 
-
D
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
V
 
G
V
 
L
D
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
V
P
 
P
T
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
A
D
 
R
V
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
R
R
 
L
P
 
P
I
 
L
H
 
Y
P
 
P
G
 
P
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
V
S
 
A
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
R
E
 
E
K
 
K
E
 
T
F
 
F
L
 
F
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
Q
 
P
T
 
T
A
 
P
P
 
P
F
 
F
A
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
G
A
 
P
A
 
E
G
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
R
I
 
V
G
 
G
T
 
L
P
 
P
A
 
A
I
x
L
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
R
 
L
L
 
V
T
 
R
A
 
T
P
 
E
G
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
R
P
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
F
|
F
V
|
V
E
 
P
F
 
F
S
 
D
H
 
R
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
D
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
V
A
 
A
C
 
F
F
 
Y
D
 
P
P
 
L
G
 
V
E
 
E
N
 
N
V
 
R
H
|
H
R
 
W
D
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
R
T
 
L
T
 
S
T
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
P
-
 
G
L
 
A
S
 
S
H
 
E
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
T
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
E
L
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
L
R
 
R
I
 
A
L
 
M
N
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
L
G
 
A
V
 
L
E
|
E
L
 
F
F
|
F
V
 
Q
T
 
V
R
 
G
G
 
E
G
 
E
L
 
L
I
 
L
V
 
F
N
 
N
E
|
E
I
 
M
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
H
 
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
T
 
T
Q
 
I
T
 
E
G
 
G
C
 
A
V
 
E
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
N
H
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
L
G
 
G
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
S
G
 
T
Q
 
A
R
 
P
H
 
R
A
 
G
D
 
Q
V
 
S
V
 
A
M
 
M
E
 
V
N
 
N
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
-
D
 
E
M
 
K
D
 
P
R
 
P
V
 
F
P
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
L
A
 
K
A
 
V
R
 
E
D
 
G
V
 
A
A
 
H
L
 
L
H
 
H
L
 
W
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
-
T
 
V
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
K
|
K
M
 
V
G
 
G
H
 
H

3orqA Crystal structure of n5-carboxyaminoimidazole synthetase from staphylococcus aureus complexed with adp (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:349/357 of query aligns to 8:353/373 of 3orqA

query
sites
3orqA
L
 
L
A
 
K
P
 
F
G
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
K
M
 
M
L
 
M
S
 
A
M
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
C
 
V
H
 
V
I
 
V
F
 
L
E
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
E
A
 
D
P
 
C
P
 
P
A
 
C
G
 
R
Q
 
Y
V
 
V
A
 
A
E
 
H
A
 
E
V
 
F
T
 
I
T
 
Q
A
 
A
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
L
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
N
R
 
Q
F
 
L
A
 
G
E
 
Q
V
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
S
T
 
A
A
 
Q
A
 
Q
L
 
L
D
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
C
A
 
E
L
 
K
R
 
Y
P
 
N
I
 
I
H
 
P
P
 
Q
G
 
G
R
 
Y
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
Q
V
 
L
S
 
L
Q
 
Q
D
 
D
R
|
R
L
 
L
T
 
T
E
 
E
K
 
K
E
 
E
F
 
T
L
 
L
R
 
K
G
 
S
L
 
A
G
 
G
L
 
T
Q
 
K
T
 
V
A
 
V
P
 
P
F
 
F
A
 
I
P
 
S
V
 
V
D
 
K
D
 
E
A
 
S
A
 
T
G
 
D
L
 
I
E
 
D
A
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
Y
P
 
P
A
 
F
I
 
I
L
 
V
K
|
K
T
 
T
R
 
R
R
 
F
L
 
G
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
T
 
V
R
 
L
L
 
I
T
 
N
A
 
N
P
 
E
G
 
K
D
 
D
A
 
L
A
 
Q
E
 
E
A
 
G
L
 
F
A
 
K
A
 
L
M
 
I
A
 
E
G
 
T
A
 
S
P
 
E
A
 
C
I
 
V
L
 
A
E
|
E
G
 
K
F
x
Y
V
x
L
E
 
N
F
x
I
S
 
K
H
 
K
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
L
I
 
T
A
 
V
A
 
T
R
 
R
G
 
G
Q
 
N
D
 
N
G
 
N
A
 
Q
V
 
I
A
 
T
C
 
F
F
 
F
D
 
P
P
 
L
G
 
Q
E
 
E
N
 
N
V
 
E
H
|
H
R
 
R
D
 
N
G
 
Q
I
 
I
L
 
L
A
 
F
T
 
K
T
 
T
T
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
L
 
I
S
 
D
H
 
-
A
 
-
Q
 
K
R
 
T
T
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
K
L
 
E
L
 
Q
A
 
V
G
 
N
R
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
Q
A
 
S
L
 
I
D
 
H
Y
 
F
V
 
I
G
 
G
V
 
T
M
 
F
G
 
T
V
 
V
E
|
E
L
 
F
F
|
F
V
 
I
-
 
D
T
 
S
R
 
N
G
 
N
G
 
Q
L
 
L
I
 
Y
V
 
V
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
P
H
 
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
T
 
S
Q
 
I
T
 
E
G
 
A
C
 
C
V
 
D
I
 
Y
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
D
Q
 
T
H
 
H
I
 
I
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
T
G
 
G
W
 
Q
P
 
S
L
 
L
G
 
P
D
 
N
G
 
S
-
 
I
Q
 
E
R
 
L
H
 
L
A
 
K
D
 
P
V
 
A
V
 
V
M
 
M
E
 
M
N
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
K
D
 
D
M
 
L
D
 
D
R
 
L
V
 
L
P
 
E
-
 
N
E
 
E
L
 
F
A
 
N
A
 
E
A
 
H
R
 
P
D
 
E
V
 
W
A
 
H
L
 
L
H
 
H
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
K
|
K
A
 
S
E
 
E
T
 
R
R
 
K
A
 
D
G
 
S
R
|
R
K
|
K
M
 
M
G
 
G
H
 
H

5jqwA The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with adp
41% identity, 96% coverage: 11:351/357 of query aligns to 3:340/365 of 5jqwA

query
sites
5jqwA
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
E
C
 
F
H
 
H
I
 
C
F
 
L
E
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
G
A
 
-
P
 
D
P
 
C
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
T
T
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
L
D
 
T
D
 
K
L
 
V
D
 
N
A
 
D
L
 
V
R
 
V
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
K
V
 
Q
V
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
S
T
 
H
A
 
E
A
 
L
L
 
I
D
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
N
A
 
H
L
 
E
R
 
V
P
 
S
I
 
V
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
I
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
R
|
R
L
 
L
T
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
S
F
 
F
L
 
M
R
 
Q
G
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
Q
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
K
F
 
F
A
 
V
P
 
N
V
 
I
D
 
D
D
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
D
I
 
H
G
 
G
T
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
F
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
R
 
V
L
 
I
T
 
R
A
 
S
P
 
Q
G
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
W
A
 
D
A
 
V
M
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
P
-
 
D
-
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
G
 
A
F
 
F
V
|
V
E
 
D
F
 
F
S
 
D
H
 
Y
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
I
A
 
C
A
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
A
 
A
C
 
F
F
 
Y
D
 
P
P
 
L
G
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
T
H
|
H
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
I
A
 
V
T
 
E
T
 
S
T
 
E
V
 
A
P
 
P
-
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
V
S
 
V
H
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
A
D
 
Q
A
 
Q
V
 
I
L
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
K
R
 
I
I
 
L
L
 
V
N
 
K
A
 
E
L
 
F
D
 
A
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
L
 
F
F
|
F
V
 
V
T
 
K
R
 
G
G
 
D
G
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
H
 
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
T
 
S
Q
 
I
T
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
V
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
L
P
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
T
Q
 
T
R
 
S
H
 
R
A
 
K
D
 
-
V
 
T
V
 
V
M
 
M
E
 
L
N
 
N
L
 
C
I
 
I
G
 
G
S
 
G
D
 
-
M
 
M
D
 
P
R
 
A
V
 
T
P
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
D
D
 
R
V
 
V
A
 
K
L
 
I
H
 
H
L
 
S
Y
 
Y
G
 
N
K
 
K
A
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
R
K
|
K
M
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
L
N
 
N

4ma0A The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with partially hydrolysed atp
41% identity, 96% coverage: 11:351/357 of query aligns to 3:340/366 of 4ma0A

query
sites
4ma0A
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
E
C
 
F
H
 
H
I
 
C
F
 
L
E
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
G
A
 
-
P
 
D
P
 
C
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
T
T
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
L
D
 
T
D
 
K
L
 
V
D
 
N
A
 
D
L
 
V
R
 
V
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
K
V
 
Q
V
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
S
T
 
H
A
 
E
A
 
L
L
 
I
D
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
N
A
 
H
L
 
E
R
 
V
P
 
S
I
 
V
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
I
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
S
F
 
F
L
 
M
R
 
Q
G
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
Q
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
K
F
 
F
A
 
V
P
 
N
V
 
I
D
 
D
D
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
D
I
 
H
G
 
G
T
 
L
P
 
P
A
 
A
I
|
I
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
R
 
V
L
 
I
T
 
R
A
 
S
P
 
Q
G
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
W
A
 
D
A
 
V
M
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
P
-
 
D
-
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
E
|
E
G
x
A
F
|
F
V
|
V
E
 
D
F
 
F
S
 
D
H
 
Y
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
I
A
 
C
A
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
A
 
A
C
 
F
F
 
Y
D
 
P
P
 
L
G
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
T
H
|
H
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
I
A
 
V
T
 
E
T
 
S
T
 
E
V
 
A
P
 
P
-
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
V
S
 
V
H
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
A
D
 
Q
A
 
Q
V
 
I
L
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
K
R
 
I
I
 
L
L
 
V
N
 
K
A
 
E
L
 
F
D
 
A
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
L
 
F
F
|
F
V
 
V
T
 
K
R
 
G
G
 
D
G
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
H
 
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
T
 
S
Q
 
I
T
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
V
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
L
P
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
T
Q
 
T
R
 
S
H
 
R
A
 
K
D
 
-
V
 
T
V
 
V
M
 
M
E
 
L
N
 
N
L
 
C
I
 
I
G
 
G
S
 
G
D
 
-
M
 
M
D
 
P
R
 
A
V
 
T
P
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
D
D
 
R
V
 
V
A
 
K
L
 
I
H
 
H
L
 
S
Y
 
Y
G
 
N
K
 
K
A
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
R
K
|
K
M
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
L
N
 
N

4mamA The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with an adp analog, amp-cp
41% identity, 96% coverage: 11:351/357 of query aligns to 3:340/373 of 4mamA

query
sites
4mamA
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
E
C
 
F
H
 
H
I
 
C
F
 
L
E
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
G
A
 
-
P
 
D
P
 
C
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
T
T
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
L
D
 
T
D
 
K
L
 
V
D
 
N
A
 
D
L
 
V
R
 
V
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
K
V
 
Q
V
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
S
T
 
H
A
 
E
A
 
L
L
 
I
D
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
N
A
 
H
L
 
E
R
 
V
P
 
S
I
 
V
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
I
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
R
|
R
L
 
L
T
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
S
F
 
F
L
 
M
R
 
Q
G
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
Q
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
K
F
 
F
A
 
V
P
 
N
V
 
I
D
 
D
D
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
D
I
 
H
G
 
G
T
 
L
P
 
P
A
 
A
I
|
I
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Y
|
Y
D
 
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
T
 
F
R
 
V
L
 
I
T
 
R
A
 
S
P
 
Q
G
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
W
A
 
D
A
 
V
M
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
P
-
 
D
-
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
E
|
E
G
 
A
F
|
F
V
|
V
E
 
D
F
|
F
S
 
D
H
 
Y
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
I
A
 
C
A
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
A
 
A
C
 
F
F
 
Y
D
 
P
P
 
L
G
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
T
H
|
H
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
I
A
 
V
T
 
E
T
 
S
T
 
E
V
 
A
P
 
P
-
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
V
S
 
V
H
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
A
D
 
Q
A
 
Q
V
 
I
L
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
K
R
 
I
I
 
L
L
 
V
N
 
K
A
 
E
L
 
F
D
 
A
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
L
 
F
F
|
F
V
 
V
T
 
K
R
 
G
G
 
D
G
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
H
 
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
T
 
S
Q
 
I
T
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
V
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
L
P
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
T
Q
 
T
R
 
S
H
 
R
A
 
K
D
 
-
V
 
T
V
 
V
M
 
M
E
 
L
N
 
N
L
 
C
I
 
I
G
 
G
S
 
G
D
 
-
M
 
M
D
 
P
R
 
A
V
 
T
P
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
D
D
 
R
V
 
V
A
 
K
L
 
I
H
 
H
L
 
S
Y
 
Y
G
 
N
K
 
K
A
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
R
K
|
K
M
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
L
N
 
N

Sites not aligning to the query:

4ma5A The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with an atp analog, amp-pnp.
41% identity, 96% coverage: 11:351/357 of query aligns to 3:338/363 of 4ma5A

query
sites
4ma5A
I
 
I
G
 
G
M
 
I
L
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
E
C
 
F
H
 
H
I
 
C
F
 
L
E
 
G
P
 
K
G
 
N
A
 
G
A
 
-
P
 
D
P
 
C
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
K
A
 
T
V
 
V
T
 
T
T
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
L
D
 
T
D
 
K
L
 
V
D
 
N
A
 
D
L
 
V
R
 
V
R
 
A
F
 
W
A
 
A
E
 
K
V
 
Q
V
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
 
E
N
 
N
I
 
I
P
 
S
T
 
H
A
 
E
A
 
L
L
 
I
D
 
K
V
 
A
L
 
I
E
 
N
A
 
H
L
 
E
R
 
V
P
 
S
I
 
V
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
I
S
 
S
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
L
E
 
E
K
 
K
E
 
S
F
 
F
L
 
M
R
 
Q
G
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
Q
 
A
T
 
T
A
 
A
P
 
K
F
 
F
A
 
V
P
 
N
V
 
I
D
 
D
D
 
S
A
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
L
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
D
I
 
H
G
 
G
T
 
L
P
 
P
A
 
A
I
|
I
L
 
L
K
|
K
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
T
 
F
R
 
V
L
 
I
T
 
R
A
 
S
P
 
Q
G
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
W
A
 
D
A
 
V
M
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
P
-
 
D
-
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
G
 
A
F
|
F
V
|
V
E
 
D
F
 
F
S
 
D
H
 
Y
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
I
A
 
C
A
 
T
R
 
A
G
 
D
Q
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
A
 
A
C
 
F
F
 
Y
D
 
P
P
 
L
G
 
A
E
 
R
N
 
N
V
 
T
H
|
H
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
I
A
 
V
T
 
E
T
 
S
T
 
E
V
 
A
P
 
P
-
 
F
A
 
E
R
 
N
L
 
V
S
 
V
H
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
T
 
A
D
 
Q
A
 
Q
V
 
I
L
 
-
L
 
-
A
 
A
G
 
K
R
 
I
I
 
L
L
 
V
N
 
K
A
 
E
L
 
F
D
 
A
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
T
M
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
L
 
F
F
|
F
V
 
V
T
 
K
R
 
E
G
 
-
G
 
-
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
|
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
H
|
H
N
|
N
S
|
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
T
 
S
Q
 
I
T
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
V
I
 
T
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
N
H
 
H
I
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
L
P
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
T
Q
 
T
R
 
S
H
 
R
A
 
K
D
 
-
V
 
T
V
 
V
M
 
M
E
 
L
N
 
N
L
 
C
I
 
I
G
 
G
S
 
G
D
 
-
M
 
M
D
 
P
R
 
A
V
 
T
P
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
D
D
 
R
V
 
V
A
 
K
L
 
I
H
 
H
L
 
S
Y
 
Y
G
 
N
K
 
K
A
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
R
K
|
K
M
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
L
N
 
N

P09029 N5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase; N5-CAIR synthase; 5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthetase; EC 6.3.4.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
40% identity, 96% coverage: 11:351/357 of query aligns to 4:319/355 of P09029

query
sites
P09029
I
 
V
G
 
C
M
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
R
M
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
E
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
I
R
 
-
C
 
-
H
 
-
I
 
-
F
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
V
T
 
W
T
 
P
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
D
 
A
L
 
E
D
 
P
A
 
A
L
 
A
R
 
V
R
 
P
F
 
F
A
 
Q
E
 
Q
V
 
-
V
 
-
D
 
S
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
A
E
 
E
F
 
I
E
 
E
N
 
R
I
 
W
P
 
P
T
 
E
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
T
V
 
R
L
 
E
E
 
L
A
 
A
L
 
R
R
 
H
P
 
P
I
 
A
H
 
F
P
 
V
G
 
N
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
F
A
 
P
V
 
I
S
 
I
Q
 
A
D
 
D
R
|
R
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
L
 
F
R
 
D
G
 
K
L
 
L
G
 
H
L
 
L
Q
 
P
T
 
T
A
 
A
P
 
P
F
 
W
A
 
Q
P
 
L
V
 
L
D
 
A
D
 
E
A
 
R
A
 
S
G
 
E
L
 
W
E
 
P
A
 
A
A
 
V
L
 
F
A
 
D
A
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
V
K
|
K
T
 
R
R
 
R
R
 
T
L
 
G
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
G
|
G
K
x
R
G
|
G
Q
|
Q
T
 
W
R
 
R
L
 
L
T
 
R
A
 
A
P
 
-
G
 
-
D
 
N
A
 
E
A
 
T
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
A
 
A
M
 
E
A
 
C
G
 
Y
A
 
G
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
V
E
|
E
G
x
Q
F
x
G
V
x
I
E
 
N
F
 
F
S
 
S
H
 
G
E
|
E
V
 
V
S
 
S
V
 
L
I
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
F
D
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
T
A
 
V
C
 
F
F
 
Y
D
 
P
P
 
L
G
 
T
E
 
H
N
 
N
V
 
L
H
|
H
R
 
Q
D
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
A
 
R
T
 
T
T
 
S
T
 
V
V
 
A
P
 
F
A
 
P
R
 
Q
L
 
A
S
 
N
H
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
E
L
 
E
L
 
M
A
 
L
G
 
S
R
 
A
I
 
I
L
 
M
N
 
Q
A
 
E
L
 
L
D
 
G
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
M
 
M
G
 
A
V
 
M
E
 
E
L
 
C
F
 
F
V
 
V
T
 
T
R
 
P
G
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
I
N
|
N
E
|
E
I
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
V
H
 
H
N
 
N
S
 
S
G
 
G
H
 
H
W
 
W
T
 
T
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
C
 
A
V
 
S
I
 
I
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
L
H
 
H
I
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
T
G
 
D
W
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
P
D
 
Q
G
 
P
Q
 
V
R
 
V
H
 
N
A
 
N
D
 
P
V
 
S
V
 
V
M
 
M
E
 
I
N
 
N
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
M
 
V
D
 
N
R
 
Y
V
 
-
P
 
-
E
 
D
L
 
W
A
 
L
A
 
K
A
 
L
R
 
P
D
 
L
V
 
V
A
 
H
L
 
L
H
 
H
L
 
W
Y
 
Y
G
 
D
K
 
K
A
 
-
E
 
E
T
 
V
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
K
 
K
M
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
L
N
 
N

3ethA Crystal structure of e. Coli purk in complex with mgatp (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:351/357 of query aligns to 4:319/355 of 3ethA

query
sites
3ethA
I
 
V
G
 
C
M
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
L
S
 
R
M
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
E
R
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
I
R
 
-
C
 
-
H
 
-
I
 
-
F
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
V
T
 
W
T
 
P
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
D
 
A
L
 
E
D
 
P
A
 
A
L
 
A
R
 
V
R
 
P
F
 
F
A
 
Q
E
 
Q
V
 
-
V
 
-
D
 
S
V
 
V
I
 
I
T
 
T
Y
 
A
E
 
E
F
 
I
E
 
E
N
 
R
I
 
W
P
 
P
T
 
E
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
T
V
 
R
L
 
Q
E
 
L
A
 
A
L
 
R
R
 
H
P
 
P
I
 
A
H
 
F
P
 
V
G
 
N
R
 
R
R
 
D
A
 
V
L
 
F
A
 
P
V
 
I
S
 
I
Q
 
A
D
 
D
R
|
R
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
L
 
F
R
 
D
G
 
K
L
 
L
G
 
H
L
 
L
Q
 
P
T
 
T
A
 
A
P
 
P
F
 
W
A
 
Q
P
 
L
V
 
L
D
 
A
D
 
E
A
 
R
A
 
S
G
 
E
L
 
W
E
 
P
A
 
A
A
 
V
L
 
F
A
 
D
A
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
L
A
 
A
I
|
I
L
 
V
K
|
K
T
 
R
R
 
R
R
 
T
L
 
G
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
G
|
G
K
 
R
G
 
G
Q
|
Q
T
 
W
R
 
R
L
 
L
T
 
R
A
 
A
P
 
-
G
 
-
D
 
N
A
 
E
A
 
T
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
P
A
 
A
M
 
E
A
 
C
G
 
Y
A
 
G
P
 
E
A
 
C
I
 
I
L
 
V
E
 
E
G
 
Q
F
 
G
V
x
I
E
 
N