SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607536 Dshi_0948 L-lactate dehydrogenase (cytochrome) (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P05414 Glycolate oxidase; GAO; GOX; Short chain alpha-hydroxy acid oxidase; EC 1.1.3.15 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 4 papers)
36% identity, 96% coverage: 4:376/390 of query aligns to 3:354/369 of P05414

query
sites
P05414
I
 
I
T
 
T
E
 
N
I
 
V
E
 
N
D
 
E
L
 
Y
K
 
E
R
 
A
I
 
I
Y
 
A
K
 
K
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
 
Y
E
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
E
T
 
D
E
 
Q
Q
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
E
N
 
N
S
 
R
S
 
N
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
I
K
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
L
M
 
I
D
 
D
M
 
V
D
 
T
N
 
N
R
 
I
S
 
D
T
 
M
K
 
T
T
 
T
T
 
T
M
 
I
V
 
L
G
 
G
Q
 
F
E
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
M
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
K
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
S
K
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
I
F
 
M
T
 
T
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
H
 
T
T
 
G
E
 
P
T
 
G
P
 
I
F
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
V
x
L
Y
|
Y
T
 
V
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
N
F
 
V
M
 
V
K
 
A
R
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
G
C
 
F
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
I
 
L
T
|
T
V
 
V
D
 
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
H
 
E
R
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
M
 
-
M
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
F
 
E
G
 
G
N
 
I
I
 
D
V
 
L
G
 
G
H
 
K
A
 
M
K
 
D
G
 
K
V
 
A
T
 
N
D
 
D
P
 
-
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
S
S
 
S
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
G
A
 
Q
F
 
I
D
 
D
Q
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
S
W
 
W
E
 
K
R
 
D
I
 
V
K
 
A
Q
 
W
F
 
L
R
 
Q
S
 
T
W
 
I
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
L
A
 
A
L
 
V
N
 
Q
V
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
V
S
|
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
Y
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
M
M
 
A
L
 
L
P
 
E
Q
 
E
I
 
V
M
 
V
D
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
K
 
R
I
 
I
E
 
P
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
x
V
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
F
I
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
V
T
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
K
R
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
M
I
 
M
H
 
R
K
 
D
E
 
E
L
 
F
D
 
E
L
 
L
S
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
R
S
 
S
V
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
I
D
 
S
A
 
R
S
 
S
N
 
H
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6gmcA 1.2 a resolution structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and 4-carboxy-5-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-1,2,3-thiadiazole
35% identity, 96% coverage: 1:374/390 of query aligns to 2:356/360 of 6gmcA

query
sites
6gmcA
M
 
L
P
 
P
V
 
R
I
 
L
T
 
I
E
 
C
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
x
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
|
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
S
 
N
I
 
F
A
 
S
N
 
T
M
 
L
M
 
S
T
x
F
K
 
S
V
 
P
Q
 
E
W
 
E
G
 
N
L
 
F
G
 
G
M
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
|
L
S
 
A
S
 
A
W
x
Y
T
x
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
 
R
S
 
R
W
 
L
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

6gmbA Structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and glycolate
36% identity, 96% coverage: 1:374/390 of query aligns to 2:358/362 of 6gmbA

query
sites
6gmbA
M
 
L
P
 
P
V
 
R
I
 
L
T
 
I
E
 
C
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
R
I
 
M
A
 
K
N
 
N
M
 
F
M
 
E
T
 
T
K
 
S
V
 
T
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
S
G
 
F
T
 
S
K
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
 
R
S
 
R
W
 
L
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

Q9UJM8 2-Hydroxyacid oxidase 1; HAOX1; Glycolate oxidase; GO; GOX; Glyoxylate oxidase; EC 1.1.3.15; EC 1.2.3.5 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
36% identity, 96% coverage: 1:374/390 of query aligns to 2:358/370 of Q9UJM8

query
sites
Q9UJM8
M
 
L
P
 
P
V
 
R
I
 
L
T
 
I
E
 
C
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
 
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
 
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
 
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
R
I
 
M
A
 
K
N
 
N
M
 
F
M
 
E
T
 
T
K
 
S
V
 
T
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
S
G
 
F
T
 
S
K
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
 
R
S
 
R
W
 
L
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
|
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
x
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

2rduA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with glyoxylate (see paper)
36% identity, 96% coverage: 2:374/390 of query aligns to 1:356/360 of 2rduA

query
sites
2rduA
P
 
P
V
 
R
I
 
L
T
 
I
E
 
C
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
R
I
 
M
A
 
K
N
 
N
M
 
F
M
 
E
T
 
T
K
 
S
V
 
T
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
S
G
 
F
T
 
S
K
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
 
R
S
 
R
W
 
L
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

5zzqA The crystal structure of mandelate oxidase with (s)-4-hydroxymandelic acid (see paper)
38% identity, 93% coverage: 7:368/390 of query aligns to 4:342/355 of 5zzqA

query
sites
5zzqA
I
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
A
K
 
R
R
 
D
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
G
M
 
E
F
 
I
Y
 
F
D
 
D
Y
x
F
A
x
L
E
 
A
S
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
A
T
 
S
F
 
L
R
 
V
E
 
A
N
 
N
S
 
R
S
 
T
D
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
R
L
 
V
K
 
F
L
 
V
R
 
I
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
D
M
 
L
D
 
T
N
 
D
R
 
V
S
 
T
T
 
T
K
 
E
T
 
I
T
 
D
M
 
I
V
 
F
G
 
G
Q
 
R
E
 
R
V
 
A
A
 
A
M
 
L
P
 
P
V
 
M
A
 
A
L
 
V
A
|
A
P
|
P
V
|
V
G
x
A
L
 
Y
T
 
Q
G
 
R
M
 
L
Q
 
F
H
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
D
F
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
T
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
M
x
L
S
 
S
I
 
S
C
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
V
T
 
G
E
 
G
T
 
R
P
 
P
F
 
-
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
W
L
 
L
K
 
R
D
 
D
D
 
E
D
 
K
F
 
R
M
 
S
K
 
L
R
 
D
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
D
A
 
A
K
 
G
C
 
C
S
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
V
Q
 
P
L
 
W
L
x
M
G
 
G
Q
 
R
R
|
R
H
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
M
K
 
R
N
 
N
G
 
G
L
 
F
S
 
A
A
 
L
P
 
P
P
 
E
K
 
W
L
 
V
T
 
T
P
 
A
A
 
A
S
 
N
I
 
-
A
 
-
N
 
-
M
 
-
M
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
D
G
 
A
N
 
G
I
 
T
V
 
A
G
 
A
H
 
H
A
 
R
K
 
R
G
 
-
V
 
T
T
 
Q
D
 
G
P
 
V
S
 
S
S
 
A
L
 
V
S
 
A
S
 
D
W
 
H
T
|
T
A
 
A
E
 
R
A
 
E
F
|
F
D
 
A
Q
 
P
S
 
A
L
 
-
D
 
T
W
 
W
E
 
E
R
 
S
I
 
V
K
 
E
Q
 
A
F
 
V
R
 
R
S
 
A
W
 
H
W
 
T
D
 
D
G
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
A
P
 
V
E
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
A
 
G
I
 
I
V
 
V
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
P
S
 
G
I
 
I
R
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
G
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
D
 
G
K
 
G
I
 
C
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
V
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
S
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
V
T
 
M
Y
 
W
G
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
R
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
L
I
 
L
H
 
A
K
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
R
L
 
D
S
 
A
M
 
M
G
 
G
L
 
L
C
 
A
G
 
G
R
 
C
R
 
E
S
 
S
V
 
V

6a24A The crystal structure of mandelate oxidase with 3-fluoropyruvate (see paper)
38% identity, 93% coverage: 7:368/390 of query aligns to 4:342/354 of 6a24A

query
sites
6a24A
I
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
A
Y
 
A
K
 
R
R
 
D
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
G
M
 
E
F
 
I
Y
 
F
D
 
D
Y
x
F
A
x
L
E
 
A
S
 
G
G
 
G
S
 
S
W
 
G
T
 
T
E
 
E
Q
 
A
T
 
S
F
 
L
R
 
V
E
 
A
N
 
N
S
 
R
S
 
T
D
 
A
F
 
L
D
 
E
L
 
R
L
 
V
K
 
F
L
 
V
R
 
I
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
D
M
 
L
D
 
T
N
 
D
R
 
V
S
 
T
T
 
T
K
 
E
T
 
I
T
 
D
M
 
I
V
 
F
G
 
G
Q
 
R
E
 
R
V
 
A
A
 
A
M
 
L
P
 
P
V
 
M
A
 
A
L
 
V
A
|
A
P
|
P
V
|
V
G
x
A
L
 
Y
T
 
Q
G
 
R
M
 
L
Q
 
F
H
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
D
F
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
T
 
T
L
 
I
S
 
C
T
 
T
M
 
L
S
 
S
I
 
S
C
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
H
 
V
T
 
G
E
 
G
T
 
R
P
 
P
F
 
-
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
W
L
 
L
K
 
R
D
 
D
D
 
E
D
 
K
F
 
R
M
 
S
K
 
L
R
 
D
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
D
A
 
A
K
 
G
C
 
C
S
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
V
Q
 
P
L
 
W
L
 
M
G
 
G
Q
 
R
R
|
R
H
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
M
K
 
R
N
 
N
G
 
G
L
 
F
S
 
A
A
 
L
P
 
P
P
 
E
K
 
W
L
 
V
T
 
T
P
 
A
A
 
A
S
 
N
I
 
-
A
 
-
N
 
-
M
 
-
M
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
D
G
 
A
N
 
G
I
 
T
V
 
A
G
 
A
H
 
H
A
 
R
K
 
R
G
 
-
V
 
T
T
 
Q
D
 
G
P
 
V
S
 
S
S
 
A
L
 
V
S
 
A
S
 
D
W
 
H
T
 
T
A
 
A
E
 
R
A
 
E
F
 
F
D
 
A
Q
 
P
S
 
A
L
 
-
D
 
T
W
 
W
E
 
E
R
 
S
I
 
V
K
 
E
Q
 
A
F
 
V
R
 
R
S
 
A
W
 
H
W
 
T
D
 
D
G
 
L
P
 
P
V
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
A
P
 
V
E
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
D
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
G
A
 
G
I
 
I
V
 
V
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
V
S
 
P
S
 
G
I
 
I
R
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
G
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
S
D
 
G
K
 
G
I
 
C
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
V
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
S
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
V
T
 
M
Y
 
W
G
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
A
G
 
G
E
 
Q
A
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
R
R
 
Q
A
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
L
I
 
L
H
 
A
K
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
R
L
 
D
S
 
A
M
 
M
G
 
G
L
 
L
C
 
A
G
 
G
R
 
C
R
 
E
S
 
S
V
 
V

5qigA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z1407672867
37% identity, 94% coverage: 7:374/390 of query aligns to 5:355/359 of 5qigA

query
sites
5qigA
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
x
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
 
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
R
I
 
M
A
 
K
N
 
N
M
 
F
M
 
E
T
 
T
K
 
S
V
 
T
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
S
G
 
F
T
 
S
K
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
|
R
S
 
R
W
 
L
W
 
T
D
x
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
|
G
A
 
L
D
x
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
x
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
x
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
x
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

Sites not aligning to the query:

5qifA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z31792168
37% identity, 94% coverage: 7:374/390 of query aligns to 5:355/359 of 5qifA

query
sites
5qifA
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
R
I
 
M
A
 
K
N
 
N
M
 
F
M
 
E
T
 
T
K
 
S
V
 
T
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
S
G
 
F
T
 
S
K
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
|
R
S
x
R
W
 
L
W
 
T
D
x
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
x
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

2rdwA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with sulfate (see paper)
37% identity, 94% coverage: 7:374/390 of query aligns to 5:355/359 of 2rdwA

query
sites
2rdwA
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
-
 
E
A
 
A
H
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
A
P
 
L
F
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
I
L
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
E
F
 
V
M
 
T
K
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
A
 
M
K
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
I
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
R
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
S
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
R
I
 
M
A
 
K
N
 
N
M
 
F
M
 
E
T
 
T
K
 
S
V
 
T
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
S
G
 
F
T
 
S
K
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
D
P
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
I
D
 
D
Q
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
E
 
E
R
 
D
I
 
I
K
 
K
Q
 
W
F
 
L
R
 
R
S
 
R
W
 
L
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
P
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
E
A
 
A
L
 
V
N
 
K
V
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
V
 
L
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
M
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
I
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
I
T
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
R
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
I
 
L
H
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
L
 
L
S
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
E
 
K
D
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
K
S
 
T

1al7A Three-dimensional structures of glycolate oxidase with bound active- site inhibitors (see paper)
36% identity, 96% coverage: 4:376/390 of query aligns to 3:345/350 of 1al7A

query
sites
1al7A
I
 
I
T
 
T
E
 
N
I
 
V
E
 
N
D
 
E
L
 
Y
K
 
E
R
 
A
I
 
I
Y
 
A
K
 
K
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
E
T
 
D
E
 
Q
Q
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
E
N
 
N
S
 
R
S
 
N
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
I
K
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
L
M
 
I
D
 
D
M
 
V
D
 
T
N
 
N
R
 
I
S
 
D
T
 
M
K
 
T
T
 
T
T
 
T
M
 
I
V
 
L
G
 
G
Q
 
F
E
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
M
L
 
I
A
|
A
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
M
T
 
Q
G
 
K
M
 
M
Q
 
A
H
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
S
K
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
I
F
 
M
T
 
T
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
H
 
T
T
 
G
E
 
P
T
 
G
P
 
I
F
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
V
 
L
Y
|
Y
T
 
V
L
x
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
R
D
 
N
F
 
V
M
 
V
K
 
A
R
 
Q
L
 
L
F
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
G
C
 
F
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
I
 
L
T
|
T
V
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
L
 
R
L
|
L
G
 
G
Q
 
R
R
|
R
H
 
E
R
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
N
 
N
G
 
R
L
x
F
S
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
N
 
-
M
 
-
M
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
W
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
K
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
F
 
E
G
 
G
N
 
I
I
 
D
V
 
L
G
 
G
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
S
W
 
Y
T
 
V
A
 
A
E
 
G
A
 
Q
F
x
I
D
 
D
Q
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
S
W
 
W
E
 
K
R
 
D
I
 
V
K
 
A
Q
 
W
F
 
L
R
 
Q
S
 
T
W
 
I
W
 
T
D
 
S
G
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
R
M
 
L
A
 
A
L
 
V
N
 
Q
V
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
Y
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
M
M
 
A
L
 
L
P
 
E
Q
 
E
I
 
V
M
 
V
D
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
K
 
R
I
 
I
E
 
P
V
 
V
H
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
F
K
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
F
I
|
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
W
 
V
T
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
K
R
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
M
I
 
M
H
 
R
K
 
D
E
 
E
L
 
F
D
 
E
L
 
L
S
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
R
 
C
R
 
R
S
 
S
V
 
L
E
 
K
D
 
E
L
 
I
D
 
S
A
 
R
S
 
S
N
 
H
L
 
I

7r4nA Structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with 5-bromo-n-methyl- 1h-indazole-3-carboxamide
35% identity, 96% coverage: 1:374/390 of query aligns to 1:348/352 of 7r4nA

query
sites
7r4nA
M
 
L
P
 
P
V
 
R
I
 
L
T
 
I
E
 
C
I
 
I
E
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
R
 
Q
I
 
H
Y
 
A
K
 
K
R
 
S
R
 
V
V
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
A
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
W
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
S
 
I
S
 
A
D
 
A
F
 
F
D
 
S
L
 
R
L
 
W
K
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
R
 
R
I
 
M
A
 
L
M
 
R
D
 
N
M
 
V
D
 
A
N
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
K
 
S
T
 
T
T
 
S
M
 
V
V
 
L
G
 
G
Q
 
Q
E
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T