SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607639 Dshi_1048 Enoyl-CoA hydratase/isomerase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
37% identity, 95% coverage: 14:265/265 of query aligns to 10:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
R
 
K
E
 
E
G
 
G
P
 
N
V
 
L
A
 
F
R
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
D
R
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
N
L
 
A
A
 
K
M
 
L
W
 
L
Q
 
E
G
 
E
L
 
L
G
 
-
D
 
D
L
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
S
L
 
Q
A
 
A
A
 
E
S
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
D
 
-
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
S
 
T
E
 
Q
F
|
F
P
 
N
Q
 
Q
V
 
L
R
 
-
A
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
A
G
 
E
V
 
A
A
 
W
A
 
K
Y
 
F
N
x
S
R
 
K
T
 
K
V
 
G
A
x
R
R
 
E
A
 
I
L
 
M
E
 
D
G
 
K
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
S
M
 
K
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
I
R
 
N
G
 
G
H
 
Y
C
 
A
I
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
L
R
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
A
 
G
F
 
L
T
x
P
P
x
E
A
 
I
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
I
A
 
Y
I
x
P
G
|
G
A
 
Y
D
 
G
E
 
G
V
 
T
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
G
A
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
M
L
 
M
Y
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
D
P
x
R
V
 
I
D
 
P
A
 
G
A
 
K
R
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
A
M
 
N
L
 
L
M
 
E
D
 
Q
E
 
E
A
 
T
D
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
K
N
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
I
T
 
S
L
 
L
R
 
A
A
 
L
V
 
I
K
 
K
A
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
D
A
 
S
F
 
P
A
 
L
R
 
L
P
 
S
G
 
G
D
 
L
A
|
A
A
 
L
A
 
E
A
 
S
S
 
V
H
 
G
A
 
W
D
 
G
A
 
V
L
 
V
V
 
-
K
 
-
T
 
-
C
 
-
F
|
F
D
 
S
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
K
R
 
K
E
 
E
G
 
G
Q
 
V
R
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
E
P
 
P
E
 
T
F
 
F
K
 
K
G
 
G
Q
 
K

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
37% identity, 96% coverage: 12:265/265 of query aligns to 9:261/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
L
 
V
D
 
D
R
 
A
E
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
E
R
 
I
I
 
W
T
 
T
L
 
I
N
 
D
N
 
G
P
 
E
D
x
S
R
|
R
L
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
I
R
 
S
L
 
R
A
 
A
M
 
M
W
 
L
Q
 
K
G
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
T
E
 
R
L
 
V
A
 
S
A
 
S
S
 
S
-
 
R
D
 
D
A
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
L
S
x
K
E
 
E
F
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
R
|
R
A
 
A
T
 
T
-
 
M
-
 
A
P
 
E
E
 
D
G
 
E
V
 
V
A
 
R
A
 
A
Y
 
F
N
x
L
R
 
D
T
 
G
V
 
L
A
x
R
R
 
R
A
 
T
L
 
F
E
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
S
P
 
D
M
 
C
P
 
V
V
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
N
G
 
G
H
 
A
C
 
A
I
x
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
T
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
L
R
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
A
S
 
A
E
 
P
T
 
A
A
 
A
R
 
E
I
 
L
A
 
G
F
 
L
T
|
T
P
x
E
A
 
V
K
 
K
L
|
L
G
 
G
L
x
I
A
 
I
I
x
P
G
|
G
A
 
G
D
 
G
E
 
G
V
 
T
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
L
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
G
A
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
D
L
 
L
L
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
R
P
x
R
V
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
F
R
 
S
W
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
N
R
 
R
R
 
L
V
 
A
P
 
P
E
 
E
D
 
G
M
 
H
L
 
L
M
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
D
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
E
T
 
S
I
 
V
A
 
V
A
 
E
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
I
T
 
A
L
 
V
R
 
A
A
 
T
V
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
A
L
 
I
A
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
D
D
 
E
A
 
G
A
 
T
A
 
G
A
 
L
S
 
E
H
 
L
A
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
-
x
A
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
K
V
 
Y
K
 
E
T
 
E
C
 
I
F
x
L
D
 
K
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
R
R
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
V
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
Q
 
R

Q4WF54 Mevalonyl-coenzyme A hydratase sidH; Siderophore biosynthesis protein H; EC 4.2.1.- from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata) (see paper)
34% identity, 92% coverage: 21:263/265 of query aligns to 24:266/270 of Q4WF54

query
sites
Q4WF54
I
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
E
R
 
K
L
 
R
N
 
N
A
 
C
M
 
I
R
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
T
W
 
S
Q
 
A
G
 
E
L
 
I
G
 
Q
D
 
R
L
 
L
A
 
W
V
 
T
E
 
W
L
 
F
A
 
D
A
 
T
S
 
Q
D
 
P
A
 
A
-
 
L
R
 
Y
V
 
V
V
 
A
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
T
G
 
G
D
 
E
R
 
-
A
 
S
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
K
E
 
E
F
 
W
P
 
N
Q
 
D
V
 
L
R
 
N
A
 
A
T
 
-
P
 
-
E
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
T
A
 
-
Y
 
-
N
 
N
R
 
E
T
 
M
V
 
T
A
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
S
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
G
H
 
Y
C
 
C
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
F
E
 
E
I
 
M
A
 
V
V
 
A
R
 
N
C
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
N
A
 
A
R
 
T
I
 
F
A
 
G
F
 
L
T
 
P
P
 
E
A
 
V
K
 
Q
L
 
R
G
 
G
L
 
I
A
 
A
I
 
A
G
 
V
A
 
A
D
 
G
E
 
S
V
 
L
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
A
Y
 
L
T
 
S
A
 
G
Q
 
L
P
 
S
V
 
F
D
 
S
A
 
A
A
 
S
R
 
Q
A
 
L
E
 
E
R
 
R
W
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
H
D
 
D
M
 
Q
L
 
L
M
 
L
D
 
A
E
 
T
A
 
A
D
 
V
A
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
T
T
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
R
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
D
T
 
S
L
 
V
R
 
R
A
 
V
V
 
T
K
 
M
A
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
H
A
 
Y
F
 
G
A
 
W
R
 
E
P
 
M
G
 
A
D
 
S
A
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
S
H
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
V
D
 
D
A
 
Q
L
 
W
V
 
Y
K
 
A
T
 
K
C
 
L
F
 
M
D
 
A
S
 
G
A
 
E
D
 
N
Y
 
F
R
 
H
E
 
E
G
 
G
Q
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
Q
F
 
W
K
 
R

Sites not aligning to the query:

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
35% identity, 95% coverage: 10:262/265 of query aligns to 6:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
L
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
x
Q
R
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
R
 
N
L
 
S
A
 
Q
M
 
V
W
 
M
Q
 
N
G
 
E
L
 
V
G
 
T
D
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
D
S
 
D
-
 
P
D
 
D
A
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
D
 
-
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
S
x
K
E
 
E
F
x
M
P
 
A
Q
 
D
V
 
L
R
 
T
A
 
F
T
 
A
P
 
D
E
 
A
G
 
F
V
x
T
A
 
A
A
 
D
Y
 
F
N
x
F
R
 
A
T
 
T
V
 
W
A
 
G
R
 
K
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
R
M
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
 
Y
C
 
A
I
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
I
 
F
A
 
G
F
 
Q
T
x
P
P
x
E
A
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
I
x
P
G
|
G
A
x
M
D
 
G
E
 
G
V
 
S
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
R
P
 
T
V
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
A
D
 
D
M
 
D
L
 
L
M
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
T
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
N
A
 
R
F
 
A
A
 
F
R
 
E
P
 
S
G
 
S
D
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
x
L
H
 
Y
A
 
E
D
 
R
A
 
R
L
 
L
V
 
F
K
 
H
T
 
S
C
 
A
F
|
F
D
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
Q
R
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
35% identity, 95% coverage: 10:262/265 of query aligns to 6:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
L
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
Q
R
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
N
L
 
S
A
 
Q
M
 
V
W
 
M
Q
 
N
G
 
E
L
 
V
G
 
T
D
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
D
S
 
D
-
 
P
D
 
D
A
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
D
 
-
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
S
x
K
E
 
E
F
x
M
P
 
A
Q
 
D
V
 
L
R
 
T
A
 
F
T
 
A
P
 
D
E
 
A
G
 
F
V
x
T
A
 
A
A
 
D
Y
 
F
N
x
F
R
 
A
T
 
T
V
 
W
A
 
G
R
 
K
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
R
M
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
x
Y
C
 
A
I
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
I
 
F
A
 
G
F
 
Q
T
x
P
P
x
E
A
 
I
K
 
K
L
|
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
I
x
P
G
|
G
A
 
M
D
 
G
E
 
G
V
 
S
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
R
P
 
T
V
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
A
D
 
D
M
 
D
L
 
L
M
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
T
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
N
A
 
R
F
 
A
A
 
F
R
 
E
P
 
S
G
 
S
D
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
x
L
H
 
Y
A
 
E
D
 
R
A
 
R
L
 
L
V
 
F
K
 
H
T
 
S
C
 
A
F
|
F
D
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
Q
R
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 95% coverage: 10:262/265 of query aligns to 5:253/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
L
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
Q
R
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
N
L
 
S
A
 
Q
M
 
V
W
 
M
Q
 
N
G
 
E
L
 
V
G
 
T
D
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
D
S
 
D
-
 
P
D
 
D
A
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
D
 
-
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
S
 
K
E
 
E
F
x
M
P
 
A
Q
 
D
V
 
L
R
 
T
A
 
F
T
 
A
P
 
D
E
 
A
G
 
F
V
x
T
A
 
A
A
 
D
Y
 
F
N
x
F
R
 
A
T
 
T
V
 
W
A
 
G
R
 
K
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
R
M
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
 
Y
C
 
A
I
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
I
 
F
A
 
G
F
 
Q
T
x
P
P
x
E
A
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
I
x
P
G
|
G
A
 
M
D
 
G
E
 
G
V
 
S
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
R
P
 
T
V
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
A
D
 
D
M
 
D
L
 
L
M
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
T
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
N
A
 
R
F
 
A
A
 
F
R
 
E
P
 
S
G
 
S
D
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
x
L
H
 
Y
A
 
E
D
 
R
A
 
R
L
 
L
V
 
F
K
 
H
T
 
S
C
 
A
F
|
F
D
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
x
Q
R
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
35% identity, 95% coverage: 10:262/265 of query aligns to 5:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
L
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
R
E
 
D
G
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
Q
R
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
N
L
 
S
A
 
Q
M
 
V
W
 
M
Q
 
N
G
 
E
L
 
V
G
 
T
D
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
D
S
 
D
-
 
P
D
 
D
A
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
D
 
-
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
S
 
K
E
 
E
F
x
M
P
 
F
Q
 
A
V
 
D
R
 
A
A
 
F
T
|
T
P
 
A
E
 
D
G
 
F
V
x
F
A
 
A
A
 
T
Y
 
W
N
 
G
R
 
K
T
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
R
M
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
 
Y
C
 
A
I
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
I
 
F
A
 
G
F
 
Q
T
x
P
P
x
E
A
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
I
x
P
G
|
G
A
 
M
D
 
G
E
 
G
V
 
S
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
A
A
 
I
G
 
G
P
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
M
E
 
D
L
 
L
L
 
I
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
R
P
 
T
V
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
A
D
 
D
M
 
D
L
 
L
M
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
N
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
T
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
N
A
 
R
F
 
A
A
 
F
R
 
E
P
 
S
G
 
S
D
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
A
 
L
S
x
L
H
 
Y
A
 
E
D
 
R
A
 
R
L
 
L
V
x
F
K
 
H
T
 
S
C
 
A
F
|
F
D
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
Q
R
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

1ef9A The crystal structure of methylmalonyl coa decarboxylase complexed with 2s-carboxypropyl coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 14:261/261 of 1ef9A

query
sites
1ef9A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
x
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
x
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
x
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
 
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
x
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

P52045 Methylmalonyl-CoA decarboxylase; MMCD; Transcarboxylase; EC 4.1.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 14:261/261 of P52045

query
sites
P52045
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
H
D
 
D
I
 
I
S
 
H
E
 
E
F
 
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
 
W
G
 
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
 
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
 
P
A
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
V
A
 
P
I
 
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
 
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
 
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

6n97A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- amino(dethia)-coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n97A

query
sites
6n97A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
x
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
 
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
|
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

6n96A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- oxa(dethia)-coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n96A

query
sites
6n96A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
x
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
x
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
|
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

6n95A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-sulfonate-propionyl- coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n95A

query
sites
6n95A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
x
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
x
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
|
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

6n94A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- amino(dethia)-coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n94A

query
sites
6n94A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
x
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
|
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

6n93A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- oxa(dethia)-coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n93A

query
sites
6n93A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
x
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
 
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
|
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

6n92F Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n92F

query
sites
6n92F
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
x
R
R
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
 
I
S
 
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
x
S
C
 
V
I
x
W
G
|
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
x
T
I
x
F
A
x
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
x
S
P
|
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
x
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
x
H

6n92A Methylmalonyl-coa decarboxylase in complex with 2-nitronate-propionyl- coa (see paper)
30% identity, 94% coverage: 18:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 6n92A

query
sites
6n92A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
N
 
N
N
 
Y
P
 
G
D
 
R
R
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
R
 
S
L
 
K
A
 
V
M
 
F
W
 
I
Q
 
D
G
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
Q
L
 
A
A
 
L
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
R
S
 
P
D
 
E
A
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
A
-
 
P
A
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
S
x
H
E
 
E
F
x
L
P
 
P
Q
 
S
V
 
G
R
 
G
A
 
R
T
 
D
P
 
P
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
L
A
 
S
Y
 
Y
N
 
D
R
 
D
T
 
P
V
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
I
L
 
T
E
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
Q
A
 
K
L
 
F
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
M
I
 
V
R
 
E
G
 
G
H
 
S
C
 
V
I
x
W
G
|
G
G
|
G
G
 
A
L
 
F
E
|
E
I
 
M
A
 
I
V
 
M
R
 
S
C
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
I
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
S
T
 
T
A
 
S
R
 
T
I
 
F
A
 
S
F
 
M
T
|
T
P
|
P
A
 
V
K
 
N
L
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
P
I
x
Y
G
 
N
A
 
L
D
 
V
E
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
D
A
 
A
G
 
G
P
 
F
A
 
H
A
 
I
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
A
 
A
Q
 
S
P
 
P
V
 
I
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
A
W
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
N
 
N
R
 
H
R
 
V
V
 
V
P
 
E
E
 
V
D
 
E
M
 
E
L
 
L
M
 
E
D
 
D
E
 
F
A
 
T
D
 
L
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
R
 
H
T
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
N
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
V
V
 
I
K
 
K
A
 
E
G
 
E
L
 
L
A
 
R
A
 
V
F
 
L
-
 
G
-
 
E
A
 
A
R
 
H
P
 
T
G
 
M
D
 
N
A
 
S
A
 
D
A
 
E
A
 
F
S
x
E
H
 
R
A
 
I
D
 
Q
A
 
G
L
 
M
V
 
R
K
 
R
T
 
A
C
 
V
F
x
Y
D
 
D
S
 
S
A
 
E
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
K
P
 
P
E
 
N
F
 
F
K
 
V
G
 
G
Q
 
H

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
32% identity, 92% coverage: 18:262/265 of query aligns to 34:278/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
Q
R
 
V
L
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
R
 
R
-
 
P
L
 
L
A
 
T
M
 
V
W
 
K
Q
 
E
G
 
M
L
 
I
G
 
Q
D
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
D
E
 
A
L
 
R
A
 
Y
A
 
D
S
 
D
D
 
N
A
 
V
R
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
D
I
 
Q
S
 
K
E
 
V
F
 
R
P
 
G
Q
 
D
V
 
Y
R
 
G
A
 
G
T
 
Y
P
 
Q
E
 
D
G
 
D
V
 
S
A
 
G
A
 
V
Y
 
H
N
 
H
R
 
L
T
 
N
V
 
V
A
 
L
R
 
D
A
 
F
L
 
Q
E
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
R
A
 
T
L
 
C
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
M
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
 
Y
C
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
H
E
 
V
I
 
L
A
 
H
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
R
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
N
A
 
A
R
 
I
I
 
F
A
 
G
F
x
Q
T
|
T
P
x
G
A
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
S
A
 
F
I
 
D
G
 
G
A
 
G
D
 
W
E
 
G
V
 
A
A
 
S
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
G
P
 
Q
A
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
I
L
 
W
Y
 
F
T
 
L
A
 
C
Q
 
R
P
 
Q
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
R
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
D
W
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
A
M
 
D
L
 
L
M
 
E
D
 
K
E
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
R
L
 
W
A
 
C
R
 
R
T
 
E
I
 
M
A
 
L
A
 
Q
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
M
T
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
A
F
 
D
A
 
C
R
 
-
P
 
D
G
 
G
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
S
 
E
H
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
N
L
 
A
V
 
T
K
 
M
T
 
L
C
 
F
F
 
Y
D
 
M
S
 
T
A
 
E
D
 
E
Y
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
R
R
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
31% identity, 95% coverage: 14:265/265 of query aligns to 13:260/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
R
 
K
E
 
N
G
 
N
P
 
T
V
 
V
A
 
G
R
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
x
K
R
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
R
 
C
L
 
D
A
 
G
M
 
L
W
 
I
Q
 
D
G
 
E
L
 
L
G
 
-
D
 
N
L
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
K
L
 
I
A
 
F
A
 
E
S
 
E
D
 
D
A
 
P
R
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
D
 
D
R
x
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
S
 
K
E
 
E
F
x
M
P
 
Q
Q
 
N
V
 
L
R
 
S
A
 
F
T
 
Q
P
 
D
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
C
Y
 
Y
N
x
S
R
 
S
T
 
K
V
 
F
A
x
L
R
 
K
A
 
H
L
 
W
E
 
D
G
 
H
L
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
V
P
 
K
M
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
R
 
N
G
 
G
H
 
Y
C
 
A
I
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
L
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
I
 
F
A
 
A
F
 
Q
T
x
P
P
x
E
A
 
I
K
 
L
L
 
I
G
 
G
L
x
T
A
 
I
I
x
P
G
|
G
A
 
A
D
 
G
E
 
G
V
 
T
A
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
K
A
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
E
L
 
M
L
 
V
Y
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
D
P
 
R
V
 
I
D
 
S
A
 
A
A
 
Q
R
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
R
 
I
V
 
C
P
 
P
E
 
V
D
 
E
M
 
T
L
 
L
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
R
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
T
 
V
L
 
V
R
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
A
 
E
G
 
S
L
 
V
A
 
N
A
 
A
F
 
A
A
 
F
R
 
E
P
 
M
G
 
T
D
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
G
A
 
S
S
x
K
H
 
L
A
 
E
D
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
F
K
 
Y
T
 
S
C
 
T
F
|
F
D
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
R
 
K
E
 
E
G
 
G
Q
 
M
R
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
G
 
D
Q
 
Q

4i42A E.Coli. 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase (ecmenb) in complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
32% identity, 92% coverage: 18:262/265 of query aligns to 34:278/285 of 4i42A

query
sites
4i42A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
Q
R
x
V
L
x
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
R
 
R
-
 
P
L
 
L
A
 
T
M
 
V
W
 
K
Q
 
E
G
 
M
L
 
I
G
 
Q
D
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
D
E
 
A
L
 
R
A
 
Y
A
 
D
S
 
D
D
 
N
A
 
I
R
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
I
x
Q
S
x
K
E
 
V
F
x
R
P
 
G
Q
 
D
V
 
Y
R
 
G
A
 
G
T
x
Y
P
 
K
E
 
D
G
 
D
V
 
S
A
 
G
A
 
V
Y
 
H
N
x
H
R
 
L
T
 
N
V
|
V
A
x
L
R
 
D
A
 
F
L
 
Q
E
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
R
A
 
T
L
 
C
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
M
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
x
Y
C
 
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
H
E
x
V
I
 
L
A
 
H
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
R
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
R
 
I
I
 
F
A
 
G
F
 
Q
T
|
T
P
x
G
A
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
A
 
F
I
x
D
G
|
G
A
 
G
D
 
W
E
 
G
V
 
A
A
 
S
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
G
P
 
Q
A
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
I
L
 
W
Y
 
F
T
 
L
A
 
C
Q
 
R
P
 
Q
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
D
W
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
A
M
 
D
L
 
L
M
 
E
D
 
K
E
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
R
L
 
W
A
 
C
R
 
R
T
 
E
I
 
M
A
 
L
A
 
Q
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
M
T
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
A
F
 
D
A
 
C
R
 
-
P
 
D
G
 
G
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
S
 
E
H
 
L
A
|
A
D
 
G
A
 
N
L
 
A
V
x
T
K
 
M
T
 
L
C
 
F
F
x
Y
D
 
M
S
 
T
A
 
E
D
 
E
Y
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
 
R
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F

P0ABU0 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
32% identity, 92% coverage: 18:262/265 of query aligns to 34:278/285 of P0ABU0

query
sites
P0ABU0
V
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
N
 
R
P
 
P
D
 
Q
R
 
V
L
x
R
N
 
N
A
 
A
M
 
F
R
 
R
-
 
P
L
 
L
A
 
T
M
 
V
W
 
K
Q
 
E
G
 
M
L
 
I
G
 
Q
D
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
D
E
 
A
L
 
R
A
 
Y
A
 
D
S
 
D
D
 
N
A
 
I
R
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
I
x
Q
S
x
K
E
 
V
F
x
R
P
 
G
Q
 
D
V
 
Y
R
 
G
A
 
G
T
x
Y
P
 
K
E
 
D
G
 
D
V
 
S
A
 
G
A
 
V
Y
 
H
N
 
H
R
 
L
T
 
N
V
 
V
A
 
L
R
 
D
A
 
F
L
 
Q
E
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
R
A
 
T
L
 
C
P
 
P
M
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
M
I
 
V
R
 
A
G
 
G
H
x
Y
C
x
S
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
H
E
 
V
I
 
L
A
 
H
V
 
M
R
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
R
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
R
 
I
I
 
F
A
 
G
F
x
Q
T
|
T
P
x
G
A
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
L
x
S
A
 
F
I
 
D
G
 
G
A
 
G
D
 
W
E
 
G
V
 
A
A
 
S
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
G
P
 
Q
A
 
K
A
 
K
A
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
I
L
x
W
Y
 
F
T
 
L
A
 
C
Q
 
R
P
 
Q
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
K
R
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
D
W
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
R
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
A
M
 
D
L
 
L
M
 
E
D
 
K
E
 
E
A
 
T
D
 
V
A
 
R
L
 
W
A
 
C
R
 
R
T
 
E
I
 
M
A
 
L
A
 
Q
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
M
T
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
N
A
 
A
F
 
D
A
 
C
R
 
-
P
 
D
G
 
G
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
S
 
E
H
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
N
L
 
A
V
 
T
K
 
M
T
 
L
C
 
F
F
x
Y
D
 
M
S
 
T
A
 
E
D
 
E
Y
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
Q
x
R
R
 
N
A
 
A
F
|
F
A
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F

Query Sequence

>3607639 Dshi_1048 Enoyl-CoA hydratase/isomerase (RefSeq)
MSRALAEGRLLLDREGPVARITLNNPDRLNAMRLAMWQGLGDLAVELAASDARVVVLRGA
GDRAFCAGADISEFPQVRATPEGVAAYNRTVARALEGLAALPMPVLAAIRGHCIGGGLEI
AVRCDLRLASETARIAFTPAKLGLAIGADEVAALARIAGPAAAAELLYTAQPVDAARAER
WGLVNRRVPEDMLMDEADALARTIAANAPLTLRAVKAGLAAFARPGDAAAASHADALVKT
CFDSADYREGQRAFAEKRRPEFKGQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory