SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607850 Dshi_1258 short-chain dehydrogenase/reductase SDR (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
40% identity, 94% coverage: 8:239/247 of query aligns to 11:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
I
 
V
I
 
V
L
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
Q
 
D
D
 
E
S
 
A
V
 
Q
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
V
R
 
R
L
 
K
G
 
E
G
 
N
A
 
N
G
 
D
Y
 
R
L
 
L
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
C
x
T
D
 
D
M
x
I
G
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
C
G
 
Q
A
 
H
L
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
S
I
 
A
E
 
V
A
 
H
E
 
T
H
 
F
G
 
G
A
 
G
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
A
 
I
P
 
V
G
 
A
D
 
P
F
 
I
L
 
H
D
 
E
Y
 
M
D
 
E
L
 
L
A
 
S
T
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
V
 
L
A
 
M
T
 
S
Q
 
K
R
 
H
A
 
A
G
 
L
R
 
K
S
 
H
M
 
M
V
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
G
I
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
C
S
|
S
I
 
V
N
 
G
A
 
G
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
W
P
 
P
S
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
G
 
C
P
|
P
G
|
G
S
x
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
E
 
P
M
 
L
-
 
N
-
 
E
M
 
K
A
 
S
G
 
F
V
 
L
N
 
E
A
 
N
N
 
N
P
 
E
E
 
G
A
 
T
M
 
L
N
 
E
M
 
E
V
 
I
L
 
K
S
 
K
R
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
V
T
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
L
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
S
T
 
A
I
 
I
Y
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
37% identity, 95% coverage: 6:239/247 of query aligns to 9:249/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Y
 
K
A
 
S
C
 
M
A
 
A
E
 
I
A
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
V
L
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
R
-
 
S
-
 
K
A
 
E
D
 
D
I
 
E
Q
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
Q
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
I
A
 
K
R
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
E
G
 
A
Y
 
-
L
 
I
C
 
A
D
 
V
M
 
K
G
 
G
D
|
D
A
x
V
A
 
T
A
 
V
V
 
E
G
 
S
A
 
D
L
 
V
F
 
I
D
 
N
R
 
L
I
 
V
E
 
Q
A
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
K
E
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
K
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
A
 
A
A
 
N
P
 
P
G
 
V
D
 
S
F
 
S
L
 
H
D
 
E
Y
 
M
D
 
S
L
 
L
A
 
S
T
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
T
 
S
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
I
R
 
K
S
 
Y
M
 
F
V
 
V
A
 
E
H
 
N
G
 
D
I
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
V
V
 
I
N
 
N
M
|
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
H
A
 
E
Q
 
K
V
 
I
A
 
P
I
 
W
P
 
P
S
 
L
I
 
F
P
 
V
A
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
M
M
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
K
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
G
 
G
P
|
P
G
|
G
S
 
A
I
|
I
D
 
N
T
|
T
E
 
P
M
 
I
M
 
N
A
 
A
G
 
E
V
 
K
N
 
F
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
Q
M
 
R
N
 
A
M
 
D
V
 
V
L
 
E
S
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
Y
V
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
K
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
I
T
 
T
I
 
L
Y
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 6:239/247 of query aligns to 9:249/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
V
A
 
V
L
x
V
I
|
I
T
|
T
G
|
G
G
x
S
A
x
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
Y
x
K
A
x
S
C
x
M
A
|
A
E
x
I
A
x
R
L
x
F
A
|
A
A
x
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
R
x
K
I
x
V
I
x
V
L
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
-
 
S
-
 
K
A
 
E
D
 
D
I
 
E
Q
 
A
D
 
N
S
 
S
V
 
V
Q
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
I
A
 
K
R
 
K
L
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
E
G
 
A
Y
 
-
L
 
I
C
 
A
D
 
V
M
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
T
A
 
V
V
 
E
G
 
S
A
 
D
L
 
V
F
 
I
D
 
N
R
 
L
I
 
V
E
 
Q
A
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
K
E
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
K
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
x
E
A
 
N
P
 
P
G
 
V
D
 
S
F
 
S
L
 
H
D
 
E
Y
 
M
D
 
S
L
 
L
A
 
S
T
x
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
|
V
L
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
T
 
S
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
I
R
 
K
S
 
Y
M
 
F
V
 
V
A
x
E
H
 
N
G
 
D
I
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
V
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
V
N
 
H
A
 
E
Q
 
K
V
 
I
A
 
P
I
 
W
P
 
P
S
 
L
I
 
F
P
 
V
A
 
H
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
M
M
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
K
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
I
D
 
N
T
 
T
E
x
P
M
 
I
M
 
N
A
 
A
G
 
E
V
 
K
N
 
F
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
Q
M
 
R
N
 
A
M
 
D
V
 
V
L
x
E
S
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
x
Y
V
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
K
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
I
T
 
T
I
 
L
Y
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3d3wA Structure of l-xylulose reductase with bound coenzyme, phosphate and hydroxide. (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:239/247 of query aligns to 11:240/244 of 3d3wA

query
sites
3d3wA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
G
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
G
C
 
T
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
V
-
 
A
-
 
V
-
x
S
-
x
R
-
x
T
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
L
Q
 
D
D
 
S
S
 
L
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
A
 
C
A
 
P
A
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
I
G
 
E
Y
 
P
L
 
V
C
 
C
-
x
V
D
 
D
M
x
L
G
 
G
D
 
D
A
 
W
A
 
E
A
 
A
V
 
T
G
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
E
R
 
R
I
 
A
E
 
L
A
 
G
E
 
S
H
 
V
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
D
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
P
 
L
G
 
Q
D
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
E
Y
 
V
D
 
T
L
 
K
A
 
E
T
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
L
 
F
D
 
E
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
F
 
I
V
 
Q
A
 
V
T
 
S
Q
 
Q
R
 
I
A
 
V
G
 
A
R
 
R
S
 
G
M
 
L
V
 
I
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
V
S
|
S
S
|
S
I
 
Q
N
 
C
A
 
S
Q
 
Q
V
 
R
A
 
A
I
 
V
P
 
T
S
 
N
I
x
H
P
 
S
A
 
V
Y
|
Y
C
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
L
M
 
D
Q
 
M
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
N
P
|
P
G
x
T
S
 
V
I
x
V
D
 
M
T
|
T
E
x
S
M
|
M
M
x
G
A
 
Q
G
 
A
V
 
T
N
 
W
A
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
H
A
 
K
M
 
A
N
 
K
M
 
T
V
 
M
L
 
L
S
 
N
R
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
K
V
 
F
G
 
A
T
 
E
A
 
V
Q
 
E
E
 
H
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
S
S
 
G
Y
 
M
V
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
S
T
 
T
I
 
L
Y
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G

1pr9A Human l-xylulose reductase holoenzyme (see paper)
38% identity, 94% coverage: 8:239/247 of query aligns to 11:240/244 of 1pr9A

query
sites
1pr9A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
G
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
G
C
 
T
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
V
-
 
A
-
 
V
-
x
S
-
x
R
-
x
T
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
L
Q
 
D
D
 
S
S
 
L
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
A
 
C
A
 
P
A
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
I
G
 
E
Y
 
P
L
 
V
C
 
C
-
 
V
D
 
D
M
x
L
G
 
G
D
 
D
A
 
W
A
 
E
A
 
A
V
 
T
G
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
E
R
 
R
I
 
A
E
 
L
A
 
G
E
 
S
H
 
V
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
D
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
P
 
L
G
 
Q
D
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
E
Y
 
V
D
 
T
L
 
K
A
 
E
T
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
L
 
F
D
 
E
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
F
 
I
V
 
Q
A
 
V
T
 
S
Q
 
Q
R
 
I
A
 
V
G
 
A
R
 
R
S
 
G
M
 
L
V
 
I
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
V
S
 
S
S
|
S
I
 
Q
N
x
C
A
 
S
Q
 
Q
V
 
R
A
 
A
I
 
V
P
 
T
S
 
N
I
x
H
P
 
S
A
 
V
Y
|
Y
C
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
L
M
 
D
Q
 
M
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
N
P
 
P
G
x
T
S
 
V
I
x
V
D
 
M
T
|
T
E
 
S
M
|
M
M
 
G
A
 
Q
G
 
A
V
 
T
N
 
W
A
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
H
A
 
K
M
 
A
N
 
K
M
 
T
V
 
M
L
 
L
S
 
N
R
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
K
V
 
F
G
 
A
T
 
E
A
 
V
Q
 
E
E
 
H
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
S
S
 
G
Y
 
M
V
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
S
T
 
T
I
 
L
Y
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G

Q7Z4W1 L-xylulose reductase; XR; Carbonyl reductase II; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; Kidney dicarbonyl reductase; kiDCR; Short chain dehydrogenase/reductase family 20C member 1; Sperm surface protein P34H; EC 1.1.1.10 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
38% identity, 94% coverage: 8:239/247 of query aligns to 11:240/244 of Q7Z4W1

query
sites
Q7Z4W1
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
A
x
G
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
Y
x
R
A
x
G
C
x
T
A
x
V
E
x
Q
A
|
A
L
|
L
A
x
H
A
|
A
E
x
T
G
|
G
A
|
A
R
|
R
I
x
V
I
x
V
-
x
A
-
x
V
-
x
S
-
x
R
-
x
T
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
L
Q
 
D
D
 
S
S
 
L
V
 
V
Q
 
R
E
 
E
A
 
C
A
 
P
A
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
I
G
 
E
Y
 
P
L
 
V
C
 
C
-
 
V
D
 
D
M
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
W
A
 
E
A
 
A
V
 
T
G
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
E
R
 
R
I
 
A
E
 
L
A
 
G
E
 
S
H
 
V
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
D
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
P
 
L
G
 
Q
D
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
E
Y
 
V
D
 
T
L
 
K
A
 
E
T
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
L
 
F
D
 
E
I
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
R
G
 
A
V
 
V
F
 
I
V
 
Q
A
 
V
T
 
S
Q
 
Q
R
 
I
A
 
V
G
 
A
R
 
R
S
 
G
M
 
L
V
 
I
A
 
A
H
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
P
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
V
S
 
S
S
|
S
I
 
Q
N
 
C
A
 
S
Q
 
Q
V
 
R
A
 
A
I
 
V
P
 
T
S
 
N
I
 
H
P
 
S
A
 
V
Y
 
Y
C
 
C
A
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
L
M
 
D
Q
 
M
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
N
P
 
P
G
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
M
T
 
T
E
 
S
M
 
M
M
 
G
A
 
Q
G
 
A
V
 
T
N
 
W
A
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
H
A
 
K
M
 
A
N
 
K
M
 
T
V
 
M
L
 
L
S
 
N
R
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
K
V
 
F
G
 
A
T
 
E
A
 
V
Q
 
E
E
 
H
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
I
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
S
S
 
G
Y
 
M
V
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
S
T
 
T
I
 
L
Y
 
P
V
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
42% identity, 94% coverage: 8:239/247 of query aligns to 9:235/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
I
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
C
D
|
D
I
x
L
Q
x
R
D
 
P
S
 
E
V
 
G
Q
 
K
E
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
F
Y
 
F
L
 
Q
C
x
V
D
|
D
M
x
L
G
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
R
A
 
E
V
 
R
G
 
V
A
 
R
L
 
F
F
 
V
D
 
E
R
 
E
I
 
A
E
 
A
A
 
Y
E
 
A
H
 
L
G
 
G
A
 
R
V
 
V
T
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
S
F
 
A
L
 
L
D
 
T
Y
 
V
D
 
R
L
 
L
A
 
P
T
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
E
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
A
V
 
P
F
 
M
V
 
H
A
 
L
T
 
S
Q
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
R
S
 
E
M
 
M
V
 
R
A
 
K
H
 
V
G
 
G
I
 
-
K
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
V
S
 
A
S
|
S
I
 
V
N
 
Q
A
 
G
Q
 
L
V
 
F
A
 
A
I
 
E
P
 
Q
S
 
E
I
x
N
P
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
L
M
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
V
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
A
I
|
I
D
 
A
T
|
T
E
 
E
M
x
A
M
x
V
A
 
L
G
 
E
V
 
A
N
 
I
A
 
A
N
 
R
P
 
R
E
 
D
A
 
W
M
 
E
N
 
D
M
 
L
V
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
H
P
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
E
K
 
K
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
I
I
 
L
Y
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
40% identity, 94% coverage: 8:239/247 of query aligns to 11:223/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
C
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
I
 
V
I
 
V
L
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
Q
 
D
D
 
E
S
 
A
V
 
Q
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
V
R
 
R
L
 
K
G
 
E
G
 
N
A
 
N
G
 
D
Y
 
R
L
 
L
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
C
x
T
D
|
D
M
x
I
G
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
C
G
 
Q
A
 
H
L
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
S
I
 
A
E
 
V
A
 
H
E
 
T
H
 
F
G
 
G
A
 
G
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
A
 
I
P
 
V
G
 
A
D
 
P
F
 
I
L
 
H
D
 
E
Y
 
M
D
 
E
L
 
L
A
 
S
T
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
M
F
 
F
V
 
L
A
 
M
T
 
S
Q
 
K
R
 
H
A
 
A
G
 
L
R
 
K
S
 
H
M
 
M
V
 
L
A
 
A
H
 
A
G
 
G
I
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
C
S
|
S
I
 
V
N
 
G
A
 
G
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
W
P
 
P
S
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
M
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
G
 
C
P
|
P
G
|
G
S
 
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
E
 
-
M
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
M
 
-
N
 
-
M
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
L
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
S
T
 
A
I
 
I
Y
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
41% identity, 95% coverage: 6:239/247 of query aligns to 12:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
L
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
G
E
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
V
I
 
V
L
 
V
A
 
G
D
|
D
I
|
I
Q
 
D
D
 
P
S
 
T
V
 
T
Q
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
D
R
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
G
A
 
L
G
 
F
Y
 
V
L
 
P
C
x
V
D
|
D
M
x
V
G
 
S
D
 
E
A
 
Q
A
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
D
A
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
T
I
 
A
E
 
A
A
 
S
E
 
T
H
 
F
G
 
G
A
 
R
V
 
V
T
 
D
Y
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
S
A
 
P
P
 
P
G
 
E
D
 
D
F
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
E
D
 
N
Y
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
P
T
 
A
F
 
W
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
Q
D
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
S
V
 
V
F
 
Y
V
 
L
A
 
S
T
 
C
Q
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
L
R
 
R
S
 
H
M
 
M
V
 
V
A
 
P
H
 
A
G
 
G
I
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
A
S
|
S
I
 
F
N
 
V
A
 
A
Q
 
V
V
 
M
-
 
G
A
 
S
I
 
A
P
 
T
S
 
S
I
x
Q
P
 
I
A
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
M
 
L
Q
 
A
L
 
M
T
 
S
K
 
R
V
 
E
A
 
L
A
 
G
L
 
V
A
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
G
 
C
P
|
P
G
 
G
S
x
P
I
x
V
D
 
N
T
 
T
E
 
P
M
 
L
M
 
L
A
 
Q
G
 
E
V
 
L
N
 
F
A
 
A
-
 
K
N
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
R
M
 
A
N
 
A
M
 
R
V
 
R
L
 
L
S
 
V
R
 
H
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
F
G
 
A
T
 
E
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
N
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
S
T
 
T
I
 
F
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1cydA Carbonyl reductase complexed with NADPH and 2-propanol (see paper)
36% identity, 95% coverage: 7:241/247 of query aligns to 8:240/242 of 1cydA

query
sites
1cydA
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
G
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
D
C
 
T
A
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
H
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
V
L
 
A
A
 
V
D
 
T
I
x
R
Q
x
T
D
 
N
S
 
S
-
 
D
V
 
L
Q
 
V
E
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
C
G
 
P
G
 
G
A
 
I
G
 
E
Y
 
P
L
 
V
C
 
C
-
 
V
D
|
D
M
x
L
G
 
G
D
 
D
A
 
W
A
 
D
A
 
A
V
 
T
G
 
E
A
 
K
L
 
A
F
 
L
D
 
G
R
 
G
I
 
I
E
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
D
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
L
A
 
V
A
 
I
P
 
M
G
 
Q
D
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
E
Y
 
V
D
 
T
L
 
K
A
 
E
T
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
L
 
F
D
 
S
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
Q
A
 
V
T
 
S
Q
 
Q
R
 
M
A
 
V
G
 
A
R
 
R
S
 
D
M
 
M
V
 
I
A
 
N
H
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
P
G
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
V
S
 
S
S
|
S
I
 
M
N
 
V
A
 
A
Q
 
H
V
 
V
A
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
N
I
x
L
P
 
I
A
 
T
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
M
M
 
T
Q
 
M
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
G
 
N
P
|
P
G
x
T
S
x
V
I
x
V
D
 
L
T
|
T
E
 
D
M
|
M
M
x
G
A
 
K
G
 
K
V
|
V
N
 
S
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
F
M
 
A
N
 
R
M
 
K
V
 
L
L
 
K
S
 
E
R
 
R
T
 
H
P
 
P
L
 
L
K
 
R
R
 
K
V
 
F
G
 
A
T
 
E
A
 
V
Q
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
I
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
S
S
 
A
Y
 
S
V
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
G
T
 
G
I
 
I
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
L

P08074 Carbonyl reductase [NADPH] 2; Adipocyte protein P27; AP27; Lung carbonyl reductase; LCR; NADPH-dependent carbonyl reductase 2; EC 1.1.1.184 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 7:241/247 of query aligns to 10:242/244 of P08074

query
sites
P08074
A
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
A
x
G
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
Y
x
R
A
x
D
C
x
T
A
x
V
E
x
K
A
|
A
L
|
L
A
x
H
A
|
A
E
x
S
G
|
G
A
|
A
R
x
K
I
x
V
I
x
V
L
x
A
A
x
V
D
x
T
I
x
R
Q
 
T
D
 
N
S
 
S
-
 
D
V
 
L
Q
 
V
E
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
C
G
 
P
G
 
G
A
 
I
G
 
E
Y
 
P
L
 
V
C
 
C
-
 
V
D
 
D
M
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
W
A
 
D
A
 
A
V
 
T
G
 
E
A
 
K
L
 
A
F
 
L
D
 
G
R
 
G
I
 
I
E
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
D
Y
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
I
P
 
M
G
 
Q
D
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
E
Y
 
V
D
 
T
L
 
K
A
 
E
T
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
S
L
 
F
D
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
Q
A
 
V
T
 
S
Q
 
Q
R
 
M
A
 
V
G
 
A
R
 
R
S
 
D
M
 
M
V
 
I
A
 
N
H
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
P
G
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
V
S
 
S
S
 
S
I
 
M
N
 
V
A
 
A
Q
 
H
V
 
V
A
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
N
I
 
L
P
 
I
A
 
T
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
S
 
T
K
 
K
G
 
G
G
 
A
L
 
M
M
 
T
Q
 
M
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
G
 
N
P
 
P
G
 
T
S
 
V
I
 
V
D
 
L
T
 
T
E
 
D
M
 
M
M
 
G
A
 
K
G
 
K
V
 
V
N
 
S
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
F
M
 
A
N
 
R
M
 
K
V
 
L
L
 
K
S
 
E
R
 
R
T
 
H
P
 
P
L
 
L
K
 
R
R
 
K
V
 
F
G
 
A
T
 
E
A
 
V
Q
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
I
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
S
S
 
A
Y
 
S
V
 
T
T
 
S
G
 
G
E
 
G
T
 
G
I
 
I
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
L

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
34% identity, 95% coverage: 6:239/247 of query aligns to 8:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
Q
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
G
C
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
S
I
 
V
I
 
V
L
 
V
A
 
A
D
x
S
I
x
R
Q
 
N
-
 
L
D
 
E
S
 
E
V
 
A
Q
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
G
 
T
G
 
E
A
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
M
G
 
A
Y
 
F
L
 
R
C
|
C
D
|
D
M
x
V
G
 
S
D
 
N
A
 
Y
A
 
E
A
 
E
V
 
V
G
 
K
A
 
K
L
 
L
F
 
L
D
 
E
R
 
A
I
 
V
E
 
K
A
 
E
E
 
K
H
 
F
G
 
G
A
 
K
V
 
L
T
 
D
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
N
A
 
R
P
 
R
G
 
H
D
 
P
F
 
A
L
 
E
D
 
E
Y
 
F
D
 
P
L
 
L
A
 
D
T
 
E
F
 
F
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
D
 
E
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
F
G
 
G
V
 
T
F
 
Y
V
 
Y
A
 
V
T
 
C
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
F
R
 
-
S
 
S
M
 
L
V
 
L
A
 
R
H
 
E
G
 
S
I
 
D
K
 
N
G
 
P
A
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
G
S
|
S
I
 
L
N
 
T
A
 
V
Q
 
E
-
 
E
V
 
V
A
 
T
I
 
M
P
 
P
S
 
N
I
|
I
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
V
M
 
A
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
E
L
 
W
A
 
G
P
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
I
G
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
W
I
x
Y
D
 
R
T
|
T
E
 
K
M
|
M
M
x
T
A
 
E
G
 
A
V
 
V
N
 
F
A
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
E
A
 
K
M
 
L
N
 
D
M
 
Y
V
 
M
L
 
L
S
 
K
R
 
R
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
T
G
 
G
T
 
V
A
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
L
A
 
K
N
 
G
V
 
V
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
E
K
 
E
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
I
I
 
I
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
40% identity, 96% coverage: 4:239/247 of query aligns to 8:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
T
 
S
P
 
K
L
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
F
A
 
G
C
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
I
 
V
I
 
I
L
 
I
A
 
A
D
|
D
I
 
-
Q
x
R
D
 
D
S
 
A
V
 
H
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
R
 
R
L
 
E
G
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
Q
Y
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
I
-
 
S
C
|
C
D
 
N
M
x
I
G
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
T
A
 
Q
V
 
V
G
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
S
R
 
Q
I
 
A
E
 
E
A
 
E
E
 
A
H
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
N
A
 
R
P
 
D
G
 
A
D
 
M
F
 
L
L
 
H
D
 
K
Y
 
L
D
 
T
L
 
E
A
 
A
T
 
D
F
 
W
D
 
D
R
 
T
V
 
V
L
 
I
D
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
V
 
L
A
 
C
T
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
A
G
 
A
R
 
I
S
 
R
M
 
M
V
 
R
A
 
E
H
 
R
G
 
G
I
 
-
K
 
A
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
N
 
S
A
 
W
Q
 
L
V
 
G
A
 
N
I
 
V
P
 
G
S
 
Q
I
 
T
P
 
N
A
 
-
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
V
Q
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
C
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
G
 
C
P
 
P
G
 
G
S
 
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
M
x
T
A
 
R
G
 
G
V
 
V
N
 
P
A
 
E
N
 
N
P
 
-
E
 
-
A
 
V
M
 
W
N
 
Q
M
 
I
V
 
M
L
 
V
S
 
S
R
 
K
T
 
I
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
Y
V
 
A
G
 
G
T
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
N
 
E
V
 
C
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
G
A
 
A
S
 
R
Y
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
V
I
 
I
Y
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
38% identity, 97% coverage: 1:239/247 of query aligns to 1:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
S
 
K
Q
 
M
T
 
T
P
 
K
L
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
S
C
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
I
 
V
I
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
K
A
 
E
D
 
K
I
 
A
Q
 
E
D
 
A
S
 
V
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
K
A
 
A
R
 
K
-
 
G
L
 
V
G
 
D
G
 
S
A
 
F
G
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
 
A
D
 
N
M
 
V
G
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
V
G
 
K
A
 
A
L
 
M
F
 
I
D
 
K
R
 
E
I
 
V
E
 
V
A
 
S
E
 
Q
H
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
A
 
R
P
 
D
G
 
N
D
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
D
 
K
L
 
E
A
 
Q
T
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
N
A
 
C
T
 
I
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
M
 
M
V
 
L
A
 
R
H
 
Q
G
 
R
I
 
-
K
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
A
 
G
I
 
N
P
 
P
S
 
G
I
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
M
 
T
A
 
D
G
 
A
V
 
L
N
 
S
A
 
-
N
 
-
P
 
D
E
 
E
A
 
L
M
 
K
N
 
E
M
 
Q
V
 
M
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
V
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
Q
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
I
 
I
Y
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
36% identity, 95% coverage: 6:239/247 of query aligns to 15:255/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
Q
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Y
 
R
A
 
A
C
 
M
A
 
A
E
 
V
A
 
R
L
 
F
A
 
G
A
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
N
-
 
Y
-
x
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
D
 
D
I
 
A
Q
 
K
D
 
K
S
 
E
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
G
 
A
Y
 
I
L
 
I
C
 
V
-
 
Q
-
 
G
D
|
D
M
x
V
G
 
T
D
 
K
A
 
E
A
 
E
A
 
D
V
 
V
G
 
V
A
 
N
L
 
L
F
 
V
D
 
Q
R
 
T
I
 
A
E
 
I
A
 
K
E
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
T
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
A
x
E
A
 
N
P
 
P
G
 
V
D
 
P
F
 
S
L
 
H
D
 
E
Y
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
D
T
 
N
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
T
 
S
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
I
R
 
K
S
 
Y
M
 
F
V
 
V
A
 
E
H
 
N
G
 
D
I
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
N
V
 
V
V
 
I
N
 
N
M
|
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
x
H
A
 
E
Q
 
M
V
 
I
A
 
P
I
x
W
P
 
P
S
 
L
I
 
F
P
 
V
A
 
H
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
L
 
M
M
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
K
 
E
V
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
G
 
G
P
|
P
G
|
G
S
 
A
I
x
M
D
 
N
T
|
T
E
x
P
M
x
I
M
x
N
A
 
A
G
 
E
V
x
K
N
 
F
A
 
A
N
 
D
P
 
P
E
 
V
A
 
Q
M
 
R
N
 
A
M
 
D
V
 
V
L
 
E
S
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
Y
V
 
I
G
 
G
T
 
K
A
 
P
Q
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
K
 
Q
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
I
T
 
T
I
 
L
Y
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q6WVP7 NADP-dependent (R)-specific alcohol dehydrogenase; (R)-specific ADH; Ketoreductase; KRED; EC 1.1.1.- from Lentilactobacillus kefiri (Lactobacillus kefiri) (see paper)
37% identity, 95% coverage: 6:239/247 of query aligns to 9:248/252 of Q6WVP7

query
sites
Q6WVP7
L
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
x
T
Q
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
F
A
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
V
L
 
I
A
 
T
D
 
G
I
x
R
Q
x
H
D
 
A
S
 
D
V
 
V
Q
 
G
E
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
K
-
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
T
G
 
D
Y
 
V
L
 
I
-
 
R
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
C
 
H
D
|
D
M
x
A
G
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
G
V
 
W
G
 
T
A
 
K
L
 
L
F
 
F
D
 
D
R
 
T
I
 
T
E
 
E
A
 
E
E
 
A
H
 
F
G
 
G
A
 
P
V
 
V
T
 
T
Y
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
V
P
 
S
G
 
K
D
 
S
F
 
V
L
 
E
D
 
D
Y
 
T
D
 
T
L
 
T
A
 
E
T
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
F
A
 
G
T
 
T
Q
 
R
R
 
L
A
 
G
G
 
I
R
 
Q
S
 
R
M
 
M
V
 
K
A
 
N
H
 
K
G
 
G
I
 
L
K
 
G
G
 
A
A
 
S
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
I
N
 
E
A
 
G
Q
 
F
V
 
V
A
 
G
I
 
D
P
 
P
S
 
T
I
 
L
P
 
G
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
V
M
 
R
Q
 
I
L
 
M
T
 
S
K
 
K
V
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
C
A
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
H
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
G
 
H
P
 
P
G
 
G
S
 
Y
I
|
I
D
x
K
T
|
T
E
x
P
M
x
L
M
 
V
A
 
D
G
 
D
V
 
L
N
 
E
A
 
G
N
 
A
P
 
E
E
 
E
A
 
M
M
 
M
N
 
S
M
 
Q
V
 
-
L
 
R
S
 
T
R
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
H
V
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
P
Q
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
W
V
 
I
V
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
S
S
 
K
Y
 
F
V
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
E
I
 
F
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
38% identity, 96% coverage: 4:239/247 of query aligns to 1:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
T
 
T
P
 
K
L
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
S
C
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
I
 
V
I
 
A
L
 
V
-
x
N
-
x
Y
-
x
A
-
x
G
-
x
S
-
 
K
A
 
E
D
 
K
I
 
A
Q
 
E
D
 
A
S
 
V
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
K
A
 
A
R
 
K
-
 
G
L
 
V
G
 
D
G
 
S
A
 
F
G
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
x
A
D
x
N
M
x
V
G
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
V
G
 
K
A
 
A
L
 
M
F
 
I
D
 
K
R
 
E
I
 
V
E
 
V
A
 
S
E
 
Q
H
 
F
G
 
G
A
 
S
V
 
L
T
 
D
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
A
 
R
P
 
D
G
 
N
D
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
D
 
K
L
 
E
A
 
Q
T
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
I
x
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
N
A
 
C
T
 
I
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
M
 
M
V
 
L
A
 
R
H
 
Q
G
 
R
I
 
-
K
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
V
A
 
G
Q
 
A
V
 
V
A
 
G
I
 
N
P
 
P
S
 
G
I
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
V
M
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
M
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
A
 
-
N
 
T
P
 
D
E
 
E
A
 
L
M
 
K
N
 
E
M
 
Q
V
 
M
L
 
L
S
 
T
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
V
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
Q
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
K
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
I
 
I
Y
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 3:239/247 of query aligns to 4:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
Q
 
E
T
 
G
P
 
K
L
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
I
-
 
G
L
 
T
A
 
A
D
x
T
I
 
S
Q
 
E
D
 
N
S
 
G
V
 
A
Q
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
L
L
 
M
C
 
L
D
x
N
M
x
V
G
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
S
V
 
I
G
 
E
A
 
S
L
 
V
F
 
L
D
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
V
T
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
A
 
R
P
 
D
G
 
N
D
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
D
 
K
L
 
D
A
 
E
T
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
R
A
 
L
T
 
S
Q
 
K
R
 
A
A
 
V
G
 
M
R
 
R
S
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
H
 
K
G
 
R
I
 
-
K
 
H
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
M
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
V
A
 
G
Q
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
P
 
G
S
 
G
I
 
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
V
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
M
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
N
 
S
A
 
D
N
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
A
M
 
G
N
 
-
M
 
-
V
 
I
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
G
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
T
 
T
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 96% coverage: 3:239/247 of query aligns to 3:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
Q
 
E
T
 
G
P
 
K
L
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
I
-
 
G
L
 
T
A
 
A
D
x
T
I
 
S
Q
 
E
D
 
N
S
 
G
V
 
A
Q
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
A
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
N
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Y
 
L
L
 
M
C
 
L
D
x
N
M
x
V
G
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
S
V
 
I
G
 
E
A
 
S
L
 
V
F
 
L
D
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
E
V
 
V
T
 
D
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
A
 
R
P
 
D
G
 
N
D
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
D
 
K
L
 
D
A
 
E
T
x
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
R
A
 
L
T
 
S
Q
 
K
R
 
A
A
 
V
G
 
M
R
 
R
S
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
H
 
K
G
 
R
I
 
-
K
 
H
G
 
G
A
 
R
V
 
I
V
 
I
N
 
T
M
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
A
 
G
Q
 
T
V
 
M
A
 
G
I
 
N
P
 
G
S
 
G
I
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
V
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
G
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
M
 
T
A
 
R
G
 
A
V
 
L
N
 
S
A
 
D
N
 
D
P
 
Q
E
 
R
A
 
A
M
 
G
N
 
-
M
 
-
V
 
I
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
T
 
G
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
K
 
E
A
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
T
|
T
I
 
L
Y
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
39% identity, 86% coverage: 27:239/247 of query aligns to 30:251/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
A
L
 
L
A
 
I
D
|
D
I
 
L
Q
 
D
D
 
Q
S
 
G
V
 
L
Q
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
S
A
 
A
R
 
A
L
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
G
 
G
Y
 
F
L
 
G
C
 
A
D
|
D
M
x
V
G
 
T
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
D
V
 
I
G
 
T
A
 
A
L
 
A
F
 
I
D
 
T
R
 
S
I
 
A
E
 
E
A
 
Q
E
 
T
H
 
I
G
 
G
A
 
S
V
 
L
T
 
T
Y
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
F
G
 
G
D
 
S
F
 
V
L
 
H
D
 
D
Y
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
F
 
W
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
M
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
R
 
T
G
 
G
V
 
T
F
 
F
V
 
L
A
 
A
T
 
S
Q
 
K
R
 
A
A
 
A
G
 
L
R
 
A
S
 
G
M
 
M
V
 
L
A
 
E
H
 
R
G
 
H
I
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
F
S
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
A
A
 
G
Q
 
L
V
 
V
A
 
G
I
 
I
P
 
P
S
 
T
I
 
M
P
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
L
 
I
M
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
V
 
Q
A
 
M
A
 
A
L
 
A
A
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
G
 
C
P
 
P
G
 
G
S
x
T
I
x
V
D
x
T
T
x
S
-
x
T
-
x
G
-
 
M
-
 
G
E
 
Q
M
 
Q
M
 
L
A
 
L
G
 
G
V
 
S
N
 
D
A
 
T
N
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
V
M
 
Q
N
 
A
M
 
R
V
x
R
L
 
L
S
 
A
R
x
K
T
x
Y
P
 
P
L
 
I
K
 
G
R
 
R
V
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
Q
A
 
A
S
 
A
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
A
I
 
F
Y
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3607850 Dshi_1258 short-chain dehydrogenase/reductase SDR (RefSeq)
MSQTPLALITGGAQGIGYACAEALAAEGARIILADIQDSVQEAAARLGGAGYLCDMGDAA
AVGALFDRIEAEHGAVTYLVNNAGIAAPGDFLDYDLATFDRVLDINLRGVFVATQRAGRS
MVAHGIKGAVVNMSSINAQVAIPSIPAYCASKGGLMQLTKVAALALAPHGIRVNAVGPGS
IDTEMMAGVNANPEAMNMVLSRTPLKRVGTAQEIANVVAFLCSDKASYVTGETIYVDGGR
LGLNYTC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory