SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3607950 FitnessBrowser__Dino:3607950 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
38% identity, 95% coverage: 12:255/258 of query aligns to 2:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
R
 
Q
L
 
F
F
 
M
G
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
E
T
 
L
L
 
L
G
 
A
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
x
T
R
 
S
A
 
E
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
R
 
G
A
 
D
E
 
N
G
 
G
I
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
K
T
 
G
A
 
M
A
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
A
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
T
 
K
T
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
G
P
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
A
 
I
W
 
F
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
L
 
M
I
 
M
A
 
K
-
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
V
A
x
G
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
T
G
 
M
V
 
G
L
 
N
K
 
A
T
 
G
V
x
Q
G
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
P
 
D
I
 
M
N
 
N
T
 
D
E
 
E
F
 
Q
F
 
R
A
 
T
S
 
A
E
 
T
A
 
L
G
 
A
Q
 
Q
K
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
V
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 95% coverage: 12:255/258 of query aligns to 2:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
Q
L
 
F
F
 
M
G
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
E
T
 
L
L
 
L
G
 
A
Q
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
x
T
R
 
S
A
 
E
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
R
 
G
A
 
D
E
 
N
G
 
G
I
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
K
T
 
G
A
 
M
A
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
A
 
P
A
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
T
 
K
T
 
A
V
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
F
G
 
G
P
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
V
x
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
A
 
I
W
 
F
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
L
 
M
I
 
M
A
 
K
-
 
K
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
T
G
 
M
V
 
G
L
 
N
K
 
A
T
 
G
V
 
Q
G
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
S
M
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
P
 
D
I
x
M
N
 
-
T
 
T
E
 
K
F
 
A
F
 
L
A
 
N
S
 
D
E
 
E
A
 
Q
G
 
R
Q
 
T
K
 
A
M
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
G
 
R
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
V
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
38% identity, 95% coverage: 14:257/258 of query aligns to 12:261/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
F
 
F
G
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
G
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
R
T
 
G
L
 
L
G
 
A
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
I
A
 
N
A
 
D
R
|
R
R
 
N
A
 
E
D
 
E
R
 
K
L
 
A
E
 
A
A
 
T
V
 
L
A
 
A
E
 
R
T
 
R
L
 
F
R
 
R
A
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
F
V
 
A
A
 
A
Q
 
D
T
 
H
A
 
A
A
 
V
L
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
E
A
 
H
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
D
T
 
E
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
R
V
 
V
G
 
G
P
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
V
 
I
S
 
Q
G
 
R
Q
 
R
D
 
A
M
 
P
V
 
L
I
 
D
D
 
A
T
 
F
T
 
E
E
 
P
A
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
H
R
 
A
V
 
L
L
 
M
D
 
R
T
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
N
V
 
V
S
 
A
R
 
Q
A
 
A
F
 
V
A
 
A
P
 
R
G
 
H
L
 
M
I
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
G
Q
 
H
G
 
G
T
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
C
S
|
S
I
 
V
L
 
Q
G
 
S
I
 
E
G
 
L
V
 
A
L
 
R
K
 
P
T
 
T
V
 
I
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
I
 
R
Q
 
M
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
G
M
 
M
A
 
C
L
 
A
E
 
D
L
 
W
A
 
A
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
L
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
I
x
F
E
 
E
T
|
T
P
 
E
I
x
L
N
|
N
T
 
R
E
 
A
F
 
L
F
 
V
A
 
D
S
 
D
E
 
A
A
 
A
G
 
F
Q
 
S
K
 
D
M
 
W
L
 
L
-
 
C
R
 
K
G
 
R
V
 
T
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
G
Q
 
Q
P
 
V
G
 
D
D
 
E
L
 
L
D
 
C
A
 
G
A
 
A
V
 
A
L
 
I
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
D
F
 
F
V
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
V
 
L
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
L
T
 
T
L
 
S
A
 
A
L
 
V

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 92% coverage: 19:255/258 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
E
 
N
V
 
V
-
 
A
I
 
V
L
 
N
A
 
Y
A
 
A
R
 
G
R
 
S
A
 
K
D
 
E
R
 
K
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
I
R
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
D
A
 
S
Q
 
F
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
T
 
K
T
 
E
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
F
G
 
G
P
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
N
V
 
C
S
 
I
R
 
Q
A
 
K
F
 
A
A
 
T
P
 
P
G
 
Q
L
 
M
I
 
L
-
 
R
A
 
Q
R
 
R
Q
 
S
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
V
V
 
G
L
 
N
K
 
P
T
 
G
V
x
Q
G
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
M
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
N
 
-
T
 
T
E
 
D
F
 
A
F
 
L
A
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
T
G
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
G
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
V
L
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
K
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
V
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
40% identity, 96% coverage: 9:256/258 of query aligns to 3:254/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
L
 
L
F
 
Y
K
 
F
R
 
Q
L
 
S
F
 
M
G
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
x
T
R
 
S
A
 
A
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
N
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
G
Q
 
A
T
 
G
A
 
L
A
 
V
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
S
A
 
D
A
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
T
 
E
T
 
H
V
 
I
-
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
-
 
G
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
-
I
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
V
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
F
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
L
 
M
I
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
W
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
-
G
 
-
I
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
M
K
 
G
T
 
N
V
 
A
G
 
G
P
 
Q
-
 
T
-
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
R
 
S
D
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
P
 
D
I
x
M
N
x
T
T
 
R
E
 
E
F
 
L
F
 
-
A
 
-
S
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
Q
Q
 
R
K
 
E
M
 
A
L
 
L
R
 
L
G
 
G
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
G
 
E
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M
A
 
S

4hp8B Crystal structure of a putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens (target efi-506435) with bound NADP
40% identity, 94% coverage: 11:252/258 of query aligns to 1:242/246 of 4hp8B

query
sites
4hp8B
K
 
K
R
 
N
L
 
P
F
 
F
G
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
N
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
V
T
 
G
L
 
L
G
 
A
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
V
L
 
C
A
 
A
A
 
A
R
|
R
R
|
R
A
 
A
-
 
P
-
 
D
D
 
E
R
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
I
V
 
I
A
 
A
E
 
K
T
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
D
G
 
G
I
 
G
V
 
N
A
 
A
Q
 
S
T
 
A
A
 
L
A
 
L
L
 
I
D
|
D
V
x
F
T
 
A
D
 
D
A
 
P
A
 
L
S
 
A
V
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
S
V
 
F
T
 
T
T
 
D
V
 
A
G
 
G
P
 
-
L
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
|
G
V
x
I
S
 
I
G
 
R
Q
 
R
D
 
A
M
 
D
V
 
S
I
 
V
D
 
E
T
 
F
T
 
S
E
 
E
A
 
L
D
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
E
V
 
V
L
 
M
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
A
 
L
W
 
F
R
 
F
V
 
T
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
P
 
K
G
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
A
-
 
K
-
 
G
R
 
R
Q
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
V
L
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
I
 
L
L
 
L
G
 
S
I
 
F
G
 
Q
V
 
G
L
 
G
K
 
I
T
 
R
V
|
V
G
 
P
P
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
A
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
N
E
 
E
L
 
W
A
 
A
R
 
A
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
I
|
I
E
 
E
T
|
T
P
 
N
I
 
-
N
|
N
T
|
T
E
 
E
F
 
A
F
 
L
A
 
R
S
 
A
E
 
D
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
K
 
N
-
 
K
-
 
A
M
 
I
L
 
L
R
 
E
G
 
R
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
G
Q
 
H
P
 
S
G
 
E
D
 
D
L
 
I
D
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
A
L
 
V
M
 
F
L
 
L
L
 
S
G
 
S
P
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
D
F
 
Y
V
 
V
T
 
H
G
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
40% identity, 95% coverage: 9:252/258 of query aligns to 9:251/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
L
 
L
F
 
Y
K
 
F
R
 
Q
L
 
S
F
 
M
G
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
 
T
R
 
S
A
 
A
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
N
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
G
Q
 
A
T
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
A
 
D
A
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
T
 
E
T
 
H
V
 
I
-
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
-
 
G
G
 
Q
P
 
P
L
 
L
D
 
-
I
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
N
S
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
V
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
F
R
 
D
V
 
V
L
x
V
D
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
K
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
L
 
M
I
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
W
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
G
G
 
N
V
 
A
L
 
G
K
 
Q
T
 
T
V
 
-
G
 
-
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
Q
x
G
L
x
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
R
 
S
D
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
P
 
D
I
 
M
N
 
T
T
 
R
E
 
E
F
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
A
A
 
Q
G
 
R
Q
 
E
K
 
A
M
 
L
L
 
L
R
 
G
G
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
G
 
E
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
37% identity, 92% coverage: 19:255/258 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
H
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
G
 
A
Q
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
E
 
N
V
 
V
-
 
A
I
 
V
L
x
N
A
x
Y
A
|
A
R
x
G
R
x
S
A
 
K
D
 
E
R
 
K
L
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
I
R
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
D
A
 
S
Q
 
F
T
 
A
A
 
I
A
 
Q
L
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
T
 
K
T
 
E
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
F
G
 
G
P
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
V
 
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
N
V
 
C
S
 
I
R
 
Q
A
 
K
F
 
A
A
 
T
P
 
P
G
 
Q
L
 
M
I
 
L
-
 
R
A
 
Q
R
 
R
Q
 
S
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
V
V
 
G
L
 
N
K
 
P
T
 
G
V
x
Q
G
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
M
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
N
 
T
T
 
D
E
 
E
F
 
L
F
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
K
Q
 
E
K
 
Q
M
 
M
L
 
L
R
 
T
G
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
G
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
V
L
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
K
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
V
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M

4bo1A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(4-chloro-2,5- dimethoxyphenyl)quinoline-8-carboxamide at 2.2a resolution (see paper)
40% identity, 96% coverage: 9:256/258 of query aligns to 1:237/237 of 4bo1A

query
sites
4bo1A
L
 
L
F
 
Y
K
 
F
R
 
Q
L
 
S
F
 
M
G
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
 
T
R
 
S
A
 
A
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
N
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
G
Q
 
A
T
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
A
 
D
A
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
T
 
E
T
 
H
V
 
I
-
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
G
 
G
P
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
N
S
 
A
G
 
G
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
E
 
D
A
 
D
D
 
E
W
|
W
D
 
F
R
 
D
V
 
V
L
x
V
D
x
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
K
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
L
 
M
I
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
W
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
Q
L
 
T
K
 
N
T
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
R
 
S
D
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
P
 
D
I
 
M
N
 
T
T
 
R
E
 
E
F
 
L
F
 
-
A
 
-
S
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
Q
Q
 
R
K
 
E
M
 
A
L
 
L
R
 
L
G
 
G
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
G
 
E
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M
A
 
S

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:255/258 of query aligns to 3:253/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
F
 
Y
K
 
R
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
R
 
C
A
 
A
L
 
A
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
C
L
 
R
T
 
A
L
 
F
G
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
R
 
E
A
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
 
R
A
 
I
A
 
V
L
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
A
T
 
A
T
 
E
V
 
A
G
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
S
S
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
R
Q
 
L
D
 
H
M
 
D
V
 
A
I
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
G
A
 
M
W
 
F
R
 
W
V
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
G
P
 
R
G
 
A
L
 
M
I
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
G
Q
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
L
A
 
G
S
|
S
I
 
M
L
 
S
G
 
G
I
 
T
G
 
I
V
 
V
L
x
N
K
 
R
T
 
P
-
 
Q
-
 
F
V
 
A
G
 
S
P
 
S
Y
|
Y
A
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
I
 
H
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
R
 
G
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
I
x
V
E
 
A
T
|
T
P
 
E
I
x
M
N
x
T
T
 
L
E
 
K
F
x
M
F
 
R
A
 
E
-
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
G
 
F
Q
 
E
K
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
G
 
M
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
L
 
V

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:255/258 of query aligns to 3:253/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
F
 
Y
K
 
R
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
R
 
C
A
 
A
L
 
A
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
C
L
 
R
T
 
A
L
 
F
G
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
R
 
E
A
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
 
R
A
 
I
A
 
V
L
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
A
T
 
A
T
 
E
V
 
A
G
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
S
S
x
A
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
R
Q
 
L
D
 
H
M
 
D
V
 
A
I
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
G
A
 
M
W
 
F
R
 
W
V
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
G
P
 
R
G
 
A
L
 
M
I
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
G
Q
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
L
A
 
G
S
|
S
I
x
M
L
 
S
G
 
G
I
 
T
G
 
I
V
 
V
L
x
N
K
 
R
T
 
P
-
 
Q
-
 
F
V
 
A
G
 
S
P
 
S
Y
|
Y
A
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
I
 
H
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
R
 
G
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
I
x
V
E
 
A
T
|
T
P
 
E
I
x
M
N
x
T
T
 
L
E
 
K
F
 
M
F
 
R
A
 
E
-
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
G
 
F
Q
 
E
K
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
G
 
M
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
L
 
V

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:255/258 of query aligns to 3:253/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
F
 
Y
K
 
R
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
R
 
C
A
 
A
L
 
A
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
C
L
 
R
T
 
A
L
 
F
G
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
|
R
R
 
E
A
|
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
E
x
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
x
R
A
 
I
A
 
V
L
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
A
T
 
A
T
 
E
V
 
A
G
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
S
S
x
A
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
R
Q
 
L
D
 
H
M
 
D
V
 
A
I
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
G
A
 
M
W
 
F
R
 
W
V
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
G
P
 
R
G
 
A
L
 
M
I
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
G
Q
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
L
A
 
G
S
|
S
I
 
M
L
x
S
G
 
G
I
 
T
G
 
I
V
 
V
L
 
N
K
 
R
T
 
P
-
 
Q
-
 
F
V
 
A
G
 
S
P
 
S
Y
|
Y
A
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
I
 
H
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
R
 
G
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
I
x
V
E
 
A
T
|
T
P
 
E
I
x
M
N
x
T
T
 
L
E
 
K
F
 
M
F
 
R
A
 
E
-
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
G
 
F
Q
 
E
K
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
G
 
M
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
L
 
V

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:255/258 of query aligns to 3:253/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
F
 
Y
K
 
R
R
 
T
L
 
V
F
 
F
G
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
R
 
C
A
 
A
L
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
C
L
 
R
T
 
A
L
 
F
G
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
I
A
x
D
R
 
R
R
 
E
A
 
A
D
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
A
G
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
 
R
A
 
I
A
 
V
L
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
A
T
 
A
T
 
E
V
 
A
G
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
L
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
S
S
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
A
G
 
R
Q
 
L
D
 
H
M
 
D
V
 
A
I
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
T
W
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
G
A
 
M
W
 
F
R
 
W
V
 
A
S
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
G
P
 
R
G
 
A
L
 
M
I
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
G
Q
 
A
G
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
G
S
 
S
I
 
M
L
 
S
G
 
G
I
 
T
G
 
I
V
 
V
L
 
N
K
 
R
T
 
P
-
 
Q
-
 
F
V
 
A
G
 
S
P
 
S
Y
|
Y
A
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
I
 
H
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
R
 
G
D
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
I
x
V
E
x
A
T
|
T
P
 
E
I
 
M
N
 
T
T
 
L
E
 
K
F
 
M
F
 
R
A
 
E
-
 
R
S
 
P
E
 
E
A
 
L
G
 
F
Q
 
E
K
 
T
M
 
W
L
 
L
R
 
D
G
 
M
V
 
T
P
 
P
Q
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
A
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
36% identity, 93% coverage: 16:255/258 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
V
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
x
T
R
 
S
A
 
E
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
T
 
Y
L
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
N
G
 
G
I
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
K
T
 
G
A
 
L
A
 
M
L
|
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
T
 
E
T
 
N
V
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
F
G
 
G
P
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
S
x
A
G
|
G
V
x
I
S
 
T
G
 
R
Q
 
D
D
 
N
M
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
D
A
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
A
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
M
P
 
R
G
 
A
L
 
M
I
 
M
A
 
K
-
 
K
R
 
R
Q
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
V
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
I
 
T
G
 
M
V
 
G
L
 
N
K
 
A
T
 
G
V
 
Q
G
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
A
 
S
M
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
D
I
 
M
N
 
-
T
 
T
E
 
R
F
 
A
F
 
L
A
 
T
S
 
D
E
 
E
A
 
Q
G
 
R
Q
 
A
K
 
G
M
 
T
L
 
L
R
 
A
G
 
A
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
G
 
N
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
E
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
T
 
T
V
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
41% identity, 93% coverage: 16:256/258 of query aligns to 5:241/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
H
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
G
A
 
T
A
 
A
R
 
T
R
 
S
A
 
A
D
 
S
R
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
N
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
G
Q
 
A
T
 
G
A
 
L
A
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
S
A
 
D
A
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
T
 
E
T
 
H
V
 
I
-
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
G
 
G
P
 
Q
L
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
N
 
N
S
 
A
G
 
G
V
 
R
S
 
M
G
 
K
Q
 
D
D
 
D
M
 
-
V
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
E
W
 
W
D
x
F
R
 
D
V
 
V
L
x
V
D
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
K
 
N
G
 
S
A
 
L
W
 
Y
R
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
F
 
V
A
 
L
P
 
R
G
 
G
L
 
M
I
 
T
-
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
W
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
-
G
 
-
I
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
M
K
 
G
T
 
N
V
 
A
G
 
G
P
 
Q
-
 
T
-
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
I
 
E
Q
 
G
L
x
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
G
R
 
S
D
 
R
G
 
A
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
P
 
D
I
 
M
N
 
T
T
 
R
E
 
E
F
 
L
F
 
-
A
 
-
S
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
Q
Q
 
R
K
 
E
M
 
A
L
 
L
R
 
L
G
 
G
-
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
G
 
E
D
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
A
G
 
S
P
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
H
 
M
T
 
Y
L
 
M
A
 
S

1xr3A Actinorhodin polyketide ketoreductase with NADP and the inhibitor isoniazid bound (see paper)
38% identity, 90% coverage: 21:252/258 of query aligns to 4:252/256 of 1xr3A

query
sites
1xr3A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
E
 
R
V
 
V
I
 
F
L
 
V
A
 
C
A
|
A
R
|
R
R
x
G
A
 
E
D
 
E
R
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
K
T
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
A
Q
 
D
T
 
G
A
 
R
A
 
T
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
E
A
 
A
S
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
E
T
 
R
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
V
 
R
S
 
P
G
 
G
Q
 
G
D
 
G
M
 
A
V
 
T
I
 
A
D
 
E
T
 
L
T
 
A
E
 
D
A
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
L
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
R
 
K
A
 
Q
F
 
V
-
 
L
-
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
E
R
 
R
-
 
G
Q
 
T
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
I
x
T
L
x
G
G
 
G
I
 
K
G
 
Q
V
 
G
L
x
V
K
 
V
T
 
H
V
 
A
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
V
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
Y
 
F
I
x
V
E
 
E
T
|
T
P
|
P
I
 
M
N
 
A
T
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
x
Y
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
W
E
 
E
F
 
V
F
 
S
A
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
Q
 
D
K
 
R
M
 
I
L
 
T
R
 
A
G
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
I
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
M
V
 
V
L
 
A
M
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
38% identity, 90% coverage: 21:252/258 of query aligns to 7:255/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
E
 
R
V
 
V
I
 
F
L
 
V
A
 
C
A
 
A
R
|
R
R
x
G
A
 
E
D
 
E
R
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
K
T
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
A
Q
 
D
T
 
G
A
 
R
A
 
T
L
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
E
A
 
A
S
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
E
T
 
R
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
|
G
V
 
R
S
 
P
G
 
G
Q
 
G
D
 
G
M
 
A
V
 
T
I
 
A
D
 
E
T
 
L
T
 
A
E
 
D
A
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
L
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
R
 
K
A
 
Q
F
 
V
-
 
L
-
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
E
R
 
R
-
 
G
Q
 
T
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
I
 
K
G
 
Q
V
 
G
L
 
V
K
 
V
T
 
H
V
 
A
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
V
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
x
V
E
 
E
T
|
T
P
 
P
I
 
M
N
 
A
T
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
x
Y
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
W
E
 
E
F
 
V
F
 
S
A
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
Q
 
D
K
 
R
M
 
I
L
 
T
R
 
A
G
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
I
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
M
V
 
V
L
 
A
M
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
38% identity, 90% coverage: 21:252/258 of query aligns to 5:253/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
E
 
R
V
 
V
I
 
F
L
 
V
A
 
C
A
|
A
R
|
R
R
x
G
A
 
E
D
 
E
R
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
K
T
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
A
Q
 
D
T
 
G
A
 
R
A
 
T
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
E
A
 
A
S
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
E
T
 
R
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
|
G
V
 
R
S
 
P
G
 
G
Q
 
G
D
 
G
M
 
A
V
 
T
I
 
A
D
 
E
T
 
L
T
 
A
E
 
D
A
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
L
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
R
 
K
A
 
Q
F
 
V
-
 
L
-
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
E
R
 
R
-
 
G
Q
 
T
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
I
x
T
L
 
G
G
 
G
I
 
K
G
x
Q
V
 
G
L
x
V
K
 
V
T
 
H
V
 
A
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
V
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
I
x
V
E
 
E
T
|
T
P
 
P
I
x
M
N
 
A
T
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
x
Y
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
W
E
 
E
F
 
V
F
 
S
A
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
Q
 
D
K
 
R
M
 
I
L
 
T
R
 
A
G
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
I
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
M
V
 
V
L
 
A
M
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2rh4B Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
38% identity, 90% coverage: 21:252/258 of query aligns to 16:264/268 of 2rh4B

query
sites
2rh4B
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
H
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
E
 
R
V
 
V
I
 
F
L
 
V
A
 
C
A
|
A
R
|
R
R
x
G
A
 
E
D
 
E
R
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
K
T
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
A
Q
 
D
T
 
G
A
 
R
A
 
T
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
E
A
 
A
S
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
E
T
 
R
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
S
 
A
G
 
G
V
 
R
S
 
P
G
 
G
Q
 
G
D
 
G
M
 
A
V
 
T
I
 
A
D
 
E
T
 
L
T
 
A
E
 
D
A
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
L
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
R
 
K
A
 
Q
F
 
V
-
 
L
-
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
E
R
 
R
-
 
G
Q
 
T
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
I
 
K
G
 
Q
V
 
G
L
 
V
K
 
V
T
 
H
V
 
A
G
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
V
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
Y
 
F
I
x
V
E
 
E
T
|
T
P
 
P
I
x
M
N
 
A
T
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
x
Y
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
W
E
 
E
F
 
V
F
 
S
A
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
Q
 
D
K
 
R
M
 
I
L
 
T
R
 
A
G
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
I
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
M
V
 
V
L
 
A
M
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
38% identity, 90% coverage: 21:252/258 of query aligns to 9:257/261 of P16544

query
sites
P16544
A
 
A
L
 
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
L
H
x
E
L
x
I
A
|
A
L
x
R
T
x
R
L
|
L
G
|
G
Q
x
K
A
x
E
G
|
G
A
x
L
E
x
R
V
|
V
I
x
F
L
x
V
A
x
C
A
|
A
R
|
R
R
x
G
A
 
E
D
 
E
R
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
K
T
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
A
Q
 
D
T
 
G
A
 
R
A
 
T
L
 
C
D
|
D
V
 
V
T
 
R
D
 
S
A
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
I
-
 
E
A
 
A
S
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
E
T
 
R
V
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
S
 
A
G
 
G
V
 
R
S
 
P
G
 
G
Q
 
G
D
 
G
M
 
A
V
 
T
I
 
A
D
 
E
T
 
L
T
 
A
E
 
D
A
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
L
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
R
 
K
A
 
Q
F
 
V
-
 
L
-
 
K
A
 
A
P
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
E
R
 
R
-
 
G
Q
 
T
G
 
G
T
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
I
 
K
G
 
Q
V
 
G
L
 
V
K
 
V
T
 
H
V
 
A
G
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
V
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
I
 
M
N
 
A
T
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
Y
-
 
S
-
 
D
-
 
I
-
 
W
E
 
E
F
 
V
F
 
S
A
 
T
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
Q
 
D
K
 
R
M
 
I
L
 
T
R
 
A
G
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
I
R
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
 
S
D
 
E
L
 
V
D
 
A
A
 
E
A
 
M
V
 
V
L
 
A
M
 
Y
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
A
F
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
V
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>3607950 FitnessBrowser__Dino:3607950
MQEVVQAALFKRLFGLEGKRALITGASSGIGAHLALTLGQAGAEVILAARRADRLEAVAE
TLRAEGIVAQTAALDVTDAASVAAAVTTVGPLDILINNSGVSGQDMVIDTTEADWDRVLD
TNLKGAWRVSRAFAPGLIARQGTILNVASILGIGVLKTVGPYAASKAGLIQLTRAMALEL
ARDGVRVNALAPGYIETPINTEFFASEAGQKMLRGVPQRRLGQPGDLDAAVLMLLGPGAG
FVTGATVVVDGGHTLALS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory