SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3608022 Dshi_1429 short-chain dehydrogenase/reductase SDR (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6b9uA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from brucella melitensis complexed with nadh
49% identity, 96% coverage: 10:256/256 of query aligns to 2:244/244 of 6b9uA

query
sites
6b9uA
L
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
F
|
F
G
 
G
R
 
E
E
 
G
I
 
M
A
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
x
R
N
x
D
G
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
G
A
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
D
N
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
A
C
x
A
D
|
D
V
x
I
S
 
S
K
 
K
G
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
E
 
A
T
 
A
I
 
L
D
 
S
A
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
S
 
G
H
 
H
R
 
K
N
 
P
Q
 
Q
P
 
N
A
 
A
L
 
E
D
 
L
V
 
V
D
 
E
F
 
P
E
 
E
T
 
E
F
 
F
K
 
D
R
 
R
V
 
I
Y
 
V
E
 
G
V
|
V
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
G
I
 
V
F
 
Y
H
 
L
A
 
M
T
 
T
H
 
R
A
 
K
L
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
H
W
 
F
R
 
K
D
 
E
I
 
N
G
 
G
G
 
A
G
 
K
-
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
C
V
 
V
M
 
I
I
 
L
N
 
N
V
|
V
G
x
A
S
|
S
T
 
T
A
 
G
G
 
A
I
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
R
P
 
P
G
 
N
L
|
L
S
 
A
W
 
W
Y
|
Y
N
 
N
S
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
W
V
 
V
N
 
V
M
 
S
M
 
V
T
 
T
K
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
A
R
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
N
P
|
P
V
|
V
M
x
A
G
|
G
A
 
E
T
|
T
P
|
P
L
|
L
L
 
L
E
 
T
T
 
T
F
|
F
M
 
M
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
A
 
K
K
 
K
F
 
F
L
 
R
G
 
D
T
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
C
 
L
E
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
D
M
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
Q
A
 
A
N
 
S
F
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
T
 
S
V
 
I

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 96% coverage: 9:253/256 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
|
A
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
V
F
 
F
V
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
N
|
N
G
 
E
E
 
A
G
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
-
Q
 
N
Q
 
P
N
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
F
V
 
I
T
 
R
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
D
G
 
R
A
 
E
D
 
S
V
 
V
S
 
H
R
 
R
A
 
L
V
 
V
Q
 
E
E
 
N
T
 
V
I
 
A
D
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
S
x
T
H
 
-
R
 
R
N
x
D
Q
 
S
P
 
M
A
 
L
L
 
S
D
x
K
V
 
M
D
 
T
F
 
V
E
 
D
T
 
Q
F
 
F
K
 
Q
R
 
Q
V
 
V
Y
 
I
E
 
N
V
|
V
N
|
N
V
 
L
D
 
T
S
 
G
I
 
V
F
 
F
H
 
H
A
 
C
T
 
T
H
 
Q
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
Y
W
 
M
R
 
A
D
 
E
I
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
V
 
K
M
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
x
S
S
|
S
T
 
V
A
x
T
G
 
G
I
 
T
R
 
Y
P
 
G
R
x
N
P
x
V
G
|
G
L
x
Q
S
 
T
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
S
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
I
M
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
D
 
K
R
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
P
x
G
L
x
F
L
x
T
E
 
E
T
|
T
F
x
A
M
|
M
G
 
-
M
x
V
P
 
A
D
 
E
T
 
V
P
 
P
E
 
E
N
 
K
R
 
V
-
 
I
A
 
E
K
|
K
F
 
M
L
 
K
G
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
M
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
N
 
D
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 96% coverage: 10:255/256 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
S
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
H
R
 
S
F
 
Y
V
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
V
V
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
G
 
E
E
 
D
-
 
H
G
 
G
A
 
N
K
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
I
L
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
N
 
G
A
 
G
I
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
F
V
 
V
T
 
K
C
x
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
K
 
N
G
 
P
A
 
E
D
 
E
V
 
V
S
 
E
R
 
A
A
 
L
V
 
V
Q
 
K
E
 
R
T
 
T
I
 
V
D
 
E
A
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
I
S
 
G
H
 
G
R
 
E
N
 
Q
Q
 
A
P
 
L
A
 
A
L
 
G
D
 
D
V
 
Y
D
 
G
F
 
L
E
 
D
T
 
S
F
 
W
K
 
R
R
 
K
V
 
V
Y
 
L
E
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
D
S
 
G
I
 
V
F
 
F
H
 
Y
A
 
G
T
 
C
H
 
K
A
 
Y
L
 
E
V
 
L
P
 
E
H
 
Q
W
 
M
R
 
E
D
 
K
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
M
G
x
A
S
|
S
T
 
I
A
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
V
P
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
S
S
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
S
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
V
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
N
L
 
I
A
 
G
V
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
G
 
A
L
 
V
A
 
G
P
|
P
V
x
A
M
x
Y
G
x
I
A
 
E
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
 
L
E
 
E
T
 
S
F
 
L
M
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
K
E
 
E
N
 
M
R
 
K
A
 
E
K
 
A
F
 
L
L
 
I
G
 
S
T
 
K
I
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
M
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
L
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
N
 
S
F
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
I
 
Y
L
 
Y
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
T
 
T

1ahiA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with nadh and 7-oxo glycochenodeoxycholic acid (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:253/256 of query aligns to 8:249/255 of 1ahiA

query
sites
1ahiA
R
 
R
L
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
I
R
 
T
F
 
F
V
 
A
R
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
S
D
|
D
L
x
I
N
|
N
G
 
A
E
 
D
G
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
H
V
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
E
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
G
N
 
Q
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
C
T
 
R
C
|
C
D
|
D
V
x
I
S
 
T
K
 
S
G
 
E
A
 
Q
D
 
E
V
 
L
S
 
S
R
 
A
A
 
L
V
 
A
Q
 
D
E
 
F
T
 
A
I
 
I
D
 
S
A
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
G
S
x
G
H
 
-
R
 
-
N
x
G
Q
x
P
P
 
K
A
 
P
L
 
F
D
 
D
V
 
M
D
 
P
F
 
M
E
 
A
T
 
D
F
 
F
K
 
R
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
F
S
 
S
I
 
F
F
 
F
H
 
H
A
 
L
T
 
S
H
 
Q
A
 
L
L
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
E
W
 
M
R
 
E
D
 
K
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
L
N
 
T
V
x
I
G
x
T
S
|
S
T
 
M
A
|
A
G
 
A
I
 
E
R
x
N
P
 
K
R
 
N
P
 
I
G
 
N
L
x
M
S
 
T
W
 
S
Y
|
Y
N
 
A
S
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
S
M
 
H
M
 
L
T
 
V
K
 
R
T
 
N
L
 
M
A
 
A
V
 
F
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
E
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
G
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
G
M
x
A
G
x
I
A
 
L
T
|
T
P
 
D
L
x
A
L
|
L
E
 
K
T
 
S
F
x
V
M
 
I
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
I
R
 
E
A
 
Q
K
 
K
F
 
M
L
 
L
G
 
Q
T
 
H
I
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
Q
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
M
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
N
 
S
F
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
I
 
I
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P0AET8 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NAD-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.159 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
38% identity, 96% coverage: 9:253/256 of query aligns to 8:249/255 of P0AET8

query
sites
P0AET8
R
 
R
L
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
S
 
A
G
 
G
F
x
I
G
 
G
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
I
R
 
T
F
 
F
V
 
A
R
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
G
 
A
E
 
D
G
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
H
V
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
E
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
G
N
 
Q
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
C
T
 
R
C
 
C
D
|
D
V
x
I
S
 
T
K
 
S
G
 
E
A
 
Q
D
 
E
V
 
L
S
 
S
R
 
A
A
 
L
V
 
A
Q
 
D
E
 
F
T
 
A
I
 
I
D
 
S
A
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
G
S
x
G
H
 
-
R
 
-
N
 
G
Q
 
P
P
 
K
A
 
P
L
 
F
D
 
D
V
 
M
D
 
P
F
 
M
E
 
A
T
 
D
F
 
F
K
 
R
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
F
S
 
S
I
 
F
F
 
F
H
 
H
A
 
L
T
 
S
H
 
Q
A
 
L
L
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
E
W
 
M
R
 
E
D
 
K
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
L
N
 
T
V
 
I
G
 
T
S
|
S
T
 
M
A
 
A
G
 
A
I
 
E
R
x
N
P
 
K
R
 
N
P
 
I
G
 
N
L
 
M
S
 
T
W
 
S
Y
|
Y
N
 
A
S
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
S
M
 
H
M
 
L
T
 
V
K
 
R
T
 
N
L
 
M
A
 
A
V
 
F
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
E
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
G
L
 
I
A
 
A
P
 
P
V
 
G
M
 
A
G
x
I
A
x
L
T
|
T
P
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
K
T
 
S
F
 
V
M
 
I
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
I
R
 
E
A
 
Q
K
 
K
F
 
M
L
 
L
G
 
Q
T
 
H
I
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
Q
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
M
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
N
 
S
F
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
I
 
I
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

1ahhA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:253/256 of query aligns to 8:249/253 of 1ahhA

query
sites
1ahhA
R
 
R
L
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
I
R
 
T
F
 
F
V
 
A
R
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
S
D
|
D
L
x
I
N
 
N
G
 
A
E
 
D
G
 
A
A
 
A
K
 
N
A
 
H
V
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
E
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
G
N
 
Q
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
C
T
 
R
C
|
C
D
|
D
V
x
I
S
 
T
K
 
S
G
 
E
A
 
Q
D
 
E
V
 
L
S
 
S
R
 
A
A
 
L
V
 
A
Q
 
D
E
 
F
T
 
A
I
 
I
D
 
S
A
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
G
S
 
G
H
 
-
R
 
-
N
 
G
Q
 
P
P
 
K
A
 
P
L
 
F
D
 
D
V
 
M
D
 
P
F
 
M
E
 
A
T
 
D
F
 
F
K
 
R
R
 
R
V
 
A
Y
 
Y
E
 
E
V
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
F
S
 
S
I
 
F
F
 
F
H
 
H
A
 
L
T
 
S
H
 
Q
A
 
L
L
 
V
V
 
A
P
 
P
H
 
E
W
 
M
R
 
E
D
 
K
I
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
L
N
 
T
V
x
I
G
x
T
S
|
S
T
 
M
A
 
A
G
 
A
I
 
E
R
 
N
P
 
K
R
 
N
P
 
I
G
 
N
L
x
M
S
 
T
W
 
S
Y
|
Y
N
 
A
S
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
A
N
 
S
M
 
H
M
 
L
T
 
V
K
 
R
T
 
N
L
 
M
A
 
A
V
 
F
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
E
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
G
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
G
M
x
A
G
x
I
A
 
L
T
|
T
P
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
K
T
 
S
F
 
V
M
 
I
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
I
R
 
E
A
 
Q
K
 
K
F
 
M
L
 
L
G
 
Q
T
 
H
I
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
Q
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
M
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
N
 
S
F
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
I
 
I
L
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
38% identity, 97% coverage: 5:253/256 of query aligns to 3:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
N
 
D
T
 
L
S
 
T
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
T
A
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
G
D
|
D
L
x
I
N
x
D
G
 
P
E
 
T
G
 
T
A
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
Q
 
-
N
 
-
A
 
G
I
 
L
A
 
F
V
 
V
T
 
P
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
E
G
 
Q
A
 
E
D
 
A
V
 
V
S
 
D
R
 
N
A
 
L
V
 
F
Q
 
D
E
 
T
T
 
A
I
 
A
D
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
S
 
S
H
 
P
R
 
P
N
 
E
Q
 
D
P
 
D
A
 
L
L
 
I
D
 
E
-
 
N
V
 
T
D
 
D
F
 
L
E
 
P
T
 
A
F
 
W
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
Q
E
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
K
S
 
S
I
 
V
F
 
Y
H
 
L
A
 
S
T
 
C
H
 
R
A
 
A
L
 
A
V
 
L
P
 
R
H
 
H
W
 
M
R
 
V
D
 
P
I
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
V
 
S
M
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
x
A
S
|
S
T
 
F
A
 
V
G
 
A
I
 
V
R
 
M
P
 
G
R
 
S
P
 
A
G
 
T
L
 
S
S
x
Q
W
 
I
-
 
S
Y
|
Y
N
 
T
S
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
V
N
 
L
M
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
D
 
Q
R
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
C
P
|
P
V
x
G
M
x
P
G
x
V
A
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
T
 
E
F
 
L
M
 
F
G
 
A
M
 
-
P
 
-
D
 
K
T
 
D
P
 
P
E
 
E
N
 
R
R
 
A
A
 
A
K
 
R
F
 
R
L
 
L
G
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
C
 
A
E
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
M
 
L
A
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
S
I
 
T
L
 
F
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 96% coverage: 10:255/256 of query aligns to 3:237/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
F
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
G
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
S
x
R
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
V
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
x
R
G
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
K
 
K
A
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
G
Q
 
G
N
 
A
A
 
F
I
 
F
A
 
Q
V
|
V
T
 
-
C
 
-
D
|
D
V
x
L
S
 
E
K
 
D
G
 
E
A
 
R
D
 
E
V
 
R
S
 
V
R
 
R
A
 
F
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
A
I
 
A
D
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
W
x
I
S
 
A
H
 
A
R
 
P
N
 
G
Q
 
S
P
 
-
A
 
A
L
 
L
D
 
T
V
 
V
D
 
R
F
 
L
E
 
P
T
 
E
F
 
W
K
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
E
 
E
V
|
V
N
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
A
I
 
P
F
 
M
H
 
H
A
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
L
L
 
A
V
 
A
P
 
R
H
 
E
W
 
M
R
 
R
D
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
A
M
 
I
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
x
A
S
|
S
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
F
P
 
A
R
 
E
P
 
Q
G
 
E
L
x
N
S
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
N
S
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
L
N
 
V
M
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
x
G
M
x
A
G
x
I
A
 
A
T
|
T
P
 
E
L
x
A
L
x
V
E
 
L
T
 
E
F
 
A
M
 
I
G
 
A
M
 
R
P
 
R
D
 
D
T
 
W
P
 
E
E
 
D
N
 
L
R
 
H
A
 
A
K
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
M
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
40% identity, 95% coverage: 10:253/256 of query aligns to 5:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
K
 
R
T
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
x
K
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
A
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
A
F
 
L
V
 
D
R
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
|
D
L
|
L
N
 
D
G
 
V
E
 
M
G
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
V
D
 
A
A
 
G
L
 
L
Q
 
E
Q
 
N
N
 
G
A
 
G
I
 
F
A
 
A
V
 
V
T
 
E
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
K
G
 
R
A
 
A
D
 
S
V
 
V
S
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
E
 
K
T
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
F
D
 
D
I
 
L
A
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
V
S
 
S
H
 
T
R
 
M
N
 
-
Q
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
D
 
D
V
 
I
D
 
T
F
 
D
E
 
E
T
 
E
F
 
W
K
 
D
R
 
F
V
 
N
Y
 
F
E
 
D
V
|
V
N
 
N
V
 
A
D
 
R
S
 
G
I
 
V
F
 
F
H
 
L
A
 
A
T
 
N
H
 
Q
A
 
I
L
 
A
V
 
C
P
 
R
H
 
H
W
 
F
R
 
L
D
 
A
I
 
S
G
 
N
-
 
T
G
 
K
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
T
G
x
A
S
|
S
T
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
K
R
 
V
P
 
G
R
 
A
P
 
P
G
 
L
L
|
L
S
 
A
W
 
H
Y
|
Y
N
 
S
S
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
F
M
 
G
M
 
W
T
 
T
K
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
R
E
 
E
L
 
M
A
 
A
P
 
P
D
 
K
R
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
C
L
 
V
A
 
C
P
|
P
V
x
G
M
x
F
G
x
V
A
 
K
T
|
T
P
 
A
L
x
M
L
 
Q
E
 
E
-
x
R
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
W
-
x
E
-
 
A
T
 
E
F
 
L
M
 
R
G
 
G
M
 
M
P
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
A
-
 
V
R
 
R
A
 
A
K
 
E
F
 
Y
L
 
V
G
 
S
T
 
L
I
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
C
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
M
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
V
A
 
V
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
A
N
 
R
F
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
I
 
G
L
 
I
E
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
40% identity, 96% coverage: 7:253/256 of query aligns to 2:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
S
 
T
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
A
R
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
|
D
L
 
L
-
 
V
N
 
P
G
 
A
E
 
P
G
 
E
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
I
D
 
R
A
 
N
L
 
L
Q
 
G
Q
 
R
N
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
V
T
 
K
C
|
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
Q
G
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
E
R
 
A
A
 
F
V
 
G
Q
 
K
E
 
Q
T
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
-
S
 
I
H
x
Y
R
 
P
N
 
L
Q
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
D
D
 
E
V
 
L
D
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
F
 
W
K
 
K
R
 
K
V
 
T
Y
 
F
E
 
E
V
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
S
I
 
G
F
 
F
H
 
L
A
 
M
T
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
H
 
G
W
 
M
R
 
K
D
 
R
I
 
N
G
 
G
G
 
W
G
 
G
V
 
R
M
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
L
G
 
T
S
 
S
T
 
T
A
 
T
G
 
Y
I
 
W
R
 
L
P
 
K
R
 
I
P
 
E
G
 
A
L
 
Y
S
 
T
W
 
H
Y
 
Y
N
 
I
S
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
N
N
 
I
M
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
K
D
 
D
R
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
-
x
S
-
x
L
V
|
V
M
 
R
G
 
T
A
 
A
T
|
T
P
 
T
L
 
E
L
 
A
E
 
S
T
 
A
F
 
L
M
 
S
G
 
A
M
 
M
P
 
F
D
 
D
T
 
V
P
 
L
E
 
P
N
 
N
R
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
M
L
 
L
G
 
Q
T
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
C
 
Q
E
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
D
M
 
L
A
 
T
N
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
36% identity, 95% coverage: 13:255/256 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
F
x
N
G
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
R
 
R
F
 
F
V
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
A
V
 
L
D
|
D
L
|
L
N
 
S
G
 
A
E
 
E
G
 
T
A
 
L
K
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
D
 
H
A
 
A
L
 
Y
Q
 
A
Q
 
D
N
 
K
A
 
V
I
 
L
A
 
R
V
 
V
T
 
R
C
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
K
 
D
G
 
E
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
N
R
 
A
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
E
 
A
T
 
T
I
 
M
D
 
E
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
x
I
S
x
T
H
 
G
R
 
N
N
 
S
Q
 
E
P
 
A
A
 
G
L
 
V
-
 
L
-
 
H
D
 
T
V
 
T
D
 
P
F
 
V
E
 
E
T
 
Q
F
 
F
K
 
D
R
 
K
V
 
V
Y
 
M
E
 
A
V
|
V
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
G
I
 
I
F
 
F
H
 
L
A
 
G
T
 
C
H
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
H
W
 
M
R
 
L
D
 
L
I
 
Q
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
I
G
x
A
S
|
S
T
x
V
A
|
A
G
 
S
I
 
L
R
 
V
P
 
A
R
x
F
P
 
P
G
 
G
L
x
R
S
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
S
 
T
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
L
M
 
Q
M
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
D
 
S
R
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
G
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
V
x
G
M
|
M
G
x
I
A
 
E
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
x
T
E
 
Q
T
x
W
F
x
R
M
 
L
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
N
 
L
R
 
R
A
 
D
K
 
Q
F
 
V
L
 
L
G
 
A
T
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
E
L
 
I
C
 
G
E
 
T
P
 
A
E
 
A
D
 
Q
M
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
T
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
A
I
 
A
L
 
L
E
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
Y
T
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
36% identity, 95% coverage: 13:255/256 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
|
S
G
|
G
F
x
N
G
 
G
R
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
T
R
 
R
F
 
F
V
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
A
V
 
L
D
|
D
L
 
L
N
 
S
G
 
A
E
 
E
G
 
T
A
 
L
K
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
D
 
H
A
 
A
L
 
Y
Q
 
A
Q
 
D
N
 
K
A
 
V
I
 
L
A
 
R
V
 
V
T
 
R
C
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
K
 
D
G
 
E
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
N
R
 
A
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
E
 
A
T
 
T
I
 
M
D
 
E
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
W
 
I
S
 
T
H
 
G
R
 
N
N
 
S
Q
 
E
P
 
A
A
 
G
L
 
V
-
 
L
-
 
H
D
 
T
V
 
T
D
 
P
F
 
V
E
 
E
T
 
Q
F
 
F
K
 
D
R
 
K
V
 
V
Y
 
M
E
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
G
I
 
I
F
 
F
H
 
L
A
 
G
T
 
C
H
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
L
P
 
P
H
 
H
W
 
M
R
 
L
D
 
L
I
 
Q
G
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
I
G
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
S
I
 
L
R
 
V
P
 
A
R
 
F
P
 
P
G
 
G
L
x
R
S
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
S
 
T
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
L
M
 
Q
M
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
D
 
S
R
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
C
C
 
N
G
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
V
 
G
M
 
M
G
x
I
A
x
E
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
 
T
E
 
Q
T
x
W
F
x
R
M
 
L
G
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
N
 
L
R
|
R
A
 
D
K
 
Q
F
 
V
L
 
L
G
 
A
T
x
R
I
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
E
L
 
I
C
 
G
E
 
T
P
 
A
E
 
A
D
 
Q
M
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
T
F
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
A
I
 
A
L
 
L
E
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
Y
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
38% identity, 96% coverage: 9:253/256 of query aligns to 8:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
R
 
K
L
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
K
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
A
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
A
F
 
L
V
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
x
N
D
x
Y
L
x
A
N
x
S
G
x
S
E
 
K
-
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
D
 
S
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
Q
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
G
N
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
G
C
x
G
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
K
G
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
A
S
 
Q
R
 
R
A
 
I
V
 
V
Q
 
D
E
 
T
T
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
T
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
W
x
V
S
 
-
H
x
Y
R
 
E
N
x
F
Q
 
A
P
 
P
A
 
I
L
 
E
D
 
A
V
 
I
D
 
T
F
 
E
E
 
E
T
 
H
F
 
Y
K
 
R
R
 
R
V
 
Q
Y
 
F
E
 
D
V
x
T
N
 
N
V
 
V
D
 
F
S
 
G
I
 
V
F
 
L
H
 
L
A
 
T
T
 
T
H
 
Q
A
 
A
L
 
A
V
 
V
P
 
K
H
 
H
W
 
L
R
 
G
D
 
E
I
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
A
V
 
S
M
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
x
S
S
|
S
T
x
V
A
x
V
G
 
T
I
 
S
R
 
I
P
 
T
R
 
P
P
 
P
G
 
A
L
 
S
S
 
A
W
 
V
Y
|
Y
N
 
S
S
 
G
S
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
D
M
 
A
M
 
I
T
 
T
K
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
D
 
R
R
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
I
A
 
N
P
|
P
V
x
G
M
|
M
G
x
I
A
 
V
T
|
T
P
x
E
L
x
G
L
x
T
E
 
H
T
 
S
F
 
A
M
 
G
G
x
I
M
 
I
P
 
G
D
 
S
T
 
D
P
 
L
E
 
E
N
 
-
R
 
-
A
 
A
K
 
Q
F
x
V
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
I
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
M
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
R
F
 
W
I
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
E
I
 
H
L
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
41% identity, 96% coverage: 8:253/256 of query aligns to 1:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
K
G
 
D
K
 
K
T
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
R
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
A
R
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
A
D
|
D
L
|
L
-
 
V
N
 
P
G
 
A
E
 
P
G
 
E
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
I
D
 
R
A
 
N
L
 
L
Q
 
G
Q
 
R
N
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
V
T
 
K
C
|
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
Q
G
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
E
R
 
A
A
 
F
V
 
G
Q
 
K
E
 
Q
T
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
C
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
W
 
-
S
 
I
H
x
Y
R
 
P
N
 
L
Q
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
D
D
 
E
V
 
L
D
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
F
 
W
K
 
K
R
 
K
V
 
T
Y
 
F
E
 
E
V
x
I
N
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
S
I
 
G
F
 
F
H
 
L
A
 
M
T
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
F
V
 
V
P
 
P
H
 
G
W
 
M
R
 
K
D
 
R
I
 
N
G
 
G
G
 
W
G
 
G
V
 
R
M
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
L
G
x
T
S
|
S
T
 
T
A
 
T
G
 
Y
I
 
W
R
 
L
P
 
K
R
 
I
P
 
E
G
 
A
L
x
Y
S
 
T
W
 
H
Y
|
Y
N
 
I
S
 
S
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
N
N
 
I
M
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
K
D
 
D
R
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
-
x
S
-
x
L
V
|
V
M
 
R
G
x
T
A
 
A
T
|
T
P
x
T
L
 
E
L
 
A
E
 
S
T
 
A
F
 
L
M
 
S
G
 
A
M
 
M
P
 
F
D
 
D
T
 
V
P
 
L
E
 
P
N
 
N
R
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
M
L
 
L
G
 
Q
T
 
A
I
 
I
P
 
P
L
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
C
 
Q
E
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
D
M
 
L
A
 
T
N
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7xqmB Indel-mutant short chain dehydrogenase bound to sah (see paper)
40% identity, 96% coverage: 10:255/256 of query aligns to 4:243/253 of 7xqmB

query
sites
7xqmB
L
 
F
S
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
G
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
G
S
x
I
G
 
G
F
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
A
F
 
F
V
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
x
R
G
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
-
K
 
K
A
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
G
Q
 
G
N
 
A
A
 
F
I
 
F
A
 
Q
V
|
V
T
 
-
C
 
-
D
|
D
V
x
L
S
 
E
K
 
D
G
 
E
A
 
R
D
 
E
V
 
R
S
 
V
R
 
R
A
 
F
V
 
V
Q
 
E
E
 
E
T
 
A
I
 
A
D
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
W
x
I
S
 
A
H
 
A
R
 
P
N
 
G
Q
 
S
P
 
-
A
 
A
L
 
L
D
 
T
V
 
V
D
 
R
F
 
L
E
 
P
T
 
E
F
 
W
K
 
R
R
 
R
V
 
V
Y
 
L
E
 
E
V
|
V
N
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
A
I
 
P
F
 
M
H
 
H
A
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
L
L
 
A
V
 
A
P
 
R
H
 
E
W
 
M
R
 
R
D
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
A
M
 
I
I
 
V
N
 
N
V
|
V
G
 
A
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
F
P
 
A
R
 
E
P
 
Q
G
 
E
L
 
N
S
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
N
S
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
V
 
L
N
 
V
M
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
G
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
G
M
 
A
G
 
I
A
 
A
T
 
T
-
 
E
P
 
A
L
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
A
F
 
I
M
 
A
G
 
L
M
 
S
P
 
P
D
 
D
T
 
P
P
 
E
E
 
R
N
 
T
R
 
R
A
 
R
K
 
D
F
 
W
L
 
E
G
 
D
T
 
L
I
 
H
P
 
A
L
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
C
 
G
E
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
M
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
A
N
 
S
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
T
 
T

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:256/256 of query aligns to 2:253/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
E
 
D
T
 
Y
N
 
R
T
 
T
S
 
V
R
 
F
R
 
R
L
 
L
S
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
R
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
C
R
 
R
R
 
A
F
 
F
V
 
A
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
I
I
 
L
V
 
I
D