SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3608603 FitnessBrowser__Dino:3608603 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00944 Xylose isomerase; D-xylulose keto-isomerase; EC 5.3.1.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
60% identity, 100% coverage: 1:434/434 of query aligns to 1:437/440 of P00944

query
sites
P00944
M
 
M
S
 
Q
D
 
A
F
 
Y
F
 
F
A
 
D
G
 
Q
I
 
L
P
 
D
A
 
R
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
S
E
 
K
A
 
S
R
 
S
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
D
 
D
E
 
E
M
 
L
V
 
V
M
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
M
 
M
E
 
E
D
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
A
A
 
C
W
 
Y
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
F
A
 
C
W
 
W
E
 
N
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
M
F
 
F
G
 
G
G
 
V
P
 
G
T
 
A
F
 
F
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
W
 
W
F
 
Q
-
 
Q
-
 
P
G
 
G
D
 
E
T
 
A
L
 
L
D
 
A
H
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
R
K
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
A
F
 
F
E
 
E
M
 
F
F
 
F
R
 
H
I
 
K
L
 
L
N
 
H
V
 
V
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
S
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
Y
T
 
I
A
 
N
N
 
N
L
 
F
E
 
A
A
 
Q
M
 
M
V
 
V
D
 
D
Y
 
V
L
 
L
G
 
A
Q
 
G
K
 
K
Q
 
Q
E
 
E
A
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
C
F
 
F
S
 
T
H
 
N
R
 
P
R
 
R
Y
 
Y
M
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
V
F
 
F
A
 
S
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
Q
I
 
V
K
 
V
T
 
T
C
 
A
M
 
M
D
 
E
A
 
A
T
 
T
H
 
H
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
R
R
 
Q
E
 
E
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
F
L
 
M
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
V
 
V
D
 
E
Y
 
H
K
 
K
H
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
L
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
V
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
Q
F
 
F
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
I
K
 
K
M
 
L
N
 
N
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
H
 
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
S
F
 
F
E
 
H
H
 
H
E
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
I
E
 
A
F
 
L
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
A
Q
 
Q
S
 
L
G
 
G
W
 
W
D
 
D
T
 
T
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
N
N
 
S
I
 
V
P
 
E
E
 
E
V
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
T
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
F
 
F
D
 
D
S
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
K
A
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
F
A
 
Y
A
 
G
H
 
H
V
 
I
A
 
G
A
 
A
M
 
M
D
 
D
V
 
T
C
 
M
A
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
D
Q
 
K
R
 
R
R
 
I
E
 
A
D
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
W
 
W
R
 
N
A
 
S
P
 
E
S
 
L
A
 
G
E
 
Q
A
 
Q
M
 
I
L
 
L
N
 
K
G
 
G
G
 
Q
-
 
M
K
 
S
L
 
L
E
 
A
D
 
D
C
 
L
F
 
A
A
 
K
H
 
Y
V
 
A
M
 
Q
E
 
E
T
 
H
G
 
H
L
 
L
D
 
S
P
 
P
Q
 
V
P
 
H
V
 
Q
S
 
S
G
 
G
G
 
R
Q
 
Q
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
N
R
 
H
Y
 
Y
L
 
L

1a0eA Xylose isomerase from thermotoga neapolitana
50% identity, 100% coverage: 2:434/434 of query aligns to 1:435/443 of 1a0eA

query
sites
1a0eA
S
 
A
D
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
P
G
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
K
V
 
V
T
 
Q
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
E
A
 
S
R
 
T
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
K
H
 
F
Y
 
Y
N
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
I
V
 
I
M
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
P
M
 
L
E
 
K
D
 
D
Q
 
H
L
 
L
R
 
K
F
 
F
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
F
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
F
A
 
V
W
 
N
E
 
E
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
D
P
 
P
T
 
T
F
 
A
Q
 
D
R
 
R
P
 
P
W
 
W
-
 
N
-
 
R
F
 
Y
G
 
T
D
 
D
T
 
P
L
 
M
D
 
D
H
 
K
A
 
A
R
 
F
A
 
A
K
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
L
F
 
F
E
 
E
M
 
F
F
 
C
R
 
E
I
 
K
L
 
L
N
 
N
V
 
I
P
 
E
F
 
Y
Y
 
F
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
K
S
 
T
F
 
L
A
 
R
E
 
E
T
 
T
T
 
N
A
 
K
N
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
K
M
 
V
V
 
V
D
 
E
Y
 
R
L
 
I
G
 
K
Q
 
E
K
 
R
Q
 
M
E
 
K
A
 
D
S
 
S
G
 
N
K
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
H
R
 
P
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
C
D
 
S
P
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
V
K
 
K
T
 
K
C
 
A
M
 
L
D
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
K
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
E
N
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
F
E
 
E
R
 
L
E
 
E
Q
 
N
A
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
L
 
L
Q
 
R
M
 
M
V
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
K
K
 
R
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
T
G
 
G
T
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
S
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
S
F
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
D
 
E
E
 
Y
V
 
F
K
 
K
M
 
F
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
A
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
Q
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
R
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
I
F
 
L
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
Q
N
 
G
D
 
D
Y
 
L
Q
 
L
S
 
L
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
T
N
 
N
I
 
V
P
 
Y
E
 
D
V
 
T
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
L
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
T
T
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
A
S
 
S
L
 
Y
D
 
K
P
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
F
A
 
I
A
 
G
H
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
T
C
 
F
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
Y
R
 
K
M
 
L
L
 
V
E
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
K
R
 
F
R
 
I
E
 
E
D
 
E
R
 
K
Y
 
Y
A
 
R
G
 
S
W
 
F
R
 
R
A
 
E
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
R
A
 
D
M
 
I
L
 
V
N
 
E
G
 
-
G
 
G
K
 
K
L
 
V
E
 
D
D
 
-
C
 
-
F
 
F
A
 
E
H
 
K
V
 
L
M
 
E
E
 
E
T
 
Y
G
 
I
L
 
I
D
 
D
P
 
K
Q
 
E
P
 
T
V
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
P
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
L
V
 
I
A
 
N
R
 
S
Y
 
Y
L
 
I

5nhcA Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with two co2+ ions and xylulose (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nhcA

query
sites
5nhcA
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
|
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
|
G
I
 
M
L
|
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
x
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
D
x
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5nhaA Crystal structure of xylose isomerase from piromyces sp. E2 in complex with two mn2+ ions and sorbitol (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nhaA

query
sites
5nhaA
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
|
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5nh9A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with two mn2+ ions and xylose (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nh9A

query
sites
5nh9A
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
|
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
x
G
T
 
T
F
x
K
Q
x
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
x
K
R
 
R
E
 
E
R
x
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
x
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
x
D
F
x
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5nh7A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with two mg2+ ions and xylose (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nh7A

query
sites
5nh7A
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
x
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
|
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
|
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
x
G
T
 
T
F
x
K
Q
x
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
x
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
x
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
x
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5nh6A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 complexed with one mg2+ ion and xylitol (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nh6A

query
sites
5nh6A
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
|
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5nh5A Crystal structure of native xylose isomerase from piromyces e2 (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nh5A

query
sites
5nh5A
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5nh4A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces e2 in complex with one mg2+ ions and glycerol (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 2:435/436 of 5nh4A

query
sites
5nh4A
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

5yn3A Crystal structure of xylose isomerase from piromyces sp. E2 (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 1:434/435 of 5yn3A

query
sites
5yn3A
S
 
K
D
 
E
F
 
Y
F
 
F
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
P
 
Q
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
H
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
 
E
E
 
K
M
 
E
V
 
V
M
 
M
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
A
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
S
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
T
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
I
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
L
N
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
N
S
 
S
F
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
K
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
E
 
K
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
S
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
M
G
 
A
R
 
T
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
S
I
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
A
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
N
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
Q
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
Q
A
 
A
Y
 
W
Y
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
T
Q
 
K
R
 
M
R
 
K
E
 
K
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
S
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
K
A
 
D
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
C
 
V
F
 
Y
A
 
E
H
 
Y
V
 
G
M
 
K
E
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
M
Y
 
Y

1a0dA Xylose isomerase from bacillus stearothermophilus
50% identity, 99% coverage: 4:434/434 of query aligns to 2:433/437 of 1a0dA

query
sites
1a0dA
F
 
Y
F
 
F
A
 
D
G
 
N
I
 
I
P
 
S
A
 
T
V
 
I
T
 
A
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
K
H
 
F
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
K
V
 
V
M
 
G
G
 
D
K
 
K
R
 
T
M
 
M
E
 
E
D
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
Y
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
F
A
 
T
W
 
G
E
 
D
G
 
G
G
 
S
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
A
P
 
G
T
 
N
F
 
M
Q
 
I
R
 
R
P
 
P
W
 
W
F
 
N
G
 
K
D
 
Y
T
 
S
-
 
G
L
 
M
D
 
D
H
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
R
A
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
M
 
F
F
 
F
R
 
E
I
 
K
L
 
L
N
 
N
V
 
I
P
 
P
F
 
F
Y
 
F
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
E
S
 
T
F
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
T
T
 
Y
A
 
K
N
 
N
L
 
L
E
 
D
A
 
I
M
 
I
V
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
I
G
 
E
Q
 
E
K
 
Y
Q
 
M
E
 
K
A
 
T
S
 
S
G
 
K
K
 
T
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
N
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
R
Y
 
F
M
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
S
P
 
C
D
 
N
P
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
K
I
 
V
K
 
K
T
 
K
C
 
G
M
 
L
D
 
E
A
 
I
T
 
A
H
 
K
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
M
G
 
K
R
 
L
E
 
E
R
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
L
 
L
Q
 
H
M
 
M
V
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
K
K
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
G
 
G
T
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
Q
E
 
T
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
E
 
Y
V
 
F
K
 
K
M
 
F
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
A
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
I
F
 
H
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
V
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
Q
N
 
G
D
 
D
Y
 
M
Q
 
L
S
 
L
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
T
N
 
D
I
 
L
P
 
Y
E
 
S
V
 
T
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
L
D
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
G
S
 
S
L
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
F
A
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
S
C
 
F
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
H
R
 
R
M
 
L
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
R
E
 
V
L
 
F
E
 
D
Q
 
E
R
 
F
R
 
I
E
 
E
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
K
G
 
S
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
R
A
 
E
M
 
I
L
 
V
N
 
E
G
 
G
G
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
H
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
A
H
 
H
V
 
A
M
 
L
E
 
Q
T
 
L
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
I
Q
 
Q
P
 
N
V
 
Q
S
 
S
G
 
G
G
 
R
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
T
L
 
L
V
 
L
A
 
N
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

1a0cA Xylose isomerase from thermoanaerobacterium thermosulfurigenes
47% identity, 100% coverage: 2:434/434 of query aligns to 1:435/437 of 1a0cA

query
sites
1a0cA
S
 
N
D
 
K
F
 
Y
F
 
F
A
 
E
G
 
N
I
 
V
P
 
S
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
S
R
 
N
S
 
N
D
 
P
F
 
Y
A
 
S
F
 
F
R
 
K
H
 
F
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
V
V
 
I
M
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
T
M
 
M
E
 
E
D
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
Y
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
F
A
 
T
W
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
T
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
K
P
 
A
T
 
T
F
 
M
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
W
 
W
-
 
N
-
 
H
F
 
Y
G
 
T
D
 
D
T
 
P
L
 
M
D
 
D
H
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
R
A
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
M
 
F
F
 
F
R
 
D
I
 
K
L
 
I
N
 
N
V
 
A
P
 
P
F
 
Y
Y
 
F
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
D
S
 
T
F
 
L
A
 
R
E
 
E
T
 
T
T
 
N
A
 
K
N
 
N
L
 
L
E
 
D
A
 
T
M
 
I
V
 
V
D
 
A
Y
 
M
L
 
I
G
 
K
Q
 
D
K
 
Y
Q
 
L
E
 
K
A
 
T
S
 
S
G
 
K
K
 
T
R
 
K
L
 
V
L
 
L
W
|
W
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
N
R
 
P
R
 
R
Y
 
F
M
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
T
N
 
S
P
 
C
D
 
N
P
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
V
K
 
K
T
 
K
C
 
A
M
 
L
D
 
E
A
 
I
T
 
T
H
 
K
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
M
G
 
E
R
 
F
E
 
E
R
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
F
G
 
A
R
 
R
M
 
F
L
 
L
Q
 
H
M
 
M
V
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
K
K
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
A
T
 
N
V
 
V
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
R
E
 
K
F
 
Y
G
 
D
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
Y
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
A
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
F
H
 
H
S
 
D
F
 
F
E
 
Q
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
R
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
E
 
I
F
 
N
G
 
G
I
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
T
N
 
G
D
 
D
Y
 
M
Q
 
L
S
 
L
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
T
N
 
D
I
 
I
P
 
R
E
 
M
V
 
T
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
E
I
 
V
L
 
I
R
 
K
A
 
M
G
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
L
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
A
S
 
S
L
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
F
A
 
L
A
 
G
H
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
F
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
F
K
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
Y
R
 
K
M
 
L
L
 
V
E
 
K
D
 
D
G
 
R
E
 
V
L
 
F
E
 
D
Q
 
K
R
 
F
R
 
I
E
 
E
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
Y
R
 
K
A
 
D
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
A
A
 
D
M
 
I
L
 
V
N
 
S
G
 
G
G
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
K
D
 
A
C
 
D
F
 
F
A
 
R
H
 
S
V
 
L
M
 
E
E
 
K
T
 
Y
G
 
A
L
 
L
D
 
E
P
 
R
Q
 
S
P
 
Q
V
 
I
-
 
V
-
 
N
-
 
K
S
 
S
G
 
G
G
 
R
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
V
 
L
A
 
N
R
 
Q
Y
 
Y
L
 
L

4xkmA Crystal structure of xylose isomerase from an human intestinal tract microbe bacteroides thetaiotaomicron
51% identity, 100% coverage: 2:433/434 of query aligns to 1:434/435 of 4xkmA

query
sites
4xkmA
S
 
K
D
 
E
F
 
F
F
 
F
A
 
P
G
 
G
I
 
I
P
 
E
A
 
K
V
 
I
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
D
A
 
S
R
 
K
S
 
N
D
 
P
F
 
M
A
 
A
F
|
F
R
 
R
H
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
P
 
A
D
x
E
E
 
K
M
 
V
V
 
I
M
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
K
M
 
M
E
 
K
D
 
D
Q
 
W
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
A
W
 
W
W
 
W
H
 
H
S
 
T
F
 
L
A
 
C
W
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
G
T
 
T
F
 
K
Q
 
Q
R
 
F
P
 
P
W
 
W
F
 
N
G
 
G
-
 
N
-
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
I
D
 
Q
H
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
D
K
 
K
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
G
F
 
F
E
 
E
M
 
F
F
 
M
R
 
Q
I
 
K
L
 
M
N
 
G
V
 
I
P
 
E
F
 
Y
Y
 
Y
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
V
D
|
D
I
 
L
R
 
V
P
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
V
A
 
E
E
 
E
T
 
Y
T
 
E
A
 
A
N
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
E
M
 
I
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
A
G
 
K
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
E
 
A
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
I
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
G
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
F
S
 
G
H
 
H
R
 
A
R
 
R
Y
 
Y
M
 
M
A
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
F
D
 
D
V
 
V
F
 
V
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
V
T
 
Q
I
 
I
K
 
K
T
 
N
C
 
A
M
 
I
D
 
D
A
 
A
T
 
T
H
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
G
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
G
 
A
R
 
Q
M
 
M
L
 
L
Q
 
T
M
 
I
V
 
A
V
 
R
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
R
K
 
A
I
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
V
D
 
D
V
 
T
A
 
E
T
 
T
V
 
V
F
 
I
S
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
K
E
 
A
F
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
D
D
 
K
E
 
D
V
 
F
K
 
K
M
 
V
N
 
N
I
 
I
E
|
E
Q
 
V
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
V
E
 
D
F
 
N
G
 
G
I
 
M
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
R
N
 
G
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
Q
F
 
F
P
 
P
N
 
I
N
 
D
I
 
N
P
 
Y
E
 
E
V
 
L
A
 
T
L
 
Q
A
 
A
Y
 
M
Y
 
M
E
 
Q
I
 
I
L
 
I
R
 
R
A
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
L
D
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
T
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
S
 
S
L
 
T
D
 
D
P
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
F
A
 
I
A
 
A
H
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
M
A
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
D
D
 
E
G
 
S
E
 
P
L
 
Y
E
 
K
Q
 
K
R
 
M
R
 
L
E
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
D
A
 
G
P
 
G
S
 
K
A
 
G
E
 
K
A
 
E
M
 
F
L
 
E
N
 
D
G
 
G
G
 
K
-
 
L
K
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
V
F
 
V
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
M
 
K
E
 
T
T
 
K
G
 
G
L
 
-
D
 
E
P
 
P
Q
 
K
P
 
Q
V
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
K
Q
 
Q
E
 
E
R
 
L
L
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
L
A
 
N
R
 
M
Y
 
Y

6intA Xylose isomerase from paenibacillus sp. R4 (see paper)
44% identity, 98% coverage: 4:429/434 of query aligns to 1:402/413 of 6intA

query
sites
6intA
F
 
Y
F
 
F
A
 
D
G
 
H
I
 
V
P
 
G
A
 
T
V
 
V
T
 
K
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
P
 
K
E
 
S
A
 
S
R
 
T
S
 
N
D
 
P
F
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
K
H
 
F
Y
 
Y
N
 
N
P
 
P
D
 
D
E
 
E
M
 
I
V
 
I
M
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
T
M
 
M
E
 
R
D
 
E
Q
 
H
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
Y
W
 
L
H
 
S
S
 
G
F
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
Q
 
-
R
 
-
P
 
-
W
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
M
D
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
R
A
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
C
F
 
F
E
 
E
M
 
L
F
 
L
R
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
D
V
 
V
P
 
D
F
 
Y
Y
 
F
C
 
C
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
D
S
 
T
F
 
L
A
 
Q
E
 
E
T
 
T
T
 
N
A
 
R
N
 
N
L
 
L
E
 
D
A
 
E
M
 
I
V
 
V
D
 
A
Y
 
L
L
 
I
G
 
K
Q
 
Q
K
 
H
Q
 
M
E
 
H
A
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
L
W
|
W
G
 
N
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
M
F
 
F
S
 
T
H
 
N
R
 
P
R
 
R
Y
 
F
M
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
S
D
 
N
P
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
V
K
 
K
T
 
K
C
 
A
M
 
L
D
 
D
A
 
H
T
 
G
H
 
K
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
|
G
Y
 
Y
E
 
E
T
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
T
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
L
E
|
E
R
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
L
 
L
Q
 
Q
M
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
H
 
K
K
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
D
G
 
A
T
 
Q
I
 
F
L
 
L
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
S
K
 
K
H
 
H
Q
 
Q
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
T
F
 
L
S
 
Q
F
 
F
L
 
L
S
 
Q
E
 
K
F
 
Y
G
 
D
L
 
L
Q
 
A
D
 
K
E
 
H
V
 
F
K
 
K
M
 
L
N
 
N
I
 
L
E
|
E
Q
 
A
G
 
N
H
|
H
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
G
H
 
H
S
 
T
F
 
F
E
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
I
F
 
N
G
 
G
I
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
I
 
I
D
|
D
M
 
A
N
 
N
R
 
Q
N
 
G
D
 
D
Y
 
L
Q
 
L
S
 
L
G
 
G
W
 
W
D
|
D
T
 
T
D
|
D
Q
 
E
F
 
F
P
 
P
N
 
T
N
 
D
I
 
L
P
 
Y
E
 
A
V
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
M
Y
 
Y
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
Q
-
 
N
A
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
I
D
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
V
N
 
N
F
 
F
D
|
D
S
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
S
 
S
L
 
F
D
 
E
P
 
P
A
 
I
D
 
D
L
 
V
I
 
V
A
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
I
A
 
N
A
 
G
M
 
M
D
 
D
V
 
A
C
 
F
A
 
A
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
L
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
R
E
 
A
L
 
F
E
 
D
Q
 
N
R
 
V
R
 
I
E
 
E
D
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
S
W
 
F
R
 
T
A
 
K
P
 
G
S
 
I
A
 
G
E
 
A
A
 
D
M
 
I
L
 
V
N
 
S
G
 
G
G
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
K
C
 
A
F
 
N
A
 
F
H
 
H
V
 
T
M
 
L
E
 
E
T
 
A
-
 
Y
G
 
A
L
 
L
D
 
Q
P
 
N
Q
 
N
P
 
P
V
 
I
S
 
T
G
 
N
G
 
K
Q
 
S
E
 
G
R
 
R
L
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
L

1xycA X-ray crystallographic structures of d-xylose isomerase-substrate complexes position the substrate and provide evidence for metal movement during catalysis (see paper)
30% identity, 69% coverage: 43:342/434 of query aligns to 9:291/386 of 1xycA

query
sites
1xycA
R
 
R
F
 
F
A
 
T
V
 
F
A
 
G
W
 
L
W
|
W
H
 
-
S
 
T
F
 
V
A
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
D
P
 
A
T
 
T
F
 
-
Q
 
-
R
 
R
P
 
P
W
 
A
F
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
P
L
 
V
D
 
E
H
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
R
K
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
F
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
G
V
 
A
P
 
H
F
 
G
Y
 
V
C
 
T
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
D
D
 
D
I
 
L
R
 
I
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
F
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
R
T
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
S
M
 
H
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
F
G
 
R
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
M
R
 
T
L
 
V
L
 
P
W
x
M
G
 
A
T
|
T
A
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
V
Y
 
F
M
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
T
N
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
R
D
 
D
V
 
V
F
 
R
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
R
T
 
K
I
 
T
K
 
I
T
 
R
C
 
N
M
 
I
D
 
D
A
 
L
T
 
A
H
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
K
N
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
A
E
 
E
T
 
S
L
 
G
L
 
A
N
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
V
G
 
R
R
 
V
E
 
A
R
 
L
E
 
D
Q
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
M
 
A
L
 
F
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
E
Y
 
Y
K
 
V
H
 
T
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
G
 
T
T
 
R
I
 
F
L
 
A
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
R
K
 
G
H
 
D
Q
 
I
Y
 
L
D
 
L
Y
 
P
D
 
T
V
 
V
A
 
G
T
 
H
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
E
 
R
F
 
L
G
 
E
L
 
R
Q
 
P
D
 
E
E
 
L
V
 
Y
K
 
G
M
 
V
N
 
N
I
 
P
E
|
E
Q
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
E
I
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
P
H
 
H
E
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
W
F
 
A
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
F
S
 
H
I
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
N
R
 
G
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
W
 
I
D
 
K
T
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
-
x
D
-
 
L
-
 
R
F
 
F
P
 
G
N
 
A
N
 
G
I
 
D
P
 
L
E
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
W
Y
 
L
Y
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
D
 
E
T
 
-
G
 
G
G
 
P
T
 
R
N
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
F
K
 
K
L
 
P
R
 
P
R
 
R

1xybA X-ray crystallographic structures of d-xylose isomerase-substrate complexes position the substrate and provide evidence for metal movement during catalysis (see paper)
30% identity, 69% coverage: 43:342/434 of query aligns to 9:291/386 of 1xybA

query
sites
1xybA
R
 
R
F
 
F
A
 
T
V
 
F
A
 
G
W
 
L
W
 
W
H
 
-
S
 
T
F
 
V
A
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
D
P
 
A
T
 
T
F
 
-
Q
 
-
R
 
R
P
 
P
W
 
A
F
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
P
L
 
V
D
 
E
H
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
R
K
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
F
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
G
V
 
A
P
 
H
F
 
G
Y
 
V
C
 
T
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
D
D
 
D
I
 
L
R
 
I
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
F
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
R
T
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
S
M
 
H
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
F
G
 
R
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
M
R
 
T
L
 
V
L
 
P
W
x
M
G
 
A
T
 
T
A
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
V
Y
 
F
M
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
T
N
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
R
D
 
D
V
 
V
F
 
R
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
R
T
 
K
I
 
T
K
 
I
T
 
R
C
 
N
M
 
I
D
 
D
A
 
L
T
 
A
H
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
K
N
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
A
E
 
E
T
 
S
L
 
G
L
 
A
N
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
V
G
 
R
R
 
V
E
 
A
R
 
L
E
 
D
Q
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
M
 
A
L
 
F
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
E
Y
 
Y
K
 
V
H
 
T
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
G
 
T
T
 
R
I
 
F
L
 
A
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
R
K
 
G
H
 
D
Q
 
I
Y
 
L
D
 
L
Y
 
P
D
 
T
V
 
V
A
 
G
T
 
H
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
E
 
R
F
 
L
G
 
E
L
 
R
Q
 
P
D
 
E
E
 
L
V
 
Y
K
 
G
M
 
V
N
 
N
I
 
P
E
|
E
Q
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
E
I
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
P
H
 
H
E
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
W
F
 
A
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
F
S
 
H
I
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
N
R
 
G
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
W
 
I
D
 
K
T
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
-
x
D
-
 
L
-
 
R
F
 
F
P
 
G
N
 
A
N
 
G
I
 
D
P
 
L
E
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
W
Y
 
L
Y
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
D
 
E
T
 
-
G
 
G
G
 
P
T
 
R
N
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
F
K
 
K
L
 
P
R
 
P
R
 
R

2gyiA Design, synthesis, and characterization of a potent xylose isomerase inhibitor, d-threonohydroxamic acid, and high-resolution x-ray crystallographic structure of the enzyme-inhibitor complex (see paper)
30% identity, 69% coverage: 43:342/434 of query aligns to 8:290/385 of 2gyiA

query
sites
2gyiA
R
 
R
F
 
F
A
 
T
V
 
F
A
 
G
W
 
L
W
 
W
H
 
-
S
 
T
F
 
V
A
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
D
P
 
A
T
 
T
F
 
-
Q
 
-
R
 
R
P
 
P
W
 
A
F
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
P
L
 
V
D
 
E
H
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
R
K
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
F
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
G
V
 
A
P
 
H
F
 
G
Y
 
V
C
 
T
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
D
D
|
D
I
 
L
R
 
I
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
F
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
R
T
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
S
M
 
H
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
F
G
 
R
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
M
R
 
T
L
 
V
L
 
P
W
x
M
G
 
A
T
 
T
A
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
V
Y
 
F
M
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
T
N
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
R
D
 
D
V
 
V
F
 
R
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
R
T
 
K
I
 
T
K
 
I
T
 
R
C
 
N
M
 
I
D
 
D
A
 
L
T
 
A
H
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
K
N
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
A
E
 
E
T
 
S
L
 
G
L
 
A
N
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
V
G
 
R
R
 
V
E
 
A
R
 
L
E
 
D
Q
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
M
 
A
L
 
F
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
E
Y
 
Y
K
 
V
H
 
T
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
G
 
T
T
 
R
I
 
F
L
 
A
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
R
K
 
G
H
 
D
Q
 
I
Y
 
L
D
 
L
Y
 
P
D
 
T
V
 
V
A
 
G
T
 
H
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
E
 
R
F
 
L
G
 
E
L
 
R
Q
 
P
D
 
E
E
 
L
V
 
Y
K
 
G
M
 
V
N
 
N
I
 
P
E
|
E
Q
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
E
I
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
P
H
 
H
E
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
W
F
 
A
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
F
S
 
H
I
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
N
R
 
G
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
W
 
I
D
 
K
T
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
-
x
D
-
 
L
-
 
R
F
 
F
P
 
G
N
 
A
N
 
G
I
 
D
P
 
L
E
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
W
Y
 
L
Y
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
D
 
E
T
 
-
G
 
G
G
 
P
T
 
R
N
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
F
K
 
K
L
 
P
R
 
P
R
 
R

1s5mA Xylose isomerase in substrate and inhibitor michaelis states: atomic resolution studies of a metal-mediated hydride shift (see paper)
30% identity, 69% coverage: 43:342/434 of query aligns to 9:291/386 of 1s5mA

query
sites
1s5mA
R
 
R
F
 
F
A
 
T
V
 
F
A
 
G
W
 
L
W
 
W
H
 
-
S
 
T
F
 
V
A
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
D
P
 
A
T
 
T
F
 
-
Q
 
-
R
 
R
P
 
P
W
 
A
F
 
L
G
 
-
D
 
D
T
 
P
L
 
V
D
 
E
H
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
R
K
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
F
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
G
V
 
A
P
 
H
F
 
G
Y
 
V
C
 
T
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
D
D
|
D
I
 
L
R
 
I
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
F
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
R
T
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
S
M
 
H
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
F
G
 
R
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
M
R
 
T
L
 
V
L
 
P
W
x
M
G
 
A
T
 
T
A
 
T
N
 
N
L
 
L
F
|
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
V
Y
 
F
M
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
T
N
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
R
D
 
D
V
 
V
F
 
R
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
R
T
 
K
I
 
T
K
 
I
T
 
R
C
 
N
M
 
I
D
 
D
A
 
L
T
 
A
H
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
K
N
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
A
E
 
E
T
 
S
L
 
G
L
 
A
N
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
V
G
 
R
R
 
V
E
 
A
R
 
L
E
 
D
Q
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
M
 
A
L
 
F
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
E
Y
 
Y
K
 
V
H
 
T
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
G
 
I
T
 
R
I
 
F
L
 
A
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
R
K
 
G
H
 
D
Q
 
I
Y
 
L
D
 
L
Y
 
P
D
 
T
V
 
V
A
 
G
T
 
H
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
E
 
R
F
 
L
G
 
E
L
 
R
Q
 
P
D
 
E
E
 
L
V
 
Y
K
 
G
M
 
V
N
 
N
I
 
P
E
|
E
Q
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
E
I
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
P
H
 
H
E
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
W
F
 
A
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
F
S
 
H
I
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
N
R
 
G
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
W
 
I
D
 
K
T
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
-
x
D
-
 
L
-
 
R
F
 
F
P
 
G
N
 
A
N
 
G
I
 
D
P
 
L
E
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
W
Y
 
L
Y
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
D
 
E
T
 
-
G
 
G
G
 
P
T
 
R
N
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
F
K
 
K
L
 
P
R
 
P
R
 
R

1muwA The 0.86 angstrom structure of xylose isomerase
30% identity, 69% coverage: 43:342/434 of query aligns to 9:291/386 of 1muwA

query
sites
1muwA
R
 
R
F
 
F
A
 
T
V
 
F
A
 
G
W
 
L
W
 
W
H
 
-
S
 
T
F
 
V
A
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
D
P
 
A
T
 
T
F
 
-
Q
 
-
R
 
R
P
 
P
W
 
A
F
 
L
G
 
-
D
 
D
T
x
P
L
 
V
D
 
E
H
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
R
K
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
F
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
G
V
 
A
P
 
H
F
 
G
Y
 
V
C
 
T
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
D
D
|
D
I
x
L
R
 
I
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
F
 
D
A
 
T
E
 
E
T
 
R
T
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
S
M
x
H
V
 
I
D
 
K
Y
 
R
L
 
F
G
 
R
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
M
R
 
T
L
 
V
L
 
P
W
x
M
G
 
A
T
 
T
A
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
V
Y
 
F
M
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
T
N
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
R
D
 
D
V
 
V
F
 
R
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
R
T
 
K
I
 
T
K
 
I
T
 
R
C
 
N
M
 
I
D
 
D
A
 
L
T
 
A
H
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
K
N
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
A
E
 
E
T
 
S
L
 
G
L
 
A
N
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
V
G
 
R
R
 
V
E
 
A
R
 
L
E
 
D
Q
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
M
 
A
L
 
F
Q
x
D
M
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
E
Y
 
Y
K
 
V
H
 
T
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
G
 
I
T
 
R
I
 
F
L
 
A
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
R
K
 
G
H
 
D
Q
 
I
Y
 
L
D
 
L
Y
 
P
D
 
T
V
 
V
A
 
G
T
 
H
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
E
 
R
F
 
L
G
x
E
L
x
R
Q
 
P
D
 
E
E
 
L
V
x
Y
K
 
G
M
 
V
N
 
N
I
 
P
E
|
E
Q
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
E
I
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
P
H
 
H
E
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
W
F
 
A
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
F
S
 
H
I
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
N
R
 
G
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
W
 
I
D
 
K
T
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
-
x
D
-
 
L
-
 
R
F
 
F
P
 
G
N
 
A
N
 
G
I
 
D
P
 
L
E
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
W
Y
 
L
Y
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
D
 
E
T
 
-
G
 
G
G
 
P
T
 
R
N
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
F
K
 
K
L
 
P
R
 
P
R
 
R

4j4kA Crystal structure of glucose isomerase
30% identity, 69% coverage: 43:342/434 of query aligns to 8:290/385 of 4j4kA

query
sites
4j4kA
R
 
R
F
 
F
A
 
T
V
 
F
A
 
G
W
 
L
W
 
W
H
 
-
S
 
T
F
 
V
A
 
G
W
 
W
E
 
E
G
 
G
G
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
Q
 
-
R
 
-
P
 
-
W
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
D
H
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
R
K
 
A
A
 
L
D
 
D
A
 
P
A
 
V
F
 
E
E
 
S
M
 
V
F
 
R
R
 
R
I
 
L
-
 
A
-
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
A
P
 
H
F
 
G
Y
 
V
C
 
T
F
 
F
H
|
H
D
 
D
A
 
D
D
|
D
I
 
L
R
 
I
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
S
S
 
S
F
 
D
A
 
S
E
 
E
T
 
R
T
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
A
 
E
M
 
H
V
 
V
D
 
K
Y
 
R
L
 
F
G
 
R
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
L
E
 
D
A
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
M
R
 
K
L
 
V
L
 
P
W
x
M
G
 
A
T
 
T
A
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
T
H
 
H
R
 
P
R
 
V
Y
 
F
M
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
F
T
 
T
N
 
A
P
 
N
D
 
D
P
 
R
D
 
D
V
 
V
F
 
R
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
A
 
R
T
 
K
I
 
T
K
 
I
T
 
R
C
 
N
M
 
I
D
 
D
A
 
L
T
 
A
H
 
V
K
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
E
N
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
Y
 
A
E
 
E
T
 
S
L
 
G
L
 
G
N
 
A
T
 
K
D
 
D
L
 
V
G
 
R
R
 
D
E
 
A
R
 
L
E
 
D
Q
 
R
A
 
M
G
 
K
R
 
E
M
 
A
L
 
F
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
V
 
G
D
 
E
Y
 
Y
K
 
V
H
 
T
K
 
S
I
 
Q
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
G
 
I
T
 
R
I
 
F
L
 
A
L
 
I
E
|
E
P
 
P
K
|
K
P
 
P
Q
 
N
E
 
E
P
 
P
T
 
R
K
 
G
H
 
D
Q
 
I
Y
 
L
D
 
L
Y
 
P
D
 
T
V
 
V
A
 
G
T
 
H
V
 
A
F
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
E
E
 
R
F
 
L
G
 
E
L
 
R
Q
 
P
D
 
E
E
 
L
V
 
Y
K
 
G
M
 
V
N
 
N
I
 
P
E
|
E
Q
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
E
I
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
P
H
 
H
E
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
W
F
 
A
G
 
G
I
 
K
L
 
L
G
 
F
S
 
H
I
 
I
D
|
D
M
 
L
N
 
N
R
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
G
Q
 
Q
S
 
N
G
 
G
W
 
I
D
 
K
T
 
Y
D
|
D
Q
 
Q
-
x
D
-
 
L
-
 
R
F
 
F
P
 
G
N
 
A
N
 
G
I
 
D
P
 
L
E
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
W
Y
 
L
Y
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
R
 
E
A
 
S
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
D
 
-
T
 
S
G
 
G
G
 
P
T
 
R
N
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
F
K
 
K
L
 
P
R
 
P
R
 
R

Query Sequence

>3608603 FitnessBrowser__Dino:3608603
MSDFFAGIPAVTYEGPEARSDFAFRHYNPDEMVMGKRMEDQLRFAVAWWHSFAWEGGDPF
GGPTFQRPWFGDTLDHARAKADAAFEMFRILNVPFYCFHDADIRPEGASFAETTANLEAM
VDYLGQKQEASGKRLLWGTANLFSHRRYMAGAATNPDPDVFAYAAATIKTCMDATHKLGG
ANYVLWGGREGYETLLNTDLGREREQAGRMLQMVVDYKHKIGFEGTILLEPKPQEPTKHQ
YDYDVATVFSFLSEFGLQDEVKMNIEQGHAILAGHSFEHELALAREFGILGSIDMNRNDY
QSGWDTDQFPNNIPEVALAYYEILRAGGFDTGGTNFDSKLRRQSLDPADLIAAHVAAMDV
CAAGLKAAARMLEDGELEQRREDRYAGWRAPSAEAMLNGGKLEDCFAHVMETGLDPQPVS
GGQERLEALVARYL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory