SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609096 FitnessBrowser__Dino:3609096 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3tw6B Structure of rhizobium etli pyruvate carboxylase t882a with the allosteric activator, acetyl coenzyme-a (see paper)
64% identity, 99% coverage: 4:1141/1145 of query aligns to 3:1129/1129 of 3tw6B

query
sites
3tw6B
F
 
I
Q
 
S
K
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Y
 
W
A
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
C
 
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
S
Y
 
Y
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
E
 
R
G
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
S
P
 
P
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
V
 
N
A
 
K
N
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
A
E
 
D
T
 
T
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
N
K
|
K
A
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
N
V
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
P
L
 
L
G
 
A
D
 
E
D
 
-
M
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
V
R
 
A
A
 
K
E
 
M
A
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
K
|
K
A
 
A
S
 
S
W
 
W
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
I
 
I
F
 
R
D
 
S
P
 
E
D
 
A
E
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
K
K
 
E
V
 
V
R
 
T
E
 
E
G
 
A
R
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
N
 
K
G
 
D
E
 
E
G
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
|
E
K
 
K
M
x
L
I
x
V
T
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
T
M
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
H
 
H
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
V
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
S
 
E
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
Q
 
E
L
 
L
C
 
A
E
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
L
K
 
K
I
 
I
C
 
A
A
 
G
H
 
A
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
E
 
I
C
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
|
L
M
 
M
D
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
S
 
A
L
 
I
-
 
G
V
 
T
E
 
P
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
P
S
 
N
Q
 
Q
Y
 
E
D
 
D
V
 
I
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
C
R
|
R
I
 
V
T
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
N
 
N
F
 
F
I
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
A
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
F
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
W
 
W
A
 
A
P
 
P
T
 
N
P
 
P
E
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
M
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
A
T
 
T
N
 
N
I
 
L
A
 
T
F
 
F
V
 
L
E
 
E
N
 
A
L
 
I
L
 
I
K
 
G
H
 
H
P
 
P
T
 
K
F
 
F
L
 
R
N
 
D
N
 
N
Q
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
K
 
R
F
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
Q
P
 
V
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
R
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
A
E
 
K
G
 
D
R
 
R
P
 
P
K
 
K
P
 
P
P
 
L
A
 
E
T
 
N
P
 
A
R
 
A
A
 
R
L
 
P
R
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Y
P
 
N
K
 
G
A
 
N
A
 
G
P
 
V
A
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
T
K
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
K
V
 
F
A
 
G
D
 
E
W
 
W
M
|
M
A
x
R
A
 
N
Q
x
E
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
T
T
 
T
M
 
M
R
 
R
D
|
D
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
M
 
M
R
 
R
S
 
T
I
 
Y
D
 
D
M
 
I
I
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
P
 
G
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
A
 
H
N
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
L
E
 
E
C
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
M
R
 
R
F
 
F
L
 
L
Q
 
T
E
 
E
C
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
A
D
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
L
M
 
L
T
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
Y
F
 
F
T
 
V
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
F
R
 
R
V
 
V
F
 
F
D
|
D
S
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
E
S
 
E
G
 
N
K
 
K
V
 
L
C
 
C
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
S
N
 
A
R
 
R
A
 
P
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
T
T
 
N
M
 
L
G
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
A
L
 
V
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
A
V
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
I
H
 
H
F
 
F
H
|
H
T
 
T
H
|
H
D
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
P
T
 
C
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
H
 
G
T
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
P
K
 
A
A
 
W
V
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
I
S
 
S
D
 
F
Y
 
Y
W
 
W
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
N
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
D
M
 
L
Q
 
K
A
 
G
P
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
E
 
E
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
W
 
W
H
 
H
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
N
Q
 
Q
M
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
x
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
M
 
M
M
 
M
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
D
L
 
L
S
 
T
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
V
D
 
S
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
E
V
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
V
D
 
S
M
 
M
M
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
D
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
P
G
 
S
G
 
G
F
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
Q
A
 
K
K
 
K
I
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
E
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
S
H
 
L
I
 
L
P
 
K
P
 
E
V
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
K
 
A
T
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
R
D
 
E
I
 
V
D
 
S
D
 
D
E
 
F
D
 
E
L
 
F
N
 
A
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
M
 
A
T
 
L
R
 
A
H
 
S
A
 
D
E
 
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
S
T
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
P
T
 
A
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
Q
 
A
P
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
F
V
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
I
R
 
V
M
 
N
Q
 
Q
T
 
A
A
 
V
S
 
S
E
 
A
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
Q
G
 
G
E
 
M
V
 
V
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
V
 
V
P
 
P
N
 
D
R
 
R
K
 
A
A
 
H
A
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
-
K
 
-
R
 
R
P
 
R
K
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
N
 
P
H
 
H
V
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
M
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
I
A
 
S
S
 
R
V
 
V
A
 
F
V
 
V
Q
 
S
A
 
S
G
 
A
A
 
-
S
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
V
T
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
K
|
K
M
 
M
E
 
E
T
 
T
G
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
A
E
 
E
R
 
K
D
 
D
A
 
G
V
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
E
V
 
V
H
 
L
V
 
V
T
 
K
P
 
A
A
 
G
A
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
L
 
L

3tw6C Structure of rhizobium etli pyruvate carboxylase t882a with the allosteric activator, acetyl coenzyme-a (see paper)
64% identity, 92% coverage: 4:1058/1145 of query aligns to 3:1044/1044 of 3tw6C

query
sites
3tw6C
F
 
I
Q
 
S
K
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Y
 
W
A
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
C
 
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
S
Y
 
Y
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
E
 
R
G
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
S
P
 
P
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
V
 
N
A
 
K
N
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
A
E
 
D
T
 
T
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
N
K
|
K
A
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
N
V
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
P
L
 
L
G
 
P
D
 
D
D
 
D
M
 
M
D
 
A
K
 
E
V
 
V
R
 
A
A
 
K
E
 
M
A
 
A
E
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
M
 
M
L
 
L
K
|
K
A
 
A
S
 
S
W
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
|
M
R
 
R
P
 
V
I
 
I
F
 
R
D
 
S
P
 
E
D
 
A
E
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
K
K
 
E
V
 
V
R
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
T
F
 
F
G
 
G
N
 
K
G
 
D
E
 
E
G
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
L
I
x
V
T
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
T
M
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
H
 
H
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
V
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
N
Q
 
Q
K
|
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
S
 
E
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
Q
 
E
L
 
L
C
 
A
E
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
L
K
 
K
I
 
I
C
 
A
A
 
G
H
 
A
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
E
 
I
C
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
 
L
M
 
M
D
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
S
 
A
L
 
I
-
 
G
V
 
T
E
 
P
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
P
S
 
N
Q
 
Q
Y
 
E
D
 
D
V
 
I
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
C
R
|
R
I
 
V
T
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
N
 
N
F
 
F
I
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
A
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
F
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
W
 
W
A
 
A
P
 
P
T
 
N
P
 
P
E
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
M
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
F
 
F
R
|
R
I
 
I
R
|
R
G
 
G
V
 
V
S
 
A
T
 
T
N
 
N
I
 
L
A
 
T
F
 
F
V
 
L
E
 
E
N
 
A
L
 
I
L
 
I
K
 
G
H
 
H
P
 
P
T
 
K
F
 
F
L
 
R
N
 
D
N
 
N
Q
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
K
 
R
F
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
Q
P
 
V
K
 
K
R
|
R
R
x
Q
D
|
D
R
|
R
A
 
A
T
 
T
R
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
A
E
 
K
G
 
D
R
 
R
P
 
P
K
 
K
P
 
P
P
 
L
A
 
E
T
 
A
P
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
P
P
 
V
A
 
V
P
 
P
K
 
Y
A
 
N
A
 
G
P
 
V
A
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
T
K
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
K
V
 
F
A
 
G
D
 
E
W
 
W
M
 
M
A
 
R
A
 
N
Q
 
E
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
T
T
 
T
M
 
M
R
 
R
D
|
D
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
M
 
M
R
 
R
S
 
T
I
 
Y
D
 
D
M
 
I
I
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
P
 
G
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
A
 
H
N
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
L
E
 
E
C
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
M
R
 
R
F
 
F
L
 
L
Q
 
T
E
 
E
C
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
A
D
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
L
M
 
L
T
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
Y
F
 
F
T
 
V
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
F
R
 
R
V
 
V
F
 
F
D
|
D
S
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
E
S
 
E
G
 
N
K
 
K
V
 
L
C
 
C
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
S
N
 
A
R
 
R
A
 
P
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
T
T
 
N
M
 
L
G
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
A
L
 
V
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
A
V
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
I
H
 
H
F
 
F
H
|
H
T
 
T
H
|
H
D
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
P
T
 
C
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
H
 
G
T
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
P
K
 
A
A
 
W
V
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
I
S
 
S
D
 
F
Y
 
Y
W
 
W
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
N
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
D
M
 
L
Q
 
K
A
 
G
P
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
E
 
E
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
W
 
W
H
 
H
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
N
Q
 
Q
M
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
x
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
M
 
M
M
 
M
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
D
L
 
L
S
 
T
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
V
D
 
S
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
E
V
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
V
D
 
S
M
 
M
M
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
D
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
P
G
 
S
G
 
G
F
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
Q
A
 
K
K
 
K
I
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
E
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
S
H
 
L
I
 
L
P
 
K
P
 
E
V
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
K
 
A
T
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
R
D
 
E
I
 
V
D
 
S
D
 
D
E
 
F
D
 
E
L
 
F
N
 
A
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
M
 
A
T
 
L
R
 
A
H
 
S
A
 
D
E
 
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
S
T
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
P
T
 
A
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
Q
 
A
P
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
F
V
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
|
L
V
 
V
V
 
I
R
 
V
M
 
N
Q
 
Q
T
 
A
A
 
V
S
 
S
E
 
A
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
Q
G
 
G
E
 
M
V
 
V
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
V
 
V
P
 
P
N
 
D

2qf7B Crystal structure of a complete multifunctional pyruvate carboxylase from rhizobium etli (see paper)
63% identity, 92% coverage: 4:1059/1145 of query aligns to 3:1015/1017 of 2qf7B

query
sites
2qf7B
F
 
I
Q
 
S
K
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Y
 
W
A
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
C
 
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
S
Y
 
Y
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
E
 
R
G
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
S
P
 
P
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
V
 
N
A
 
K
N
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
R
 
K
A
 
A
E
 
D
T
 
T
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
D
 
N
K
|
K
A
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
N
V
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
P
L
 
L
G
 
P
D
 
-
D
 
-
M
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
P
L
 
V
M
|
M
L
 
L
K
|
K
A
 
A
S
 
S
W
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
|
M
R
 
R
P
 
V
I
 
I
F
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
R
G
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
|
E
K
 
K
M
 
L
I
x
V
T
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
T
M
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
H
 
H
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
V
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
N
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
S
 
E
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
Q
 
E
L
 
L
C
 
A
E
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
L
K
 
K
I
 
I
C
 
A
A
 
G
H
 
A
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
E
 
I
C
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
|
L
M
 
M
D
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
|
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
S
 
A
L
 
I
-
 
G
V
 
T
E
 
P
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
P
S
 
N
Q
 
Q
Y
 
E
D
 
D
V
 
I
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
C
R
|
R
I
 
V
T
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
N
 
N
F
 
F
I
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
A
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
F
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
W
 
W
A
 
A
P
 
P
T
 
N
P
 
P
E
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
M
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
A
T
 
T
N
 
N
I
 
L
A
 
T
F
 
F
V
 
L
E
 
E
N
 
A
L
 
I
L
 
I
K
 
G
H
 
H
P
 
P
T
 
K
F
 
F
L
 
R
N
 
D
N
 
N
Q
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
|
T
K
 
R
F
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
-
P
 
Q
K
 
V
R
 
R
R
 
Q
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
R
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
A
E
 
K
G
 
D
R
 
R
P
 
P
K
 
K
P
 
P
P
 
L
A
 
E
T
 
A
P
 
A
R
 
R
A
 
P
L
 
V
R
 
-
A
 
V
P
 
P
A
 
Y
P
 
G
K
 
N
A
 
G
A
 
V
P
 
-
A
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
T
K
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
K
V
 
F
A
 
G
D
 
E
W
 
W
M
|
M
A
x
R
A
 
N
Q
x
E
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
T
T
 
T
M
 
M
R
 
R
D
|
D
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
M
 
M
R
 
R
S
 
T
I
 
Y
D
 
D
M
 
I
I
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
P
 
G
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
A
 
H
N
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
L
E
 
E
C
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
M
R
 
R
F
 
F
L
 
L
Q
 
T
E
 
E
C
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
A
D
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
L
M
 
L
T
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
Y
F
 
F
T
 
V
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
F
R
 
R
V
 
V
F
 
F
D
|
D
S
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
E
S
 
E
G
 
N
K
 
K
V
 
L
C
 
C
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
S
N
 
A
R
 
R
A
 
P
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
T
T
 
N
M
 
L
G
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
A
L
 
V
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
A
V
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
I
H
 
H
F
 
F
H
|
H
T
 
T
H
|
H
D
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
P
T
 
C
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
H
 
G
T
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
P
K
 
A
A
 
W
V
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
I
S
 
S
D
 
F
Y
 
Y
W
 
W
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
N
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
D
M
 
L
Q
 
K
A
 
G
P
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
E
 
E
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
W
 
W
H
 
H
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
N
Q
 
Q
M
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
|
T
P
 
P
S
 
S
S
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
M
 
M
M
 
M
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
D
L
 
L
S
 
T
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
V
D
 
S
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
E
V
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
V
D
 
S
M
 
M
M
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
D
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
P
G
 
S
G
 
G
F
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
Q
A
 
K
K
 
K
I
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
E
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
S
H
 
L
I
 
L
P
 
K
P
 
E
V
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
K
 
A
T
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
R
D
 
E
I
 
V
D
 
S
D
 
D
E
 
F
D
 
E
L
 
F
N
 
A
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
M
 
A
T
 
L
R
 
A
H
 
S
A
 
D
E
 
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
S
T
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
P
T
 
A
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
Q
 
A
P
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
F
V
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
I
R
 
V
M
 
N
Q
 
Q
T
 
A
A
 
V
S
 
S
E
 
A
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
Q
G
 
G
E
 
M
V
 
V
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
V
 
V
P
 
P
N
 
D
R
 
R

3tw6A Structure of rhizobium etli pyruvate carboxylase t882a with the allosteric activator, acetyl coenzyme-a (see paper)
61% identity, 93% coverage: 4:1064/1145 of query aligns to 3:1007/1007 of 3tw6A

query
sites
3tw6A
F
 
I
Q
 
S
K
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
F
R
 
R
A
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Y
 
W
A
 
A
E
 
E
E
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
C
 
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
F
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
S
Y
 
Y
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
E
 
R
G
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
I
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
V
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
S
P
 
P
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
A
C
 
C
V
 
N
A
 
K
N
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
D
 
P
K
 
K
A
 
A
S
 
D
A
 
T
R
 
M
R
 
R
V
 
Q
A
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
G
 
G
D
 
N
D
x
K
M
 
V
D
 
-
K
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
N
E
 
L
A
 
A
E
 
I
A
 
S
I
 
V
G
 
G
F
 
V
P
 
P
L
 
V
M
 
V
L
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
R
 
-
P
 
P
I
 
A
F
 
T
D
 
E
P
 
P
D
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
K
M
x
L
I
x
V
T
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
T
M
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
H
 
H
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
V
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
S
 
E
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
Q
 
E
L
 
L
C
 
A
E
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
L
K
 
K
I
 
I
C
 
A
A
 
G
H
 
A
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
E
 
I
C
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
|
L
M
 
M
D
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
S
 
A
L
 
I
-
 
G
V
 
T
E
 
P
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
P
S
 
N
Q
 
Q
Y
 
E
D
 
D
V
 
I
Q
 
R
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
C
 
C
R
|
R
I
 
V
T
 
T
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
N
 
H
N
 
N
F
 
F
I
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
G
 
S
A
 
A
T
 
S
G
 
G
M
 
F
G
 
G
I
 
I
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
P
L
 
L
L
 
L
E
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
A
W
 
W
A
 
A
P
 
P
T
 
N
P
 
P
E
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
M
 
M
D
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
|
R
G
 
G
V
 
V
S
 
A
T
 
T
N
 
N
I
 
L
A
 
T
F
 
F
V
 
L
E
 
E
N
 
A
L
 
I
L
 
I
K
 
G
H
 
H
P
 
P
T
 
K
F
 
F
L
 
R
N
 
D
N
 
N
Q
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
K
 
R
F
 
F
I
 
I
D
 
D
E
 
T
T
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
F
 
Q
P
 
V
K
 
K
R
|
R
R
x
Q
D
|
D
R
|
R
A
 
A
T
 
T
R
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
T
Y
 
Y
I
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
H
P
 
P
E
 
E
T
 
A
E
 
K
G
 
D
R
 
R
P
 
P
K
 
K
P
 
P
P
 
-
A
 
-
T
 
L
P
 
E
R
 
N
A
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
P
P
 
V
A
 
V
P
 
P
K
 
Y
A
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
N
A
 
G
P
 
V
A
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
T
K
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
K
V
 
F
A
 
G
D
 
E
W
 
W
M
|
M
A
x
R
A
 
N
Q
x
E
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
D
T
 
T
T
 
T
M
 
M
R
 
R
D
|
D
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
M
 
M
R
 
R
S
 
T
I
 
Y
D
 
D
M
 
I
I
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
P
 
G
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
A
 
H
N
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
L
 
L
F
 
L
S
 
S
V
 
L
E
 
E
C
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
S
Y
 
M
R
 
R
F
 
F
L
 
L
Q
 
T
E
 
E
C
 
D
P
 
P
W
 
W
Q
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
A
D
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
L
M
 
L
T
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
R
 
K
A
 
Y
F
 
F
T
 
V
L
 
R
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
L
F
 
F
R
 
R
V
 
V
F
 
F
D
|
D
S
 
C
L
 
L
N
 
N
W
 
W
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
D
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
A
E
 
E
S
 
E
G
 
N
K
 
K
V
 
L
C
 
C
E
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
C
 
C
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
S
N
 
A
R
 
R
A
 
P
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
K
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
T
T
 
N
M
 
L
G
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
A
L
 
V
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
E
E
 
A
V
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
I
H
 
H
F
 
F
H
|
H
T
 
T
H
|
H
D
 
D
T
 
T
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
P
T
 
C
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
H
 
G
T
 
S
D
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
P
K
 
A
A
 
W
V
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
I
S
 
S
D
 
F
Y
 
Y
W
 
W
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
N
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
D
M
 
L
Q
 
K
A
 
G
P
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
H
 
H
E
 
E
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
T
R
 
R
W
 
W
H
 
H
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
V
 
A
N
 
N
Q
 
Q
M
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
x
A
P
 
P
S
 
S
S
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
M
 
M
M
 
M
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
D
L
 
L
S
 
T
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
V
D
 
S
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
E
V
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
P
D
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
V
D
 
S
M
 
M
M
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
D
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
A
 
P
G
 
S
G
 
G
F
 
W
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
L
V
 
Q
A
 
K
K
 
K
I
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
K
P
 
P
N
 
Y
T
 
T
E
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
G
K
 
S
H
 
L
I
 
L
P
 
K
P
 
E
V
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
K
 
A
T
 
E
R
 
R
A
 
K
D
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
V
 
R
D
 
E
I
 
V
D
 
S
D
 
D
E
 
F
D
 
E
L
 
F
N
 
A
G
 
S
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
V
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
M
 
A
T
 
L
R
 
A
H
 
S
A
 
D
E
 
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
S
T
 
V
L
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
P
T
 
A
F
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
Q
 
A
P
 
D
G
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
L
E
 
F
V
 
A
E
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
T
|
T
L
|
L
V
 
V
V
 
I
R
 
V
M
 
N
Q
 
Q
T
 
A
A
 
V
S
 
S
E
 
A
T
 
T
N
 
D
E
 
S
D
 
Q
G
 
G
E
 
M
V
 
V
K
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
V
 
I
R
 
K
V
 
V
P
 
P
N
 
D
R
 
R
K
 
A
A
 
H
A
 
G
A
 
A
S
 
T

2qf7A Crystal structure of a complete multifunctional pyruvate carboxylase from rhizobium etli (see paper)
63% identity, 82% coverage: 204:1141/1145 of query aligns to 140:1073/1076 of 2qf7A

query
sites
2qf7A
K
 
K
M
 
L
I
 
V
T
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
T
M
 
H
G
 
G
N
 
N
I
 
V
Y
 
V
H
 
H
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
V
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
N
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
S
 
E
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
Q
 
E
L
 
L
C
 
A
E
 
A
L
 
Y
G
 
S
R
 
L
K
 
K
I
 
I
C
 
A
A
 
G
H
 
A
V
 
T
N
 
N
Y
 
Y
E
 
I
C
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
V
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
|
L
M
 
M
D
 
D
M
 
A
D
 
D
T
 
T
G
 
G
E
 
K
F
 
F
F
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
V
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
I
 
I
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
S
 
A
L
 
I
-
 
G
V
 
T
E
 
P
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
P
S
 
N
Q
 
Q
Y
 
E
D
 
D
V
 
I
Q
 
R
L
 
L
N
 
N