SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609200 Dshi_2586 HpcH/HpaI aldolase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1dxfA 2-dehydro-3-deoxy-galactarate aldolase from escherichia coli in complex with pyruvate (see paper)
32% identity, 87% coverage: 2:219/251 of query aligns to 5:226/253 of 1dxfA

query
sites
1dxfA
D
 
N
D
 
K
F
 
F
R
 
K
T
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
K
E
 
Q
M
 
V
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
C
F
 
W
V
 
S
K
 
A
T
 
L
P
 
S
A
 
N
I
 
P
E
 
I
M
 
S
V
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
I
G
 
S
R
 
T
-
 
F
I
 
I
D
 
P
A
 
Q
C
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
G
A
 
S
L
 
A
G
 
S
F
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
-
V
 
V
R
|
R
V
 
V
A
 
P
E
 
T
A
 
N
T
 
E
P
 
P
P
 
V
A
 
I
L
 
I
M
 
K
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
I
G
 
G
A
 
F
A
 
Y
G
 
N
V
 
F
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
F
V
 
V
D
 
E
S
 
T
A
 
K
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
S
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
-
 
P
H
 
E
G
 
G
G
 
I
R
 
R
G
 
G
F
 
V
A
 
S
G
 
V
S
 
S
T
 
H
R
 
R
S
 
A
A
 
N
G
 
M
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
R
 
-
G
 
-
M
 
V
G
 
A
D
 
D
V
 
Y
L
 
F
S
 
A
D
 
Q
G
 
S
P
 
N
K
 
K
P
 
N
L
 
I
-
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
S
P
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
N
C
 
V
E
 
D
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
V
G
|
G
P
|
P
A
x
S
D
|
D
L
 
L
S
 
A
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
H
M
 
L
D
 
G
Q
 
N
T
 
A
S
 
S
-
 
H
P
 
P
E
 
D
L
 
V
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
Q
R
 
H
V
 
I
G
 
F
A
 
N
A
 
R
C
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
H
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
S
M
 
G
T
 
I
F
 
L
T
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
R
K
 
R
A
 
Y
A
 
L
A
 
E
W
 
W

1dxeA 2-dehydro-3-deoxy-galactarate aldolase from escherichia coli (see paper)
32% identity, 87% coverage: 2:219/251 of query aligns to 5:226/253 of 1dxeA

query
sites
1dxeA
D
 
N
D
 
K
F
 
F
R
 
K
T
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
K
E
 
Q
M
 
V
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
C
F
x
W
V
 
S
K
 
A
T
 
L
P
 
S
A
 
N
I
 
P
E
 
I
M
 
S
V
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
I
G
 
S
R
 
T
-
 
F
I
 
I
D
 
P
A
 
Q
C
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
G
A
 
S
L
 
A
G
 
S
F
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
-
V
 
V
R
|
R
V
 
V
A
 
P
E
 
T
A
 
N
T
 
E
P
 
P
P
 
V
A
 
I
L
 
I
M
 
K
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
I
G
 
G
A
 
F
A
 
Y
G
 
N
V
 
F
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
F
V
 
V
D
 
E
S
 
T
A
 
K
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
S
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
-
 
P
H
 
E
G
 
G
G
 
I
R
 
R
G
 
G
F
 
V
A
 
S
G
 
V
S
 
S
T
 
H
R
 
R
S
 
A
A
 
N
G
 
M
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
R
 
-
G
 
-
M
 
V
G
 
A
D
 
D
V
 
Y
L
 
F
S
 
A
D
 
Q
G
 
S
P
 
N
K
 
K
P
 
N
L
 
I
-
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
S
P
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
N
C
 
V
E
 
D
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
V
G
|
G
P
 
P
A
 
S
D
|
D
L
 
L
S
 
A
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
H
M
 
L
D
 
G
Q
 
N
T
 
A
S
 
S
-
 
H
P
 
P
E
 
D
L
 
V
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
Q
R
 
H
V
 
I
G
 
F
A
 
N
A
 
R
C
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
H
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
S
M
 
G
T
 
I
F
 
L
T
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
R
K
 
R
A
 
Y
A
 
L
A
 
E
W
 
W

P23522 5-keto-4-deoxy-D-glucarate aldolase; KDGluc aldolase; KDGlucA; 2-dehydro-3-deoxy-D-glucarate aldolase; 2-keto-3-deoxy-D-glucarate aldolase; 5-dehydro-4-deoxy-D-glucarate aldolase; Alpha-keto-beta-deoxy-D-glucarate aldolase; EC 4.1.2.20 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 87% coverage: 2:219/251 of query aligns to 8:229/256 of P23522

query
sites
P23522
D
 
N
D
 
K
F
 
F
R
 
K
T
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
K
E
 
Q
M
 
V
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
C
F
 
W
V
 
S
K
 
A
T
 
L
P
 
S
A
 
N
I
 
P
E
 
I
M
 
S
V
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
I
G
 
S
R
 
T
-
 
F
I
 
I
D
 
P
A
 
Q
C
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
G
A
 
S
L
 
A
G
 
S
F
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
-
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
P
E
 
T
A
 
N
T
 
E
P
 
P
P
 
V
A
 
I
L
 
I
M
 
K
Q
 
R
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
F
A
 
Y
G
 
N
V
 
F
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
F
V
 
V
D
 
E
S
 
T
A
 
K
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
S
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
-
 
P
H
 
E
G
 
G
G
 
I
R
 
R
G
 
G
F
 
V
A
 
S
G
 
V
S
 
S
T
 
H
R
 
R
S
 
A
A
 
N
G
 
M
Y
 
F
G
 
G
T
 
T
R
 
-
G
 
-
M
 
V
G
 
A
D
 
D
V
 
Y
L
 
F
S
 
A
D
 
Q
G
 
S
P
 
N
K
 
K
P
 
N
L
 
I
-
 
T
V
 
I
I
 
L
A
 
V
Q
|
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
S
P
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
N
C
 
V
E
 
D
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
V
G
 
G
P
 
P
A
x
S
D
|
D
L
 
L
S
 
A
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
H
M
 
L
D
 
G
Q
 
N
T
 
A
S
 
S
-
 
H
P
 
P
E
 
D
L
 
V
M
 
Q
A
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
Q
R
 
H
V
 
I
G
 
F
A
 
N
A
 
R
C
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
H
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
S
M
 
G
T
 
I
F
 
L
T
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
E
-
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
R
K
 
R
A
 
Y
A
 
L
A
 
E
W
 
W

2vwtA Crystal structure of yfau, a metal ion dependent class ii aldolase from escherichia coli k12 - mg-pyruvate product complex (see paper)
30% identity, 89% coverage: 4:226/251 of query aligns to 9:236/256 of 2vwtA

query
sites
2vwtA
F
 
F
R
 
K
T
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
R
A
 
K
G
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
L
F
 
W
V
 
L
K
 
S
T
 
S
P
 
T
A
 
T
I
 
A
E
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
T
R
 
I
G
 
Q
R
 
D
I
 
L
D
 
Y
A
 
H
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
A
G
 
V
L
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
A
F
 
S
P
 
Q
L
 
P
L
 
V
V
 
I
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
E
A
 
G
T
 
S
P
 
K
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
D
|
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
I
 
V
A
 
V
K
 
S
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
-
 
P
H
 
Y
G
 
G
G
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
V
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
V
R
 
A
S
 
R
A
 
A
G
 
A
Y
 
R
G
 
W
T
 
G
R
 
R
G
 
I
M
 
E
G
 
N
D
 
Y
V
 
M
L
 
A
S
 
Q
D
 
V
G
 
N
P
 
D
K
 
S
P
 
L
L
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
T
G
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
D
T
 
V
P
 
E
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
V
F
|
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
 
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
S
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
P
D
 
D
Q
 
N
T
 
A
-
 
G
S
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
M
 
Q
-
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
E
A
 
T
A
 
S
I
 
I
D
 
R
R
 
R
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
-
P
 
-
Y
 
F
M
x
L
T
 
A
F
 
V
T
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
-
 
A
E
 
Q
K
 
Q
A
 
C
A
 
L
A
 
A
W
 
W
R
 
G
A
 
A
H
 
N
G
 
F
F
 
V
S
 
A
V
 
V

P76469 2-keto-3-deoxy-L-rhamnonate aldolase; KDR aldolase; 2-dehydro-3-deoxyrhamnonate aldolase; 2-keto-3-deoxy acid sugar aldolase; EC 4.1.2.53 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 89% coverage: 4:226/251 of query aligns to 9:236/267 of P76469

query
sites
P76469
F
 
F
R
 
K
T
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
R
A
 
K
G
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
L
F
 
W
V
 
L
K
 
S
T
 
S
P
 
T
A
 
T
I
 
A
E
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
T
R
 
I
G
 
Q
R
 
D
I
 
L
D
 
Y
A
 
H
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
A
G
 
V
L
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
A
F
 
S
P
 
Q
L
 
P
L
 
V
V
 
I
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
E
A
 
G
T
 
S
P
 
K
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
I
 
V
A
 
V
K
 
S
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
-
 
P
H
 
Y
G
 
G
G
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
V
A
 
G
G
 
A
S
 
S
T
 
V
R
 
A
S
 
R
A
 
A
G
 
A
Y
 
R
G
 
W
T
 
G
R
 
R
G
 
I
M
 
E
G
 
N
D
 
Y
V
 
M
L
 
A
S
 
Q
D
 
V
G
 
N
P
 
D
K
 
S
P
 
L
L
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
T
G
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
D
T
 
V
P
 
E
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
S
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
P
D
 
D
Q
 
N
T
 
A
-
 
G
S
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
M
 
Q
-
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
E
A
 
T
A
 
S
I
 
I
D
 
R
R
 
R
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
-
P
 
-
Y
 
F
M
 
L
T
 
A
F
 
V
T
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
-
 
A
E
 
Q
K
 
Q
A
 
C
A
 
L
A
 
A
W
 
W
R
 
G
A
 
A
H
 
N
G
 
F
F
 
V
S
 
A
V
 
V

4tv5A Crystal structure of citrate synthase sbng (see paper)
29% identity, 91% coverage: 4:232/251 of query aligns to 4:224/245 of 4tv5A

query
sites
4tv5A
F
x
L
R
 
K
T
 
H
R
 
R
M
 
L
L
 
N
A
 
N
G
 
G
E
 
D
M
 
S
L
 
V
A
 
Y
G
 
G
T
 
I
F
 
F
V
 
N
K
 
S
T
 
I
P
 
P
A
 
D
I
 
P
E
 
L
M
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
V
C
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
T
E
 
E
H
|
H
A
 
V
P
 
A
F
 
I
D
 
N
R
 
D
G
 
E
R
 
T
I
 
L
D
 
A
A
 
H
C
 
L
L
 
I
A
 
R
L
 
A
G
 
A
L
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
H
F
 
I
P
 
I
L
 
P
L
 
I
V
 
V
R
|
R
V
 
V
A
 
T
E
 
A
A
 
V
T
 
I
P
 
D
P
 
R
A
 
D
L
 
I
M
 
I
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
D
|
D
A
 
M
G
 
G
A
 
A
A
x
R
G
 
G
V
 
I
V
 
I
V
 
V
P
 
P
H
 
H
V
 
V
D
 
K
S
 
D
A
 
R
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
E
R
 
H
I
 
I
A
 
V
K
 
K
A
 
L
C
 
S
R
 
R
Y
 
Y
G
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
Y
G
 
P
Y
 
Q
G
 
G
T
 
L
R
 
R
G
 
S
M
 
L
G
 
N
D
 
P
V
 
L
L
 
L
S
 
D
D
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
M
-
 
A
G
 
N
P
 
E
K
x
H
P
 
I
L
 
M
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Q
 
M
I
 
I
E
|
E
D
 
D
P
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
M
A
 
A
C
 
I
E
 
D
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
P
 
E
G
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
M
I
 
I
F
 
V
L
 
E
G
 
G
P
 
A
A
 
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
Q
S
 
S
H
 
L
G
 
G
K
 
I
M
 
P
D
 
W
Q
 
Q
T
 
T
-
 
R
S
 
D
P
 
D
E
 
Q
L
 
V
M
 
T
A
 
S
A
 
H
I
 
V
D
 
Q
R
 
H
V
 
I
G
 
F
A
 
E
A
 
V
C
 
V
A
 
N
A
 
A
S
 
H
G
 
G
K
 
K
P
 
H
Y
 
F
M
 
C
T
 
A
F
 
L
T
 
P
P
 
R
D
 
E
V
 
D
E
 
E
K
 
D
A
 
I
A
 
A
A
 
K
W
 
W
R
 
Q
A
 
A
H
 
Q
G
 
G
F
 
V
S
 
Q
V
 
T
F
 
F
F
 
I
V
 
L
A
 
G
S
 
D
E
 
D

Sites not aligning to the query:

4tv6A Crystal structure of citrate synthase variant sbng e151q (see paper)
29% identity, 91% coverage: 4:232/251 of query aligns to 2:205/225 of 4tv6A

query
sites
4tv6A
F
 
L
R
 
K
T
 
H
R
 
R
M
 
L
L
 
N
A
 
N
G
 
G
E
 
D
M
 
S
L
 
V
A
 
Y
G
 
G
T
 
I
F
 
F
V
 
N
K
 
S
T
 
I
P
 
P
A
 
D
I
 
P
E
 
L
M
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
F
A
 
V
C
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
T
E
|
E
H
|
H
A
 
V
P
 
A
F
 
I
D
 
N
R
 
D
G
 
E
R
 
T
I
 
L
D
 
A
A
 
H
C
 
L
L
 
I
A
 
R
L
 
A
G
 
A
L
 
E
A
 
A
L
 
A
G
 
H
F
 
I
P
 
I
L
 
P
L
 
I
V
 
V
R
|
R
V
 
V
A
 
T
E
 
D
A
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
I
M
 
I
Q
 
K
A
 
V
L
 
L
D
|
D
A
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
I
V
 
V
P
 
P
H
|
H
V
 
V
D
 
K
S
 
D
A
 
R
A
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
E
R
 
H
I
 
I
A
 
V
K
 
K
A
 
L
C
 
S
R
 
R
Y
 
Y
G
 
-
H
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
Y
A
 
P
G
 
Q
S
 
G
T
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
L
G
 
H
Y
 
I
G
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
M
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Q
 
M
I
 
I
E
x
Q
D
 
D
P
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
M
A
 
A
C
 
I
E
 
D
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
P
 
E
G
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
M
I
 
I
F
 
V
L
 
E
G
 
G
P
 
A
A
 
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
Q
S
 
S
H
 
L
G
 
G
K
 
I
M
 
P
D
 
W
Q
 
Q
T
 
T
-
 
R
S
 
D
P
 
D
E
 
Q
L
 
V
M
 
T
A
 
S
A
 
H
I
 
V
D
 
Q
R
 
H
V
 
I
G
 
F
A
 
E
A
 
V
C
 
V
A
 
N
A
 
A
S
 
H
G
 
G
K
 
K
P
 
H
Y
 
F
M
 
C
T
 
A
F
 
L
T
 
P
P
 
R
D
 
E
V
 
D
E
 
E
K
 
D
A
 
I
A
 
A
A
 
K
W
 
W
R
 
Q
A
 
A
H
 
Q
G
 
G
F
 
V
S
 
Q
V
 
T
F
 
F
F
 
I
V
 
L
A
 
G
S
 
D
E
 
D

7o5rA Crystal structure of holo-swhpa-mn (hydroxyketoacid aldolase) from sphingomonas wittichii rw1 (see paper)
31% identity, 94% coverage: 14:250/251 of query aligns to 15:251/251 of 7o5rA

query
sites
7o5rA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
-
F
 
W
V
 
L
K
 
Q
T
 
L
P
 
P
A
 
G
I
 
T
E
 
L
M
 
H
V
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
R
S
 
L
G
 
D
L
 
Y
D
 
D
F
 
A
A
 
V
C
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
M
E
 
Q
H
 
H
A
 
S
P
 
P
F
 
I
D
 
D
R
 
F
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
D
 
-
A
 
A
C
 
P
L
 
M
A
 
L
L
 
I
G
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
G
F
 
A
P
 
E
L
 
P
L
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
T
A
 
Q
E
 
V
A
 
N
T
 
D
P
 
P
P
 
S
A
 
D
L
 
I
M
 
M
Q
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
I
V
 
A
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
N
S
 
T
A
 
R
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
Q
R
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
C
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
S
-
 
P
H
 
R
G
 
G
G
 
L
R
 
R
G
 
S
F
 
F
A
 
G
G
 
P
S
 
R
T
 
R
R
 
P
S
 
S
A
 
L
G
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
G
V
 
Y
L
 
L
S
 
A
D
 
Q
G
 
A
P
 
S
K
 
E
P
 
T
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
 
L
A
 
A
Q
 
M
I
 
I
E
|
E
D
 
T
P
 
R
E
 
E
G
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
N
C
 
I
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
S
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
T
D
|
D
L
 
L
S
 
A
V
 
L
S
 
D
H
 
L
G
 
G
K
 
H
-
 
A
-
 
P
-
 
L
M
 
V
D
 
D
Q
 
T
T
 
E
S
 
E
P
 
A
E
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
A
R
 
H
V
 
V
G
 
R
A
 
E
A
 
R
C
 
A
A
 
H
A
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
R
Y
 
V
M
 
G
T
 
I
F
 
F
T
 
C
P
 
G
D
 
S
V
 
G
E
 
G
K
 
F
A
 
A
A
 
R
A
 
V
W
 
K
R
 
L
A
 
A
H
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
D
V
 
F
F
 
V
F
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
P
E
 
D
H
 
L
A
 
A
W
 
M
M
 
L
L
 
S
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
A
 
I
K
 
A
G
 
D
I
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L

8adqA Crystal structure of holo-swhpa-mg (hydroxy ketone aldolase) from sphingomonas wittichii rw1 in complex with hydroxypyruvate and d- glyceraldehyde (see paper)
31% identity, 94% coverage: 14:250/251 of query aligns to 16:252/252 of 8adqA

query
sites
8adqA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
-
F
x
W
V
 
L
K
x
Q
T
 
L
P
 
P
A
 
G
I
 
T
E
 
L
M
 
H
V
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
R
S
 
L
G
 
D
L
 
Y
D
 
D
F
 
A
A
 
V
C
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
M
E
 
Q
H
|
H
A
 
S
P
 
P
F
 
I
D
 
D
R
 
F
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
D
 
-
A
 
A
C
 
P
L
 
M
A
 
L
L
 
I
G
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
G
F
 
A
P
 
E
L
 
P
L
 
F
V
 
V
R
|
R
V
 
T
A
 
Q
E
 
V
A
 
N
T
 
D
P
 
P
P
 
S
A
 
D
L
 
I
M
 
M
Q
 
K
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
V
 
I
V
 
I
V
 
A
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
N
S
 
T
A
 
R
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
Q
R
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
A
C
 
L
R
 
H
Y
 
Y
G
 
S
-
 
P
H
 
R
G
 
G
G
 
L
R
 
R
G
 
S
F
|
F
A
 
G
G
 
P
S
 
R
T
 
R
R
 
P
S
 
S
A
 
L
G
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
R
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
G
V
x
Y
L
|
L
S
 
A
D
 
Q
G
 
A
P
 
S
K
 
E
P
 
T
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
 
L
A
 
A
Q
x
M
I
 
I
E
|
E
D
 
T
P
 
R
E
 
E
G
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
N
C
 
I
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
S
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
x
T
D
|
D
L
 
L
S
 
A
V
 
L
S
 
D
H
 
L
G
 
G
K
 
H
-
 
A
-
 
P
-
 
L
M
 
V
D
 
D
Q
 
T
T
 
E
S
 
E
P
 
A
E
 
E
L
 
V
M
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
I
D
 
A
R
 
H
V
 
V
G
 
R
A
 
E
A
 
R
C
 
A
A
 
H
A
 
A
S
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
R
Y
 
V
M
 
G
T
 
I
F
|
F
T
 
C
P
 
G
D
 
S
V
 
G
E
 
G
K
 
F
A
 
A
A
 
R
A
 
V
W
 
K
R
 
L
A
 
A
H
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
D
V
 
F
F
 
V
F
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
P
E
 
D
H
 
L
A
 
A
W
 
M
M
 
L
L
 
S
Q
 
A
G
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
A
 
I
K
 
A
G
 
D
I
 
A
K
 
R
A
 
A
L
 
L

7ethA Crystal structure of abhpai-zn-pyruvate-propionaldehyde complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 4:210/251 of 7ethA

query
sites
7ethA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
x
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

7et9A Crystal structure of abhpai-zn-pyruvate complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/254 of 7et9A

query
sites
7et9A
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

7etiA Crystal structure of abhpai-zn-pyruvate-4-hydroxybenzaldehyde complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7etiA

query
sites
7etiA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
|
G
S
 
A
T
x
A
R
x
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7etfA Crystal structure of abhpai-mn-pyruvate-succinic semialdehyde complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7etfA

query
sites
7etfA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
|
G
S
x
A
T
x
A
R
x
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
|
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

7eteA Crystal structure of abhpai-mg-(4r)-kdgal complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7eteA

query
sites
7eteA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
|
G
S
 
A
T
x
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7etdA Crystal structure of abhpai-zn-(4s)-kdglu complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7etdA

query
sites
7etdA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
|
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7etcA Crystal structure of abhpai-zn-(4r)-kdgal complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7etcA

query
sites
7etcA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

7etbA Crystal structure of abhpai-mn-pyruvate complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7etbA

query
sites
7etbA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
|
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

7etaA Crystal structure of abhpai-co-pyruvate complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 80% coverage: 3:203/251 of query aligns to 6:212/253 of 7etaA

query
sites
7etaA
D
 
N
F
 
Y
R
 
F
T
 
K
R
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
E
M
 
Q
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
M
F
 
W
V
 
V
K
 
G
T
 
L
P
 
A
A
 
D
I
 
G
E
 
Y
M
 
C
V
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
N
S
 
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
D
R
 
V
G
 
R
R
 
S
I
 
I
D
 
L
A
 
A
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
S
G
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
A
L
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
P
A
 
V
E
 
S
A
 
G
T
 
D
P
 
V
P
 
P
A
 
L
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
I
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
M
A
 
V
K
 
K
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
I
G
 
R
F
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
T
 
A
R
 
L
S
 
A
A
 
R
G
 
A
Y
 
S
G
 
R
T
 
W
R
 
N
G
 
N
M
 
I
G
 
S
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
T
G
 
A
P
 
D
K
 
E
P
 
Q
L
 
I
-
 
C
V
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
V
E
|
E
D
 
S
P
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
D
 
D
A
 
N
C
 
L
E
 
D
G
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
N
T
 
V
P
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
A
H
 
L
G
 
G
K
 
Y
M
 
R
D
 
G
Q
 
N
T
 
P
S
 
G
P
 
H
E
 
E
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
I
L
 
I
M
 
V
A
 
Q
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
V
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
C
 
G
A
 
K
A
 
A
S
 
A
G
 
G

1izcA Crystal structure analysis of macrophomate synthase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 12:251/251 of query aligns to 40:278/299 of 1izcA

query
sites
1izcA
E
 
K
M
 
T
L
 
L
A
 
M
G
 
G
T
 
V
F
 
A
V
 
H
K
 
G
T
 
I
P
 
P
A
 
S
I
 
T
E
 
F
M
 
V
V
 
T
E
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
A
S
 
T
G
 
K
L
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
V
C
 
W
L
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
H
|
H
A
 
G
P
 
M
F
 
F
D
 
N
R
 
R
G
 
L
R
 
E
I
 
L
D
 
H
A
 
D
C
 
A
L
 
I
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
H
A
 
S
L
 
E
G
 
G
L
 
R
A
 
S
L
 
L
G
 
-
F
 
-
P
 
-
L
 
V
L
 
I
V
 
V
R
|
R
V
 
V
A
 
P
E
 
K
A
 
H
T
 
D
P
 
E
P
 
V
A
 
S
L
 
L
M
 
S
Q
 
T
A
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
I
P
 
P
H
 
H
V
 
V
D
 
E
S
 
T
A
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
V
A
 
R
R
 
E
I
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
E
C
 
M
R
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
P
-
 
I
G
 
G
G
 
R
R
 
R
G
 
S
F
 
F
A
 
S
G
 
P
S
 
W
T
 
T
R
 
F
S
 
S
A
 
P
G
 
G
Y
 
I
G
 
A
T
 
D
R
 
A
G
 
S
M
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
P
G
 
Y
D
 
N
V
 
V
L
 
A
S
 
T
D
 
S
G
 
N
P
 
N
K
 
H
P
 
V
L
 
C
V
 
I
I
 
I
A
 
P
Q
|
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
S
P
 
V
E
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
E
A
 
N
C
 
V
E
 
D
G
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
M
P
 
P
G
 
E
V
 
I
D
 
H
G
 
G
I
 
L
F
 
M
L
 
F
G
|
G
P
|
P
A
x
G
D
|
D
L
 
Y
S
 
M
V
 
I
S
 
D
H
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
Q
 
-
T
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
A
A
 
G
I
 
L
D
 
D
R
 
L
V
 
N
G
 
G
A
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
A
A
 
L
S
 
S
G
 
G
K
 
V
P
 
P
Y
 
H
M
 
P
T
 
T
F
 
F
T
 
V
P
 
E
D
 
A
V
 
M
E
 
T
K
 
K
-
 
F
A
 
S
A
 
T
A
 
A
W
 
A
R
 
Q
A
 
R
H
 
N
G
 
G
F
 
V
S
 
P
V
 
I
F
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
L
F
 
S
V
 
V
A
 
D
S
 
M
E
 
V
H
 
P
A
 
S
W
 
L
M
 
I
L
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
V
G
 
Q
I
 
F
K
 
D
A
 
V
L
 
W
G
 
G

4b5vA Crystal structures of divalent metal dependent pyruvate aldolase, hpai, in complex with 4-hydroxyl-2-ketoheptane-1,7-dioate (see paper)
31% identity, 81% coverage: 2:204/251 of query aligns to 3:207/251 of 4b5vA

query
sites
4b5vA
D
 
N
D
 
S
F
 
F
R
 
K
T
 
A
R
 
A
M
 
L
L
 
K
A
 
A
G
 
G
E
 
R
M
 
P
L
 
Q
A
 
I
G
 
G
T
 
L
F
 
W
V
 
L
K
 
G
T
 
L
P
 
S
A
 
S
I
 
S
E
 
Y
M
 
S
V
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
G
S
 
A
G
 
G
L
 
F
D
 
D
F
 
W
A
 
L
C
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
H
|
H
A
 
A
P
 
P
F
 
N
D
 
N
R
 
V
G
 
Q
R
 
T
I
 
V
D
 
L
A
 
T
C
 
Q
L
 
L
A
 
Q
L
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
P
F
 
S
P
 
Q
L
 
P
L
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
A
 
S
E
 
W
A
 
N
T
 
D
P
 
P
P
 
V
A
 
Q
L
 
I
M
 
K
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
V
G
 
G
A
 
T
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
V
 
V
P
 
P
H
 
M
V
 
V
D
 
Q
S
 
N
A
 
A
A
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
E
I
 
A
A
 
V
K
 
R
A
 
A
C
 
T
R
 
R
Y
 
Y
G
 
P
H
 
P
G
 
A
G
 
G
-
 
I
R
 
R
G
 
G
F
 
V
A
 
G
G
 
S
S
 
A
T
 
L
R
 
A
S
 
R
A
 
A
G
 
S
Y
 
R
G
 
W
T
 
N
R
 
R
G
 
-
M
 
I
G
 
P
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
S
 
Q
D
 
K
G
 
A
P
 
N
K
 
D
P
 
Q
L
 
M
-
 
C
V
 
V
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
T
P
 
R
E
 
E
G
 
A
V
 
M
D
 
K
A
 
N
C
 
L
E
 
P
G
 
Q
I
 
I
A
 
L
A
 
D
T
 
V
P
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
V
F
|
F
L
 
I
G
|
G
P
|
P
A
|
A
D
|
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
S
 
D
H
 
M
G
 
G
K
 
Y
M
 
A
-
 
G
D
 
N
Q
 
P
T
 
Q
S
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
V
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
E
R
 
Q
V
 
A
G
 
I
A
 
V
A
 
Q
C
 
I
A
 
R
A
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3609200 Dshi_2586 HpcH/HpaI aldolase (RefSeq)
MDDFRTRMLAGEMLAGTFVKTPAIEMVEVLALSGLDFACLDAEHAPFDRGRIDACLALGL
ALGFPLLVRVAEATPPALMQALDAGAAGVVVPHVDSAAAAARIAKACRYGHGGRGFAGST
RSAGYGTRGMGDVLSDGPKPLVIAQIEDPEGVDACEGIAATPGVDGIFLGPADLSVSHGK
MDQTSPELMAAIDRVGAACAASGKPYMTFTPDVEKAAAWRAHGFSVFFVASEHAWMLQGA
RAVAKGIKALG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory