SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609413 Dshi_2797 PfkB domain protein (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
54% identity, 99% coverage: 1:306/308 of query aligns to 7:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
M
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
C
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
E
L
 
T
P
 
T
D
 
G
G
 
G
T
 
E
A
 
T
G
 
A
F
 
F
A
 
Q
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
P
V
 
T
G
 
G
L
 
F
V
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
I
S
 
S
R
 
S
D
 
D
L
 
F
F
 
F
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
L
M
 
R
T
 
D
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
S
D
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
Y
D
 
S
M
 
F
A
 
A
V
 
A
L
 
I
S
 
S
D
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
R
L
 
L
T
 
V
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
N
 
N
T
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
M
L
 
L
A
 
S
P
 
R
A
 
N
D
 
D
M
 
M
P
 
P
D
 
Y
P
 
V
G
 
D
P
 
E
E
 
T
V
 
I
G
 
S
T
 
A
L
 
M
F
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
C
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
I
V
 
S
E
 
E
P
 
P
C
 
C
A
 
G
A
 
S
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
A
 
T
L
 
L
C
 
L
L
 
A
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
P
G
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
M
M
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
R
P
 
A
G
 
N
F
 
L
I
 
I
K
 
T
D
 
V
E
 
R
T
 
K
T
 
T
F
 
H
R
 
L
A
 
T
R
 
R
I
 
M
D
 
K
R
 
R
M
 
M
L
 
I
A
 
A
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
D
W
 
W
L
 
F
M
 
G
G
 
E
P
 
K
G
 
G
D
 
S
L
 
H
A
 
D
E
 
E
S
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
W
R
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
G
P
 
P
A
 
K
V
 
L
V
 
V
C
 
V
V
 
I
T
|
T
R
 
K
G
|
G
G
x
A
A
 
H
G
|
G
V
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
A
 
N
T
 
H
G
 
A
I
 
T
T
 
V
H
 
P
V
 
V
A
 
P
A
 
G
E
 
V
A
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
x
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
H
E
 
S
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
T
K
 
K
D
 
D
R
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
N
L
 
L
D
 
S
A
 
E
P
 
D
V
 
Q
L
 
I
T
 
H
S
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
A
L
 
L
G
 
G
A
x
V
Q
 
R
A
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
P
 
P
P
 
P
W
 
W
R
 
A
D
 
H
E
 
E
L
 
M

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:298/308 of query aligns to 5:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
L
 
L
C
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
I
L
 
V
P
 
D
R
 
G
A
 
P
L
 
D
P
 
P
D
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
P
 
E
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
P
F
 
L
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
R
D
 
D
V
 
V
G
 
D
L
 
L
V
 
L
T
 
T
G
 
H
L
 
I
S
 
G
R
|
R
D
 
D
L
 
A
F
 
R
G
 
G
E
 
R
V
 
R
L
 
I
M
 
A
T
 
E
A
 
Y
L
 
I
A
 
E
A
 
S
A
 
S
D
 
G
V
 
V
D
 
Q
-
 
L
S
 
V
D
x
S
M
x
G
A
 
S
V
 
Q
L
 
T
S
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
T
T
 
P
T
 
T
L
 
A
A
 
T
F
 
A
V
 
R
T
 
T
L
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
Y
 
D
D
 
L
E
 
E
N
 
W
T
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
Q
M
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
T
G
 
P
P
 
P
E
 
V
V
 
A
G
 
P
T
 
P
L
 
L
F
 
L
F
 
V
-
 
H
-
 
T
G
 
G
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
R
E
 
E
P
 
P
C
 
G
A
 
C
A
 
L
A
 
A
Y
 
V
E
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
L
L
 
D
K
 
A
A
 
Y
A
 
R
A
 
A
G
 
A
R
 
A
V
 
T
V
 
V
M
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
V
R
 
R
P
 
P
G
 
S
F
 
L
I
 
S
K
 
A
D
 
D
E
 
P
T
 
D
T
 
L
F
 
T
R
 
R
A
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
Q
R
 
R
M
 
L
L
 
V
A
 
E
V
 
R
T
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
H
W
 
W
L
 
I
M
 
D
G
 
P
P
 
T
G
 
Q
D
 
P
L
 
P
A
 
E
E
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
R
A
 
A
L
 
W
R
 
L
A
 
A
R
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
I
V
 
V
C
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
G
 
D
A
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
V
A
 
A
H
 
F
T
 
C
A
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
P
T
 
A
H
 
S
V
 
V
A
 
P
A
 
A
E
 
Q
A
 
-
V
 
-
E
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
T
L
 
L
A
 
W
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
G
K
 
A
D
 
D
R
 
R
-
 
R
-
 
T
-
 
E
L
 
L
R
 
R
A
 
K
L
 
I
D
 
G
A
 
V
P
 
S
V
 
A
L
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
E
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
34% identity, 96% coverage: 2:298/308 of query aligns to 5:303/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
A
R
 
Q
A
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
R
G
 
A
T
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
L
P
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
A
V
 
V
G
 
Q
L
 
F
V
 
V
T
 
G
G
 
M
L
 
L
S
 
G
R
 
S
D
 
D
L
 
M
F
 
F
G
 
G
E
 
D
V
 
F
L
 
L
M
 
F
T
 
D
A
 
S
L
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
D
 
G
V
 
V
D
 
V
S
 
T
D
 
D
M
 
G
A
 
I
V
 
V
-
 
R
L
 
T
S
 
S
D
 
T
R
 
A
P
 
K
T
 
T
T
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
A
L
 
L
T
 
-
D
 
D
G
 
G
H
 
E
A
 
R
Q
 
S
Y
 
F
A
 
S
F
 
F
Y
 
Y
D
 
R
E
 
P
N
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
L
M
 
L
L
 
F
A
 
R
P
 
V
A
 
E
D
 
H
M
 
F
P
 
Q
D
 
D
P
 
A
G
 
S
P
 
F
E
 
S
V
 
D
G
 
A
T
 
L
L
 
I
F
 
F
F
 
H
G
 
A
G
 
C
I
 
S
S
 
N
L
 
S
A
 
M
V
 
T
E
 
D
P
 
A
C
 
D
A
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
V
A
 
T
Y
 
F
E
 
E
A
 
G
L
 
M
C
 
R
L
 
R
K
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
A
V
 
I
V
 
V
M
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
I
 
F
R
 
R
P
 
P
G
 
M
F
 
L
I
 
W
K
 
P
D
 
N
E
 
G
T
 
E
T
 
N
F
 
P
R
 
A
A
 
S
R
 
R
I
 
L
D
 
W
R
 
K
M
 
G
L
 
L
A
 
S
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
D
W
 
Y
L
 
L
M
 
-
G
 
-
P
 
A
G
 
N
D
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
N
A
 
A
L
 
V
R
 
I
A
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
W
R
 
Q
G
 
G
P
 
R
A
 
A
V
 
Q
V
 
L
C
 
L
V
 
L
T
 
V
R
x
T
G
x
D
G
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
P
V
 
V
E
 
H
A
 
W
H
 
Y
T
 
T
A
 
R
T
 
T
G
 
A
I
 
G
T
 
G
H
 
E
V
 
V
A
 
P
A
x
T
E
 
F
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
V
 
Q
D
 
D
T
 
S
V
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
L
A
 
Y
G
 
T
L
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
Q
K
 
F
D
 
D
R
 
D
L
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
H
D
 
D
A
 
P
P
 
E
V
 
S
L
 
I
T
 
V
S
 
S
A
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
F
G
 
A
A
|
A
Q
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
I
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
28% identity, 85% coverage: 2:262/308 of query aligns to 4:262/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
I
 
V
L
 
W
C
 
L
A
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
M
 
L
L
 
I
P
 
P
R
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
A
 
Q
G
 
H
F
 
Y
A
 
L
P
 
K
V
 
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
P
F
 
A
N
|
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
G
D
 
R
V
 
S
G
 
A
L
 
F
V
 
F
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
F
L
 
M
M
 
Q
T
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
D
A
 
E
D
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
C
D
 
Q
M
 
H
A
 
L
V
 
H
L
 
F
S
 
D
D
 
P
R
 
V
P
 
H
T
 
R
T
 
T
L
 
S
A
 
T
F
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
D
T
 
L
D
 
D
G
 
E
H
|
H
A
 
G
Q
 
E
-
 
R
-
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
|
F
Y
 
M
D
 
V
E
 
K
N
 
P
T
 
S
A
 
A
G
 
D
R
 
Q
M
 
F
L
 
L
A
 
Q
P
 
L
A
 
S
D
 
D
M
 
I
P
 
P
D
 
S
P
 
-
G
 
F
P
 
Q
E
 
K
V
 
G
G
 
E
T
 
W
L
 
L
F
 
H
F
 
V
G
 
C
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
N
E
 
Q
P
 
P
C
 
S
-
 
R
A
 
S
A
 
S
A
 
T
Y
 
F
E
 
A
A
 
A
L
 
I
C
 
A
L
 
Q
K
 
M
A
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
G
V
 
Y
V
 
V
M
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
E
G
 
E
F
 
V
I
 
W
K
 
S
D
 
E
E
 
P
T
 
Q
T
 
E
F
 
L
R
 
Q
A
 
A
R
 
T
I
 
V
D
 
M
R
 
R
M
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
Q
W
 
F
L
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
T
G
 
Q
D
 
S
L
 
I
A
 
E
E
 
E
S
 
G
A
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
D
R
 
F
G
 
Q
P
 
I
A
 
P
V
 
L
V
 
V
C
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
A
A
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
L
A
 
V
H
 
A
T
 
T
A
 
P
T
 
N
G
 
S
I
 
Q
T
 
Q
H
 
I
V
 
V
A
 
S
A
 
G
E
 
K
A
|
A
V
|
V
E
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:306/308 of query aligns to 11:303/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
M
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
E
G
 
K
T
 
Q
A
 
N
G
 
S
F
 
Y
A
 
L
P
 
K
V
 
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
S
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
F
V
 
I
T
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
D
F
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
F
L
 
L
M
 
R
T
 
Q
A
 
V
L
 
F
A
 
Q
A
 
D
A
 
N
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
V
D
 
T
M
 
F
A
 
L
V
 
R
L
 
L
-
 
D
S
 
A
D
 
D
R
 
L
P
 
T
T
 
S
T
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
N
L
 
L
T
 
T
-
 
A
D
 
D
G
 
G
H
 
E
A
 
R
Q
 
S
Y
 
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
D
 
V
E
 
H
N
 
P
T
 
G
A
 
A
G
 
D
R
 
T
M
 
Y
L
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
M
 
L
P
 
P
D
 
-
P
 
P
G
 
F
P
 
R
E
 
Q
V
 
Y
G
 
E
T
 
W
L
 
F
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
D
E
 
R
P
 
P
C
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
-
C
 
C
L
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
M
-
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
Y
V
 
V
M
 
L
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
S
G
 
K
F
 
M
I
 
W
K
 
G
D
 
N
E
 
T
T
 
D
T
 
E
F
 
I
R
 
P
A
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
A
R
 
R
M
 
S
L
x
A
A
|
A
V
 
L
T
x
A
D
 
S
I
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
C
W
 
Q
L
 
L
M
 
S
G
 
G
P
 
A
G
 
S
D
 
H
L
 
W
A
 
Q
E
 
D
S
 
A
A
 
R
A
 
Y
A
 
Y
L
 
L
R
 
R
A
 
D
R
 
L
G
|
G
P
 
C
A
 
D
V
 
T
V
 
T
C
 
I
V
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
A
E
 
L
A
 
L
H
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
E
G
 
G
I
 
E
T
 
F
H
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
A
E
 
P
A
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
A
G
 
N
A
 
C
L
 
W
D
 
D
K
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
N
A
 
A
L
 
N
R
 
A
L
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
A
 
-
A
 
-
A
|
A
I
 
V
T
 
T
V
x
A
S
 
K
R
x
G
A
 
A
G
 
M
A
 
T
N
 
A
P
 
L
P
 
P
W
 
F
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
L
 
L

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
33% identity, 99% coverage: 2:306/308 of query aligns to 4:297/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
I
 
V
L
 
V
C
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
A
M
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
Q
A
 
E
L
 
-
P
 
P
D
 
G
G
 
H
T
 
L
A
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
F
 
L
A
 
E
P
 
V
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
E
F
 
V
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
V
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
A
V
 
M
L
 
V
M
 
E
T
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
L
D
 
T
M
 
H
A
 
F
V
 
R
L
 
R
S
 
A
D
 
P
R
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
V
 
R
T
 
E
-
 
Y
L
 
L
T
 
P
D
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
Q
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
D
 
R
E
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
S
M
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
A
M
 
F
-
 
D
P
 
P
D
 
D
P
 
Y
G
 
L
P
 
E
E
 
G
V
 
V
G
 
R
T
 
F
L
 
L
F
 
H
F
 
L
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
A
 
A
V
 
L
E
 
S
P
 
P
C
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
S
A
 
L
L
 
W
C
 
A
L
 
M
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
V
V
 
R
V
 
V
M
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
 
R
P
 
Q
G
 
T
F
 
L
I
 
W
K
 
S
D
 
P
E
 
E
T
 
E
T
 
A
F
 
-
R
 
R
A
 
G
R
 
F
I
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
P
V
 
G
T
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
E
W
 
L
L
 
L
M
 
F
G
 
G
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
R
S
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
S
P
 
A
A
 
P
V
 
E
V
 
V
C
 
V
V
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
G
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
W
A
 
A
H
 
F
T
 
V
A
 
D
T
 
G
G
 
R
I
 
R
T
 
V
H
 
E
V
 
G
A
 
S
A
|
A
E
x
F
A
 
A
V
|
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
-
A
 
A
E
 
V
A
 
W
G
 
G
A
 
L
L
 
P
D
 
V
K
 
E
D
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
L
L
 
A
D
x
N
A
 
L
P
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
A
|
A
Q
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
S
T
 
R
V
 
G
S
 
D
R
 
H
A
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
P
W
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
L

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
33% identity, 99% coverage: 2:306/308 of query aligns to 4:297/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
I
 
V
L
 
V
C
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
A
M
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
Q
A
 
E
L
 
-
P
 
P
D
 
G
G
 
H
T
 
L
A
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
F
 
L
A
 
E
P
 
V
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
x
E
F
x
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
V
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
A
V
 
M
L
 
V
M
 
E
T
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
L
D
 
T
M
 
H
A
 
F
V
 
R
L
 
R
S
 
A
D
 
P
R
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
V
 
R
T
 
E
-
 
Y
L
 
L
T
 
P
D
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
Q
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
x
Y
Y
|
Y
D
x
R
E
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
S
M
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
A
M
 
F
-
 
D
P
 
P
D
 
D
P
 
Y
G
 
L
P
 
E
E
 
G
V
 
V
G
 
R
T
 
F
L
 
L
F
 
H
F
 
L
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
A
 
A
V
 
L
E
 
S
P
 
P
C
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
S
A
 
L
L
 
W
C
 
A
L
 
M
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
V
V
 
R
V
 
V
M
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
|
R
P
 
Q
G
 
T
F
 
L
I
 
W
K
 
S
D
 
P
E
 
E
T
 
E
T
 
A
F
 
-
R
 
R
A
 
G
R
 
F
I
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
P
V
 
G
T
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
E
W
 
L
L
 
L
M
 
F
G
 
G
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
R
S
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
S
P
 
A
A
 
P
V
 
E
V
 
V
C
 
V
V
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
G
x
A
A
x
K
G
|
G
V
x
A
E
 
W
A
 
A
H
 
F
T
 
V
A
 
D
T
 
G
G
 
R
I
 
R
T
 
V
H
 
E
V
 
G
A
 
S
A
 
A
E
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
-
A
 
A
E
 
V
A
 
W
G
 
G
A
 
L
L
 
P
D
 
V
K
 
E
D
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
L
L
 
A
D
x
N
A
 
L
P
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
S
T
 
R
V
 
G
S
x
D
R
 
H
A
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
P
W
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
L

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
33% identity, 99% coverage: 2:306/308 of query aligns to 4:297/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
I
 
V
L
 
V
C
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
|
L
I
 
V
D
 
A
M
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
Q
A
 
E
L
 
-
P
 
P
D
 
G
G
 
H
T
 
L
A
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
F
 
L
A
 
E
P
 
V
V
 
Y
A
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
E
F
 
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
V
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
E
F
 
L
G
 
G
E
 
A
V
 
M
L
 
V
M
 
E
T
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
L
D
 
T
M
 
H
A
 
F
V
 
R
L
 
R
S
 
A
D
 
P
R
 
G
P
 
F
T
 
T
T
 
G
L
 
L
A
x
Y
F
 
L
V
 
R
T
 
E
-
 
Y
L
 
L
T
 
P
D
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
Q
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
D
x
R
E
 
K
N
 
G
T
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
S
M
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
A
M
 
F
-
 
D
P
 
P
D
 
D
P
 
Y
G
 
L
P
 
E
E
 
G
V
 
V
G
 
R
T
 
F
L
 
L
F
 
H
F
 
L
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
A
 
A
V
 
L
E
 
S
P
 
P
C
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
S
A
 
L
L
 
W
C
 
A
L
 
M
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
V
V
 
R
V
 
V
M
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
Y
R
|
R
P
 
Q
G
 
T
F
 
L
I
 
W
K
 
S
D
 
P
E
 
E
T
 
E
T
 
A
F
 
-
R
 
R
A
 
G
R
 
F
I
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
A
L
 
L
A
 
P
V
 
G
T
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
A
 
E
W
 
L
L
 
L
M
 
F
G
 
G
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
R
S
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
S
P
 
A
A
 
P
V
 
E
V
 
V
C
 
V
V
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
G
x
A
A
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
W
A
 
A
H
 
F
T
 
V
A
 
D
T
 
G
G
 
R
I
 
R
T
 
V
H
 
E
V
 
G
A
 
S
A
 
A
E
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
-
A
 
A
E
 
V
A
 
W
G
 
G
A
 
L
L
 
P
D
 
V
K
 
E
D
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
L
L
 
A
D
x
N
A
 
L
P
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
A
|
A
Q
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
S
T
 
R
V
 
G
S
x
D
R
 
H
A
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
P
W
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
L

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
28% identity, 85% coverage: 2:262/308 of query aligns to 8:266/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
I
 
V
L
 
W
C
 
L
A
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
M
 
L
L
 
I
P
 
P
R
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
A
 
Q
G
 
H
F
 
Y
A
 
L
P
 
K
V
 
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
A
 
G
D
 
R
V
 
S
G
 
A
L
 
F
V
 
F
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
R
V
 
F
L
 
M
M
 
Q
T
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
T
A
 
D
A
 
E
D
 
Q
V
 
V
D
 
D
S
 
C
D
 
Q
M
 
H
A
 
L
V
 
H
L
 
F
S
 
D
D
 
P
R
 
V
P
 
H
T
 
R
T
 
T
L
 
S
A
 
T
F
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
D
T
 
L
D
 
D
-
 
E
-
 
C
G
 
G
H
 
E
A
 
R
Q
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
|
F
Y
 
M
D
 
V
E
 
K
N
 
P
T
 
S
A
 
A
G
 
D
R
 
Q
M
 
F
L
 
L
A
 
Q
P
 
L
A
 
S
D
 
D
M
 
I
P
 
P
D
 
S
P
 
-
G
 
F
P
 
Q
E
 
K
V
 
G
G
 
E
T
 
W
L
 
L
F
 
H
F
 
V
G
 
C
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
N
E
 
Q
P
 
P
C
 
S
-
 
R
A
 
S
A
 
S
A
 
T
Y
 
F
E
 
A
A
 
A
L
 
I
C
 
A
L
 
Q
K
 
M
A
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
G
V
 
Y
V
 
V
M
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
E
G
 
E
F
 
V
I
 
W
K
 
S
D
 
E
E
 
P
T
 
Q
T
 
E
F
 
L
R
 
Q
A
 
A
R
 
T
I
 
V
D
 
M
R
 
R
M
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
K
|
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
Q
W
 
F
L
 
L
M
 
T
G
 
G
P
 
T
G
 
Q
D
 
S
L
 
I
A
 
E
E
 
E
S
 
G
A
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
A
A
 
D
R
 
F
G
 
Q
P
 
I
A
 
P
V
 
L
V
 
V
C
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
A
E
 
L
A
 
V
H
 
A
T
 
T
A
 
P
T
 
N
G
 
S
I
 
Q
T
 
Q
H
 
I
V
 
V
A
 
S
A
 
G
E
 
K
A
|
A
V
|
V
E
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
Y
G
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
26% identity, 84% coverage: 1:259/308 of query aligns to 2:256/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
M
 
L
I
 
I
L
 
A
C
 
S
A
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
L
L
 
I
P
 
-
R
 
-
A
 
S
L
 
V
P
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
D
A
 
L
G
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
F
 
F
A
 
E
P
 
K
V
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
S
G
 
S
L
 
L
V
 
I
T
 
S
G
 
K
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
M
 
I
T
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
S
A
 
K
A
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
T
D
 
R
M
 
G
A
 
I
V
 
V
L
 
K
S
 
D
D
 
E
R
 
K
P
 
K
T
 
H
T
 
T
-
 
G
L
 
I
A
 
V
F
 
F
V
 
V
T
 
Q
L
 
L
T
 
K
D
 
G
G
 
A
H
 
S
A
 
P
Q
 
S
Y
 
F
A
 
L
F
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
D
N
 
V
T
 
A
A
 
Y
G
 
F
R
 
N
M
 
M
L
 
T
A
 
L
P
 
N
A
 
D
D
 
I
M
 
N
P
 
W
D
 
D
P
 
I
G
 
V
P
 
E
E
 
E
V
 
A
G
 
K
T
 
I
L
 
V
F
 
N
F
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
R
E
 
N
P
 
P
C
 
S
A
 
R
A
 
E
A
 
T
Y
 
V
E
 
M
A
 
K
L
 
V
C
 
I
L
 
K
K
 
K
A
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
S
R
 
S
V
 
L
V
 
I
M
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
 
R
P
 
L
G
 
D
F
 
L
I
 
W
K
 
R
-
 
G
D
 
Q
E
 
E
T
 
E
T
 
E
F
 
M
R
 
I
A
 
K
R
 
V
I
 
L
D
 
E
R
 
E
M
 
S
L
 
I
A
 
K
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
E
G
 
N
P
 
Q
G
 
G
D
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
V
R
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
G
P
 
S
A
 
M
V
 
L
V
 
T
C
 
A
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
F
E
 
R
A
 
L
H
 
I
T
 
K
A
 
N
T
 
E
G
 
T
I
 
V
T
 
V
H
 
D
V
 
V
A
 
P
A
 
S
E
 
Y
A
 
N
V
|
V
E
 
N
V
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
26% identity, 84% coverage: 1:259/308 of query aligns to 1:255/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
M
 
L
I
 
I
L
 
A
C
 
S
A
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
L
L
 
I
P
 
-
R
 
-
A
 
S
L
 
V
P
 
E
D
 
E
G
 
G
T
 
D
A
 
L
G
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
F
 
F
A
 
E
P
 
K
V
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
V
 
S
G
 
S
L
 
L
V
 
I
T
 
S
G
 
K
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
M
 
I
T
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
S
A
 
K
A
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
T
D
 
R
M
 
G
A
 
I
V
 
V
L
 
K
S
 
D
D
 
E
R
 
K
P
 
K
T
 
H
T
 
T
-
 
G
L
 
I
A
 
V
F
 
F
V
 
V
T
 
Q
L
 
L
T
 
K
D
 
G
G
 
A
H
 
S
A
 
P
Q
 
S
Y
 
F
A
 
L
F
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
D
N
 
V
T
 
A
A
 
Y
G
 
F
R
 
N
M
 
M
L
 
T
A
 
L
P
 
N
A
 
D
D
 
I
M
 
N
P
 
W
D
 
D
P
 
I
G
 
V
P
 
E
E
 
E
V
 
A
G
 
K
T
 
I
L
 
V
F
 
N
F
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
R
E
 
N
P
 
P
C
 
S
A
 
R
A
 
E
A
 
T
Y
 
V
E
 
M
A
 
K
L
 
V
C
 
I
L
 
K
K
 
K
A
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
S
R
 
S
V
 
L
V
 
I
M
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
 
R
P
 
L
G
 
D
F
 
L
I
 
W
K
 
R
-
 
G
D
 
Q
E
 
E
T
 
E
T
 
E
F
 
M
R
 
I
A
 
K
R
 
V
I
 
L
D
 
E
R
 
E
M
 
S
L
 
I
A
 
K
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
L
W
 
Y
L
 
L
M
 
E
G
 
N
P
 
Q
G
 
G
D
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
V
R
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
G
P
 
S
A
 
M
V
 
L
V
 
T
C
 
A
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
 
P
A
 
K
G
 
G
V
 
F
E
 
R
A
 
L
H
 
I
T
 
K
A
 
N
T
 
E
G
 
T
I
 
V
T
 
V
H
 
D
V
 
V
A
 
P
A
 
S
E
 
Y
A
 
N
V
|
V
E
 
N
V
x
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
29% identity, 98% coverage: 6:306/308 of query aligns to 7:292/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
I
 
V
D
|
D
M
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
E
G
 
K
T
 
Q
A
 
N
G
 
S
F
 
Y
A
 
L
P
 
K
V
x
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
S
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
F
V
 
I
T
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
D
F
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
F
L
 
L
M
 
R
T
 
Q
A
 
V
L
 
F
A
 
Q
A
 
D
A
 
N
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
V
D
 
T
M
 
F
A
 
L
V
 
R
L
 
L
S
 
D
D
 
A
R
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
S
L
 
A
A
 
V
F
x
L
V
 
I
T
 
V
L
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
N
Q
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
D
 
V
E
 
H
N
 
P
T
 
G
A
 
A
G
 
D
R
 
T
M
 
Y
L
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
M
 
L
P
 
P
D
 
-
P
 
P
G
 
F
P
 
R
E
 
Q
V
 
Y
G
 
E
T
 
W
L
 
F
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
D
E
 
R
P
 
P
C
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
-
C
 
C
L
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
M
-
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
Y
V
 
V
M
 
L
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
I
 
L
R
|
R
P
 
S
G
 
K
F
x
M
I
 
W
K
 
G
D
 
N
E
 
T
T
 
D
T
 
E
F
 
I
R
 
P
A
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
A
R
 
R
M
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
L
T
 
A
D
 
S
I
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
C
W
 
Q
L
 
L
M
 
S
G
 
G
P
 
A
G
 
S
D
 
H
L
 
W
A
 
Q
E
 
D
S
 
A
A
 
R
A
 
Y
A
 
Y
L
 
L
R
 
R
A
 
D
R
 
L
G
 
G
P
 
C
A
 
D
V
 
T
V
 
T
C
 
I
V
 
I
T
 
S
R
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
A
E
 
L
A
 
L
H
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
E
G
 
G
I
 
E
T
 
F
H
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
A
E
 
P
A
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
A
G
 
N
A
 
C
L
 
W
D
 
D
K
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
N
A
 
A
L
 
N
R
 
A
L
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
A
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
A
S
 
K
R
 
G
A
 
A
G
 
M
A
 
T
N
 
A
P
 
L
P
 
P
W
 
F
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
L
 
L

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
29% identity, 98% coverage: 6:306/308 of query aligns to 7:292/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
M
 
L
L
 
V
P
 
P
R
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
E
G
 
K
T
 
Q
A
 
N
G
 
S
F
 
Y
A
 
L
P
 
K
V
x
C
A
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
S
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
V
 
C
G
 
G
L
 
F
V
 
I
T
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
D
F
 
A
G
 
G
E
 
R
V
 
F
L
 
L
M
 
R
T
 
Q
A
 
V
L
 
F
A
 
Q
A
 
D
A
 
N
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
V
D
 
T
M
 
F
A
 
L
V
 
R
L
 
L
S
 
D
D
 
A
R
 
D
P
 
L
T
 
T
T
 
S
L
 
A
A
 
V
F
 
L
V
 
I
T
 
V
L
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
N
Q
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
D
 
V
E
 
H
N
 
P
T
 
G
A
 
A
G
 
D
R
 
T
M
 
Y
L
 
V
A
 
S
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
M
 
L
P
 
P
D
 
-
P
 
P
G
 
F
P
 
R
E
 
Q
V
 
Y
G
 
E
T
 
W
L
 
F
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
T
V
 
D
E
 
R
P
 
P
C
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
-
C
 
C
L
 
L
K
 
E
A
 
G
A
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
M
-
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
Y
V
 
V
M
 
L
L
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
I
 
L
R
|
R
P
 
S
G
 
K
F
x
M
I
 
W
K
 
G
D
 
N
E
 
T
T
 
D
T
 
E
F
 
I
R
 
P
A
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
A
R
 
R
M
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
L
T
 
A
D
 
S
I
 
I
V
 
C
K
|
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
A
 
C
W
 
Q
L
 
L
M
 
S
G
 
G
P
 
A
G
 
S
D
 
H
L
 
W
A
 
Q
E
 
D
S
 
A
A
 
R
A
 
Y
A
 
Y
L
 
L
R
 
R
A
 
D
R
 
L
G
 
G
P
 
C
A
 
D
V
 
T
V
 
T
C
 
I
V
 
I
T
x
S
R
 
L
G
|
G
G
x
A
A
 
D
G
|
G
V
 
A
E
 
L
A
 
L
H
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
E
G
 
G
I
 
E
T
 
F
H
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
A
E
 
P
A
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
R
A
 
A
G
 
N
A
 
C
L
 
W
D
 
D
K
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
L
A
 
A
P
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
S
S
 
N
A
 
A
L
x
N
R
 
A
L
 
C
G
|
G
A
|
A
Q
 
M
A
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
A
S
 
K
R
 
G
A
 
A
G
 
M
A
 
T
N
 
A
P
 
L
P
 
P
W
 
F
R
 
P
D
 
D
E
 
Q
L
 
L

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
29% identity, 83% coverage: 2:257/308 of query aligns to 4:263/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
I
 
V
L
 
F
C
 
T
A
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
I
L
 
L
I
 
V
D
 
E
M
 
I
L
 
M
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
Q
P
 
P
R
 
F
A
 
D
L
 
Q
P
 
P
D
 
G
G
 
I
T
 
W
A
 
N
G
 
G
F
 
P
A
 
Y
P
 
P
V
 
S
A
 
G
G
 
A
G
 
P
A
 
A
V
 
I
F
 
F
N
 
I
T
 
D
A
 
Q
V
 
V
A
 
T
L
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
P
V
 
C
G
 
G
L
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
C
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
D
V
 
I
L
 
N
M
 
I
T
 
H
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
D
D
 
G
V
 
V
D
 
D
-
 
I
S
 
R
D
 
G
M
 
I
A
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
P
D
 
L
R
 
E
P
 
A
T
 
T
T
 
G
L
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
T
L
 
Y
T
 
G
D
 
D
G
 
-
H
 
-
A
 
R
Q
 
D
Y
 
F
A
 
I
F
 
F
Y
 
N
D
 
I
E
 
K
N
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
C
R
 
G
M
 
K
L
 
L
A
 
S
P
 
A
A
 
Q
D
 
H
M
 
V
P
 
D
D
 
E
P
 
N
G
 
I
P
 
L
E
 
K
V
 
D
G
 
C
T
 
T
L
 
H
F
 
F
-
 
H
-
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
S
I
 
S
S
 
L
L
 
F
A
 
S
V
 
F
E
 
H
P
 
M
C
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
V
Y
 
K
E
 
K
A
 
A
L
 
V
C
 
T
L
 
I
K
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
R
 
G
V
 
V
V
 
I
M
 
S
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
I
R
 
R
P
 
K
G
 
E
F
 
M
I
 
L
K
 
-
D
 
D
E
 
I
T
 
P
T
 
E
F
 
M
R
 
R
A
 
D
R
 
A
I
 
L
D
 
H
R
 
F
M
 
V
L
 
L
A
 
E
V
 
L
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
Y
K
 
M
V
 
P
S
|
S
D
 
E
E
 
G
D
 
E
L
 
V
A
 
-
W
 
L
L
 
L
M
 
L
G
 
S
P
 
P
G
 
H
D
 
S
L
 
T
A
 
P
E
 
E
S
 
R
A
 
A
-
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
F
R
 
L
A
 
E
R
 
E
G
 
G
P
 
V
A
 
K
V
 
E
V
 
V
C
 
I
V
 
V
T
x
K
R
 
R
G
|
G
G
 
N
A
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
S
A
 
Y
H
 
Y
T
 
S
A
 
A
T
 
N
G
 
E
I
 
Q
T
 
F
H
 
H
V
 
V
A
 
E
A
 
S
E
 
Y
A
 
P
V
 
V
E
 
E
V
x
E
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
C
F
|
F
N
 
G
A
 
G
G
 
A
F
 
W
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
30% identity, 99% coverage: 1:306/308 of query aligns to 1:294/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
M
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
V
G
 
G
E
 
S
A
 
L
L
 
N
I
 
M
D
 
D
M
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
G
G
 
E
T
 
T
A
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
E
G
 
D
F
 
Y
A
 
Q
P
 
T
V
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
K
V
 
G
F
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
V
 
V
G
 
R
L
 
M
V
 
L
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
M
 
K
T
 
S
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
V
D
 
A
M
 
W
A
 
V
V
 
L
L
 
E
S
 
T
D
 
P
R
 
G
P
 
P
T
 
S
T
 
G
L
 
T
A
 
G
F
 
F
V
 
I
T
 
-
L
 
L
T
 
V
D
 
D
G
 
P
H
 
E
A
 
G
Q
 
Q
Y
 
N
A
 
Q
F
 
I
Y
 
A
D
 
V
E
 
A
N
 
P
T
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
A
M
 
R
L
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
P
 
P
D
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
A
T
 
T
L
 
A
F
 
F
-
 
Q
-
 
G
F
 
V
G
 
G
G
 
V
I
 
V
S
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
E
 
E
-
 
I
P
 
P
C
 
L
A
 
E
A
 
T
A
 
V
Y
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
R
A
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
A
V
 
R
V
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
-
P
 
-
N
 
N
I
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
A
F
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
H
A
 
A
R
 
L
I
 
P
D
 
S
R
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
Q
V
 
S
T
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
L
V
 
V
S
x
N
D
 
E
E
 
V
D
 
E
L
 
A
A
 
A
W
 
Q
L
 
L
M
 
T
-
 
E
-
 
A
G
 
S
P
 
P
G
 
P
D
 
R
L
 
T
A
 
P
E
 
E
S
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
G
R
 
R
G
 
A
P
 
P
A
 
Q
V
 
A
V
 
Q
C
 
V
V
 
V
T
 
L
R
x
T
G
 
L
G
|
G
A
|
A
G
 
Q
V
x
G
E
 
A
A
 
V
H
 
W
T
 
S
A
 
G
T
 
T
G
 
E
I
 
E
T
 
S
H
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
A
E
 
F
A
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
|
F
N
 
A
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
G
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
Q
R
 
N
L
 
M
R
 
R
A
 
A
L
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
F
G
 
A
A
x
N
Q
 
A
A
 
A
A
x
G
A
|
A
I
 
L
T
x
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
L
P
 
P
W
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
V

4ebuA Crystal structure of a sugar kinase (target efi-502312) from oceanicola granulosus, with bound amp/adp crystal form i
31% identity, 83% coverage: 2:256/308 of query aligns to 17:273/306 of 4ebuA

query
sites
4ebuA
I
 
I
L
 
L
C
 
S
A
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
C
L
 
M
I
 
A
D
 
E
M
 
L
L
 
A
P
 
P
R
 
A
A
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
-
G
 
G
T
 
T
A
 
Y
-
 
R
-
 
L
G
 
G
F
 
F
A
 
A
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
D
V
 
T
F
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
V
 
W
A
 
Y
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
R
A
 
P
D
 
E
-
 
S
-
 
R
V
 
I
G
 
S
L
 
Y
V
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
I
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
A
F
 
L
G
 
S
E
 
Q
V
 
Q
L
 
M
M
 
R
T
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
G
V
 
I
D
 
D
S
 
G
D
 
G
-
 
G
M
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
I
S
 
P
D
 
G
R
 
R
P
 
T
T
 
V
T
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
T
 
R
D
 
S
G
 
-
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
Y
 
F
A
 
A
F
 
Y
Y
 
W
D
 
R
E
 
G
N
 
Q
T
 
S
A
 
A
G
 
A
R
 
R
M
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
G
A
 
D
D
 
A
M
 
D
P
 
A
D
 
L
P
 
A
G
 
A
P
 
A
E
 
M
V
 
A
G
 
R
-
 
A
-
 
D
T
 
V
L
 
V
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
-
 
L
E
 
D
P
 
Q
C
 
C
A
 
G
A
 
R
A
 
A
-
 
T
-
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
Q
K
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
T
V
 
I
M
 
A
L
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
I
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
R
F
 
L
I
 
W
K
 
A
D
 
G
E
 
T
T
 
G
T
 
E
F
 
M
R
 
T
A
 
E
R
 
T
I
 
I
D
 
M
R
 
Q
M
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
A
K
 
L
V
 
P
S
|
S
D
 
F
E
 
E
D
 
D
-
 
E
L
 
A
A
 
A
W
 
W
L
 
F
M
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
D
L
 
A
A
 
G
E
 
P
S
 
D
A
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
D
R
 
R
-
 
Y
A
 
A
R
 
R
G
 
A
P
 
G
A
 
V
V
 
R
V
 
S
C
 
V
V
 
V
T
 
V
R
x
K
G
 
N
G
|
G
A
 
P
G
 
H
V
 
A
E
 
V
A
 
H
H
 
F
T
 
L
A
 
Q
T
 
D
G
 
G
I
 
R
-
 
R
-
 
G
T
 
R
H
 
V
V
 
P
A
 
V
A
 
P
E
 
P
A
x
V
V
 
A
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
S
F
|
F
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6znxC Ribokinase from thermus species
29% identity, 99% coverage: 1:306/308 of query aligns to 1:259/265 of 6znxC

query
sites
6znxC
M
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
V
A
 
V
G
 
G
E
 
S
A
 
L
L
 
N
I
 
M
D
 
D
M
 
L
L
 
V
P
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
D
F
 
Y
A
 
Q
P
 
T
V
 
H
A
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
K
V
 
G
F
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
V
 
V
G
 
R
L
 
M
V
 
L
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
M
 
K
T
 
S
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
D
S
 
V
D
 
A
M
 
W
A
 
V
V
 
L
L
 
E
S
 
T
D
 
P
R
 
G
P
 
P
T
 
S
T
 
G
L
 
T
A
 
A
F
 
F
V
 
V
T
 
D
L
 
-
T
 
P
D
 
E
G
 
G
H
 
Q
A
 
N
Q
 
Q
Y
 
I
A
 
A
F
 
V
Y
 
A
D
 
P
E
 
G
N
 
A
T
 
N
A
 
A
G
 
-
R
 
-
M
 
R
L
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
D
M
 
L
P
 
P
D
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
A
T
 
T
L
 
A
F
 
F
-
 
Q
-
 
G
F
 
V
G
 
G
G
 
V
I
 
V
S
 
L
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
E
 
E
-
 
I
P
 
P
C
 
L
A
 
E
A
 
T
A
 
V
Y
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
G
A
 
R
A
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
A
V
 
R
V
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
-
P
 
-
N
 
N
I
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
A
F
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
H
A
 
A
R
 
L
I
 
P
D
 
S
R
 
E
M
 
I
L
 
L
A
 
Q
V
 
S
T
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
L
V
 
V
S
x
N
D
 
E
E
 
V
D
 
E
L
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
E
 
A
S
 
Q
A
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
R
R
 
Q
A
 
L
R
 
R
G
 
G
P
 
A
A
 
Q
V
 
V
V
 
V
C
 
L
V
x
L
T
x
G
R
 
A
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
V
V
 
W
E
 
S
A
 
G
H
 
E
T
 
E
A
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
S
H
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
A
E
 
F
A
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
|
F
N
 
A
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
G
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
Q
R
 
N
L
 
M
R
 
R
A
 
A
L
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
F
G
 
A
A
x
N
Q
 
A
A
 
A
A
x
G
A
|
A
I
 
L
T
 
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
 
S
-
 
L
P
 
P
W
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
V

1gqtB Activation of ribokinase by monovalent cations (see paper)
27% identity, 90% coverage: 29:306/308 of query aligns to 40:300/307 of 1gqtB

query
sites
1gqtB
G
 
G
G
|
G
A
 
K
V
 
G
F
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
A
G
 
C
L
 
T
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
S
L
 
V
M
 
R
T
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
D
D
 
N
V
 
I
D
 
D
-
 
I
S
 
T
D
 
P
M
 
V
A
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
K
D
 
G
R
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
G
L
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
I
T
 
-
L
 
F
T
 
V
D
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
G
Q
 
E
Y
 
N
A
 
V
F
 
I
Y
 
G
D
 
I
E
 
H
N
 
A
T
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
L
M
 
V
P
 
E
D
 
A
P
 
Q
G
 
R
P
 
E
E
 
R
V
 
I
G
 
A
T
 
N
L
 
A
F
 
-
F
 
-
G
 
S
G
 
A
I
 
L
S
 
L
L
 
M
A
 
Q
V
 
L
E
|
E
-
 
S
P
 
P
C
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
V
Y
 
M
E
 
A
A
 
A
L
 
A
C
 
K
L
 
I
K
 
A
A
 
H
A
 
Q
A
 
N
G
 
K
R
 
T
V
 
I
V
 
V
M
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
A
T
 
P
F
 
A
R
 
R
A
 
E
R
 
L
I
 
P
D
 
D
R
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
T
V
 
P
S
x
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
A
 
E
W
 
K
L
 
L
M
 
T
G
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
N
P
 
D
G
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
E
R
 
K
G
 
G
P
 
I
A
 
R
V
 
T
V
 
V
C
 
L
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
S
A
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
W
A
 
A
H
 
S
T
 
V
A
 
N
T
 
G
G
 
E
I
 
G
T
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
P
A
 
G
E
 
F
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
T
G
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
E
A
 
E
P
 
K
V
 
P
L
 
L
T
 
P
S
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
F
G
 
A
A
x
H
Q
 
A
A
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
I
T
x
A
V
 
V
S
 
T
R
|
R
A
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
V
P
 
P
W
 
W
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P0A9J6 Ribokinase; RK; EC 2.7.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
27% identity, 90% coverage: 29:306/308 of query aligns to 41:301/309 of P0A9J6

query
sites
P0A9J6
G
 
G
G
|
G
A
x
K
V
x
G
F
x
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
A
G
 
C
L
 
T
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
S
L
 
V
M
 
R
T
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
D
D
 
N
V
 
I
D
 
D
-
 
I
S
 
T
D
 
P
M
 
V
A
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
K
D
 
G
R
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
G
L
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
I
T
 
-
L
 
F
T
 
V
D
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
G
Q
 
E
Y
 
N
A
 
V
F
 
I
Y
 
G
D
 
I
E
 
H
N
 
A
T
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
L
M
 
V
P
 
E
D
 
A
P
 
Q
G
 
R
P
 
E
E
 
R
V
 
I
G
 
A
T
 
N
L
 
A
F
 
-
F
 
-
G
 
S
G
 
A
I
 
L
S
 
L
L
 
M
A
 
Q
V
 
L
E
|
E
-
 
S
P
 
P
C
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
V
Y
 
M
E
 
A
A
 
A
L
 
A
C
 
K
L
 
I
K
 
A
A
 
H
A
 
Q
A
 
N
G
 
K
R
 
T
V
 
I
V
 
V
M
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
A
T
 
P
F
 
A
R
 
R
A
 
E
R
 
L
I
 
P
D
 
D
R
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
T
V
 
P
S
x
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
A
 
E
W
 
K
L
 
L
M
 
T
G
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
N
P
 
D
G
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
E
R
 
K
G
 
G
P
 
I
A
 
R
V
 
T
V
 
V
C
 
L
V
 
I
T
|
T
R
x
L
G
|
G
G
x
S
A
x
R
G
|
G
V
 
V
E
 
W
A
 
A
H
 
S
T
 
V
A
 
N
T
 
G
G
 
E
I
 
G
T
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
P
A
 
G
E
 
F
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
I
G
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
T
G
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
E
A
 
E
P
 
K
V
 
P
L
 
L
T
 
P
S
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
F
G
 
A
A
x
H
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
 
S
-
 
V
P
 
P
W
 
W
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1rk2A E. Coli ribokinase complexed with ribose and adp, solved in space group p212121 (see paper)
27% identity, 90% coverage: 29:306/308 of query aligns to 38:298/305 of 1rk2A

query
sites
1rk2A
G
|
G
G
|
G
A
x
K
V
 
G
F
 
A
N
|
N
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
A
L
 
F
V
 
I
T
 
A
G
 
C
L
 
T
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
S
L
 
V
M
 
R
T
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
D
D
 
N
V
 
I
D
 
D
-
 
I
S
 
T
D
 
P
M
 
V
A
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
K
D
 
G
R
 
E
P
 
S
T
 
T
T
 
G
L
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
I
T
 
-
L
 
F
T
 
V
D
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
G
Q
 
E
Y
 
N
A
 
V
F
 
I
Y
 
G
D
 
I
E
 
H
N
 
A
T
 
G
A
 
A
G
 
N
R
 
A
M
 
A
L
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
L
M
 
V
P
 
E
D
 
A
P
 
Q
G
 
R
P
 
E
E
 
R
V
 
I
G
 
A
T
 
N
L
 
A
F
 
-
F
 
-
G
 
S
G
 
A
I
 
L
S
 
L
L
 
M
A
 
Q
V
 
L
E
|
E
-
 
S
P
 
P
C
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
V
Y
 
M
E
 
A
A
 
A
L
 
A
C
 
K
L
 
I
K
 
A
A
 
H
A
 
Q
A
 
N
G
 
K
R
 
T
V
 
I
V
 
V
M
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
P
N
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
A
T
 
P
F
 
A
R
 
R
A
 
E
R
 
L
I
 
P
D
 
D
R
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
T
V
 
P
S
 
N
D
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
A
A
 
E
W
 
K
L
 
L
M
 
T
G
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
N
P
 
D
G
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
E
R
 
K
G
|
G
P
 
I
A
x
R
V
 
T
V
 
V
C
 
L
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
G
x
S
A
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
W
A
 
A
H
 
S
T
 
V
A
 
N
T
 
G
G
 
E
I
 
G
T
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
P
A
 
G
E
 
F
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
 
I
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
 
F
N
 
N
A
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
T
G
 
A
L
 
L
A
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
L
D
 
E
A
 
E
P
 
K
V
 
P
L
 
L
T
 
P
S
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
L
 
F
G
 
A
A
x
H
Q
 
A
A
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
I
T
x
A
V
 
V
S
 
T
R
|
R
A
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
V
P
 
P
W
 
W
R
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3609413 Dshi_2797 PfkB domain protein (RefSeq)
MILCAGEALIDMLPRALPDGTAGFAPVAGGAVFNTAVALGRLGADVGLVTGLSRDLFGEV
LMTALAAADVDSDMAVLSDRPTTLAFVTLTDGHAQYAFYDENTAGRMLAPADMPDPGPEV
GTLFFGGISLAVEPCAAAYEALCLKAAAGRVVMLDPNIRPGFIKDETTFRARIDRMLAVT
DIVKVSDEDLAWLMGPGDLAESAAALRARGPAVVCVTRGGAGVEAHTATGITHVAAEAVE
VVDTVGAGDTFNAGFLAGLAEAGALDKDRLRALDAPVLTSALRLGAQAAAITVSRAGANP
PWRDELPR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory