SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609507 Dshi_2891 short-chain dehydrogenase/reductase SDR (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6b9uA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from brucella melitensis complexed with nadh
53% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:244/244 of 6b9uA

query
sites
6b9uA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
|
F
G
 
G
A
 
E
G
 
G
I
 
M
V
 
A
R
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
K
E
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
A
 
V
D
|
D
I
x
R
N
 
D
K
 
K
G
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
G
E
 
E
Y
 
I
G
 
G
G
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
L
Q
 
A
V
 
V
-
 
A
-
x
A
D
|
D
V
x
I
S
 
S
D
 
K
A
 
E
D
 
A
S
 
D
M
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
A
A
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
S
A
 
K
H
 
F
G
 
G
A
 
K
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
G
H
 
H
L
 
K
P
 
P
K
 
Q
P
 
N
M
 
A
E
 
E
E
 
L
V
 
V
T
 
E
E
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
S
 
G
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
S
 
M
A
 
T
R
 
R
V
 
K
F
 
L
V
 
I
P
 
P
A
 
H
M
 
F
K
 
K
A
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
K
A
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
C
-
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
T
 
T
A
 
G
G
 
A
V
 
G
S
 
R
P
 
P
R
 
R
P
 
P
K
 
N
L
|
L
N
 
A
W
 
W
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
G
W
 
W
M
 
V
I
 
V
T
 
S
A
 
V
T
 
T
K
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
A
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
|
A
G
|
G
E
 
E
T
|
T
P
|
P
L
|
L
L
 
L
A
 
T
S
 
T
F
|
F
M
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
M
 
M
R
 
R
A
 
K
K
 
K
F
 
F
L
 
R
A
 
D
T
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
L
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
Q
A
 
A
S
 
S
M
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
L
E
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
S
I
 
I

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
43% identity, 99% coverage: 1:239/242 of query aligns to 6:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
M
 
Q
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
I
 
T
V
 
G
R
 
R
K
 
R
F
 
L
A
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
G
D
|
D
I
|
I
N
 
D
K
 
P
G
 
T
A
 
T
A
 
G
E
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
D
E
 
E
Y
 
L
G
 
E
G
 
G
T
 
L
A
 
F
A
 
V
Q
 
P
V
|
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
E
A
 
Q
D
 
E
S
 
A
M
 
V
A
 
D
A
 
N
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
T
H
 
F
G
 
G
A
 
R
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
S
H
 
P
L
 
P
P
 
E
K
 
D
P
 
D
M
 
L
E
 
I
E
 
E
V
 
N
T
 
T
E
 
D
-
 
L
E
 
P
E
 
A
F
 
W
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
Q
A
 
D
V
 
I
N
 
N
A
 
L
K
 
K
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
A
 
C
R
 
R
V
 
A
F
 
A
V
 
L
P
 
R
A
 
H
M
 
M
K
 
V
A
 
P
R
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
F
A
 
V
G
 
A
V
 
V
-
 
M
-
 
G
S
 
S
P
 
A
R
 
T
P
 
S
K
x
Q
L
 
I
N
 
S
W
 
-
Y
|
Y
N
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
G
M
 
V
I
 
L
T
 
A
A
 
M
T
 
S
K
 
R
A
 
E
M
 
L
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
F
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
C
P
|
P
V
 
G
A
x
P
G
x
V
E
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
S
 
E
F
 
L
M
 
F
G
 
A
E
 
K
D
 
D
T
 
-
P
 
P
E
 
E
M
 
R
R
 
A
A
 
A
K
 
R
F
 
R
L
 
L
A
 
V
T
 
H
I
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
S
 
S
M
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
T
M
 
F
E
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:239/242 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
I
 
A
V
 
A
R
 
R
K
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
K
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
G
-
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
A
E
 
N
Y
 
P
G
 
G
G
 
V
T
 
V
A
 
F
A
 
I
Q
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
A
 
R
D
 
E
S
 
S
M
 
V
A
 
H
A
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
A
 
K
P
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
H
 
R
L
 
-
P
x
D
K
 
S
P
 
M
M
 
L
E
 
S
E
x
K
V
 
M
T
 
T
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
A
 
L
K
 
T
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
H
S
 
C
A
 
T
R
 
Q
V
 
A
F
 
V
V
 
L
P
 
P
A
 
Y
M
 
M
K
 
A
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
T
G
 
G
V
 
T
S
 
Y
P
 
G
R
x
N
P
x
V
K
 
G
L
x
Q
N
 
T
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
W
 
G
M
 
V
I
 
I
T
 
G
A
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
M
 
W
A
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
F
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
A
P
|
P
V
 
G
A
x
F
G
x
T
E
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
L
 
V
A
 
A
S
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
E
T
 
V
P
 
P
E
 
E
-
 
K
M
 
V
R
 
I
A
 
E
K
|
K
F
 
M
L
 
K
A
 
A
T
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
S
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
S
 
D
M
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
A
 
V
M
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
36% identity, 98% coverage: 2:239/242 of query aligns to 3:245/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
R
 
R
L
 
L
E
 
L
G
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
N
S
|
S
G
 
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
I
 
F
V
 
I
A
 
V
D
 
G
I
x
R
N
x
R
K
 
R
G
 
K
A
 
E
A
 
L
E
 
E
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
Y
 
I
G
 
G
G
 
R
-
 
N
-
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
Q
 
K
V
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
E
D
 
D
A
 
L
D
 
D
S
 
R
M
 
L
A
 
Y
A
 
A
L
 
I
A
 
V
-
 
R
E
 
E
A
 
Q
H
 
R
G
 
G
A
 
S
P
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
A
T
 
I
H
 
E
L
 
-
P
 
Q
K
 
K
P
 
T
M
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
E
E
 
H
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
V
 
T
L
 
F
A
 
D
V
|
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
S
 
G
V
 
L
Y
 
I
L
 
F
S
 
T
A
 
V
R
 
Q
V
 
K
F
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
L
M
 
L
K
 
-
A
 
-
R
 
R
G
 
D
S
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
L
I
 
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
L
P
 
G
R
 
L
P
 
Q
K
 
A
L
x
H
N
 
D
W
 
T
Y
|
Y
N
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
W
 
A
M
 
V
I
 
R
T
 
S
A
 
L
T
 
A
K
 
R
A
 
T
M
 
W
A
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
P
 
G
F
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
S
P
 
P
V
x
G
A
 
A
G
x
I
E
 
D
T
|
T
P
 
P
L
x
I
L
 
I
A
 
E
S
 
N
F
 
Q
M
 
V
G
 
S
-
 
T
-
x
Q
E
 
E
D
 
E
T
 
A
P
 
D
E
 
E
M
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
F
 
F
L
 
A
A
 
A
T
 
A
I
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
V
S
 
G
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
T
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
E
M
 
L
E
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:239/242 of query aligns to 3:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
R
 
N
L
 
L
E
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
I
 
A
V
 
V
R
 
Q
K
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
K
 
E
G
 
A
A
 
Q
A
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
V
E
 
R
E
 
K
Y
 
E
G
 
N
G
 
N
T
 
D
A
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
F
A
 
V
Q
 
Q
V
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
-
 
E
-
 
A
A
 
A
D
 
C
S
 
Q
M
 
H
A
 
A
A
 
V
L
 
E
A
 
S
E
 
A
A
 
V
H
 
H
-
 
T
-
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
T
 
-
H
 
E
L
 
I
P
 
V
K
 
A
P
 
P
M
 
I
E
 
H
E
 
E
V
 
M
T
 
E
E
 
L
E
 
S
E
 
D
F
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
K
 
T
S
 
G
V
 
M
Y
 
F
L
 
L
S
 
M
A
 
S
R
 
K
V
 
H
F
 
A
V
 
L
P
 
K
A
 
H
M
 
M
K
 
L
A
 
A
R
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
T
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
L
S
 
V
P
 
A
R
 
W
P
 
P
K
 
D
L
 
I
N
 
P
W
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
G
M
 
V
I
 
L
T
 
Q
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
F
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
N
 
C
P
|
P
V
x
G
A
x
I
G
x
I
E
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
N
L
 
E
A
 
K
S
 
S
F
 
F
M
 
L
-
 
E
-
 
N
G
 
N
E
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
L
E
 
E
M
 
E
R
 
I
A
 
K
K
 
K
F
 
E
L
 
K
A
 
A
T
 
K
I
 
V
-
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
R
F
 
L
S
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
S
 
S
M
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
A
M
 
I
E
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
36% identity, 98% coverage: 2:239/242 of query aligns to 3:245/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
R
 
R
L
 
L
E
 
L
G
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
N
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
I
 
F
V
 
I
A
 
V
D
 
G
I
x
R
N
x
R
K
 
R
G
 
K
A
 
E
A
 
L
E
 
E
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
Y
 
I
G
 
G
G
 
R
-
 
N
-
 
V
T
 
T
A
 
A
A
 
V
Q
 
K
V
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
-
 
K
-
 
L
-
 
E
D
 
D
A
 
L
D
 
D
S
 
R
M
 
L
A
 
Y
A
 
A
L
 
I
A
 
V
-
 
R
E
 
E
A
 
Q
H
 
R
G
 
G
A
 
S
P
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
I
 
A
T
 
V
H
 
E
L
 
-
P
 
Q
K
 
K
P
 
T
M
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
E
E
 
H
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
V
 
T
L
 
F
A
 
D
V
|
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
S
 
G
V
 
L
Y
 
I
L
 
F
S
 
T
A
 
V
R
 
Q
V
 
K
F
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
L
M
 
L
K
 
-
A
 
-
R
 
R
G
 
D
S
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
L
I
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
L
P
 
G
R
 
L
P
 
Q
K
 
A
L
x
H
N
 
D
W
 
T
Y
|
Y
N
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
W
 
A
M
 
V
I
 
R
T
 
S
A
 
L
T
 
A
K
 
R
A
 
T
M
 
W
A
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
P
 
G
F
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
S
P
|
P
V
x
G
A
|
A
G
x
I
E
 
D
T
|
T
P
 
P
L
x
S
L
|
L
A
 
E
S
 
N
F
 
N
M
 
V
G
 
S
-
 
T
-
 
Q
E
 
E
D
 
E
T
 
A
P
 
D
E
 
E
M
 
L
R
 
R
A
 
A
K
 
K
F
 
A
L
 
A
A
 
A
T
 
A
I
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
V
S
 
G
Q
 
R
P
 
P
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
S
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
T
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
E
M
 
L
E
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 7:253/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
M
 
F
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
C
R
 
R
K
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
L
I
 
I
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
x
R
N
 
E
K
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
V
 
I
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
A
D
 
E
S
 
A
M
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
E
H
 
A
G
 
E
A
 
A
P
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
R
L
 
L
P
 
H
K
 
D
P
 
A
M
 
L
E
 
-
E
 
E
V
 
T
T
 
D
E
 
D
E
 
A
E
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
D
S
 
G
V
 
M
Y
 
F
L
 
W
S
 
A
A
 
S
R
 
R
V
 
A
F
 
F
V
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
K
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
T
 
M
A
 
S
G
 
G
-
 
T
V
 
I
S
 
V
P
x
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
-
 
A
N
 
S
W
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
V
I
 
H
T
 
Q
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
A
P
|
P
V
 
-
A
 
-
G
 
G
E
x
Y
T
x
V
P
 
A
L
x
T
L
 
E
A
x
M
S
x
T
F
 
L
M
 
K
G
x
M
E
 
R
D
 
E
T
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
R
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
L
 
L
A
 
D
T
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
S
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
S
D
 
E
L
 
I
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
I
M
 
L
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
C
 
T
I
 
V

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 7:253/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
M
 
F
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
C
R
 
R
K
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
L
I
 
I
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
x
R
N
 
E
K
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
V
 
I
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
A
D
 
E
S
 
A
M
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
E
H
 
A
G
 
E
A
 
A
P
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
R
L
 
L
P
 
H
K
 
D
P
 
A
M
 
L
E
 
-
E
 
E
V
 
T
T
 
D
E
 
D
E
 
A
E
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
D
S
 
G
V
 
M
Y
 
F
L
 
W
S
 
A
A
 
S
R
 
R
V
 
A
F
 
F
V
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
K
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
T
x
M
A
 
S
G
 
G
-
 
T
V
 
I
S
 
V
P
x
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
-
 
A
N
 
S
W
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
V
I
 
H
T
 
Q
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
A
P
|
P
V
 
-
A
 
-
G
 
G
E
x
Y
T
x
V
P
 
A
L
x
T
L
 
E
A
x
M
S
x
T
F
 
L
M
 
K
G
 
M
E
 
R
D
 
E
T
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
R
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
L
 
L
A
 
D
T
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
S
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
S
D
 
E
L
 
I
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
I
M
 
L
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
C
 
T
I
 
V

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 7:253/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
M
 
F
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
C
R
 
R
K
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
L
I
 
I
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
x
R
N
 
E
K
x
A
G
 
A
A
 
A
A
 
L
E
x
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
x
R
V
 
I
-
 
V
-
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
A
D
 
E
S
 
A
M
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
E
H
 
A
G
 
E
A
 
A
P
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
R
L
 
L
P
 
H
K
 
D
P
 
A
M
 
L
E
 
-
E
 
E
V
 
T
T
 
D
E
 
D
E
 
A
E
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
D
S
 
G
V
 
M
Y
 
F
L
 
W
S
 
A
A
 
S
R
 
R
V
 
A
F
 
F
V
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
K
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
L
A
 
G
S
|
S
T
 
M
A
x
S
G
 
G
-
 
T
V
 
I
S
 
V
P
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
-
 
A
N
 
S
W
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
V
I
 
H
T
 
Q
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
A
P
|
P
V
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
Y
T
x
V
P
 
A
L
x
T
L
 
E
A
x
M
S
x
T
F
 
L
M
 
K
G
 
M
E
 
R
D
 
E
T
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
R
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
L
 
L
A
 
D
T
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
S
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
S
D
 
E
L
 
I
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
I
M
 
L
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
C
 
T
I
 
V

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
40% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 7:253/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
M
 
F
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
A
T
 
C
A
 
A
I
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
C
R
 
R
K
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
L
I
 
I
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
 
R
N
 
E
K
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
-
 
A
G
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
V
 
I
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
A
D
 
E
S
 
A
M
 
M
A
 
T
A
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
E
H
 
A
G
 
E
A
 
A
P
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
R
L
 
L
P
 
H
K
 
D
P
 
A
M
 
L
E
 
-
E
 
E
V
 
T
T
 
D
E
 
D
E
 
A
E
 
T
F
 
W
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
D
S
 
G
V
 
M
Y
 
F
L
 
W
S
 
A
A
 
S
R
 
R
V
 
A
F
 
F
V
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
K
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
L
A
 
G
S
 
S
T
 
M
A
 
S
G
 
G
-
 
T
V
 
I
S
 
V
P
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
-
 
A
N
 
S
W
 
S
Y
|
Y
N
 
M
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
V
I
 
H
T
 
Q
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
A
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
A
P
 
P
V
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
Y
T
x
V
P
x
A
L
x
T
L
 
E
A
 
M
S
 
T
F
 
L
M
 
K
G
 
M
E
 
R
D
 
E
T
 
R
P
 
P
E
 
E
M
 
L
R
 
F
A
 
E
K
 
T
F
 
W
L
 
L
A
 
D
T
 
M
I
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
C
S
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
S
D
 
E
L
 
I
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
I
M
 
L
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
C
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Q6WVP7 NADP-dependent (R)-specific alcohol dehydrogenase; (R)-specific ADH; Ketoreductase; KRED; EC 1.1.1.- from Lentilactobacillus kefiri (Lactobacillus kefiri) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:239/242 of query aligns to 4:248/252 of Q6WVP7

query
sites
Q6WVP7
R
 
R
L
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
x
T
S
x
L
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
A
I
 
I
V
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
F
A
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
A
 
T
D
 
G
I
x
R
N
x
H
K
 
A
G
 
D
A
 
V
A
 
G
E
 
E
A
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
S
Y
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
R
-
 
F
A
 
V
Q
 
Q
V
 
H
D
|
D
V
x
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
D
 
A
S
 
G
M
 
W
A
 
T
A
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
T
A
 
E
E
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
A
 
P
P
 
V
D
 
T
I
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
-
L
 
V
P
 
S
K
 
K
P
 
S
M
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
E
E
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
L
L
 
L
A
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
L
K
 
D
S
 
G
V
 
V
Y
 
F
L
 
F
S
 
G
A
 
T
R
 
R
V
 
L
F
 
G
V
 
I
P
 
Q
A
 
R
M
 
M
K
 
K
A
 
N
R
 
K
G
 
G
S
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
T
 
I
A
 
E
G
 
G
V
 
F
S
 
V
P
 
G
R
 
D
P
 
P
K
 
T
L
 
L
N
 
G
W
 
A
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
V
I
 
R
T
 
I
A
 
M
T
 
S
K
 
K
A
 
S
M
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
D
F
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
N
 
H
P
 
P
V
 
G
A
 
Y
G
x
I
E
x
K
T
|
T
P
|
P
L
|
L
L
 
V
A
 
D
S
 
D
F
 
L
M
 
E
G
 
G
E
 
A
D
 
E
T
 
-
P
 
-
E
 
E
M
 
M
R
 
M
A
 
S
K
 
Q
F
 
R
L
 
T
A
 
K
T
 
T
I
 
-
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
F
 
I
S
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
W
A
 
I
A
 
C
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
S
 
K
M
 
F
I
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
E
M
 
F
E
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
38% identity, 99% coverage: 1:239/242 of query aligns to 1:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
M
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
N
K
 
R
T
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
Q
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
R
G
 
I
I
 
Y
V
 
A
R
 
E
K
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
N
 
N
K
 
E
G
 
P
A
 
K
A
 
A
E
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
S
E
 
S
-
 
I
-
 
T
-
 
S
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
R
-
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
A
 
V
D
 
E
S
 
S
M
 
V
A
 
N
A
 
R
L
 
M
A
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
V
E
 
E
A
 
A
H
 
F
G
 
G
A
 
T
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
I
-
 
F
-
x
S
T
 
T
H
 
L
L
 
K
P
 
M
K
 
K
P
 
P
M
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
S
E
 
G
E
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
A
K
 
K
S
 
G
V
 
T
Y
 
F
L
 
L
S
 
C
A
 
C
R
 
Q
V
 
A
F
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
V
M
 
M
K
 
R
A
 
K
R
 
N
G
 
Q
S
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
S
S
|
S
T
 
S
A
 
V
G
 
V
V
 
V
S
 
T
P
 
G
R
 
R
P
 
P
K
 
N
L
 
Y
N
 
A
W
 
H
Y
|
Y
N
 
I
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
V
I
 
W
T
 
A
A
 
L
T
 
T
K
 
H
A
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
T
E
 
E
L
 
M
A
 
G
P
 
T
F
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
N
 
S
P
|
P
V
x
H
A
 
G
G
x
I
E
 
I
T
 
T
P
 
E
L
x
I
L
 
P
A
 
R
S
 
E
F
 
T
M
 
I
G
 
S
E
 
E
D
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
E
M
 
G
R
 
W
A
 
R
K
 
R
F
 
N
L
 
L
A
 
E
T
 
E
I
 
Q
P
 
A
L
 
L
G
 
K
R
 
R
F
 
K
S
 
G
Q
 
D
P
 
A
E
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
V
N
 
G
A
 
I
A
 
L
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
S
 
K
M
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
M
 
V
E
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:239/242 of query aligns to 2:251/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
L
 
L
E
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
A
R
 
Q
K
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
L
I
 
I
V
 
L
-
 
N
-
x
G
-
x
F
A
 
G
D
 
D
I
 
V
N
 
D
K
 
-
G
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
E
 
-
Y
 
Y
G
 
G
G
 
K
T
 
T
A
 
P
A
 
G
Q
 
Y
-
 
H
-
 
G
V
 
A
D
 
D
V
x
L
S
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
A
 
A
D
 
D
S
 
M
M
 
M
A
 
R
A
 
Y
L
 
A
A
 
E
E
 
S
A
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
Q
H
 
H
L
 
V
P
 
-
K
 
S
P
 
P
M
 
I
E
 
E
E
 
T
V
 
F
T
 
P
E
 
V
E
 
D
E
 
K
F
 
W
D
 
N
R
 
A
V
 
I
L
 
I
A
 
A
V
 
I
N
 
N
A
 
L
K
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
L
 
H
S
 
T
A
 
T
R
 
R
V
 
L
F
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
K
 
R
A
 
A
R
 
R
G
 
N
S
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
I
 
I
A
|
A
S
 
S
T
 
V
A
 
H
G
 
G
V
 
L
S
 
V
P
 
A
R
 
S
P
 
K
K
 
E
L
 
K
N
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
W
 
G
M
 
V
I
 
V
T
 
G
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
M
 
I
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
P
 
Q
F
 
T
G
 
E
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
C
P
|
P
V
x
G
A
 
W
G
x
V
E
 
L
T
|
T
P
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
S
 
Q
F
 
Q
M
 
I
G
 
D
E
 
K
D
 
R
T
 
I
P
 
A
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
D
K
 
A
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
E
T
 
K
I
 
Q
P
 
P
L
 
S
G
 
R
R
 
E
F
 
F
S
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
N
 
N
A
 
L
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
D
E
 
G
A
 
A
S
 
A
M
 
Q
I
 
V
T
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
N
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
40% identity, 98% coverage: 3:239/242 of query aligns to 3:247/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
Q
T
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
S
 
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
Q
K
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
N
 
D
K
 
S
G
 
A
A
 
G
A
 
G
E
 
E
A
 
G
V
 
T
A
 
V
E
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
R
E
 
Q
Y
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
E
A
 
A
A
 
V
-
 
F
-
 
I
Q
 
R
V
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
R
A
 
D
D
 
A
S
 
E
M
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
A
A
 
A
H
 
Y
G
 
G
A
 
R
P
 
L
D
 
D
I
 
Y
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
E
H
 
I
L
 
E
P
 
Q
K
 
G
P
 
K
M
 
L
E
 
A
E
 
D
V
 
G
T
 
N
E
 
E
E
 
A
E
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
A
V
 
I
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
V
Y
 
W
L
 
L
S
 
C
A
 
M
R
 
K
V
 
H
F
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
 
L
M
 
M
K
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
S
 
G
P
 
A
R
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
M
N
 
S
W
 
I
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
H
W
 
A
M
 
V
I
 
I
T
 
G
A
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
M
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
F
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
C
P
 
P
V
x
A
A
x
V
G
 
I
E
 
D
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
F
A
 
R
S
 
R
F
 
A
M
 
Y
G
 
-
E
 
E
D
 
A
T
 
D
P
 
P
E
 
R
M
 
-
R
 
K
A
 
A
K
 
E
F
 
F
L
 
A
A
 
A
T
 
A
I
 
M
-
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
V
S
 
G
Q
 
R
P
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
I
G
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
L
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
D
E
 
N
A
 
A
S
 
G
M
 
F
I
 
T
T
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
A
M
 
L
E
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1ahhA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:239/242 of query aligns to 7:249/253 of 1ahhA

query
sites
1ahhA
M
 
L
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
A
G
|
G
F
 
I
G
 
G
A
 
K
G
 
E
I
 
I
V
 
A
R
 
I
K
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
A
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
Q
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
-
 
A
-
 
F
A
 
A
A
 
C
Q
 
R
V
x
C
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
S
A
 
E
D
 
Q
S
 
E
M
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
-
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
S
A
 
K
H
 
L
G
 
G
A
 
K
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
-
T
 
G
H
 
G
L
 
G
P
 
P
K
 
K
P
 
P
M
 
F
E
 
-
E
 
D
V
 
M
T
 
P
E
 
M
E
 
A
E
 
D
F
 
F
D
 
R
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
A
 
E
V
 
L
N
 
N
A
 
V
K
 
F
S
 
S
V
 
F
Y
 
F
L
 
H
S
 
L
A
 
S
R
 
Q
V
 
L
F
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
E
M
 
M
K
 
E
A
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
T
I
 
I
A
x
T
S
|
S
T
 
M
A
 
A
G
 
A
V
 
E
S
 
N
P
 
K
R
 
N
P
 
I
K
 
N
L
x
M
N
 
T
W
 
S
Y
|
Y
N
 
A
A
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
A
W
 
A
M
 
A
I
 
S
T
 
H
A
 
L
T
 
V
K
 
R
A
 
N
M
 
M
A
 
A
V
 
F
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
E
F
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
N
 
A
P
|
P
V
x
G
A
 
A
G
x
I
E
 
L
T
 
T
P
 
D
L
 
A
L
 
L
A
 
K
S
 
S
F
 
V
M
 
I
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
R
 
E
A
 
Q
K
 
K
F
 
M
L
 
L
A
 
Q
T
 
H
I
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
F
 
L
S
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

1ahiA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with nadh and 7-oxo glycochenodeoxycholic acid (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:239/242 of query aligns to 7:249/255 of 1ahiA

query
sites
1ahiA
M
 
L
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
A
 
K
G
 
E
I
 
I
V
 
A
R
 
I
K
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
A
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
Q
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
-
 
A
-
 
F
A
 
A
A
 
C
Q
 
R
V
 
C
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
S
A
 
E
D
 
Q
S
 
E
M
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
-
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
S
A
 
K
H
 
L
G
 
G
A
 
K
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
G
H
 
G
L
 
G
P
 
P
K
 
K
P
 
P
M
 
F
E
 
-
E
 
D
V
 
M
T
 
P
E
 
M
E
 
A
E
 
D
F
 
F
D
 
R
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
A
 
E
V
 
L
N
 
N
A
 
V
K
 
F
S
 
S
V
 
F
Y
 
F
L
 
H
S
 
L
A
 
S
R
 
Q
V
 
L
F
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
E
M
 
M
K
 
E
A
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
T
I
 
I
A
 
T
S
|
S
T
 
M
A
|
A
G
 
A
V
 
E
S
x
N
P
 
K
R
 
N
P
 
I
K
 
N
L
x
M
N
 
T
W
 
S
Y
|
Y
N
 
A
A
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
A
W
 
A
M
 
A
I
 
S
T
 
H
A
 
L
T
 
V
K
 
R
A
 
N
M
 
M
A
 
A
V
 
F
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
E
F
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
N
 
A
P
|
P
V
x
G
A
 
A
G
x
I
E
 
L
T
|
T
P
 
D
L
x
A
L
 
L
A
 
K
S
 
S
F
x
V
M
 
I
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
R
 
E
A
 
Q
K
 
K
F
 
M
L
 
L
A
 
Q
T
 
H
I
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
F
 
L
S
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P0AET8 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NAD-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.159 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
38% identity, 99% coverage: 1:239/242 of query aligns to 7:249/255 of P0AET8

query
sites
P0AET8
M
 
L
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
C
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
G
 
G
F
x
I
G
 
G
A
 
K
G
 
E
I
 
I
V
 
A
R
 
I
K
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
T
E
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
N
A
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
Q
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
-
 
A
-
 
F
A
 
A
A
 
C
Q
 
R
V
 
C
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
S
A
 
E
D
 
Q
S
 
E
M
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
-
 
F
-
 
A
-
 
I
-
 
S
A
 
K
H
 
L
G
 
G
A
 
K
P
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
G
H
x
G
L
 
G
P
 
P
K
 
K
P
 
P
M
 
F
E
 
-
E
 
D
V
 
M
T
 
P
E
 
M
E
 
A
E
 
D
F
 
F
D
 
R
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
A
 
E
V
 
L
N
 
N
A
 
V
K
 
F
S
 
S
V
 
F
Y
 
F
L
 
H
S
 
L
A
 
S
R
 
Q
V
 
L
F
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
E
M
 
M
K
 
E
A
 
K
R
 
N
G
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
T
I
 
I
A
 
T
S
|
S
T
 
M
A
 
A
G
 
A
V
 
E
S
x
N
P
 
K
R
 
N
P
 
I
K
 
N
L
 
M
N
 
T
W
 
S
Y
|
Y
N
 
A
A
 
S
S
 
S
K
|
K
G
 
A
W
 
A
M
 
A
I
 
S
T
 
H
A
 
L
T
 
V
K
 
R
A
 
N
M
 
M
A
 
A
V
 
F
E
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
E
F
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
I
N
 
A
P
 
P
V
 
G
A
 
A
G
x
I
E
x
L
T
|
T
P
 
D
L
 
A
L
 
L
A
 
K
S
 
S
F
 
V
M
 
I
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
I
R
 
E
A
 
Q
K
 
K
F
 
M
L
 
L
A
 
Q
T
 
H
I
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
R
R
 
R
F
 
L
S
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
A
 
I
M
 
L
E
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
38% identity, 88% coverage: 28:239/242 of query aligns to 28:249/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
x
L
N
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
E
 
A
-
 
M
-
 
L
E
 
S
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
V
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
K
A
 
A
-
 
A
D
 
D
S
 
I
M
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
T
E
 
S
A
 
A
H
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
L
D
 
T
I
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
G
L
 
F
P
 
-
K
 
G
P
 
S
M
 
V
E
 
H
E
 
D
V
 
A
T
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
A
F
 
W
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
M
A
 
A
V
|
V
N
|
N
A
 
V
K
 
T
S
 
G
V
 
T
Y
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
S
R
 
K
V
 
A
F
 
A
V
 
L
P
 
A
A
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
H
S
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
S
 
V
P
 
G
R
 
I
P
 
P
K
 
T
L
 
M
N
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
I
I
 
V
T
 
N
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
M
 
M
A
 
A
V
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
C
P
|
P
-
 
G
V
x
T
A
x
V
G
 
T
E
 
S
T
|
T
P
 
G
L
x
M
L
 
G
A
 
Q
S
 
Q
F
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
T
 
T
-
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
V
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
F
x
R
L
 
L
A
 
A
T
 
K
I
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
A
M
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
A
M
 
F
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
38% identity, 88% coverage: 28:239/242 of query aligns to 30:251/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
 
L
N
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
E
 
A
-
 
M
-
 
L
E
 
S
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
V
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
K
A
 
A
-
 
A
D
 
D
S
 
I
M
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
T
E
 
S
A
 
A
H
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
L
D
 
T
I
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
G
L
 
F
P
 
G
K
 
S
P
 
-
M
 
V
E
 
H
E
 
D
V
 
A
T
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
A
F
 
W
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
T
S
 
G
V
 
T
Y
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
S
R
 
K
V
 
A
F
 
A
V
 
L
P
 
A
A
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
H
S
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
S
 
V
P
 
G
R
 
I
P
 
P
K
 
T
L
 
M
N
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
I
I
 
V
T
 
N
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
M
 
M
A
 
A
V
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
C
P
 
P
-
 
G
V
x
T
A
x
V
G
x
T
E
x
S
T
|
T
P
x
G
L
 
M
L
 
G
A
 
Q
S
 
Q
F
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
S
D
 
D
T
 
T
-
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
V
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
F
x
R
L
 
L
A
 
A
T
x
K
I
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
A
M
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
A
M
 
F
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
37% identity, 88% coverage: 28:239/242 of query aligns to 28:244/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
L
A
 
I
D
|
D
I
x
L
N
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
E
 
E
-
 
R
-
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
M
E
 
L
E
 
S
Y
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
V
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
K
A
 
A
-
 
A
D
 
D
S
 
I
M
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
T
E
 
S
A
 
A
H
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
G
 
G
A
 
S
P
 
L
D
 
T
I
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
H
 
G
L
 
F
P
 
G
K
 
S
P
 
-
M
 
V
E
 
H
E
 
D
V
 
A
T
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
A
F
 
W
D
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
M
A
 
A
V
|
V
N
|
N
A
 
V
K
 
T
S
 
G
V
 
T
Y
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
S
R
 
K
V
 
A
F
 
A
V
 
L
P
 
A
A
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
H
S
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
I
x
F
A
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
S
 
V
P
 
G
R
 
I
P
 
P
K
 
T
L
 
M
N
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
W
 
A
M
 
I
I
 
V
T
 
N
A
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
M
 
M
A
 
A
V
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
C
P
|
P
V
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
G
P
 
T
L
x
V
L
 
T
A
 
S
S
x
T
F
x
G
M
|
M
G
 
G
E
 
Q
D
 
Q
-
 
L
T
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
V
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
F
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
K
I
 
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
F
 
F
S
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
G
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
A
M
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
A
 
A
M
 
F
E
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>3609507 Dshi_2891 short-chain dehydrogenase/reductase SDR (RefSeq)
MRLEGKTAIVTGGGSGFGAGIVRKFAAEGAQVIVADINKGAAEAVAEEYGGTAAQVDVSD
ADSMAALAEAHGAPDILVNNAGITHLPKPMEEVTEEEFDRVLAVNAKSVYLSARVFVPAM
KARGSGAILNIASTAGVSPRPKLNWYNASKGWMITATKAMAVELAPFGIRVNALNPVAGE
TPLLASFMGEDTPEMRAKFLATIPLGRFSQPEDLGNAAAFLCSDEASMITGVAMEVDGGR
CI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory