SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609586 FitnessBrowser__Dino:3609586 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:323/328 of query aligns to 4:321/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
S
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
N
V
 
G
E
 
I
T
 
N
R
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
E
L
 
E
F
 
F
D
 
E
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
W
E
 
E
S
 
E
D
 
E
T
 
R
P
 
E
M
 
I
S
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
E
A
 
K
M
 
V
R
 
K
R
 
D
A
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
T
T
x
M
V
x
L
S
 
S
D
 
E
H
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
Q
A
 
E
M
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
N
V
 
-
G
 
A
D
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
x
A
A
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
A
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
N
D
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
M
 
H
T
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
T
T
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
L
 
D
A
 
K
L
 
F
M
 
V
Q
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
E
W
 
W
T
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
G
 
A
W
 
W
S
 
H
P
 
P
T
 
K
A
 
W
L
 
F
M
 
L
G
 
G
G
 
Y
R
 
E
I
 
L
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
M
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
R
I
 
I
H
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
 
T
R
 
R
L
 
K
H
 
S
K
 
Q
G
 
A
I
 
-
E
 
E
E
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
G
A
 
A
T
 
E
W
 
Y
W
 
-
E
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
V
V
 
L
S
 
K
R
 
E
M
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
I
V
 
L
N
x
A
C
x
V
P
|
P
H
 
L
T
 
T
P
 
K
S
 
E
T
|
T
F
 
M
H
 
Y
L
 
M
M
 
I
N
 
N
A
 
E
R
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
N
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
I
R
 
K
M
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
D
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
E
G
x
E
H
 
P
E
 
Y
V
 
Y
N
 
N
P
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
F
E
 
S
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
E
G
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
A
M
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
L
V
 
V
I
 
A
I
 
R
N
 
N
I
 
L
K
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
K
D
 
R
G
 
G
H
 
E
R
 
I
P
 
P
P
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:323/328 of query aligns to 3:320/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
S
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
N
V
 
G
E
 
I
T
 
E
R
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
H
F
 
F
D
 
E
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
W
E
 
E
S
 
H
D
 
E
T
 
H
P
 
E
M
 
I
S
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
L
A
 
E
A
 
K
M
 
V
R
 
K
R
 
D
A
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
T
T
 
M
V
 
L
S
 
S
D
 
E
H
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
R
A
 
E
M
 
V
L
 
F
A
 
D
G
 
A
V
 
-
G
 
A
D
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
M
 
L
T
 
A
L
 
W
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
L
 
D
A
 
K
L
 
F
M
 
V
Q
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
E
W
 
W
T
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
G
 
A
W
 
W
S
 
H
P
 
P
T
 
K
A
 
M
L
 
F
M
 
L
G
 
G
G
 
Y
R
 
D
I
 
V
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
M
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
R
I
 
I
H
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
x
A
R
|
R
R
x
S
R
 
R
L
x
K
H
 
P
K
 
E
G
 
A
I
 
-
E
 
E
E
 
K
E
 
E
L
 
L
E
 
G
A
 
A
T
 
E
W
 
F
W
 
-
E
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
L
V
 
L
S
 
R
R
 
E
M
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
V
V
 
L
N
 
A
C
x
V
P
|
P
H
 
L
T
 
T
P
 
K
S
x
E
T
|
T
F
 
Y
H
 
H
L
 
M
M
 
I
N
 
N
A
 
E
R
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
V
S
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
N
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
I
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
D
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
E
G
x
E
H
 
P
E
 
Y
V
 
Y
N
 
D
P
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
F
E
 
A
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
G
G
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
G
M
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
L
V
 
V
I
 
A
I
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
K
D
 
N
G
 
G
H
 
E
R
 
V
P
 
P
P
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:323/328 of query aligns to 4:321/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
S
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
V
V
 
G
E
 
I
T
 
K
R
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
D
L
 
E
F
 
F
D
 
E
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
W
E
 
G
S
 
D
D
 
E
T
 
K
P
 
E
M
 
I
S
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
I
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
K
M
 
V
R
 
K
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
T
T
 
M
V
 
L
S
 
S
D
 
E
H
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
K
A
 
E
M
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
N
V
 
-
G
 
A
D
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
M
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
T
T
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
L
 
D
A
 
R
L
 
F
M
 
V
Q
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
E
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
T
 
V
G
 
A
W
 
W
S
 
H
P
 
P
T
 
K
A
 
W
L
 
F
M
 
L
G
 
G
G
 
Y
R
 
D
I
 
V
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
R
I
 
I
H
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
x
T
R
 
R
L
 
-
H
 
K
K
 
E
G
 
E
I
 
V
E
 
E
E
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
N
A
 
A
T
 
E
W
 
F
W
 
-
E
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
S
 
R
R
 
E
M
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
V
V
 
L
N
x
A
C
x
V
P
|
P
H
 
L
T
 
T
P
 
R
S
 
E
T
|
T
F
 
Y
H
 
H
L
 
L
M
 
I
N
 
N
A
 
E
R
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
V
R
 
K
M
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
D
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
E
G
x
E
H
 
P
E
 
Y
V
 
Y
N
 
N
P
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
F
E
 
K
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
F
E
 
G
G
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
G
M
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
L
V
 
V
I
 
A
I
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
K
D
 
R
G
 
G
H
 
E
R
 
I
P
 
P
P
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
41% identity, 97% coverage: 7:323/328 of query aligns to 4:321/334 of O58320

query
sites
O58320
S
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
I
T
 
T
R
 
R
R
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
V
V
 
G
E
 
I
T
 
K
R
 
M
L
 
L
K
 
E
E
 
D
L
 
E
F
 
F
D
 
E
V
 
V
E
 
E
L
 
V
N
 
W
E
 
G
S
 
D
D
 
E
T
 
K
P
 
E
M
 
I
S
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
I
L
 
L
Q
 
L
A
 
K
A
 
K
M
 
V
R
 
K
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
T
T
 
M
V
 
L
S
 
S
D
 
E
H
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
K
A
 
E
M
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
N
V
 
-
G
 
A
D
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
T
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
A
T
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
T
T
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
L
 
D
A
 
R
L
 
F
M
 
V
Q
 
R
T
 
S
G
 
G
A
 
E
W
 
W
-
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
T
 
V
G
 
A
W
 
W
S
 
H
P
 
P
T
 
K
A
 
W
L
 
F
M
 
L
G
 
G
G
 
Y
R
 
D
I
 
V
A
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
R
I
 
I
H
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
R
x
T
R
 
R
L
 
-
H
 
K
K
 
E
G
 
E
I
 
V
E
 
E
E
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
N
A
 
A
T
 
E
W
 
F
W
 
-
E
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
S
 
R
R
 
E
M
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
V
V
 
L
N
 
A
C
 
V
P
 
P
H
 
L
T
 
T
P
 
R
S
 
E
T
 
T
F
 
Y
H
 
H
L
 
L
M
 
I
N
 
N
A
 
E
R
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
V
R
 
K
M
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
G
D
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
E
G
 
E
H
 
P
E
 
Y
V
 
Y
N
 
N
P
 
E
R
 
E
L
 
L
R
 
F
E
 
K
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
M
x
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
F
E
 
G
G
 
A
R
 
R
A
 
E
E
 
G
M
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
L
V
 
V
I
 
A
I
 
K
N
 
N
I
 
L
K
 
I
T
 
A
F
 
F
D
 
K
D
 
R
G
 
G
H
 
E
R
 
I
P
 
P
P
 
P
D
 
T
L
 
L
V
 
V

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
38% identity, 92% coverage: 2:302/328 of query aligns to 3:305/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
P
 
P
G
 
V
E
 
R
R
 
L
L
 
M
S
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
V
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
I
P
 
P
E
 
A
A
 
E
V
 
G
E
 
R
T
 
V
R
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
R
L
 
A
F
 
A
D
 
D
V
 
C
E
 
E
L
 
V
N
 
E
E
 
Q
-
 
W
-
 
D
S
 
S
D
 
D
T
 
E
P
 
P
M
 
I
S
 
P
R
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
G
M
 
V
R
 
A
R
 
G
A
 
A
D
 
H
V
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
C
T
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
K
A
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
T
Y
 
M
G
 
S
A
x
V
G
|
G
V
 
I
D
 
D
H
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
L
A
 
D
T
 
E
A
 
I
R
 
K
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
R
V
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
T
V
 
T
T
 
C
R
 
R
R
 
R
I
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
E
M
 
V
Q
 
K
T
 
N
G
 
G
A
 
G
W
 
W
T
 
T
G
 
S
W
 
W
S
 
K
P
 
P
T
 
L
A
 
W
L
 
L
M
 
C
G
 
G
G
 
Y
R
 
G
I
 
L
A
 
T
G
 
Q
R
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
R
H
 
F
Y
 
L
H
 
Y
N
 
T
R
 
G
R
|
R
R
x
Q
L
x
P
H
x
R
K
 
P
G
 
E
I
 
E
E
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
F
E
 
Q
A
 
A
T
 
E
W
 
-
W
 
F
E
 
V
S
 
S
L
 
T
D
 
P
Q
 
E
M
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
Q
M
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
V
V
 
V
N
 
A
C
 
C
P
x
S
H
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
T
F
 
E
H
 
G
L
 
L
M
 
C
N
 
N
A
 
K
R
 
D
R
 
F
L
 
F
K
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
N
E
 
Q
N
 
D
A
 
D
L
 
L
T
 
Y
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
E
 
S
-
 
P
H
 
E
G
 
P
H
 
L
E
 
P
V
 
T
N
 
N
P
 
H
R
 
P
L
 
L
R
 
L
E
 
T
L
 
L
P
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
x
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
E
 
H
E
 
R
G
 
T
R
 
R
A
 
N
E
 
T
M
 
M

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
38% identity, 91% coverage: 6:302/328 of query aligns to 3:301/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
L
 
M
S
 
K
V
 
V
V
 
F
V
 
V
T
 
T
R
 
R
R
 
R
L
 
I
P
 
P
E
 
A
A
 
E
V
 
G
E
 
R
T
 
V
R
 
A
L
 
L
K
 
A
E
 
R
L
 
A
F
 
A
D
 
D
V
 
C
E
 
E
L
 
V
N
 
E
E
 
Q
-
 
W
-
 
D
S
 
S
D
 
D
T
 
E
P
 
P
M
 
I
S
 
P
R
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
G
M
 
V
R
 
A
R
 
G
A
 
A
D
 
H
V
 
G
L
 
L
V
 
L
P
 
C
T
 
L
V
x
L
S
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
K
A
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
A
R
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
T
Y
 
M
G
x
S
A
x
V
G
|
G
V
 
I
D
 
D
H
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
L
A
 
D
T
 
E
A
 
I
R
 
K
Q
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
R
V
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
T
T
|
T
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
S
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
T
V
 
T
T
 
C
R
 
R
R
 
R
I
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
E
M
 
V
Q
 
K
T
 
N
G
 
G
A
 
G
W
 
W
T
 
T
G
 
S
W
 
W
S
 
K
P
 
P
T
 
L
A
 
W
L
 
L
M
 
C
G
 
G
G
 
Y
R
 
G
I
 
L
A
 
T
G
 
Q
R
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
M
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
K
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
R
H
 
F
Y
 
L
H
 
Y
N
 
T
R
x
G
R
|
R
R
 
Q
L
 
P
H
x
R
K
 
P
G
 
E
I
 
E
E
 
A
E
 
A
E
 
E
L
 
F
E
 
Q
A
 
A
T
 
E
W
 
-
W
 
F
E
 
V
S
 
S
L
 
T
D
 
P
Q
 
E
M
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
Q
M
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
V
V
 
V
N
 
A
C
|
C
P
x
S
H
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
A
T
|
T
F
 
E
H
 
G
L
 
L
M
 
C
N
 
N
A
 
K
R
 
D
R
 
F
L
 
F
K
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
N
E
 
Q
N
 
D
A
 
D
L
 
L
T
 
Y
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
E
 
S
-
 
P
H
x
E
G
 
P
H
 
L
E
 
P
V
 
T
N
 
N
P
 
H
R
 
P
L
 
L
R
 
L
E
 
T
L
 
L
P
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
H
E
 
R
G
 
T
R
 
R
A
 
N
E
 
T
M
 
M

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 86% coverage: 36:317/328 of query aligns to 31:304/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
P
 
P
M
 
A
S
 
Q
R
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
L
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
M
 
S
R
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
-
V
 
-
L
 
V
V
 
V
P
 
G
T
 
N
V
 
S
S
 
N
D
 
A
H
 
G
I
 
A
D
 
D
G
 
A
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
D
G
 
A
V
 
L
G
 
-
D
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
S
N
 
S
Y
 
F
G
 
S
A
x
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
I
T
 
K
A
 
C
R
 
E
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
H
 
R
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
L
T
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
P
 
C
E
 
E
G
 
C
L
 
D
A
 
K
L
 
Y
M
 
V
Q
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
W
T
 
K
G
 
F
W
 
G
S
 
D
P
 
F
T
 
K
A
 
-
L
 
-
M
 
L
G
 
T
G
 
T
R
 
K
I
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
Q
 
P
I
 
I
H
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
R
x
S
R
 
K
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
P
E
 
N
L
 
T
E
 
N
A
 
Y
T
 
T
W
 
Y
W
 
Y
E
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
Q
 
E
M
 
L
V
 
A
S
 
S
R
 
N
M
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
L
S
 
V
V
 
V
N
 
A
C
|
C
P
|
P
H
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
E
T
|
T
F
 
T
H
 
H
L
 
I
M
 
I
N
 
N
A
 
R
R
 
E
R
 
V
L
 
I
K
 
D
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
P
V
 
H
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
P
A
 
E
L
 
L
T
 
V
R
 
S
M
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
E
G
 
G
D
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
R
G
x
E
H
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
P
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
F
E
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
E
 
V
E
 
E
G
 
T
R
 
R
A
 
K
E
 
V
M
 
M
G
 
A
E
 
D
K
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
G
N
 
N
I
 
L
K
 
E
T
 
A
F
 
H
D
 
F
D
 
S
G
 
G
H
 
K

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
38% identity, 86% coverage: 36:317/328 of query aligns to 33:306/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
P
 
P
M
 
A
S
 
Q
R
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
L
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
E
M
 
S
R
 
I
R
 
R
A
 
A
D
 
-
V
 
-
L
 
V
V
 
V
P
 
G
T
 
N
V
 
S
S
 
N
D
 
A
H
 
G
I
 
A
D
 
D
G
 
A
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
D
G
 
A
V
 
L
G
 
-
D
 
P
R
 
K
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
S
N
 
S
Y
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
I
T
 
K
A
 
C
R
 
E
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
H
 
R
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
L
T
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
P
 
C
E
 
E
G
 
C
L
 
D
A
 
K
L
 
Y
M
 
V
Q
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
W
T
 
K
G
 
F
W
 
G
S
 
D
P
 
F
T
 
K
A
 
-
L
 
-
M
 
L
G
 
T
G
 
T
R
 
K
I
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
Q
 
P
I
 
I
H
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
R
x
S
R
 
K
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
K
E
 
P
E
 
N
L
 
T
E
 
N
A
 
Y
T
 
T
W
 
Y
W
 
Y
E
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
Q
 
E
M
 
L
V
 
A
S
 
S
R
 
N
M
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
L
S
 
V
V
 
V
N
 
A
C
 
C
P
 
P
H
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
E
T
 
T
F
 
T
H
 
H
L
 
I
M
 
I
N
 
N
A
 
R
R
 
E
R
 
V
L
 
I
K
 
D
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
P
V
 
H
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
P
A
 
E
L
 
L
T
 
V
R
 
S
M
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
E
G
 
G
D
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
R
G
 
E
H
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
P
P
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
F
E
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
M
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
E
 
V
E
 
E
G
 
T
R
 
R
A
 
K
E
 
V
M
 
M
G
 
A
E
 
D
K
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
G
N
 
N
I
 
L
K
 
E
T
 
A
F
 
H
D
 
F
D
 
S
G
 
G
H
 
K

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
38% identity, 94% coverage: 10:317/328 of query aligns to 14:303/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
M
V
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
V
L
 
R
K
 
I
E
 
E
L
 
R
F
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
A
L
 
L
N
 
V
E
 
T
S
 
A
D
 
D
T
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
M
R
 
R
R
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
S
V
 
G
P
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
S
D
 
G
H
 
K
I
 
L
D
 
P
G
 
V
A
 
P
M
 
L
L
 
M
A
 
D
G
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
P
R
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
N
V
 
T
T
 
L
R
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
E
A
 
Q
L
 
W
M
 
L
Q
 
R
T
 
Q
G
 
G
A
 
R
W
 
W
T
 
V
G
 
R
W
 
E
S
 
G
P
 
A
T
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
S
G
 
P
G
 
L
R
 
S
I
 
L
A
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
Q
 
S
I
 
I
H
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
R
 
P
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
R
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
G
A
 
F
T
 
T
W
 
Y
W
 
H
E
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
S
 
E
R
 
A
M
 
V
D
 
D
V
 
T
I
 
L
S
 
I
V
 
V
N
 
I
C
 
V
P
|
P
H
 
G
T
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
F
 
L
H
 
K
L
 
A
M
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
D
R
 
V
L
 
L
K
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
V
S
 
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
V
R
 
T
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
N
G
 
G
D
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
N
G
x
E
H
 
P
E
 
N
V
 
V
N
 
P
P
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
G
 
T
R
 
R
A
 
N
E
 
A
M
 
M
G
 
S
E
 
D
K
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
D
N
 
N
I
 
L
K
 
K
T
 
A
-
 
W
F
 
F
D
 
S
D
 
T
G
 
G
H
 
E

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
38% identity, 94% coverage: 10:317/328 of query aligns to 16:305/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
M
V
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
V
L
 
R
K
 
I
E
 
E
L
 
R
F
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
A
L
 
L
N
 
V
E
 
T
S
 
A
D
 
D
T
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
M
R
 
R
R
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
S
V
 
G
P
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
S
D
 
G
H
 
K
I
 
L
D
 
P
G
 
V
A
 
P
M
 
L
L
 
M
A
 
D
G
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
P
R
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
N
V
 
T
T
 
L
R
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
E
A
 
Q
L
 
W
M
 
L
Q
 
R
T
 
Q
G
 
G
A
 
R
W
 
W
T
 
V
G
 
R
W
 
E
S
 
G
P
 
A
T
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
S
G
 
P
G
 
L
R
 
S
I
 
L
A
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
Q
 
S
I
 
I
H
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
R
 
P
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
R
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
G
A
 
F
T
 
T
W
 
Y
W
 
H
E
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
S
 
E
R
 
A
M
 
V
D
 
D
V
 
T
I
 
L
S
 
I
V
 
V
N
 
I
C
x
V
P
|
P
H
 
G
T
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
F
 
L
H
 
K
L
 
A
M
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
D
R
 
V
L
 
L
K
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
V
R
 
T
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
N
G
 
G
D
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
N
G
x
E
H
 
P
E
 
N
V
 
V
N
 
P
P
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
G
 
T
R
 
R
A
 
N
E
 
A
M
 
M
G
 
S
E
 
D
K
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
D
N
 
N
I
 
L
K
 
K
T
 
A
-
 
W
F
 
F
D
 
S
D
 
T
G
 
G
H
 
E

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
38% identity, 94% coverage: 10:317/328 of query aligns to 15:304/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
M
V
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
V
L
 
R
K
 
I
E
 
E
L
 
R
F
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
A
L
 
L
N
 
V
E
 
T
S
 
A
D
 
D
T
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
M
R
 
R
R
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
S
V
 
G
P
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
S
D
 
G
H
 
K
I
 
L
D
 
P
G
 
V
A
 
P
M
 
L
L
 
M
A
 
D
G
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
P
R
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
N
V
 
T
T
 
L
R
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
E
A
 
Q
L
 
W
M
 
L
Q
 
R
T
 
Q
G
 
G
A
 
R
W
 
W
T
 
V
G
 
R
W
 
E
S
 
G
P
 
A
T
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
S
G
 
P
G
 
L
R
 
S
I
 
L
A
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
Q
 
S
I
 
I
H
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
R
 
P
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
R
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
G
A
 
F
T
 
T
W
 
Y
W
 
H
E
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
S
 
E
R
 
A
M
 
V
D
 
D
V
 
T
I
 
L
S
 
I
V
 
V
N
 
I
C
x
V
P
|
P
H
 
G
T
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
F
 
L
H
 
K
L
 
A
M
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
D
R
 
V
L
 
L
K
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
V
R
 
T
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
N
G
 
G
D
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
N
G
x
E
H
 
P
E
 
N
V
 
V
N
 
P
P
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
G
x
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
G
 
T
R
|
R
A
 
N
E
 
A
M
 
M
G
 
S
E
 
D
K
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
D
N
 
N
I
 
L
K
 
K
T
 
A
-
 
W
F
 
F
D
 
S
D
 
T
G
 
G
H
 
E

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
37% identity, 97% coverage: 1:317/328 of query aligns to 6:303/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
M
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
-
R
 
K
L
 
I
S
 
N
V
 
P
V
 
R
V
 
V
T
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
M
V
 
F
E
 
E
T
 
T
R
 
V
L
 
R
K
 
I
E
 
E
L
 
R
F
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
A
L
 
L
N
 
V
E
 
T
S
 
A
D
 
D
T
 
-
P
 
-
M
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
M
R
 
R
R
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
S
V
 
G
P
 
I
T
 
A
V
 
V
S
 
S
D
 
G
H
 
K
I
 
L
D
 
P
G
 
V
A
 
P
M
 
L
L
 
M
A
 
D
G
 
A
V
 
F
G
 
-
D
 
P
R
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
A
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
H
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
L
A
 
N
V
 
T
T
 
L
R
 
R
R
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
E
A
 
Q
L
 
W
M
 
L
Q
 
R
T
 
Q
G
 
G
A
 
R
W
 
W
T
 
V
G
 
R
W
 
E
S
 
G
P
 
A
T
 
F
A
 
P
L
 
L
M
 
S
G
 
P
G
 
L
R
 
S
I
 
L
A
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
L
K
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
Q
 
S
I
 
I
H
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
R
 
T
R
 
P
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
R
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
G
A
 
F
T
 
T
W
 
Y
W
 
H
E
 
P
S
 
T
L
 
L
D
 
V
Q
 
G
M
 
M
V
 
A
S
 
E
R
 
A
M
 
V
D
 
D
V
 
T
I
 
L
S
 
I
V
 
V
N
 
I
C
x
V
P
|
P
H
 
G
T
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
F
 
L
H
 
K
L
 
A
M
 
V
N
 
N
A
 
A
R
 
D
R
 
V
L
 
L
K
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
V
R
 
T
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
N
G
 
G
D
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
H
 
N
G
x
E
H
 
P
E
 
N
V
 
V
N
 
P
P
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
G
 
T
R
 
R
A
 
N
E
 
A
M
 
M
G
 
S
E
 
D
K
 
L
V
 
V
I
 
V
I
 
D
N
 
N
I
 
L
K
 
K
T
 
A
-
 
W
F
 
F
D
 
S
D
 
T
G
 
G
H
 
E

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
32% identity, 86% coverage: 28:310/328 of query aligns to 3:289/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
V
 
V
E
 
L
L
 
I
N
 
S
E
 
D
S
 
S
D
 
L
T
 
D
P
 
P
M
 
C
S
 
C
R
 
R
D
 
K
A
 
I
L
 
L
Q
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
L
A
 
Q
A
 
V
M
 
V
R
 
E
R
 
K
A
 
Q
D
 
N
V
 
L
L
 
L
V
 
I
P
 
A
T
 
E
V
 
L
S
 
Q
D
 
D
H
 
-
I
 
C
D
 
E
G
 
G
A
 
L
M
 
I
L
 
V
A
 
R
G
 
S
V
 
A
G
 
A
D
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
 
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
|
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
|
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
 
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
|
S
T
 
T
F
 
T
H
 
G
L
|
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 30:297/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
|
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
x
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
T
H
 
G
L
|
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 32:299/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
x
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
M
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
x
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
|
T
F
 
T
H
 
G
L
 
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
M
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
|
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

Sites not aligning to the query:

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 31:298/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
|
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
x
H
C
x
T
P
 
P
H
 
L
T
x
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
T
H
 
G
L
 
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 30:297/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
x
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
x
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
x
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
|
T
F
 
T
H
 
G
L
 
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
S
x
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
M
 
L
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 31:298/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
M
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
|
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
 
P
R
 
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
x
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
T
H
 
G
L
 
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 31:298/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
G
|
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
x
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
|
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
 
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
T
H
 
G
L
|
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
33% identity, 84% coverage: 37:310/328 of query aligns to 31:298/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
M
 
L
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
D
A
 
C
D
 
E
V
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
V
T
 
R
V
 
S
S
 
A
D
 
T
H
 
K
I
 
V
D
 
T
G
 
A
A
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
-
G
 
N
V
 
A
G
 
A
D
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
G
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
H
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
V
 
G
L
 
N
T
 
S
D
 
L
D
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
L
 
M
A
 
C
V
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
S
M
 
M
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
A
 
K
W
 
W
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
E
P
 
R
T
 
K
A
 
K
L
 
F
M
 
M
G
 
G
G
 
T
R
 
E
I
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
I
 
T
H
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
R
 
I
R
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
I
|
I
E
 
S
E
 
P
E
 
E
L
 
V
E
 
S
A
 
A
T
 
S
W
 
F
W
 
G
E
 
V
S
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
M
 
I
V
 
W
S
 
P
R
 
L
M
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
V
 
V
N
x
H
C
x
T
P
|
P
H
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
T
H
 
G
L
|
L
M
 
L
N
 
N
A
 
D
R
 
N
R
 
T
L
 
F
K
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
T
E
 
E
V
 
E
N
 
P
P
 
P
R
 
R
L
 
D
R
 
R
E
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
G
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
R
M
 
C
G
 
G
E
 
E
K
 
E
V
 
I
I
 
A
I
 
V
N
 
Q
I
 
F

Query Sequence

>3609586 FitnessBrowser__Dino:3609586
MPGERLSVVVTRRLPEAVETRLKELFDVELNESDTPMSRDALQAAMRRADVLVPTVSDHI
DGAMLAGVGDRLKLIANYGAGVDHIDVATARQRGIHVSNTPGVLTDDTADMTLALILAVT
RRIPEGLALMQTGAWTGWSPTALMGGRIAGRRLGILGMGRIGQAVARRAKAFGMQIHYHN
RRRLHKGIEEELEATWWESLDQMVSRMDVISVNCPHTPSTFHLMNARRLKLMKPSAVIVN
TSRGEVIDENALTRMLRAGDIAGAGLDVFEHGHEVNPRLRELPNVVLLPHMGSATEEGRA
EMGEKVIINIKTFDDGHRPPDLVVPSML

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory