SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609664 FitnessBrowser__Dino:3609664 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3w6zA Crystal structure of NADP bound l-serine 3-dehydrogenase (k170m) from hyperthermophilic archaeon pyrobaculum calidifontis (see paper)
36% identity, 95% coverage: 3:282/294 of query aligns to 15:293/296 of 3w6zA

query
sites
3w6zA
K
 
R
V
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
x
I
M
|
M
G
 
G
Y
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
T
H
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
F
E
 
L
V
 
A
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
N
|
N
R
|
R
T
|
T
T
 
R
A
 
E
K
|
K
A
 
T
E
 
K
A
 
P
W
 
F
V
 
-
A
 
A
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
G
 
V
S
 
Y
H
 
V
A
 
A
L
 
E
T
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
R
C
 
V
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
I
T
 
V
C
 
M
V
|
V
G
x
S
N
 
D
D
 
A
D
 
P
D
|
D
L
 
V
R
 
E
S
x
Q
V
 
V
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
E
A
 
G
L
 
A
G
 
R
S
 
P
G
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
N
S
 
S
A
 
P
E
 
D
V
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
K
I
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
L
A
 
A
E
 
Q
N
 
Y
G
 
G
V
 
I
G
 
E
F
 
F
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
I
N
 
E
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
V
 
I
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
K
E
 
E
T
 
E
D
 
L
Y
 
F
A
 
H
R
 
R
A
 
L
K
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
F
D
 
K
S
 
A
Y
 
M
A
 
G
K
 
R
A
 
D
T
 
I
D
 
V
L
 
Y
F
 
M
G
 
G
A
 
P
A
 
V
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
M
K
 
M
M
 
L
V
 
V
N
 
N
Q
 
Q
L
 
V
C
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
L
L
 
N
V
 
T
Q
 
V
S
 
A
I
 
M
S
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
K
F
 
L
A
 
A
M
 
K
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
M
R
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
S
 
T
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
A
G
 
R
S
 
S
W
 
G
Q
 
A
L
 
I
A
 
E
N
 
L
R
 
Y
H
 
L
E
 
P
T
 
K
M
 
L
I
 
L
D
 
K
N
 
G
E
 
D
F
 
L
D
 
S
H
 
P
G
 
G
F
|
F
A
x
K
V
 
A
D
 
E
W
x
H
M
 
L
R
 
K
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
Y
A
 
V
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
A
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
G
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
Y
Q
 
E
F
 
L
Y
 
Y
G
 
R
E
 
K
V
 
M
Q
 
V
Q
 
E
M
 
D
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
S
W
 
L
D
 
G
T
 
I
S
 
H
S
 
A
L
 
L

3ws7A The 1.18 a resolution structure of l-serine 3-dehydrogenase complexed with NADP+ and sulfate ion from the hyperthermophilic archaeon pyrobaculum calidifontis (see paper)
36% identity, 95% coverage: 3:282/294 of query aligns to 15:290/293 of 3ws7A

query
sites
3ws7A
K
 
R
V
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
x
I
M
|
M
G
 
G
Y
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
T
H
 
H
L
 
L
K
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
F
E
 
L
V
 
A
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
N
|
N
R
|
R
T
|
T
T
 
R
A
 
E
K
|
K
A
 
T
E
 
K
A
 
P
W
 
F
V
 
-
A
 
A
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
G
 
V
S
 
Y
H
 
V
A
 
A
L
 
E
T
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
A
E
 
K
G
 
R
C
 
V
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
I
T
 
V
C
x
M
V
|
V
G
x
S
N
 
D
D
 
A
D
 
P
D
|
D
L
 
V
R
 
E
S
x
Q
V
 
V
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
E
A
 
G
L
 
A
G
 
R
S
 
P
G
 
G
A
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
N
S
 
S
A
 
P
E
 
D
V
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
K
I
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
L
A
 
A
E
 
Q
N
 
Y
G
 
G
V
 
I
G
 
E
F
 
F
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
x
T
G
|
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
I
N
 
E
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
V
 
I
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
K
E
 
E
T
 
E
D
 
L
Y
 
F
A
 
H
R
 
R
A
 
L
K
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
F
D
 
K
S
 
A
Y
 
M
A
 
G
K
 
R
A
 
D
T
 
I
D
 
V
L
 
Y
F
 
M
G
 
G
A
 
P
A
 
V
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
M
K
|
K
M
 
L
V
 
V
N
 
N
Q
 
Q
L
 
V
C
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
L
L
 
N
V
 
T
Q
 
V
S
 
A
I
 
M
S
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
K
F
 
L
A
 
A
M
 
K
K
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
M
R
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
S
 
T
Q
 
A
G
 
R
A
 
S
G
 
G
G
 
A
S
 
I
W
 
E
Q
 
L
L
 
Y
A
 
L
N
 
P
R
 
K
H
 
-
E
 
-
T
 
-
M
 
L
I
 
L
D
 
K
N
 
G
E
 
D
F
 
L
D
 
S
H
 
P
G
 
G
F
|
F
A
x
K
V
 
A
D
 
E
W
x
H
M
 
L
R
 
K
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
Y
A
 
V
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
A
 
K
M
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
G
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
Y
Q
 
E
F
 
L
Y
 
Y
G
 
R
E
 
K
V
 
M
Q
 
V
Q
 
E
M
 
D
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
S
W
 
L
D
 
G
T
 
I
S
 
H
S
 
A
L
 
L

5je8B The crystal structure of bacillus cereus 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase in complex with NAD (see paper)
33% identity, 97% coverage: 1:285/294 of query aligns to 3:288/294 of 5je8B

query
sites
5je8B
M
 
M
A
 
K
K
 
K
V
 
I
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
x
N
M
|
M
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
M
 
M
A
 
S
G
 
K
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
K
A
 
S
G
 
G
H
 
Y
E
 
T
V
 
V
-
 
Y
-
 
G
V
 
V
V
x
D
Y
x
L
N
 
N
R
 
K
T
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
S
V
 
F
A
 
E
Q
 
K
H
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
I
H
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
I
R
 
S
A
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
T
C
 
C
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
F
T
 
T
C
 
S
V
x
L
G
x
P
N
 
S
D
 
P
D
 
R
D
 
A
L
 
V
R
 
E
S
 
A
V
|
V
V
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
L
L
 
F
A
 
E
A
 
N
L
 
G
G
 
H
S
 
S
G
 
N
A
 
V
I
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
T
T
x
S
T
 
T
A
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
Q
V
 
L
A
 
N
R
 
K
E
 
Q
I
 
L
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
K
E
 
E
N
 
K
G
 
K
V
 
V
G
 
D
F
 
F
V
 
L
D
 
A
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
N
G
 
R
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
S
E
 
K
T
 
D
D
 
V
Y
 
Y
A
 
E
R
 
K
A
 
T
K
 
E
P
 
S
V
 
I
M
 
M
D
 
G
S
 
-
Y
 
-
A
 
V
K
 
L
A
 
G
T
 
A
D
 
N
L
 
I
F
 
F
G
 
H
A
 
V
A
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
G
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
T
T
 
V
K
 
K
M
 
L
V
 
I
N
 
N
Q
 
N
L
 
L
C
 
L
I
 
I
A
 
G
G
 
F
L
 
Y
V
 
T
Q
 
A
S
 
G
I
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
A
L
 
L
F
 
T
F
 
L
A
 
A
M
 
K
K
 
K
A
 
N
G
 
N
L
 
M
D
 
D
A
 
L
R
 
D
K
 
K
V
 
M
A
 
F
Q
 
D
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
V
G
 
S
A
 
Y
G
 
G
G
 
Q
S
 
S
W
 
R
Q
 
I
L
 
Y
A
 
E
N
 
R
R
 
N
H
 
Y
E
 
K
T
 
S
M
 
F
I
 
I
D
 
A
N
 
P
E
 
E
-
 
N
F
 
Y
D
 
E
H
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
T
V
 
V
D
 
N
W
 
L
M
 
L
R
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
V
D
 
D
Q
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
S
G
 
E
V
 
L
S
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
M
V
 
L
D
 
L
Q
 
N
F
 
V
Y
 
Y
G
 
D
E
 
E
V
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
M
 
A
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
R
 
E
W
 
N
D
 
D
T
 
M
S
 
A
S
 
A
L
 
L
I
 
Y
Q
 
K
R
 
K

2cvzC Structure of hydroxyisobutyrate dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
36% identity, 90% coverage: 1:266/294 of query aligns to 1:260/289 of 2cvzC

query
sites
2cvzC
M
 
M
A
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
I
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
x
A
M
|
M
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
H
L
 
L
K
 
-
A
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
F
E
 
P
V
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
T
 
F
A
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
R
W
 
H
V
 
-
A
 
Q
Q
 
E
H
 
E
G
 
F
G
 
G
S
 
S
H
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
P
P
 
L
R
 
E
A
 
R
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
-
C
 
A
D
 
R
F
 
V
V
 
I
M
 
F
T
 
T
C
|
C
V
x
L
G
x
P
N
 
T
D
 
T
D
 
R
D
x
E
L
 
V
R
 
Y
S
x
E
V
 
V
V
 
A
F
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
E
G
 
A
A
 
L
L
 
Y
A
 
P
A
 
Y
L
 
L
G
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
T
I
 
Y
L
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
A
T
 
T
T
x
S
A
 
G
S
 
E
A
 
P
E
 
E
V
 
A
A
 
S
R
 
R
E
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
L
A
 
R
E
 
E
N
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
T
F
 
Y
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
V
 
V
M
 
M
C
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
E
D
 
A
Y
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
V
K
 
R
P
 
P
V
 
F
M
 
L
D
 
-
S
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
K
T
 
V
D
 
V
L
 
H
F
 
V
G
 
G
A
 
P
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
H
L
 
A
T
 
V
K
|
K
M
 
A
V
 
I
N
|
N
Q
x
N
L
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
V
L
 
N
V
 
L
Q
 
W
S
 
A
I
 
A
S
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
L
F
 
A
A
 
L
M
 
V
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
E
K
 
K
V
 
A
A
 
L
Q
 
E
L
 
V
V
 
I
S
 
N
Q
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
R
S
 
S
W
 
N
Q
 
A
L
 
T
A
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
I
H
 
P
E
 
Q
T
 
R
M
 
V
I
 
L
D
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
F
D
 
P
H
 
K
G
 
T
F
|
F
A
 
A
V
 
L
D
 
G
W
 
L
M
 
L
R
 
V
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
M
D
 
G
Q
 
V
A
 
L
K
 
D
A
 
G
M
 
E
G
 
K
V
 
A
S
 
P
L
 
S
P
 
P
V
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
R
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y

1wp4A Structure of tt368 protein from thermus thermophilus hb8 (see paper)
35% identity, 90% coverage: 3:266/294 of query aligns to 2:259/288 of 1wp4A

query
sites
1wp4A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
I
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
x
A
M
|
M
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
G
H
 
H
L
 
L
K
 
-
A
 
A
A
 
R
G
 
R
H
 
F
E
 
P
V
 
T
V
 
L
V
 
V
Y
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
T
 
F
A
 
E
K
|
K
A
 
A
E
 
L
A
 
R
W
 
H
V
 
-
A
 
Q
Q
 
E
H
 
E
G
 
F
G
 
G
S
 
S
H
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
P
P
 
L
R
 
E
A
 
R
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
-
C
 
A
D
 
R
F
 
V
V
 
I
M
 
F
T
 
T
C
|
C
V
x
L
G
x
P
N
 
T
D
 
T
D
 
R
D
x
E
L
 
V
R
 
Y
S
 
E
V
 
V
V
 
A
F
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
E
G
 
A
A
 
L
L
 
Y
A
 
P
A
 
Y
L
 
L
G
 
R
S
 
E
G
 
G
A
 
T
I
 
Y
L
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
A
T
 
T
T
x
S
A
 
G
S
 
E
A
 
P
E
 
E
V
 
A
A
 
S
R
 
R
E
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
L
A
 
R
E
 
E
N
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
T
F
 
Y
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
A
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
V
 
V
M
 
M
C
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
P
E
 
E
T
 
E
D
 
A
Y
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
V
K
 
R
P
 
P
V
 
F
M
 
L
D
 
-
S
 
A
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
K
T
 
V
D
 
V
L
 
H
F
 
V
G
 
G
A
 
P
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
H
L
 
A
T
 
V
K
|
K
M
 
A
V
 
I
N
|
N
Q
x
N
L
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
V
L
 
N
V
 
L
Q
 
W
S
 
A
I
 
A
S
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
L
F
 
A
A
 
L
M
 
V
K
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
E
K
 
K
V
 
A
A
 
L
Q
 
E
L
 
V
V
 
I
S
 
N
Q
 
A
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
R
S
 
S
W
 
N
Q
 
A
L
 
T
A
 
E
N
 
N
R
 
L
-
 
I
H
 
P
E
 
Q
T
 
R
M
 
V
I
 
L
D
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
F
D
 
P
H
 
K
G
x
T
F
|
F
A
 
A
V
 
L
D
 
G
W
 
L
M
 
L
R
 
V
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
M
D
 
G
Q
 
V
A
 
L
K
 
D
A
 
G
M
 
E
G
 
K
V
 
A
S
 
P
L
 
S
P
 
P
V
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
R
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y

P29266 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial; HIBADH; EC 1.1.1.31 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:288/294 of query aligns to 41:331/335 of P29266

query
sites
P29266
V
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
K
H
 
N
L
 
L
K
 
I
A
 
K
A
 
H
G
 
G
H
 
Y
E
 
P
V
 
L
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
N
x
D
R
 
V
T
 
F
T
 
P
A
 
D
K
 
V
A
 
C
E
 
K
A
 
E
W
 
F
V
 
-
A
 
K
Q
 
E
H
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
Q
H
 
V
A
 
A
L
 
S
T
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
K
C
 
A
D
 
D
F
 
R
V
 
I
M
 
I
T
 
T
C
 
M
V
 
L
G
 
P
N
 
S
D
 
S
D
 
M
D
 
N
L
 
S
R
 
I
S
 
E
V
 
V
V
 
Y
F
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
D
A
 
P
E
 
S
V
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
V
A
 
E
E
 
K
N
 
M
G
 
G
V
 
A
G
 
V
F
 
F
V
 
M
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
A
E
 
R
N
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
 
T
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
E
 
E
T
 
N
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
P
 
E
V
 
L
M
 
L
D
 
G
S
 
C
Y
 
M
A
 
G
K
 
S
A
 
N
T
 
V
D
 
L
L
 
Y
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
L
 
S
T
 
A
K
|
K
M
 
I
V
 
C
N
 
N
Q
x
N
L
 
M
C
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
I
L
 
S
V
 
M
Q
 
I
S
 
G
I
 
T
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
M
F
 
N
F
 
L
A
 
G
M
 
I
K
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
K
K
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
M
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
R
S
 
C
W
 
W
Q
 
S
-
 
S
-
 
D
L
 
T
A
 
Y
N
 
N
R
 
P
H
 
V
E
 
P
T
 
G
M
 
V
I
 
M
D
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
S
N
 
N
E
 
N
F
 
Y
D
 
Q
H
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
T
D
 
T
W
 
L
M
 
M
R
 
A
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
Q
D
 
D
Q
 
S
A
 
A
K
 
T
A
 
S
M
 
T
G
 
K
V
 
T
S
 
P
L
 
I
P
 
L
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
V
V
 
A
D
 
H
Q
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
G
 
R
E
 
M
V
 
M
Q
 
C
Q
 
S
M
 
K
G
 
G
G
 
Y
G
 
S
R
 
K
W
 
K
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
V
I
 
F
Q
 
Q
R
 
Y
F
 
L
R
 
R
K
 
E

2i9pB Crystal structure of human hydroxyisobutyrate dehydrogenase complexed with NAD+
29% identity, 97% coverage: 4:288/294 of query aligns to 3:293/296 of 2i9pB

query
sites
2i9pB
V
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
x
N
M
|
M
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
K
H
 
N
L
 
L
K
 
M
A
 
K
A
 
H
G
 
G
H
 
Y
E
 
P
V
 
L
V
 
I
V
 
I
Y
|
Y
N
x
D
R
x
V
T
 
F
T
 
P
A
 
D
K
 
A
A
 
C
E
 
K
A
 
E
W
 
F
V
 
-
A
 
-
Q
 
Q
H
 
D
G
 
A
G
 
G
S
 
E
H
 
Q
A
 
V
L
 
V
T
 
S
-
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
K
C
 
A
D
 
D
F
 
R
V
 
I
M
 
I
T
 
T
C
x
M
V
x
L
G
x
P
N
 
T
D
 
S
D
 
I
D
 
N
L
 
A
R
 
I
S
 
E
V
 
A
V
 
Y
F
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
|
T
A
 
I
S
 
D
A
 
P
E
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
V
A
 
E
E
 
K
N
 
M
G
 
G
V
 
A
G
 
V
F
 
F
V
 
M
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
 
S
G
|
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
A
E
 
R
N
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
 
T
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
E
 
E
T
 
D
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
P
 
E
V
 
L
M
 
L
D
 
G
S
 
C
Y
 
M
A
 
G
K
 
S
A
 
N
T
 
V
D
 
V
L
 
Y
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
A
K
 
K
M
 
I
V
 
C
N
 
N
Q
 
N
L
 
M
C
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
I
L
 
S
V
 
M
Q
 
I
S
 
G
I
 
T
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
M
F
 
N
F
 
L
A
 
G
M
 
I
K
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
K
K
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
M
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
R
S
 
C
W
 
W
Q
 
S
-
 
S
-
 
D
L
 
T
A
 
Y
N
 
N
R
 
P
H
 
V
E
 
P
T
 
G
M
 
V
I
 
M
D
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
A
N
 
N
E
 
N
F
 
Y
D
 
Q
H
 
G
G
 
G
F
|
F
A
 
G
V
 
T
D
 
T
W
 
L
M
 
M
R
 
A
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
Q
D
 
D
Q
 
S
A
 
A
K
 
T
A
 
S
M
 
T
G
 
K
V
 
S
S
 
P
L
 
I
P
 
L
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
L
V
 
A
D
 
H
Q
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
G
 
R
E
 
M
V
 
M
Q
 
C
Q
 
A
M
 
K
G
 
G
G
 
Y
G
 
S
R
 
K
W
 
K
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
V
I
 
F
Q
 
Q
R
 
F
F
 
L
R
 
R
K
 
E

P31937 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial; HIBADH; EC 1.1.1.31 from Homo sapiens (Human) (see paper)
29% identity, 97% coverage: 4:288/294 of query aligns to 42:332/336 of P31937

query
sites
P31937
V
|
V
A
x
G
F
|
F
I
|
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
x
N
M
|
M
G
|
G
Y
x
N
P
|
P
M
|
M
A
|
A
G
x
K
H
x
N
L
|
L
K
x
M
A
x
K
A
x
H
G
|
G
H
x
Y
E
x
P
V
x
L
V
x
I
V
x
I
Y
|
Y
N
 
D
R
 
V
T
 
F
T
 
P
A
 
D
K
 
A
A
 
C
E
 
K
A
 
E
W
 
F
V
 
-
A
 
-
Q
 
Q
H
 
D
G
 
A
G
 
G
S
 
E
H
 
Q
A
 
V
L
 
V
T
 
S
-
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
D
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
K
C
 
A
D
 
D
F
 
R
V
 
I
M
 
I
T
 
T
C
 
M
V
x
L
G
x
P
N
 
T
D
 
S
D
 
I
D
x
N
L
 
A
R
 
I
S
 
E
V
 
A
V
 
Y
F
 
S
G
 
G
E
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
|
T
A
 
I
S
 
D
A
 
P
E
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
V
A
 
E
E
 
K
N
 
M
G
 
G
V
 
A
G
 
V
F
 
F
V
 
M
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
A
E
 
R
N
 
S
G
 
G
Q
 
N
L
 
L
A
 
T
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
E
 
E
T
 
D
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
A
K
 
Q
P
 
E
V
 
L
M
 
L
D
 
G
S
 
C
Y
 
M
A
 
G
K
 
S
A
 
N
T
 
V
D
 
V
L
 
Y
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
A
K
 
K
M
 
I
V
 
C
N
 
N
Q
 
N
L
 
M
C
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
I
L
 
S
V
 
M
Q
 
I
S
 
G
I
 
T
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
M
F
 
N
F
 
L
A
 
G
M
 
I
K
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
K
K
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
M
G
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
R
S
 
C
W
 
W
Q
 
S
-
 
S
-
 
D
L
 
T
A
 
Y
N
 
N
R
 
P
H
 
V
E
 
P
T
 
G
M
 
V
I
 
M
D
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
A
N
 
N
E
 
N
F
 
Y
D
 
Q
H
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
G
V
 
T
D
 
T
W
 
L
M
 
M
R
 
A
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
Q
D
 
D
Q
 
S
A
 
A
K
 
T
A
 
S
M
 
T
G
 
K
V
 
S
S
 
P
L
 
I
P
 
L
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
L
V
 
A
D
 
H
Q
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
G
 
R
E
 
M
V
 
M
Q
 
C
Q
 
A
M
 
K
G
 
G
G
 
Y
G
 
S
R
 
K
W
 
K
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
V
I
 
F
Q
 
Q
R
 
F
F
 
L
R
 
R
K
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9V8 3-sulfolactaldehyde reductase; SLA reductase; 4-hydroxybutyrate dehydrogenase; Gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase; GHBDH; Succinic semialdehyde reductase; SSA reductase; EC 1.1.1.373; EC 1.1.1.61 from Escherichia coli (strain K12)
30% identity, 98% coverage: 1:287/294 of query aligns to 1:287/298 of P0A9V8

query
sites
P0A9V8
M
 
M
A
 
A
K
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
x
Q
M
|
M
G
 
G
Y
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
S
H
 
N
L
 
L
K
 
L
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
V
 
L
V
 
R
V
 
V
Y
 
F
N
x
D
R
 
-
T
 
V
T
 
N
A
 
A
K
 
E
A
 
A
E
 
V
A
 
R
W
 
H
V
 
L
A
 
V
Q
 
D
H
 
K
G
 
G
G
 
A
S
 
T
H
 
P
A
 
A
L
 
A
T
 
N
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
D
C
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
I
M
 
I
T
 
T
C
 
M
V
x
L
G
 
P
N
 
N
D
 
G
D
 
D
D
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
V
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
C
A
 
E
A
 
G
L
 
L
G
 
S
S
 
T
G
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
|
T
A
 
I
S
 
H
A
 
P
E
 
L
V
 
Q
A
 
T
R
 
D
E
 
K
I
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
M
A
 
Q
E
 
A
N
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
S
F
 
M
V
 
M
D
 
D
G
 
V
P
 
P
V
 
V
S
x
G
G
x
R
G
x
T
Q
 
S
A
 
A
G
 
N
A
 
A
E
 
I
N
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
L
V
 
L
M
 
L
C
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
A
T
 
E
D
 
Q
Y
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
T
P
 
P
V
 
I
M
 
L
D
 
-
S
 
-
Y
 
M
A
 
A
K
 
M
A
 
G
T
 
S
D
 
E
L
 
L
F
 
I
G
 
N
A
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
Q
 
M
-
 
G
-
 
I
L
 
R
T
 
V
K
 
K
M
 
L
V
 
I
N
|
N
Q
x
N
L
x
Y
C
x
M
I
x
S
A
 
I
G
 
A
L
 
L
V
 
N
Q
 
A
S
 
L
I
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
A
F
 
V
F
 
L
A
 
C
M
 
E
K
 
A
A
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
P
A
 
F
R
 
D
K
 
V
V
 
A
A
 
V
Q
 
K
L
 
V
V
 
M
S
 
S
Q
 
G
G
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
K
W
 
G
Q
 
H
L
 
F
A
 
T
N
 
T
R
 
S
-
 
W
H
 
P
E
 
N
T
 
K
M
 
V
I
 
L
D
 
S
N
 
G
E
 
D
F
 
L
D
 
S
H
 
P
G
 
A
F
 
F
A
 
M
V
 
I
D
 
D
W
 
L
M
 
A
R
 
H
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
Q
M
 
L
G
 
H
V
 
V
S
 
P
L
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
S
D
 
R
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y
G
 
S
E
 
Q
V
 
A
Q
 
R
Q
 
A
M
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
R
 
R
W
 
Q
D
 
D
T
 
W
S
 
S
S
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
E
R
 
Q
F
 
V
R
 
R

3pduA Crystal structure of gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase from geobacter sulfurreducens in complex with NADP+ (see paper)
28% identity, 97% coverage: 1:284/294 of query aligns to 1:283/287 of 3pduA

query
sites
3pduA
M
 
M
A
 
T
K
 
T
V
 
Y
A
 
G
F
 
F
I
 
L
G
|
G
L
 
L
G
|
G
V
x
I
M
|
M
G
 
G
Y
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
A
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
G
H
 
F
E
 
D
V
 
V
V
 
T
V
 
V
Y
 
W
N
|
N
R
|
R
T
x
N
T
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
C
E
 
A
A
 
P
W
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
L
H
 
-
G
 
G
G
 
A
S
 
R
H
 
Q
A
 
A
L
 
S
T
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
C
E
 
A
G
 
A
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
T
M
 
I
T
 
A
C
x
M
V
x
L
G
x
A
N
 
D
D
 
P
D
 
A
D
x
A
L
 
A
R
 
R
S
 
E
V
 
V
V
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
A
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
R
I
 
G
L
 
Y
V
 
I
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
|
T
A
 
V
S
 
D
A
 
D
E
 
E
V
 
T
A
 
S
R
 
T
E
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
T
E
 
A
N
 
R
G
 
G
V
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
E
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
 
S
G
|
G
G
x
T
Q
 
K
A
 
K
G
 
P
A
 
A
E
 
E
N
 
D
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
I
M
 
L
C
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
D
E
 
Q
T
 
S
D
 
L
Y
 
F
A
 
T
R
 
D
A
 
A
K
 
G
P
 
P
V
 
A
M
 
F
D
 
A
S
 
A
Y
 
L
A
 
G
K
 
K
A
 
K
T
 
C
D
 
L
L
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
Q
 
A
L
 
R
T
 
M
K
|
K
M
 
L
V
 
V
N
 
V
Q
 
N
L
 
M
C
 
I
I
 
M
A
 
G
G
 
Q
L
 
M
V
 
M
Q
 
T
S
 
A
I
 
L
S
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
M
F
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
R
K
 
N
A
 
C
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
G
K
 
Q
V
 
L
A
 
L
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
S
 
D
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
M
G
 
A
S
 
N
W
 
P
Q
 
M
L
 
F
A
 
K
N
 
G
R
 
K
H
 
G
E
 
Q
T
 
M
M
 
L
I
 
L
D
 
S
N
 
G
E
 
E
F
 
F
D
 
P
H
 
T
G
x
S
F
|
F
A
x
P
V
 
L
D
 
K
W
x
H
M
 
M
R
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
x
R
I
 
L
A
 
A
L
 
V
D
x
E
Q
 
L
A
 
G
K
 
D
A
x
R
M
 
L
G
 
G
V
 
Q
S
 
P
L
 
L
P
 
H
V
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
A
D
 
N
Q
 
E
F
 
S
Y
 
F
G
 
K
E
 
R
V
 
A
Q
 
R
Q
 
A
M
 
A
G
 
G
G
 
H
G
 
A
R
 
D
W
 
E
D
 
D
T
 
F
S
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
F
Q
 
R

6smyA Crystal structure of sla reductase yihu from e. Coli with nadh and product dhps
30% identity, 97% coverage: 2:287/294 of query aligns to 1:286/294 of 6smyA

query
sites
6smyA
A
 
A
K
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
M
 
M
G
 
G
Y
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
S
H
 
N
L
 
L
K
 
L
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
V
 
L
V
 
R
V
 
V
Y
 
F
N
 
D
R
 
-
T
 
V
T
 
N
A
 
A
K
 
E
A
 
A
E
 
V
A
 
R
W
 
H
V
 
L
A
 
V
Q
 
D
H
 
K
G
 
G
G
 
A
S
 
T
H
 
P
A
 
A
L
 
A
T
 
N
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
D
C
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
I
M
 
I
T
 
T
C
 
M
V
 
L
G
 
P
N
 
N
D
 
G
D
 
D
D
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
 
V
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
C
A
 
E
A
 
G
L
 
L
G
 
S
S
 
T
G
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
H
A
 
P
E
 
L
V
 
Q
A
 
T
R
 
D
E
 
K
I
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
M
A
 
Q
E
 
A
N
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
S
F
 
M
V
 
M
D
 
D
G
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
G
G
 
R
G
 
T
Q
 
S
A
 
A
G
 
N
A
 
A
E
 
I
N
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
L
V
 
L
M
 
L
C
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
A
T
 
E
D
 
Q
Y
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
T
P
 
P
V
 
I
M
 
L
D
 
-
S
 
-
Y
 
M
A
 
A
K
 
M
A
 
G
T
 
S
D
 
E
L
 
L
F
 
I
G
 
N
A
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
Q
 
M
-
 
G
-
 
I
L
 
R
T
 
V
K
 
K
M
 
L
V
 
I
N
 
N
Q
 
N
L
 
Y
C
 
M
I
 
S
A
 
I
G
 
A
L
 
L
V
 
N
Q
 
A
S
 
L
I
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
A
F
 
V
F
 
L
A
 
C
M
 
E
K
 
A
A
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
P
A
 
F
R
 
D
K
 
V
V
 
A
A
 
V
Q
 
K
L
 
V
V
 
M
S
 
S
Q
 
G
G
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
K
W
 
G
Q
 
H
L
 
F
A
 
T
N
 
T
R
 
S
-
 
W
H
 
P
E
 
N
T
 
K
M
 
V
I
 
L
D
 
S
N
 
G
E
 
D
F
 
L
D
 
S
H
 
P
G
 
A
F
|
F
A
 
M
V
 
I
D
 
D
W
 
L
M
 
A
R
 
H
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
Q
M
 
L
G
 
H
V
 
V
S
 
P
L
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
S
D
 
R
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y
G
 
S
E
 
Q
V
 
A
Q
 
R
Q
 
A
M
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
R
 
R
W
 
Q
D
 
D
T
x
W
S
 
S
S
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
E
R
 
Q
F
 
V
R
 
R

6smzC Crystal structure of sla reductase yihu from e. Coli in complex with nadh
30% identity, 97% coverage: 2:287/294 of query aligns to 1:286/295 of 6smzC

query
sites
6smzC
A
 
A
K
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
x
Q
M
|
M
G
 
G
Y
 
S
P
 
P
M
 
M
A
 
A
G
 
S
H
 
N
L
 
L
K
 
L
A
 
Q
A
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
V
 
L
V
 
R
V
 
V
Y
x
F
N
x
D
R
 
-
T
x
V
T
 
N
A
 
A
K
 
E
A
 
A
E
 
V
A
 
R
W
 
H
V
 
L
A
 
V
Q
 
D
H
 
K
G
 
G
G
 
A
S
 
T
H
 
P
A
 
A
L
 
A
T
 
N
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
D
C
 
A
D
 
E
F
 
F
V
 
I
M
 
I
T
 
T
C
x
M
V
x
L
G
 
P
N
 
N
D
 
G
D
 
D
D
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
N
V
|
V
V
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
C
A
 
E
A
 
G
L
 
L
G
 
S
S
 
T
G
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
M
T
x
S
T
|
T
A
 
I
S
 
H
A
 
P
E
 
L
V
 
Q
A
 
T
R
 
D
E
 
K
I
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
M
A
 
Q
E
 
A
N
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
S
F
 
M
V
 
M
D
 
D
G
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
G
G
x
R
G
 
T
Q
 
S
A
 
A
G
 
N
A
 
A
E
 
I
N
 
T
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
L
V
 
L
M
 
L
C
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
E
 
A
T
 
E
D
 
Q
Y
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
T
P
 
P
V
 
I
M
 
L
D
 
-
S
 
-
Y
 
M
A
 
A
K
 
M
A
 
G
T
 
S
D
 
E
L
 
L
F
 
I
G
 
N
A
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
G
Q
 
M
-
 
G
-
 
I
L
 
R
T
 
V
K
 
K
M
 
L
V
 
I
N
 
N
Q
 
N
L
 
Y
C
 
M
I
 
S
A
 
I
G
 
A
L
 
L
V
 
N
Q
 
A
S
 
L
I
 
S
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
A
F
 
V
F
 
L
A
 
C
M
 
E
K
 
A
A
 
L
G
 
N
L
 
L
D
 
P
A
 
F
R
 
D
K
 
V
V
 
A
A
 
V
Q
 
K
L
 
V
V
 
M
S
 
S
Q
 
G
G
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
K
W
 
G
Q
 
H
L
 
F
A
 
T
N
 
T
R
 
S
-
 
W
H
 
P
E
 
N
T
 
K
M
 
V
I
 
L
D
 
S
N
 
G
E
 
D
F
 
L
D
 
S
H
 
P
G
 
A
F
 
F
A
 
M
V
 
I
D
 
D
W
 
L
M
 
A
R
 
H
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
Q
 
V
A
 
A
K
 
N
A
 
Q
M
 
L
G
 
H
V
 
V
S
 
P
L
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
S
D
 
R
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y
G
 
S
E
 
Q
V
 
A
Q
 
R
Q
 
A
M
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
R
 
R
W
 
Q
D
 
D
T
 
W
S
 
S
S
 
A
L
 
I
I
 
L
Q
 
E
R
 
Q
F
 
V
R
 
R

3pefA Crystal structure of gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase from geobacter metallireducens in complex with NADP+ (see paper)
29% identity, 97% coverage: 3:288/294 of query aligns to 3:287/287 of 3pefA

query
sites
3pefA
K
 
K
V
 
F
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
x
I
M
|
M
G
 
G
Y
 
S
P
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
K
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
C
E
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
I
Y
 
W
N
|
N
R
|
R
T
x
S
T
 
P
A
 
E
K
|
K
A
 
A
E
 
E
A
 
E
W
 
-
V
 
L
A
 
A
Q
 
A
H
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
E
H
 
R
A
 
A
L
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
C
A
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
E
G
 
S
C
 
C
D
 
P
F
 
V
V
 
T
M
 
F
T
 
A
C
x
M
V
x
L
G
x
A
N
x
D
D
 
P
D
 
A
D
x
A
L
 
A
R
 
E
S
x
E
V
 
V
V
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
K
E
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
I
G
 
G
S
 
E
G
 
G
A
 
R
I
 
G
L
 
Y
V
 
V
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
|
T
A
 
V
S
 
D
A
 
P
E
 
A
V
 
T
A
 
S
R
 
Q
E
 
R
I
 
I
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
V
E
 
A
N
 
K
G
 
G
V
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
E
G
 
A
P
 
P
V
|
V
S
 
S
G
|
G
G
x
S
Q
 
K
A
 
K
G
 
P
A
 
A
E
 
E
N
 
D
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
A
 
I
V
 
I
M
 
L
C
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
D
E
 
R
T
 
N
D
 
L
Y
 
Y
A
 
D
R
 
E
A
 
A
K
 
M
P
 
P
V
 
G
M
 
F
D
 
E
S
 
K
Y
 
M
A
 
G
K
 
K
A
 
K
T
 
I
D
 
I
L
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
T
 
M
K
|
K
M
 
L
V
 
V
N
 
V
Q
x
N
L
 
M
C
 
V
I
x
M
A
 
G
G
 
G
L
 
M
V
 
M
Q
 
A
S
 
C
I
 
F
S
 
C
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
G
M
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
A
A
 
T
R
 
D
K
 
A
V
 
I
A
x
L
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
S
x
G
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
M
G
 
A
S
x
N
W
 
P
Q
 
M
L
 
F
A
|
A
N
 
L
R
 
K
H
 
G
E
 
G
T
 
L
M
 
I
I
 
R
D
 
D
N
 
R
E
 
N
F
 
F
D
 
A
H
 
P
G
x
A
F
|
F
A
 
P
V
 
L
D
 
K
W
x
H
M
 
M
R
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
x
R
I
 
L
A
 
A
L
 
V
D
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
R
M
 
V
G
 
G
V
 
Q
S
 
P
L
 
L
P
 
V
V
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
N
Q
 
E
F
 
L
Y
 
F
G
 
K
E
 
G
V
 
A
Q
x
R
Q
 
A
M
 
A
G
 
G
G
 
F
G
 
G
R
 
D
W
 
E
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
A
L
 
I
I
 
F
Q
 
K
R
 
T
F
 
Y
R
 
E
K
 
R

2uyyA Structure of the cytokine-like nuclear factor n-pac
25% identity, 97% coverage: 3:286/294 of query aligns to 8:290/292 of 2uyyA

query
sites
2uyyA
K
 
K
V
 
I
A
 
G
F
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
V
x
L
M
|
M
G
 
G
Y
 
S
P
 
G
M
 
I
A
 
V
G
 
S
H
 
N
L
 
L
K
 
L
A
 
K
A
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
V
Y
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
T
 
A
A
 
E
K
 
K
A
 
C
E
 
D
A
 
L
W
 
F
V
 
I
A
 
-
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
G
 
A
S
 
R
H
 
L
A
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
S
G
 
T
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
T
M
 
F
T
 
A
C
 
C
V
|
V
G
x
S
N
 
D
D
 
P
D
 
K
D
x
A
L
 
A
R
 
K
S
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
E
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
R
S
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
C
L
 
Y
V
 
V
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
|
T
A
 
V
S
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
T
A
 
V
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
A
 
I
A
 
V
E
 
S
N
 
R
G
 
G
V
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
E
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
N
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
S
E
 
N
N
 
D
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
A
 
V
V
 
I
M
 
L
C
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
D
E
 
R
T
 
G
D
 
L
Y
 
Y
A
 
E
R
 
D
A
 
C
K
 
S
P
 
S
V
 
C
M
 
F
D
 
Q
S
 
A
Y
 
M
A
 
G
K
 
K
A
 
T
T
 
S
D
 
F
L
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
N
G
 
A
Q
 
A
L
 
K
T
 
M
K
 
M
M
 
L
V
 
I
N
 
V
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
Q
A
 
G
G
 
S
L
 
F
V
 
M
Q
 
A
S
 
T
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
T
F
 
L
A
 
A
M
 
Q
K
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
Q
D
 
S
A
 
Q
R
 
Q
K
 
T
V
 
L
A
 
L
Q
 
D
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Q
G
 
L
G
 
A
S
 
S
W
 
I
Q
 
F
L
 
L
A
 
D
N
 
Q
R
 
K
H
 
C
E
 
Q
T
 
N
M
 
I
I
 
L
D
 
Q
N
 
G
E
 
N
F
 
F
D
 
K
H
 
P
G
 
D
F
|
F
A
x
Y
V
 
L
D
 
K
W
x
Y
M
 
I
R
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
I
D
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
V
G
 
N
V
 
H
S
 
P
L
 
T
P
 
P
V
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
N
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y
G
 
K
E
 
R
V
 
A
Q
 
K
Q
 
A
M
 
L
G
 
D
G
 
Q
G
 
S
R
 
D
W
 
N
D
 
D
T
 
M
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
Y
Q
 
R
R
 
A
F
 
Y

Q49A26 Cytokine-like nuclear factor N-PAC; NPAC; 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase-like protein; Glyoxylate reductase 1 homolog; Nuclear protein NP60; Nuclear protein of 60 kDa; Nucleosome-destabilizing factor; hNDF; Putative oxidoreductase GLYR1 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
25% identity, 97% coverage: 3:286/294 of query aligns to 269:551/553 of Q49A26

query
sites
Q49A26
K
 
K
V
 
I
A
x
G
F
|
F
I
x
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
V
x
L
M
|
M
G
|
G
Y
x
S
P
x
G
M
x
I
A
x
V
G
x
S
H
x
N
L
 
L
K
 
L
A
 
K
A
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
V
Y
 
W
N
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
A
A
 
E
K
 
K
A
 
C
E
 
D
A
 
L
W
 
F
V
 
I
A
 
-
Q
 
Q
H
 
E
G
 
G
G
 
A
S
 
R
H
 
L
A
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
S
G
 
T
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
T
M
 
F
T
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
S
N
 
D
D
 
P
D
 
K
D
 
A
L
 
A
R
 
K
S
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
E
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
R
S
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
C
L
 
Y
V
 
V
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
|
T
A
 
V
S
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
T
A
 
V
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
A
 
I
A
 
V
E
 
S
N
 
R
G
 
G
V
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
E
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
N
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
S
E
 
N
N
 
D
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
A
 
V
V
 
I
M
 
L
C
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
D
E
 
R
T
 
G
D
 
L
Y
 
Y
A
 
E
R
 
D
A
 
C
K
 
S
P
 
S
V
 
C
M
 
F
D
 
Q
S
 
A
Y
 
M
A
 
G
K
 
K
A
 
T
T
 
S
D
 
F
L
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
N
G
 
A
Q
 
A
L
 
K
T
 
M
K
x
M
M
 
L
V
 
I
N
 
V
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
Q
A
 
G
G
 
S
L
 
F
V
 
M
Q
 
A
S
 
T
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
T
F
 
L
A
 
A
M
 
Q
K
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
Q
D
 
S
A
 
Q
R
 
Q
K
 
T
V
 
L
A
 
L
Q
 
D
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Q
G
 
L
G
 
A
S
 
S
W
 
I
Q
 
F
L
 
L
A
 
D
N
 
Q
R
 
K
H
 
C
E
 
Q
T
 
N
M
 
I
I
 
L
D
 
Q
N
 
G
E
 
N
F
 
F
D
 
K
H
x
P
G
 
D
F
 
F
A
 
Y
V
 
L
D
 
K
W
 
Y
M
 
I
R
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
I
D
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
V
G
 
N
V
 
H
S
 
P
L
 
T
P
 
P
V
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
N
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y
G
 
K
E
 
R
V
 
A
Q
 
K
Q
 
A
M
 
L
G
 
D
G
 
Q
G
 
S
R
 
D
W
 
N
D
 
D
T
 
M
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
Y
Q
 
R
R
 
A
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q922P9 Cytokine-like nuclear factor N-PAC; NPAC; Glyoxylate reductase 1 homolog; Nuclear protein NP60; Putative oxidoreductase GLYR1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
25% identity, 97% coverage: 3:286/294 of query aligns to 268:544/546 of Q922P9

query
sites
Q922P9
K
 
K
V
 
I
A
 
G
F
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
M
 
M
G
 
G
Y
 
S
P
 
G
M
 
I
A
 
V
G
 
S
H
 
N
L
 
L
K
 
L
A
 
K
A
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
T
V
 
V
V
 
T
V
 
V
Y
 
W
N
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
A
A
 
E
K
 
K
A
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
E
G
 
G
G
 
A
S
 
R
H
 
L
A
 
G
L
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
V
E
 
S
G
 
T
C
 
C
D
 
D
F
 
I
V
 
T
M
 
F
T
 
A
C
 
C
V
 
V
G
 
S
N
 
D
D
 
P
D
 
K
D
 
A
L
 
A
R
 
K
S
 
D
V
 
L
V
 
V
F
 
L
G
 
G
E
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
L
 
I
G
 
R
S
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
C
L
 
Y
V
 
V
D
 
D
H
 
M
T
 
S
T
 
T
A
 
V
S
 
D
A
 
A
E
 
D
V
 
T
A
 
V
R
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
A
 
I
A
 
V
E
 
S
N
 
R
G
 
G
V
 
G
G
 
R
F
 
F
V
 
L
D
 
E
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
N
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
L
A
 
S
E
 
N
N
 
D
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
A
 
V
V
 
I
M
 
L
C
 
A
G
 
A
G
 
G
T
 
D
E
 
R
T
 
G
D
 
L
Y
 
Y
A
 
E
R
 
D
A
 
C
K
 
S
P
 
S
V
 
C
M
 
F
D
 
Q
S
 
A
Y
 
M
A
 
G
K
 
K
A
 
T
T
 
S
D
 
F
L
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
N
G
 
A
Q
 
A
L
 
K
T
 
M
K
 
M
M
 
L
V
 
I
N
 
V
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
Q
A
 
G
G
 
S
L
 
F
V
 
M
Q
 
A
S
 
T
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
T
F
 
L
A
 
A
M
 
Q
K
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
Q
D
 
S
A
 
Q
R
 
Q
K
 
T
V
 
L
A
 
L
Q
 
D
L
 
I
V
 
L
S
 
N
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Q
G
 
L
G
 
A
S
 
S
W
 
I
Q
 
F
L
 
L
A
 
D
N
 
Q
R
 
K
H
 
C
E
 
Q
T
 
N
M
 
I
I
 
L
D
 
Q
N
 
G
E
 
N
F
 
F
D
 
K
H
x
P
G
 
D
F
 
F
A
 
Y
V
 
L
D
 
K
W
 
Y
M
 
I
R
 
Q
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
R
I
 
L
A
 
A
L
 
I
D
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
A
M
 
V
G
 
N
V
 
H
S
 
P
L
 
T
P
 
P
V
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
A
D
 
N
Q
 
E
F
 
V
Y
 
Y
G
 
K
E
 
R
V
 
A
Q
 
K
Q
 
A
M
 
L
G
 
D
G
 
Q
G
 
S
R
 
D
W
 
N
D
 
D
T
 
M
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
Y
Q
 
R
R
 
A
F
 
Y

5y8lB Mycobacterium tuberculosis 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (mthibadh) + NAD +(s)-3-hydroxyisobutyrate (s-hiba) (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:287/294 of query aligns to 1:289/290 of 5y8lB

query
sites
5y8lB
M
 
M
A
 
T
K
 
T
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
L
G
|
G
L
 
L
G
|
G
V
x
N
M
|
M
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
M
 
M
A
 
S
G
 
A
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
V
V
 
V
V
 
R
V
 
G
Y
x
F
N
x
D
R
x
P
T
 
A
T
 
P
A
 
T
K
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
G
W
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
H
H
 
G
G
 
V
G
 
A
S
 
V
H
 
F
A
 
R
L
 
S
T
 
A
P
 
P
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
-
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
I
T
 
T
C
x
M
V
x
L
G
 
P
N
 
T
D
 
G
D
 
E
D
 
V
L
 
V
R
 
R
S
 
R
V
 
C
V
 
Y
F
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
R
S
 
P
G
 
A
A
 
T
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
|
T
A
 
I
S
 
S
A
 
V
E
 
T
V
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
S
N
 
H
G
 
G
V
 
M
G
 
L
F
 
Q
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
x
T
L
 
L
A
 
A
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
T
Y
 
L
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
R
P
 
P
V
 
V
M
 
L
D
x
E
S
 
P
Y
 
M
A
|
A
K
x
G
A
x
K
T
 
I
D
 
I
L
 
H
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
A
K
|
K
M
 
V
V
 
C
N
 
N
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
V
L
 
Q
V
 
Q
Q
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
F
F
 
V
F
 
L
A
 
A
M
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
S
 
T
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
N
S
 
C
W
|
W
Q
 
A
L
 
V
A
 
H
N
 
T
R
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
V
H
 
P
E
 
T
T
 
S
M
 
P
I
 
A
D
 
N
N
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
K
H
 
P
G
 
G
F
|
F
A
 
S
V
 
T
D
 
A
W
x
L
M
 
M
R
 
N
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
H
V
 
A
D
 
A
Q
 
D
F
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
V
 
F
Q
 
A
Q
 
A
M
 
-
G
 
D
G
 
H
G
 
A
R
 
D
W
 
L
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
I
Q
 
H
R
 
T
F
 
L
R
 
R

5y8kA Mycobacterium tuberculosis 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (mthibadh) + l-serine (see paper)
32% identity, 98% coverage: 1:287/294 of query aligns to 1:289/290 of 5y8kA

query
sites
5y8kA
M
 
M
A
 
T
K
 
T
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
M
 
M
A
 
S
G
 
A
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
V
V
 
V
V
 
R
V
 
G
Y
 
F
N
 
D
R
 
P
T
 
A
T
 
P
A
 
T
K
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
G
W
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
H
H
 
G
G
 
V
G
 
A
S
 
V
H
 
F
A
 
R
L
 
S
T
 
A
P
 
P
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
-
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
I
T
 
T
C
 
M
V
 
L
G
 
P
N
 
T
D
 
G
D
 
E
D
 
V
L
 
V
R
 
R
S
 
R
V
 
C
V
 
Y
F
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
R
S
 
P
G
 
A
A
 
T
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
|
T
A
 
I
S
 
S
A
 
V
E
 
T
V
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
S
N
 
H
G
 
G
V
 
M
G
 
L
F
 
Q
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
T
Y
 
L
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
x
R
P
 
P
V
 
V
M
 
L
D
x
E
S
 
P
Y
 
M
A
|
A
K
x
G
A
 
K
T
x
I
D
 
I
L
 
H
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
A
K
|
K
M
 
V
V
 
C
N
 
N
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
V
L
 
Q
V
 
Q
Q
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
F
F
 
V
F
 
L
A
 
A
M
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
S
 
T
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
N
S
 
C
W
 
W
Q
 
A
L
 
V
A
 
H
N
 
T
R
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
V
H
 
P
E
 
T
T
 
S
M
 
P
I
 
A
D
 
N
N
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
K
H
 
P
G
 
G
F
|
F
A
 
S
V
 
T
D
 
A
W
x
L
M
 
M
R
 
N
K
|
K
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
H
V
 
A
D
 
A
Q
 
D
F
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
V
 
F
Q
 
A
Q
 
A
M
 
-
G
 
D
G
 
H
G
 
A
R
 
D
W
 
L
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
I
Q
 
H
R
 
T
F
 
L
R
 
R

5y8hA Mycobacterium tuberculosis 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (mthibadh) + NAD+ (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:287/294 of query aligns to 3:288/291 of 5y8hA

query
sites
5y8hA
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
L
G
|
G
L
 
L
G
|
G
V
x
N
M
|
M
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
M
 
M
A
 
S
G
 
A
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
V
V
 
V
V
 
R
V
 
G
Y
x
F
N
x
D
R
x
P
T
 
A
T
 
P
A
 
T
K
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
G
W
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
H
H
 
G
G
 
V
G
 
A
S
 
V
H
 
F
A
 
R
L
 
S
T
 
A
P
 
P
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
-
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
I
T
 
T
C
x
M
V
x
L
G
 
P
N
 
T
D
 
G
D
 
E
D
 
V
L
 
V
R
 
R
S
 
R
V
 
C
V
 
Y
F
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
R
S
 
P
G
 
A
A
 
T
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
V
E
 
T
V
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
S
N
 
H
G
 
G
V
 
M
G
 
L
F
 
Q
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
T
Y
 
L
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
x
R
P
 
P
V
 
V
M
 
L
D
x
E
S
 
P
Y
 
M
A
|
A
K
 
G
A
x
K
T
 
I
D
 
I
L
 
H
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
A
K
 
K
M
 
V
V
 
C
N
 
N
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
V
L
 
Q
V
 
Q
Q
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
F
F
 
V
F
 
L
A
 
A
M
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
S
 
T
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
N
S
 
C
W
 
W
Q
 
A
L
 
V
A
 
H
N
 
T
R
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
V
H
 
P
E
 
T
T
 
S
M
 
P
I
 
A
D
 
N
N
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
K
H
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
S
V
 
T
D
 
A
W
x
L
M
 
M
R
 
N
K
|
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
H
V
 
A
D
 
A
Q
 
D
F
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
V
 
F
Q
 
A
Q
 
A
M
 
-
G
 
D
G
 
H
G
 
A
R
 
D
W
 
L
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
I
Q
 
H
R
 
T
F
 
L
R
 
R

5y8iA Mycobacterium tuberculosis 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (mthibadh) + (s)-3-hydroxyisobutyrate (s-hiba) (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:287/294 of query aligns to 3:288/292 of 5y8iA

query
sites
5y8iA
V
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
N
M
 
M
G
 
G
Y
 
A
P
 
P
M
 
M
A
 
S
G
 
A
H
 
N
L
 
L
K
 
V
A
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
H
E
 
V
V
 
V
V
 
R
V
 
G
Y
 
F
N
 
D
R
 
P
T
 
A
T
 
P
A
 
T
K
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
G
W
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
H
H
 
G
G
 
V
G
 
A
S
 
V
H
 
F
A
 
R
L
 
S
T
 
A
P
 
P
R
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
-
D
 
D
F
 
V
V
 
V
M
 
I
T
 
T
C
 
M
V
 
L
G
 
P
N
 
T
D
 
G
D
 
E
D
 
V
L
 
V
R
 
R
S
 
R
V
 
C
V
 
Y
F
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
T
G
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
G
 
R
S
 
P
G
 
A
A
 
T
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
D
H
 
S
T
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
V
E
 
T
V
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
S
N
 
H
G
 
G
V
 
M
G
 
L
F
 
Q
V
 
L
D
 
D
G
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
A
N
 
A
G
 
A
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
F
M
 
M
C
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
T
Y
 
L
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
R
P
 
P
V
 
V
M
 
L
D
x
E
S
 
P
Y
 
M
A
|
A
K
 
G
A
x
K
T
x
I
D
 
I
L
 
H
F
 
C
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
T
 
A
K
 
K
M
 
V
V
 
C
N
 
N
Q
 
N
L
 
M
C
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
V
L
 
Q
V
 
Q
Q
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
F
F
 
V
F
 
L
A
 
A
M
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
S
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
S
 
T
Q
 
G
G
 
A
A
 
T
G
 
G
G
 
N
S
 
C
W
 
W
Q
 
A
L
 
V
A
 
H
N
 
T
R
 
N
-
 
C
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
V
H
 
P
E
 
T
T
 
S
M
 
P
I
 
A
D
 
N
N
 
N
E
 
D
F
 
F
D
 
K
H
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
S
V
 
T
D
 
A
W
 
L
M
 
M
R
 
N
K
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
A
A
 
V
K
 
A
A
 
A
M
 
T
G
 
G
V
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
G
A
 
S
L
 
H
V
 
A
D
 
A
Q
 
D
F
 
I
Y
 
Y
G
 
A
E
 
K
V
 
F
Q
 
A
Q
 
A
M
 
-
G
 
D
G
 
H
G
 
A
R
 
D
W
 
L
D
 
D
T
 
F
S
 
S
S
 
A
L
 
V
I
 
I
Q
 
H
R
 
T
F
 
L
R
 
R

Query Sequence

>3609664 FitnessBrowser__Dino:3609664
MAKVAFIGLGVMGYPMAGHLKAAGHEVVVYNRTTAKAEAWVAQHGGSHALTPRAAAEGCD
FVMTCVGNDDDLRSVVFGEEGALAALGSGAILVDHTTASAEVAREIAAAAAENGVGFVDG
PVSGGQAGAENGQLAVMCGGTETDYARAKPVMDSYAKATDLFGAAGAGQLTKMVNQLCIA
GLVQSISEGLFFAMKAGLDARKVAQLVSQGAGGSWQLANRHETMIDNEFDHGFAVDWMRK
DLGIALDQAKAMGVSLPVAALVDQFYGEVQQMGGGRWDTSSLIQRFRKMDGQDV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory