SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609950 FitnessBrowser__Dino:3609950 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P14611 Acetyl-CoA acetyltransferase; Acetoacetyl-CoA thiolase; Beta-ketothiolase; EC 2.3.1.9 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
49% identity, 98% coverage: 6:392/394 of query aligns to 3:391/393 of P14611

query
sites
P14611
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
V
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
K
T
 
I
A
 
P
P
 
A
I
 
P
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
V
V
 
V
A
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
K
G
 
P
A
 
E
Q
 
Q
I
 
V
G
 
S
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
M
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
N
 
-
T
 
T
E
 
A
P
 
G
R
 
S
D
 
G
M
 
Q
Y
 
N
L
 
P
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
M
T
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
M
N
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
K
L
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
M
S
 
L
V
 
A
I
 
A
Q
 
N
S
 
A
L
 
I
M
 
M
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
F
 
I
G
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
V
M
 
L
P
 
P
V
 
G
A
 
S
R
 
R
W
 
D
G
 
G
Q
 
F
K
 
R
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
K
A
 
L
M
 
V
D
 
D
-
 
T
M
 
M
M
 
I
L
 
V
G
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
W
C
 
D
P
 
V
F
 
Y
G
 
N
T
 
Q
G
 
Y
H
|
H
M
 
M
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
R
A
 
E
D
 
A
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
K
F
 
F
N
 
D
S
 
E
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
L
V
 
I
K
 
P
V
 
Q
K
 
R
R
 
K
-
 
G
D
 
D
M
 
P
V
 
V
D
 
A
F
 
F
V
 
K
R
 
T
D
 
D
E
 
E
H
x
F
P
 
V
K
x
R
P
 
Q
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
P
V
 
A
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
M
R
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
L
A
 
A
R
 
T
I
 
I
L
 
K
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
H
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
K
A
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
R
T
 
A
D
 
E
L
 
W
S
 
T
V
 
P
S
 
Q
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
M
E
 
E
S
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
H
K
 
Q
G
 
Q
L
 
M
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
T
A
 
S
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
C
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
H
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
D
G
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
S
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
V
E
 
E

5f38D X-ray crystal structure of a thiolase from escherichia coli at 1.8 a resolution (see paper)
50% identity, 98% coverage: 5:392/394 of query aligns to 4:393/394 of 5f38D

query
sites
5f38D
Q
 
K
D
 
N
I
 
C
V
 
V
I
 
I
L
 
V
D
 
S
G
 
A
A
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
S
T
 
T
A
 
S
P
 
A
I
 
I
T
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
K
V
 
I
E
 
D
G
 
S
A
 
Q
Q
 
H
I
 
V
G
 
D
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
M
G
 
G
H
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
Q
T
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
L
M
 
L
E
 
K
A
 
S
G
 
G
I
 
L
P
 
A
D
 
E
T
 
T
T
 
V
P
 
C
A
 
G
M
 
F
N
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
K
L
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
K
A
 
S
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
A
I
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
I
M
 
Q
L
 
A
G
 
G
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
F
 
S
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
L
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
L
M
 
L
P
 
D
V
 
A
-
 
K
A
 
A
R
 
R
W
 
S
G
 
G
Q
 
Y
K
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
T
 
Q
A
 
V
M
 
Y
D
 
D
M
 
V
M
 
I
L
 
L
-
 
R
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
M
C
 
C
P
 
A
F
 
T
G
 
H
T
 
G
G
 
Y
H
 
H
M
 
M
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
R
A
 
E
D
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
A
Q
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
F
 
F
N
 
T
S
 
A
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
N
V
 
V
K
 
V
V
 
T
K
 
R
R
 
K
D
 
K
M
 
T
V
 
F
D
 
V
F
 
F
V
 
S
R
 
Q
D
 
D
E
 
E
H
 
F
P
 
P
K
 
K
P
 
A
-
 
N
T
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
|
I
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
M
R
 
E
A
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
K
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
H
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
P
P
 
P
E
 
A
V
 
L
M
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
T
Q
 
Q
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
Q
K
 
L
T
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
Q
V
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
I
D
 
D
V
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
G
K
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
F
D
 
D
P
 
S
A
 
E
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
|
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
H
E
 
A
L
 
M
E
 
Q
R
 
A
I
 
R
G
 
D
G
 
K
K
 
T
R
 
L
A
 
G
L
 
L
V
x
A
T
 
T
M
x
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
V
F
 
I
E
 
E

4o9cC Crystal structure of beta-ketothiolase (phaa) from ralstonia eutropha h16 (see paper)
49% identity, 98% coverage: 6:392/394 of query aligns to 3:391/393 of 4o9cC

query
sites
4o9cC
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
V
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
K
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
K
T
 
I
A
 
P
P
 
A
I
 
P
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
V
V
 
V
A
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
K
G
 
P
A
 
E
Q
 
Q
I
 
V
G
 
S
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
M
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
N
 
-
T
 
T
E
 
A
P
 
G
R
 
S
D
 
G
M
 
Q
Y
 
N
L
 
P
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
M
T
 
V
P
 
P
A
 
A
M
 
M
N
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
K
L
 
V
C
x
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
M
S
 
L
V
 
A
I
 
A
Q
 
N
S
 
A
L
 
I
M
 
M
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
E
F
 
I
G
 
V
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
A
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
V
M
 
L
P
 
P
V
 
G
A
 
S
R
 
R
W
 
D
G
 
G
Q
 
F
K
 
R
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
A
T
 
K
A
 
L
M
 
V
D
 
D
-
 
T
M
 
M
M
 
I
L
 
V
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
W
C
 
D
P
 
V
F
 
Y
G
 
N
T
 
Q
G
 
Y
H
 
H
M
 
M
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
R
A
 
E
D
 
A
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
G
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
G
 
G
H
 
K
F
 
F
N
 
D
S
 
E
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
L
V
 
I
K
 
P
V
 
Q
K
 
R
R
 
K
-
 
G
D
 
D
M
 
P
V
 
V
D
 
A
F
 
F
V
 
K
R
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
F
P
 
V
K
x
R
P
 
Q
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
P
V
 
A
F
|
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
A
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
x
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
M
R
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
L
A
 
A
R
 
T
I
 
I
L
 
K
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
H
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
K
A
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
R
T
 
A
D
 
E
L
 
W
S
 
T
V
 
P
S
 
Q
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
M
E
 
E
S
 
I
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
H
K
 
Q
G
 
Q
L
 
M
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
T
A
 
S
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
C
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
H
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
D
G
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
S
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
V
E
 
E

P45359 Acetyl-CoA acetyltransferase; Acetoacetyl-CoA thiolase; CaTHL; EC 2.3.1.9 from Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / LMG 5710 / VKM B-1787) (see paper)
45% identity, 98% coverage: 5:392/394 of query aligns to 2:390/392 of P45359

query
sites
P45359
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
K
G
 
D
T
 
V
A
 
P
P
 
A
I
 
V
T
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
K
R
 
K
S
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
K
G
 
P
A
 
E
Q
 
D
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
T
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
S
M
 
F
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
D
x
V
T
 
E
T
 
I
P
 
P
A
 
A
M
 
M
N
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
K
L
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
T
L
 
V
V
x
S
S
 
L
V
 
A
I
 
A
Q
 
Q
S
 
I
L
 
I
M
 
K
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
D
F
 
V
G
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
R
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
L
M
 
A
P
 
N
V
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
Q
 
Y
K
 
R
M
 
M
G
 
G
D
 
N
A
 
A
T
 
K
A
 
F
M
 
V
D
 
D
-
 
E
M
 
M
M
 
I
L
 
T
G
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
W
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
x
N
T
 
D
G
 
Y
H
 
H
M
 
M
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
R
H
 
W
G
 
N
I
 
I
G
 
S
R
 
R
A
 
E
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
K
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
I
E
 
K
A
 
S
G
 
G
H
 
Q
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
E
V
 
T
D
 
V
F
 
V
V
 
D
R
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
H
P
 
P
K
 
R
-
 
F
P
 
G
T
 
S
T
 
T
A
 
I
E
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
L
R
 
K
T
 
P
V
 
A
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
M
R
 
S
A
 
A
S
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
P
R
 
L
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
Y
A
x
G
H
x
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
x
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
F
P
 
Y
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
A
 
E
K
 
K
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
T
V
 
V
S
 
D
D
 
E
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
A
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
L
 
F
D
 
D
P
 
M
A
 
N
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
V
Y
 
H
E
 
A
L
 
M
E
 
Q
R
 
K
I
 
R
G
 
D
G
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
|
A
L
 
I
A
 
L
F
 
L
E
 
E

5f38B X-ray crystal structure of a thiolase from escherichia coli at 1.8 a resolution (see paper)
50% identity, 99% coverage: 5:394/394 of query aligns to 2:391/391 of 5f38B

query
sites
5f38B
Q
 
K
D
 
N
I
 
C
V
 
V
I
 
I
L
 
V
D
 
S
G
 
A
A
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
S
T
 
T
A
 
S
P
 
A
I
 
I
T
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
K
V
 
I
E
 
D
G
 
S
A
 
Q
Q
 
H
I
 
V
G
 
D
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
M
G
 
G
H
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
Q
T
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
L
M
 
L
E
 
K
A
 
S
G
 
G
I
 
L
P
 
A
D
 
E
T
 
T
T
 
V
P
 
C
A
 
G
M
 
F
N
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
K
L
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
K
A
 
S
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
A
I
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
I
M
 
Q
L
 
A
G
 
G
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
F
 
S
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
L
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
L
M
 
L
P
 
D
V
 
A
-
 
K
A
 
A
R
 
R
W
 
S
G
 
G
Q
 
Y
K
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
G
T
 
Q
A
 
V
M
 
Y
D
 
D
M
 
V
M
 
I
L
 
L
-
 
R
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
M
C
 
C
P
 
A
F
 
T
G
 
H
T
 
G
G
 
Y
H
 
H
M
 
M
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
E
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
T
R
 
R
A
 
E
D
 
M
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
A
Q
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
F
 
F
N
 
T
S
 
A
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
N
V
 
V
K
 
V
V
 
T
K
 
K
R
 
T
D
 
F
M
 
V
V
 
-
D
 
-
F
 
F
V
 
S
R
 
Q
D
 
D
E
 
E
H
 
F
P
 
P
K
|
K
P
 
A
-
 
N
T
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
|
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
I
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
M
R
 
E
A
 
E
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
L
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
K
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
H
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
P
P
 
P
E
 
A
V
 
L
M
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
T
Q
 
Q
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
Q
K
 
L
T
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
Q
V
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
I
D
 
D
V
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
G
K
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G
L
 
F
D
 
D
P
 
S
A
 
E
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
H
E
 
A
L
 
M
E
 
Q
R
 
A
I
 
R
G
 
D
G
 
K
K
 
T
R
 
L
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
V
F
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
L

4xl4A Crystal structure of thiolase from clostridium acetobutylicum in complex with coa (see paper)
45% identity, 98% coverage: 5:392/394 of query aligns to 2:390/392 of 4xl4A

query
sites
4xl4A
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
K
G
 
D
T
 
V
A
 
P
P
 
A
I
 
V
T
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
I
K
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
K
R
 
K
S
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
K
G
 
P
A
 
E
Q
 
D
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
N
V
 
V
I
 
L
N
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
G
T
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
S
M
 
F
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
D
 
V
T
 
E
T
 
I
P
 
P
A
 
A
M
 
M
N
 
T
V
 
I
N
 
N
R
 
K
L
 
V
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
T
L
 
V
V
 
S
S
 
L
V
 
A
I
 
A
Q
 
Q
S
 
I
L
 
I
M
 
K
L
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
D
F
 
V
G
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
N
M
 
M
S
 
S
R
 
R
S
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
L
M
 
A
P
 
N
V
 
N
A
 
A
R
 
R
W
 
W
G
 
G
Q
 
Y
K
 
R
M
 
M
G
 
G
D
 
N
A
 
A
T
 
K
A
 
F
M
 
V
D
 
D
-
 
E
M
 
M
M
 
I
L
 
T
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
W
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
N
T
 
D
G
 
Y
H
|
H
M
 
M
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
R
H
 
W
G
 
N
I
 
I
G
 
S
R
 
R
A
 
E
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
E
F
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
K
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
I
E
 
K
A
 
S
G
 
G
H
 
Q
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
E
V
 
T
D
 
V
F
 
V
V
 
D
R
 
T
D
 
D
E
 
E
H
 
H
P
 
P
K
x
R
-
 
F
P
 
G
T
 
S
T
 
T
A
 
I
E
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
|
L
R
 
K
T
 
P
V
 
A
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
M
R
 
S
A
 
A
S
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
K
S
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
P
R
 
L
A
 
A
R
 
K
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
Y
A
 
G
H
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
A
V
 
I
M
 
M
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
F
P
 
Y
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
A
 
E
K
 
K
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
T
V
 
V
S
 
D
D
 
E
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
A
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
L
 
F
D
 
D
P
 
M
A
 
N
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
V
K
 
T
A
 
L
L
 
V
Y
 
H
E
 
A
L
 
M
E
 
Q
R
 
K
I
 
R
G
 
D
G
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
x
S
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
L
F
 
L
E
 
E

2vu2A Biosynthetic thiolase from z. Ramigera. Complex with s-pantetheine-11- pivalate. (see paper)
46% identity, 98% coverage: 7:394/394 of query aligns to 2:389/389 of 2vu2A

query
sites
2vu2A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
P
P
 
A
I
 
H
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
A
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
N
 
G
T
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
T
 
A
P
 
T
A
 
A
M
 
W
N
 
G
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
G
I
 
M
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
I
M
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
S
F
 
I
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
C
M
 
A
P
 
H
V
 
L
A
 
-
R
 
R
W
 
G
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
F
T
 
K
A
 
M
M
 
I
D
 
D
M
 
T
M
 
M
L
 
I
-
 
K
G
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
T
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
Y
T
 
G
G
 
Y
H
|
H
M
|
M
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
H
 
W
G
 
Q
I
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
D
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
R
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
D
V
 
I
D
 
T
F
 
V
V
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
P
 
I
K
 
R
P
 
H
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
L
 
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
|
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
M
R
 
S
A
 
E
S
 
A
A
 
E
A
 
A
E
 
S
S
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
P
R
 
L
A
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
W
A
 
A
H
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
R
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
S
 
G
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
V
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
S
K
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
N
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
G
G
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
C
F
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
L

1dm3A Acetylated biosynthetic thiolase from zoogloea ramigera in complex with acetyl-coa (see paper)
46% identity, 98% coverage: 7:394/394 of query aligns to 2:389/389 of 1dm3A

query
sites
1dm3A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
P
P
 
A
I
 
H
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
A
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
N
 
G
T
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
T
 
A
P
 
T
A
 
A
M
 
W
N
 
G
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
G
I
 
M
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
I
M
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
S
F
 
I
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
C
M
 
A
P
 
H
V
 
L
A
 
-
R
 
R
W
 
G
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
F
T
 
K
A
 
M
M
 
I
D
 
D
M
 
T
M
 
M
L
 
I
-
 
K
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
T
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
Y
T
 
G
G
 
Y
H
|
H
M
|
M
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
H
 
W
G
 
Q
I
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
D
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
R
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
D
V
 
I
D
 
T
F
 
V
V
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
P
 
I
K
x
R
P
 
H
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
x
S
L
x
M
A
 
A
G
 
K
L
 
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
M
R
 
S
A
 
E
S
 
A
A
 
E
A
 
A
E
 
S
S
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
P
R
 
L
A
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
W
A
 
A
H
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
|
M
G
 
G
I
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
R
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
S
 
G
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
V
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
S
K
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
N
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
G
G
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
C
F
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
L

1dlvA Biosynthetic thiolase from zoogloea ramigera in complex with coa (see paper)
46% identity, 98% coverage: 7:394/394 of query aligns to 2:389/389 of 1dlvA

query
sites
1dlvA
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
P
P
 
A
I
 
H
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
A
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
N
 
G
T
 
Q
E
 
N
P
 
P
R
 
-
D
 
-
M
 
-
Y
 
-
L
 
-
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
T
 
A
P
 
T
A
 
A
M
 
W
N
 
G
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
G
I
 
M
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
I
M
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
S
F
 
I
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
C
M
 
A
P
 
H
V
 
L
A
 
-
R
 
R
W
 
G
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
F
T
 
K
A
 
M
M
 
I
D
 
D
M
 
T
M
 
M
L
 
I
-
 
K
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
T
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
Y
T
 
G
G
 
Y
H
|
H
M
|
M
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
H
 
W
G
 
Q
I
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
D
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
R
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
D
V
 
I
D
 
T
F
 
V
V
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
P
 
I
K
x
R
P
 
H
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
L
|
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
 
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
M
R
 
S
A
 
E
S
 
A
A
 
E
A
 
A
E
 
S
S
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
P
R
 
L
A
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
W
A
 
A
H
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
R
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
S
 
G
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
V
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
S
K
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
N
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
G
G
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
C
F
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
L

2vu1A Biosynthetic thiolase from z. Ramigera. Complex of with o-pantheteine- 11-pivalate. (see paper)
47% identity, 98% coverage: 7:394/394 of query aligns to 4:391/391 of 2vu1A

query
sites
2vu1A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
P
P
 
A
I
 
H
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
A
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
N
 
P
T
 
A
E
 
-
P
 
G
R
 
E
D
 
G
M
 
Q
Y
 
N
L
 
P
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
T
 
A
P
 
T
A
 
A
M
 
W
N
 
G
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
G
I
 
M
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
I
M
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
S
F
 
I
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
C
M
 
A
P
 
H
V
 
L
A
 
-
R
 
R
W
 
G
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
F
T
 
K
A
 
M
M
 
I
D
 
D
M
 
T
M
 
M
L
 
I
-
 
K
G
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
T
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
Y
T
 
G
G
 
Y
H
|
H
M
 
M
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
H
 
W
G
 
Q
I
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
D
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
R
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
D
V
 
I
D
 
T
F
 
V
V
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
P
 
I
K
 
R
P
 
H
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
L
 
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
|
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
M
R
 
S
A
 
E
S
 
A
A
 
E
A
 
A
E
 
S
S
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
P
R
 
L
A
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
W
A
 
A
H
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
R
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
S
 
G
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
V
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
S
K
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
N
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
G
G
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
C
F
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
L

1ou6A Biosynthetic thiolase from zoogloea ramigera in complex with acetyl-o- pantetheine-11-pivalate
47% identity, 98% coverage: 7:394/394 of query aligns to 5:392/392 of 1ou6A

query
sites
1ou6A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
 
S
G
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
P
P
 
A
I
 
H
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
A
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
N
 
-
T
 
P
E
 
A
P
 
G
R
 
E
D
 
G
M
 
Q
Y
 
N
L
 
P
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
T
 
A
P
 
T
A
 
A
M
 
W
N
 
G
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
G
I
 
M
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
I
M
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
S
F
 
I
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
C
M
 
A
P
 
H
V
 
L
A
 
-
R
 
R
W
 
G
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
F
T
 
K
A
 
M
M
 
I
D
 
D
M
 
T
M
 
M
L
 
I
-
 
K
G
 
D
A
 
G
L
|
L
N
 
T
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
Y
T
 
G
G
 
Y
H
|
H
M
|
M
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
H
 
W
G
 
Q
I
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
D
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
R
F
 
F
N
 
K
S
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
G
K
 
R
R
 
K
D
 
G
M
 
D
V
 
I
D
 
T
F
 
V
V
 
D
R
 
A
D
 
D
E
 
E
H
 
Y
P
 
I
K
 
R
P
 
H
-
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
M
A
 
A
G
 
K
L
 
L
R
 
R
T
 
P
V
 
A
F
|
F
Q
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
A
|
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
M
R
 
S
A
 
E
S
 
A
A
 
E
A
 
A
E
 
S
S
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
P
 
P
R
 
L
A
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
G
 
S
Y
 
W
A
 
A
H
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
I
P
 
P
A
 
A
V
 
S
Q
 
R
A
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
E
K
 
R
T
 
A
D
 
G
L
 
W
S
 
K
V
 
I
S
 
G
D
 
D
F
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
V
E
 
E
S
 
A
N
 
N
E
 
E
A
|
A
F
|
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
C
A
 
A
V
 
V
N
 
N
K
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
W
D
 
D
P
 
P
A
 
S
K
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
H
|
H
P
 
P
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
R
I
 
I
A
 
L
L
 
N
K
 
T
A
 
L
L
 
L
Y
 
F
E
 
E
L
 
M
E
 
K
R
 
R
I
 
R
G
 
G
G
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
A
T
 
T
M
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
C
F
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
L

2wkuA Biosynthetic thiolase from z. Ramigera. The n316h mutant. (see paper)
46% identity, 98% coverage: 7:394/394 of query aligns to 2:389/389 of 2wkuA

query
sites
2wkuA
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
A
D
x
S
G
x
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
V
G
 
G
T
 
S
F
 
F
G
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
P
P
 
A
I
 
H
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
|
R
S
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
A
A
 
G
Q
 
E
I
 
V
G
 
N
H
 
E
V
 
V
V
 
I
F
 
L
G
 
G
H
 
Q
V
 
V
I
 
L
N
 
P
T
 
A
E
 
-
P
 
G
R
 
E
D
 
G
M
 
Q
Y
 
N
L
 
P
S
 
A
R
 
R
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
M
 
M
E
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
T
 
A
P
 
T
A
 
A
M
 
W
N
 
G
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
C
|
C
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
A
S
 
L
V
 
G
I
 
M
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
I
M
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
A
Q
 
S
F
 
I
G
 
I
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
M
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
M
S
 
A
P
 
P
Y
 
H
A
 
C
M
 
A
P
 
H
V
 
L
A
 
-
R
 
R
W
 
G
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
F
T
 
K
A
 
M
M
 
I
D
 
D
M
 
T
M
 
M
L
 
I
-
 
K
G
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
T
C
 
D
P
 
A
F
 
F
G
 
Y
T
 
G
G
 
Y
H
 
H
M
 
M
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
H
 
W
G
 
Q
I
 
L
G
 
S
R
 
R
A
 
D
D
 
E
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
V
E
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
N
R
x
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
E
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
R
F
 
F
N
 
K
S
x
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
I
V
 
V
K
 
K
V